Orientadores: Shirlei Maria Recco Pimentel, Luciana Bolsoni Lourenço / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T06:02:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vittorazzi_StenioEder_D.pdf: 3469046 bytes, checksum: 548f412477dbed97bd45f19e26cea793 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os genomas dos eucariotos são ricos em sequências repetitivas, as quais compreendem sequências dispersas e em tandem. Entre as sequências em tandem, incluem-se os DNA satélites, os DNA ribossomais e cópias parálogas. Os DNA satélites são os principais constituintes da heterocromatina constitutiva e os genes ribossomais transcrevem os RNAr para compor os ribossomos, que dividem-se em duas famílias, DNAr 45S e 5S. Em um mesmo organismo, diferentes tipos de DNAr 5S já foram reconhecidos, mostrando a existência de uma diversidade quanto a esse tipo de sequência. No anuro Physalaemus cuvieri, uma forma de DNA satélite denominada PcP190 foi caracterizada e teve sua origem atribuída a uma derivação do DNAr 5S em uma espécie ancestral. Em diferentes populações de P. cuvieri estudadas previamente com as ferramentas da citogenética convencional, uma acentuada variação interpopulacional nos cromossomos portadores da NOR pôde ser observada, e nas demais espécies do grupo de P. cuvieri, peculiaridades interespecíficas foram evidenciadas, porém, os cariótipos entre essas espécies são muito semelhantes. O objetivo nessa tese foi ampliar o estudo citogenético de espécies do grupo de P. cuvieri que possuíam carência na descrição cromossômica, como P. kroyeri e P. cicada. Objetivou-se também analisar o DNA satélite PcP190 em nível cromossômico e molecular, assim como estudar a organização molecular e a diversidade de sequências do DNAr 5S no genoma das espécies de Physalaemus e espécies de gêneros relacionados. Com os resultados da pesquisa, três capítulos são apresentados, sendo eles: (i) "Long-time evolution and highly dynamic satellite DNA in leptodactylid and hylodid frogs", o qual mostra que o DNA satélite PcP190 é amplamente conservado e pode ser reconhecido em representantes de duas famílias de anuros, Leptodactylidae e Hylodidae; além disso, mostra também que essas sequências são altamente dinâmicas nos cromossomos das espécies do grupo de P. cuvieri. (ii) "Diversidade do DNAr 5S em Leiuperinae (Anura)", os resultados mostram que no genoma desses anuros existe uma diversidade dessa classe de família multigênica maior do que proposto até então, e que essas sequências do DNAr 5S permanecem conservadas desde a divergência evolutiva entre os Actinopterigio e Sarcopterigio. (iii) "Cariótipo e mapeamento de DNA repetitivo em Physalaemus kroyeri e P. cicada (Anura Leptodactylidae)", onde é apresentado que a banda 5p de P. kroyeri tem se mostrado um bom marcador cromossômico para as espécies do grupo de P. cuvieri, o que indica se tratar de uma sinapomorfia cromossômica. Contrariamente, a ausência dessa banda 5p em P. cicada não fornece evidência para a inclusão de P. cicada no grupo de P. cuvieri ou em qualquer outro grupo de espécies / Abstract: The genomes of eukaryotic organisms are rich in repetitive DNA sequences, which can be dispersed or arrayed in tandem. The tandem repeat sequences include the satellite DNA, the ribosomal DNA, and paralogous copies. Satellite DNA is the main component of constitutive heterochromatin, while the ribosomal genes encode the rRNAs that make up the ribosomes; they are divided into two families, the 45S and 5S rRNA. Different types of 5S rDNA have been identified in a single organism, proving that there is diversity in this type of DNA sequence. In the anuran Physalaemus cuvieri, a satellite DNA family called PcP190 has been identified, which is thought to have derived from the 5S rDNA of an ancestor species. In different populations of P. cuvieri that were previously studied with conventional cytogenetic tools, an accentuated interpopulational variation among chromosomes harboring the NOR was observed, while in other species of the P. cuvieri group, interspecific traits were found. However, the karyotypes in these species are very similar. The aim of this thesis was to expand the cytogenetic studies on P. cuvieri species that needed further chromosomal description, such as P. kroyeri and P. cicada. Another objective was to analyze the PcP190 satellite DNA at the chromosomal and molecular level, as well as to study the molecular organization and the diversity of 5S rDNA sequences in the genomes of the Physalaemus species and other species of related genera. We present three chapters as a result of this research: (i) "Long-time evolution and highly dynamic satellite DNA in frogs," which demonstrates that the PcP190 satellite DNA is widely conserved and was recognized in representatives of two anurans families, Leptodactylidae and Hylodidae. Moreover, it also demonstrates that these sequences are highly dynamic within the chromosomes of the P. cuvieri species group. (ii) "5S rDNA in Leiuperinae (Anura): new insights on its evolution." The results show that in the genomes of these anurans there is wider diversity among this multigenic family than previously assumed and that these 5S rDNA sequences have remained conserved since the evolutionary divergence of Actinopterygii and Sarcopterygii. (iii) "Karyotype and repetitive DNA mapping of the Physalaemus kroyeri and P. cicada (Anura Leptodactylidae)," which demonstrates that the 5p chromosomal band of P. kroyeri is a good chromosomal marker for species from the P. cuvieri group, indicating that it is a chromosomal synapomorphy. Conversely, the absence of this 5p band in P. cicada does not provide evidence for the inclusion of this species in the P. cuvieri group or any other species group / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Tadeu Siqueira / Resumo: A natureza é ruidosa. Passarinhos gorjeiam enquanto o vento silva ao pentear os campos com abelhas e seus zunzuns rondando flores. Desatentos, deixamos de notar uma incrível quantidade de elementos retumbando em nosso entorno. No entanto, cada som parte de uma fonte, deixando uma pista sobre a situação na qual foi produzido. Podemos identificar a espécie de passarinho pelo seu canto, e, quem sabe, revelar a passagem de uma espécie migratória. A imagem de um campo nos é desperta ao escutar o vento soprando por gramíneas, que ressoaria diferente se soprasse por uma floresta. Por conseguinte, podemos registrar a atividade acústica dos organismos e descrever as dinâmicas de ecossistemas através de um conjunto de técnicas oferecidas pelo monitoramento acústico passivo. Além disto, os diversos sons emitidos por animais são produzidos sobretudo para fins reprodutivos e territoriais. Sua produção possui elevado custo energético e influencia se a performance de um organismo resultará em saldo positivo para a perpetuação de seus descendentes. Diante disso, alguns percalços no caminho entre a emissão e a recepção desses sons podem adulterar suas características e inviabilizar seu reconhecimento. Por serem ondas mecânicas, a vegetação pode refratar e absorver elementos dos sons emitidos por animais. Ou ainda, em grandes agregações, como os coros por aves no amanhecer e por anuros e invertebrados ao ocaso, os diversos sons podem gerar interferências. Em ambos os casos, a degradação sonora... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Nature is noisy. Birds chirps while the wind whistle when brushing the fields, with bees buzzing around flowers. Meanwhile, our absence of mind prevents us to notice many elements rumbling on our surroundings. However, each sound has a source that leaves clues about the situation in which it was produced. The songbird can be identified by its song and eventually reveal the passage of a migratory species. The wind blowing through the grass quickly resemble the image of a field that would otherwise sound different if it blew through a forest. Therefore, such acoustic activity of the organisms can be recorded and used to describe ecosystems dynamics through a set of techniques included in passive acoustic monitoring. In addition, sounds emitted by animals are produced mainly for reproductive and territorial purpose. Its production is costly and influences whether the performance of an organisms will lead a positive balance for the perpetuation of its descendants. As such, obstacles on the path between sound emission and reception may distort its characteristics and impair sound recognition. As sound are mechanical waves, vegetation can refract and absorb elements on the acoustic signal, or in large aggregations, such as dawn bird chorus and dusk anuran and invertebrate choruses, an abundance of animal sounds can generate interferences. In both cases, sound degradation may compromise species’ reproductive success. On the contrary, another perspective predicts that such obstacles ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

This project examined the role of the cytoskeleton in regulatory mechanisms of the amiloride-sensitive Na⁺ channels in isolated frog skin epithelium. The epithelium from ventral frog skin is a model tissue which has proved significant in our understanding of the basic principles involved in water and Na⁺ homeostasis. In particular, this project examines ways in which local (non-hormonal) and hormonal regulatory mechanisms adjust the Na⁺ permeability of apical membranes of frog skin epithelium. Both mechanisms contain factors that are known to increase the apical membrane Na⁺ permeability mainly by increases in the number of open channels. The origin of these new open channels is unknown but, it is postulated that they could arise either by activation of quiescent channels already present in the apical membrane, or by recruitment of channels from cytoplasmic stores. Regarding the latter hypothesis, we also examined the idea that the cytoskeleton might somehow be involved in the insertion of Na⁺ channels within vesicles, into the apical membrane. This is based on the fact that the cytoskeleton is involved in a similar mechanism whereby, in the toad urinary bladder, anti-diuretic hormone (ADH) causes the insertion of aggregates with water channels. Much current interest focuses on the role of the cytoskeleton in the regulation of epithelial Na⁺ channels. To test this hypothesis, we used noise analysis to examine the effects of disrupting the cytoskeleton, on two different mechanisms which bring about changes in open channel densities. The mechanisms are: (1) lowering mucosal Na⁺ concentration (non-hormonal), and (2) addition of arginine-vasopressin (A VP) (hormonal). Non-hormonal, autoregulatory changes in apical membrane Na⁺ conductance were examined by investigating the effects of reducing the mucosal Na⁺ concentration. Our results showed that lowering the mucosal Na⁺ concentration induced large increases in the open channel density in order to stabilise the transport rate. In addition, we observed an average 55-60% increase in the open channel probability, which implies that in epithelium from Rana fuscigula, changes of channel open probability are also an important mechanism in the autoregulation of channel densities in response to a reduction in mucosal Na⁺. The hormonal control of Na⁺ channels by A VP has been intensively studied by noise analysis and the patch clamp. Our results confirmed previous reports that A VP increases the Na⁺ transport rate by increasing the number of open Na⁺ channels, primarily through large changes in the total number of channels, without a significant change in open probability. Regarding the role of the cytoskeleton in regulation of Na⁺ channels and/or its possible role in control of inserting putative vesicles with Na⁺ channels, we studied the effects of disrupting the cytoskeleton on the two regulatory mechanisms. Disrupting microtubules with colchicine had no, or very little effect on either of the regulatory mechanisms. On the other hand, the integrity of the microfilaments was very important for the autoregulatory changes in the number of open channels. After cytochalasin B treatment, lowering the mucosal Na⁺ concentration did not result in the usual compensatory changes in channel densities. There was no prior evidence that cytochalasin B had any actual effect on the F-actin network in the frog skin epithelium. Accordingly, modified cytochemical techniques were designed to demonstrate and localise F-actin in the epithelial granular cells. The direct immunofluorescent method proved useful, but did not allow sufficient resolution to examine the changes to different populations of actin in the cells. We then modified an immunogold method to suit our conditions, and the results demonstrated the localisation of different pools of F-actin and showed the effects of the cytochalasin B and vasopressin.

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Two aspects of possible adaptation In cardiovascular performance caused by Increased plasma electrolytes were examined. Cells In anisotonic plasma may either act as osmometers or volume regulate. Blood flow rate Is dependent upon cell viscosity, which in turn is a consequence of cell volume and membrane deform-ability. Cell volume changes which Increase membrane deform-ability will thus potentially extend the limits of dehydration tolerance. It was found in R. catesbeiana and B. marinus that red blood cell Is maintain constant volume during dehydration. Cells in vitro Initially lose water, but then sodium, potassium and water move Into the cell. Cell viscosity within the physiologic range of hematocrits was higher In salt loaded non-regulating cell Is of B. marinus than In regulating isotonic cells.

京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(理学) / 甲第18827号 / 理博第4085号 / 新制||理||1587(附属図書館) / 31778 / 京都大学大学院理学研究科生物科学専攻 / (主査)准教授 森 哲, 教授 沼田 英治, 教授 高橋 淑子 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Science / Kyoto University / DFAM

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-08-03T11:52:14Z No. of bitstreams: 1 2011 - Gabriela Bueno B. Silva.pdf: 16499028 bytes, checksum: f77bf195f420f4227c29b60a75895d0d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T11:52:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Gabriela Bueno B. Silva.pdf: 16499028 bytes, checksum: f77bf195f420f4227c29b60a75895d0d (MD5) Previous issue date: 2011-04-15 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior, CAPES, Brasil. / BITTENCOURT-SILVA, Gabriela Bueno. Insular Anuran (Amphibia) Communities of the Southeast Coast of Brazil: Taxonomic Composition and Relationship to the History of the Islands. 2011. 72p. Dissertation (Master of Science in Animal Biology). Instituto de Biologia, Departamento de Biologia Animal, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Serop?dica, RJ, 2011. A data set containing a list of the known species of frogs that occur near shore and on eight islands of the south coast of the State of Rio de Janeiro and north of the State of S?o Paulo was produced. For that, I compiled data from the literature and conducted inventories of a few of the islands. This list included 67 anuran species belonging to 11 families for eight islands and 117 species and 14 families for two localities on the mainland. The pattern of richness between islands was analyzed in respect to the island area and the composition of habitats used by the anurans for reproduction. Insular structural complexity was also evaluated in this regard. The results of correlation analyses of area vs. species richness and species richness vs. number of reproductive habitats were highly significant indicating that species richness prediction in fragmented environments depends on both factors. Nestedness analyses using the metric NODF was performed in an attempt to investigate whether shared species absences among the islands are the result of a random process or represents a pattern indicative of ordered loss of species. The predicted pattern was confirmed ? that is, that species loss is nonrandom and that this was possibly caused by habitat loss. The role played by climatic events at the beginning of the Holocene and of the availability of reproductive habitats in the islands upon species loss is discussed. Furthermore, it is discussed how these results can help to guide conservation strategies of anuran species. / BITTENCOURT-SILVA, Gabriela Bueno. Comunidades de Anf?bios Anuros Insulares do Litoral Sudeste do Brasil: Composi??o Taxon?mica e Rela??es com a Hist?ria de Forma??o das Ilhas. 2011. 72p. Disserta??o (Mestrado em Biologia Animal). Instituto de Biologia, Departamento de Biologia Animal, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Serop?dica, RJ, 2011. Atrav?s de invent?rios e compila??o de dados da literatura levantou-se a composi??o de esp?cies de anf?bios anuros de oito ilhas, sendo seis da Costa Verde do Estado do Rio de Janeiro e duas do litoral norte do Estado de S?o Paulo. Al?m das ilhas, foram tamb?m compilados da literatura os invent?rios de duas comunidades representativas do litoral dos dois Estados. Adicionalmente, foram registradas 67 esp?cies, pertencentes a 11 fam?lias de anuros nas ilhas e 117 esp?cies e 14 fam?lias para o continente. O padr?o de distribui??o de riqueza das ilhas foi avaliado em rela??o ? ?rea das ilhas, ? composi??o de ambientes usados pelos anuros para reprodu??o e ? complexidade estrutural das ilhas. As an?lises de correla??o da riqueza de esp?cies vs. ?rea e riqueza de esp?cies vs. n?mero de ambientes reprodutivos apresentam resultados significativos, que s?o indicativos que a riqueza de esp?cies em ambientes fragmentados depende da intera??o de ambos os fatores. A fim de avaliar se as aus?ncias compartilhadas de esp?cies entre as ilhas ocorrem ao acaso ou encontram-se estruturadas, realizou-se uma an?lise de aninhamento com o aux?lio da m?trica NODF. O padr?o previsto foi confirmado e a perda de diversidade ? discutida em rela??o ? eventos clim?ticos do in?cio do Holoceno e ? disponibilidade de ambientes reprodutivos nas ilhas. Discute-se ainda como os resultados desse estudo podem servir para orientar programas de conserva??o de esp?cies de anf?bios anuros

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes

Cada capítulo da tese apresenta resumo e abstract. O resumo que segue é referente ao primeiro capítulo / Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Luís Olímpio Menta Giasson / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Resumo: Vocalizações são muito importantes para atração de fêmeas e delimitação de territórios em anuros de reprodução prolongada. Machos de Hypsiboas prasinus apresentam atividade de vocalização noturna ao longo de todo o ciclo anual na Serra do Japi, utilizando principalmente a vegetação marginal arbustiva e herbácea como sítios de vocalização. O padrão de atividade de vocalização dessa espécie foi acompanhado em um ciclo de 12 meses, de julho de 2011 a junho de 2012 e foram feitas gravações de suas vocalizações para análise bioacústica. Aqui são apresentados os parâmetros físicos de quatro das cinco vocalizações identificadas para esta espécie, sendo uma nota de anúncio introdutória (nota A), uma nota de anúncio utilizada em atividade de coro (nota B), uma nota de anúncio utilizada para retomada da atividade de vocalização (nota C) e uma nota agonística (nota D). Foi encontrada uma concentração de atividade de vocalização no mês de julho e não foi encontrada correlação significativa entre temperatura do ar e atividade de vocalização, sugerindo uma regulação da atividade baseada em interações comportamentais e não em limitações fisiológicas, conforme verificado por outros autores. Foi observado que alguns indivíduos passam a vocalizar a partir da superfície da água durante a estação fria e seca e aqui são discutidas as prováveis vantagens deste comportamento / Abstract: Vocalizations have great importance for female attraction and territory delimitation in prolonged breeding anurans. Males of Hypsiboas prasinus present a year-round nocturnal calling activity, using mainly marginal herbaceous and bushy vegetation as calling sites. The temporal pattern of calling activity was monitored for a twelve-month period, from July 2011 to June 2012 and vocalizations were recorded for bioacoustics analysis. Herein are shown physical parameters for four of the five types of vocalizations found in this species, being one introductory advertisement call (note A), one chorus advertisement call (note B), one resuming activity advertisement call (note C) and one agonistic call (note D). A significant activity concentration was found in July and there was no significant correlation between air temperature and calling activity, suggesting a behaviorally-controlled calling pattern instead of a physiologically-controlled one, as observed by previous authors. During the cold dry season, some individuals were observed to shift their calling sites to the water surface and the plausible advantages of such behavior are discussed / Mestre