1 |
Modeling Equilibrium Salt Partitioning in Neosepta AMX and Selemion AMV Antion Exchange MembranesMalewitz, Timothy January 2009 (has links)
No description available.
|
2 |
Anime Music Videos and Storytelling: Performing Channels of CommunicationHarris, Sabra 27 October 2016 (has links)
Anime Music Videos (AMVs) are transformative works that provide channels of communication between the viewer and the viewed. The editors who make AMVs have distinct communities built on the evolution of anime conventions in the United States but have prospered and transformed globally. In the performance of technology, AMV editors find ways of using mass-mediated texts to express themselves, to convey emotions, and to communicate social messages. They make new associations by combining materials and display these associations in sophisticated ways on social forums like the Internet and anime conventions. The associations are interpretive and articulate how storytelling, rather than a fixed and linear one-way flow, is nonlinear, a negotiation between the storytelling performer and audience.
|
3 |
Vicilina de sementes da leguminosa selvagem Anadenanthera macrocarpa: purifica??o, caracteriza??o, efeito delet?rio e mecanismo de a??o para Callosobruchus maculatusFran?a, Anderson Felipe J?come de 29 October 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:03:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1
AndersonFJF_DISSERT.pdf: 1523854 bytes, checksum: fcaa34d5302cf667d8de6933e27ac7c5 (MD5)
Previous issue date: 2013-10-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Grains and legume seeds are foods that form the basis of the diets of many cultures
around the world, winch contritbute to the daily nutrient requirements of humans.
Vicilins (7S globulin) are storage proteins found in legume seeds, and may have an
additional function constitutive defense of the embryo against pests and pathogens.
In this work the vicilin from Anadenanthera macrocarpa - AmV (red-angico), was
purified and partially characterized, its effect on development and larval survival and
adult emergence of Callosobruchus maculatus was evaluated by determination of
LD50, WD50 and ED50 in system bioassay. Purification of vicilin was initiated by the
chitin affinity chromatography and then gel filtration (Superdex 75 Tricorn 10x300
mm) FPLC system followed by reverse phase chromatography (C8 phenomenex) on
HPLC system. Bioassays WD50 and LD50 for larvae were 0.32% and 0.33% (w:w)
respectively, since the ED50 for adults was 0.096%. The probable mechanism of
action was evaluated by testing digestibility of AmV in vitro, and observed for the
involvement of two fragments vicilins immunoreactive against polyclonal Anti-vicilin
from Erythrina velutina (Anti-EvV) about of 22 and 13 kDa chitin binding. The AmV in
its native form has been recognized by the anti-EvV, indicating that there is a
conserved region in the vicilin and is probably corresponding to the chitin binding
domains. These results point to a new vicilin chitin binding that can subsequently be
used as a possible biopesticide protein source, in order to control insect pest C.
maculatus and confirm literature findings that demonstrate vicilin in the presence of
different kinds of ligands to conserved regions chitin not yet characterized / Sementes de leguminosas s?o alimentos que comp?em a base das dietas de
diversas culturas ao redor do mundo, tendo uma importante contribui??o nas
necessidades di?rias de nutrientes dos seres humanos. As globulinas 7S (vicilinas)
s?o prote?nas de reserva encontradas em sementes de leguminosas, e podem
apresentar uma fun??o adicional de defesa constitutiva do embri?o contra pragas e
pat?genos. Neste trabalho uma vicilina de Anadenanthera macrocarpa - AmV
(Angico-vermelho), foi purificada e parcialmente caracterizada. Seu efeito sobre o
desenvolvimento, sobreviv?ncia larval e emerg?ncia dos adultos de Callosobruchus
maculatus foram avaliados pela determina??o das LD50, WD50 e ED50 em sistema de
bioensaio. A purifica??o da vicilina foi iniciada por cromatografia de afinidade ?
quitina e posteriormente em cromatografia de gel filtra??o Superdex 75 Tricorn
10x300 mm no sistema de FPLC, seguida por cromatografia de fase reversa C8
phenomenex em sistema HPLC. Por SDS-PAGE, AmV dissociou-se em quatro
subunidades principais com aproximadamente 73, 70, 43 e 41 kDa, e quando
submetida ? eletroforese a 12% em condi??es nativas apresentou uma banda ?nica
de caracter?stica eletrofor?tica ?cida. Nos bioensaios, a WD50 e a LD50 para as larvas
foram de 0,32% e 0,33% (p:p) respectivamente, j? para os adultos a ED50 foi de
0,096%. O prov?vel mecanismo de a??o foi avaliado por ensaios de digestibilidade
da AmV in vitro, sendo observado o envolvimento de dois fragmentos de vicilinas
imunorreativos contra anticorpo policlonal Anti-vicilinas de Erythrina velutina (Anti-
EvV), de aproximadamente 22 e 13 kDa ligantes ? quitina. A AmV na sua forma
nativa foi reconhecida pelo anticorpo anti-EvV, indicando que existe uma provavel
regi?o conservada nas vicilinas, que pode corresponder ? dom?nios de liga??o ?
quitina. Estes resultados apontam para uma nova vicilina que pode vir a ser utilizada
como um poss?vel bioinseticida de origem proteica, de maneira a controlar o inseto
praga C. maculatus, bem como corroborar com achados da literatura que
demonstram em vicilinas de diferentes esp?cies a exist?ncia de regi?es conservadas
ligantes ? quitina ainda n?o caracterizados
|
4 |
RECEPTOR LIKE KINASE ACTIVITY MODULATES VIRAL INFECTION THROUGH PHOSPHORYLATION OF A CHLOROPLAST PROTEINLongfei Wang (9661535) 15 December 2020 (has links)
<p>An increasing number of chloroplast proteins have been found
to interact with plant virus proteins. This is not surprising because these
viruses cause various mosaic, mottles, and chlorosis symptoms on host leaves
indicating damage to chloroplasts. A chloroplast protein, AtPsbP, was
identified in a yeast two-hybrid screen as interacting with <i>Alfalfa mosaic
virus</i> (AMV) coat protein (CP). AMV is a ssRNA virus with a wide host range
including Arabidopsis. AtPsbP is an
extrinsic subunit of photosystem II and with PsbQ is vital for water oxidation.
We found that an RNAi knock-down of PsbP in <i>Nicotiana tabacum</i>, allowed
increased replication of AMV and the development of quite severe disease
symptoms in comparison to a wild-type <i>N. tabacum</i>. This suggested that
PsbP plays an important role in plant resistance to AMV. PsbP, in addition to
its role in photosynthesis, has been reported to interact with a
wall-associated receptor kinase, WAK1, whereby it may affect plant defense
signaling. We found that AtPsbP is a link between AtWAK1 and AMV CP at the
plasma membrane. The formation of the AtWAK1-AtPsbP-AMV CP complex activated
WAK1 kinase activity causing phosphorylation of PsbP and significant inhibition
of AMV replication. We also found that the formation of the ternary complex
induced the activation of the MAPK signal pathway. Analysis of the
susceptibility of an Arabidopsis WAK1 knock-down indicated that WAK1, like
PsbP, is critical for inhibiting AMV replication. Overall, we found a unique
virus perception strategy, whereby a chloroplast protein (PsbP) interacts with
a virus protein and then a Receptor-like kinase protein (WAK1) to transduce
signals through the MAPK signaling pathway to activate defense responses.</p>
|
5 |
Framtagning av jämförande mät- och analysmetod för att studera komfort i barnvagnar : Ett arbete om hur komfort med avseende på vibrationerkan mätas och analyseras komparativtTörn, Mikael, Påhlsson, Noah January 2023 (has links)
This study seeks to take a closer look at how to create a reliable and repeatable method for comparative measurement and analysis of comfort regarding vibrations in strollers.To achieve this goal the study has been divided in three questions that focuses on established standards and previous studies, a construction of a measurement method and finally a construction of a data analysis method. To answer these questions the study uses information gathered from a literature study, conducted experiments as well as an analysis of quantitative data via descriptive statistics and thematic analysis. Furthermore, during the development of the comparative method the authors has made use of various workshops to generate ideas and evaluate the best course of action. This has allowed for rapid iteration of the method that is presented in this report.To make a comparison with previous studies possible, ISO-2631:1, ISO-102361:1 and the Swedish Work Environment Authority’s regulations regarding whole body vibration are used as a foundation for the decisions made. The final method is presented in its entirety, both regardingmeasurement and data analysis. This study also displays an example of how both methods can be used to compare strollers.Additionally, the report applies the developed method on a selection of Thules’ and their competitors’ strollers. For the purpose of anonymity, the strollers’ brand and names has beenreplaced with code names and taken pictures has been replaced by illustrations.Finally, the results of the report is analyzed and discussed to compare the decisions taken throughout the process with each other as well as with the current standards, regulations and previous studies. Moreover, a conclusion in made that the presented methodology is a fair toolfor measurement of the passengers’ comfort with regard whole body vibrations in strollersduring activity. The resulting data is directly comparable on a case-by-case basis, but caution is advised if comparisons are to be made with the guidelines provided in presented standards or the regulations regarding whole body vibration, as these are not adapted for measurementsconducted with children.
|
6 |
Thermal comfort conditions and perception by staff and patients in a Swedish health care center : A measurement and survey field study for summer conditionsHasan, Md Mahmudul January 2020 (has links)
A challenging aspect of modern global development is to provide desired thermal environment for building occupants with optimum consideration of energy and occupants health and satisfaction, both physically and psychologically. The variation of activity level, health condition, needs, clothing habit and staying time of different categories of occupants in hospitals makes it critical where comfort level should be optimized. Now-a-days, tremendous changing on climate makes even more challenging to maintain optimum level of indoor thermal environment at low energy cost. Thermal comfort can be assessed by the well-established PMV- PPD model, and studies on the correlation with AMV ratings from the occupants can help to understand the exact scenario of the thermal comfort. Therefore, this research aims to estimate the thermal comfort level of healthcare occupants, compare PMV-PPD values with AMV for different categories of occupants, and analyze optimum operative temperature for energy savings. A combination of objective measurements and a field study with a semi-structured interview on comfort perception, following ISO-7726, 7730, 8996, 9920, 10551 and ASHARE- 55 regulations, were conducted, where a total number of 56 occupants, including 35 patients, 5 visitors and 16 medical staffs were participated from a health care center of a hospital in Stockholm, Sweden. The data was collected during the summertime. Based on studied thermal environment, both PMV (-1.59 to 1.01) and AMV range (-2 to 1) considering gender, indicated health care center of studied hospital toward slightly cold, where occupants wanted warmer indoor environment. Patients more than 60 years were most sensitive on thermal comfort and overall patients were more sensitive for warm indoor climate than medical staff due to health condition and age. But male respondents were less sensitive than female. PMV and AMV with optimum operative temperature provides the clear idea about optimum thermal environment for the hospitals occupant. Identifying an optimum thermal environment could be a sustainable solution if and only if energy can be reduced.
|
7 |
L-Lysine Decarboxylase and Cadaverine Gamma-Glutamylation Pathways in Pseudomonas Aeruginosa PAO1Chou, Han Ting 14 December 2011 (has links)
In comparison to other Pseudomonas, P. aeruginosa grows poorly in L-lysine as a sole source of nutrient while fast growth mutants can be obtained. The proposed catabolic pathway involves lysine decarboxylation to cadaverine and its subsequent degradation through g-glutamylation pathway to d-aminovalerate and glutarate. The lysine decarboxylase A (ldcA) gene, previously identified as a member of the ArgR regulon of L-arginine metabolism, was found essential for L-lysine catabolism. The ldcA gene encodes a decarboxylase which takes L-lysine but not L-arginine as substrate. Contrarily, the ldcA expression was inducible by L-arginine but not by L-lysine. This peculiar arginine control on lysine utilization was also noted from uptake experiments. The lack of lysine-responsive control on lysine catabolism and its tight connection to arginine regulatory network provided an explanation of lysine as poor nutrient for P. aeruginosa. Catabolism of cadaverine, a product from lysine decarboxylation, was investigated and compared to that of putrescine, another diamine of similar biochemical properties that is derived from arginine and ornithine. While the g-glutamylation pathway was first reported in E. coli for putrescine utilization, an expanded version of this pathway was found in P. aeruginosa with redundant enzymes for polyamine degradation. The PauR protein was identified as a transcriptional repressor of genes for the catabolism of putrescine and cadaverine, as well as their corresponding downstream metabolites, g-aminobutyrate (GABA) and d-aminovalerate (AMV). PauR shows distinct dimer configuration after glutaraldehyde crosslinkage, and possible conformational changes could be triggered by the presence of putrescine and cadaverine, but not GABA. A newly identified ABC transport system, encoded by the agtABCD operon, was found important for the uptake of GABA and AMV; and expression of which is controlled by the AgtSR two-component system. The CbrAB two-component system was proposed to regulate the catabolite repression control protein Crc through a small RNA CrcZ. A consensus CbrB recognition sequence was proposed based on the conserved palindromic nucleotide sequence in the upstream activating sequence of the crcZ promoter. Genetic studies indicated utilization of arginine, lysine and diamines (but not histidine, GABA and AMV) might be under CbrAB regulation through the CbrAB/CrcZ/Crc system in P. aeruginosa.
|
8 |
Involvement of the host RNA N6-adenosine methylation (m6A) pathway in the infection cycle of Alfalfa mosaic virusMartínez Pérez, Mireya 27 November 2020 (has links)
[ES] Las modificaciones químicas post-transcripcionales implican un nuevo nivel de modulación de la expresión génica. Al comienzo de esta Tesis, algunos componentes del complejo de metilación del nitrógeno en posición 6 de la adenosina (m6A) habían sido caracterizados en plantas. Sin embargo, a diferencia de mamíferos y levadura, ninguno de los 13 homólogos de AlkB (atALKBH1-10B) - potenciales desmetilasas (o erasers) - y las 13 proteínas de la familia YTH (ECT1- 11, AT4G11970 y CPSF30) - potenciales proteínas de reconocimiento de m6A (o readers) - identificadas en el genoma de Arabidopsis se habían caracterizado funcionalmente. Además, varios estudios describen la presencia de m6A en RNAs de virus de mamíferos y las diferentes funciones que desempeña esta modificación en la regulación de esas infecciones. No obstante, no se ha estudiado la posible implicación de este mecanismo molecular en las infecciones virales de plantas. El descubrimiento de la interacción entre la CP del virus del mosaico de la alfalfa (AMV) y una proteína de Arabidopsis (atALKBH9B) con homología a una eraser humana fue el punto de partida de esta Tesis. En este trabajo se confirma esta interacción, y se demuestra que atALKBH9B también puede reconocer los RNAs virales. Los resultados revelan que atALKBH9B tiene la capacidad de desmetilar m6A a partir de moléculas de RNA monocatenario in vitro. Esta proteína se acumula en gránulos citoplasmáticos que se colocalizan con siRNA bodies y se asocian a P-bodies, lo que sugiere que su actividad podría estar relacionada con el silenciamiento y/o degradación de mRNA. Por otro lado, ensayos preliminares muestran que los RNAs del AMV, el virus del mosaico del pepino (CMV), el virus de la arruga del nabo (TCV) y el virus del mosaico de la coliflor (CaMV) se metilan durante la infección en Arabidopsis. Además, para AMV y CMV, los resultados fueron corroborados por UPLC-PDA-Tof-MS y los sitios m6A a lo largo de los RNAs del AMV fueron identificados mediante MeRIP-seq. Los resultados presentados confirman que la relación m6A/A a lo largo de los RNAs virales aumenta en plantas atalkbh9b en comparación con las silvestres, mientras que la traducción y/o replicación se ven afectadas y el movimiento sistémico a los tallos florales está prácticamente bloqueado. A diferencia de la CP de AMV, la de CMV no interacciona con atALKBH9B por Y2H y, como ocurre con el resto de virus analizados (CMV, TCV y CaMV), su ciclo de infección no se ve afectado en plantas atalkbh9b. Además, la secuenciación de mRNA realizada en este trabajo revela que la infección por AMV induce algunos genes de Arabidopsis pertenecientes a la maquinaria m6A, MTA, MTB, VIR y ECT5. De acuerdo con el efecto antiviral dependiente de m6A para el AMV y teniendo en cuenta que ECT2, ECT3 y ECT4 fueron recientemente caracterizadas como readers citoplasmáticas, la supresión del módulo ECT2/ECT3/ECT5 aumenta significativamente los títulos sistémicos de AMV y CMV. El efecto antiviral de ECT2 sobre AMV parece estar modulado por su unión directa a los residuos de m6A presentes en los RNAs virales, ya que un mutante de ECT2 defectuoso en el reconocimiento de m6A pierde la actividad antiviral que sí presenta la proteína original y no es capaz de arrastrar RNAs virales in vivo. Por otro lado, acorde a la localización previamente descrita para ECT2 y ECT4 y la capacidad de ECT2 para experimentar una fase similar al gel in vitro, la expresión transitoria de ECT5 muestra un patrón citoplasmático con formación de agregados. Se propone que, como se ha descrito para las proteínas YTH de mamíferos, la interacción entre las ECTs y el RNA polimetilado (en este caso, RNA viral) promovería la formación de gránulos de estrés y, en consecuencia, reduciría las tasas de traducción y replicación viral. En resumen, en este trabajo se caracteriza la primera m6A eraser de plantas, atALKBH9B, y, por primera vez, se describe la influencia del mecanismo de metilación m6A en las infecciones virales de plantas. / [EN] Post-transcriptional chemical modifications entail a new level of gene expression modulation. At the beginning of this Thesis, some components of the N6-adenosine methylation (m6A) complex had been characterized in plants, whereas 13 homologs of AlkB (atALKBH1-10B) - putative demethylases (or erasers) - and 13 proteins of the YTH family (ECT1-11, AT4G11970 and CPSF30) had been identified in the Arabidopsis genome. However, unlike mammals and yeast, no functional roles had been described for any of these proteins. Besides, several reports have brought to light the presence of m6A residues in viral RNAs from mammalian viruses and the critical roles that this modification plays regulating viral infections. However, the potential relevance of this molecular mechanism on plant viral infections remained fully unexplored.
The discovery of the interaction between the AMV CP and an Arabidopsis protein (atALKBH9B) with similarity to a human eraser was the starting point of this Thesis. Here, this interaction is confirmed and it is demonstrated that atALKBH9B can also recognize the viral RNAs. Furthermore, the obtained results prove that atALKBH9B has the capability of demethylating m6A from single-stranded RNA molecules in vitro. This protein was observed to accumulate in cytoplasmic granules that colocalize with siRNA-bodies and associate to P-bodies, suggesting that atALKBH9B activity could be related to mRNA silencing and/or decay processes. On the other hand, preliminary assays show that viral RNAs of AMV, Cucumber mosaic virus (CMV), Turnip crinkle virus (TCV) and Cauliflower mosaic virus (CaMV) become methylated during infection in Arabidopsis. Besides, for AMV and CMV, the results were corroborated by UPLC-PDA-Tof-MS and m6A sites along the RNAs of AMV were identified through MeRIP-seq approach. The results presented here confirm that m6A/A ratio along viral RNAs is increased in atalkbh9b plants compared to wild type, whereas translation and/or replication are impaired and systemic movement to the floral stems is practically blocked. In contrast to AMV, CMV CP does not interact with atALKBH9B by Y2H and, as it occurs with the rest of the assayed viruses (CMV, TCV and CaMV), its infection cycle is not affected in atalkbh9b plants.
Furthermore, the mRNA-seq analysis performed in this Thesis reveals that some Arabidopsis factors belonging to the m6A machinery, MTA, MTB, VIR and ECT5 genes, are upregulated upon AMV infection. Consistent with the m6A-dependent antiviral effect for AMV and considering that ECT2, ECT3 and ECT4 were recently characterized as cytoplasmic m6A readers, mutations of ECT2/ECT3/ECT5 Arabidopsis module significantly increase AMV and CMV systemic titers. The antiviral effect of ECT2 on AMV seems to be modulated via its direct binding to the m6A residues presented in the viral RNAs, since an ECT2 mutant defective in m6A recognition loses wild type antiviral activity and is not able to pull down viral RNAs in vivo. On the other hand, according to the previous subcellular localization described for ECT2 and ECT4 and the ability of ECT2 to undergo gel-like phase in vitro, the transitory expression of ECT5 displays a cytoplasmic pattern with the formation of some aggregates. As found for mammal YTH proteins, the interaction between ECTs and poly-methylated RNA (in this case viral RNA) is proposed to promote the formation of stress granules and, consequently, reduce viral translation and replication rates.
In summary, in this work, atALKBH9B is reported as the first m6A eraser identified in plants and, for the first time, it is described the influence of m6A methylation mechanism in plant viral infections. / [CA] Les modificacions químiques post-transcripcionals impliquen un nou nivell de modulació de l'expressió gènica. Al començament d'esta Tesi, s'havien caracteritzat alguns components del complex de metilació del nitrogen en posició 6 de la adenosina (m6A) en plantes. No obstant això, a diferència de mamífers i llevat, cap dels 13 homòlegs d'AlkB (atALKBH1-10B) - potencials desmetilases (o erasers) - i les 13 proteïnes de la família YTH (ECT1- 11, AT4G11970 i CPSF30) - potencials proteïnes de reconeixement de m6A (o readers) - identificades en el genoma d'Arabidopsis s'havien caracteritzat funcionalment. A més, diversos estudis han descrit la presència de residus m6A en RNAs de virus de mamífers i les diferents funcions que exercix esta modificació en la regulació de les infeccions virals. No obstant això, no s'ha estudiat la possible implicació d'este mecanisme molecular en les infeccions virals de plantes. El descobriment de la interacció entre la CP del virus del mosaic de l'alfals (AMV) i una proteïna d'Arabidopsis (atALKBH9B) amb homologia a una eraser humana va ser el punt de partida d'esta Tesi. En este treball es confirma esta interacció, i es demostra que atALKBH9B també pot reconéixer els RNAs virals. Els resultats revelen que atALKBH9B té la capacitat de desmetilar m6A a partir de molècules de RNA monocatenari in vitro. Esta proteïna s'acumula en grànuls citoplasmàtics que es colocalitzen amb siRNA bodies i s'associen a P-bodies, la qual cosa suggerix que l'activitat atALKBH9B podria estar relacionada amb els processos de silenciament i/o degradació de mRNA. D'altra banda, assajos preliminars mostren que els RNAs virals de l'AMV, el virus del mosaic del cogombre (CMV), el virus de l'arruga del nap (TCV) i el virus del mosaic de la coliflor (CaMV) es metilen durant la infecció en Arabidopsis. A més, per AMV i CMV els resultats van ser confirmats per UPLC-PDA-Tof-MS i els llocs m6A al llarg dels RNAs d'AMV s'identificaren mitjançant MeRIP-seq. Els resultats presentats confirmen que la relació m6A/A al llarg dels RNAs virals augmenta en les plantes atalkbh9b en comparació amb les silvestres, mentre que la traducció i/o replicació es veuen afectades i el moviment sistèmic a les tiges florals està pràcticament bloquejat. A diferència de la CP d'AMV, la de CMV no interacciona amb atALKBH9B per Y2H i, com ocorre amb la resta dels virus analitzats (CMV, TCV i CaMV), el seu cicle d'infecció no es veu afectat en plantes atalkbh9b. A més, la seqüenciació de mRNA realitzada en este treball revela que la infecció per AMV indueix alguns gens d'Arabidopsis pertanyents a la maquinària m6A, MTA, MTB, VIR i ECT5. D'acord amb l'efecte antiviral dependent de m6A per a l'AMV i tenint en compte que ECT2, ECT3 i ECT4 van ser recentment caracteritzades com readers citoplasmàtiques, la supressió del mòdul ECT2/ECT3/ECT5 augmenta significativament els títols sistèmics d'AMV i CMV. L'efecte antiviral d'ECT2 sobre AMV sembla estar modulat a través de la seua unió directa als nucleòtids m6A presents en els RNAs virals, ja que un mutant de la proteïna ECT2 defectuós en el reconeixement de m6A perd l'activitat antiviral que sí que presenta la proteïna original i no és capaç d'arrossegar RNAs virals in vivo. D'altra banda, d'acord amb la localització subcel·lular descrita prèviament per a ECT2 i ECT4 i la capacitat d'ECT2 per a experimentar una fase similar al gel in vitro, l'expressió transitòria d'ECT5 mostra un patró citoplasmàtic amb la formació d'agregats. Es proposa que, com s'ha descrit per a les proteïnes YTH de mamífers, la interacció entre les ECTs i el RNA polimetilat (en aquest cas, RNA viral) promouria la formació de grànuls d'estrès i, en conseqüència, reduiria les taxes de traducció i replicació viral. En resum, en este treball es caracteritza la primera m6A eraser de plantes, atALKBH9B, i, per primera vegada, es descriu la influència de l'mecanisme de metilació M6A en les infeccions virals de plantes. / Martínez Pérez, M. (2020). Involvement of the host RNA N6-adenosine methylation (m6A) pathway in the infection cycle of Alfalfa mosaic virus [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/155976
|
9 |
Proteínas de movimiento de la familia 30K:interacción con membranas biológicas y factores proteicos y su implicación en el transporte viralPeiró Morell, Ana 30 March 2015 (has links)
Para que el proceso infeccioso de un virus de plantas tenga éxito la progenie
viral tiene que propagarse desde las primeras células infectadas al resto de la planta;
inicialmente se moverá célula a célula a través de los plasmodesmos (PDs) hasta
alcanzar el sistema vascular, lo cual le permitirá invadir las partes distales de la planta.
En este proceso, las proteínas de movimiento (MPs), junto con la colaboración de otros
actores secundarios, desempeñan un papel relevante. El conocimiento de la posible
asociación de las MPs con estructuras u orgánulos celulares así como de la interacción
con factores del huésped es de vital importancia para poder desarrollar estrategias
antivirales que permitan una mejora en la producción de los cultivos. Además, este tipo
de estudios no sólo han posibilitado un mayor conocimiento de las respuestas al estrés
en plantas sino que han sido pioneros en desentrañar los mecanismos de translocación
intercelular de factores celulares implicados en los procesos de desarrollo de las
plantas.
Las MPs virales se clasifican en familias/grupos en función de su grado de
similitud. Los virus, cuyas MPs pertenecen a la Superfamilia 30K, expresan una única MP
encargada de orquestar el movimiento intra- e intercelular de genoma viral. En el
Capítulo 1 de la presente Tesis se ha caracterizado la asociación de la MP del Virus del
mosaico del tabaco (TMV), miembro tipo de la familia 30K, al sistema de
endomembranas. Mediante el uso de aproximaciones in vivo se ha estudiado la
eficiencia de inserción de sus regiones hidrofóbicas (HRs) en la membrana del retículo
endoplasmático (ER). Nuestros resultados demuestran que ninguna de las dos HRs de la
MP es capaz de atravesar las membranas biológicas y que la alteración de la
hidrofobicidad de la primera HR es suficiente para modificar su asociación a la
membrana. En base a los resultados obtenidos, proponemos un modelo topológico en
el cual la MP del TMV se encontraría fuertemente asociada a la cara citosólica de la
membrana del ER, sin llegar a atravesarla. La observación de que i), el modelo
propuesto es compatible con otros motivos, previamente caracterizados, de la MP de
TMV y ii), concuerda con la topología descrita para otras MPs de la familia 30K, permite
cuestionar el modelo establecido desde el año 2000 para la MP de TMV así como
predecir, en base a la conservada estructura secundaria de las MPs de esta familia, una
topología similar para todos sus componentes.
Para el transporte intercelular de los virus de plantas se han descrito tres
modelos en base a la capacidad de transportar complejos ribonucloeprotéicos, a través
de PD modificados, formados por el RNA viral y la MP (ej. MP de TMV) más la proteína
de cubierta (ej. MP del virus del mosaico del pepino, CMV) o la capacidad de transportar
viriones a través estructuras tubulares formadas por la MP (ej. MP del Virus del mosaico
del caupí, CPMV). A pesar de las diferencias observadas entre los tres modelos, las MPs
representativas de cada uno de ellos pertenecen a la misma familia 30K y son
funcionalmente intercambiables (MPs de TMV, CMV, CPMV, Virus del mosaico del
Bromo -BMV- o Virus de los anillos necróticos de los prunus -PNRSV-) por la MP del Virus
del mosaico de la alfalfa (AMV), para el transporte a corta distancia. Con el objeto de
comprender la versatilidad que presentan las MPs en cuanto al movimiento viral,
hemos analizado la capacidad de estas MPs heterólogas de transportar sistémicamente
el genoma quimérico del AMV. El estudio ha revelado que todas las MPs analizadas
permiten el transporte del genoma quimera a las partes distales de la planta,
independientemente del modelo descrito para el transporte a corta distancia, aunque
requieren la extensión de los 44 aminoácidos C-terminales de la MP del AMV. Además,
para todas las ellas, excepto para la MP del TMV, se ha establecido una relación entre la
capacidad de movimiento local y la presencia del virus en las hojas no inoculadas de la
planta, indicando la existencia de un umbral de transporte célula a célula, por debajo
del cual, el virus es incapaz de invadir sistémicamente la planta.
Durante el proceso de infección viral, las MPs interaccionan tanto con otras
proteínas de origen viral como de la planta huésped. La interacción entre las MPs y
dichos factores de la planta afectan a la patogénesis viral, facilitando u obstaculizando
el movimiento intra- o intercelular del virus. En el Capítulo 3 del presente trabajo hemos
demostrado la interacción entre la MP del AMV y dos miembros de la familia de
Patellinas de arabidopsis, Patellin 3 (atPATL3) y Patellin 6 (atPATL6), mediante el
sistema de los dos híbridos de levadura y ensayos de reconstitución bimolecular de la
fluorescencia. Nuestros resultados, en general, demuestran que la interacción entre la
MP-PATLs obstaculizaría un correcto direccionamiento de la MP al PD, dando lugar a un
movimiento intracelular menos eficiente de los complejos virales, que forma la MP, y
disminuyendo el movimiento célula a célula del virus. Podríamos estar hablando de un
posible mecanismo de defensa de la planta, dirigido a evitar la invasión sistémica del
huésped. En este sentido, las MPs virales pueden ser buenos candidatos para el
desarrollo de estrategias antivirales dado que cualquier respuesta de defensa de la
planta que, a priori, reduzca el transporte célula a célula del virus, puede representar la
diferencia entre una infección local o sistémica, como hemos observado en el Capítulo 2
del presente trabajo. Los virus, a su vez, también son capaces de evolucionar hacia
variantes más eficaces, que permitan superar las diferentes barreras defensivas de la
planta huésped. En este contexto hemos identificado a la MP del Virus del bronceado
del tomate (TSWV) como determinante de avirulencia en la resistencia mediada por el
gen Sw-5. Del mismo modo, comprobamos que el cambio de 1-2 residuos de amino
ácidos de la MP de TSWV fue suficiente para superar la resistencia pero que a la vez, y
posiblemente debido a las altas restricciones que conlleva el reducido genoma de un
virus, afectaron a la eficiencia de la MP. / Peiró Morell, A. (2014). Proteínas de movimiento de la familia 30K:interacción con membranas biológicas y factores proteicos y su implicación en el transporte viral [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/48471 / TESIS
|
Page generated in 0.0161 seconds