Orientador: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Coorientador: Renato Christensen Nali / Banca: Itamar Alves Martins / Banca: Victor Goyannes Dill Orrico / Resumo: A forma de comunicação mais estudada em anuros é a acústica, porém estudos atuais, inclusive com espécies de hábito noturno, demonstram que a comunicação visual também tem grande importância neste grupo. Este trabalho procurou compreender os contextos sociais e estímulos envolvidos na comunicação acústica e visual em Hypsiboas albopunctatus em uma lagoa e brejos no município de Rio Claro, estado de São Paulo. Os objetivos deste estudo foram: (1) verificar a influência do tamanho corporal de machos e temperatura do ar nas características físicas dos cantos (frequência dominante e duração das notas); (2) avaliar a influência do número de machos presentes no coro sobre a taxa de repetição de notas agressivas e de anúncio; (3) avaliar os fatores relacionados à emissão de notas agressivas e de anúncio por meio de observações diretas e experimentos de playback com machos no campo, utilizando diferentes tipos de canto; e (4) avaliar os fatores relacionados à emissão de sinais visuais pelos machos através de observações diretas e playbacks na presença e ausência de um macho intruso. Encontrou-se uma correlação negativa entre a massa corpórea e CRC (comprimento rostro-cloacal) do macho com frequência dominante e duração das notas agressivas, indicando que tais características podem ser utilizadas tanto por rivais quanto por fêmeas para avaliar o tamanho dos machos. Porém, características físicas dos cantos não tiveram correlação com a temperatura do ar, provavelmente devido ao fato dos dados terem sido coletados apenas na estação chuvosa, quando há pouca variação na temperatura. O número de machos no coro influenciou no número de notas agressivas emitidas; machos vocalizando em coros maiores emitiram menos notas agressivas, mostrando um provável aumento de limites de tolerância para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The most studied form of communication in frogs is the acoustic one, but current studies have shown that visual communication is also important in this group, even in nocturnal species. We aimed to understand the social contexts and stimuli involved in the acoustic and visual communications of Hypsiboas albopunctatus in a pond and wetlands, in the municipality of Rio Claro, São Paulo state, southeastern Brazil. The specific aims of this study were: (1) to verify the influence of male body size and air temperature on the physical characteristics of the calls (dominant frequency and duration of notes), (2) to evaluate the influence of the number of males in the chorus on the repetition rate of aggressive and advertisement notes, (3) to evaluate the factors related to the emission of aggressive and advertisement notes through direct observations and playback experiments carried out in the field, using different types of calls, and (4) to evaluate the factors related to the emission of visual signals by males through direct observations and playback experiments with and without the presence of an intruder male. Dominant frequency and duration of aggressive notes were negatively correlated with male SVL (snout vent length) and body mass, suggesting that these traits might be used by females and rivals to evaluate male size. However, there was no correlation of any physical characteristics of the calls with air temperature, probably because data have been collected during the rainy season, when there is less variation in temperature. The chorus size influenced the number of aggressive notes emitted, i. e., focal males emitted less aggressive notes in larger chorus, which suggest an increase of tolerance regarding calls of neighbor males in larger chorus, allowing the resident males to defend their territories less aggressively, while maximizing... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Classius de Oliveira / Banca: Ana Maria de Lauro Castrucci / Banca: Sebastião Roberto Taboga / Resumo: Os anfíbios compartilham com os demais vertebrados ectotérmicos a existência de um sistema pigmentar extracutâneo, constituído por células com o citoplasma repleto de melanina, em vários tecidos e órgãos. O papel funcional dessas células ainda não está definido, havendo várias hipóteses, dentre elas o papel na defesa contra patógenos. O objetivo do trabalho foi observar a resposta das células pigmentares viscerais presentes no fígado e testículos dos anuros frente ao processo inflamatório induzido experimentalmente por lipopolissacarídeo (LPS) de Escherichia coli. Para isso, foram realizadas análises morfológicas, estereológicas e histoquímicas; com o intuito de observar as respostas celulares envolvendo mudanças na forma e substâncias presentes desse tipo celular no fígado e testículos, além da descrição anatômica do sistema pigmentar extracutâneo desses animais após infecção. Foram utilizados 30 exemplares da espécie Eupemphix nattereri, os animais foram inoculados, com dose única de LPS de E. coli, sendo analisados 2 e 24 horas após a inoculação. Após esse período, os animais foram eutanasiados, a pigmentação visceral foi descrita, em 12 regiões pré-estabelecidas; sendo o fígado e testículos posteriormente retirados e submetidos ao processamento histológico para realização das análises. A pigmentação presente no fígado aumentou no grupo tratado após 24 horas, enquanto que nos testículos é observado aumento após 2 horas. As substâncias hemosiderina e lipofuscina não são verificadas nas gônadas, estando presentes apenas no fígado. Quanto à hemosiderina, não há variação significativa entre os tratamentos. Já a lipofuscina apresenta um aumento significativo nos animais tratados após 24 horas, estando ainda correlacionada positivamente com a quantidade... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Ectothermic vertebrates have a well-developed system of melanin-containing cells present on several organs (liver, spleen, lung, heart, thymus, and gonads) and tissues (meninges and connective tissues surrounding blood vessels), constituting an extracutaneous pigmentary system. The functional role of these pigmented cells in the visceral organs are not known, however there are several hypotheses, including a bactericide function. Our aim was to characterize the response of visceral pigmented cells in the liver of the anuran Eupemphix nattereri inoculated with lipopolysaccharide (LPS) of Escherichia coli. Morphological, estereological and histochemicals analyses were carried out in order to describe the cellular responses involving changes in the form and amount of pigmentary substances that occur in this cellular type in the liver and testes. We inoculated twenty animals with one dose of LPS of E. coli, and analyzed 2 and 24 hours after the inoculation for observation of pigmented cells. After this period, the animals were euthanized and the liver and the testes were submitted to the histological processing. The pigmentation increased in the liver of the treatment group after 24 hours, whereas the pigmentation on testes increased after 2 hours of inoculation. In the liver, haemosiderin and lipofuscin are located within melanomacrophages, along with melanin. Haemosiderin showed no variation between the treatments, but lipofuscin increased in the treatment group after 24 hours. The amount of haemosiderin was not correlated neither with melanin nor lipofuscina, but melanin and lipofuscin were significantly correlated in the animals analyzed 24 hours after LPS inoculation. Haemosiderin and lipofuscin were not observed on testes. Although the liver and testes in E. nattereri presented pigmented... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-10-31Bitstream added on 2014-06-13T20:00:16Z : No. of bitstreams: 1 ramalho_ces_me_rcla.pdf: 366177 bytes, checksum: c0b4165015a30f1122b7496f028ef432 (MD5) / A forma de comunicação mais estudada em anuros é a acústica, porém estudos atuais, inclusive com espécies de hábito noturno, demonstram que a comunicação visual também tem grande importância neste grupo. Este trabalho procurou compreender os contextos sociais e estímulos envolvidos na comunicação acústica e visual em Hypsiboas albopunctatus em uma lagoa e brejos no município de Rio Claro, estado de São Paulo. Os objetivos deste estudo foram: (1) verificar a influência do tamanho corporal de machos e temperatura do ar nas características físicas dos cantos (frequência dominante e duração das notas); (2) avaliar a influência do número de machos presentes no coro sobre a taxa de repetição de notas agressivas e de anúncio; (3) avaliar os fatores relacionados à emissão de notas agressivas e de anúncio por meio de observações diretas e experimentos de playback com machos no campo, utilizando diferentes tipos de canto; e (4) avaliar os fatores relacionados à emissão de sinais visuais pelos machos através de observações diretas e playbacks na presença e ausência de um macho intruso. Encontrou-se uma correlação negativa entre a massa corpórea e CRC (comprimento rostro-cloacal) do macho com frequência dominante e duração das notas agressivas, indicando que tais características podem ser utilizadas tanto por rivais quanto por fêmeas para avaliar o tamanho dos machos. Porém, características físicas dos cantos não tiveram correlação com a temperatura do ar, provavelmente devido ao fato dos dados terem sido coletados apenas na estação chuvosa, quando há pouca variação na temperatura. O número de machos no coro influenciou no número de notas agressivas emitidas; machos vocalizando em coros maiores emitiram menos notas agressivas, mostrando um provável aumento de limites de tolerância para... / The most studied form of communication in frogs is the acoustic one, but current studies have shown that visual communication is also important in this group, even in nocturnal species. We aimed to understand the social contexts and stimuli involved in the acoustic and visual communications of Hypsiboas albopunctatus in a pond and wetlands, in the municipality of Rio Claro, São Paulo state, southeastern Brazil. The specific aims of this study were: (1) to verify the influence of male body size and air temperature on the physical characteristics of the calls (dominant frequency and duration of notes), (2) to evaluate the influence of the number of males in the chorus on the repetition rate of aggressive and advertisement notes, (3) to evaluate the factors related to the emission of aggressive and advertisement notes through direct observations and playback experiments carried out in the field, using different types of calls, and (4) to evaluate the factors related to the emission of visual signals by males through direct observations and playback experiments with and without the presence of an intruder male. Dominant frequency and duration of aggressive notes were negatively correlated with male SVL (snout vent length) and body mass, suggesting that these traits might be used by females and rivals to evaluate male size. However, there was no correlation of any physical characteristics of the calls with air temperature, probably because data have been collected during the rainy season, when there is less variation in temperature. The chorus size influenced the number of aggressive notes emitted, i. e., focal males emitted less aggressive notes in larger chorus, which suggest an increase of tolerance regarding calls of neighbor males in larger chorus, allowing the resident males to defend their territories less aggressively, while maximizing... (Complete abstract click electronic access below)

A Floresta Atlântica é considerada um dos mais importantes conjuntos de ecossistemas e apesar de ser caracterizada pela alta diversidade de espécies e elevado grau de endemismo, os conhecimentos acumulados sobre a sua fauna ainda são incipientes. Com a anurofauna poucos estudos enfocam a distribuição, os padrões ecológicos e a utilização de ambientes alterados por ação antrópica. O Estado de São Paulo apresenta uma extensa área de plantios de Eucalyptus spp. em áreas anteriormente ocupadas por Floresta Atlântica; no entanto, informações de como os anuros de serapilheira utilizam esses ambientes ainda não foram abordadas nessas regiões. O presente estudo foi desenvolvido em um mosaico de remanescentes de Floresta Atlântica e plantios de Eucalyptus saligna na Fazenda João XXIII, localizada no Município de Pilar do Sul – SP, objetivando caracterizar a riqueza, a composição específica e a diversidade de anuros de serapilheira existente na área, incluindo os plantios. Para a coleta dos anuros utilizou-se armadilhas de interceptação e queda com cercas-guias distribuídas em três ambientes – floresta contínua, fragmentos circundados por plantios de E. saligna e os próprios plantios. Durante os 12 meses de coleta, com um esforço amostral de 1728 armadilhas-dia, foram registradas 23 espécies na área de estudo, das quais seis foram consideradas capturas acidentais; sendo analisados os dados referentes a 1454 capturas. A taxocenose de anuros de serapilheira na Fazenda João XXIII é composta de pelo menos quatro espécies relativamente comuns e nove espécies raras. As espécies com maior abundância relativa em ambientes de floresta nativa foram Crossodactylus caramaschii, Eleutherodactylus guentheri, Bufo crucifer e Adenomera marmorata. Nos plantios de E. saligna, B. crucifer foi responsável por 60,85 % da abundância relativa de espécies. Um total de 18 espécies foi estimado para a localidade; o método utilizado amostrou aproximadamente 94,4 % da riqueza estimada de anuros de serapilheira. No entanto, poucas espécies de lagartos e serpentes foram registradas, indicando que o método é apropriado para a amostragem de anuros de serapilheira, mas deve ser combinado a outros métodos para melhor caracterização da riqueza total de espécies da herpetofauna de serapilheira. A diversidade de espécies foi semelhante nos dois ambientes de floresta nativa e menor nos plantios de E. saligna. Os resultados obtidos, aliados ao atual contexto de fragmentação e degradação da Floresta Atlântica, demonstram que os plantios de E. saligna na Fazenda João XXIII, se devidamente manejados, podem ser localmente importantes para a conservação de anuros de serapilheira, visto que o ambiente parece ser utilizado como hábitat por muitas das espécies registradas em ambientes florestais, ainda que em menor abundância. / The Atlantic Forest is considered one of the most important sets of ecosystems being characterized by the high diversity of species and high degree of endemisms. In spite of the high diversity of anuran amphibians, information on the distribution, ecological patterns, and use of altered environments are incipient. The State of São Paulo presents an extensive area of Eucalyptus spp. plantations. In areas previously covered by the Atlantic Forest. However, information of the way litter frogs still use these environments have not been obtained in these areas. The present study was developed in a mosaic of Atlantic Forest remnants and Eucalyptus saligna plantations in the Fazenda João XXIII, located in the Municipality of Pilar do Sul – São Paulo State. The goal of this study was to survey the anuran species of litter to verify its richness and diversity in the forest fragments and in the E. saligna plantations. For the collection of the litter frogs were used pitfall with drift-fences distributed in three environments: continuous forest, fragments surrounded by E. saligna and E. saligna plantations. During the 12 months of work, with a sampling effort of 1728 trap-day, in the studied site 23 species were registered, of wich six were considered accidental captures, being analyzed 1454 captures. The litter frog assemblage at Fazenda João XXIII has at least four relatively common species and nine rare species. The species with higher relative abundance in environments of native forest were Crossodactylus caramaschii, Eleutherodactylus guentheri, Bufo crucifer, and Adenomera marmorata. In the E. saligna plantations, B. crucifer was responsible for 60.85 % of the relative abundance of species. A total of 18 species was estimated for the locality, the used method showed approximately 94.4 % of the estimated richness of litter frogs. However, few species of lizards and snakes were registered, indicating that the method is appropriate for the sampling of litter frogs, but must be combined to other methods for a better characterization of the total herpetofauna. The species diversity was similar in the two environments of native forest and lesser in the E. saligna plantations. The results obtained in the present context of fragmentation and degradation of the Atlantic Forest demonstrate that the E. saligna plantations in the Fazenda João XXIII, if duly handled, represent an important role in the local conservation of litter anuran species, because most of these species use this environment as habitat, although in lesser abundance that in the environments of native forest.

O canto de anúncio é o principal sinal emitido pelos machos durante a estação reprodutiva e geralmente apresenta duas funções básicas: a atração de fêmeas coespecíficas receptivas sexualmente e o anúncio da posição de um macho para outros machos coespecíficos / heteroespecíficos, ajudando a manter o espaçamento entre os indivíduos vocalizando. A importância do canto de anúncio em anuros como mecanismo primário de isolamento reprodutivo foi extensivamente documentado na literatura e, em decorrência disso, os cantos tem se mostrado altamente valiosos na determinação da identidade das espécies, com aplicação potencial em abordagens macroevolutivas e zoogeográficas. O gênero Leptodactylus atualmente abriga 89 espécies, distribuídas do sul da América do Norte e ao longo de toda a extensão neotropical, do México e Antilhas até a Argentina e Uruguai, cujas espécies são atualmente classificadas em cinco grupos fenéticos. O grupo de L. fuscus é formado por 27 espécies que se distribuem desde o sul do México até o sul do Uruguai e norte da Argentina. Leptodactylus cunicularius foi descrito da Serra do Cipó, área serrana pertencente à porção meridional do complexo da Serra do Espinhaço, e posteriormente, citado de outras três regiões serranas do estado de Minas Gerais. O presente estudo tem como objetivo específico acessar dados bioacústicos e morfológicos/morfométricos de populações previamente atribuídas a Leptodactylus cunicularius, visando a caracterização de populações e o reconhecimento de espécies potencialmente novas. Para isso, analisamos espécimes adultos e cantos de anúncio de oito populações, incluindo a população topotípica, sendo que algumas populações foram previamente atribuídas a L. cunicularius, e outras populações eram desconhecidas até o presente momento. Cinco populações foram reconhecidas como distintas de L. cunicularius através de dados morfológicos/morfométricos e/ou bioacústicos. As outras duas populações ainda estão sob análise. Regiões serranas podem representar áreas de endemismo para anfíbios anuros, ao passo que em algumas delas, é possível detectar congruência biogeográfica para outros grupos de anuros, incluindo espécies próximas e populações confinadas a essas regiões sob complexos de espécies ainda não estudados. / The advertisement call is the main acoustic signal emitted by males during the reproductive season, and usually plays two basic roles: the attraction of conspecific females sexually receptive, and the advertisement of a males position to other conspecific / heteroespecific males, contributing to keep the distance among calling individuals. The importance of the advertisement call in anurans as a primary mechanism of reproductive isolation has been extensively documented in the literature, so that calls have been recognized as very useful to the recognition of species identity, in addition to potential application on macro-evolutionary and zoogeographic approaches. The genus Leptodactylus currently comprises 89 species, distributed from southern North America and throughout the Neotropics, from Mexico and Antilles to Argentina and Uruguay, whose species are today encompassed within five phonetic groups. The L. fuscus group includes 27 species distributed from southern Mexico to southern Uruguay and northern Argentina. Leptodactylus cunicularius was described from the Serra do Cipó, a montane region belonging to the southern secton of the Serra do Espinhaço mountain range, and later, cited from other three montane regions in the State of Minas Gerais. The aim of the present study is to assess bioacoustic and morphological/morphometric data of populations previously assigned to Leptodactylus cunicularius so as to the characterization of populations and the recognition of potentially new species. We analyzed adult specimens and advertisement calls of eight populations, including the topotypic population, considering that some populations were previously assigned to L. cunicularius, and other populations have been unreported so far. Five populations were recognized as different from L. cunicularius based on morphological/morphometric and/or bioacoustic data. The other two populations are still under analysis. Montane regions might represent endemism areas for anuran amphibians, since in some regions, it is already possible to detect biogeographic congruence concerning other anuran groups, including related species and populations restricted to these regions under complex of species unstudied.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-07-10T18:47:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1971791 bytes, checksum: 3db6edc8314196e7faded31d0a589269 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T18:47:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1971791 bytes, checksum: 3db6edc8314196e7faded31d0a589269 (MD5) Previous issue date: 2017-10-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente trabalho apresentamos novos dados sobre taxonomia e história natural de Ololygon carnevallii, uma espécie de anuro descrita para o Parque Estadual do Rio Doce, município de Marliéria, estado de Minas Gerais, Brasil. No primeiro capítulo fizemos uma revisão taxonômica desta espécie através de dados integrativos como morfologia, morfometria, bioacústica e dados moleculares. No segundo capítulo descrevemos o uso do habitat, a dieta e a reprodução desta espécie, e no terceiro e último capítulo, descrevemos comportamentos defensivos desta espécie. Para realização deste estudo, visitamos coleções científicas e examinamos espécimes identificados como O. carnevallii e demais indivíduos com nomes relacionados a esta espécie (‘’cf’’, ‘’aff’’, ‘’gr’’.). Adicionalmente, realizamos campanhas de campo para coletar indivíduos de novas áreas de ocorrência e buscar dados sobre sua história natural. Analisamos 449 indivíduos pertencentes a 35 localidades, distribuídos em cinco bacias hidrográficas, em área de Mata Atlântica e transição com o Cerrado, todas no estado de Minas Gerais, Brasil. Como resultado do primeiro capítulo, descrevemos o canto de anúncio e de soltura de O. carnevallii. O primeiro canto se constitui de uma a três notas com duração de 0,002 a 0,05s e frequência dominante entre 3100,8Hz a 4823,4Hz. Dentre os parâmetros analisados, o canto de anúncio de O. carnevallii se difere de outros cantos de outras espécies principalmente pelo menor número de notas, menor duração e frequência dominante. O canto de soltura desta espécie se constitui de uma a duas notas com duração entre 0,007s e 0,055s e frequência dominante de 3273Hz a 4823,4Hz. Ainda no primeiro capítulo, descrevemos uma nova espécie para o gênero, denominada Ololygon ‘’Zona da Mata’’ sp. nov. cuja localidade tipo é Cataguases, estado de Minas Gerais, Brasil. Esta espécie é morfologicamente semelhante a O. albicans e O. trapiqueiroi, no entanto, o menor tamanho das fêmeas, formato do focinho, padrão de machas e parâmetros acústicos a distinguem prontamente dessas espécies. Os cantos desta espécie foram diferentes das demais espécies do gênero com canto descrito principalmente pelo menor número de notas e frequência dominante. Como resultado do segundo capítulo, obtivemos que machos, fêmeas e jovens utilizam os mesmos habitats e os itens alimentares encontrados pertencem ao filo Arthropoda, distribuídos em oito ordens. Dentre estas as que apresentaram maior importância relativa para os machos foram Araneae, Diptera e Ortoptera, e para as fêmeas foram Blattaria, Ortoptera e Araneae. A espécie apresenta dimorfismo sexual, onde as fêmeas são maiores que os machos, no entanto, o tamanho da fêmea não influencia no número estimado de ovócitos, que variou de 30 a 400. Como resultado do terceiro capítulo, observamos que O. carnevallii exibiu sete tipos de comportamentos defensivos: fugir, esconder, abrir a boca, tanatose, descarga cloacal, inflar o corpo e agachar. Devido a deficiência de dados sobre taxonomia e história natural de várias espécies, nosso trabalho apresenta informações inéditas que podem contribuir para a melhor diagnose e conhecimento sobre dados ecológicos de uma espécie que pertence a um grupo de taxonomia difícil. / This paper presents new data on the taxonomy and natural history of Ololygon carnevallii, an anuran species describe for the Parque Estadual do Rio Doce, Marliéria municipality, Minas Gerais state, Brasil. In the first chapter we did a taxonomic revision of this species through integrative data such as morphology, morphometry, bioacoustics and molecular data. In the second chapter we describe the habitat use, the diet and the reproduction of this species, and in the third and last chapter, we write up defensive behaviors of this species. To execute this paper, we visited scientific collections and examined specimens identified as O. carnevalli and others individuals with names related to it (“cf”, “aff”, “gr”). In addition, we carried out field samples to collect individuals from new areas of occurrence and seek data on their natural history. We analyzed 449 individuals belonging to 35 localities, distributed in five hydrographic basins, in the Atlantic Forest area in transition with the Cerrado biome, all in the Minas Gerais state, Brazil. As a result of the first chapter, we describe the advertisement call and release call of O. carnevallii. The advertisement call is consists of one to three notes duration of 0,002 to 0,05s, and a dominant frequency between 3100,8Hz and 4823.4Hz. Among the analyzed parameters, advertisement call of O. carnevallii differs from others species, mainly due to the lower number of notes, shorter duration and dominant frequency. The release call of this species consists of one to two notes with duration between 0.007s and 0.055s and a dominant frequency of 3273Hz to 4823.4Hz. Also in the first chapter, we describe a new species for the genus, called Ololygon '' Zona da Mata '' sp. nov. whose locality is Cataguases, Minas Gerais state, Brazil. This species is morphologically similar to O. albicans and O. trapiqueiroi, however, the smaller size of the females, snout shape, spot pattern and acoustic parameters distinguish it readily from these species. The calls of this species were different from the other species of the genus with described calls mainly by the smaller number of notes and dominant frequency. As a result of the second chapter, we obtained that males, females and juvenile use the same habitats, and the food items founded belong to the Arthropoda, distributed in eight orders. Among these, the orders that presented the greatest relative importance for the males were Araneae, Diptera and Ortoptera, and for females were Blattaria, Ortoptera and Araneae. The species exhibits sexual dimorphism, where females are larger than males, however, female size does not influence the estimated number of oocytes, ranging from 30 to 400. As a result of the third chapter, we observed that O. carnevallii exhibited seven types of defensive behaviors: fleeing, hiding, mouthgaping, thanatosis, cloacal discharge, puffing up the body and crouching down. Due to the lack of data on taxonomy and natural history of several species, our work presents unpublished information that can contribute to the best diagnosis and knowledge about ecological data of a species belonging to a group of difficult taxonomy.

Orientadores: Shirley Maria Recco Pimentel, Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-14T04:15:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Conte_Monica_D.pdf: 2562572 bytes, checksum: 5809c698460cf03316a75fff9039a861 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Muitas espécies de anfíbios estão entre as mais ameaçados de extinção, e no entanto, informações sobre a variabilidade genética e a estruturação genética das suas populações são ainda limitadas. No presente trabalho, a variabilidade genética de populações da espécie Physalaemus cuvieri foi analisada utilizando microssatélites como marcadores moleculares. Considerando-se sua ampla distribuição geográfica, variação morfológica interpopulacional e variação intra- e interpopulacional em algumas características citogenéticas, espécimes de dez populações de P. cuvieri foram amostradas, em São Pedro da Água Branca (MA), Urbana Santo (MA), Porto Nacional (TO), Uberlândia (MG), Vitória Brasil (SP), Palestina (SP), Nova Itapirema (SP), Chapada dos Guimarães (MT), Vitória da Conquista (BA) e Passo Fundo (RS). Dez locos de microssatélites de P. cuvieri foram isolados a partir de uma biblioteca enriquecida em repetições (CA)8 e (GT)8. A amplificação desses locos em 160 indivíduos de P. cuvieri revelou uma média de 5,7 alelos por loco e uma heterozigosidade esperada variando de 0,30 a 0,85. Embora a maior parte da variação genética esteja dentro das populações, o valor global do FST encontrado indica uma alta diferenciação entre essas populações. O baixo fluxo gênico encontrado sugere baixa capacidade dispersiva, no padrão de escala geográfica usado neste trabalho, e condiz com o comportamento filopátrico atribuído aos anuros. Nesse estudo foi ainda verificado que não existe correlação entre distância geográfica e distância genética das populações amostradas, sugerindo uma alta fidelidade dessa espécie aos seus locais de desova. Os resultados indicam que a distância geográfica sozinha não explica a variabilidade genética dessas populações. Duas populações, São Pedro da Água Branca (MA) e Nova Itapirema (SP), possivelmente passaram por efeito de gargalo populacional (bottleneck), que pode ser resultado, entre outros fatores, da destruição de habitat levando à fragmentação da população. Dos dez locos de microssatélites desenvolvidos para P. cuvieri, nove foram utilizados para verificar a possibilidade de amplificação e sua aplicabilidade no estudo da estrutura genética de duas outras espécies do grupo cuvieri muito proximamente relacionadas à P. cuvieri. Essas espécies são: P. ephippifer (15 indivíduos) e P. albonotatus (11). As duas populações estudadas ficaram isoladas das cinco de P. cuvieri, mostrando um alto grau de diferenciação genética, e indicando claramente sua condição de espécie distinta de P. cuvieri. A população de Crateús - CE agrupou com Urbano Santos - MA (ambas P. cuvieri). Este resultado corrobora os resultados de estudos citogenéticos. As populações de Porto Nacional (TO) e Passo Fundo (RS) formaram dois grupos de indivíduos cada uma. Parte dos indivíduos de Porto Nacional agrupou com a população de Uberlândia (MG) de P. cuvieri, e o restante dos indivíduos não mostrou nenhum agrupamento com qualquer outra população e espécies analisadas neste trabalho. Resultados semelhantes foram obtidos com a população de Passo Fundo, que não mostrou agrupamento com nenhuma outra população analisada. Estudos adicionais dessas populações serão necessários para melhor compreender esses dados. O conhecimento do padrão de dispersão da variabilidade genética de P. cuvieri, avaliada por microssatélites, somado ao conhecimento acumulado, obtido por meio de outras metodologias, poderá contribuir para a definição de estratégias de conservação e contribuir para o delineamento entre as fronteiras taxonômicas dessa espécie. / Abstract: Even though many amphibian species are among the most endangered animals, the knowledge about their genetic variability and population genetic structure is still limited. In the present work, natural populations of the barker frog Physalaemus cuvieri were analyzed for genetic variability and differentiation using microsatellites, considering its wide geographic distribution, interpopulational morphological variation and cytogenetic intra- and interpopulational variation. Analyzes comprised specimens from ten P. cuvieri populations sampled in the following regions of Brazil: São Pedro da Água Branca (MA), Urbano Santo (MA), Porto Nacional (TO), Uberlândia (MG), Vitória Brasil (SP), Palestina (SP), Nova Itapirema (SP), Chapada dos Guimarães (MT), Vitória da Conquista (BA) and Passo Fundo (RS). Ten microsatellite loci were isolated for P. cuvieri from a library enriched in (CA)8 and (GT)8 repeats. In 160 P. cuvieri individuals, the average number of alleles per locus was 5.7 and the expected heterozygosity ranged from 0.30 to 0.85. Although most of the genetic variation was found within populations, the overall FST value indicated high genetic differentiation among the populations. The low gene flow among populations suggested low dispersion capability within the geographic scale pattern used in this work, which is compatible with the anuran philopatric behavior. In addition, there was no correlation between geographic and genetic distances of these populations, suggesting fidelity of P. cuvieri populations to their spawning place. These results indicated that the geographic distance alone does not explain the genetic variability observed among these populations. The data also indicated that the populations from São Pedro da Água Branca (MA) and Nova Itapirema (SP), respectively in the Northeast and Southeast regions of Brazil, have likely gone through a recent population bottleneck effect. Destruction of natural habitats leading to population fragmentation could be a major cause of this suggested bottleneck effect. Of the ten microsatellite loci developed for P. cuvieri, nine were used to investigate cross-amplification and suitability for population genetic structure studies in two other species of the cuvieri group closely related to P. cuvieri. These species are: P. ephippifer (15 specimens) and P. albonotatus (11 specimens). These two populations remained isolated from all populations of P. cuvieri, demonstrating its high genetic differentiation, pointing that these two species are distinct from P. cuvieri. The Crateús (CE) population was grouped with Urbano Santos (MA) population (both P. cuvieri). This result corroborated previous cytogenetic results. The Porto Nacional (TO) and Passo Fundo (RS) populations were divided in two sets of individuals each one. Part of Porto Nacional individuals were clustering with P. cuvieri from Uberlândia (MG), and the remaining did not show any grouping with none of other analyzed species. Similar results were found to Passo Fundo population, which also did not show any group with the analyzed species. The knowledge of the dispersion pattern of the P. cuvieri genetic variability evaluated by microsatellites, in addition to the genetic variability data obtained using other methodologies, will contribute for the development of future ecological and conservation strategies and to improve the taxonomy of this species. / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T06:46:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Quindere_YedaRumiSerraDouglas_M.pdf: 8609021 bytes, checksum: 5a91bb6ce1e8fff91e49eb0b18f73d2d (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: O gênero Physalaemus é composto por 40 espécies divididas em sete grupos: ¿albifrons¿, ¿cuvieri¿, ¿deimaticus¿, ¿gracilis¿, ¿henselii¿, ¿olfersii¿ e ¿signifer¿. Nove espécies compõem o grupo "cuvieri" e dessas apenas P. cuvieri já teve seu cariótipo descrito com detalhes, tendo apresentado expressiva variação intra e interpopulacional em relação à localização de regiões organizadoras de nucléolo (NOR). Dado que P. Cuvieri apresenta ampla distribuição geográfica e que a variação mencionada foi encontrada em populações do sul e do sudeste do Brasil, no presente trabalho ampliamos seu estudo, com a análise cromossômica de quatro populações da região nordeste, uma da região norte e uma da região sudeste do Brasil. Adicionalmente uma população da Argentina também foi estudada. Com o intuito de comparar cariotipicamente P. cuvieri com outras espécies de Physalaemus, também foram estudados os cariótipos de P. albonotatus, P. centralis, P. cuqui e P. ephippifer, pertencentes ao grupo "cuvieri", P. albifrons, espécie recentemente removida desse grupo, e P. santafecinus atualmente do grupo de P. albifrons. Todas as populações de P. cuvieri aqui estudadas apresentaram cariótipo com 2n=22 cromossomos e grande variação em relação às NORs pôde ser observada. Duas populações de P. cuvieri (Urbano Santos-MA e Crateús-CE) apresentaram as NORs nos pares 8 e 9. No par 8, a NOR, de localização intersticial, mostrou-se adjacente a uma região de heterocromatina, enquanto a NOR presente no par 9 foi coincidente com um bloco heterocromático. Na população de São Pedro da Água Branca (MA), além dos pares 8 e 9, o par 7 foi também portador de NOR. Na população de Palmeiras (BA) e Uberlândia (MG), apenas um par cromossômico (8) foi portador de NOR. Na população mineira, diferenças intra-individuais foram encontradas principalmente em relação ao tamanho da NOR. Já nas populações da Argentina, a NOR intersticialmente localizada no o par cromossômico 8 não foi encontrada. Em todos os exemplares dessas populações argentinas, o par 11 foi portador de NOR e NORs adicionais foram encontradas nos cromossomos 1, 7 ou 8 (em posição pericentromérica) em alguns indivíduos. É interessante notar que o morfo 11 dessa população argentina é muito semelhante ao cromossomo 11 encontrado na população de Santa Maria (RS) analisada anteriormente. Já na população do estado de Tocantins, NORs múltiplas foram visualizadas em pelo menos cinco cromossomos (pertencentes aos pares 1, 3, 4 e 10), padrão que difere bastante daqueles encontrados nas outras populações de P. cuvieri. Também em relação ao padrão de distribuição de bandas heterocromáticas no cariótipo, a população de Tocantins analisada difere das demais, fato que intriga e corrobora a necessidade de uma revisão taxonômica da espécie em questão. A morfologia cariotípica de P. albifrons, P. albonotatus, P. centralis, P. cuqui, P. ephippifer e P. santafecinus foi muito semelhante, principalmente em relação aos primeiros pares cromossômicos, embora em P. albonotatus e P. cuqui a ordenação de alguns pares tenha sido diferente. Todas essas espécies puderam ser diferenciadas pela localização da NOR e em P.ephippifer um interessante heteromorfismo foi observado no par 8 portador de NOR em todas as fêmeas analisadas. Não foi descartada a hipótese de tal heteromorfismo estar relacionado à determinação sexual nessa espécie, no entanto, futuros estudos são necessários para sua comprovação. Exceto no cariótipo dos indivíduos de P. cuvieri de Tocantins, nos cariótipos aqui descritos a principal (ou única) NOR foi encontrada nos últimos pares cromossômicos, alterando a morfologia desses, o que dificultou a inferência de homeologias interespecíficas e dos possíveis rearranjos que envolveram a NOR durante a diferenciação das espécies em análise. Já com o bandamento C, algumas homeologias interespecíficas foram claramente notadas. Uma banda intersticial no braço curto do par 5, outras na região pericentromérica do braço curto dos pares 3 e 7, por exemplo, foram encontradas em P. cuvieri, P. centralis e P. ephippifer, e parecem homeólogas às encontradas nos pares classificados como 3, 5 e 7 no cariótipo de P. albonotatus / Abstract: The genus Physalaemus is composed by 41 species distributed in seven groups: ¿albifrons¿, ¿cuvieri¿, ¿deimaticus¿, ¿gracilis¿, ¿henselii¿, ¿olfersii¿ and ¿signifer¿. Nine species compose the group ¿cuvieri¿ but just P. cuvieri had already been karyotyped in details. Expressive intra and interpopulational variation related to the localization of the nucleolus organizer regions (NOR) was described for this species. Physalaemus cuvieri is widely geographically distributed and NOR variation was described based on populations from Southern and Southeastern Brazil. In the present work we analyzed the cytogenetic of four populations from Northeastern, one from Northern and one from Southeastern Brazil. Additionally, three Argentinian populations were also included. To cytogenetically compare P. cuvieri with other species of Physalaemus, species belonging to P. cuvieri group (i.e. P. albonotatus, P. centralis, P. cuqui and P. ephippifer), P. albifrons, recently removed from this group, and P. santafecinus, currently alocated in P. albifrons group, were also analyzed. All populations of P. cuvieri studied here showed diploid number of 22 chromosomes and high intraspecific variation was observed related to the NORs. Two populations of P. cuvieri (Urbano Santos, state of Maranhão (MA) and Crateús, state of Ceará (CE)) had pairs 8 and 9 as NOR-bearing chromosomes. In pair 8 the interstitial NOR was adjacent to C-bands whereas the NOR at the nineth pair was coincident with a heterochromatic block. In the population from São Pedro da Água Branca, state of Maranhão (MA), besides pairs 8 and 9, the seventh pair was also a NOR-bearing one. The specimens from Palmeiras, state of Bahia (BA) and Uberlândia, state of Minas Gerais (MG) showed only one NOR, which was located at pair 8. In the population from Uberlândia (MG) intraindividual differences was found related to the NOR size. In the populations from Argentina, the interstitial NOR in chromosome pair 8 was not found. In all the specimens of these Argentinean populations, pair 11 was the NOR-bearing chromosome pair and additional NORs were also found in chromosomes 1, 7 or 8 (in a pericentromeric position) in some of the individuals. The morph 11 of specimens from Argentina was very similar to the NOR-bearing eleventh pair described for specimens from Santa Maria (RS) previously analyzed. In contrast, in the population from Porto Nacional, state of Tocantins (TO), multiple NORs were visualized at least at five chromosomes (belonging to pair 1, 3, 4 and 10), a pattern that greatly differed from those found in the others populations of P. cuvieri. Also concerning the C-band distribution, the karyotype found in the population of Tocantins differed from the others. These findings are very interesting and can be useful for future taxonomic studies of this taxon. Regarding to chromosome morphology, P. albifrons, P. albonotatus, P. centralis, P. cuqui, P. ephippifer and P. santafecinus were very similar, specially for the seven first chromosome pairs, although in P. albonotatus and P. cuqui the position of some chromosome pairs was different. All the species could be differentiated by NOR localization and in P. ephippifer an interesting heteromorphism was detected in NOR bearing pair 8 of all the females. We do not discard the hypothesis that such heteromorphism could be related to sex determination in this species, but future studies are necessary to test it. Except for the karyotype of P. cuvieri from Tocantins, the karyotypes described here the principal (or only) NOR was found among the last chromosome pairs, resulting in different chromosome morphologies, what impaired interespecific inferences of homeologies and the recognition of possible rearrengements involving the NOR during the differentiation of the species analyzed. On the other hand, C-banding tecnique permitted to notice some interspecific homeologies. A band at an interstitial region in the short arm of pair 5, and pericentromeric C-bands in the short arm of pairs 3 and 7 were detected in P. cuvieri, P. centralis and P. ephippifer which seemed to be homeologous to C-bands found in pair 3, 5 and 7 of P. albonotatus / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-07T11:33:43Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Macks Wendhell Gonçalves - 2015.pdf: 2230980 bytes, checksum: 89b6fe4e650d5cf40d848556e6b1de0a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-07T11:35:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Macks Wendhell Gonçalves - 2015.pdf: 2230980 bytes, checksum: 89b6fe4e650d5cf40d848556e6b1de0a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-07T11:35:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Macks Wendhell Gonçalves - 2015.pdf: 2230980 bytes, checksum: 89b6fe4e650d5cf40d848556e6b1de0a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-02-20 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Amphibian populations have declined in many areas of the world. These declines seem to have worsened over the past 25 years and amphibians are now more threatened than other taxa, such as mammals or birds. Numerous factors contribute to this decrease; however, environmental pollution has recently been cited as a major factor. These vertebrates are important in natural control of several pests in natural and agricultural areas, where they are constantly exposed to large amounts of pesticides. Genotoxicity studies with amphibians are important to detect indicator species of environmental change. Amphibians are particularly sensitive to these variations due to their behavioral and physiological characteristics, such as, permeable skin (cutaneous respiration), low mobility and life cycle with simultaneous dependence of the aquatic and terrestrial environment. In this context, these animals could be used as bioindicators of the environmental quality in genotoxicity and mutagenicity studies. The aim of this study was to analyze the genomic damage in tadpoles of Dendropsophus minutus and Physalaemus cuvieri sampled in perturbed and natural areas, by the comet assay and micronucleus test. We found that the tadpoles of D. minutus and P. cuvieri collected in perturbed areas had the highest extensions of DNA damage compared to the tadpoles of natural areas. Tadpoles sampled in soybean crop areas had higher DNA damage, followed by those sampled in the cornfields. In contrast, the frequency of DNA damage in tadpoles of natural areas were significantly lower in relation to DNA damage suffered by tadpoles of agricultural areas. Thus, we can conclude that tadpoles of D. minutus and P. cuvieri sampled in this study can be considered excellent sentinel organisms, as they were sensitive to environmental changes. In addition, we can highlight the advantages of using the comet assay in environmental genotoxicity studies, such as its speed, high sensitivity in detecting DNA damage in the genome of amphibians, for a relatively low cost. However, it is necessary to invest in the standardization of methodologies for field studies, thus the results could be compared between different laboratories, and make environmental genotoxicity studies, involving aquatic organisms, more informative and applicable as a practical laboratory routine. / Populações de anfíbios tem diminuído em diversas áreas do mundo. Estes declínios têm se agravado nos últimos 25 anos, fazendo com que esses animais sejam agora considerados mais ameaçados do que outros táxons como por exemplo, mamíferos e aves. Numerosos fatores contribuem para esse decréscimo, no entanto, a poluição do meio ambiente tem sido recentemente citada como um dos principais fatores. Estes vertebrados são importantes no controle natural de pragas em áreas naturais e agrícolas, onde estão constantemente expostos a grandes quantidades de pesticidas. Estudos de genotoxicidade com anfíbios anuros se fazem importantes para se detectar espécies indicadoras de mudanças ambientais. Os anfíbios são particularmente sensíveis a essas variações devido às suas características comportamentais e fisiológicas, tais como, pele permeável (respiração cutânea), pouca mobilidade e ciclo de vida com dependência simultânea do ambiente aquático e terrestre. Neste contexto, estes animais podem ser utilizados como bioindicadores da qualidade ambiental em estudos de genotoxicidade e mutagenicidade. O objetivo deste estudo foi analisar os danos genômicos em girinos de Dendropsophus minutus e Physalaemus cuvieri amostrados em áreas antropizadas e naturais, via ensaio cometa e teste do micronúcleo. Os resultados deste estudo detectaram que os girinos de D. minutus e P. cuvieri amostrados em áreas antropizadas apresentaram as maiores extensões de danos genômicos quando comparados com os girinos de áreas naturais. Os girinos coletados nas áreas de lavoura de soja tiveram maiores danos no DNA, seguidos daqueles amostrados nas plantações de milho. Em contrapartida, a frequência de danos genômicos nos girinos de áreas naturais foram significativamente menores em relação aos danos genômicos sofridos pelos girinos das áreas agrícolas. Assim, pode se concluir que os girinos das espécies D. minutus e P. cuvieri amostrados neste estudo podem ser consideradas excelentes bioindicadores, uma vez que se mostraram sensíveis a alterações ambientais. Além disso, podese ressaltar as vantagens de se utilizar o ensaio cometa em estudos de genotoxicidade ambiental, como sua rapidez, alta sensibilidade em detectar danos no DNA no genoma de anfíbios, por um custo relativamente baixo. No entanto faz-se necessário a normatização de uma metodologia para estudos de campo, de forma que, os resultados possam ser comparados entre laboratórios diferentes, tornando assim, os estudos de genotoxicidade ambiental envolvendo organismos aquáticos mais informativos e aplicados como uma prática de rotina.

Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-07-17T19:14:03Z No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-20T12:48:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-20T12:53:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-20T12:53:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) Previous issue date: 2011-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Amphibian skin secretions are rich sources of biologically active substances with various physiological functions and defense, most of low molecular weight, as biogenic amines, alkaloids, steroids, peptides and proteins of high molecular weight. The genus Hypsiboas, belonging to the family Hylidae from class of amphibians, presents as promissing supplier of peptides with biological potential. Peptides identified of species Hypsiboas are analogous to the known antimicrobial peptides. This work was realized a systematic study of the skin secretion of Hypsiboas cinerascens obtained by stimulation, where it was possible to identify a new peptide with wide antimicrobial activity, named cinerascetina. Its sequence was identified by techniques of high performance liquid chromatography (HPLC) and mass spectrometry (MALDI-TOFTOF) and confirmed by genetic sequencing, and was also possible identified six new peptides with possible antimicrobial activity. / Secreções de pele de anfíbios são fontes ricas de substâncias biologicamente ativas com diversas funções fisiológicas e de defesa, a maioria de baixa massa molecular como as aminas biogênicas, alcaloides, esteroides, peptídeos e proteínas de massa molecular elevada. O gênero Hypsiboas, pertencente à família Hylidae da classe dos anfíbios, apresenta-se como promissor fornecedor de peptídeos com potencial biológico. Peptídeos identificados de espécies de Hypsiboas apresentaram analógia a peptídeos antimicrobianos conhecidos. Neste trabalho foi realizado um estudo sistemático da secreção da cutânea de Hypsiboas cinerascens obtida por estimulação, onde foi possível identificar um novo peptídeo com ampla atividade antimicrobiana, o qual foi denominado de Cinerascetina. Sua sequência foi identificada por técnicas de cromatografia liquida de alta eficiência (CLAE) e espectrometria de massa (MALDITOF- TOF) e confirmada por técnica de sequenciamento genético, sendo que através desse estudo de sequenciamento genético, também foi possível identificar seis novos peptídeos com possível atividade antimicrobiana.