Les travaux de recherche présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le domaine de la traduction automatique et automatisée. Nous nous intéressons en particulier aux outils d'aide à la traduction sur le Web favorisant la traduction bénévole, non-commerciale et incrémentale. La croissance remarquable de la quantité des documents multilingues disséminés en ligne gratuitement (W3C, Traduct, Mozilla, traducteurs bénévoles de documents en droits de l'homme, etc.) est le résultat d'un travail laborieux de communautés bénévoles qui sont malheureusement technologiquement marginalisées, et privées de toute aide « linguistique » à la traduction. Nous avons effectué une étude approfondie des communautés bénévoles et en avons dégagé les problèmes les plus intéressants et difficiles. Nous avons construit BEYTrans, un environnement collaboratif et non commercial offrant des services linguistiques et répondant aux besoins spécifiques de ces communautés. Les principales composantes logicielles développées sont : un éditeur multilingue Web intégrant des fonctionnalités linguistiques avancées et variées, un module de recyclage des traductions existantes, et la gestion et le traitement d'une masse de données multilingues. Chacun d'eux résout un problème intéressant, et ils sont entièrement intégrés (avec d'autres fonctionnalités) dans un environnement collaboratif complet, qui a été expérimenté avec succès dans des situations concrètes.

La façon d'organiser le travail, d'une part au sein des entreprises, et d'autre part entre les différentes entreprises, est un enjeu central dans la recherche de l'efficacité et de la performance. Dans les années 90 l'arrivée des progiciels de gestion intégrés a favorisé l'émergence d'une rationalité globale de l'entreprise, mais leur valeur ajoutée s'appuie en grande partie sur un alignement organisationnel de l'entreprise. Cette transformation s'est accompagnée d'un mouvement de spécialisation des entreprises et de recentrage sur leur coeur de métier. L'entreprise est devenue très interdépendante de ses partenaires directs, elle s'insère désormais dans un réseau d'entreprises qui impose de maîtriser un ensemble croissant de flux inter organisationnels. La recherche en Génie Industriel a accompagné ces nouvelles préoccupations des entreprises en déplaçant le champ de la recherche suivant deux axes : celui de l'ingénierie des systèmes de production intra-entreprise, vers l'ingénierie des entreprises en réseau, et celui de la rationalisation du système physique, vers une rationalisation du système d'information, puis vers une rationalisation des processus décisionnels et cognitifs. Le travail présenté dans ce mémoire d'Habilitation à Diriger les Recherches s'intègre dans cette mouvance du génie industriel. Mes travaux de doctorat m'ont permis d'aborder le pilotage proactif qui s'appuie sur un rapprochement entre le processus décisionnel et l'activité. L'organisation n'est pas alors seulement décrite de manière fonctionnelle, comme une structure de division des tâches, mais aussi à travers le maillage des activités qui engendrent de la valeur. Par la suite, le décloisonnement fonctionnel lié en partie à l'implantation des ERP (Enterprise Resource Planning), et la montée en puissance du Supply Chain Mangement ont mis en avant le passage d'une logique de découplage et d'optimisation locale à une logique d'intégration et de coordination. En nous intéressant à la fois aux périmètres intra et inter entreprises, nous mettons en évidence dans ce travail trois leviers d'intégration des organisations : les processus, le Système d'Information (SI) et la collaboration. Pour cette raison, ce mémoire est articulé autour de trois parties : 1) Les processus comme levier de l'intégration organisationnelle Les outils de modélisation sont utiles à la (re) conception des organisations productives. Des référentiels standards de processus ont été élaborés. Porteur d'indicateurs de performance et de best practices, ils permettent un déploiement accéléré des approches transverses. • La première problématique que nous traitons concerne les méthodes de classification pour l'élaboration d'une typologie de chaînes logistiques intra entreprise. Dans les grands groupes industriels, se pose la question de la position du curseur entre d'un coté des processus complètement standardisés pour l'ensemble des entreprises concernées et de l'autre une personnalisation totale des processus pour chacune des entreprises. Le SCOR model est utilisé pour réaliser le codage. • La deuxième problématique concerne la définition de tableaux de bord permettant d'évaluer la performance logistique. L'approche est multi facettes, le référentiel SCOR, le rapport CEN TC273 (Communauté Européenne de Normalisation) et leBalanced Scorecard ont été utilisés pour définir un cadre de l'évaluation des processus. Plusieurs applications sont présentées. • La troisième problématique concerne l'intégration des processus inter organisationnels dans le cadre de l'externalisation. La reconfiguration des processus s'appuie ici sur des outils de Business Process Réengineering et des modèles de simulation. 2) Le Système d'Information comme levier de l'intégration informationnelle. Les technologies de l'information (TI) sont reconnues comme un facteur clé de la performance des entreprises, mais seul un bon alignement entre business model et système d'information permet d'atteindre le niveau de performance souhaité. Certains outils, comme les ERP sont en soit porteurs d'intégration, si bien que leur installation nécessite un remodelage de l'organisation permettant un ajustement entre intégration informationnelle et intégration organisationnelle. Pour les Systèmes d'Information non intégrés, la question de la qualité du couplage organisationnel et informationnel repose sur les principes de l'interopérabilité des systèmes (des données aux métiers). Nous développons deux chapitres dans cette partie : • Le management des projets ERP. A partir des outils et méthodes de modélisation d'entreprise, nous avons proposé une méthodologie de déploiement des projets ERP. Une approche par les facteurs clés de succès nous a permis de mettre en évidence l'impact des spécificités des entreprises sur le déploiement de ces projets. • Intégration et interopérabilité. En nous appuyant sur les concepts de MDA (Model Driven Architecture) et de MDI (Model Driven Interoperability), nous avons proposé une architecture permettant de suivre la qualité des données de production dans le secteur pharmaceutique. L'intégration n'est pas ici vue du point de vue transactionnel, comme le ferait un ERP, mais du point de vue produit, permettant le long de son cycle de vie, de garantir un déroulement des processus de production (données de l'ERP) en conformité avec les données issues du processus de développement (Réglementaires). 3) La collaboration comme levier de l'intégration relationnelle Si les approches processus permettent une représentation de ce qui est réalisé (les activités), elles intègrent difficilement le pilotage (comment c'est réalisé), là où réside une grande part de la valeur ajoutée. Les relations collaboratives sont devenues un vrai enjeu dans le pilotage des échanges inter entreprises, car d'elles dépend une partie de la performance des organisations. Cette troisième partie est divisée en 2 chapitres : • Le premier chapitre propose un ensemble d'outils et méthodes permettant de caractériser et d'analyser les relations dans les chaînes logistiques. L'étude de l'impact des pratiques collaboratives sur la performance a permis de développer un modèle de caractérisation du comportement collaboratif d'une entreprise, en vue de dégager des pistes d'amélioration. • Le deuxième chapitre nous permet d'étendre le champ des relations dans les chaînes logistiques à celui des relations dans les clusters d'entreprises. La collaboration n'est plus ici d'ordre Client/Fournisseur, mais elles s'intéressent à la construction d'un cadre d'interaction permettant la gestion et la capitalisation des connaissances. Ce travail s'est appuyé sur une adaptation de la méthodologie de CommonKADS et a été appliqué au cas de l'industrie artisanale de la céramique en Thaïlande.

Cette thèse a été effectué sur l'expérience LHCb, située sur le collisionneur proton-proton LHC au CERN. Sa première partie porte sur l'alignement en temps des calorimètres. Nous décrivons une méthode basée sur une asymétrie permettant d'assurer l'alignement en temps des calorimètres électromagnétique (ECAL) et hadronique (HCAL). Nous montrons qu'avec des faisceaux de 450 GeV, et en l'absence du champ magnétique, il faut 55 000 événements minimum bias pour aligner en temps 84$\%$ des cellules du ECAL et 96 $\%$ des cellules du HCAL avec une précision de 0.5 ns. Lors de la mise en service des sous-détecteurs, nous avons analysé plus d'un million d'événements cosmiques, et vérifié que l'alignement interne est meilleur que 1 ns dans le ECAL et le HCAL. D'autre part nous avons aligné en temps le ECAL et le HCAL et obtenu une précision de l'ordre de 2 ns. Grâce aux gerbes hadroniques produites par le faisceau du LHC le 10 septembre 2008, nous avons montré que l'alignement global du HCAL avec l'horloge du LHC est de l'ordre de 0.8 ns.\\ La seconde partie de cette thèse porte sur la reconstruction des canaux $B_{d}\rightarrow D^{-}\rho(770)^{+}$, $B_{s}\rightarrow D_{s}^{-}\rho(770)^{+}$ et $B_{s}\rightarrow D_{s}^{-}K^{*+}(892)$. Une mé\-thode multivariable a été utilisée pour sélectionner les événements de signal et minimiser le bruit de fond $b\bar{b}$. Avec une année nominale de prise de données à LHCb, on attend 450 000 événements $B_{d}\rightarrow D^{-}\rho(770)^{+}$ , 71 000 événements $B_{s}\rightarrow D_{s}^{-}\rho(770)^{+}$ et 1300 événements $B_{s}\rightarrow D_{s}^{-}K^{*+}(8 92)$ avec des rapports signal sur bruit variant entre 1.6 et 6.

Le boson chargé W sera abondamment produit au Large Hadron Collider (LHC) dans des collisions proton-proton à une énergie dans le centre de masse de 14 TeV: sa fréquence de production est 1 Hz à basse luminosité. Sa désintégration dans le canal électron aura une signature claire dans le détecteur ATLAS, marquée par un électron de haute impulsion transverse et une énergie transverse manquante élevée. Le détecteur ATLAS est un détecteur généraliste constitué d'un détecteur de traces, d'un calorimètre électromagnétique, d'un calorimètre hadronique et d'un spectromètre à muon. Entièrement installé dans sa caverne, il a enregistré des données avec le premier faisceau du LHC en septembre 2008.<br />Une première partie de la thèse consiste dans le développement d'une stratégie d'analyse pour la mesure de la section efficace de production inclusive du boson $W$ avec les premières données d'ATLAS, maximisant l'utilisation des données par rapport aux simulations Monte-Carlo. Les principales sources d'incertitude systématique sont mises en évidence et étudiées: une précision sur la mesure meilleure que 10% sera accessible dès la première phase de l'expérience. Une seconde partie est consacrée à l'alignement en temps des canaux de lecture des calorimètres à argon liquide, étape nécessaire pour atteindre les performances nominales. Des constantes de temps sont calculées à partir des données enregistrées en septembre 2008: elles permettront d'assurer un alignement en temps à 2-3 ns de tous les canaux pour les premières collisions

L'alignement multiple est une opération permettant de mettre en évidence la similarité entre plusieurs séquences. Il est notamment utilisé pour la reconstruction de phylogénies, la recherche de motifs et la prédiction de structures. Cette thèse s'intéresse au développement de nouveaux algorithmes pour ce problème particulièrement difficile, et introduit deux algorithmes progressifs ayant pour point commun de réaliser un alignement multiple par alignements successifs de groupes de séquences.<br />Le premier algorithme, Plasma utilise une méthode de descente, dont chaque itération consiste à réaliser des insertions de colonnes de brèches dans deux alignements multiples à aligner. Le second algorithme, Plasma II , est basé sur le principe de la programmation dynamique. Nous généralisons ici l'algorithme utilisé pour l'alignement de deux séquences, et étendons le cadre de la programmation dynamique `a l'alignement de deux alignements multiples. Cet algorithme ainsi que plusieurs variantes sont intensivement évalués sur les jeux d'essais de Balibase, montrant des résultats encourageants, voire compétitifs, par rapport à certains algorithmes de référence comme Clustal W, tant sur la qualité de l'alignement que sur le temps de calcul.

On souhaite modéliser la sémantique d'un réseau de connaissances hétérogènes mises en correspondances. On suppose que ces réseaux sont représentés par un ensemble d'ontologies reliées entre elles par des alignements d'ontologies. Dans un contexte comme le Web ou certains réseaux pair-à-pair, diverses ontologies sont accessibles mais fortement hétérogènes en termes d'expressivité et de modélisation. Aussi, les systèmes d'inférence associés peuvent être indépendants les uns des autres. Je propose une sémantique générique pour ces réseaux, tolérante à l'hétérogénéité et permettant d'exploiter des systèmes existants sans les perturber. Cette sémantique garantie par ailleurs le principe de médiation, et permet une réutilisabilité des alignements et des ontologies. J'en propose quatre applications : les ontologies modulaires ; un langage d'alignement expressif distinct du langage d'ontologies ; un opérateur de composition d'alignements ; une procédure de raisonnement distribué.

On étudie le contrôle de systèmes quantiques en dimension finie soumis à des champs laser externes. Après avoir examiné l'exemple concret de l'alignement d'une molécule diatomique en milieu dissipatif, on s'intéresse au problème spécifique du contrôle optimal, où l'objectif est d'amener le système d'un état initial à un certain état final tout en minimisant une fonctionnelle de coût. Le principe du maximum de Pontryagin (PMP) fournit les conditions nécessaires d'optimalité, en établissant que toute trajectoire optimale est la solution extrémale d'un problème étendu de structure Hamiltonienne. Dans ce contexte, on procède à l'analyse de deux systèmes particuliers. Le premier est un système dissipatif à 2 niveaux, dont on souhaite déterminer l'ensemble des trajectoires en temps minimum; le second est un système conservatif à 3 niveaux non complètement contrôlable, où une mesure projective permet d'assister le processus de contrôle.

Se situant à l'interface de la prosodie et du discours, notre recherche a pour objet de déterminer le domaine de variabilité phonétique et la valeur discursive d'un contour intonatif du français : l'intonation d'implication, au moyen de l'observation écologique de l'usage qu'en font les locuteurs dans un corpus fermé de débat radiophonique. A partir de l'identification auditive des occurrences de l'intonation d'implication du corpus en fonction de la description qu'en donne Delattre (1966) nous proposons une analyse qualitative et quantitative de la variabilité de réalisation phonétique de ce contour. Nous montrons que, contre toute attente, ces réalisations sont très souvent confondues avec celles du contour montant continuatif et que l'alignement du pic de fréquence fondamentale sur le noyau syllabique de la dernière syllabe du contour (à gauche pour l'implication, à droite pour le continuatif) est déterminant pour leur différenciation. Nous montrons également que l'intonation d'implication est souvent confondue avec un autre contour montant-descendant dont le pic de fréquence est aligné avec la syllabe pénultième. Une analyse discursive approfondie, menée grâce au modèle proposé par l'Ecole de Genève (Roulet et al., 2001) nous permet de mettre en évidence l'usage spécifique, interactif et argumentatif, que font de ce contour les participants au débat radiophonique. La synthèse de nos analyses prosodique et discursive nous permet de proposer une interprétation compositionnelle de la valeur pragmatique de l'intonation d'implication.

Cette thèse est consacrée à la spectroscopie de l'éthylène en vue de l'étude de cette molécule piégée dans des zéolithes. La première partie expose le modèle tensoriel adapté à la symétrie de la molécule isolée : formalisme, hamiltonien et moments de transition. Afin de prendre en compte les champs électriques intenses présents dans les zéolithes, nous proposons dans la deuxième partie une extension du modèle à l'effet Stark. La troisième partie décrit les programmes du logiciel D2hTDS qui ont été construits pour calculer et analyser les spectres des molécules de type X2Y4. La quatrième partie présente les applications au calcul et à l'analyse de spectres de l'éthylène à champ nul et sous effet Stark. En particulier, le modèle a été testé sur l'analyse à champ nul de l'état de base et des bandes nu2 et nu12. Un calcul à champ faible de la bande nu7 et une simulation à champ fort de la bande nu12 ont été effectués, ainsi qu'une étude d'alignement de la molécule en fonction du champ.

La diaspora bretonne offre un terrain fertile pour questionner la composition des collectifs web 2.0. Nous faisons ici référence aux nouvelles formes de regroupements qui émergent avec le web mais que l'on aborde trop souvent en distinguant les problématiques sociales des problématiques techniques. En recourant aux diasporas, nous décentrons notre regard pour aborder ces collectifs selon un point de vue tout à la fois technique, social et cognitif. Dans ce travail, nous recourrons à la sociologie de la traduction et à la sociologie pragmatique pour construire une méthodologie basée sur l'analyse des traces numériques produites par les collectifs. Après avoir identifié au sein de la diaspora bretonne trois collectifs correspondants à nos critères, nous les avons analysé à l'aide de trois formats, afin d'identifier les médiateurs de différentes natures qui les composent. Nos résultats démontrent que les collectifs web sont des regroupements proliférants et hétérogènes. Loin d'homogénéiser les cultures ou les civilisations, les technologies web favorisent l'exploration et la combinaison. Les collectifs web détiennent une dynamique et un fonctionnement en proche qui favorisent l'innovation