A presença de Ad com competência para replicar (RCA, replication-competent adenovirus) nas preparações é um dos maiores problemas para a produção de Ad em larga escala. RCAs são gerados pela recombinação entre seqüência do vetor e seqüência homóloga do gene E1 presente nas células helper. Objetivo: desenvolver uma nova linhagem auxiliar para produção de Ad livre de RCA - LEY79 - derivada da linhagem de retinoblastoma humano Y79, tratando-se da primeira linhagem empacotadora de adenovírus com inativação mutacional da proteína supressora de tumor pRb, que crescem em suspensão. Células Y79 foram infectadas com o retrovírus pCLDE1A/E1BSN, selecionadas com G418. A eficiência de produção de AdeGFP na linhagem LEY79 foi testada e comparada com a HEK293A. Células Y79 foram adaptadas em meio livre de soro. Esperamos com a linhagem LEY79SF inovar no campo de processos para a produção de Ad recombinante. / The presence of Ad with the ability to replicate (RCA, replication-competent adenovirus) in preparations is a major problem in the large-scale production of Ad. RCAs are generated by recombination between the vector sequence and sequence of the homologous gene in E1 helper cells. Objective: To develop a new helper cell line for the production of RCA-free Ad., called LEY79, derived from the Y79 of human retinoblastoma line, the first line Packer adenovirus with mutational inactivation of the tumor suppressor protein pRb, which are adapted to grow in suspension. Y79 cells were infected with the retrovirus pCLDE1A/E1BSN, selected with G418. The efficiency of production of AdeGFP in the LEY79 was tested and compared with the HEK293A. Y79 cells were adapted to grow in serum-free medium. We hope that use of the the LEY79SF cell line will promote innovation in the processing and production of recombinant Ad.

Adenovirus humanos são responsáveis por infecção respiratória aguda (IRA) em crianças e adultos, sendo os das espécies B e C mais frequêntes. Com o objetivo de estudar a variabilidade genética de HAdVs, 3087 amostras de aspirado de nasofaringe foram colhidas de crianças, em São Paulo, de 1995 à 2006. A PCR direcionada ao gene VA-RNA detectou 677 adenovírus (22%). O sequenciamento dos genes hexon, fibra e região E3 foram utilizados para determinar os sorotipos e estudar sua variabilidade genética. Dos 677 adenovírus, 69% são da espécie B, 23% da C e 0,7% da E. Variabilidades genéticas foram observadas em todas as regiões estudadas, por meio de mutações, evidenciadas por substituições, recombinações e deleções. Os genes que apresentaram maior variabilidade foram VA-RNA e E3 ORF7.7. Genomas virais de DNA, como dos adenovírus, podem se manter estáveis em condições diversas, contudo, a pressão sofrida por esses genomas, através da resposta imunológica do hospedeiro, fazem com que seu mecanismos evolutivos entrem em operação e variabilidades genéticas sejam observadas. / Human adenoviruses (HAdV) cause acute respiratory disease (ARD) in children and adults, being the adenovirus from species B and C the most frequently detected. With the aim of study the genetic variability of HAdV, 3087 nasopharyngeal aspirate were collected from children in São Paulo, from 1995 to 2006. PCR assay directed to adenovirus VA-RNA gene detected 677 HAdV (22%). Sequencing of the hexon and fiber genes and the E3 region were done to determine the serotypes and study genetic variability. Among the 677 adenoviruses detected 69 % were classified as species B, 23% as species C and 0,7 % as species E. Genetic variability was observed in all studied region, specially at the 7.7Orf of the E3 region and the VA-RNA gene. Genetic modifications were observed as recombination, substitutions and deletions. It is known that viral DNA genomes, as adenovirus, remain genetically stable under a variety of conditions, however, the pressure of the host on these viruses make that their evolutionary mechanisms come to operation and genetic variability are observed.

A presença de Ad com competência para replicar (RCA, replication-competent adenovirus) nas preparações é um dos maiores problemas para a produção de Ad em larga escala. RCAs são gerados pela recombinação entre seqüência do vetor e seqüência homóloga do gene E1 presente nas células helper. Objetivo: desenvolver uma nova linhagem auxiliar para produção de Ad livre de RCA - LEY79 - derivada da linhagem de retinoblastoma humano Y79, tratando-se da primeira linhagem empacotadora de adenovírus com inativação mutacional da proteína supressora de tumor pRb, que crescem em suspensão. Células Y79 foram infectadas com o retrovírus pCLDE1A/E1BSN, selecionadas com G418. A eficiência de produção de AdeGFP na linhagem LEY79 foi testada e comparada com a HEK293A. Células Y79 foram adaptadas em meio livre de soro. Esperamos com a linhagem LEY79SF inovar no campo de processos para a produção de Ad recombinante. / The presence of Ad with the ability to replicate (RCA, replication-competent adenovirus) in preparations is a major problem in the large-scale production of Ad. RCAs are generated by recombination between the vector sequence and sequence of the homologous gene in E1 helper cells. Objective: To develop a new helper cell line for the production of RCA-free Ad., called LEY79, derived from the Y79 of human retinoblastoma line, the first line Packer adenovirus with mutational inactivation of the tumor suppressor protein pRb, which are adapted to grow in suspension. Y79 cells were infected with the retrovirus pCLDE1A/E1BSN, selected with G418. The efficiency of production of AdeGFP in the LEY79 was tested and compared with the HEK293A. Y79 cells were adapted to grow in serum-free medium. We hope that use of the the LEY79SF cell line will promote innovation in the processing and production of recombinant Ad.

A glicoproteína gp120 do HIV apresenta domínios conservados, dentre os quais está o C4. Este domínio está envolvido no reconhecimento da molécula CD4 na superfície das células alvo, e anticorpos dirigidos contra ele neutralizam o vírus. Em trabalho anterior, este domínio foi introduzido dentro da região globular da proteína fibra do adenovírus. Como a fibra adenoviral é estimulante do sistema imune, decidimos testar a capacidade de indução de anticorpos anti-C4 por essa proteína modificada. Assim, foram construídos vetores plasmídicos e adenovirais portando o gene da região globular da fibra adenoviral contendo o domínio C4, que usados na imunização de camundongos induziram anticorpos capazes de reconhecer a proteína gp120. Também construímos um vetor baculoviral expressando essa proteína híbrida, que purificada por HPLC, foi utilizada para imunizar camundongos que também produziram anticorpos capazes de reconhecer a proteína gp120. Nossos dados sugerem que a região globular da fibra adenoviral é uma boa plataforma para a exposição de epítopos de imunização. / HIV glycoprotein gp120 has conserved domains, one of them being the C4 domain. This region is involved in the recognition of the CD4 marker in target cells and antibodies that recognize this domain can block HIV infection. Previously, the C4 domain was introduced in the adenovirus fiber knob. As the adenovirus fiber stimulates de immune system, we decided to test the production of anti-C4 antibodies by this hybrid protein. We constructed plasmid and adenovirus vectors carrying the fiber knob modified with the C4 domain. Immunization of mice with these vectors showed the production of specific antibodies that recognized de gp120 glycoprotein. Also, we constructed a baculovirus vector expressing the hybrid protein, which was purified by HPLC. Mice immunized with this protein also produced antibodies capable of recognizing gp120. Our data suggest that the fiber knob is a good carrier protein for epitope immunization.

Este trabalho descreve a remediação simultânea de dois genes supressores de tumor, CDKN2A e p53, em três linhagens celulares derivadas de glioblastoma multiforme: U87 (CDKN2A-/-, p53wt/wt), U251 (CDKN2A-/-, p53mut/mut) e T98G (CDKN2A-/-, p53mut/mut). A entrega gênica foi mediada por vetor adenoviral bicistrônico contendo o cassete CDKN2AIRESp53, capaz de expressar as duas proteínas simultaneamente. Vetores monocistrônicos também foram testados (AdCDKN2A e Adp53). Visando detectar apoptose, as linhagens receberam o sensor de atividade de caspase-3/7 GFP-DEVD-ssGLUC por transdução lentiviral. Este possui Gaussia luciferase (GLUC) C-terminal, que é secretada após ativação de caspases e pode ser dosada no sobrenadante. Após a marcação, realizaram-se ensaios de viabilidade celular, proliferação, formação de colônias, senescência, ciclo celular e dosagem de GLUC após remediação dos genes supressores de tumor nas linhagens GBMDEVD-GLUC. Com ensaio de viabilidade, observou-se efeito citotóxico do vetor bicistrônico AdCDKN2AIRESp53 maior que a soma dos obtidos com cada tratamento monocistrônico. No ensaio de senescência, o vetor AdCDKN2A resultou na maior indução do fenótipo senescente em todas as linhagens, seguido por Adp53, enquanto AdCDKN2AIRESp53 produziu resultados similares a um desses dois perfis em cada linhagem. Dosagem de GLUC no sobrenadante foi usada como indicador para atividade de caspase-3/7 após tratamento com os vetores supressores de tumor. O controle AdLacZ resultou em atividade de GLUC maior que nas amostras sem vírus (mock), enquanto tratamento com AdCDKN2A obteve resultados maiores que o controle em 72 h nas três linhagens. O vetor AdCDKN2AIRESp53 alcançou, inesperadamente, resultados variados em 72 h. Os dados obtidos neste trabalho indicam que a remediação simultânea de CDKN2A e p53 possui notável ação antiproliferativa tumoral, podendo levar à morte ou à senescência celular. Também é apontado que o sensor de caspase-3/7 GFP-DEVD-ssGLUC é robusto, mas detecta não apenas a indução de apoptose, mas a combinação de todos os processos ativadores de caspases em uma amostra. / This thesis describes the simultaneous remedy of two tumor suppressor genes, CDKN2A and p53, in three glioblastoma multiforme (GBM)-derived cell lines: U87 (CDKN2A-/-, p53wt/wt), U251 (CDKN2A-/-, p53mut/mut) and T98G (CDKN2A-/-, p53mut/mut). Gene delivery was mediated by a bicistronic adenoviral vector bearing the sequence CDKN2AIRESp53, which simultaneously expresses both proteins. Monocistronic vectors were also tested (AdCDKN2A and Adp53). To detect apoptosis, the GBM cell lines received caspase-3/7 sensor GFP-DEVD-ssGLUC via lentiviral transduction. This sensor has a C-terminal Gaussia luciferase (GLUC), which is secreted by the cell after caspase activation and can be measured in the supernatant. After sensorization, functional assays were carried out, including cell viability, proliferation, colony formation, cell senescence, cell cycle and GLUC measure after treatment with the tumor suppressor vectors in GBMDEVD-GLUC lineages. Viability assay with the AdCDKN2AIRESp53 vector resulted in a remarkable cytotoxic effect, greater than the sum of the effects with each monocistronic treatment. In the senescence assay, vector AdCDKN2A yielded the highest induction of cell senescence in all lineages, followed by Adp53, while AdCDKN2AIRESp53 induced results that followed one of these two profiles in each cell line. GLUC measure was an indicator of intracellular caspase-3/7 activity after treatment with the tumor supressor vectors. Control vector AdLacZ resulted in higher GLUC activity than mock treatment in all three cell lines, while AdCDKN2A treatment showed results bigger than control at 72 h in all cell lines. Bicistronic vector AdCDKN2AIRESp53 reached, unexpectedly, varied results at 72 h in all cell lines. Data obtained in this study indicate that simultaneous remedy of CDKN2A and p53 has remarkable antiproliferative activity in GBM cells, resulting in cell death or cell senescence. It is also shown that caspase-3/7 sensor GFP-DEVD-ssGLUC is a robust tool, but its results detect not only a single cellular process, such as apoptosis, but the combination of all caspase-activating processes in a cell population.

BIM é uma proteína pro-apoptótica membro da família Bcl-2. No sistema imunológico, BIM foi descrita como reguladora da homeostase de linfócitos. Porém, ainda não foi estudado o papel do BIM no estabelecimento da resposta imune de linfócitos T CD8+. Sendo que os vetores adenovirais fortes ativadores da resposta, neste trabalho investigamos o papel de BIM na qualidade e frequência de linfócitos T CD8+ estimulados com Ad.cOVA. Camundongos C57Bl/6 selvagens, bim+/- e bim-/- foram imunizados com 2x106 PFU/100μl. Assim, observou-se uma redução da lise especifica e menor freqüência de linfócitos CD8+ produtores de IFNγ em camundongos bim-/-. Em paralelo, foi avaliada a resposta imune anti-tumoral destes camundongos sem encontrar diferencias significativas. A cinética da resposta efetora de linfócitos T CD8+ de camundongos bim-/- mostrou escassa perda das capacidades efetoras destes linfócitos, sendo o possível mecanismo para controlar a progressão tumoral. Em conclusão camundongos bim-/- apresentam uma menor freqüência de células efetoras, sugerindo um importante papel de BIM na produção de linfócitos T CD8+ antígeno-específicos trás a vacinação com Ad.cOVA. / BIM is a pro-apoptotic member of the Bcl-2 protein family. In the immune system, BIM has been described as lymphocyte homeostasis regulator. However, the role of BIM in the establishment of the immune response of CD8+ T lymphocytes has not yet been studied. As the strong adenoviral vectors activating the response, we investigated the role of BIM in the quality and frequency of Ad.cOVA-stimulated CD8+ T lymphocytes. Wild C57Bl/6 mice, bim+/- and bim-/- were immunized with 2x106 PFU/100μl. Thus, a reduction of the specific lysis and decreased frequency of IFNγ producing CD8+ lymphocytes in bim-/- mice was observed. In parallel, the anti-tumor immune response of these mice was evaluated without finding significant differences. The kinetics of the effector response of CD8+ T lymphocytes from bim-/- mice showed little loss of the effector capacities of these lymphocytes, being the possible mechanism to control tumor progression. In conclusion, bim-/- mice show a lower frequency of effector cells, suggesting an important role of BIM in the production of antigen-specific CD8+ T lymphocytes after vaccination with Ad.cOVA.

Os vírus entéricos humanos são encontrados no esgoto e em subprodutos dos processos de tratamento. Recentemente vem sendo recomendados como indicadores de qualidade microbiológica em normas da legislação brasileira e também nas de outros países, mas ainda com parâmetros a definir. O objetivo do estudo é a avaliação e a comparação entre métodos clássicos e moleculares aplicados à detecção de vírus entéricos em amostras de água de reúso e de lodo, visando subsidiar a legislação brasileira. Ensaios de semeadura experimental de protótipos de rotavírus e de adenovírus foram realizados nas matrizes ambientais e os vírus detectados por métodos clássicos (cultivo celular e reação de imunoperoxidase) e moleculares (PCR/nested-PCR, RT-PCR e ICC-PCR), determinando-se os limites de detecção de cada método para cada matriz. A pesquisa de rotavírus e adenovírus presentes naturalmente em 25 amostras de água de reúso e em 25 de lodo possibilitou a comparação dos métodos propostos. O ICC-PCR mostrou ser o método mais factível a ser aplicado na área de saneamento. / Human enteric viruses are common contaminants of raw sewage and subproducts of sewage treatment processes. In recent years, those viruses were recommend as new microbiological indicators in different matrices in Brazilian legislation and others countries, although some questions should be elucidated. At present, the aim was to evaluate and compare the efficiencies of standard and molecular virological methods for detection of human enteric viruses in sludge and reclaimed water samples. Rotavirus and adenovirus were experimentally spiked in the proposed matrices and virus recovery and detection limits established for each method and matrice. Viruses naturally presented in 25 samples of sludge and 25 samples of reclaimed water were assayed by all methods and results evaluated and compared for statistical significance. From all methods evaluated, ICC-PCR showed to be the most suitable for virus surveillance in sludge and reclaimed water.

Para verificar a permissividade de células de origem hematopoiéticas à infecção por HAdV-41, foram infectados PBMC e IEL de voluntários. Os ensaios foram comparados com células HEK-293 infectadas. Foram analisadas as expressões dos genes virais E1A, E1B (55K), E3 (14K), VARNA, hexon e fibra curta (FC) e do gene celular GAPDH. O mRNA foi detectado por RT-PCR em tempo real e a produção de proteínas foi visualizada por IFI. Em HEK-293, a transcrição dos genes E1A, E1B e E3 iniciou-se às 11h p.i, hexon,às 13h pi.,VARNA e FC às 14h p.i. Em PBMC a transcrição de E1A, E1B e VARNA iniciou-se 17h p.i e a expressão dos genes hexon e fibra curta foi detectada 18h p.i e 20 h p.i. respectivamente. O nível de expressão dos genes virais em HEK-293 foi quase 200 vezes maior em relação à PBMC. Os IELs também mostraram-se permissivos à infecção pelo HAdV-41 como mostrado pela expressão dos genes virais. Essa é a primeira evidência de que este vírus possa infectar tais células. Os resultados obtidos ajudam a elucidar os mecanismos de interação do vírus com a célula-hospedeira. / In order to verify the permissiveness of hematopoietic cells to HAdV-41 infection, PBMC and IEL from volunteers were infected. The infection assays were compared with infected HEK -293 cells. We analysed the E1A, E1B (55K), E3 (14K), VARNA, hexon and short fiber (SF) viral gene expression and GAPDH cellular gene expression. The mRNA were detected by real time PCR and the viral protein synthesis were detected by IIF. In HEK-293 cells E1A, E1B and E3 gene expression were detected 11h p.i Hexon gene expression was detected at 13h p.i, while VARNA and SF were detected 14h p.i In PBMC, E1A, E1B and VARNA gene expression were detected 17h p.i and the hexon and SF were detected 18h p.i and 20h p.i, respectively. The viral gene expression level in infected HEK-293 cells was 200 fold higher than infected PBMC. The IEL also were permissive to HAdV-41 infection showed by viral gene expressions. This is the first evidence that HAdV-41 is able to infect these cells types. These results helps to understand the virus-cell interaction mechanisms.

O P. vivax é a segunda espécie mais prevalente causadora de malária no mundo. Medidas de controle ineficientes exigem o desenvolvimento de novas estratégias de prevenção, como vacinas, novas drogas e novos inseticidas. O objetivo geral do trabalho foi gerar uma formulação vacinal universal com proteínas e adenovírus recombinantes capazes de induzir anticorpos contra as diferentes formas alélicas da proteína circumsporozoíta (CSP) do P. vivax. As proteínas foram produzidas em E. coli e purificadas por cromatografia de afinidade e troca iônica. A obtenção destas proteínas nos permitiu testar qual seria a melhor formulação vacinal para a indução de anticorpos contra as três formas alélicas da proteína CSP de P. vivax (PvCSP). Anticorpos específicos reconheceram esporozoítas do P. vivax por imunofluorescência. Por fim testamos o uso de dois adenovírus recombinantes, um símio e um humano, deficientes em replicação, expressando as três regiões imunodominantes da proteína PvCSP em fusão. Estes foram capazes de induzir resposta imune específica contra as proteínas PvCSP sendo testados em esquema de prime-boost heterólogo, onde camundongos foram primados com os adenovírus e nas doses-reforço receberam a mistura com as três proteínas recombinantes. / The Plasmodium vivax is the second most prevalent species of malaria in the world. Inefficient measures of control used today demand the development of new strategies for prevention, as vaccines, new drugs and new insecticides. The central objective of this thesis was to generate a universal vaccine formulation with proteins and recombinant adenoviral vectors representing the different allelic forms of the circumsporozoite protein (CSP) of the P. vivax. The recombinant proteins were expressed in E. coli and purified. These proteins allowed us to test which would be the best vaccine formulation for the induction of antibodies against the three allelic forms of CSP. The specific antibodies also recognized P. vivax sporozoites by immunofluorescence. Finally we test the use of two recombinant adenoviral vectors, a simian and a human, both replication deficient, expressing a protein containing the repeat regions of the CSP in fusion. These adenoviral vectors induced specific immune response against CSP and were successfully used in an immunization regimen of heterologous prime and boost where in the first dose the mice received recombinant adenoviral vector and in the subsequent doses, the mixture with three recombinant proteins.

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Thus, studies that show or even the occurrence of these interactions in water are of great importance, since these studies are still scarce. The aims of these studies were: (i) to detect, quantify and molecularly characterize the HAdV serotypes that can to circulate in the water supply treatment in the city of Goiania; (ii) evaluate the infectivity and recovery of genomic copies (GC) of HAdV-5 in simulated condition with solids derived from tropical soils and under controlled conditions of the pH and the presence of organic matter (OM); (iii) establish a mathematical equation to evaluate the recovery rate of virus genome copies in simulated conditions with clay soils. Thus, in the second half of 2012, we collected sample water in a volume of 5 L of 4 treated water reservoir and their respective points in the distribution network in the city of Goiania, totaling 80 samples. The samples were concentrated, quantified by qPCR and sequenced. Altogether 76.6% (100 - 109 CG/mL) and 37.5% (101 - 108 CG/mL) of the samples were positive for the reservoir and their respective points in the distribution network respectively. Therefore, Goiânia’s treated water is contaminated with a high number of HAdV type C. In the study of the interaction of HAdV-5 with the solid (sediments), a hydromorphic soil sample was divided into two parts: soil organic matter (WOM) and soil less organic matter (LOM). Then, it was added separately 5, 25 and 50 mg of soil WOM and LOM in sterile polypropylene tubes of 50 mL, added ultrapure water and adjusted the pH to 6.0 and 8.0. Then was added 1 mL of viral aliquot and the volume made up to 50 mL. The tubes in replica were shaken at 150 rpm for 1h at 24 °C followed by decantation. The viral genome was quantified (GC/mL) by Real-Time PCR and the Infectivity by Assay Plate Lysis. Water with solids promoted a reduction in the number of GC/mL and viral infectivity. The OM did not affect the recovery of GC/mL (p> 0.05). However, the OM was harmfulto to the infectivity of the virus, with a reduction of 2 log10 of Plaque Forming Units per milliliter (PFU/mL), when compared with treatments LMO. The acidic pH is unfavorable to virus inactivation, and the clay is the main element responsible for the interaction of HAdV-5. The mathematical equation is useful in assessing the recovery of viral genomic copies in clay solutions. These data can offer support in ecoepidemiological studies of viral inactivation or water treatment. / O adenovírus humano (HAdV) é indicado como um biomarcador viral para a análise de qualidade da água. Assim, estudos que evidenciam a ocorrência ou mesmo as interações destes em água são de suma importância, já que as pesquisas na área são inexpressivas. Neste contexto, foram objetivos do estudo: (i) detectar, quantificar e caracterizar molecularmente os HAdVs circulantes no sistema de abastecimento de água tratada da cidade Goiânia; (ii) avaliar a infecciosidade e a recuperação de cópias genômicas (CG) de HAdV-5 em soluções simuladas com sólidos tropicais e em condições controladas de pH e presença de matéria orgânica (MO) e (iii) estabelecer uma equação matemática para avaliar a taxa de recuperação de cópias genômicas virais em condições simuladas com solos argilosos. Assim, no segundo semestre de 2012, foram coletadas amostras de água tratada (5 L) em 4 reservatórios e em seus respectivos pontos na rede de distribuição de Goiânia, totalizando 80 amostras. As amostras foram concentradas, quantificadas por PCR em Tempo Real Quantitativa (qPCR) e parte destas sequenciadas. Ao todo, 76,6% (100 - 109 CG/mL) e 37,5% (101 - 108 CG/mL) das amostras foram positivas para os reservatórios e seus pontos na rede de distribuição respectivamente. Portanto, a água tratada de Goiânia está contaminada por um elevado número de HAdV tipo C. Quanto ao estudo com os sólidos, amostra de um solo hidromórfico foi subdividida em duas partes: solo com matéria orgânica (CMO) e solo sem matéria orgânica (SMO). Foi adicionado separadamente 5, 25 e 50 mg de solo CMO e SMO em tubos de polipropileno estéreis de 50 mL, adicionado água ultrapura e o pH das soluções ajustado para 6,0 e 8,0. Em seguida, foi adicionado 1 mL de alíquota viral e o volume foi completado para 50 mL. Os tubos em réplica foram agitados a 150 rpm por 1h a 24 ºC e decantados por 1h. O genoma viral foi quantificado (CG/mL) por qPCR e a Infecciosidade por Ensaio em Placa de Lise. A água com sólidos promoveu uma redução na recuperação das CG/mL e na infecciosidade viral. A MO não influenciou na recuperação das CG/mL (p>0,05), todavia, foi predudicial à infecciosidade viral, com diminuição de 2 log10 de Unidades Formadoras de Placa por Mililitro (PFU/mL), quando comparado com os tratamentos SMO. O pH 6,0 desfavorece a inativação e a argila é o principal elemento responsável pela interação do HAdV-5. A equação matemática é útil na avaliação da recuperação das cópias genômicas virais em soluções argilosas. Estes dados podem auxiliar em estudos eco-epidemilógicos, de inativação viral ou tratamento da água.