Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-17Bitstream added on 2015-03-03T12:06:20Z : No. of bitstreams: 1 000810932.pdf: 1215868 bytes, checksum: aff0fc69a7978fa7932c34edebbc8657 (MD5) / A raça de bovinos de corte Tabapuã possui características desejáveis para as condições tropicais de produção como rusticidade e adaptabilidade. No entanto, é uma raça de formação recente e existem poucos estudos da estrutura populacional, variabilidade genética, endogamia e estimativas de parâmetros genéticos para características de interesse econômico. Este trabalho teve dois objetivos principais. O primeiro foi avaliar e descrever a estrutura populacional da raça Tabapuã e a relação linear de classes de coeficiente de endogamia com as médias dos valores fenotípicos de peso ao desmame ajustado para 210 dias de idade (P210), idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos médio (IPM), primeiro intervalo de partos (IP1), segundo intervalo de partos (IP2) e produtividade acumulada (PAC). O segundo objetivo foi estimar parâmetros genéticos, tendências genéticas e eficiência relativa de seleção para P210, IPP, IPM, IP1 e PAC em uma população de bovinos Tabapuã. Foram utilizados registros fenotípicos de 7.340 vacas da raça Tabapuã, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da Raça Tabapuã (PMGRT) mantido pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). O arquivo de pedigree continha 15.241 animais. A análise de estrutura populacional foi realizada por meio do programa ENDOG. As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita, utilizando modelo animal multicaracterística. O teste de razão de verossimilhança foi utilizado para definir os efeitos aleatórios para análise de P210. O modelo animal de P210 incluiu os efeitos aleatórios genético aditivo materno e de ambiente permanente, além do efeito genético aditivo direto e do efeito residual e efeitos fixos. Para IPP, IPM, IP1 e PAC consideraram-se apenas o efeito aleatório genético aditivo direto, efeito aleatório residual e efeitos fixos. As tendências genéticas ... / Tabapuã is a rustic beef cattle breed that is highly adapted to tropical environmental conditions. Due Tabapuã recent origin, there are only a few studies about population structure and genetic parameters. Thus, this study had two main objectives. The first was to evaluate the population structure and relationship of inbreeding coefficient and the phenotype of weaning weight adjusted at 210 days of age (W210), age at first calving (AFC), average of calving interval (ACI), first calving interval (CI1), second calving interval (CI2), and accumulated productivity (ACP). The second was to estimate genetic parameters, genetic trends and relative efficiency of selection for W210, AFC, ACI, CI1, and ACP in Tabapuã beef cattle. We used pedigree information of 15,241 animals and phenotypic information of 7,340 Tabapuã cows included in the Brazilian Tabapuã Breeding Program. Analysis of population structure was performed using ENDOG software. Estimates of genetic parameters were obtained by restricted maximum likelihood method, fitting a multiple-trait animal model. The likelihood ratio test was used to define the random effects for W210 analysis. For W210 the maternal genetic, permanent environmental, additive genetic, and residual effects were included in model; while only the additive genetic and residual effects were included for AFC, ACI, CI1, and ACP. Genetic trends were calculated from a linear regression of predicted breeding value on birth year. Average pedigree completeness was 47.99% for 6 last generations. Complete, maximum and equivalent generations were 5, 16 and 6.66, respectively. Effective number of founders and ancestors was equal to 124 and 110, respectively, and the ratio between both was 1.13. The average inbreeding coefficient was equal to 0.0072.The average inbreeding coefficient as well as the average relatedness and the percentage of number of inbred animals increased across generation. However, it was observed ...

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-28Bitstream added on 2015-04-09T12:48:09Z : No. of bitstreams: 1 000814741_20160228.pdf: 112944 bytes, checksum: 9be232e5b0d5e262a61f2c56745d55ce (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:17Z: 000814741_20160228.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:20Z : No. of bitstreams: 1 000814741.pdf: 3226410 bytes, checksum: 8f37ec63c6f15fbaf65bc5404c0c68b3 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Apesar de ter sido introduzida no Brasil em 1999, estudos envolvendo aspectos biológicos bem como a dinâmica populacional de Zaprionus indianus ainda são muito escassos. Este drosofilídeo, considerado praga em monoculturas de figo-roxo, possui uma grande capacidade de dispersão e de estabelecimento em diferentes ambientes. Este fato contribuiu de forma expressiva para sua rápida expansão em todas as regiões do país, atacando tanto frutos de ambientes naturais, quanto os presentes nestas monoculturas. Esses ataques têm causado grandes prejuízos à comercialização desta fruta, tanto no mercado nacional quanto de exportação, fazendo com que alguns produtores abandonem suas plantações. Diante desta problemática, os objetivos desse estudo foram: analisar a dinâmica populacional de Z. indianus em plantações de figo-roxo e caracterizar alguns aspectos biológicos que influenciam sua flutuação populacional. Para isso, foram realizadas coletas mensais de set/2010 a ago/2011 em plantações de figo-roxo localizadas na região de Valinhos (SP). Ademais, experimentos voltados à caracterização dos estágios imaturos de Z. indianus, como número de instares, processo de pupação e caracterização morfológica destes estágios foram conduzidos no laboratório de Entomologia I e no laboratório de Microscopia Eletrônica da UNESP/RC. Outros, voltados à caracterização de aspectos como sobrevivência, tempo de desenvolvimento, tamanho corporal do adulto, parâmetros nutricionais ótimos para desempenho larval e escolha da fêmea quanto a locais para oviposição foram realizados, via geometria nutricional, no laboratório “Development, Evolution and the Environment” – IGC/Portugal. A nutrição é um fator diretamente relacionado às características de vida dos drosofilídeos, podendo ser usada para se compreender a história de vida destes animais. No método utilizado, a condição nutricional de um animal é representada... / Despite having been introduced in Brazil in 1999, studies involving biological aspects and population dynamics of Zaprionus indianus are still very scarce. This drosophilid, considered as a pest in fig-purple crops, has a great capacity of dispersal and establishment in different environments. This fact contributed significantly to its rapid expansion in all regions of the country, attacking fruits of natural environments and in monocultures. These attacks have caused major damage to both national and export markets, causing the fact that some producers have abandoned their plantations. Considering this problem, the objectives of this study were to analyze the population dynamics of Z. indianus in fig-purple crops and characterize some biological aspects that influence its population fluctuations. For this, the drosophilids were monthly collected from Sep/2010 until Aug/2011 in fig-purple crops in the region of Valinhos (SP). Furthermore, others experiments aimed at characterize the immature stages of Z. indianus were conducted, like number of instars, pupation process and morphological characterization of these stages by scanning electron microscopy. Others, involving the characterization of aspects such as survival, viability, development time, adult body size, nutritional parameters for optimal larval performance and female oviposition site choice were performed by nutritional geometry. The nutrition is a factor directly related to the life history of drosophilids. In this methodology, the nutritional status of an animal is represented as a point within a nutritional space with “n” dimensions. Depending on the intake of calories and macronutrients, the regulatory systems of this animal are able to alter its metabolism in order to achieve a balance, and the consequences of these adjustments can be viewed by changes in its biological characteristics, these being analyzed here. As in field work, the species Drosophila simulans revealed...

Orientador: Rita de Cassia Bianchi / Banca: Milton Cezar Ribeiro / Banca: Luciano Martins Verdade / Banca: Mariella Superina / Banca: Frederico Gemesio Lemos / Resumo: Tamanduás-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) são mamíferos de ampla distribuição, porém suas populações sofrem diversas ameaças, que colaboram para sua presença em listas vermelhas internacionais, nacionais e regionais. É um animal de grande porte especialista alimentar em insetos sociais, que contribui para a dinâmica dos ecossistemas. Apesar de sua importância, a espécie é pouco conhecida, principalmente no que tange ao entendimento ecológico de populações em áreas com influência antrópica. Este estudo teve como objetivos (i) estimar as áreas de vida e de uso de tamanduás-bandeira em Estação Ecológica de domínio Cerrado com influência antrópica, além de investigar a organização espacial dos indivíduos, (ii) identificar os hábitats que compõem as áreas de vida e avaliar se houve seleção em diferentes escalas, (iii) testar a proposta de identificação de indivíduos por armadilhas fotográficas, e então, analisar aspectos populacionais. Oito tamanduás-bandeira foram monitorados via GPSIridium, sendo sete concomitantemente de maio a setembro de 2015 na Estação Ecológica de Santa Bárbara - EESB. A área de vida e a área de uso foram de 3,41 km² e de 0,65 km², respectivamente. Machos tiveram áreas de vida maiores e maior atividade. O compartilhamento do espaço foi baixo e os machos sobrepuseram suas áreas às das fêmeas. Machos e fêmeas estiveram em proximidade. A seleção de hábitat foi direcionada para savana e o reflorestamento foi evitado. Para testar um método de identificação in... / Abstract: Giant anteaters (Myrmecophaga tridactyla) are mammals with a wide range and their populations are threatened by several causes, which have led to the inclusion of the species in international, national and regional red lists. This large-sized species feeds exclusively on social insects, contributing to ecosystem dynamics. Despite its importance, the species is poorly known, mainly in what concerns the ecological understanding of populations in areas with anthropogenic influence. The goals of this study were (i) to estimate the home range and core areas of giant anteaters at an Ecological Station with Cerrado habitat influenced by anthropogenic actions, as well as to investigate the spatial ... / Doutor

Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-08-05T19:19:27Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Approved for entry into archive by Vilma Conceição(vilmagc@ufba.br) on 2013-08-08T14:11:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-08T14:11:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Final ZAFIRA pdf.pdf: 692134 bytes, checksum: b4494b39d68a80325cc5987e4daa2f93 (MD5) / Fapesb, Plantações Michelin da Bahia / 1. As abelhas sem ferrão A tribo Meliponini pertence à família Apidae (Apoidea, Hymenoptera) que se destaca como a mais diversificada e com distribuição mais ampla no mundo (Silveira et al., 2002). Das 19 tribos da sub-família Apinae, Meliponini e Apini agrupam as abelhas com comportamento eusocial, o mais alto nível de organização social (Michener, 2000). As abelhas Meliponini apresentam ampla distribuição nos trópicos de todo o mundo (Michener, 2000). A região neotropical contém o maior número de espécies de meliponíneos apresentando 32 gêneros exclusivos (Camargo e Pedro, 2007) do total de 56 gêneros da tribo distribuídos no mundo (Costa et al., 2003). Essas abelhas são visitantes florais numericamente dominantes em várias formações vegetais, destacando-se particularmente nas florestas tropicais pluviais. Na Mata Atlântica, os meliponíneos aparecem associados especialmente às floradas maciças (mass-flowerings), desempenhando papel central na biologia reprodutiva de árvores do dossel (Ramalho, 2004; Monteiro e Ramalho, 2009). Nos meliponíneos, a reprodução e fundação de uma nova colônia perene são feitas por um conjunto de abelhas (rainha e operárias) e ocorre através de um processo de enxameagem progressiva, com longo período de contato entre colônia mãe e filha, ao contrário da ruptura abrupta observada em Apis (Nogueira-Neto, 1997; Velthuis et al., 1997). As operárias nascidas na colônia mãe passam vários dias abastecendo o novo ninho com materiais de construção (cerúmen) e alimento (Nogueira-Neto, 1997). Esta característica pode limitar a formação de novas colônias aos sítios de nidificação mais próximos ao ninho materno (Batista et al., 2003). Apesar dos meliponíneos apresentarem ampla diversidade de substrato de nidificação a maioria das espécies necessitam de cavidades pré-existentes em ocos de árvores (Roubik, 1989; Michener, 2000; Batista et al., 2003). Por isso, as espécies deste grupo de abelhas podem ser bastante suscetíveis à fragmentação da floresta. A manutenção das abelhas sociais sem ferrão para a conservação da Mata Atlântica se deve à importância dessas abelhas como agentes polinizadores de árvores nativas. A redução brusca dos meliponíneos ocasionadas por desmatamentos ou por ação predatória pode gerar redução na diversidade de espécies destes indivíduos e, consequentemente redução de espécies de plantas dependente destas abelhas (Roubik, 1993). 2. A espécie Tetragonisca angustula A espécie Tetragonisca angustula (Latreille, 1811) é uma das abelhas mais comuns com uma ampla distribuição geográfica na América Tropical (Moure, 2007), apresentando um importante papel na polinização da flora nativa (Oliveira et al., 2004). T. angustula é uma espécie generalista na ocupação dos habitats e também no uso de fontes florais e locais de nidificação (Batista et al., 2003). Adapta-se bem a diversos substratos de nidificação, ocupando cavidades pré existentes em troncos de árvores vivas ou mortas, construções humanas, solo, etc. Ao contrário de espécies de Meliponini mais estreitamente associadas à floresta, T. angustula comporta-se como generalista, ocupando vários hábitats em ambientes modificados, incluindo áreas urbanas (Batista et al., 2003; Ramalho e Batista 2005). 3. Fragmentação do habitat A fragmentação de habitats naturais tem sido uma das causas mais importantes para o decréscimo populacional local e perda de biodiversidade regional. Os fragmentos naturais geralmente formam paisagens em mosaico, onde a dinâmica das populações agora também em mosaico e os processos ecológicos podem estar sob forte pressão de fatores dependentes da escala espacial e das características das matrizes modificadas (Andren, 1994; Wiens, 1995). A Mata Atlântica foi reduzida em mais de 90% da sua extensão original e os fragmentos florestados remanescentes estão pulverizados na ampla área de distribuição (Guedes et al., 2005), de modo que a conectividade funcional se tornou uma variável chave para preservação da biodiversidade. Em áreas como o litoral da Bahia, na porção norte, a maioria dos remanescentes florestados tem menos de 100 ha, e a conectividade funcional é o problema central que atinge as populações de meliponíneos (Ramalho e Batista, 2005). A preservação da biodiversidade em longo prazo na região demanda medidas de maior escala espacial, como os corredores ecológicos (Zaú, 1998). Operacionalmente os corredores estão associados à idéia de conectividade física - ou melhor, da matriz interveniente entre os fragmentos - mas o aspecto relevante é o nível de conectividade funcional alcançada: ou seja, de que forma a estrutura de populações de organismos focais e processos ecológicos associados são afetados nestas escalas espaciais. 4. Marcadores Moleculares O estudo de polimorfismos até a década de 60 foi baseado em variações fenotípicas. Essas eram pouco perceptíveis e limitavam a percepção de diferenças significativas entre as populações (Futuyma, 1992) ou suas respostas sutis às variações espaciais. Ensaios subseqüentes com marcadores moleculares evidenciaram locos polimórficos que não seriam identificados com observações fenotípicas. A primeira técnica utilizada foi a eletroforese de proteínas, desenvolvida por Harris (1966) e Hubby e Lewotin (1966). Os marcadores isoenzimáticos foram muito usadas em estudos de dispersão de espécies e na análise de filogenia e sua difusão ocorreu a partir do desenvolvimento de métodos eficientes de visualização do produto enzimático (Ferreira e Gratapaglia, 1998). As isoenzimas foram utilizadas em estudos com abelhas inclusive com T. angustula (Castanheira e Contel (1995 e 2005). Em 1968 foram descobertas as enzimas de restrição houve um desenvolvimento da técnica de RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). Esta técnica oferecia vantagens em relação à anterior e podia ser utilizada em estudos populacionais. Atualmente existem vários tipos descritos de marcadores moleculares que podem ser utilizados em estudos populacionais comportamentais e filogenéticos. O marcador é escolhido de acordo com o problema a ser analisado e com a disponibilidade de recursos (Avise, 1989). Os marcadores co-dominantes são mais indicados para estudos populacionais, pois, nesses casos, oferece maior precisão e vantagens técnicas do que os marcadores dominantes (Sunnucks, 2000; Arias et al., 2006). Entre as características que tornam os marcadores co-dominantes mais versáteis e precisos, destacam-se: i) grande abundância e distribuição uniforme por todo o genoma; ii) são multi-alélicos e, portanto, maior conteúdo informativo por loco (Ferreira e Gratapaglia, 1998). Os microssatélites são marcadores moleculares, que permitem acessar uma ampla gama de diferenciações e abordar os processos ecológicos e evolutivos subjacentes, sendo por isso adequados para estudos populacionais (Arias et at., 2006). 3.1 Microssatélites Os marcadores microssatélites também são denominados SSRs (Simple Sequence Repeats) ou STRs (Short Tandem Repeats). Inicialmente, o termo microssatélite foi utilizado apenas para designar repetições CA (ou CG) (Brito 2005 apud Litt; Luty, 1989) e os termos “Simple Sequence Repeats” ou “Short Tandem Reapeats” eram utilizados para as outras repetições. Atualmente o termo microssatélite é utilizado para quaisquer repetições que envolvam um pequeno número de pares de bases (Oliveira et al., 2006). Assim, os microssatélites constituem uma curta seqüência repetida em tandem (em “fila”), com um tamanho de 1-6 nucleotídeos, distribuídos aleatoriamente pelo genoma da maioria dos organismos. Essas seqüências podem se repetir por até algumas dezenas de vezes e, freqüentemente, exibem polimorfismo multi-alélico (Ferreira e Gratapaglia 1998). Para visualizar o polimorfismo nos microssatélites é realizada a amplificação das sequências repetidas pela reação em cadeia da polimerase (PCR), que utiliza pequenas seqüências de nucleotídeos como primers (Farah, 2000). Para isso, é mais indicado a seleção de primers específicos ou a transferência de primers heterólogos previamente testados (Francisco et al. 2006). 20 Os microssatélites podem ser separados em quatro classes: (i) perfeito, quando as seqüências são repetidas sem interrupção (GTGTGTGTGT); (ii) imperfeito, quando uma ou outra repetição apresenta uma base que não pertence à repetição (GTGTCGTGT); (iii) interrompido, quando há a inserção de um pequeno número de pares de bases entre as seqüências repetidas (GTGTGTAAAGTGT); e (iv) composto: quando dois ou mais microssatélites estão justapostos (CACACAGTGTGT) (Oliveira et al., 2006). Estas interrupções do tipo “ii, iii e iv” parecem estabilizar os microssatélites, visto que se observa menor incidência de erros durante a replicação nesses casos (Weber, 1990). Os microssatélites têm sido extremamente úteis em estudos populacionais, principalmente no que se refere às análises de relações de parentesco, variações espaciais intra-específicas e filogeografia (Sunnucks, 2000; Moritriz e Hills, 1996; Avise, 1989). A transferência de primers heterólogos de microssatélites é uma alternativa para a redução de tempo e de custos de seleção de primers específicos. Esta transferência se torna possível pela conservação de regiões que flanqueiam os microssatélites em espécies taxonomicamente próximas (Ferreira e Grattapaglia, 1998), mas há riscos de insucesso, sobretudo na detecção de alelos polimórficos. Atualmente há um grande número de estudos com microssatélites, incluindo vários com abelhas Meliponini (Chung et al., 1993; Butcher et al., 2001; Paxton et al., 2003; Peters, 2003; Jean-Chistophe et al., 2005; Francisco et al., 2006; Carvalho-Zilse e Kerr, 2006; Steiner et al., 2006; Thorén et al., 2007; Souza et al., 2007). Em muitos casos a transferência de primers entre espécies gerou resultados satisfatórios. Chung et al.(1993) transferiu com sucesso primers de bovinos para caprinos; Francisco et al. (2006) ressaltou que a transferência de primers heterólogos para Plebeia remota foi eficiente, apesar de revelar poucos alelos por loco; Carvalho-Zilse e Kerr (2006) utilizaram primers heterólogos entre espécies do gênero Melipona e o resultado foi satisfatório. 3.2 Estudos Populacionais Envolvendo Microssatélites Recentemente, a utilização dos microssatélites como marcadores moleculares em estudos populacionais e evolutivos tem sido bem sucedida em diversos organismos (Simonsen et al., 1998, Haavi et al., 2000, Clémencet et al., 2005). Arias et al. (2006) descreveram vários exemplos em que microssatélites e DNA mitocondrial (DNAmt) foram aplicados ao estudo de espécies de abelhas sociais. Os resultados obtidos já permitem formular hipóteses a cerca da filogenia, dinâmica populacional e evolução dos grupos de abelhas. Widmer et al. (1998) puderam constatar que populações de abelhas Bombus (Bombini) das ilhas Canárias (Bombus canariensis) e Madeira (Bombus maderensis) apresentavam grandes diferenças de afinidade com populações do continente próximo (Bombus terrestres), usando microssatélites e um loco do DNA mitocondrial do citocromo b. Com uso de microsatélites. Widmer e Schmid-Hempel (1999) detectaram diferenças consistentes entre 16 populações de Bombus pascuorum, que sustentavam o argumento de isolamento por processo de vicariância, causado pelo soerguimento dos Alpes. Em Meliponini, Francisco (2002) fez análises de DNAmt e microssatélites em Plebeia remota para estudos populacionais. O trabalho identificou diferenças genéticas entre amostras de populações de diferentes estados brasileiros (São Paulo, Paraná e Santa Catarina). Entretanto, mostrou que houve um baixo polimorfirmo na transferência de primers entre espécies. Werneck (2008) avaliou a influência de alelos nulos no sucesso sobre a transferência de sete primers para Melipona mandacaia, desenvolvidos para Melipona bicolor. Em estudos de populações de Partamona mulata e Partamona helleri (Meliponini), Brito (2005) observou baixa variabilidade genética nos locos de microssatélites de ambas as espécies e discreta estruturação genética dentro das populações locais. Segundo a autora, este último aspecto poderia ser conseqüência da fragmentação dos habitats de floresta ou de cerrados, áreas de distribuição das espécies. Em síntese, os microssatélites são muito úteis no estudo de diferenciações nas populações em grande escala ou escala geográfica e, provavelmente, também podem ser aplicados com sucesso na análise de estrutura de populações em menor escala espacial (populações locais ou em mosaico). No entanto, nos estudos com abelhas Meliponini tem sido observado baixo polimorfismo com a utilização de primers heterólogos, o que pode demandar maior esforço de caracterização de marcadores específicos em número adequado para análises robustas de estrutura espacial de populações. / Salvador, Bahia

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-16Bitstream added on 2014-06-13T20:29:27Z : No. of bitstreams: 1 rodrigues_mg_me_sjrp.pdf: 1264858 bytes, checksum: 0078fa5981910a3510d18b60f351fd54 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foram analisados exemplares das cinco espécies de Chironius (C. bicarinatus, C. exoletus, C. foveatus, C. fuscus e C. laevicollis), provenientes da Floresta Atlântica na Serra do Mar, incluindo os estados do Paraná, São Paulo e Rio de Janeiro. Todas as espécies foram caracterizadas em relação à morfologia, dieta e uso do ambiente. O dimorfismo sexual no tamanho de corpo é variável entre as espécies: machos de C. bicarinatus e C. foveatus são maiores que as fêmeas conspecíficas, ao passo que em C. fuscus e C. laevicollis não existe dimorfismo sexual de tamanho, e em C. exoletus, as fêmeas são maiores. Essas diferenças sugerem que o comportamento de combate ritual, registrado em algumas espécies não esteja difundido em todos representantes do gênero. A comparação interespecífica evidência diferenças marcantes na morfologia e dieta: Chironius laevicollis tem corpo grande, maior robustez, a menor cauda e dieta baseada em anfíbios terrestres, características condizentes com o hábito terrestre; C. fuscus, tem corpo pequeno, robustez intermediária e alimenta-se principalmente de anuros terrestres, indicando hábito predominantemente terrestre; C. bicarinatus tem corpo médio, robustez intermediária e dieta baseada em anuros arborícolas e terrestres, sugerindo que forrageia freqüentemente nos dois ambientes; C. exoletus possui corpo pequeno, é pouco robusta e apresa principalmente anuros arborícolas, indicando que forrageia principalmente no substrato arbóreo, e por fim, C. foveatus possui o maior tamanho corporal, menor robustez, a maior cauda e dieta baseada em anuros arborícolas, o que indica ser a espécie mais arborícola do grupo. O ancestral hipotético desse grupo possuía tamanho médio de corpo e cauda, era semi-arborícola e alimentava-se de anfíbios terrestres e arborícolas. / We explored the relationship of morphology, diet and habitat use in five sympatric species of Chironius (C. bicarinatus, C. exoletus, C. foveatus, C. fuscus and C. laevicollis) from Serra do Mar, eastern Brazil. Sexual dimorphism in body length varies among species: males C. bicarinatus and C. foveatus are larger than conspecific females, whereas no sexual dimorphism in body size is recorded for C. fuscus and C. laevicollis, and female C. exoletus is the larger sex. Such differences suggest that ritual combat (already recorded in the genus Chironius) may be absent in some species. Interespecific comparison shows differences in morphology and diet: Chironius laevicollis has large body size and the smallest tail, is more stout, and prey on terrestrial anurans, characters that may reflect terrestrial habit; C. fuscus, has small body length, medium stoutness and feed on terrestrial anurans, indicating a predominant terrestrial habit; C. bicarinatus has medium body size and stoutness, preying on terrestrial and arboreal anurans, suggesting a semi arboreal habit; C. exoletus has small and slender body and prey on arboreal anurans, indicating an arboreal habit, and finally C. foveatus has the largest body size and tail length, is more slender, and feed on arboreal anurans, thus may been the most arboreal species of the group. Hypothetic ancestor of this clade had medium body and tail length, was semi arboreal and fed on terrestrial and arboreal anurans.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-29Bitstream added on 2014-06-13T19:09:03Z : No. of bitstreams: 1 silva_je_me_araca.pdf: 480204 bytes, checksum: 3f672851a7676fc325ad0d02e687d2c1 (MD5) / Existem vários métodos para quantificação da população canina em áreas urbanas, dentre elas o censo, que consiste na contagem integral dos animais domiciliados. Como alternativas para este método existem os métodos de amostragens que permitem uma estimativa da população, que podem ser utilizados tanto para animais domiciliados quanto para animais soltos nas ruas. Um dos métodos utilizados para dimensionar a população de cães sem supervisão nas ruas em áreas urbanas, é a captura-recaptura fotográfica. Porém, torna-se ineficiente quando se quer investigar como estes animais se movimentam e utilizam os espaços urbanos. Este trabalho propõe o emprego da captura-recaptura fotográfica, juntamente com o uso de um GPS (Global Positioning System), para avaliar a movimentação destes cães. Com este objetivo e por meio da utilização de uma motocicleta e um observador, todas as ruas do bairro Jardim Ipanema e parte do bairro Dona Amélia, de Araçatuba-SP foram percorridas por 12 vezes durante dois dias, no período diurno, nos horários entre 7 e 18 horas, com uma semana de intervalo entre eles. O percurso foi feito de forma que cada rua fosse percorrida na mesma sequência e no mesmo período de tempo. Os cães encontrados soltos foram fotografados e tiveram suas localizações determinadas por meio de um GPS. A identificação dos animais e o registro de seus respectivos posicionamentos geográficos possibilitou uma estimativa da concentração espacial e temporal dos mesmosas ruas do bairro. Os resultados foram analisados através do teste Quiquadrado pelo programa BioEstat 5.3 (significância 0,05). Foram observados 77 cães soltos nas ruas, sendo que 21 destes foram fotografados mais de uma vez (foto-recapturados). A metodologia permitiu observar que houve maior concentração dos mesmos em determinadas regiões do bairro, com destaque para as áreas onde as ruas... / There are several methods for the quantification of the canine population in urban areas, including the census, which is the total or direct count of restricted or supervised dogs. As an alternative to this method there are sampling methods which allow an estimation of the population, which can be used for both restricted and free roaming dogs. One method used to determine the size population of free roaming dogs in urban areas, is the photographic capture-recapture. However, if used isolate, becomes inefficient when the purpose is to investigate how these animals use public spaces. This paper proposes the use of this method with the use of a GPS (Global Positional System) to evaluate the movement of free dogs on public roads. With the use of a motorcycle and an observer, all the streets of Ipanema Garden and part of Dona Amelia districts, in Araçatuba-SP, were covered by 12 times over two days, during the morning and afternoon, from 07 until 18 o’clock, with one week interval between them. The free dogs were photographed and their locations were determined by a GPS. The animal identification and the registration of their respective geographic positions allowed us to estimate the spatial and geographical concentration of animals and the distances traveled by them in the neighborhood. Qui-Square test was used for statistical analysis of the results with the BioEstat 5.3 Program (0.05 of significance). A total of 77 dogs were observed on the streets and 21 of them were photographed more than once (photo recaptured).The methodology allows observing that there was a greaterconcentration of them in certain areas of the district, especially in areas where the streets were unpaved and most houses had no walls... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Francisco Manoel de Souza Braga / Banca: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Maria Elina Bichuette / Resumo: A bacia do rio Itanhaém é a segunda maior bacia costeira do Estado de São Paulo. Nesta bacia, a proximidade da Serra do Mar determina um forte gradiente altitudinal que pode ser percebido pela distribuição da ictiofauna. Ferreira (2007) realizou estudo acerca da estrutura da ictiofauna e de sua distribuição nos riachos da bacia do rio Itanhaém, verificando a complexa diversidade, comparada a outras bacias costeiras do Leste. Silva (2009) enfocou estudo sobre a composição alimentar e estrutura trófica das principais espécies encontradas no trabalho de Ferreira (2007). O objetivo desse trabalho foi caracterizar a biologia reprodutiva das principais espécies de peixes nos riachos na bacia do rio Itanhaém (SP), a saber : Deuterodon iguape (n= 1.367) (Characidae), Mimagoniates lateralis (n=247) e M. microlepis (n=294) (Characidae), H. reticulatus (n=180) (Characidae), Kronichthys heylandi (n=392) (Loricariidae), Scleromystax macropterus (n=98) e S. barbatus (n=112) (Callichthyidae), Rhandioglanis transfaciatus (n=220) (Heptapteridae). A análise da dinâmica da reprodução foi realizada através dos parâmetros reprodutivos: estádios de maturidade gonadal (EM), relação gonadossomática (RGS), grau de gordura acumulada (GA) e grau de repleção do estômago (GR) associados aos valores do fator de condição alométrico (K) e relativo (Kr) para cada população. A determinação do tipo de desova e a estimativa da fecundidade foram realizadas para as fêmeas que estiveram em atividade reprodutiva (estádio C). As estratégias reprodutivas adotadas por cada população de peixes foram analisadas, com relação aos diferentes tipos de água (clara e preta) dos riachos. O período reprodutivo de todas as espécies culminou na estação chuvosa, período que apresenta altos índices pluviométricos na região, que é regida pelo regime pluvial marcado, de chuvas mais intensas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Itanhaém River basin is the second largest coastal basin of São Paulo State. Its proximity of the Serra do Mar provides a strong altitudinal gradient which may be perceived by the fish distribution. Ferreira (2007) conducted a study about the fish fauna structure and its distribution in the Itanhaém River basin streams by checking the diversity complex, compared to other East coastal basins. Silva (2009) focused on the food composition and trophic structure of the main species found in Ferreia (2007). The aim of this study was to characterize the reproductive biology of the main species in the Itanhaém River basin streams, as followed: Deuterodon iguape (n= 1.367) (Characidae), Mimagoniates lateralis (n=247) and M. microlepis (n=294) (Characidae), H. reticulatus (n=180) (Characidae), Kronichthys heylandi (n=392) (Loricariidae), Scleromystax macropterus (n=98) and S. barbatus (n=112) (Callichthyidae), Rhandioglanis transfaciatus (n=220) (Heptapteridae). Reproductive dynamic analysis was carried out using reproductive parameters: stage of gonadal maturity (EM), gonadosomatic relationship (RGS), degree of fat accumulation (GA) and degree of stomach replation (GR) associated with allometric (K) and relative (Kr) condition factor values for each population. Type of spawning and fecundity estimative were conducted from females in reproductive activity (stage C). The reproductive strategies adopted by each fish population were analysed for different type of stream water (clear and black). All species reproduced at the rainy season in Itanhaém river basin, which has high rainfall indices, marked by heaviest rains during February to May and dry season during August to November. Species were allocated into two groups to better discussion. The Characiforms, represented by D. iguape, M. lateralis, M. microlepis and H. reticulatus were total spawner, had small oocytes and showed... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Selene Maria Coelho Loibel / Banca: José Silvio Govone / Banca: Ermínia de Lourdes Campello Fanti / Resumo: O conhecimento dos métodos de amostragem juntamente com suas técnicas para a coleta de dados é indispensável a todos àqueles que desejam realizar trabalhos com levantamentos amostrais. Inicia-se o seu estudo fazendo-se um apanhado de fatos históricos que marcaram a estatística e a amostragem juntamente com seus principais pensadores desde o século XVIII. Em seguida são descritos os principais estimadores da amostragem aleatória simples (AAS) com ou sem reposição onde as mesmas são comparadas. Tem-se também a amostragem estratificada (AE), destacando-se as alocações Proporcional, Uniforme e Ótima de Neyman com seus respectivos estimadores, feita uma comparação entre AAS e AE para uma indicação da melhor entre as técnicas descritas. Outras técnicas também são mencionadas de forma superficial. Um exemplo de aplicação é apresentado no final do capítulo 3 para uma visualização numérica das teorias apresentadas. Por fim, tem-se alguns resultados de um levantamento de dados com aplicação direta ao projeto de extensão "Dimensionamento da População Canina no município de Rio Claro - SP / Abstract: The knowledge of sampling methods along with their techniques for data collection is indispensable to all those wishing to undertake work with sample surveys. We begin this study with an overview of historical events that marked statistics and sampling along with its major thinkers since the eighteenth century. Then we describe the main estimate of simple random sampling (SRS), with or without replacement, where the same are compared. We also present stratified sampling (SS), highlighting Neyman's Proportional, Uniform and Optimal allocations with their respective estimate. A comparison is made between the SRS and SS for an indication of the best among the techniques described. Other techniques are also mentioned, in a superficial way. An application example is presented at the end of chapter 3 for a numerical display of the theories presented. Finally, there are some results of a survey of data with direct application to the extension project "Scaling of the Canine Population in the city of Rio Claro - SP / Mestre

Orientador:'Claudio José Von Zuben / Banca: Daniela Rodrigues / Banca: Wesley Augusto Conde Godoy / Banca: Rosana Tidon / Banca: César Pagotto Stein / Resumo: Apesar de ter sido introduzida no Brasil em 1999, estudos envolvendo aspectos biológicos bem como a dinâmica populacional de Zaprionus indianus ainda são muito escassos. Este drosofilídeo, considerado praga em monoculturas de figo-roxo, possui uma grande capacidade de dispersão e de estabelecimento em diferentes ambientes. Este fato contribuiu de forma expressiva para sua rápida expansão em todas as regiões do país, atacando tanto frutos de ambientes naturais, quanto os presentes nestas monoculturas. Esses ataques têm causado grandes prejuízos à comercialização desta fruta, tanto no mercado nacional quanto de exportação, fazendo com que alguns produtores abandonem suas plantações. Diante desta problemática, os objetivos desse estudo foram: analisar a dinâmica populacional de Z. indianus em plantações de figo-roxo e caracterizar alguns aspectos biológicos que influenciam sua flutuação populacional. Para isso, foram realizadas coletas mensais de set/2010 a ago/2011 em plantações de figo-roxo localizadas na região de Valinhos (SP). Ademais, experimentos voltados à caracterização dos estágios imaturos de Z. indianus, como número de instares, processo de pupação e caracterização morfológica destes estágios foram conduzidos no laboratório de Entomologia I e no laboratório de Microscopia Eletrônica da UNESP/RC. Outros, voltados à caracterização de aspectos como sobrevivência, tempo de desenvolvimento, tamanho corporal do adulto, parâmetros nutricionais ótimos para desempenho larval e escolha da fêmea quanto a locais para oviposição foram realizados, via geometria nutricional, no laboratório "Development, Evolution and the Environment" - IGC/Portugal. A nutrição é um fator diretamente relacionado às características de vida dos drosofilídeos, podendo ser usada para se compreender a história de vida destes animais. No método utilizado, a condição nutricional de um animal é representada... / Abstract: Despite having been introduced in Brazil in 1999, studies involving biological aspects and population dynamics of Zaprionus indianus are still very scarce. This drosophilid, considered as a pest in fig-purple crops, has a great capacity of dispersal and establishment in different environments. This fact contributed significantly to its rapid expansion in all regions of the country, attacking fruits of natural environments and in monocultures. These attacks have caused major damage to both national and export markets, causing the fact that some producers have abandoned their plantations. Considering this problem, the objectives of this study were to analyze the population dynamics of Z. indianus in fig-purple crops and characterize some biological aspects that influence its population fluctuations. For this, the drosophilids were monthly collected from Sep/2010 until Aug/2011 in fig-purple crops in the region of Valinhos (SP). Furthermore, others experiments aimed at characterize the immature stages of Z. indianus were conducted, like number of instars, pupation process and morphological characterization of these stages by scanning electron microscopy. Others, involving the characterization of aspects such as survival, viability, development time, adult body size, nutritional parameters for optimal larval performance and female oviposition site choice were performed by nutritional geometry. The nutrition is a factor directly related to the life history of drosophilids. In this methodology, the nutritional status of an animal is represented as a point within a nutritional space with "n" dimensions. Depending on the intake of calories and macronutrients, the regulatory systems of this animal are able to alter its metabolism in order to achieve a balance, and the consequences of these adjustments can be viewed by changes in its biological characteristics, these being analyzed here. As in field work, the species Drosophila simulans revealed... / Doutor

Orientador: Mauro Galetti Rodrigues / Coorientador: Milton Cezar Ribeiro / Supervisor: Carlos Peres / Banca: Adriano Garcia Chiarello / Banca: Luciano Martins Verdade / Resumo: A crescente demanda por fontes alternativas de energia tem contribuído para o aumento da produção de biocombustíveis, levando a fragmentação dos habitats naturais. No entanto, paisagens naturais imersas em matrizes agrícolas podem reter uma diversidade de espécies considerável, mas os efeitos da mudança no uso do solo para a produção de biocombustíveis sobre a persistência das espécies nessas paisagens ainda permanecem incertos. A Mata Atlântica, ecossistema mais fragmentado do Brasil, tem apenas cerca de 12% de sua cobertura vegetal original. A maioria destes remanescentes estão distribuídos em fragmentos pequenos e isolados devido à expansão agrícola, especialmente pela monocultura de cana-de-açúcar. No presente estudo examinamos a riqueza e a composição de mamíferos de médio e grande porte, e quantificamos a contribuição da cobertura florestal, da área estrutural e da quantidade de borda sobre a persistência desses animais. Amostramos 20 paisagens fragmentadas, em um gradiente de cobertura florestal (3% a 96%), imersas em plantações de cana-de-açúcar. Registramos apenas 50% das espécies esperadas de mamíferos de médio e grande porte em todas as 20 paisagens, em comparação com o maior remanescente de floresta semidecídua, o "Parque Estadual Morro do Diabo". Isso nos mostra que esses remanescentes de Mata Atlântica estão altamente empobrecidos, restando apenas25% de espécies especialistas florestais, e a maioria dos mamíferos registrados são espécies generalistas, exóticas e típicas de cerrado. A cobertura florestal foi importante para explicar apenas a presença de alguns ungulados e um roedor de médio porte. As comunidades de mamíferos responderam à substituição de espécies entre as paisagens, que representou 94% da β-diversidade total. Nosso estudo é novo em mostrar que a riqueza de mamíferos não foi afetada pela quantidade de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The growing demand for alternative energy sources has contributed to increased biofuel production, leading to fragmentation of natural habitats. However, natural landscapes immersed in agricultural matrices can retain a considerable diversity of species, but the effects of the change in land use for the production of biofuels on the persistence of the species in these landscapes remain unclear. The Atlantic Forest, the most fragmented ecosystems in Brazil, has only about 12% of its original vegetation cover. The most of these remnants are distributed in small and isolated fragments due to agricultural expansion, especially by the sugarcane monocultures. In the present study we examined the richness and composition of medium and large sized mammals, and quantify the contribution of the forest cover, the structural area and the edge amount over persistence of these animals. We sampled 20 fragmented landscapes on a forest cover gradient (3% to 96%), immersed in sugarcane plantations. We recorded only 50% of expected species of medium and large sized mammals in all the 20 landscapes, compared to the largest remnant of semideciduous forest, the "Morro do Diabo State Park". This shows that the Atlantic Forest remnants are highly depleted, with only 25% of forest-specialist species and most of the mammals registered are generalist species, exotic and typical from savana. Forest cover was important to explain only the presence of some ungulates and a medium sized rodent. The mammal communities responded to a high turnover of species between the landscapes, which represented 94% of the total β- diversity. Our study is novel in showing that mammal richness was not affected by the habitat amount. It is important to implement effective conservation measures in natural areas in agricultural landscapes in order to develop measures of restoration of forest cover of the fragments, because they are ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre