El conocimiento de la estructura y dinámica de la población de una especie dada se fundamenta principalmente en el conocimiento de la fracción adulta. Hasta la fecha dicho conocimiento era mínimo para Alytes muletensis, reduciéndose a aspectos etológicos como la reproducción, y en muchos casos la información obtenida provenía de poblaciones cautivas. El presente conjunto de trabajos asienta las bases para el conocimiento de la fracción adulta, como es la identificación de los miembros de la población a partir de técnicas de fotoidentificación, así como la determinación del sexo a partir de la construcción de funciones discriminantes de clasificación sexual a partir de un estudio morfológico. Gracias a la obtención de esta metodología se ha podido continuar en el estudio de la estructura y dinámica poblacional. Así, se han comparado las longitudes y condiciones corporales procedentes de individuos de poblaciones naturales y artificiales, hecho que ha permitido conocer mejor la idoneidad del hábitat. Los individuos procedentes de poblaciones artificiales presentan una longitud y condición corporal mayor que los de poblaciones naturales, dando lugar a pensar que, desde el punto de vista del individuo, los hábitats óptimos para la especie son aquellos más similares a los artificiales. Además, se han podido establecer parámetros propios de poblaciones silvestres como es el caso del tamaño de puesta, la edad media, la esperanza de vida o la tasa de crecimiento, tanto para machos como para hembras. Estos datos han sido de vital transcendencia ya que han permitido elaborar el primer ciclo de vida sencillo con el que se han podido calcular las primeras tasas de supervivencia de cada sexo para una población silvestre. Este hecho supone un antes y un después en el conocimiento de la dinámica de la población que permitirá en un futuro mejorar este ciclo de vida en función de diferentes situaciones y tipos de poblaciones. El conjunto de trabajos realizados se complementa con la detección de los primeros casos de malformaciones en individuos adultos. También se presta especial atención a la interacción entre Natrix maura y la fracción adulta de la población, hecho que ha permitido conocer el impacto de la llegada de ejemplares de culebra viperina sobre la actividad reproductora.

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Humans can induce contemporary evolution through harvesting wild animals. This thesis provides evidence of this process for recreational fishing at surprisingly small geographical scales. Marine fish populations are characterized by high variability in heritable individual life‐history traits which are exposed to biased fishing mortality. The life histories strategies of actual populations, which collectively reduce adult body size, mirror such biased mortality in populations exposed to limited gene flow. Because the relationship between life history and behaviour, it is very likely that fishing also induces adaptive responses in behavioural traits. Due the potential negative effects of fishing selection the productivity and quality of the fishery, this thesis recommend considering the evolutionary impacts of fishing in the management plans of species exploited by the recreational fishing / El humans poden produir evolució contemporània a través de la recol∙lecció de animals salvatges. Aquesta tesis proporciona evidencies d’aquest procés per la pesca recreativa a una sorprenent escala espacial petita. Les poblacions marines de peixos tenen una alta variabilitat individual en caràcters heretables de la història exposada a una mortalitat selectiva per pesca. Les estratègies vitals de les poblacions actuals de peixos costaners, les quals conjuntament produeixin una reducció en la mida del individu, són el reflexa d’aquesta pesca selectiva en poblacions amb baixa connectivitat. Degut a la correlació entre història vital i comportament, la pesca pot induir també respostes adaptatives en cert caràcters comportamentals. Considerant els efectes negatius de la selecció per pesca en la productivitat i la qualitat de les pesqueries, aquesta tesis recomana considerar els possibles efectes evolutius produïts per la pesca en les estratègies de gestió d’espècies explotades per la pesca recreativa. / El hombre puede producir evolución contemporánea por la recolección de animales salvajes. La presente tesis proporciona evidencias de este proceso por la pesca recreativa en una sorprendente escala espacial pequeña. Las poblaciones de peces marinos presentan una alta variabilidad en caracteres heredables de la historia vital expuesta a mortalidad selectiva por pesca. Las estrategias vitales de las poblaciones actuales de los peces costeros, las cuales conjuntamente producen una reducción en el tamaño del individuo, son el reflejo de esta mortalidad selectiva en poblaciones con baja conectividad. Debido a la relación entre historia vital y comportamiento, la pesca puede también inducir cambios adaptativos en ciertos rasgos de comportamiento. Considerando los efectos negativos de la selección por pesca en al productividad y calidad de la pesquería, esta tesis recomienda considerara los posibles efectos evolutivos inducidos por la pesca en la estrategias de gestión de especies explotadas por la pesca recreativa.

El incremento de disponibilidad de nutrientes produce cambios en la estructura y funcionamiento de los ecosistemas litorales. La eutrofización en los ecosistemas litorales mediterráneos favorece el predominio de algas epifitas de crecimiento rápido que compiten por la luz y los nutrientes con Posidonia oceanica. La herbivoría sobre los epifitos suministra la mayor parte del carbono que asimilan los consumidores primarios y secundarios asociados a la pradera. Esta tesis evalúa la importancia del consumo ejercido por la epifauna asociada a las praderas de P. oceanica en revertir los efectos de la eutrofización sobre la biomasa de algas epifitas. Los resultados muestran un incremento de las tasas de consumo en respuesta a una mayor disponibilidad de biomasa epifita si bien el consumo no es capaz de revertir los efectos del aumento de nutrientes sobre la biomasa epifita. La comunidad íctica tiene un papel marginal en la regulación de la biomasa epifita en la Bahía de Palma.

El cálculo de oxalato cálcico monohidrato (COM) papilar puede iniciarse en una calcificación subepitelial de la papila renal. La formación de hidroxiapatita en la capa epitelial papilar puede llegar a ser el nido del cálculo COM papilar. En este trabajo se estudian a 60 pacientes con litiasis de oxalato cálcico, 30 con COM papilar y 30 con oxalato cálcico dihidrato (COD). El potencial redox fue más alto en el grupo COM papilar que en el grupo COD, sugiriendo un déficit en antioxidantes debido a un incremento de estrés oxidativo. El calcio urinario fue significativamente más alto en el grupo COD, mientras que el oxalato urinario fue más alto en el grupo COM, sugiriendo un alto grado de injuria oxidativa en las células renales. La evaluación de las dietas mostraron que ambos grupos consumieron bajas cantidades de productos ricos en fitatos. De las enfermedades asociadas a urolitiasis, la prevalencia de úlcera gastroduodenal difiere significativamente, siendo mayor en el grupo COM y sugiere que las lesiones epiteliales son comunes entre las úlceras gastroduodenales y la litiasis COM papilar. La prevalencia de Diabetes Mellitus tipo 2 fue mayor significativamente en el grupo COD frente al grupo COM papilar. La exposición ocupacional a productos citotóxicos ocurren en 47% del COM papilar frente al 27% del grupo COD, pero sin diferencias estadísticamente significativas. El síndrome metabólico ocurre en 23% del grupo COD frente al 3% del grupo COM papilar. Estos hallazgos indican que el estrés oxidativo esta asociado con una injuria al tejido papilar y este sería el origen de las calcificaciones intrapapilares. La continuación de este proceso es debido a moduladores y/o deficiencias en inhibidores de la cristalización. La identificación y eliminación de las causas de injuria pueden prevenir episodios recurrentes en pacientes con cálculos COM papilar. / Calcium oxalate monohydrate (COM) papillary calculi can be initiated by subepithelial calcification of the renal papillae. Hydroxyapatite disruption of the papillary epithelial layer can become the nidus of a COM papillary calculus. This study evaluated the causes of papillary tissue calcifications in 60 patients with calcium oxalate lithiasis, 30 with COM papillary and 30 with calcium oxalate dihydrate (COD) calculi. Urinary redox potential was higher in the COM papillary than the COD group, suggesting that the former are more deficient in antioxidants due to increased oxidative stress. Urinary calcium was significantly higher in the COD group, whereas urinary oxalate was significantly higher in the COM group, suggesting a great degree of oxidative injury of renal cells.Evaluations of their diets showed that both groups consumed low amounts of phytate-rich products. Of diseases possibly associated with urolithiasis, the prevalence of gastroduodenal ulcer differed significantly, being higher in the COM group and suggesting that epithelial lesions are common to gastroduodenal ulcers and COM papillary renal stones. The prevalence of Diabetes Mellitus type 2 was higher significantly in the COD than the COM papillary group. Occupational exposure to cytotoxic products occurred in 47% of the COM and 27% of the COD group, but this difference was not statistically significant. Metabolic syndrome occurred in 23% of the COD and 3% of the COM papillary. These findings indicate that oxidative stress is associated with injury to papillary tissue and that this is the origin of intrapapillary calcifications. The continuation of this process is due to modulators and/or deficiencies in inhibitors of crystallization. Identifying and eliminating the causes of injury may prevent recurrent episodes in patients with papillary COM calculi.

Typescript (Photocopy) / A stereo-viewer is provided ... to facilitate fusing of the three dimensional CT reconstructions and the stereo wire frame models--Pref. v. 2 / Bibliography: leaves [244]-263 / 3 v. : ill ; 30 cm. + 1 viewer (Taylor-Merchant stereopticon 707) in back pocket of vol. 2 / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Thesis (Ph.D.)--Dept. of Dentistry, University of Adelaide, 1990

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:09:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_9594_Regimento_interno_PPGBV_-_mestrado_e_doutorado_-_06-06 (1).pdf: 255017 bytes, checksum: 88efa4c0bbf6d716b9f291ee06555737 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CAPES / O subgrupo tridentata de Conura Spinola possui atualmente somente uma espécie descrita - C. (Spilochalcis) tridentata Delvare, 1992. O presente estudo morfológico propõe 15 outras espéceis, além da já drescrita. A diagnose do subgrupo tridentata e a descrição original de C. tridentata foram reavaliadas decorrendo na modificação e introdução de novos caracteres. A quantidade de caracteres descritivos para as espécies foi expandida para aproximadamente três vezes mais do que a contida na descrição original de C. tridentata. Novos dados sobre distribuição geográfica e associação com hospedeiros são apresentados. Uma chave de identificação e ilustrações são fornecidas para o reconhecimento de todas as espécies.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:09:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_9749_Dissertação final Dayse Dias - versão BC.pdf: 1977545 bytes, checksum: a3faf899c92685986b4db136a39fe8c9 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Brucepattersonius Hershkovitz compreende roedores cricetídeos de hábitos terrestres e semi-fossoriais que ocupam predominantemente regiões de florestas e campos subtropicais e áreas de maior altitude em zonas tropicais da América do Sul. A descrição do gênero é muito recente (1998) e muitos aspectos de sua distribuição geográfica, relações filogenéticas e processos evolutivos são pouco conhecidos. O presente estudo buscou avaliar a diversidade molecular e as relações de Brucepattersonius e inferir processos históricos ligados à diversificação do gênero a partir de uma hipótese filogenética com dados de cinco loci. Quatro linhagens evolutivas foram identificadas: três foram associadas a espécies descritas (Brucepattersonius griserufescens, Brucepattersonius soricinus, Brucepattersonius iheringi) e uma não apresenta forma nominal estabelecida (Brucepattersonius sp.). Além disso, os dados sugerem que Brucepattersonius igniventris é provavelmente um sinônimo-júnior de B. soricinus. Foi possível reconhecer dois clados supraespecíficos, um com distribuição no sudeste (B. griserufescens + Brucepattersonius sp.) e outro (B. soricinus + B. iheringi) encontrado na região sul e sudeste da Mata Atlântica. A diversificação do gênero ocorreu principalmente durante o Plioceno-Pleistoceno e sua história evolutiva parece estar relacionada à complexidade topográfica, às alterações na cobertura vegetal moduladas pelas mudanças climáticas pleistocênicas e aos movimentos neotectônicos. Os dados genéticos revelaram padrões filogeográficos idiossincráticos para as espécies. Brucepattersonius griserufescens figura como uma espécie relictual sujeita a gargalos populacionais e efeitos fundadores em ambientes alto-montanos do Parque Nacional do Caparaó. Brucepattersonius sp. e B. soricinus têm fraca estruturação demográfica associada à topografia complexa da áreas montanhosas do sudeste. Já B. iheringi apresenta sinais de expansão populacional recentes em latitudes mais ao sul da distribuição do bioma. Futuras investigações relacionadas a Brucepattersonius devem focar na descrição de novas espécies e na melhor diagnose morfológica das unidades evolutivas moleculares. Palavras-chave: Akodontini, ciclos climáticos, filogeografia, Mata Atlântica, montanhas tropicais.

Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2014-12-11T21:22:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Flávia Portela.pdf: 1285658 bytes, checksum: cc37b790e08dc1a4a38bb88608df9bba (MD5) / Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2014-12-12T18:45:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Flávia Portela.pdf: 1285658 bytes, checksum: cc37b790e08dc1a4a38bb88608df9bba (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-12T18:45:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Flávia Portela.pdf: 1285658 bytes, checksum: cc37b790e08dc1a4a38bb88608df9bba (MD5) Previous issue date: 2012 / Cariniana estrellensis (Raddi.) Kuntze e C. legalis (Mart.) Kuntze são arbóreas nativas do Brasil que, além de possuírem alto poder econômico, são objeto de interesse em programas de recuperação de áreas degradadas e em plantios comerciais. A escassez de informações relacionadas ao desempenho ecofisiológico dessas espécies em condições ambientais estressantes dificultam o manejo e conservação das mesmas. Dessa forma, o presente estudo objetivou avaliar a ecofisiologia das espécies em um gradiente de irradiância, por meio de dois experimentos. No experimento 1, plantas de C. estrellensis com 12 meses de idade foram submetidas a quatro tratamentos: 40%, 50%, 70% e 100% de irradiância, durante 104 dias. Ao final desse período foram feitas análises de crescimento, do conteúdo de pigmentos fotossintéticos, de trocas gasosas, da fluorescência da clorofila a, do conteúdo foliar de carboidratos solúveis, das características anatômicas foliares e caulinares e da plasticidade fenotípica da espécie. No experimento 2, plantas de C. estrellensis e C. legalis com 14 meses de idade foram submetidas a dois tratamentos: 30% e 100% de irradiância (sombra e sol, respectivamente), durante 30 dias. Ao final desse período foram feitas análises do estresse oxidativo das espécies, por meio da quantificação da atividade das enzimas catalase e peroxidase do ascorbato e por meio da quantificação do conteúdo foliar de pigmentos fotossintéticos. No experimento 1, em 70% de irradiância, as plantas apresentaram melhor crescimento em altura e diâmetro, maior massa seca de folhas (MSF), de caule (MSC) e de raiz (MSR). Em 70% e 100% de irradiância, as plantas apresentaram folhas menores (AFU) e mais espessas (AFE e MFE) resultando em menor área foliar total (AFT). Nesses tratamentos as plantas também apresentaram menor conteúdo foliar de clorofila a (Chl a) e b (Chl b), porém, maior razão Chl a/b e maior conteúdo de carotenóides, o que implicou em menor razão Chl a/Carot. Taxas fotossintéticas maiores foram encontradas nas plantas em 70% e inibidas em 40% e 50%, em função da baixa irradiância solar, e em 100%, possivelmente pela ocorrência de fotoinibição, como mostraram os parâmetros do fluxo de energia do fotossistema II. De acordo com a análise da fluorescência da clorofila a, em pleno sol, as plantas apresentaram menor densidade de centros de reação ativos (RC/ABS) e maior dissipação de energia (DI0/ABS), culminando com menor desempenho do fotossistema II (PIabs) e desempenho total (PITotal). O conteúdo foliar de carboidratos solúveis foi maior nas plantas em 70%, seguido das plantas em 100% de irradiância, com exceção da glicose, que não variou entre os tratamentos. A maior espessura encontrada nas folhas sob 100% de irradiância foi em função da maior espessura das epidermes adaxial e abaxial e dos parênquimas paliçádico e esponjoso. E o maior diâmetro do caule em 70% de irradiância se deu pela maior espessura do xilema e floema secundários. No experimento 2, as plantas em pleno sol de ambas as espécies também apresentaram menor conteúdo foliar de clorofila a (Chl a) e b (Chl b) e maior razão Chl a/b. No entanto, o conteúdo de carotenóides foi maior, o que implicou em menores razões Chl a/Carot. A atividade da catalase (CAT) variou em função do tempo e da espécie, apresentando uma queda em C. estrellensis aos 16 dias, possivelmente em função de fotoinativação, e um aumento em C. legalis aos 30 dias. Já a atividade da peroxidase do ascorbato (APX) não variou em função do tempo, da espécie ou dos tratamentos. O estudo da plasticidade fenotípica mostrou que C. estrellensis é uma espécie plástica, principalmente em função das variáveis de fotossíntese e trocas gasosas, sendo capaz de sobreviver no gradiente de irradiância testado, o que viabiliza o seu uso em projetos de recuperação de áreas degradadas. E, uma vez que as análises ecofisiológicas mostraram que C. estrellensis e C. legalis apresentaram melhor desempenho em luminosidade moderada, sugere-se que ambas comportaram-se como espécies intermediárias no processo de sucessão florestal. No entanto, uma vez que a concentração de pigmentos foliares e a produção de enzimas antioxidantes inferiram maior susceptibilidade de C. estrellensis à fotoinibição em alta irradiância, sugere-se maior viabilidade do uso de C. legalis em projetos de recuperação de áreas degradas. / Cariniana estrellenis (Raddi). Kuntze and C. legalis (Mart.) Kuntze are native Brazilian trees which have powerful economic value and are also objects of interest in recovering programs of degraded areas and in commercial plantations. The scarcity of information about their ecophysiological performance under stress conditions complicates their management and conservation. Under these circumstances, this study aimed to evaluate the ecophysiology of this species in a irradiance gradient, through a couple of experiments. In experiment 1, C. estrellensis plants with 12 months old were subjected to four treatments: 40%, 50%, 70% and 100% of irradiance during 104 days. At the end of this period, the following analyses were made: growth, photosynthetic pigment content, gas exchange, chlorophyll a fluorescence, leaf content of soluble carbohydrates, the stem and leaf anatomical characteristics and phenotypic plasticity of the species. In experiment 2, C. estrellensis and C. legalis plants with 14 months old were subjected to two treatments: 30% and 100% of irradiance (shade and sun, respectively) for 30 days. At the end of this period were analyzed the oxidative stress of the species, by quantifying the activity of catalase and ascorbate peroxidase enzymes and by quantifying the photosynthetic pigments leaf content. In experiment 1, plants submitted to 70% of irradiance showed better growth in height and diameter, higher leaf, stem and root dry mass. In 70% and 100% of irradiance, plants showed smallest and thicker leaves resulting in lower leaf total area. In these treatments, plants showed lower chlorophyll a (Chl a) and b (Chl b) content, higher Chl a/b rate, higher carotenoids (Carot) content and lower Chl a/Carot rate. Higher photosynthetic rates were found in plants in 70% and inhibited in 40%, 50%, due to low solar irradiation, and in 100%, possibly due the occurrence of photoinhibition, as showed by flow energy parameters of photosystem II. According to the analysis of chlorophyll a fluorescence, in full sun exposition, plants had lower density of active reaction centers (RC/ABS) and higher energy dissipation (DI0/ABS), which resulted in decreased performance of photosystem II (PIabs ) and total performance (PITotal). The leaf content of soluble carbohydrates was higher in plants in 70%, followed by plants in 100% of irraciance, with the exception of glucose, which did not vary between treatments. The highest leaf thickness in 100% of irradiance was due to the highest thickness of adaxial and abaxial epidermis and of palisade and spongy parenchymas. And the highest stem diameter in 70% of irradiance occurred because of the highest secondary xylem and phloem thickness. In experiment 2, the plants in full sun of both species also showed lower chlorophyll a (Chl a) and chlorophyll b (Chl b) content and higher Chl a/b ratio. Although the carotenoids (Carot) content were higher, what implied in lower Chl a/Carot ratios. Catalase (CAT) activity varied with the time and the species, showing a decrease in C. estrellensis at 16 days, possibly due to photoinactivation, and an increase in C. legalis at 30 days. The ascorbato peroxidase (APX) did not vary according the time, the species or the treatments. The study of phenotipic plasticity showed that C. estrellensis is a plastic species, mainly due to variables of photosynthesis and gas exchange, being able to survive in the irradiance gradient tested, which allows its uses in restoration projects of degraded areas. And, since the ecophysiological analysis showed that C. estrellensis e C. legalis had better performace in moderate irradiance it is suggested that both behaved as intermediate species in the florestal succession process. However, since that photosynthetic pigments concentration and the antioxidants enzymes production inferred higher susceptibility of C. estrellensis to photoinhibition in high irradiance, it is suggested higher viability os the use of C. legalis in restoration projects of degraded areas. Key words: jequitibá, forest succession, stress, morphophysiological, anatomy, biochemistry, phenotypic plasticity.

Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2014-12-17T18:19:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) TeseLoss2014.pdf: 26574811 bytes, checksum: 616f2c773f45465dee563c309c7a2f3d (MD5) / Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2014-12-19T18:05:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) TeseLoss2014.pdf: 26574811 bytes, checksum: 616f2c773f45465dee563c309c7a2f3d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-19T18:05:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) TeseLoss2014.pdf: 26574811 bytes, checksum: 616f2c773f45465dee563c309c7a2f3d (MD5) Previous issue date: 2014 / Os roedores Echimyidae tem distribuição Neotropical e são a família mais diversa de roedores Caviomorpha. Apesar da grande diversidade, pouco se sabe sobre a distribuição geográfica, história natural e evolução de vários grupos de equimídeos. O histórico taxonômico dessa família é confuso, sendo alguns grupos raramente coletados e, consequentemente, inferências sobre aspectos evolutivos e biológicos são pouco conclusivas e limitadas à análise de poucos exemplares. Filogenias moleculares não corroboram a classificação taxonômica para a família baseada em dados morfológicos, evidenciando a complexidade da história evolutiva desse grupo. Na Mata Atlântica são registrados cinco gêneros de Echimyidae: o rato-do-bambu, Kannabateomys; os arborícolas Phyllomys e Callistomys; o terrestre Trinomys, e o semi-fossorial Euryzygomatomys. O presente trabalho se baseou na utilização de sequências de DNA para abordar aspectos da evolução e filogenia de roedores equimídeos da Mata Atlântica em três níveis taxonômicos: família, gênero e espécie. O primeiro capítulo aborda a posição filogenética do gênero Callistomys dentro da família, utilizando sequências de 1 marcador mitocondrial (CitB) e 3 nucleares (GHR, RAG1 e vWF). Os resultados mostram que Callistomys forma um clado com o ratão-do-banhado (Myocastor), roedor semi-aquático das regiões abertas no cone sul da América do Sul e com o rato-de-espinho terrestre Proechimys com ocorrência na Amazônia. Esse clado é irmão de Thrichomys, um equimídeo terrestre que ocupa as áreas secas do centro da América do Sul. O agrupamento encontrado é inesperado, uma vez que seus membros apresentam aspectos morfológico, ecológicos e distribuição geográfica distintos e contrastantes. A filogenia resultante indica que Callistomys não é proximamente relacionado aos outros equimídeos arborícolas e sugere que o hábito arborícolas evoluiu mais de uma vez na família. O segundo capítulo investiga aspectos da filogenia, evolução e limites entre espécies de Phyllomys utilizando dois marcadores mitocondriais (CitB e COI) e três nucleares (GHR, RAG1 e vWF). Foram identificados três grupos principais de espécies: um com distribuição longitudinal pela porção central da Mata Atlântica (P. pattoni (P. mantiqueirensis, Phyllomys sp. 4)); e a partir daí dois outros grupos, um com distribuição na porção norte da Mata Atlântica (Phyllomys sp. 2 (P. blainvilii (P. brasiliensis, P. lamarum))); e outro na porção sul (Phyllomys sp. 3 ((Phyllomys sp. 1, P. lundi), (Phyllomys sp. 5 (P. dasythrix (P. nigrispinus (P. sulinus, Phyllomys sp. 6)))))). Foram identificadas duas linhagens independentes representando possíveis espécies novas, elevando o potencial número de espécies do gênero de 17 para 19. As filogenias associadas aos dados de distribuição geográfica sugerem que a diversificação e distribuição das espécies de Phyllomys foi influenciada pela ação conjunta de vários fatores como atividade neotectônica, gradientes altitudinais e latitudinais e mudanças climáticas que atuaram desde o Mioceno, marcando os primeiros eventos de diversificação do gênero até as especiações mais recentes, no Pleistoceno. O terceiro capítulo avalia a variação genética, distribuição geográfica e status taxonômico da espécie Euryzygomaotmys spinosus utilizando dois marcadores mitocondriais (CitB e D-loop). Os resultados mostraram que E.spinosus apresenta distribuição em áreas de Mata Atlântica e adjacências ao sul do Rio Doce, no Brasil, Paraguai e Argentina, incluindo um registro confirmado no Cerrado. A espécie ocupa habitats muito diversos e pode ser considerada generalista. As populações são geneticamente estruturadas ao longo da sua distribuição e os dados genéticos corroboram a taxonomia atual que considera apenas uma espécie, E. spinosus, para o gênero. / The Neotropical rodents of the Echimyidae family are the most diverse among the Caviomorpha clade. Little is known about the geographic range, natural history and evolution of several Echimyidae members, despite its high diversity. The taxonomic history of the family is confusing and some groups are rare in scientific collections, resulting in less conclusive inferences about evolutionary and biological traits, which are based on a few individuals. Molecular phylogenies do not support the taxonomic classification based on morphological traits, highlighting the complexity of the evolutionary history of this group. Five Echimyidae genera occur within the Atlantic Forest range: the bamboo-rat, Kannabateomys; the arboreal Phyllomys and Callistomys; the terrestrial Trinomys; and the semi-fossorial Euryzygomatomys. In the present study I used DNA sequences to investigate the phylogeny and evolutionary history of three echimyids from the Atlantic Forest at three different taxonomic levels: family, genus, and species. The first chapter investigates the phylogenetic position of Callistomys within Echimyidae using sequences of one mitochondrial (CytB) and three nuclear (GHR, RAG1 and vWF) markers. The results show that Callistomys forms a clade with the semi-aquatic coypu (Myocastor) from the grasslands in the southern South America and terrestrial spiny rats (Proechimys) from the Amazon forest. This clade is sister to Thrichomys, a terrestrial rat from the dry lands of central South America. These clades are unexpected, given the contrasting morphology, ecology, and geographic ranges of its members. The resulting echimyid phylogeny indicates that Callistomys is not closely related to the other arboreal echimyids, and suggest that arboreal habits evolved more than once in this family. The second chapter investigates aspects of the phylogeny, evolution and species limits in the genus Phyllomys using two mitochondrial (CytB and COI) and three nuclear (GHR, RAG1 and vWF) markers. Three main species groups were identified: one with a longitudinal distribution through the central portion of the Atlantic Forest (P. pattoni (P. mantiqueirensis, Phyllomys sp. 4)); one blainvilii (P. brasiliensis, P. lamarum))) and another along the southern portion (Phyllomys sp. 3 ((Phyllomys sp. 1, P. lundi), (Phyllomys sp. 5 (P. dasythrix (P. nigrispinus (P. sulinus, Phyllomys sp. 6)))))). Two independent evolutionary linages were identified, probably representing new species, raising the potential number of Phyllomys species from 17 to 19. These phylogenies, together with geographic distribution data, suggest that the diversification and distribution of Phyllomys species were affected by the concomitant action of different factors, such as neotectonics, altitudinal and latitudinal gradients, and climate change acting since the Miocene, underlining the first diversifications within Phyllomys until more recent speciation events, during the Pleistocene. The third chapter explores the genetic variation, geographic distribution and taxonomic status of the species Euryzygomatomys spinosus using two mitochondrial markers (CytB and D-loop). The results show that E. spinosus is distributed along the Atlantic Forest and surrounding areas, south of the Rio Doce in Brazil, Paraguay, and Argentina, including a confirmed occurrence in the Cerrado. This species occupies very distinct habitats and may be consider a generalist. The populations are genetically structured along its distribution and the genetic data corroborate the current taxonomy, which considers only one species in the genus, E. spinous.