En este trabajo de tesis, se presentan diversos estudios experimentales, desarrollados prin cipalmente en pez cebra pero también en ostra del Pacífico, que persiguen la puesta a punto de técnicas relevantes para la utilización de estas dos especies en el campo de la biomedicina, la toxicogenómica y la acuicultura como modelo experimental. En pez cebra, se han puesto a punto y testado: Técnicas de vitrificación de tejido de aleta caudal, de blastómeras (en microvolúmenes) y de tejido gonadal. Técnica de quimerismo de la línea germinal en estadio MBT, con una penalización previa por radiación ultravioleta de los embriones receptores. Técnica de quimerismo larvario (larvas de 48-72 h) utilizando como donantes células testiculares obtenidas de individuos adultos y previamente criopreservadas. Técnica de transplante nuclear utilizando como donantes núcleos de células somáticas adultas y larvarias. Técnica de electroactivación en medio iónico de oocitos de pez cebra. In ostra del Pacífico, se han puesto a punto y testado: Evaluación de los cambios estacionales en la calidad oocitaria y espermática en ostra del Pacífico. Técnica de electrofusión cigótica de cigotos obtenidos por fecundación in vitro en ostra del Pacífico. Técnicas de vitrificación de tejido de aleta caudal, de blastómeras (en microvolúmenes) y de tejido gonadal. En relación con este grupo de técnicas, señalar el diferente nivel de dificultad de cada una de ellas e incluso de los resultados alcanzados. Así, la vitrificación de tejido de la aleta caudal no ha supuesto problema adicional respecto a la aplicación de dicha técnica en los últimos años a tejidos epiteliales de cinco especies de mamíferos, lo que da idea de la versatilidad en el uso de dicha técnica de vitrificación básica. Por contra, la criopreservación de blastómeras ha supuesto un verdadero reto, ya que los patrones de permeabilidad celular en esta especie acuática es muy diferente a la característica en mamíferos. / Cardona Costa, J. (2010). EMBRYOLOGICAL AND MICROMANIPULATION TECHNIQUES IN ZEBRAFISH (Danio rerio) AND PACIFIC OYSTER (Crassostrea gigas) [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/8326 / Palancia

Los alojamientos ganaderos son una fuente importante de material particulado (“particulate matter”, PM) y bioaerosoles. Estas sustancias tienen un efecto perjudicial tanto para la salud humana y animal como para el medio ambiente. Para reducir los niveles de PM y bioaerosoles en alojamientos ganaderos es necesario conocer el origen de los mismos y los factores que afectan a su generación y suspensión en el aire. Esta Tesis Doctoral aborda aspectos relacionados con la concentración, origen y propiedades físicas, químicas y biológicas del PM en el aire de granjas de conejos y aves, su relación con los bioaerosoles patógenos y técnicas para reducirlos. Este trabajo pretende contribuir a paliar los efectos negativos de estas sustancias tanto en el interior de los alojamientos ganaderos como en el exterior. Los objetivos específicos planteados en la presente Tesis Doctoral fueron: i). caracterizar la morfología y la composición química del PM de distintos tamaños así como la concentración de bacterias en el aire de granjas de conejos, ii). cuantificar la concentración y emisión del PM de distintos tamaños en el aire e identificar las principales actividades que contribuyen a la generación del PM en granjas de conejos, iii). evaluar la distribución espacial de bacterias aerobias mesófilas en el aire durante un ciclo de producción de broilers y examinar su relación con la concentración y evolución del PM, iv). evaluar y comparar diferentes técnicas para muestrear y detectar el patógeno Salmonella spp. en el aire de granjas de broilers y v). evaluar la aplicación de desinfectantes en el aire como medida de reducción de los bioaerosoles en granjas de gallinas ponedoras con especial atención al patógeno Mycoplasma gallisepticum. Los resultados de esta Tesis indican que en los alojamientos avícolas y cunícolas se generan y emiten cantidades importantes de PM y bioaerosoles, por encima de los valores límite de exposición que marca la Directiva 2008/50/CE relativa a la calidad del aire ambiente y a una atmósfera más limpia en Europa, sobre todo en granjas de aves. Estas sustancias deben ser controladas y reducidas para proteger el medio ambiente, la salud y bienestar de las personas y animales. En alojamientos cunícolas, el PM mostró una morfología y composición química compleja, siendo las partículas irregulares y angulosas, ricas en S, Ca, Mg, Na y Cl, las más abundantes. La concentración de bacterias aerobias mesófilas en el aire por metro cúbico varió entre 3,1x103 y 1,6x106 unidades formadoras de colonia (UFC). Las principales fuentes generadoras de PM fueron la piel, el pienso y las heces provenientes de las actividades de limpieza de la nave, sobre todo de barrer y de los propios animales. La concentración media de PM10 (partículas de 10 μm de diámetro o inferior) fue 0,08±0,06 mg/m3 para conejos de cebo y 0,05±0,06 mg/m3 para conejas y la concentración media de PM2,5 (partículas de 2,5 μm de diámetro o inferior) fue 0,01±0,02 mg/m3 para conejos de cebo y 0,01±0,04 mg/m3 para conejas. Las emisiones variaron entre 6 y 15 mg/plaza/día para PM10 y entre 0,2 y 3,0 mg/plaza/día para PM2,5. En alojamientos de broilers, la concentración de bacterias varió entre 3,0 y 6,5 log UFC/m3. La mayoría de bacterias se asociaron con partículas entre 3,3 y más de 7,0 μm de diámetro obteniéndose una correlación positiva entre las concentraciones de PM10 y PM2,5 y las de bacterias. Respecto a la detección de patógenos en el aire, no se detectó Salmonella spp. cultivable en una explotación de broilers infectados experimentalmente mediante el uso de borboteadores de aire y técnicas de cultivo tradicional. No obstante, se detectó este patógeno en el aire mediante impactación y técnicas moleculares. Por lo tanto, no se recomienda el uso de borboteadores y técnicas de cultivo para la detección y/o cuantificación de Salmonella spp. cultivable en el aire. En alojamientos de gallinas, la concentración media de PM10 fue 0,55±0,38 mg/m3 y 0,02±0,03 mg/m3 para PM2,5. La concentración de bacterias varió entre 4,1 y 5,7 log UFC/m3. La aplicación de un desinfectante químico de amplio espectro en el aire no fue efectiva ni para reducir los niveles de bacterias aerobias mesófilas en el aire ni de Mycoplasma spp. Es necesario estudiar diferentes productos, dosis o técnicas de aplicación. En su conjunto, los resultados presentados en esta Tesis Doctoral proporcionan una información útil sobre el PM y los bioaerosoles en el aire de alojamientos ganaderos, que permitirá diseñar e implementar medidas de reducción prácticas y eficaces que mejoren la calidad del aire en los alojamientos ganaderos y reduzcan su emisión al exterior. / Adell Sales, E. (2014). Material particulado y bioaerosoles en el aire de granjas de aves y conejos: cuantificación, caracterización y medidas de reducción [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/44231 / TESIS

O Maracanã- verdadeiro é um psitacídeo vulnerável a extinção, por estar havendo redução de suas populações em diferentes partes de sua área de ocorrência. Foi realizada uma revisão sobre a distribuição, histórica e atual, e o estatus da espécie através de dados de espécimes de museus e literatura. Foram reunidos 176 registros de localização do maracanã e comparadas as distribuições histórica e atual. Constatou-se, principalmente, uma contração dos limites ao sul da distribuição histórica da espécie. Dessa maneira, foi avaliado se nessa região a ocorrência do maracanã está associada a características da composição e estrutura da vegetação. Dados de ocorrência atual da espécie foram relacionados com a localização geográfica e índices de paisagem de 54 localidades, através da análise de regressão logística. Verificou-se que o “total de cobertura vegetal da paisagem" foi a única característica de paisagem significativamente relacionada com a ocorrência do maracanã (p<0,01), porém o poder explicativo da variável foi baixo. A variável “latitude" também foi altamente significativa (p<0,001) e não foi relacionada com nenhuma das métricas de paisagem analisadas. Isso sugere a existência de um outro fator não avaliado, com estrutura espacial em clina latitudinal, que está afetando as populações meridionais do maracanã. Foi também estudado o padrão de ocorrência do maracanã em escala local, no entorno da Estação Ecológica de Caetetus (2178 ha). Essa reserva está imersa em um mosaico de paisagem constituído por pequenos remanescentes florestais que podem ser importantes para a conservação da espécie. Foram amostradas 36 destas áreas remanescentes, através do método de contagens em pontos estratégicos. Cada fragmento obteve um índice de visitas por maracanã que foram relacionados as suas características espaciais, através da análise de regressão linear. As características das paisagens no entorno dos remanescentes estudados explicaram mais a variação da freqüência de visitas pelo maracanã que as características dos próprios fragmentos. As visitas dos maracanãs foram diretamente relacionadas com a “distância do fragmento até a cidade mais próxima" (p<0,05) e o “tamanho do remanescente" (p<0,05), e inversamente relacionado a “distância mínima do fragmento até um dormitório conhecido de maracanã" (p<0,01) e “distância mínima do fragmento até a E.E. dos Caetetus" (p<0,05). Todas essas análises indicaram que a conservação da paisagem como um todo parece ser fundamental para manutenção de populações do maracanã, em escala local e regional. Porém deve-se levar em conta a área dos fragmentos e sua configuração espacial, investindo esforços para a conservação das áreas de dormitórios. / The blue-winged macaw is a vulnerable psittacidae, which has been suffering a rapid reduction of its populations in different parts of its occurrence. Thus, it was carried a detailed revision on the, historical and current, distribution and estatus of the species through using literature and specimens in museums data. We gathered 176 records of blue-winged macaw sites and compared its historical and current distributions. We verified a range contraction in the south limit of blue-winged macaw’s historical occurence. In this way, we evaluated if, in this zone, the blue-winged macaw’s occurrence is correlated to composition and structure of residual vegetation. The current occurrence of the species was related to geographic coordinates and landscape indices of 54 localities, through the logistic regression analysis. The "total of vegetal cover of the landscape" was the only feature of the landscape significantly related to blue-winged macaw’s occurrence (p<0,01), however its explicatory power was very low. The "latitude" was highly significant to predict blue-winged macaw’s occurrence (p<0,001), and also was not related to any analyzed landscape metric. This suggests the existence of another non-evaluated factor, with spatial structure highly related to latitude, affecting the southern populations of blue-winged macaw. Also we studied the occurrence pattern of blue-winged macaw in local scale, around of Caetetus Ecological Station (2178 ha). This reserve is placed in a mosaic of landscape, consisting of small remnants of native vegetation that may have some value to the specie’s maintenance. We sampled 36 of these remaining areas through the method of countings in advantage points. Each remnant got a "blue-winged macaw’s visit index" that was related to spatial remnants features and its surrounding landscape, through the linear regression model. The landscape features around of the fragments explained more the variation of the bluewinged macaw’s visit index than the features of the fragments itself. The "index of visits of maracanãs" was directly related to "distance to the closest city" (p<0,05) and to "remnant size" (p<0,05), and inversely related to "distance to the closest known roost of blue winged macaw " (p<0,01) and "shortest distance to the Caetetus Ecological Station" (p<0,05). All these analyses indicate that the conservation of the landscape as a whole seems to be critical for the maintenance of blue-winged macaw’s populations, in local and regional scale. However the size of the remnants and its spatial configuration must be taken in account, besides the efforts for the conservation of the roost sites.

Frente aos distúrbios que os ambientes aquáticos sofreram nas últimas décadas e os conseqüentes impactos causados sobre a ictiofauna, é cada vez mais relevante o entendimento da biologia e ecologia dos peixes nestes ecossistemas. O presente trabalho teve como objetivo relacionar a dieta do lambari Astyanax paranae em córregos de substrato e composição do corredor ripário distintos na bacia do rio Passa-Cinco (SP), verificando as diferenças existentes na alimentação da espécie, a origem dos itens alimentares, a disponibilidade de invertebrados e suas relações com a dieta da espécie. As coletas foram realizadas no período vespertino de fevereiro a abril de 2003. Para a captura dos peixes foram utilizados métodos combinados de pesca elétrica, rede de arrasto manual e peneiras. Para as amostragens dos invertebrados utilizou-se um amostrador tipo Surber, bandejas de retenção, redes de mão e deriva. Os conteúdos gástricos foram analisados através dos métodos de frequência de ocorrência e volumétrico. A espécie apresentou um amplo espectro alimentar. A categoria alimentar dominante foi representada por insetos terrestres, com maiores ocorrências para Formicidae (recursos alóctones). No Córrego Cantagalo, que apresenta a zona ripária constituída por pastagens, os insetos aquáticos foram a categoria alimentar mais representativa (recursos autóctones). Para medir a amplitude de nicho alimentar aplicou-se a medida de Levins e os maiores valores foram registrados nos córregos Paredão e Jibóia, indicando que A. paranae utilizou mais amplamente os recursos disponíveis nestes ambientes de mata ripária melhor preservada. A atividade alimentar deste lambari foi avaliada através do grau de repleção estomacal (GR). Os indivíduos analisados apresentaram conteúdos alimentares na maioria dos estômagos, confirmando seu período alimentar diurno. Para agrupar os locais de coleta com base na dieta de A. paranae, utilizou-se uma análise de correspondência e de agrupamento, que segregou os córregos onde a espécie consumiu mais insetos terrestres (córregos Paredão, Areião e Vereador), uma maior variedade de itens (Córrego Jibóia), algas (Córrego do Anzol) e insetos aquáticos (Córrego Cantagalo). A grande maioria dos invertebrados disponíveis nos riachos foram compostos por insetos em estágios imaturos e adultos, tanto de origem aquática quanto terrestre. Em todos os córregos amostrados, os invertebrados alóctones apresentaram maior diversidade e menor abundância em relação aos invertebrados autóctones, exceto no Córrego Vereador (zona ripária com mata alterada) onde a abundância foi maior. Para avaliar a seleção dos recursos por A. paranae utilizou-se o Índice de Eletividade de Ivlev. O recurso alóctone foi selecionado positivamente em todos os córregos pela espécie e apenas no Córrego Cantagalo houve consumo de itens autóctones na mesma proporção que a encontrada no ambiente. A espécie apresentou um hábito alimentar onívoro com tendência à insetivoria, sendo que a dieta foi influenciada pelas características geomórficas dos córregos e do corredor ripário. A presença da vegetação ripária foi importante para alimentação da espécie, demonstrada pelo maior consumo de recursos alóctones e também para a diversidade dos invertebrados. As condições de assoreamento não influenciaram na dieta devido a entrada dos recursos externos e, apesar da grande disponibilidade de recursos autóctones nos diversos córregos, A. paranae demonstrou preferência pelos itens alóctones. / Environmental disturbances of the last decades had major impact in fish fauna, turning the understanding of fish biology and ecology in aquatic ecosystems each time more relevant. This study analyses the diet of lambari Astyanax paranae in streams with different substrates and composition of the riparian corridor in the Passa-Cinco river basin (SP), regarding the relationship of local differences in species diet, origin of food items, and availability of invertebrates to the species diet. Fish were collected in the afternoon from February to April 2003, by either electrofishing or seining net. Surber sampler, forest litter trays half-filled with a soap solution, dip nets and drift nets were used for sampling invertebrates. Fish stomach contents were analyzed by the frequency of occurrence and volumetric methods. The species prsented a wide feeding spectrum. Terrestrial insects (mostly Formicidae) represented the most dominant feeding category. Aquatic insects were the most representative feeding category in the Cantagalo stream, which presented a riparian corridor covered with pasture. The Levins’s measure was used to evaluate niche breadth. The higher values were obtained in the Paredão and Jibóia streams, ecosystems characterized by pristine forest in the riparian corridor, eliciting better use of available resources by A. paranae. The feeding activity of the lambari was evaluated by the degree of stomach repletion (GR). Most individuals presented alimentary items in their stomachs, confirming a diurnal feeding habit. The analysis of cluster and correspondence were used to group study sites based on A. paranae feeding. These analysis segregated streams where the species consumed more terrestrial insects (Paredão, Jibóia, and Vereador streams), larger variety of items (Jibóia streams), algae (Anzol stream) and aquatic insects (Cantagalo stream). Immature and adult insects were the most available invertebrates in the streams. Allochthonous invertebrates presented higher diversity and lower abundance in relation to the autochthonous invertebrates in all systems, except in the Vereador stream, which presented a riparian corridor covered by anthropogenic forest. The resource selection by A. paranae was evaluated by Ivlev’s Electivity Index. Allochthonous resources were positively selected by the species in all streams but Cantagalo, where consumption of autochtonous and allochthonous resources were equal. The species presented an omnivorous feeding habit, tending to insectivorous. Feeding habits could be related both to geomorphic stream features and riparian corridor vegetation cover. The riparian vegetation was an important food source for the species, as demonstrated by the higher allochthonous resources consumption, and also by the invertebrates diversity. Streambed sand filling did not influenced species persistence, as it could rely on external resources input. A. paranae demonstrated preference by allochthonous food items besides the high availability of autochthonous resources.

Os ácaros são Arthropoda muito numerosos em diversos ambientes e substratos. No Brasil os ácaros de plantas cultivadas são relativamente bem conhecidos, porém pouco se conhece sobre os ácaros edáficos. Esse fato deve-se em parte ao restrito número de especialistas e de trabalhos que sintetizam as informações taxonômicas sobre estes. Há atualmente grande interesse na redução da utilização de agroquímicos para o controle de pragas agrícola, que é a maneira mais utilizada de controlá-las. Isto é função da preocupação com os efeitos ambientais e a resistência de pragas aos produtos utilizados, além do elevado custo dessa forma de controle. Todos estes fatores levaram à busca de novas táticas de controle de pragas, incluindo o uso de ácaros predadores. Ologamasidae e Rhodacaridae, já relatados em solos brasileiros como grupos freqüentes e abundantes, se alimentam de uma série de organismos edáficos, alguns dos quais são pragas potenciais em culturas; dentre estes estão os colêmbola, moscas da família Sciaridae, tripes, ácaros da família Acaridae e nematóides. Em todo mundo pouco se sabe sobre a biologia dos Rhodacaroidea. Os objetivos do presente trabalho foram: elaborar uma lista de informações taxonômicas de Ologamasidae do mundo; identificar espécies de Rhodacaroidea coletadas em solo e folhedo da Mata Atlântica e Cerrado do Estado de São Paulo; elaborar uma chave taxonomica para auxiliar na separação de gêneros e/ou espécies correspondentes àqueles ácaros; descrever algumas das espécies novas de Ologamasidae determinadas no presente estudo; estudar o potencial de 3 espécies de Rhodacaroidea comuns nos ambientes estudados como agentes de controle biológico de diferentes organismos edáficos. Foram realizadas buscas em bancos de dados para a detecção de referências taxonômicas sobre Ologamasidae, dispersas na literatura nacional e internacional. Com esse trabalho, criou-se uma base de informações taxonômicas sobre as espécies de Ologamasidae do mundo, o que permitiu a elaboração de uma lista de espécies de Ologamasidae. São citadas nesta lista 385 espécies válidas, distribuídas em 45 gêneros, dfos quais os mais abundantes são Gamasiphis com quase 16% do total das espécies válidas, seguido por Gamasellus e Geogamasus com metade desse percentual. Sete dos gêneros são monotípos. Vinte e cinco espécies, consideradas como Ologamasidae não puderam ser atribuídas a nenhum gênero, por serem insuficientes suas descrições (incertae sedis). Foram descritas 6 novas espécies. Foram estudados em laboratório aspectos biológicos de uma espécie ainda não descrita de Ologamasus (Ologamasidae), de Protrogamasellopsis dioscorus Manson e de Protogamasellopsis posnaniensis (Wisniewk e Hirschmann) (estas, Rhodacaridae), quando alimentados com o ácaro Astigmata Tyrophagus putrescentiae (Schrank). Considerando a freqüência com que Ologamasus sp. nova 1 tem sido encontrada no Estado de São Paulo, os resultados obtidos sugerem que em condições naturais este ácaro se alimente de outros organismos daqueles substratos, que não ácaros Astigmata. Entretanto, P. dioscorus e P. posnaniensis poderiam em condições naturais incluir aqueles ácaros em sua alimentação, como sugerido pelos parâmetros avaliados no presente estudo. / Mites are very numerous Arthropoda in diverse environments and substrates. In Brasil, mites of cultivated plants are relatively well known, but little is known about edaphic mites. This is partially due to the restrict number of specialists and of works that synthesize the taxonomic information on those mites. Presently, there is considerable interest in reducing the use of chemical products for the control of agricultural pests, presently the most common way of controlling them. This is a function of the growing preoccupation with the environmental effects, the acquisition of pest resistance to those chemicals and the high costs involved. All those factors led to the search for new control tactics, including the use of predatory mites. Ologamasidae and Rhodacaridae, already reported as frequent and abundant in Brazilian soils, feed on a series of edaphic organisms, some of which are potential pests; among these Collembola, Sciaridae flies, thrips, Acaridae mites and nematodes. In the whole world, little is known about the biology of Rhodacaroidea. The objectives of the present work were: to prepare a list of taxonomic information concerning the Ologamasidae of the world; to identify the species of Rhodacaroidea collected in soil and litter of \"Mata Atlantica\" and \"Cerrado\" vegetaions of the State of Sao Paulo; to prepare a taxonomic key to help in the separation of genera and species corresponding to those mites; to describe some of the new species of Ologamasidae determined in this study; to study the potential of 3 Rhodacaroidea species commonly found in the studied environments as biological control agents of different edaphic organisms. Searches were conducted in data bases to determine taxonomic references on Ologamasidae disperse in the Brazilian and international literature. With this work, a base on taxzonomic information was established for the world Ologamasidae. In this list, 385 valid species are mentioned, distributed in 45 genera, of which the most abundant are Gamasiphis, with almost 16% of the total number of valid species, followed by Gamasellus and Geogamasus, each with about half of that proportion. Seven of the genera are monotypic. Twenty-five species, considered as Ologamasidae could not be placed in genera because of the insufficient information provided in the descriptions of those species (Incertae sedis). Six new species were described. Aspect of the biology of an undescribed species of Ologamasus (Ologamasidae), of Protrogamasellopsis dioscorus Manson e of Protogamasellopsis posnaniensis (Wisniewk e Hirschmann) (both, Rhodacaridae) were studied in the laboratory, when offered the Astigmata mite Tyrophagus putrescentiae (Schrank) as prey. Considering the frequency with which the new species of Ologamaus has been found in the State of Sao Paulo, the results of this study suggest that in nature this mite does feeds on other organisms in those substrates, that Astigmata mites. However, P. dioscorus and P. posnaniensicould in nature include those mites in their diets, as suggested by the parameters evaluated in the present study.

A produção de aves no Brasil vem crescendo na ordem de 10% a cada ano, o que se explica pela atualização constante da tecnologia do setor (http://www.abef.com.br). Sendo a carne de frango a fonte de proteína animal mais barata e acessível ao consumidor, há necessidade de se produzir cada vez mais animais com maior acúmulo de massa muscular. Para isso, o entendimento dos mecanismos celulares e moleculares envolvidos na formação da musculatura esquelética é de extrema relevância. Os fatores miogênicos, genes responsáveis pela determinação e diferenciação de células musculares, foram clonados e progressos significativos foram desenvolvidos quanto ao controle da expressão dos mesmos. A utilização da técnica de seqüenciamento de DNA possibilita a identificação e caracterização de novos genes envolvidos na complexa rede de fatores que regulam a formação da musculatura esquelética em aves. Neste estudo, foram construídas duas bibliotecas de cDNA (fase embrionária e pós-eclosão) de músculo peitoral de uma linhagem de corte (TT) e uma biblioteca da fase embrionária de uma linhagem de postura (CC). A análise das seqüências EST (Expressed Sequence Tags) foi utilizada para identificar possíveis novos genes envolvidos no processo de formação da musculatura esquelética. As seqüências EST identificadas possibilitaram a construção de um banco com 6247 ESTs da musculatura peitoral das linhagens de corte e postura nas duas fases de desenvolvimento. Com o intuito de estabelecer uma relação entre o perfil de expressão dos fatores miogênicos: MyoD, MRF4 e miogenina; e dos genes Pax-3 e miostatina e a formação e maturação das fibras musculares, foi utilizada a técnica de PCR em tempo real. Em geral, a expressão dos fatores miogênicos foi maior na linhagem de corte em relação à de postura nas idades estudadas. Este estudo deverá contribuir para as áreas celular e molecular de desenvolvimento, além de fornecer recursos úteis aos programas de melhoramento genético de aves que visam obter animais com maior acúmulo de massa muscular. / Brazilian’s chicken production is increasing annually around 10%, which can be explained by the current technology applied to this sector (http://www.abef.com.br). Being chicken’s meat the cheapest animal protein source for consumers, there is a need to produce even more animals with increased muscular mass. For this purpose, understanding the molecular and cellular mechanisms involved with the skeletal muscle development is of great relevance. The myogenic factors, genes responsible for the determination and differentiation of muscle cells, were cloned and significant progress was made on the control of their expression. The use of DNA sequencing technique allows the identification and characterization of new genes involved in the complex chain of factors signalling systems that regulates the expression of avian skeletal muscles. In this study, two cDNA libraries (embryonic and post-hatching phases) were constructed from the breast muscle of a chicken broiler line (TT) and one library, from the embryonic phase, from a chicken layer line (CC). The EST (Expressed Sequencing Tags) analysis was used to identify probable new genes involved in the skeletal muscle development. The identified ESTs were used to generate a database containing 6247 breast muscle ESTs from two chicken lines in two development phases. Real time PCR was employed with the aim of establishing a relationship among the expression profile of myogenic factors (MyoD, MFR4, and myogenin), Pax-3 and myostatin genes with the formation and maturation of muscle fibers. In general, the expression of myogenic factors was greater in the broiler than in the layer chicken line in the phases under study. These results should contribute to other cellular and molecular development studies besides providing useful resources for chicken breeding programs whose objective is the deposition of skeletal muscle mass.

Os ácaros são Arthropoda muito numerosos em diversos ambientes e substratos. No Brasil os ácaros de plantas cultivadas são relativamente bem conhecidos, porém pouco se conhece sobre os ácaros edáficos. Esse fato deve-se em parte ao restrito número de especialistas e de trabalhos que sintetizam as informações taxonômicas sobre estes. Há atualmente grande interesse na redução da utilização de agroquímicos para o controle de pragas agrícola, que é a maneira mais utilizada de controlá-las. Isto é função da preocupação com os efeitos ambientais e a resistência de pragas aos produtos utilizados, além do elevado custo dessa forma de controle. Todos estes fatores levaram à busca de novas táticas de controle de pragas, incluindo o uso de ácaros predadores. Ologamasidae e Rhodacaridae, já relatados em solos brasileiros como grupos freqüentes e abundantes, se alimentam de uma série de organismos edáficos, alguns dos quais são pragas potenciais em culturas; dentre estes estão os colêmbola, moscas da família Sciaridae, tripes, ácaros da família Acaridae e nematóides. Em todo mundo pouco se sabe sobre a biologia dos Rhodacaroidea. Os objetivos do presente trabalho foram: elaborar uma lista de informações taxonômicas de Ologamasidae do mundo; identificar espécies de Rhodacaroidea coletadas em solo e folhedo da Mata Atlântica e Cerrado do Estado de São Paulo; elaborar uma chave taxonomica para auxiliar na separação de gêneros e/ou espécies correspondentes àqueles ácaros; descrever algumas das espécies novas de Ologamasidae determinadas no presente estudo; estudar o potencial de 3 espécies de Rhodacaroidea comuns nos ambientes estudados como agentes de controle biológico de diferentes organismos edáficos. Foram realizadas buscas em bancos de dados para a detecção de referências taxonômicas sobre Ologamasidae, dispersas na literatura nacional e internacional. Com esse trabalho, criou-se uma base de informações taxonômicas sobre as espécies de Ologamasidae do mundo, o que permitiu a elaboração de uma lista de espécies de Ologamasidae. São citadas nesta lista 385 espécies válidas, distribuídas em 45 gêneros, dfos quais os mais abundantes são Gamasiphis com quase 16% do total das espécies válidas, seguido por Gamasellus e Geogamasus com metade desse percentual. Sete dos gêneros são monotípos. Vinte e cinco espécies, consideradas como Ologamasidae não puderam ser atribuídas a nenhum gênero, por serem insuficientes suas descrições (incertae sedis). Foram descritas 6 novas espécies. Foram estudados em laboratório aspectos biológicos de uma espécie ainda não descrita de Ologamasus (Ologamasidae), de Protrogamasellopsis dioscorus Manson e de Protogamasellopsis posnaniensis (Wisniewk e Hirschmann) (estas, Rhodacaridae), quando alimentados com o ácaro Astigmata Tyrophagus putrescentiae (Schrank). Considerando a freqüência com que Ologamasus sp. nova 1 tem sido encontrada no Estado de São Paulo, os resultados obtidos sugerem que em condições naturais este ácaro se alimente de outros organismos daqueles substratos, que não ácaros Astigmata. Entretanto, P. dioscorus e P. posnaniensis poderiam em condições naturais incluir aqueles ácaros em sua alimentação, como sugerido pelos parâmetros avaliados no presente estudo. / Mites are very numerous Arthropoda in diverse environments and substrates. In Brasil, mites of cultivated plants are relatively well known, but little is known about edaphic mites. This is partially due to the restrict number of specialists and of works that synthesize the taxonomic information on those mites. Presently, there is considerable interest in reducing the use of chemical products for the control of agricultural pests, presently the most common way of controlling them. This is a function of the growing preoccupation with the environmental effects, the acquisition of pest resistance to those chemicals and the high costs involved. All those factors led to the search for new control tactics, including the use of predatory mites. Ologamasidae and Rhodacaridae, already reported as frequent and abundant in Brazilian soils, feed on a series of edaphic organisms, some of which are potential pests; among these Collembola, Sciaridae flies, thrips, Acaridae mites and nematodes. In the whole world, little is known about the biology of Rhodacaroidea. The objectives of the present work were: to prepare a list of taxonomic information concerning the Ologamasidae of the world; to identify the species of Rhodacaroidea collected in soil and litter of \"Mata Atlantica\" and \"Cerrado\" vegetaions of the State of Sao Paulo; to prepare a taxonomic key to help in the separation of genera and species corresponding to those mites; to describe some of the new species of Ologamasidae determined in this study; to study the potential of 3 Rhodacaroidea species commonly found in the studied environments as biological control agents of different edaphic organisms. Searches were conducted in data bases to determine taxonomic references on Ologamasidae disperse in the Brazilian and international literature. With this work, a base on taxzonomic information was established for the world Ologamasidae. In this list, 385 valid species are mentioned, distributed in 45 genera, of which the most abundant are Gamasiphis, with almost 16% of the total number of valid species, followed by Gamasellus and Geogamasus, each with about half of that proportion. Seven of the genera are monotypic. Twenty-five species, considered as Ologamasidae could not be placed in genera because of the insufficient information provided in the descriptions of those species (Incertae sedis). Six new species were described. Aspect of the biology of an undescribed species of Ologamasus (Ologamasidae), of Protrogamasellopsis dioscorus Manson e of Protogamasellopsis posnaniensis (Wisniewk e Hirschmann) (both, Rhodacaridae) were studied in the laboratory, when offered the Astigmata mite Tyrophagus putrescentiae (Schrank) as prey. Considering the frequency with which the new species of Ologamaus has been found in the State of Sao Paulo, the results of this study suggest that in nature this mite does feeds on other organisms in those substrates, that Astigmata mites. However, P. dioscorus and P. posnaniensicould in nature include those mites in their diets, as suggested by the parameters evaluated in the present study.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-03-03Bitstream added on 2014-06-13T18:50:03Z : No. of bitstreams: 1 ferreira_cp_me_sjrp.pdf: 2487707 bytes, checksum: 30210c5931074a08204d179f4552586f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de determinar a estrutura das comunidades de peixes em quatro trechos ao longo do Córrego da Água Limpa - uma micro-bacia foco de um plano de recuperação de matas ciliares no noroeste do Estado de São Paulo - e, a partir desse conjunto de dados, elaborar um índice de integridade biótica (IBI) local. Para cada trecho de 60 metros de extensão foram realizadas três amostragens na estação seca (julho, agosto e setembro/2004) e três na chuvosa (janeiro, fevereiro e março/2005). A análise da qualidade química da água mostrou condições boas nos quatro trechos, enquanto que a análise da integridade física do hábitat mostrou condições pobres para os trechos 2 e 3 e regulares para os trechos 1 e 4. Foram coletadas 27 espécies de peixes, totalizando 1.241 indivíduos e 5,1 kg. A estrutura quantitativa da ictiofauna demonstrou maior associação com a estrutura do hábitat do que com a sazonalidade visto que os trechos 1 e 2 foram agrupados separadamente dos trechos 3 e 4, independentemente do período de amostragem. De acordo com a análise de correspondência canônica, a elevada abundância de Gymnotus carapo nos trechos 1 e 2 esteve associada principalmente com a abundância de gramíneas nas margens. O maior volume de hábitat no trecho 3 explicou a abundância de Piabina argentea, e a predominância de substratos rochosos no trecho 4 explicaram a abundância de Hypostomus nigromaculatus. As comparações de atributos selecionados foram realizadas com base em cenários referência, seguindo uma abordagem sítio-específico em razão das particularidades de cada trecho. Houve pouca influência do esforço de amostragem e da sazonalidade nos valores finais do IBI. De modo geral, os trechos 1 e 4 apresentaram integridade biótica regular, o trecho 2 foi considerado pobre e o trecho 3, muito pobre... / The present study was conduced aiming to (i) determine the fish communities structure in four stretches of the Córrego da Água Limpa - a drainage included in a recovering plan of riparian vegetation in the northwest of the State of São Paulo - and, using this data set, (ii) to elaborate a local index of biotic integrity (IBI). For each stretch 60 meters long, three samplings were carried out during the dry season (July, August and September/2004) and three in the wet season (January, February and March/2005). Analysis of the chemical water quality showed good conditions in the four stretches, whereas analysis of the physical habitat integrity showed poor conditions for the stretches 2 and 3 and regular conditions for the stretches 1 and 4. Twenty-seven fish species were collected, for a total of 1,241 individuals and 5,1 kg. The quantitative assemblage structure demonstrated greater association with habitat structure than with seasonality, because stretches 1 and 2 were grouped separately from stretches 3 and 4, independently of the sampling period. Canonical correspondence analysis showed that the higher abundance of Gymnotus carapo in stretches 1 and 2 was explained by the abundance of riparian vegetation. The highest volume of habitat in stretch 3 explained the abundance of Piabina argentea, and the predominance of rocky substratum in stretch 4 explained the abundance of Hypostomus nigromaculatus. Comparisons of selected attributes were conduced based on reference sites, following a site-specific approach due to the particularities of each stretch. Sampling effort and seasonality had little influence on the final values of IBI. In general, stretches 1 and 4 presented regular biotic integrity; stretch 2 was considered poor and stretch 3... (Complete abstract, click electronic address below)

Frente aos distúrbios que os ambientes aquáticos sofreram nas últimas décadas e os conseqüentes impactos causados sobre a ictiofauna, é cada vez mais relevante o entendimento da biologia e ecologia dos peixes nestes ecossistemas. O presente trabalho teve como objetivo relacionar a dieta do lambari Astyanax paranae em córregos de substrato e composição do corredor ripário distintos na bacia do rio Passa-Cinco (SP), verificando as diferenças existentes na alimentação da espécie, a origem dos itens alimentares, a disponibilidade de invertebrados e suas relações com a dieta da espécie. As coletas foram realizadas no período vespertino de fevereiro a abril de 2003. Para a captura dos peixes foram utilizados métodos combinados de pesca elétrica, rede de arrasto manual e peneiras. Para as amostragens dos invertebrados utilizou-se um amostrador tipo Surber, bandejas de retenção, redes de mão e deriva. Os conteúdos gástricos foram analisados através dos métodos de frequência de ocorrência e volumétrico. A espécie apresentou um amplo espectro alimentar. A categoria alimentar dominante foi representada por insetos terrestres, com maiores ocorrências para Formicidae (recursos alóctones). No Córrego Cantagalo, que apresenta a zona ripária constituída por pastagens, os insetos aquáticos foram a categoria alimentar mais representativa (recursos autóctones). Para medir a amplitude de nicho alimentar aplicou-se a medida de Levins e os maiores valores foram registrados nos córregos Paredão e Jibóia, indicando que A. paranae utilizou mais amplamente os recursos disponíveis nestes ambientes de mata ripária melhor preservada. A atividade alimentar deste lambari foi avaliada através do grau de repleção estomacal (GR). Os indivíduos analisados apresentaram conteúdos alimentares na maioria dos estômagos, confirmando seu período alimentar diurno. Para agrupar os locais de coleta com base na dieta de A. paranae, utilizou-se uma análise de correspondência e de agrupamento, que segregou os córregos onde a espécie consumiu mais insetos terrestres (córregos Paredão, Areião e Vereador), uma maior variedade de itens (Córrego Jibóia), algas (Córrego do Anzol) e insetos aquáticos (Córrego Cantagalo). A grande maioria dos invertebrados disponíveis nos riachos foram compostos por insetos em estágios imaturos e adultos, tanto de origem aquática quanto terrestre. Em todos os córregos amostrados, os invertebrados alóctones apresentaram maior diversidade e menor abundância em relação aos invertebrados autóctones, exceto no Córrego Vereador (zona ripária com mata alterada) onde a abundância foi maior. Para avaliar a seleção dos recursos por A. paranae utilizou-se o Índice de Eletividade de Ivlev. O recurso alóctone foi selecionado positivamente em todos os córregos pela espécie e apenas no Córrego Cantagalo houve consumo de itens autóctones na mesma proporção que a encontrada no ambiente. A espécie apresentou um hábito alimentar onívoro com tendência à insetivoria, sendo que a dieta foi influenciada pelas características geomórficas dos córregos e do corredor ripário. A presença da vegetação ripária foi importante para alimentação da espécie, demonstrada pelo maior consumo de recursos alóctones e também para a diversidade dos invertebrados. As condições de assoreamento não influenciaram na dieta devido a entrada dos recursos externos e, apesar da grande disponibilidade de recursos autóctones nos diversos córregos, A. paranae demonstrou preferência pelos itens alóctones. / Environmental disturbances of the last decades had major impact in fish fauna, turning the understanding of fish biology and ecology in aquatic ecosystems each time more relevant. This study analyses the diet of lambari Astyanax paranae in streams with different substrates and composition of the riparian corridor in the Passa-Cinco river basin (SP), regarding the relationship of local differences in species diet, origin of food items, and availability of invertebrates to the species diet. Fish were collected in the afternoon from February to April 2003, by either electrofishing or seining net. Surber sampler, forest litter trays half-filled with a soap solution, dip nets and drift nets were used for sampling invertebrates. Fish stomach contents were analyzed by the frequency of occurrence and volumetric methods. The species prsented a wide feeding spectrum. Terrestrial insects (mostly Formicidae) represented the most dominant feeding category. Aquatic insects were the most representative feeding category in the Cantagalo stream, which presented a riparian corridor covered with pasture. The Levins’s measure was used to evaluate niche breadth. The higher values were obtained in the Paredão and Jibóia streams, ecosystems characterized by pristine forest in the riparian corridor, eliciting better use of available resources by A. paranae. The feeding activity of the lambari was evaluated by the degree of stomach repletion (GR). Most individuals presented alimentary items in their stomachs, confirming a diurnal feeding habit. The analysis of cluster and correspondence were used to group study sites based on A. paranae feeding. These analysis segregated streams where the species consumed more terrestrial insects (Paredão, Jibóia, and Vereador streams), larger variety of items (Jibóia streams), algae (Anzol stream) and aquatic insects (Cantagalo stream). Immature and adult insects were the most available invertebrates in the streams. Allochthonous invertebrates presented higher diversity and lower abundance in relation to the autochthonous invertebrates in all systems, except in the Vereador stream, which presented a riparian corridor covered by anthropogenic forest. The resource selection by A. paranae was evaluated by Ivlev’s Electivity Index. Allochthonous resources were positively selected by the species in all streams but Cantagalo, where consumption of autochtonous and allochthonous resources were equal. The species presented an omnivorous feeding habit, tending to insectivorous. Feeding habits could be related both to geomorphic stream features and riparian corridor vegetation cover. The riparian vegetation was an important food source for the species, as demonstrated by the higher allochthonous resources consumption, and also by the invertebrates diversity. Streambed sand filling did not influenced species persistence, as it could rely on external resources input. A. paranae demonstrated preference by allochthonous food items besides the high availability of autochthonous resources.

O Maracanã- verdadeiro é um psitacídeo vulnerável a extinção, por estar havendo redução de suas populações em diferentes partes de sua área de ocorrência. Foi realizada uma revisão sobre a distribuição, histórica e atual, e o estatus da espécie através de dados de espécimes de museus e literatura. Foram reunidos 176 registros de localização do maracanã e comparadas as distribuições histórica e atual. Constatou-se, principalmente, uma contração dos limites ao sul da distribuição histórica da espécie. Dessa maneira, foi avaliado se nessa região a ocorrência do maracanã está associada a características da composição e estrutura da vegetação. Dados de ocorrência atual da espécie foram relacionados com a localização geográfica e índices de paisagem de 54 localidades, através da análise de regressão logística. Verificou-se que o “total de cobertura vegetal da paisagem” foi a única característica de paisagem significativamente relacionada com a ocorrência do maracanã (p<0,01), porém o poder explicativo da variável foi baixo. A variável “latitude” também foi altamente significativa (p<0,001) e não foi relacionada com nenhuma das métricas de paisagem analisadas. Isso sugere a existência de um outro fator não avaliado, com estrutura espacial em clina latitudinal, que está afetando as populações meridionais do maracanã. Foi também estudado o padrão de ocorrência do maracanã em escala local, no entorno da Estação Ecológica de Caetetus (2178 ha). Essa reserva está imersa em um mosaico de paisagem constituído por pequenos remanescentes florestais que podem ser importantes para a conservação da espécie. Foram amostradas 36 destas áreas remanescentes, através do método de contagens em pontos estratégicos. Cada fragmento obteve um índice de visitas por maracanã que foram relacionados as suas características espaciais, através da análise de regressão linear. As características das paisagens no entorno dos remanescentes estudados explicaram mais a variação da freqüência de visitas pelo maracanã que as características dos próprios fragmentos. As visitas dos maracanãs foram diretamente relacionadas com a “distância do fragmento até a cidade mais próxima” (p<0,05) e o “tamanho do remanescente” (p<0,05), e inversamente relacionado a “distância mínima do fragmento até um dormitório conhecido de maracan㔠(p<0,01) e “distância mínima do fragmento até a E.E. dos Caetetus” (p<0,05). Todas essas análises indicaram que a conservação da paisagem como um todo parece ser fundamental para manutenção de populações do maracanã, em escala local e regional. Porém deve-se levar em conta a área dos fragmentos e sua configuração espacial, investindo esforços para a conservação das áreas de dormitórios. / The blue-winged macaw is a vulnerable psittacidae, which has been suffering a rapid reduction of its populations in different parts of its occurrence. Thus, it was carried a detailed revision on the, historical and current, distribution and estatus of the species through using literature and specimens in museums data. We gathered 176 records of blue-winged macaw sites and compared its historical and current distributions. We verified a range contraction in the south limit of blue-winged macaw’s historical occurence. In this way, we evaluated if, in this zone, the blue-winged macaw’s occurrence is correlated to composition and structure of residual vegetation. The current occurrence of the species was related to geographic coordinates and landscape indices of 54 localities, through the logistic regression analysis. The "total of vegetal cover of the landscape" was the only feature of the landscape significantly related to blue-winged macaw’s occurrence (p<0,01), however its explicatory power was very low. The "latitude" was highly significant to predict blue-winged macaw’s occurrence (p<0,001), and also was not related to any analyzed landscape metric. This suggests the existence of another non-evaluated factor, with spatial structure highly related to latitude, affecting the southern populations of blue-winged macaw. Also we studied the occurrence pattern of blue-winged macaw in local scale, around of Caetetus Ecological Station (2178 ha). This reserve is placed in a mosaic of landscape, consisting of small remnants of native vegetation that may have some value to the specie’s maintenance. We sampled 36 of these remaining areas through the method of countings in advantage points. Each remnant got a "blue-winged macaw’s visit index" that was related to spatial remnants features and its surrounding landscape, through the linear regression model. The landscape features around of the fragments explained more the variation of the bluewinged macaw’s visit index than the features of the fragments itself. The "index of visits of maracanãs" was directly related to "distance to the closest city" (p<0,05) and to "remnant size" (p<0,05), and inversely related to "distance to the closest known roost of blue winged macaw " (p<0,01) and "shortest distance to the Caetetus Ecological Station" (p<0,05). All these analyses indicate that the conservation of the landscape as a whole seems to be critical for the maintenance of blue-winged macaw’s populations, in local and regional scale. However the size of the remnants and its spatial configuration must be taken in account, besides the efforts for the conservation of the roost sites.