Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-05T11:28:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-09T18:43:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T18:43:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O búfalo é um animal que pode competir com produtos diferenciados nos mercados interno e mundial, que apresenta características próprias e grande rendimento quando da transformação em subprodutos e derivados. Não obstante a isso, o agronegócio do búfalo se ressente de animais melhoradores provados e/ou testados para atender uma demanda que é vital por melhor padrão genético. O presente estudo teve o objetivo de avaliar características fenotípicas da produção de leite e da eficiência reprodutiva de búfalos e efetuar análises genéticas, determinando parâmetros e índices genéticos, visando a seleção de búfalos, para a elaboração de um ranking de reprodutores geneticamente superiores, incrementando a cadeia produtiva dos búfalos do País. Foram utilizados 2.459 registros fenotípicos de búfalos das raças Murrah, Mediterrâneo e meio-sangue, do rebanho da EMBRAPA – CPATU, do período de 1953 a 2013. As características avaliadas foram: produção total de leite (PTL), percentual de gordura (G), idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos (IDP) e período de serviço (PS). A análise descritiva se iniciou com a editoração dos dados trabalhados nos ambientes da planilha Excel e no pacote SAS. Os resultados gerais foram: PTL = 1741,00 ± 496,48 kg, G = 7,07 ± 0,86 %, IPP= 49,39 ± 7,37 meses, IDP = 13,16 ± 0,79 meses e PS = 91,52 ± 24,22 dias. Os efeitos que mais influenciaram a PTL foram a Ordem de Parto e o Grau de Sangue da fêmea, para G foi Grau de Sangue da fêmea, para IPP foi Estação de Parto e Ordem de Parto e para IDP e PS foram Estação de Parto e o Sexo do bezerro. A correlação fenotípica entre PTL e G foi 0,034, entre PTL e IPP 0,118, entre PTL e IDP 0,070, entre PTL e PS 0,070, entre G e IPP -0,113, entre G e IDP -0,025, entre G e PS -0,025, entre IPP e IDP 0,445, entre IPP e PS 0,445 e entre IDP e PS 1,00. Os dados foram trabalhados na planilha Excel e no pacote SAS e as análises genéticas foram efetuadas pelo software WOMBAT. Na estimação de parâmetros genéticos foi utilizado o modelo animal com análise de bicaracterísticas. A PTL foi regredida em função da duração de lactação e o coeficiente de regressão foi utilizado para correção das lactações em 305 dias (PL305). Os efeitos fixos foram grupo de contemporâneos e efeito linear e quadrático da idade da fêmea ao parto, como (co)variável. Para IPP e PS o modelo foi igual ao anteriormente descrito com a exclusão do termo do efeito de ambiente permanente materno. As estimativas de herdabilidade para a raça Murrah foram: 0,49 para PTL; 0,59 para G; 0,75 para IPP; 0,006 para IDP e 0,06 para PS; para a raça Mediterrâneo foram: 0,31 para PTL; 0,08 para G; 0,78 para IPP; 0,90 para IDP e 0,90 para PS. As correlações genéticas entre PTL e as demais características na raça Murrah foram 0,065 PTL e G; 0,097 PTL e IPP, -0,450 PTL e IDP e 0,079 PTL e PS, para Mediterrâneo foram: -0,267 PTL e G; 0,629 PTL e IPP, 0,559 PTL e IDP e 0,624 PTL e PS. O ranking de touros/reprodutores foi elaborado com base nas predições da Provável Habilidade de Transmissão (PTA’s), utilizando-se o pacote SAS, o que permite a edição de um catálogo de touros da espécie bubalina da Embrapa Amazônia Oriental, no referido período. Com base nos resultados a variabilidade do rebanho estudado é passível de ser trabalhada com o manejo genético, tanto para as características produtivas quanto para as de eficiência reprodutiva. / The buffalo is an animal that can compete with differentiated products on internal and world markets, which presents own features and great performance when processing by-products and derivatives. Despite this, buffalo agribusiness resents of enhancers animals proved and / or tested to meet a demand that is vital for better genetic pattern. This study aimed to evaluate phenotypic characteristics of production milk and reproduction efficient of buffalo and perform genetic analyzes determining parameters and genetic index aimed at selection of buffalo to prepare a ranking of genetically superior breeding, increasing production chain of buffaloes in the Amazon region. We used 2,459 phenotypic records of Murrah, Mediterranean and half-blood buffaloes of EMBRAPA - CPATU herd from period between 1953 to 2013. The characteristics evaluated were: total milk production (TMP), fat percentage (F), age at first calving (AFC), calving interval (CI) and service period (SP). The descriptive analysis began with the editing of the data worked in the environments of Excel spreadsheet and SAS package. The overall results were: TMP = 1741.00 ± 496.48 kg, F = 7.07 ± 0.86%, AFC = 49.39 ± 7.37 months, CI = 13.16 ± 0.79 months and SP = 91.52 ± 24,22 days. In the analysis of variance for TMP the most significant effects were the birth order and the degree of blood from female, and to F was degree of female blood and AFC was calving season and birth order and CI and SP were station childbirth and the calf sex. The phenotypic correlations between TMP and F was 0.034, between TMP and AFC 0.118, between TMP and CI 0.070, between TMP and SP 0.070, between F and AFC -0.113, between F and CI -0.025, -0.025 between F and SP, among AFC and CI 0.445, 0.445 between AFC and SP and between CI and SP 1.00. Genetic analysis began with the editing of the data discussed in the environments of Excel spreadsheet and the SAS package and genetic analyzes were performed by WOMBAT software. For estimation of genetic parameters we used the animal model with two-trait analysis. The TMP was regressed depending on length of lactation and the regression coefficient was used for correction of lactation in 305 days (PL305). Fixed effects were contemporary group and linear and quadratic effects of birth female age as (co) variable. AFC and SP model was the same as described above with the exclusion of the term of the maternal permanent environmental effect. The heritability estimates for Murrah were: 0.49 for TMP; 0.59 for F; 0.75 for AFC; 0.006 for CI and 0.06 for SP; for the Mediterranean race were 0.31 for TMP; 0.08 for F; 0.78 for AFC; 0.90 for CI and 0.90 for SP. Genetic correlations between TMP and other features in the Murrah were 0.065 TMP and F; TMP and AFC 0.097, -0.450 TMP and CI and 0.079 TMP and SP for the Mediterranean were: -0.267 TMP and F; 0,629 TMP and AFC; 0.559 TMP and CI and 0.624 CI TMP and SP. The ranking of bulls / breeding was based on predictions of probable transmission ability (PTA's), using the SAS package which allows editing a bulls catalog of buffalo species of EMBRAPA Amazônia Oriental in that period. Based on the results the variability of the studied herd is likely to be crafted with the genetic management for both production characteristics as to the reproductive efficiency.

Descreve-se os achados epidemiológicos e clínico-patológicos das clostridioses diagnosticadas no Setor de Patologia Veterinaria da Universidade Federal do Rio Grande do Sul no período 1996-março/2010. Este estudo incluiu uma pesquisa retrospectiva nos arquivos do SPV e uma etapa prospectiva, a qual também teve o objetivo de desenvolver exames complementares específicos para cada clostridiose. As clostridioses mais prevalentes foram tétano (em equinos, bovinos, ovinos e caprinos), botulismo (em bovinos, suínos e aves) e enterotoxemia (em caprinos). Também houve casos de edema maligno em equinos, bem como de carbúnculo sintomático e hemoglobinúria em bovinos. Adicionalmente, foram coletadas amostras de soro sanguíneo de animais afetados por tétano, em diferentes estágios de evolução da doença, para subsequente inoculação em camundongos (testes de bioensaio) e comprovação da técnica no diagnóstico da enfermidade. / This study describes the epidemiological and clinicopathological findings of clostridial diseases diagnosed in the 1996-March, 2010 period in the Setor de Patologia Veterinária da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV_UFRGS). A retrospective survey in the files of SPV was complemented with a prospective phase, which also aimed developing complementary diagnostic tests of clostridiosis. The most prevalent clostridiosis were tetanus (in horses, cattle, sheep and goats), botulism (in cattle, pigs and birds), and enterotoxemia in goats. There also were cases of malignant edema in horses, blackleg and bacillary hemoglobinuria in cattle. In addition, blood serum samples from animals affected by tetanus on different stages of the disease evolution were applied in mice bioassay, as a complementary diagnosing test for the disease.

Descreve-se os achados epidemiológicos e clínico-patológicos das clostridioses diagnosticadas no Setor de Patologia Veterinaria da Universidade Federal do Rio Grande do Sul no período 1996-março/2010. Este estudo incluiu uma pesquisa retrospectiva nos arquivos do SPV e uma etapa prospectiva, a qual também teve o objetivo de desenvolver exames complementares específicos para cada clostridiose. As clostridioses mais prevalentes foram tétano (em equinos, bovinos, ovinos e caprinos), botulismo (em bovinos, suínos e aves) e enterotoxemia (em caprinos). Também houve casos de edema maligno em equinos, bem como de carbúnculo sintomático e hemoglobinúria em bovinos. Adicionalmente, foram coletadas amostras de soro sanguíneo de animais afetados por tétano, em diferentes estágios de evolução da doença, para subsequente inoculação em camundongos (testes de bioensaio) e comprovação da técnica no diagnóstico da enfermidade. / This study describes the epidemiological and clinicopathological findings of clostridial diseases diagnosed in the 1996-March, 2010 period in the Setor de Patologia Veterinária da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV_UFRGS). A retrospective survey in the files of SPV was complemented with a prospective phase, which also aimed developing complementary diagnostic tests of clostridiosis. The most prevalent clostridiosis were tetanus (in horses, cattle, sheep and goats), botulism (in cattle, pigs and birds), and enterotoxemia in goats. There also were cases of malignant edema in horses, blackleg and bacillary hemoglobinuria in cattle. In addition, blood serum samples from animals affected by tetanus on different stages of the disease evolution were applied in mice bioassay, as a complementary diagnosing test for the disease.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 636309 bytes, checksum: ca1e7c510537c62820f228b759c5a23d (MD5) Previous issue date: 2011-07-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O suíno (Sus scrofa) é considerado um animal de grande importância para produção de carne, sendo seu potencial de crescimento muscular objeto de grande interesse e geralmente associado com características determinadas na fase pré-natal durante a miogênese. Para o estudo de genes responsáveis por estas características, as etiquetas de sequências expressas (Expressed Sequence Tags - EST) fornecem informações diretas sobre o transcriptoma e indiretas sobre a relação entre o genoma e diferentes fenótipos, proporcionando o conhecimento sobre genes diferencialmente expressos (GDE) bem como sequências genômicas transcritas para o controle da expressão gênica como, por exemplo, alguns RNAs não codificantes. Características de tecidos musculares em suínos podem ser influenciadas diretamente por genes, e estes sendo regulados como, por exemplo, através de miRNAs, em diferentes fases de desenvolvimento. O presente trabalho teve como objetivo a identificação e a anotação in sílico de GDE e sequências não codificantes, com enfoque aos miRNAs, de bibliotecas de cDNA construídas a partir do músculo esquelético semi-membranoso de três diferentes raças de suínos (Duroc, Large White e naturalizada brasileira Piau) bem como a análise dos níveis de expressão dos genes identificados e miRNAs em sete fases de desenvolvimento do Longissimus Dorsi (21, 40, 70 e 90 dias pré-natal e 107, 121 e 171 dias pós-natal) de animais de linha comercial. Foram identificados 34 GDE sendo 21 pertencentes a uma rede gênica musculo-específica. Destes, 13 genes tiveram seus perfis de expressão analisados com o uso do qRT-PCR durante os sete períodos citados, formando quatro grupos de expressão semelhantes, um com maior expressão na fase pós-natal e três na fase pré-natal. Nas análises das sequências não codificantes um resultado importante foi a identificação de dois novos miRNAs em suínos, os quais tiveram suas sequências maduras similares aos miRNAs hsa-miR-1207-5p e hsa-miR-665 foram classificadas como verdadeiras pelo programa MiPred e formaram estruturas secundárias. Destes, encontrou-se 289 e 214 genes regulados por eles respectivamente, dos quais quatro são músculo-específicos. Os novos miRNAs tiveram seus perfis de expressão analisados com o uso do PCR em tempo real durante os sete períodos citados juntamente com outros três já identificados em suínos. Seus níveis de expressão mostraram diferenças entre os estágios pré- e pós-natal. Estes estudos podem fornecer valiosas informações possibilitando um maior entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no desenvolvimento muscular. As análises de GDE em fases pré e pós-natal sugerem a presença de genes atuando especificamente em determinados estágios de desenvolvimento do músculo, contribuindo para melhor explicar suas funções. A identificação de dois novos miRNAs, somados a outros já identificados e postados nos bancos de dados em suínos, podem contribuir para um maior entendimento dos modos de regulação gênica, sendo de importância para os estudos de genética e melhoramento animal, permitindo o entendimento da fisiologia da deposição de músculo para produção de carne em suínos. / The pig (Sus scrofa) is considered an important animal for meat production. This interest revolves around the potential for muscle growth, which usually is associated with certain characteristics during prenatal myogenesis. To study the genes responsible for these characteristics, expressed sequence tags (EST) provide direct information about the transcriptome and indirectly on the relationship between the genome and different phenotypes, supplying knowledge about differentially expressed genes (DEG) as well as other transcribed genomic sequences for the control of gene expression, e.g., some non-coding RNAs. Characteristics of muscle tissue in pigs may have been directly influenced by genes, and those being regulated, for example, by miRNAs, in different stages of development. This study aimed to identify by in silico annotation, DEG and non-coding sequences, focusing on miRNAs, using cDNA libraries constructed from semi-membranous skeletal muscle of three different pig breeds (Duroc, Large White and naturalized Brazilian Piau ) as well as analysis of gene expression profiles of identified genes and miRNAs during seven stages of development (21, 40, 70 and 90 days prenatal and 107, 121 and 171 days postnatal) from commercial line animals Longissimus Dorsi muscle. Twenty-one identified genes out of 34 DEGs belongs to the muscle-specific path. From these, 13 genes had their expression profiles analyzed by qRT-PCR during the seven periods, forming four clusters of similar expression, with one having greater expression in the postnatal period and three in the prenatal. In the analysis of non-coding sequences, an important result was the identification of two new miRNAs in pigs, which had their sequences similar to mature miRNAs hsa-miR-1207- 5p and hsa-miR-665 which had their precursor sequences forming secondary structures and classified as real precursor sequence by MiPred program. From these, we found 289 genes and 214 respectively regulated by them, of which four are muscle-specific. The new miRNAs and other three which have been identified in previous studies in pigs had their expression levels analyzed by quantitative real time PCR during the mentioned seven periods. Their levels of expression differed between pre-and postnatal stages. These studies may provide valuable information allowing a better understanding of the molecular mechanisms involved in muscle development. Analyses of DEG in the pre-and postnatal periods suggest the presence of genes acting specifically on certain stages of muscle development, contributing to better explain their functions. The identification of two new miRNAs, together with other previously identified and posted on the databases in pigs, may contribute to a better understanding of gene regulation and is important for studies of genetics and animal breeding, allowing the understanding of the muscle deposition physiology to meat production in pigs.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 503258 bytes, checksum: 31604e96fb2b70d2540a7ad0128cc921 (MD5) Previous issue date: 2007-03-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Heat stress impacts greatly animal production systems on tropical regions causing economical losses and affects milk production, meat production, physiology, reproduction, calf mortality and utter health. One way to reduce these losses is to use the genetic variation between Bos taurus and Bos indicus breeds for heat tolerance coupled with linked molecular markers as an auxiliary tool in breeding programs to produce thermotolerant and more productive animals. This work aimed to map genomic regions related to heat stress on chromosomes 10, 11 and 12 in a F2 population derived from Holstein x Gyr crosses. The following traits were evaluated: variation of rectal temperature after heat stress (DifTR), variation of skin temperature after heat stress (DifTPele), variation on the rate of respiratory movements after heat stress (DifMR), sweating rate after heat stress (TxSud), fur density (DensidPêlo), fur length (CompPêlo), coat length (CompCapa) and coat thickness (EspessCapa). All traits were evaluated in two seasons (wet-warm and dry-cool) and analyzed separatedly. A total of 17 microsatellite loci were genotyped on 480 animals (31 parents, 73 F1 and 376 F2). Association analysis indicated a QTL (p<0,01) for CompPêlo located at the position 72 cM on chromosome 10 for data collected on the wet-warm season. On chromosome 11 it was found an indication of QTL (p<0,05) for TxSud located at the position 0 cM for data collected on the drycool season. On chromosome 12 it was also found an indication of QTL (p<0,05) for CompPêlo located at the position 28 cM for data collected on the dry-cool season. The strategy of genome scan with microsatellite markers was shown to be effective to identify QTL regions related to heat tolerance traits. These mapped regions need to be refined with additional markers to better understand the QTL effects and to identify candidate genes responsible for the effects on these traits. / O estresse calórico, especialmente nas regiões tropicais, consiste em uma importante fonte de perda econômica na pecuária, tendo efeito adverso sobre a produção de leite, produção de carne, fisiologia de produção, reprodução, mortalidade de bezerros e saúde do úbere. Estes efeitos podem ser amenizados utilizando-se a variação genética existente entre as raças de Bos taurus e Bos indicus para as características associadas à resistência ao calor e os marcadores moleculares associados a esta resistência como um auxílio nos programas de melhoramento, visando a obtenção de animais termotolerantes e, consequentemente, mais produtivos. O desenvolvimento deste trabalho buscou mapear regiões genômicas nos cromossomos 10, 11 e 12 relacionadas à resistência ao estresse calórico em uma população F2 de bovinos (Holandês x Gir). As características avaliadas foram: diferença entre a temperatura retal antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifTR), diferença entre a temperatura da pele antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifTPele), diferença entre a freqüência de movimentos respiratórios antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifMR), taxa de sudação após a exposição ao estresse calórico (TxSud), densidade do pêlo (DensidPêlo), comprimento do pêlo (CompPêlo), comprimento da capa (CompCapa) e espessura de capa (EspessCapa). Todas as medidas foram tomadas no verão e no inverno e os dados foram analisados desta forma. Um total de 17 loci microssatélites foram genotipados para 480 animais, sendo 31 parentais, 73 F1 e 376 F2. O resultado das análises de associação mostrou a existência de QTL (p<0,01) para a característica CompPêlo localizado na posição 72 cM do cromossomo 10, com os dados coletados no verão. No cromossomo 11 foi encontrado um QTL sugestivo (p<0,05) para TxSud localizado a 0 cM, com os dados coletados no inverno. No cromossomo 12 foi encontrado também um QTL sugestivo (p<0,05) para a característica CompPêlo localizado a 28 cM, porém, com os dados coletados no inverno. A estratégia da varredura genômica com marcadores microssatélites se mostrou adequada para a detecção de QTL para características de tolerância ao estresse calórico. Estas regiões mapeadas precisam ser refinadas com a adição de marcadores adicionais para um melhor entendimento do efeito de cada QTL e a identificação de genes candidatos responsáveis pela variação nestas características.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 905318 bytes, checksum: 167ccc3c1b47051e3ce28eb0224bed43 (MD5) Previous issue date: 2006-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / First lactation data of 6.262 Brown-Swiss cows from 311 herds, daughters of 803 sires with calving between 1980 and 2003 were used to estimate genetic parameters for milk and fat production traits. The components of variance were estimated by restricted maximum likelihood (REML) and bayesian methods, using animal model with uni and two-traits analisys . The estimation by REML was obtained with the software MTDFREML (BOLDMAN et al. 1995) testing unitrait models with different effects to covariables and considering contemporary group and season as fixed effect. The best fitting obtained on unitrait analisys were used on two-trait analisys. The estimative of additive variance was reduced when lactation length was included on the model suggesting that the animals were been fitted to the same base on the capacity of transmit a longer or shorter lactation length to the progeny. Therefore, fitting to this covariable is not recommended. On the other side, the age of calving has linearly influenced milk and fat production. The heritability estimates were 0,26 and 0,25 to milk and fat yield respectively with genetic correlation of 0,95. the high correlation among these traits suggests that part of genes that acts on milk yield also respond to fat yield, in such way that selection for milk yield results, indirectly, in increase on fat yield. The estimation by Bayesian inference was made on software MTGSAM (VAN TASSELL E VAN VLECK, 1995). Chain lengths were tested to obtain the marginal posterior densities of unitrait analisys, the best option of chain length, burn-in and sampling interval was used on two-trait analisys. The burn-in periods were tested with the software GIBANAL (VAN KAAM, 1998) witch analysis inform a sampling interval for each burn-in tested, the criteria for choosing the sampling interval was made with the serial correlation resulting by burn-in and sampling process. The heritability estimates were 0,33 ± 0,05 for both traits with genetic correlation of 0,95. Similar results were obtained on studies using the same methodology on first lactation records. The stationary phase adequately reached with a 500.000 chain length and 30.000 burn-in iteractions. / Dados de primeira lactação de 6.262 vacas distribuídas em 311 rebanhos, filhas de 803 touros com partos entre os anos de 1980 e 2003 foram utilizados para estimar de componentes de variância para as características de produção de leite e gordura com informações de primeira lactação, em animais da raça Pardo-Suíça. Os componentes de variância foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML) e Bayesiano, sob modelo animal, por meio de análises uni e bicaracterística. A estimação realizada via REML foi obtida com o programa MTDFREML (BOLDMAN et al. 1995) testando modelos unicaracterística com diferentes efeitos para as covariáveis e considerados grupo contemporâneo e estação como efeitos fixos. Os melhores ajustes obtidos nas analises unicaracterística foram utilizados na análise bicaracterística. A duração da lactação reduziu a estimativa da variância aditiva quando era utilizada no modelo sugerindo que os animais estariam sendo corrigidos para uma mesma base quanto à capacidade de imprimir duração da lactação mais longa ou mais curta à progênie sendo, portanto, não recomendado o ajuste para esta covariável. Já a idade da vaca ao parto, influenciou linearmente a produção de leite e gordura. As herdabilidades estimadas foram 0,26 e 0,25 para produção de leite e gordura respectivamente com correlação genética de 0,95. A alta correlação entre a produção de leite e gordura obtida sugere que parte dos genes que atuam na produção de leite também responde pela produção de gordura, de tal forma que a seleção para a produção de leite resulta, indiretamente, em aumentos na produção de gordura. A estimação via inferência Bayesiana foi realizada com o programa MTGSAM (VAN TASSELL E VAN VLECK, 1995). Foram testados diversos tamanhos de cadeia para a obtenção das densidades marginais a posteriori das análises unicaracterística, a melhor proposta para o tamanho de cadeia, burn-in e amostragem foi utilizada para a análise bicaracterística. Os períodos de burn-in foram testados pelo programa GIBANAL (VAN KAAM, 1998) cujas análises fornecem um intervalo de amostragem para cada burn-in testado, o critério de escolha do intervalo de amostragem foi feito de acordo com a correlação serial, resultante do burn-in e do processo de amostragem. As estimativas de herdabilidade obtidas foram 0,33 ± 0,05 para ambas as características com correlação de 0,95. Resultados similares foram obtidos em estudos utilizando a mesma metodologia em informações de primeira lactação. A fase estacionária foi adequadamente atingida com uma cadeia de 500.000 iterações e descarte inicial de 30.000 iterações.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 443777 bytes, checksum: aa47df0593f4494e3ed6277403324b28 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this study was mapping QTL on pig chromosomes 16, 17 and 18 and associate them to performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits. A F2 population was produced by crossing two naturalized Brazilian Piau sires and 18 commercial dams (Landrace x Large White x Pietrain). The population was genotyped for 11 microsatellite markers. After the genotype scoring, it was constructed the linkage map for these markers in the population. The microsatellites markers were considered appropriate for quantitative trait analysis. It was analyzed their values for observed heterogosity (Ho), expected heterozigosity (He) and polymorphic information content (PIC). The evaluation of the four loci amplified in the SSC16 found average values of Ho, He; and PIC of 0,67, 0,57 and 0,50, respectively. In the SSC17 the average values for Ho, He and PIC of 0,72, 0,61 and 0,56, respectively for the four amplified loci. And in the SSC18, average values of Ho, He and PIC were 0,67, 0,63 and 0,59, respectively for each one of three loci. Data were analyzed by multiple regressions by F2 mapping method using the QTLEXPRESS software. Eleven QTL were mapped and not yet described in the literature: teat number, cooking loss, redness, lower backfat thickness after last lumbar vertebrae, bacon depth, heart weight and lung weight on SSC16. QTL for weight at 63 and 77 days of age were assigned on chromosome 17. QTL for weight at 21 days of age and slaughter age were identified on SSC18. Four QTL Already described in another populations were also identified: weight at 21 days of age on SSC16, backfat thickness after last lumbar vertebrae and after the last rib (at 6,5 cm from the midline ) on SSC17 backfat thickness after last lumbar vertebrae and after the last rib (at 6,5 cm from the midline) and total loss on SSC18. The generated information of significant QTL is useful for future studies dealing with fine mapping to identify genes that could provide a better understanding of the production traits in pigs. / O objetivo ao realizar este trabalho foi o mapeamento de QTL nos cromossomo 16,17 e 18 de suínos e a associação destes a característica de desempenho, de carcaça, órgãos internos e vísceras, de cortes de carcaça e de qualidade de carne. Foi construída uma população F2 provenientes do cruzamento de dois varrões da raça naturalizada Brasileira Piau com 18 fêmeas da linha comercial (Landrace x Large White x Pietrain). Foram utilizados onze marcadores microssatélites distribuídos nos SSC16, SSC17 e SSC18. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas, quando foram analisadios os valores de heterozigosidade observada (Ho), heterozigosidade esperada (He) e conteúdo de informação polimórfica (PIC). A avaliação dos quatro locos amplificados no SSC16 forneceu valores das médias da Heterozigosidade observada (Ho) e esperada (He); e do Conteúdo de informação polimórfica (PIC) de 67,62%, de 57,71% e 0,50, respectivamente. No SSC17 foram encontrados os resultados das médias de Ho, He e PIC de 72,20%, 61,40% e 0,56, respectivamente para os 4 locos utilizados. E no SSC18, o valor das médias de Ho, He e de PIC foram 67,80% 63,54% e 0,59, respectivamente utilizando 3 locos. Foi utilizado o método de regressão por intervalo de mapeamento, e as análises foram realizadas por meio do programa QTLEXPRESS. Foram detectados 11 QTL não descritos na literatura: número de tetas, índice de vermelho; perda por cozimento, menor espessura de toucinho na região acima da última vértebra lombar na linha dorso-lombar, espessura de bacon, peso do coração e do pulmão no SSC16; peso aos 63 dias de idade e peso aos 77 dias de idade no SSC 17; peso aos 21 dias e idade de abate no SSC18; e quatro QTL já descritos em outras populações foram também identificados, como para peso aos 21 dias de idade no SSC16, espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar no SSC17, espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorsolombar e perda total no SSC18. As informações dos QTL significativos encontrados servem como base de estudos futuros de mapeamento fino para identificação de genes permitindo o melhor entendimento das características de produção em suínos.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 484099 bytes, checksum: 2183b6947a541e4acdedb364504ccd85 (MD5) Previous issue date: 2007-08-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The superior phenotypes selection, in individual or families, is a practice of considerable importance for the improvers , once to obtain improved populations it is necessary to select and matings among or inside of families. This work s aim was to compare the efficiency of some arrangements between the individual selection and the selection among families to get combined selection indexes and soon afterwards to verify a cluster analysis was capable to detect different groups. Through the program GENESYS, it was simulated four genomes, each one considering only one characteristic, varying to each other just in value of heritability; then, we have two characteristics of low heritability (0,20 and 0,10), one of medium heritability (0,40) and one with high heritability (0,60). Using those genomes, bases populations of 1000 individuals (500 males and 500 females) with a rate endogamic equivalent to zero were simulated. In each base population, it was aleatory selected 10 males and 100 females corresponding, respectively, to 2% and 20% of selection intensity. When these individuals selected couple, it was maintained a control of 10 females for each male and, as a result, it was kept an initial population with 1000 descending, also maintaining a balance of 10 descending for female. For each characteristic selections, different arrangements were done to obtain combined selection s indexes. Thus, the first obtained index considers 100% for individual phenotype (Individual); the second considers 90% for individual phenotype and 10% for average phenotypic of the family (09P+01F); the third considers 70% for individual phenotype and 30% for average phenotypic of the family (07P+03F); the fourth considers 50% for the two values (05P+05F); the fifth considers 30% for individual phenotype and 70% for average phenotypic of the family (03P+07F); the sixth considers 10% for individual phenotype and 90% for average phenotypic of the family (01P+09F) and the seventh index considers 100% for the average phenotypic of the family (Family). The selected individuals' matings were driven at random. A final population of 1000 individuals was totaled. Each selection s strategy was led by 20 consecutive generations with 10 repetitions seeking to minimize the mistakes and effects of the genetic flotation. For a larger clarity in the interpretation of the results, a grouping analysis was accomplished by optimization by the method of Tocher in three intervals of time, with the first five generations, with the first ten generations and with the 20 total generations. The behavior of the selection s strategies for different herdability s values was not the same. As smaller the value of the heritability is, the difference among the averages phenotypics in each generation is bigger and the total earnings in these averages are smaller. The combination of the individual value with the family s average was more efficient for the lowest heritabilities. For these heritabilities, the individual selection or among families did not show to be a good option. The selection just through the individual s phenotypic value can be a good alternative for the characteristic of average herdabilidade and it was the best to the characteristic of high heritabilities. / A seleção de fenótipos superiores, sejam individuais ou famílias, é uma prática de considerável importância para o melhorista , uma vez que a obtenção de populações melhoradas passa pela seleção e acasalamentos entre ou dentro de famílias. O objetivo deste trabalho foi comparar a eficiência de alguns arranjos entre a seleção individual e a seleção entre famílias na obtenção de índices de seleção combinada e em seguida verificar se uma análise de agrupamento foi capaz de detectar grupos distintos. Por meio do programa GENESYS foram simulados quatro genomas, cada um considerando uma única característica, variando entre si apenas no valor da herdabilidade; assim, tem-se duas características de herdabilidade baixa (0,20 e 0,10), uma de herdabilidade média (0,40) e uma com alta herdabilidade (0,60). A partir desses genomas foram simuladas populações bases de 1000 indivíduos (500 machos e 500 fêmeas) com uma taxa endogâmica igual a zero. Em cada população base foram selecionados aleatoriamente 10 machos e 100 fêmeas correspondendo, respectivamente, a uma intensidade de seleção de 2% e 20%. Por meio do acasalamento desses indivíduos selecionados, mantendo o equilíbrio de 10 fêmeas para cada macho, obteve-se uma população inicial com 1000 descendentes, também mantendo um equilíbrio de 10 descendentes por fêmea. Para cada característica foram realizadas seleções com diferentes arranjos para obtenção de índices de seleção combinada. Assim, tem-se o primeiro índice que pondera 100% para o fenótipo individual (Individual); o segundo que considera 90% para fenótipo individual e 10% para média fenotípica da família (09P+01F); o terceiro com 70% para fenótipo individual e 30% para média fenotípica da família (07P+03F); o quarto com 50% para os dois valores (05P+05F); o quinto com 30% para fenótipo individual e 70% para média fenotípica da família (03P+07F); o sexto com 10% para fenótipo individual e 90% para média fenotípica da família (01P+09F) e o sétimo índice que considera 100% para a média fenotípica da família (Família). Os acasalamentos dos indivíduos selecionados foram conduzidos ao acaso. Totalizou-se uma população final de 1000 indivíduos. Cada estratégia de seleção foi conduzida por 20 gerações consecutivas com 10 repetições visando minimizar os erros e efeitos da flutuação genética. Para maior clareza na interpretação dos dados foi realizada análise de agrupamento por otimização pelo método de Tocher em três intervalos de tempo, com as cinco primeiras gerações, com as dez primeiras gerações e com as 20 gerações totais. O comportamento das estratégias de seleção para os diferentes valores de herdabilidade não foram iguais. Quanto menor foi o valor da herdabilidade, maior foi a diferença entre as médias fenotípicas em cada geração e menor foi o ganho total nestas médias. A combinação do valor individual com a média de família foi mais eficiente para as herdabilidades baixas. Para estas herdabilidades, a seleção individual e a entre famílias não se mostraram boa opção. A seleção apenas pelo valor fenotípico individual pode ser boa alternativa para a característica de média herdabilidade e foi a melhor opção para a característica de alta herdabilidade.

Orientador: Luiz Antonio Rossi / DissertaCAo (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-05T22:18:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sarubbi_Juliana_M.pdf: 972594 bytes, checksum: 6ec7cadc10c91ba20ca67df226c71482 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Um grande desafio na suinocultura é a definição de um modelo de edificação capaz de proporcionar melhor conforto térmico para os animais. As maiores perdas na produção ocorrem em virtude dos dias muito quentes e das grandes variações térmicas, que são características do clima tropical. Uma alternativa para minimizar estas perdas é a utilização de sistemas diversos de climatização. No entanto, estes equipamentos apresentam custos de implantação, funcionamento e manutenção variáveis que podem interferir na lucratividade do empreendimento. A utilização de um sistema de controle, por exemplo, pode reduzir os custos de funcionamento dos equipamentos. Este trabalho objetivou avaliar a eficiência de diferentes instalações suinícolas, considerando os aspectos do desempenho dos animais, do conforto térmico e da utilização de energia elétrica. Foram comparadas quatro salas de criação de suínos nas fases de crescimento e terminação em uma granja comercial. As salas estudadas são diferentes sob os pontos de vista de construção e climatização (idade dos equipamentos, número de ventiladores, forma de controle da climatização). Os parâmetros utilizados para a comparação entre as edificações foram o desempenho dos animais, condição sanitária do plantel, variáveis climáticas (temperatura e umidade), entalpia e índice de conforto térmico (ITU), variáveis elétricas (consumo, demanda e fator de potência) e índices de eficiência energética dos tratamentos. A utilização de dois ventiladores novos e sistema de nebulização, ambos com acionamento automático, foi capaz de proporcionar melhor conforto térmico aos animais, embora este resultado não tenha sido suficiente para agregar maior produção. Os ventiladores mais novos consumiram menor quantidade de energia elétrica que os antigos e apresentaram melhor fator de potência O tratamento que contou com sistema de nebulização e um ventilador, acionados manualmente, que forneceu a pior condição em termos de conforto térmico, porém apresentou as melhores condições de consumo específico (kg produzido/ kWh consumido). De acordo com a análise dos índices de eficiência energética (fator de carga), os ventiladores com acionamento automático foram melhores utilizados ao longo do tempo. Assim, concluiu-se que a utilização de controle automático de equipamentos de climatização foi capaz de melhorar as condições ambientais e da utilização de energia elétrica / Abstract: A great challenge in the swine production is the definition of a construction model capable of bringing a better thermal comfort to the animals. The greatest losses on production occur due very hot days and great thermal variation, which are the chief characteristics of the tropical weather. An alternative to minimize these losses is the use of diverse climate systems. Nevertheless, these equipment present variable implementation, functioning and maintenance costs that may interfere in the business lucrativity. The use of a control system, for instance, may reduce the equipment functioning costs. This work's main goal is the evaluation on performance of two different swine buildings, considering the animal performance, thermal comfort and electric energy consumption. Four rooms placed on two different swine structures were compared. It all happened on growing and finishing phases, in a commercial pigsty. These rooms are different under building and acclimatization systems (equipment¿s age, numbers of fans and climate control). The parameters used for the comparison between the buildings were the animal performance, group sanitary condition, climate variables (temperature and humidity), enthalpy, thermal comfort index (THI), electric energy variables (electric energy consumption, power factor, demand) and energetic efficiency. The use of two new fans and evaporative cooling system, both with automatic startup, was able to bring a better thermal comfort to the animals, however this result was not enough for bringing higher production. The newer fans consume less electric energy than the older fans and showed the best power factor. The use of an evaporative cooling and only one fan, without automatic control, was able to bring the worst thermal comfort, the worst utilization electrical energy index and showed the best specific consumption. Therefore, we may conclude that the use of an automatic control system to the climate equipment is capable of improving the environmental conditions and the use of electric energy / Mestrado / Construções Rurais e Ambiencia / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador: Nadia Farage / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Filosofia e Ciencias Humanas / Made available in DSpace on 2018-08-15T05:08:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Velden_FelipeFerreiraVander_D.pdf: 2503438 bytes, checksum: bc0a8a4c23453441cc5b626b3fe725d3 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Este trabalho investiga um tema ainda pouco conhecido e estudado pela etnologia das populações indígenas nas terras baixas da América do Sul: a relação entre estas sociedades e os animais introduzidos pelos europeus após o contato, notadamente cachorros, gatos, bois, porcos, cavalos e galinhas. Baseando-se no material empírico recolhido entre os Karitiana -povo de língua Tupi-Arikém que habita o norte do estado de Rondônia, no sudoeste da Amazônia brasileira - a pesquisa procura compreender como este grupo indígena concebeu formas práticas e simbólicas para acomodar estes seres exóticos que apareceram em seu cotidiano com o aparecimento dos brancos, provavelmente no final do século XIX. A partir da história do surgimento e da adoção dessas espécies estrangeiras - que, por si mesma, já sinaliza a diferença entre estes e as criaturas nativas - discute várias questões relativas à posição dos animais domesticados europeus no universo social e cosmológico Karitiana, entre as quais questões de gênero, parentesco e vida familiar, nominação, atividades produtivas, movimentos religiosos e conhecimento histórico e zoológico. Argumenta, por fim, que embora plenamente incorporados no cotidiano indígena, algo da exterioridade e da estranheza original desses seres permanece, e dão conta de certas ambigüidades que podem ser observadas. Ademais, estas ambigüidades são resultado do próprio descompasso entre as noções Karitiana e ocidental de domesticidade e/ou selvageria e, de uma perspectiva mais geral, entre os modos de relação entre seres humanos e não-humanos / Abstract: This work deals with a matter which was not properly investigated by ethnologists working on indigenous populations in the South American lowlands: the relationships between these societies and animal species introduced by Europeans after contact and conquest, specially dogs, cats, oxen, pigs, horses and chicken. Based on empirical data collected among the Karitiana - a Tupi-Arikém-speaking people inhabiting northern Rondônia state, southwestern Brazilian Amazon - this research aims to comprehend how this Indians created symbolical and practical ways to adopt these exotic beings, which were probably introduced by the whitemen during the XIXth century. Exploring histories on how this foreign beings appeared and were adopted by the Karitiana - histories that, by themselves, already points to differences between exotic beings and native ones - this work discusses a number of questions on European animals' positioning in the indigenous universe; among them, questions about gender relationships, kinship and family life, naming practices, economic activities, religious movements, and historical and zoological knowledge. It also argues that, in spite of being incorporated into indigenous everyday life, a little bit of that original weirdness and strangeness still persists. In turn, these aspects can explain the ambiguities we observe. For the last, these ambiguities are the result of Karitiana's and Western's distinct notions on domesticity and/or wildness, and between their distinct ways to build human and non-human relationships / Doutorado / Antropologia Social / Mestre em Antropologia Social