Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-12-12Bitstream added on 2014-06-13T18:59:02Z : No. of bitstreams: 1 peres_mg_me_botfmvz.pdf: 321962 bytes, checksum: e4980a385d5afa43c314d6e3ff0b8080 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O trabalho teve por objetivo avaliar o potencial de roedores silvestres e outros mamíferos selvagens de pequeno e médio porte como reservatório do vírus vaccínia, bem como determinar os possíveis fatores de risco associados à prevalência de portadores de anticorpos contra Orthopoxvirus em vacas leiteiras e outros animais domésticos, animais selvagens e em humanos. Para tanto, questionário epidemiológico foi aplicado a 47 propriedades rurais distribuídas ao longo dos municípios de Torre de Pedra (com registros oficiais de surtos por VACV afetando rebanhos leiteiros e ordenhadores), Bofete e Anhembi (sem registros oficias de surtos) a fim de levantar dados sobre o estado sanitário de cada propriedade e possíveis fatores de risco. Amostras de sangue e soro foram coletadas, após autorização prévia, de vacas, cavalos, carneiros, suínos, cães e gatos, também dos produtores rurais e seus familiares, e dos animais selvagens capturados em cada propriedade. Foram conduzidas análises sorológicas através das técnicas de vírus neutralização (para amostras de soro humano e de animais domésticos) e teste de neutralização pela redução da formação de placas (para amostras de animais selvagens). Os resultados mostram baixa positividade entre os animais selvagens e alta positividade entre domésticos e humanos, sugerindo que algumas espécies domésticas como cães e cavalos podem representar possíveis reservatórios além de apontar fatores de risco como a fonte de água e animais selvagens de hábitos ribeirinhos, como futuros alvos de estudo sobre as formas de disseminação do vírus vaccínia / This work aimed analyze the potential of wild rodents and others wild mammals as vaccinia virus reservoir, as well as to determine the risk factors associated to orthopoxvirus antibodies prevalence in milking cows and other domestic animals, wild animals and humans. An epidemiological questionnaire was applied to 47 farms distributed among Torre de Pedra, Bofete and Anhembi, to obtain data about sanitary situation of the farms and possible risk factors. Blood samples were collected from cows, horses, sheep, swine, dogs and cats, also from milker and their family, and from wild animals trapped in each farm. Serologic analyzes were proceeded using virus neurtalization (for humans and domestic animals samples) and Plaque Reduction Neutralization Test (for wild animals). The results showed low percentage of positivity in wild animals and high positivity between humans and domestic animals, suggesting other possible reservoirs like dogs and horses as possible reservoirs and source of water and riparian wild animals as risk factor for VACV infection opening new targets for future studies about Vaccinia virus dissemination

A Fazenda Três Lagoas, localizada no município de Angatuba, região do Alto Paranapanema (centro-sul do Estado de São Paulo), é uma área na qual houve introdução de espécies exóticas, como Eucalyptus sp e Brachiaria sp, que fragmentaram o habitat de cerrado original. Uma vez em que foi estabelecida atividade humana em um ambiente antes natural, houve expansão do contato entre humanos e animais domésticos com as populações de animais silvestres; sendo a influência destes fatores sobre o ecossistema local ainda pouco conhecido. O presente estudo teve como objetivo pesquisar a exposição de pequenos mamíferos silvestres e animais domésticos da região a agentes infecciosos e transmissores de zoonoses (Leptospira spp., Lyssavirus, Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Rickettsia spp.). O levantamento dos patógenos nos animais silvestres revelou resultados sorológicos positivos para Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). Em relação aos animais domésticos, foram encontrados 40% de cães (n=10) soropositivos para N. caninum, 20% de soropositivos para Leptospira spp. e T. gondii (n=10), e 23,27% dos cães (n=11) apresentaram títulos de anticorpos menores ou iguais a 0,5 UI/ml para Raiva. Os bovinos (n=42) apresentaram resultados sorológicos positivos para N. caninum (23,8%) e Leptospira spp. (40,5%). 47,6% do gado não havia sido vacinado ou a vacinação para o vírus rábico era desconhecida. Dos 22 bovinos conhecidamente vacinados para a Raiva, 36% foram pouco reagentes ao exame sorológico. Os resultados apresentados, além de contribuírem para a avaliação do status sanitário local, contribuem para o maior conhecimento da interface entre fauna doméstica e silvestre em agroecossistemas. / Três lagoas farm, which is located in Angatuba municipality, in High Paranapanema (southeast of São Paulo state) is an area where exotic species were introduced, such as Eucalyptus sp and Brachiaria sp, which fragmented the habitat in the original Cerradão (a tropical savanna ecoregion). Once the human activity has been established in a natural environment, the contact among human beings and domestic animals with wild animal populations has increased. Nevertheless, the influence of such factors on the ecosystem has not been clarified yet. The aim of the present study was to research the exposition between wild small mammals and domestic animals of this area against infecctious and transmitters of zoonoses agents (Leptospira spp., Toxoplasma gondii, Lyssavirus, Neospora caninum and Rickettsia spp.). The raising of pathogens in the wild animals revealed positive serological results for Leptospira spp. (5,5%, n= 73), Rickettsia spp. (7,9%, n=38) e Toxoplasma gondii (16,1%, n= 56). In relation to the domestic animals, were showed 40% of dogs (n=10) seropositives for N. caninum, 20% were seropositives for Leptospira spp. and T. gondii, and 23.7% of dogs presented antibody titers less than or equal to 0,5 UI/ml for Rabies. The cattle (n=42) had serologic results positives for N. caninum (23,8%) and for Leptospira spp. (40,5%). 47.6% of the cattle had not been vaccinated or vaccination for the rabies virus was unknown. Of the 22 cattle known to be vaccinated for rabies, 36% were less reactive to serologic test. These results presented, besides evaluating the local sanitary status, they can contribute to the greater understanding of the interface between domestic and wild fauna in agricultural ecosystems.

Afecções ortopédicas são freqüentes em pequenos animais e dentre essas afecções destaca-se a luxação coxofemoral – a mais freqüente dentre as luxações. Devido a tal incidência, a luxação coxofemoral tornou-se objeto de inúmeras pesquisas em medicina veterinária, sendo o tratamento cirúrgico o mais efetivo para sua correção. Ainda não foi, no entanto, desenvolvida uma técnica cirúrgica preferencial, amplamente difundida nas rotinas hospitalares. O presente trabalho avalia comparativamente o implante de fáscia lata bubalina e de pino de Steinmann transarticular para a estabilização de articulações coxofemorais luxadas. Foram utilizados 26 cães, separados em dois grupos que foram também, por sua vez, subdivididos. O primeiro grupo foi denominado “grupo Experimental” e reuniu 16 animais: oito pertencentes ao subgrupo “pino” e oito ao subgrupo “fáscia”. O segundo grupo foi denominado “grupo Rotina” e constituído por dez animais provenientes da rotina de atendimentos do Hospital de Clínicas Veterinárias da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), sendo igualmente subdividido nos subgrupos “pino” e “fáscia”, com cinco animais cada um. Os cães foram submetidos às respectivas técnicas de estabilização e acompanhados clínica e radiograficamente durante 60 dias, findos os quais os animais do grupo Experimental passaram por avaliação macroscópica direta das articulações, além da histopatologia e teste de tensiometria. A principal vantagem da fáscia respeita à deambulação dos animais, que apresentaram evolução pós-operatória significativamente precoce em relação ao grupo submetido ao implante do pino de Steinmann transarticular, além de menor grau de atrofia muscular. Os testes de tensiometria, avaliações radiográficas e exames histopatológicos não apresentaram diferenças estatisticamente significativas entre os grupos, evidenciando também que ambas as técnicas não geraram alterações deletérias à articulação operada. Destarte, conclui-se que a técnica de estabilização da articulação coxofemoral com implante de fáscia lata é eficaz e vantajosa quando comparada à técnica do pino transarticular. / The orthopedics disorders are very frequent in small animals and among them we can find the coxofemoral luxation as the most frequent disease. Because of a high incidence it became an important subject for veterinary researches. Surgery is the most effective treatment in cases of coxofomoral luxation, although the techniques that already exist are not so used in the clinics routine because of some difficulties these techniques present. In this paper the bubaline fascia lata implant and Steinmann transarticular pin were compared in surgeries for coxofemoral luxation. Twenty-six animals were used, divided into two groups that were subdivided. The first group was called “Grupo Experimental” and was formed by 16 animals, 8 animals in the subgroup called “pino” and the other 8 animals in the subgroup “fáscia”. The second group was called “Rotina” because these animals came from the routine of the clinic sector of Universidade Federal do Rio Grande do Sul Veterinary Hospital, and these groups were also subdivided in the subgroups “pino” and “fáscia”, with 5 animal each. These groups were submitted to the mentioned above stabilization techniques and after that, they were observed clinically and radiografically during 60 days. After that, it was realized a macroscopic study in the articulations of “Grupo Experimental”, besides an histopatological exam and a tensiometry test. The results showed that the technique with the bubaline fascia lata implant proved to be really efficient and it has some advantages comparing to the transarticular pin technique. The most important advantage is related to the deambulation, where the animals in this group showed a better evolution after the surgery. The level of muscular atrophy in this group was less marked. The tensiometry tests, the radiographic and histopatological exams did not present important differences between the two groups, but they were useful to show that the two techniques did not cause bad alterations in the worked articulation. In this sense it can be concluded that the stabilization of the coxofemoral articulation using bubaline fascia lata implant is a better technique comparing to the transarticular pin technique due to its advantages, mainly related to the deambulation and the muscular atrophy.

Os felinos domésticos há muito tempo são utilizados como animais de companhia, tornando freqüentes os atendimentos veterinários a esta espécie. As afecções ortopédicas em gatos ocupam papel de destaque na rotina do traumatologista veterinário, que pode deparar-se com fraturas cominutivas de ossos longos, neoplasias ósseas, não-uniões ou uniões-viciosas de fraturas. Uma das opções para o tratamento dessas afecções é a utilização de enxerto ou implante ósseo. O objetivo deste trabalho foi avaliar implantes ósseos corticais alógenos conservados em mel, congelados a -70°C ou liofilizados na substituição de segmento diafisário do fêmur de felinos domésticos. Foi confeccionada uma falha óssea de três centímetros na região diáfisária do fêmur de 24 felinos adultos. Em seis felinos (grupo controle), a falha foi preenchida com o próprio osso removido após a retirada do periósteo, endósteo e medula óssea, e em outros 18 animais, foi preenchida com implantes ósseos corticais alógenos conservados em mel (seis animais), congelado (seis animais) e liofilizado (seis animais). Os animais foram avaliados clínica, radiográfica e histologicamente até completarem 180 dias de pós-operatório. A porcentagem de incorporação foi de 91,6% no grupo controle, com tempo médio necessário para consolidação de 83,1 dias; no grupo mel foi de 75%, com tempo médio de 105 dias; no grupo congelado foi de 83,3% com tempo médio de 78 dias e no grupo liofilizado foi de 25%, com tempo médio de 120 dias. Foi encontrada diferença estatisticamente significativa entre as porcentagens de consolidação do grupo liofilizado em relação aos grupos congelado e controle. Não houve diferença estatística entre os grupos com relação ao tempo de consolidação. Foi identificada a bactéria Brevibacterium spp. em um dos implantes conservados no mel. Foi possível concluir que os implantes ósseos autógenos e os conservados no mel e a -70°C foram eficazes no preenchimento de defeito cortical em fêmur de felinos adultos, enquanto que os implantes liofilizados necessitam de maior avaliação da resistência e imunogenicidade para tornarem-se uma opção viável em felinos. / Cats with orthopedic conditions are a prominent part of the clinical work of veterinary traumatologists. Conditions such as comminuted fractures of the long bones, bone cancers and non-unions or unions that repeatedly fracture are often difficult to repair surgically and may require the use of bone grafts or implants for successful treatment. This study evaluated cortical bone allografts preserved in honey, frozen at -70°C or lyophilized for correcting 3 cm long bone defects created in the diaphysis of the right femur of adult domestic cats (n=24). In the control group (n=6), the defect was repaired using the autologous bone following removal of the periosteum, endosteum and bone marrow. In the remaining animals (n=6/group), the defect was repaired with cortical bone allografts preserved in honey, frozen or lyophilized. Success of implant incorporation and length of time for consolidation were assessed through clinical, radiographic and histological evaluations performed up to 180 days after surgery. In the control, frozen, honey and lyophylized groups, respectively, success of implant incorporation was 91.6%, 83.3%, 75%, and 25%, with corresponding mean length of time for consolidation of 83.1, 78, 105 and 120 days. Consolidation percentage in the lyophilized group was significantly lower than in the frozen and control groups. Length of time for consolidation was not different between the groups. Brevibacterium spp. was isolated from one of the implants preserved in honey. In conclusion, bone grafts preserved in honey or frozen at -70°C were effective for repairing cortical defects in the femurs of adult cats as compared to autologous bone. Lyophilized implants require more evaluation of resistance and immunogenicity before they can be considered a viable option for bone repair in cats.

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-07-24T12:43:55Z No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 723951 bytes, checksum: 25000f09a201aa6f11f03bd22606b6f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-24T12:43:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 723951 bytes, checksum: 25000f09a201aa6f11f03bd22606b6f3 (MD5) Previous issue date: 2017-07-03 / A uniformidade da leitegada em suínos pode ser o fator de maior impacto econômico sobre a rentabilidade da suinocultura. O estudo sobre a uniformidade de leitegada ainda é um desafio, especialmente ao nascimento. Além disso, não existe um consenso sobre a melhor característica a ser utilizada para descrever a variabilidade dos dados em suínos. A importância do estudo dos parâmetros genéticos aliada às divergências existentes quanto aos critérios de seleção e estratégias a serem adotadas para aumento do tamanho e da uniformidade de leitegada em suínos motivaram a realização do presente estudo. Os objetivos foram estimar parâmetros genéticos e as tendências genéticas para tamanho e uniformidade de leitegada, comparar índices de seleção com diferentes critérios para o melhoramento genético de suínos para características de leitegada e estabelecer a melhor variável para a avaliação genética da uniformidade de leitegada em suínos. Foram estudadas as seguintes características: número de leitões nascidos vivos (NV), peso médio dos leitões dentro de leitegada ao nascer (PMLN); desvio padrão do peso dos leitões dentro de leitegada ao nascer (DPN); coeficiente de variação do peso dos leitões dentro de leitegada ao nascer (CVN); número de leitões desmamados (ND); peso médio dos leitões dentro de leitegada aos 21 dias (PML21); desvio padrão do peso dos leitões dentro de leitegada aos 21 dias (DP21); e coeficiente de variação do peso dos leitões dentro de leitegada aos 21 dias (CV21). As herdabilidades para as características NV, PMLN, DPN e CVN foram superiores às obtidas ao desmame e iguais a 0,0898±0,0446, 0,3079±0,0787, 0,0115±0,0407, 0,0692±0,0458, respectivamente. As correlações genéticas entre CVN e NV ou PMLN (0,6400±0,3409 e - 0,9267±0,2147, respectivamente) estiveram associadas a menores erros padrão quando comparadas às correlações entre DPN e as mesmas características (-0,0219±0,9562 e -0,0869±0,7463, respectivamente). O aumento do NV esteve acompanhado do aumento no PMLN e DPN até atingir o ponto de máximo em 2012,7, reduzindo significativamente nos últimos anos. O mesmo não ocorreu com PML21, que permaneceu praticamente inalterado ao longo dos anos (0,0001 leitões por ano). As tendências genéticas anuais quadráticas para DPN e PMLN, seguidas pelas tendências genéticas lineares para NV, presumem que exista um tamanho ótimo intermediário quanto ao NV que proporcione máximos PMLN, apesar de ter sido associada a maiores DPN. O CVN parece ser uma medida mais apropriada para utilização em programas de melhoramento, principalmente quando avaliada ao nascimento, tendo em vista as suas maiores estimativas de herdabilidade. As tendências genéticas demostraram que o aumento do número de leitões desmamados não acompanhou o aumento do número de leitões nascidos vivos, ressaltando a necessidade de rever os objetivos do melhoramento, sobretudo avaliar as perdas econômicas em função da redução do peso médio dos leitões dentro de leitegada e do aumento do coeficiente de variação do peso dos leitões dentro de leitegada. Foram obtidos os seguintes índices de seleção: I 1 = 3,773873(NV) + 29,415334(PMLN) -71,343539(DPN); I 2 = 2,929140(NV) - 1,692489(CVN); I 3 = 9,186016(ND) + 26,984056(PML21) - 22,353914(DP21); I 4 = 5,600953(ND) - 6,201914(CV21). Os ganhos genéticos por geração situaram-se entre 0,3% e 0,9% para características da leitegada ao nascer e entre 0,1% e 0,2% para características da leitegada ao desmame, sendo possível a obtenção de ganhos genéticos para uniformidade de leitegada. Nesse contexto, seriam necessárias em torno de 10 a 15 gerações para obtenção dos ganhos genéticos desejados para as características avaliadas ao nascimento (NV, PMLN, DPN e CVN) e 30 a 35 gerações para a obtenção dos ganhos desejados para as características avaliadas ao desmame (ND, PML21, DP21 e CV21). Quando o objetivo do melhoramento é aumentar simultaneamente o tamanho da leitegada e sua uniformidade, os ganhos genéticos esperados por característica são maiores quando a seleção é praticada ao nascimento. A seleção para características de uniformidade de leitegada depende dos objetivos do melhoramento, com relações complexas entre as variáveis. No entanto, a utilização de índices contendo o NV, PMLN e DPN pode ser mais apropriada quando o interesse na resposta correlacionada favorável para CVN for maior, apesar dos ganhos diretos inferiores sobre DPN. / The litter uniformity in pigs may the factor of greatest economic impact on the profitability of pig production. The study about the litter uniformity is still a challenge, especially at birth. Moreover, there is not a consensus about the best trait to be used to describe the data variability in pigs. The importance of the study of genetic parameters, together with the existing divergences regarding the selection criteria and strategies to be adopted to increase the litter size and uniformity in pigs, motivated the accomplishment of the present study. The objectives were to estimate the genetic parameters and genetic trends for litter size and uniformity, to compare selection indexes with different criteria for animal breeding regarding litter traits, and to establish the best variable for genetic evaluation of litter uniformity in pigs. The following traits were studied: number of piglets born alive (NV), within-litter average of piglets’ birth weight (PMLN); within-litter standard deviation of piglets’ birth weight (DPN); within-litter coefficient of variation of piglets’ birth weight (CVN); number of piglets weaned (ND); within-litter average of piglets’ weight at 21 days of age (PML21); within-litter standard deviation of piglets’ weight at 21 days of age (DP21); and within-litter coefficient of variation of piglets’ weight at 21 days of age (CV21). The heritabilities for the traits NV, PMLN, DPN and CVN were higher than those obtained at 21 days of age, and equal to 0.0898 ± 0.0446, 0.3079 ± 0.0787, 0.0115 ± 0.0407, 0.0692 ± 0.0458, respectively. The genetic correlations between CVN and NV or PMLN (0.6400 ± 0.3409 and -0.9267 ± 0.2147, respectively) were associated with lower standard errors when compared with the genetic correlations between DPN and the same traits (-0.0219 ± 0.9562 and -0.0869 ± 0.7463, respectively). The increase in NV was followed by the increase in PMLN and DPN until reach the maximum point in 2012.7, decreasing significantly in the last years. The same did not occur with PML21, which remained almost unchanged over the years (0.0001 piglets per year). The annual quadratic genetic trends for DPN and PMLN, followed by the linear genetic trends for NV, assume that there is an optimum intermediate size regarding NV that provides maximum PMLN, although it has been associated with greater DPN. The CVN seems to be a more appropriate measure for use in breeding programs, especially when evaluated at birth, owing to its higher heritability estimates. The genetic trends showed that the increase in the number of piglets weaned did not follow the increase in the number of piglets born alive, emphasizing the need to review the breeding goals, mainly to evaluate the economic losses due to the decrease in within-litter average of piglets’ weight and the increase in within-litter coefficient of variation of piglets’ weight. The following selection indexes were obtained: I 1 = 3.773873(NV) + 29.415334(PMLN) – 71.343539(DPN); I 2 = 2.929140(NV) – 1.692489(CVN); I 3 = 9.186016(ND) + 26.984056(PML21) – 22.353914(DP21); I 4 = 5.600953(ND) – 6.201914(CV21). The genetic gains per generation were between 0.3% and 0.9% for litter traits at birth and between 0.1% and 0.2% for litter traits at weaning, making it possible to obtain genetic gains for litter uniformity. In this context, it would be necessary around 10 to 15 generations to obtain the desired genetic gains for the traits evaluated at birth (NV, PMLN, DPN and CVN) and 30 to 35 generations to obtain the desired gains for the traits evaluated at weaning (ND, PML21, DP21 and CV21). When the breeding goal is to increase simultaneously the litter size and its uniformity, the expected genetic gains per trait are greater when the selection is performed at birth. The selection for litter uniformity traits depends on the breeding goals, with complex relationships between the variables. However, the use of indexes including the NV, PMLN and DPN may be more appropriate when the interest in the favorable correlated response for CVN is greater, despite the lower direct gains on DPN.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-31T11:39:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 845120 bytes, checksum: cda774f351f72a77d5d0898c2b153f7d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-31T11:39:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 845120 bytes, checksum: cda774f351f72a77d5d0898c2b153f7d (MD5) Previous issue date: 2018-06-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A disponibilidade de uso de informações genômicas trouxe grandes oportunidades de aumento do ganho genético em sistemas produtivos de gado de corte. Apesar dos benefícios já conhecidos, implementação em larga escala nas condições nacionais ainda é um grande desafio principalmente pelo relativo alto custo de genotipagem. Uma alternativa economicamente viável é o desenvolvimento de painéis de marcadores SNP customizados para objetivos de melhoramento estrategicamente estabelecidos para características de interesse. A implementação dessa proposta tem maior impacto para os animais jovens. O objetivo desse estudo foi identificar o menor número necessário de marcadores do tipo SNP para diferenciar animais das raças Hereford, Nelore, Brahman e Braford genotipados com o painel 777K chip HD para bovinos. Adicionalmente, comparou-se o impacto na predição da proporção racial utilizando-se diferentes painéis reduzidos de marcadores do tipo SNP. Para isso, foram utilizados quatro diferentes métodos para a seleção de marcadores altamente informativos para a diferenciação racial. O software Admixture foi utilizado para os cálculos de proporção racial utilizando os painéis customizados. Os resultados observados nesse estudo sugerem a possibilidade de definir indivíduos às respectivas raças utilizando um painel de 24 marcadores do tipo SNP (isto é, 8 marcadores por raça pura). Informações de pedigree são por natureza incompletas e comumente não são bem definidas porque varias das ligações genéticas existentes não são conhecidas. A genômica trouxe grandes oportunidades para o cálculo do parentesco entre os indivíduos de uma população. Um dos principais desafios em implementações genômicas é a correta definição da população referência para o uso simultâneo das informações de pedigree e genômica. O conceito de metafundadores é baseado na definição de pseudo-indivíduos que descrevem os relacionamentos entre e dentre os indivíduos da população base. O objetivo desse estudo foi avaliar os impactos do uso de metafundadores ao estimar valores genéticos e sua habilidade preditiva utilizando a metodologia single- step GBLUP (ssGBLUP) em uma população multirracial. Três diferentes cenários foram adotados nesse estudo para a estimação de componentes de variância e predição dos valores genéticos: BLUP tradicional, ssGBLUP e ssGBLUP com inclusão de metafundadores. Um total de 28 metafundadroes foram definidos no modelo ssGBLUP+metafundadores. De forma geral, os modelos genômicos apresentaram maior habilidade preditiva. Sendo o modelo com inclusão de metafundadores o que apresentou maior habilidade preditiva. O método da máxima verossimilhança restrita (REML) é um método comumente utilizado para a estimação de componentes de variância. Por ser implementado em modelos mistos, apresenta estimativas corrigidas para efeitos de seleção. De forma geral, todos os animais genotipados são utilizados nos cálculos para a predição dos valores genéticos. O objetivo desse estudo foi avaliar quantas gerações são necessárias para acurada estimação de componentes de variância com o algoritmo para animais provados e jovens (APY) em uma população simulada com restrições de seleção. O uso de menor número de gerações reduziu a habilidade do modelo BLUP em estimar a herdabilidade simulada (0.30). A redução na estimação da herdabilidade pelos modelos genomicos são menores do que os modelos baseados em informações de pedigree. Os modelos genômicos apresentaram em média maior correlação que os modelo BLUP. Os resultados desse estudo sugerem que não é necessário grande número de gerações para acurada estimação dos componentes de variância e dos valores genéticos. O algoritmo APY não afeta a estimação dos componentes de variância. Duas gerações extras de animais não genotipados são suficientes para acurado cálculo dos componentes de variância, valores genéticos e também acurácia de predição dos valores genéticos. / The knowledge on breed composition is of major importance under design of breeding schemes. With this respect, the estimation of such parameters must be as accurately as possible. Currently, most of genetic evaluation programs has been predicting breed composition based on pedigree datasets; but, such estimations only accounts for the expected (allele frequency) contributions across ancestors After the development and establishment of single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms on the last decade, an interest in genetic diversity studies has arisen and especially the study of individuals’ origin. The objective of the present study was to evaluate the minimum required number of ancestry informative markers necessary to differentiate Hereford, Nelore, Brahman and Braford breeds genotyped with 777 K Illumina Bovine HD Bead Chip. In addition, we also compared the effects of different panels size on breed composition inference under different AIMs methods. To that, it was used the high-density Illumina Bovine HD BeadChip with more than 777 K SNPs to elucidate the structure of Hereford, Nelore, Brahman and Braford populations. Three different ancestry informative marker methods were used to distinguish such populations. Additionally, random marker selection was considered. Admixture software was used to infer breed composition using very low-density SNP panels assembled with AIMs. Our results suggest that is possible to assign individuals to populations with high confidence using less than 8 SNP markers selected per breed. Although millions of SNP markers have been identified, only few of them are needed to accurately infer ancestry in a cost-effective manner. Pedigree information is by nature incomplete and commonly not well established simply because many of the true genetic ties existent between individuals are not a priori known or they can be even wrong. Genomic era brought new opportunities when calculating relationships between individuals. The challenge under genomic approaches is the correct definition of genetic base by the use of pedigree and genomic data. Genetic base may change as more individuals are included and are inadequately defined if populations are genetically structured. Metafounder concept relies on the definition of pseudo-individuals that describes some level of within and/or across genetic relationship between base population. The purpose of this study was to evaluate metafounder theory to estimate breeding values and the predictive ability under a single-step approach for a multibreed population. Three different scenarios were adopted to estimate variance components and to compute breeding values: pedigree-based model, single- step GBLUP and single-step GBLUP with addition of metafounders. A total of 28 different metafounders were included in the ssGBLUP+metafounder model. In general, it was possible to note that genomic models were able to greater ability to predict the future performance. Among genomic models, the inclusion of metafounder information could increment even more the predictive ability under cross-validation approach. Restricted maximum likelihood (REML) is a popular method for parameter estimation. Because it uses the mixed model equations, it is resistant to selection bias and efficient implementations are currently available. When genomic information is available, two versions of REML may be applicable. When only genotyped animals have phenotypes, genomic REML can be applied with a genomic relationship matrix. When only a fraction of animals is genotyped, a single-step REML is applicable. In general, it is of interest to include many genotyped animals in parameter estimation and into evaluations, to account for genomic selection or pre- selection. The aim of this study was to investigate to what extent generations truncation affects estimates for a simulated population under selection.The use of less generations reduced the ability of pedigree-based model in estimating the benchmark heritability (0.30). The decrease in heritabilities based on genomic information was less than using only pedigree relationships. Genomic models provided greater correlations than pedigree-based model; on average 25 points. Single-step genomic models do not require a deeper pedigree relationship to estimate reliable variance components and breeding values. The use of APY algorithm does not affect the estimation of variance components. An extra of 2 ungenotyped generations are sufficient to compute reliable variance components; as well as breeding values and accuracies.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-11-07T12:26:07Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 322344 bytes, checksum: 13bb225c59e8db9b27ea88b70dc244bd (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-07T12:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 322344 bytes, checksum: 13bb225c59e8db9b27ea88b70dc244bd (MD5) Previous issue date: 2018-07-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A raça Nelore é a principal raça utilizada na pecuária brasileira, sendo a de maior rebanho comercial do mundo. Com a utilização das técnicas reprodutivas, principalmente a inseminação artificial, torna-se importante estimar parâmetros genéticos para as características reprodutivas de touros, a fim de elucidar mais as características e vislumbrar a possibilidade de sua inclusão como critério de seleção. Ao todo 17 características divididas em características biométricas do testículo, características físicas e morfológicas do sêmen e características vesiculares tiveram seus parâmetros genéticos estimados neste trabalho para uma população de touros Nelore com idade de 18 a 36 meses. Utilizou-se o modelo animal uni e bi característico para a estimação dos componentes de (co)variância. O grupo de contemporâneos foi considerado como efeito fixo e a idade como co-variável. Dentre as estimativas de herdabilidade, é importante ressaltar que perímetro escrotal, característica biométrica mais avaliada em touros, apresentou herdabilidade de 0,47, sendo esse valor similar ao encontrado para todas as outras características biométricas (0,34 a 0,48). Já dentre as características físicas e morfológicas, houve maior discrepância entre as estimativas de herdabilidade encontradas (0,05 a 0,49) e, dentre elas, é pertinente destacar a motilidade espermática (0,07) que afeta diretamente a fertilidade do touro e as características morfológicas, defeitos espermáticos maiores, menores e totais (0,49, 0,17 e 0,39). Em relação as correlações genéticas estimadas, nota-se correlação alta e favorável entre as características biométricas do testículo, sugerindo que apenas uma delas pode ser usada como critério de seleção. Entre todas as características, pode-se observar correlações variando de baixas a altas, porém sempre favoráveis. Assim, os resultados evidenciam que a escolha do perímetro escrotal como critério de seleção para fertilidade de machos é bastante acertada, por provocar mudanças favoráveis nas características de qualidade do sêmen. / Nelore is the main breed used in Brazilian cattle production, being the largest commercial herd in the world. The use of reproductive techniques, especially artificial insemination, increase the importance of genetic parameters estimation for bull’s reproductive traits. Genetic parameters increase the knowledge about the trait and provides information about their use as selection criteria. Seventeen traits divided into testis biometry, physical and morphological semen traits and vesicular traits had their genetic parameters estimated in this study for a Nelore bulls population aged 18 to 36 months. Single and multi-trait animal models were used to estimate (co)variance components. Contemporary group was used as fixed effect and age as a co-variable. Among the estimates of heritabilities, it is important to emphasize that the scrotal circumference, which is the most frequently biometric trait evaluated in bulls, had heritability of 0.47. This value was similar to the findings for all other biometric traits (0.34 to 0.48). Among the physical and morphological traits, there was high variability between heritability estimates (0.05 to 0.49). Among them, it can be highlighted the sperm motility heritability (0.07), which is a trait that directly affects the bull fertility. Across semen morphological traits, the major, minor and total sperm defects exhibited heritability 0.49, 0.17 and 0.39, respectively. The genetic correlations were high and favorable between biometric testis traits. This result, suggest that only one trait can be used as a selection criterion. The genetic correlations between all traits varied from low to high, but they were favorable. Thus, the results show that the scrotal circumference is an appropriate selection criteria for male fertility, since it can cause favorable changes in semen quality traits.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-11-07T12:58:10Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1016619 bytes, checksum: eb113beb0a5015ad27a252a3c1c8a345 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-07T12:58:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1016619 bytes, checksum: eb113beb0a5015ad27a252a3c1c8a345 (MD5) Previous issue date: 2018-09-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A evolução da cadeia produtiva de proteína animal e a maior exigência de mercado quanto a qualidade de produto final, reforçam a importância do desenvolvimento e/ou aprimorar ferramentas aplicadas ao melhoramento animal, visando ao progresso genético de modo sustentável. Assim, objetivou-se investigar fatores ligados à conversão alimentar, interação genótipos e ambientes (GxE), e bem-estar animal via diferentes métodos estatísticos, em duas linhagens de codornas de corte pertencentes à Universidade Federal de Viçosa. Para avaliação da conversão alimentar, parâmetros genéticos foram estimados por meio de modelos multicaracterísticos via inferência bayesiana, para as seguintes características: conversão alimentar individual de 21 a 28 (FC 21-28 ) e de 28 a 35 dias de idade (FC 28-35 ); ganho de peso corporal de 1 a 21 (BWG 1–21 ), 21 a 28 (BWG 21–28 ), 28 a 35 (BWG 28–35 ) e de 1 a 35 (BWG 1–35 ) dias de idade. As maiores estimativas de correlação genética encontradas para a UFV1 foram de 0.81 e 0.69 entre BWG 21–28 e BWG 1–35 , e FC 21–28 e FC 28–35 , respectivamente; e para a linha UFV2, foram de 0.88, e -0.76, entre BWG 28–35 e BWG 1–35 , e FC 28–35 e BWG 1–35 , respectivamente. As estimativas de herdabilidade para a linhagem UFV1 para BWG 21-28 e FC 21-28 foram 0.69 e 0.55, respectivamente; enquanto que para a linhagem UFV2, as herdabilidades para BWG 28–35 e FC 28–35 foram 0.68 e 0.37. Sugere-se como critérios de seleção as características BWG 21-28 e FC 21-28 para a linha UFV1; e BWG 28–35 para a linha UFV2. Para investigar a GxE foram utilizados diferentes níveis proteicos na dieta (PL), via modelos de normas de reação (RNM). Os RNM foram comparados por meio dos critérios de informação de Akaike (AIC) e Schwarz Bayesian (BIC). O RNM superou o modelo tradicional desconsiderando G×E e sugeriu interação entre genótipo e nível de proteina na dieta (G×PL) para ganho de peso aos 28 e 35 dias de idade. As herdabilidades de moderada a alta magnitude observadas aumentaram em relação ao PL, sugerindo a existência de G×PL para características de crescimento em codornas de corte. Para avaliação de bem-estar foram utilizadas informações de imobilidade tônica, linhagem, sexo e idade dos animais, via análise de sobrevivência. Não houve significância da idade entre as duas linhagens, UFV1 (P = 0.1493) e UFV2 (P = 0.2583). O teste logrank indicou diferença significativa (P = 0.0407) entre os níveis de linhagem/sexo aos 14 dias de idade. Observou-se que os machos da linhagem UFV2 apresenta maior comportamento de medo em relação aos machos da linhagem UFV1. Deste modo, acredita-se que seja possível reduzir os custos do programa de melhoramento relacionados principalmente à alimentação de animais não selecionados e mão-de-obra com fenotipagem. / The evolution of the animal protein production chain and the greater market demand for final product quality reinforce the importance of development and/or improve tools applied to animal breeding, aiming for sustainable genetic progress. The objective of this study was to investigate factors related to feed conversion, interaction genotypes and environments (GxE), and animal welfare through different statistical methods, in two lines of meat quail belonging to the Breeding Farm of the Federal University of Viçosa. In order to evaluate feed conversion, genetic parameters were estimated by means of multi-trait models via Bayesian inference, for the following characteristics: individual feed conversion from 21 to 28 (FC 21-28 ) and from 28 to 35 days of age (FC 28-35 ); body weight gain from 1 to 21 (BWG 1-21 ), 21-28 (BWG 21-28 ), 28-35 (BWG 28-35 ) and from 1 to 35 (BWG 1-35 ) days of age. The highest estimates of genetic correlation found for UFV1 were 0.81 and 0.69 between BWG 21-28 and BWG 1-35 , and FC 21-28 and FC 28-35 , respectively; and for the UFV2 line, were 0.88, and -0.76, between BWG 28-35 and BWG 1-35 , and FC 28-35 and BWG 1-35 , respectively. The heritability estimates for strain UFV1 for BWG 21-28 and FC 21-28 were 0.69 and 0.55, respectively; while for the UFV2 strain the heritabilities for BWG 28-35 and FC 28-35 were 0.68 and 0.37. It is suggested as selection criteria the characteristics BWG 21-28 and FC 21-28 for the UFV1 line; and BWG 28-35 for the UFV2 line. To investigate the GxE, different protein levels in the diet (PL) were used, through reaction norms models (RNM). The RNM were compared using the Akaike (AIC) and Schwarz Bayesian (BIC) information criteria. The RNM overcame the traditional model, disregarding G × E and suggested interaction between genotype and protein level in the diet (G × PL) for weight gain at 28 and 35 days of age. The observed moderate to high heritability increased in relation to PL, suggesting the existence of G × PL for growth characteristics in quail. For welfare evaluation, tonic immobility, lineage, sex and age of the animals were used via survival analysis. There was no age significance between the two strains, UFV1 (P = 0.1493) and UFV2 (P = 0.2583). The logrank test indicated a significant difference (P = 0.0407) between lineage / sex levels at 14 days of age. It was observed that the males of the UFV2 lineage presented higher fear behavior in relation to the males of the UFV1 lineage. In this way, it is believed that it is possible to reduce the costs of the breeding program related mainly to feeding of unselected animals and labor with phenotyping.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-11-07T13:58:29Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 837905 bytes, checksum: 9b4c7f72f11e840ba12ab9611a0c2ebf (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-07T13:58:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 837905 bytes, checksum: 9b4c7f72f11e840ba12ab9611a0c2ebf (MD5) Previous issue date: 2018-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Esse trabalho buscou por meio da análise de fatores, a redução da dimensionalidade de um banco de dados de características quantitativas de suínos e avaliar por meio das variáveis latentes obtidas, as progênies de suínos provenientes de três diferentes grupos genéticos submetidos a três planos nutricionais, por meio da análise de variância. Foram utilizadas 29 variáveis quantitativas de suínos machos castrados e fêmeas provenientes de experimento realizado na Unidade de Ensino, Pesquisa e Extensão em Melhoramento de Suínos, do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa (UFV), Viçosa - MG. Os dados foram coletados a partir de 102 animais, sendo 50 fêmeas e 52 machos castrados, de três grupos genéticos formados por suínos cruzados Piau, Duroc e Pietrain, submetidos a três planos nutricionais (baixo, médio e alto nível de lisina). A análise de fatores foi capaz de extrair 5 fatores com sentido biológico relacionados ao Desempenho (6 variáveis), Qualidade de carcaça (7 variáveis), Rendimento de carcaça (2 variáveis), Qualidade da carne (3 variáveis) e pH inicial (2 variáveis). Esses fatores foram considerados como novas variáveis quantitativas e utilizados na avaliação dos efeitos de grupos genéticos, plano nutricional e sexo, por meio da análise de variância, a qual considerou os referidos efeitos e suas interações. Foi verificada interação (p=0,036) entre grupo genético e sexo para Desempenho, em que os machos cruzados Duroc apresentaram os melhores escores se comparados aos Piau e os suínos cruzados Duroc se destacaram entre as fêmeas avaliadas. O grupo genético Pietrain apresentou melhores médias em Qualidade de carcaça (p<0,001), por outro lado, suínos cruzados Piau obtiveram melhores médias para Qualidade da carne (p=0,005) se comparados as Pietrain. Os suínos cruzados Pietrain foram superiores em relação aos Duroc para Rendimento de carcaça (p=0,001). O plano nutricional com baixo nível de lisina obteve pior Desempenho (p=0,020). Rendimento de carcaça foi afetado pelos planos nutricionais (p=0,010), em que o médio nível de lisina obteve melhor resultado se comparado ao baixo nível de fornecimento deste aminoácido. Para Qualidade da carne, o plano nutricional com alto nível de lisina foi melhor se comparado ao baixo (p=0,001). O pH inicial (p=0,002) expressou melhores médias ao se utilizar os planos nutricionais com baixo e médio níveis de lisina na composição da dieta. O sexo dos suínos apresentou efeito significativo para Qualidade de carcaça (p=0,001), sendo que as fêmeas apresentaram média maior que os machos. A redução da dimensionalidade dos dados permitiu a avaliação conjunta de grupo genético, plano nutricional e sexo por meio de novas variáveis latentes que representaram o conjunto de dados originais. / The aim of the present work was to reduce the dimensionality of a quantitative traits dataset from pigs using multivariate factor analysis, as well as take the latent traits obtained to evaluate the pig progenies from three different genetic groups, submitted to three different nutritional plans, using the analysis of variance. Twenty nine quantitative traits from borrows and gilts were used, in which pigs were from an experiment performed in the Teaching, Research and Extension Unit in Pig Breeding, from the Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa (acronym UFV), Viçosa – MG, Brazil. Data were taken from 102 animals (52 borrows and 50 gilts) of three genetic groups, Piau, Duroc and Pietrain crossbreeds, submitted to three different nutritional plans (low, medium and high lysine levels). The multivariate factor analysis extracted 5 factors with biological significance related to Performance (6 traits), Carcass quality (7 traits), Carcass yield (2 traits), Meat quality (3 traits) and Initial pH (2 traits). The factors were taken as new quantitative traits and used to evaluate the effects of the genetic group, nutritional plan and sex through the analysis of variance, considering these effects and its interactions. Regarding the Performance, interaction between genetic group and sex was statistically significant (p=0.036), in which borrows of Duroc crossbreed showed higher scores than those of Piau crossbreed and gilts exhibited better results with Duroc crossbreed. The Pietrain genetic group showed the best means for Carcass quality (p<0.001); however, Piau crossbreeds had better means for Meat quality (p=0.005) when compared to Pietrain crossbreed. Pietrain crossbreed was better than Duroc crossbreed in Carcass yield (p=0.001). The nutritional plan with low lysine level (p=0.020) represented the lowest Performace. Carcass yield was affected by nutricional plans (p=0.010), in wich the medium lysine level obtained a better result when compared to the low lysine level. The high lysine level showed a better result in Meat quality (p=0.001) than low lysine level. Inicial pH expressed better means for nutricional plans with low and medium lysine levels (p=0.002) The sex had significant effect for Carcass quality (p=0.001), where females showed higher means than those of males. The reduction in the data dimensionality, allowed an integrative evaluation of genetic group, nutritional plan and sex based on new latent traits that represented the original dataset.

Procura aprender o significado psicologico possuido pelo animal de estimacao no cotidiano das pessoas, atraves do exame de relatos de donos e nao-donos de animais. Realiza entrevistas com adultos de ambos os sexos, dos quais 13 convivem com animais de estimacao, 6 nao possuem nem pretendem a posse e 3 pretendem adquirir um animal no futuro. Inclui, tambem, no estudo, dados oriundos de observacoes da experimentadora em sua clinica veterinaria e de relatos espontaneos ouvidos em situacoes diversas. Apos a gravacao e transcricao literal das entrevistas seleciona e analisa as modalidades e razoes de obtencao de um animal; cuidados dispensados no seu tratamento e sobrevivencia; as maneiras como se efetua a comunicacao entre o dono e seu animal; as formas de rompimento do vinculo entre dono e animal de estimacao e as funcoes que o animal exerce junto ao ser humano.Verifica que a presenca de um animal de estimacao pode trazer beneficios psico-sociais ao dono, derivados nao do animal no sentido biologico, mas de um animal imaginario e que desempenha funcoes e papel de acordo com as necessidades de cada ser. Enfatiza a importancia do conhecimento dos aspectos psicologicos do relacionamento ser hunamo-animal para o profissional psicologo e para o veterinário / The experience related by a number of persons regarding their relationship with pet animals formed the background material from which the attempt was made to extract the psychological significance of such pets in everyday life. The underlying data were obtained from interviews with 13 adults who owned pets and 9 adult non-pet-owners, 3 of which intended to acquire a pet animal. All interwiews were tape-recorded and subsequently transcribed verbatim. Further data - when deemed necessary for completeness and back-up purposes - were obtained from veterinary medical records. After pinpointing and eliminating as irrelevancies certain fortuitious nos-recurring elements, conclusions could clearly be drawn on the following: motivation for acquiring a pet; forms of such an acquisition; routines and patterns of caring for, and ways to communicate with the animal; vicissitudes for both owner and pet; and finally, options to continue, discountinue or temporarily interrupt the relationship