Les études de séroprévalence portant sur les infections au SRAS-CoV-2 doivent souvent composer avec des échantillons non-aléatoires et non-représentatifs, limitant ainsi parfois la validité externe de leurs résultats lorsque ceux-ci sont appliqués à la population générale. Dans le cadre de ce mémoire, il s’agit d’investiguer la représentativité d’une cohorte pédiatrique d’une étude longitudinale de séroprévalence (Enfants et COVID-19 : Étude de séroprévalence) et d’évaluer dans quelle mesure ses estimations de séroprévalence peuvent s’appliquer à la population pédiatrique montréalaise en général. 1 632 enfants ont fourni au point de départ un échantillon sanguin afin de déterminer leur séropositivité aux anticorps contre le SRAS-CoV-2. À l’aide d’une modélisation par régression logistique et d’un procédé de « standardisation marginale », une pondération post-stratification calculée à partir des données du recensement canadien de 2016 a été appliquée à la population d’étude. Les variations dans les estimations de séroprévalence ont finalement été évaluées. D’importantes différences dans la distribution de certaines caractéristiques sociodémographiques peuvent être observées lorsqu’on compare la population d’étude et la population générale en se basant sur les données du recensement canadien de 2016. En comparaison des estimations non-pondérées, les estimations de séroprévalence générées à partir du procédé de « standardisation marginale » montrent une variation de plusieurs points de pourcentage, allant de -0,4% à +3,2%. La pondération n’a pas induit de changement dans l’estimation de mesures relatives comme les ratios de séroprévalence. Lorsque la population d’étude est non-représentative de la population-cible, il est nécessaire de pondérer les caractéristiques sociodémographiques associées à l’issue si l’on veut appliquer les résultats plus généralement. / Prevalence studies on SARS-CoV-2 infections have often based on study populations with non-random and non-representative samples, which limits the external validity of their results when applied to the general population. The aim of this thesis was to investigate the representativeness of a pediatric cohort of a longitudinal seroprevalence study (Children and COVID-19: Seroprevalence study) and to assess to what extent its baseline estimates of seroprevalence can be applied to the Montreal pediatric population. There were 1 632 children participants who provided a blood sample at baseline, which was used to determine their seropositivity to SARS-CoV-2 antibodies. Using logistic regression modeling and a "marginal standardization" method, post-stratification weights calculated from 2016 Canadian census data were applied to the study population. Variations in seroprevalence estimates were then assessed. Significant differences in the distribution of certain sociodemographic characteristics were observed when comparing the study population and the target population based on 2016 Canadian census data. Seroprevalence estimates were generated from the “marginal standardization” approach which differed to that of the non-standardized estimates, and the differences ranges from -0,4% to +3,2%. Weighting did not change relative measures estimates, such as seroprevalence ratios. When the study population is not representative of the target population, it is necessary to weight the sociodemographic characteristics associated with the prevalence estimates, if the results will be applied more broadly.

Le sommeil est essentiel à la santé et au bien-être. La littérature suggère que le sommeil s’est prolongé et sa qualité a diminué durant la première vague de COVID-19. Ce phénomène fut associé à divers prédicteurs de la santé. Dû au manque d'études longitudinales et d'échantillons représentatifs, celle-ci visait à (1) examiner les trajectoires de sommeil en début de COVID-19, (2) identifier les prédicteurs de ces trajectoires, et (3) déterminer les associations intertrajectoires. Un échantillon canadien représentatif (N=2246) fut interrogé 6 fois d’avril-juillet 2020. Les participants ont rapporté la durée et qualité de leur sommeil et des prédicteurs de santé. Premièrement, un modèle de croissance à classes latentes a identifié les trajectoires. Deuxièmement, une régression logistique a examiné les relations prédicteurs-trajectoires. Troisièmement, une analyse de trajectoires conjointes multiniveaux a testé les associations entre trajectoires. Quatre trajectoires constantes de qualité du sommeil furent identifiées (M=2,48/10, 6,7 %; M=5,44/10, 37,1%; M=7,83/10, 45,5 %; M=10/10, 10,7%). Deux trajectoires de durée de sommeil furent identifiées, une courte, mais constante (M=369 min, 33.9%), et une longue, mais décroissante (M=486 min, 66.1%, -2.32min/semaine). Le troisième âge, le genre masculin et le respect des recommandations gouvernementales prédisaient une qualité de sommeil élevée. Être plus vieux prédisait un sommeil court, mais constant, tandis que vivre avec un ménage prédisait un sommeil long, mais décroissant. Le sommeil des Canadiens n'a pas significativement changé comme suggéré par la littérature, possiblement due à la méthodologie de l’étude, déterminant les trajectoires de sommeil d’un échantillon pancanadien durant la première vague de COVID-19. / Sleep plays a critical role in maintaining overall health and well-being. During the early days of the COVID-19 pandemic, reports showed a high prevalence of short sleep and poor sleep quality. This was associated with various health predictors. Given the lack of Canadian longitudinal studies and representative samples, our study aimed to (1) examine trajectories of sleep duration and quality during COVID-19, (2) identify predictors associated with these trajectories, and (3) determine inter-trajectory associations. A representative Canadian sample (N=2,246) was surveyed 6 times between April and July 2020. Participants self-reported their sleep duration, sleep quality, and health predictors. First, a Latent Class Growth Analysis identified sleep trajectories. Second, multinomial logistic regression models were used to examine relationships between predictors and trajectory groups. Third, a multilevel joint trajectory analysis tested the associations between trajectories. Four constant sleep quality trajectories were identified (M=2.48/10, 6.7%; M=5.44/10, 37.1%; M=7.83/10, 45.5%; M=10/10, 10.7%). Two sleep duration trajectories were identified, one shorter but constant (M=369min, 33.9%), and one longer but decreasing (M=486min, 66.1%, -2.32 min/week). Being older than 25 years old predicted short but constant sleep duration, while living with a household predicted long but decreasing sleep duration. The sleep of Canadians during early COVID-19 did not meaningfully change, which contradicts earlier reports. Sleep may not be immediately impacted by health crises. This may be explained by the study’s design as the first to provide evidence of trajectories of sleep in a representative pan-Canadian sample during the first COVID-19 wave.

Objectifs : Étudier l’association entre la concentration sérique prédite de 25-hydroxyvitamine D (25(OH)D) et la récidive du cancer de l’ovaire. Comme objectif secondaire, nous avons examiné cette association selon les strates d’IMC et avons examiné l’association entre les 3 sources principales de vitamine D et la récidive du cancer de l’ovaire. Contexte : Le cancer de l'ovaire est le cancer gynécologique le plus létal au Canada. Compte tenu de son mauvais pronostic et des faibles connaissances sur les facteurs modifiables influençant sa survie, il est nécessaire d’identifier et d’étudier ces facteurs. La vitamine D semble améliorer la survie au cancer du sein et du colon, mais son association avec la survie au cancer de l’ovaire demeure incertaine. Pour ces raisons, nous avons examiné l’association entre la concentration sérique prédite de 25-hydroxivitamine D et la récidive du cancer de l’ovaire. Méthodologies : 99 femmes âgées de 37 à 75 ans ayant reçu un diagnostic de cancer épithélial de l'ovaire de haut grade, ayant été traité, et ayant participé à l'étude sur les Habitudes de vie et le PRonostic du cancer de l'Ovaire au Québec (HPROQ) ont été incluses dans cette étude. Un modèle de prédiction a été utilisé pour estimer la concentration sérique en 25(OH)D des femmes. Le modèle de prédiction utilise des données relatives au mode de vie, aux données sociodémographiques, aux habitudes alimentaires et aux attributs personnels ayant été recueillies par 2 questionnaires distincts à la baseline (6 mois après la fin des traitements). Les données cliniques ont été obtenues à partir des rapports de pathologie et des rapports médicaux. Nous avons utilisé le modèle à risque proportionnel de Cox pour estimer les rapports de risque instantanés (HR) et les intervalles de confiance à 95% (CI). Résultats : À la fin du suivi, 48 % des femmes avaient subi une récidive. Pour l’association entre la concentration sérique prédite de 25(OH)D, nous avons observé un HR ajusté de 0.91 par incrément de 20 nmol/L de concentration sérique prédite de 25(OH)D (IC à 95% : 0,62, 1,34). Cependant, en stratifiant pour l’IMC, nous avons observé une réduction du risque de récidive de 50% par incrément de 20 nmol/L de concentration sérique prédite de 25(OH)D pour les femmes ayant un IMC < 25 kg/m2 (HR entièrement ajusté : 0.50 ; 95% CI : 0.28, 0.90), alors qu’aucune association significative n’a été trouvée parmi celles ayant un IMC ≥ 25 kg/m2 (HR entièrement ajusté : 1.25 ; 95% CI : 0.70, 2.29). Les associations pour les 3 sources de vitamine D étaient près de la valeur nulle. Conclusion : Overall, our results suggest an inverse association between predicted 25(OH)D serum concentration and ovarian cancer recurrence in women with a BMI < 25 kg/m2. / Objectives : To investigate the association between predicted 25-hydroxivitamin D (25(OH)D) serum concentration and ovarian cancer recurrence. As a secondary objective, we examined this association by BMI strata and investigated the association between the 3 major sources of vitamin D and ovarian cancer recurrence. Background : Ovarian cancer is the most lethal gynecological cancer in Canada. Given its poor prognosis and the limited knowledge about modifiable factors influencing survival, it is necessary to identify and study these factors. Vitamin D appears to improve breast and colon cancer survival, but its association with ovarian cancer survival remains uncertain. For these reasons, we examined the association between predicted 25-hydroxivitamin D serum concentration and ovarian cancer recurrence. Design and methods : 99 women diagnosed with high grade epithelial ovarian cancer aged between 37-75, who were previously enrolled in the lifestyle Habits and the PRognosis of Ovarian Cancer in Quebec Study (HPROQ), were included in this study. A prediction model was used to estimate women’s 25(OH)D serum concentration. The prediction model uses lifestyle, sociodemographic, eating habits and personal attributes data that were collected through 2 different questionnaires at baseline (6 months after the end of treatments). Clinical data were obtained from medical and pathological reports. We used Cox proportional hazards regression to estimate adjusted hazard ratios (HRs) and 95% confidence intervals (CIs). Results : At the end of follow-up, 48% of women had had a recurrence. For the association between predicted serum 25(OH)D concentration, we observed an adjusted HR of 0.91 per 20 nmol/L increment of predicted 25(OH)D serum concentration (95% CI: 0.62, 1.34). However, when stratified for BMI, we observed a 50% reduction in recurrence risk per 20 nmol/L increment in predicted serum 25(OH)D concentration for women with BMI < 25 kg/m2 (fully adjusted HR: 0.50; 95% CI: 0.28, 0.90), while no significant association was found among those with BMI ≥ 25 kg/m2 (fully adjusted HR: 1.25; 95% CI: 0.70, 2.29). Associations for all 3 sources of vitamin D were close to the null value. Conclusion : Overall, our results suggest a small inverse association between predicted 25(OH)D serum concentration and ovarian cancer recurrence, with the strongest association seen in women with a BMI < 25 kg/m2.

La recherche de contacts est une pratique courante en santé publique dans la lutte contre les maladies infectieuses mais avec la pandémie de la Covid-19, c'est la première fois que cette pratique est adaptée sous la forme numérique. Une application de recherche de contacts et très différente des autres plateformes d'e-santé, elle ne répond pas au même objectif, elle implique des risques supplémentaires concernant le respect de la vie privée, d'autant plus que sa pertinence n'est pas encore établie. Ce projet de recherche vise, dans un premier temps, à questionner les enjeux sociotechniques qui sont apparus lors de la création et du déploiement des applications française et canadienne. Nous élaborerons un corpus documentaire en vue de faire une cartographie de la controverse pour ensuite comparer les différentes approches. Dans un deuxième temps, nous cherchons à connaître les facteurs qui poussent les citoyens à adopter ou à rejeter ces applications grâce à l'analyse d'entretiens individuels. Au terme de cette étude, il appert que les enjeux principaux dans le débat public sur les applications de traçage concernaient l'architecture du dispositif, centralisée ou décentralisée. Or, qu'une application de contact tracing soit centralisée ou décentralisée ne semble pas avoir été déterminant pour les individus interrogés (7 en France et 7 au Québec), lesquels restent méfiants et très largement sceptiques quant à l'utilisation de la technologie pour répondre à la crise sanitaire. Il n'y a pas eu de différence majeure entre les Québécois et Français : dans tous les cas, les applications de recherche de contacts sont majoritairement perçues comme un outil de surveillance des citoyens par l'État.

Titre de l'écran-titre (visionné le 5 juin 2023) / La surveillance épidémiologique et le contrôle des épidémies sont des aspects cruciaux de la santé globale contemporaine. De grandes institutions nationales et internationales coordonnent l'organisation de la surveillance épidémiologique sur l'ensemble du globe. Différents appels à la collaboration entre pays et disciplines sont formulés pour indiquer des voies à suivre afin de mener ce projet de sécurisation à bien. « Renforcement des capacités » et « One Health » font partie du registre actuel. En suivant un projet de collaboration scientifique canado-africain, ce mémoire vise à rendre compte de comment ces mots d'ordre sont interprétés, saisis et mis en acte par des scientifiques à travers une initiative particulière. Convoquant des approches de l'anthropologie du développement et des Science & Technology Studies, je m'intéresse à la façon dont les acteurs de la santé globale répondent à des appels à projet, formulent et appliquent leurs protocoles, et font usage de ces mots et des cadrages variés des enjeux sanitaires pour ouvrir des espaces de collaboration et de recherche. / Epidemiologic surveillance and control are key aspects of contemporary global health. National and international public health agencies coordinate and organise the deployment of this surveillance around the world. Throughout time, different calls for international and interdisciplinary collaborations have been launched in hopes of advancing the never-ending project of securing population health. "Capacity building" and "One Health" are important part of the current efforts. By following a scientific collaboration between Canadian and African actors, this thesis examines how watchwords such as "capacity building" and "One Health" are interpreted, adopted, and put into practice in a particular project. Drawing on approaches from anthropology of development and Science and Technology Studies, I am interested in the way global health actors respond to project calls, formulate and apply research protocols, and make use of different watchwords and framing of health issues to open pathways for research and collaboration.

Mon premier objectif spécifique était de déterminer le niveau de structure génétique et les éléments du paysage du Sud du Québec qui sont susceptibles d'affecter cette structure génétique chez les moufettes rayées. J'ai aussi évalué s'il existe des effets spécifiques au sexe en comparant la structure génétique entre les mâles et les femelles. Pour ce faire, j'ai genotypé à 9 loci microsatellites 289 individus capturés dans les régions de la Montérégie et de l'Estrie, au Québec. Mes résultats montrent que la présence des rivières à fort débit et possiblement aussi des autoroutes provoquent une augmentation de la structure génétique surtout chez les femelles de cette espèce. Ces résultats suggèrent aussi que les mâles de la moufette rayée seraient potentiellement des vecteurs plus actifs dans la propagation de la variante de la rage du raton laveur que les femelles, puisqu'ils ne semblent pas limités autant que les femelles par les éléments du paysage. Finalement, puisque les mâles ne semblent que très peu limités par les barrières potentielles du paysage, celles-ci ne peuvent pas être utilisées pour contrôler efficacement la propagation de la maladie.Mon deuxième objectif spécifique était de déterminer s'il existe une différence de diversité et/ou de structure génétique entre des ratons laveurs testés positifs et des ratons laveurs testés négatifs pour la rage. Une telle différence serait un indice d'un comportement de déplacement différent entre ces deux groupes. Ceci peut entre autres me permettre de vérifier la validité des résultats obtenus en étudiant des individus sains d'une espèce vectrice de la maladie pour tenter d'inférer le patron de propagation de la rage du raton laveur. Mes résultats montrent que la structure génétique ne diffère pas entre les ratons laveurs sains et les ratons laveurs rabiques, indiquant un comportement de déplacement probablement similaire entre les deux groupes. Donc, les éléments du paysage auraient possiblement un effet similaire sur les ratons laveurs rabiques et sains. Les études sur la structure génétique chez des ratons laveurs sains pourraient donc fort probablement nous informer sur les couloirs de propagation potentiels de la rage du raton laveur. Ensuite, j'ai tenté de déterminer si la diversité génétique pouvait influencer l'infection par la rage en comparant la diversité génétique à différents loci entre les animaux rabiques et sains. Une différence de diversité génétique entre les deux groupes pourrait indiquer un plus grand taux d'immigration provenant de populations adjacentes chez un des groupes. Par ailleurs, une grande diversité génétique pourrait être un élément pouvant potentiellement limiter la propagation de la rage du raton laveur. Or, mes résultats ne supportent pas que la diversité génétique puisse influencer la probabilité d'un individu d'être infecté par la rage.--Résumé abrégé par UMI.

Background : The sources and the epidemiology of Campylobacter jejuni (CJ) in environmental water are not well understood. We developed a spatial analysis methodology able to identify the main environmental factors predicting the presence and quantity of Campylobacter in river water. Methods : For two years, water samples were collected weekly and scanned for CJ and fecal coliforms at 32 sampling sites of Estrie hydrographic network, Québec. The quantity of CJ in water was estimated using the Most Probable Number method (MPN). The 32 sampling sites were linked to their catchment area; 10 of them were excluded from the analysis, because their hydrographic basin was not independent from the other sites. For each site, the following environmental variables were included: Water flow, slope, land-cover, land-use including type of farming, animal density, total precipitation in the 3 days prior to water sampling. A stepwise multivariate regression was realized across the different analysis windows to define the size of the area upstream from the sampling sites (from 1.5 to 24 km) which was the most closely associated with the mean quantity of CJ, and which environmental factors were associated with a higher mean quantity of CJ in water. Results : Preliminary results show that an area defined by a radius of 14 km upstream of the sample site was the most contributing zone for the bacteria (r2=0.38, p=0.002). Within this 14 km area, the only significant variable associated with a higher mean quantity of CJ was bovine density (p=0.002). When analyzing the data within a 120 m buffer zone across 14 km upstream of the sampling sites (r2=0.40, p=0.001), the only significant variable associated with a higher mean quantity of CJ was the percentage of agricultural surface (p=0.001). Conclusions : These results suggest a strong implication of bovine density in conjunction with crops and associated manure spreading on the quantity of CJ in environmental water.

Contexte: Les infections gastro-intestinales constituent un important problème de santé publique. Si plusieurs études recensent l'épidémiologie des cas sporadiques, peu se penchent sur la répétition d'infections dans certains ménages. L'objectif de cette étude est de déterminer quels sont les facteurs de risque associés à une récidive à Campylobacter ou à Salmonella déclarés de 2001 à 2007 dans les ménages en Montérégie. Méthodologie: Deux études ont été réalisées. Une étude descriptive a été conduite afin de dresser un portrait des deux groupes à l'étude soit : ménages avec répétitions d'infections à Campylobacter ou à Salmonella et ménages sans répétition d'infection (avec cas sporadique seulement). L'ensemble des sujets de cette étude ont été sélectionnés à partir du registre MADO. Une étude cas-témoins a ensuite permis de comparer les facteurs de risque pour chaque groupe de ménages. Un questionnaire administré au téléphone permettait de recueillir les habitudes des ménages-cas et des ménages-témoins. Les analyses ont été effectuées par régression logistique conditionnelle adaptée pour un appariement 1 cas : 2 témoins. Résultats: L'analyse descriptive portait sur 4181 cas d'infections à Campylobacter et Salmonella , déclarés du ler janvier 2001 au 31 décembre 2007. Le pourcentage de cas partageant la même adresse a été estimé à 7,8% pour Campylobacter et 7,6% pour Salmonella . Les cas de récidive présentent les mêmes caractéristiques que les cas sporadiques en ce qui concerne l'agent le plus en cause, la saison de survenue, l'âge du cas et le milieu d'habitation. Les habitudes des cas provenant de 80 ménages avec récidive et 160 ménages sans récidive ont été comparées. Dans un modèle final, en tenant compte seulement des variables affectant le ménage, il apparaît que l'habitation dans un milieu rural (RC = 2,89 ; IC95% = 1,53 - 5,46), la présence d'enfants de moins de 5 ans (RC = 2,63 ; IC95% = 1,29 - 5,37), l'exposition à une source hydrique contaminée (RC = 2,6 ; IC95% = 1,18 - 5,93) et le travail en contact avec des animaux (RC = 2.39 ; IC95% = 1,06 - 5,36) soient associés à un risque de récidive dans le ménage. Conclusion: Cette étude révèle que les répétitions de cas à certaines adresses peuvent s'expliquer par des caractéristiques du ménage. Des habitudes de vie spécifiques dans les ménages avec récidives par rapport aux ménages avec cas sporadiques ont été identifiées.

Cette recherche avait pour objectif de mieux connaître l'épidémiologie des traumatismes par accident de la route chez l'enfant. Pour cela, des analyses ont été réalisées à partir des données d'une grande qualité : le Registre du Rhône. Les incidences de traumatismes routiers chez les enfants ont été calculées. La localisation et la nature des lésions ont été finement décrites, en fonction du type d'usager de la route. Le deuxième objectif était d'identifier des facteurs de risque de traumatisme sévère et de séquelles. Les handicaps secondaires aux traumatismes routiers ont été étudiés à partir d'une étude de cohorte prospective multicentrique conduite dans douze villes françaises, incluant 139 enfants sévèrement traumatisés de la route et admis en réanimation pédiatrique. Les déficiences fonctionnelles, comportementales et cognitives ainsi que les degrés d'incapacités et les retentissements sur la famille et la scolarité, ont été évalués six mois et un an après l'accident. Les différents outils d'évaluation ont montré leur complémentarité pour apprécier la réalité des handicaps. Des facteurs de risque de séquelles à un an ont été identifiés permettant de cibler les enfants qui devraient bénéficier d'une prise en charge et d'un suivi particuliers. Des recommandations pour la prévention ont pu être élaborées, concernant particulièrement l'utilisation des dispositifs de protection en voiture, à deux-roues, les modalités de prise en charge en fonction des facteurs de gravité et les modalités de traitement en phase aiguë.

L'atteinte rénale aiguë (ARA) est une pathologie fréquente en réanimation. La littérature actuelle sur le sujet est riche mais globalement hétérogène et confuse. Ainsi, plusieurs questions clés restent à ce jour sans réponse claire. Le but de cette thèse est d'apporter des éléments nouveaux dans le domaine dans un souci de rigueur et d'originalité méthodologiques. La première partie est consacrée à l'appréciation précise de l'impact pronostique de l'ARA par le modèle à risques compétitifs de Fine et Gray. La deuxième est dédiée à l'évaluation de l'efficacité de l'épuration extra-rénale (EER) par la technique du score de propension. La troisième, enfin, s'intéresse à l'ARA induite par les produits de contraste iodés, cas particulier potentiellement grave mais étonnamment peu étudié jusqu'alors en réanimation. Les résultats soulignent le pronostic sombre associé à la survenue d'une ARA, l'efficacité incertaine de l'EER et la nécessité urgente d'uniformisation des pratiques en termes de diagnostic et de thérapeutique.