Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2017-06-22T12:29:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_marcelo_nogueira_do_amaral.pdf: 2321866 bytes, checksum: 813c57b5a855e4f2470433f907cc1a61 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-06-22T20:37:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_marcelo_nogueira_do_amaral.pdf: 2321866 bytes, checksum: 813c57b5a855e4f2470433f907cc1a61 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-22T20:37:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacao_marcelo_nogueira_do_amaral.pdf: 2321866 bytes, checksum: 813c57b5a855e4f2470433f907cc1a61 (MD5) Previous issue date: 2015-03-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O arroz (Oryza sativa L.) é o segundo cereal mais cultivado no mundo, sendo o Brasil o 9º maior produtor. Apesar dos bons níveis de produtividade, acredita-se que estes números sejam insuficientes para suprir o requerimento populacional no mundo, sendo necessário um aumento na produção. Entretanto, diversos estresses abióticos, como salinidade, toxidez por ferro e baixa temperatura, limitam a produtividade do arroz mundialmente. A resposta das plantas às condições estressantes é um fenômeno complexo, envolvendo alterações morfológicas, fisiológicas, bioquímicas e moleculares. Assim, o conhecimento do transcriptoma e análise fotossintética de plantas de arroz submetidas a estes estresses, pode auxiliar a elucidar quais vias metabólicas são alteradas e quais são as principais respostas bioquímicas e fisiológicas das plantas em tais condições. Desta forma, o objetivo desse trabalho foi analisar os genes diferencialmente expressos (DEGs), através da metodologia de RNA-Seq e quantificar as trocas gasosas em folhas de arroz (cv. BRS Querência), no estádio V3, submetidas aos estresses por frio, ferro e sal durante o período de 24 horas. Um intervalo entre 41 - 51 milhões de reads foram submetidas ao alinhamento, sendo que deste total um intervalo entre 88,47 - 89,21% foram mapeadas no genoma de referência. Foi observado 5.506 genes diferencialmente expressos para o estresse por frio, 1.808 para o sal e 630 para o ferro, sendo que 330 DEGs foram comuns aos três estresses. A anotação funcional através do software MapMan demonstrou que o estresse por frio promoveu maiores alterações no metabolismo em geral. O estresse salino apresentou uma rede de interação de termos de Ontologia Gênica (GOs) sobre-representados mais complexa que os demais estresses. Nos parâmetros de trocas gasosas, a taxa assimilatória liquida foi a única que apresentou diferença significativa, com o estresse por frio apresentando a menor média. A partir dos resultados obtidos foi possível concluir que o estresse por baixa temperatura apresenta um maior número de genes diferencialmente expressos e que há uma maior relação entre o estresse salino e por ferro. Além disso, o estresse por frio é o que afeta mais drasticamente a fotossíntese, tanto em nível molecular quanto fisiológico, e apesar de reduções na taxa assimilatória liquida, a cultivar BRS Querência demonstrou menores alterações nos estresses salino e por excesso de ferro. / Rice (Oryza sativa L.) is the second most cultivated cereal in the world; Brazil is the ninth biggest producer. Despite the high levels of productivity, it is believed that these numbers are insufficient to meet the population requirement in the world, demanding an increase in its production. However, various abiotic stresses, such as salinity, toxicity by iron and low temperature, limit the productivity of rice worldwide. The response of plants to stressful conditions is a complex phenomenon involving morphological, physiological, biochemical and molecular changes. Thus, the knowledge of the transcriptome and photosynthetic analysis of rice plants subjected to these stresses can help to elucidate which metabolic pathways are changed and what are the main biochemical and physiological responses of plants under such conditions. Thus, the objective of this study was to analyze the differentially expressed genes (DEGs), through the methodology of RNA-Seq and quantify gas exchanges in rice leaves (cv. BRS Querência) in V3 stage, under cold, iron and salt stress during 24 hours. A range from 41 to 51 million reads was submitted to alignment, in which a range from 88.47 to 89.21% has been mapped in the reference genome. 5,506 differentially expressed genes under cold stress were observed, as well as, 1,808 for salt and 630 for iron stress; 330 of them were similar to the three DEGs stresses. Functional annotation by MapMan software showed that, usually, cold stress promoted major changes in the metabolism. The saline stress presented a network of interaction of Gene Ontology terms (GOs) over-represented are more complex than the other stresses. In the parameters of gas exchange, the net assimilation rate was the only one significant difference, with stress by cold presenting the lowest average. From the results obtained it was possible to conclude that the low temperature stress has a greater number of differentially expressed genes and that there is a greater relationship between salt and iron stress. In addition, the cold stress is affecting more drastically photosynthesis, either in molecular-level and physiological, and despite reductions in net assimilation rate, BRS Querência showed minor changes in the salt stress and excess iron.

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2017-06-23T12:49:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_isabel_lopes_vighi.pdf: 2167536 bytes, checksum: ac573c14d5ef3a4795a4bf594d60bd85 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-06-23T22:08:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_isabel_lopes_vighi.pdf: 2167536 bytes, checksum: ac573c14d5ef3a4795a4bf594d60bd85 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-23T22:08:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_isabel_lopes_vighi.pdf: 2167536 bytes, checksum: ac573c14d5ef3a4795a4bf594d60bd85 (MD5) Previous issue date: 2016-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O arroz (Oryza sativa L.) é o segundo cereal mais cultivado no mundo, sendo o Brasil o 9º maior produtor. No entanto sua produção é severamente influenciada por condições ambientais adversas, dentre as quais se destaca a salinidade e baixas temperaturas. O objetivo deste estudo foi avaliar respostas, bioquímicas e moleculares desencadeadas pela salinidade e por baixas temperaturas em plantas de arroz, com respostas contrastantes. Para atingir este objetivo foram realizados três estudos: No primeiro, foram quantificados os teores do ânion Superóxido (O2•−), Peróxido de hidrogênio (H2O2), Peroxidação lipídica (MDA), atividade enzimática e expressão gênica diferencial das isoformas das enzimas Superóxido dismutase (SOD), Catalase (CAT), Ascorbato peroxidase APX e Glutationa reduzida (GR) em genótipos com tolerância contrastante ao sal. Para o genótipo sensível (BRS Pampa), ocorreu aumento na atividade enzimática da SOD, CAT, APX e diminuição nos níveis de MDA. No genótipo tolerante (BRS Bojuru), também foi observado aumento da atividade das enzimas SOD e CAT, porém diminuição nos níveis de MDA. A regulação positiva das diferentes isoformas da SOD, CAT e APX demonstrou a sua contribuição para o aumento na atividade da enzima. No segundo estudo, foram quantificados os teores de H2O2, MDA, atividade enzimática e expressão gênica da CAT, bem como análise do promotor e cis elementos, nos mesmos dois genótipos contrastantes frente ao estresse por salinidade e baixa temperatura. O genótipo BRS Pampa (sensível) foi o que mostrou maior proteção contra danos oxidativos frente ao estresse por frio, bem como aumento na atividade da CAT e do número de transcritos das isoformas OSCATA e OSCATB. No terceiro estudo, avaliou-se o metabolismo da prolina em plantas de arroz, através do padrão de expressão dos genes envolvidos na biossíntese e catabolismo desse aminoácido e verificou-se a correlação com o conteúdo de prolina produzido em condições de estresse por salinidade e baixa temperatura. O conteúdo de prolina foi maior no genótipo BRS Bojuru (tolerante) frente às duas condições de estresse testadas. Sob estresse salino, os níveis de transcritos dos genes de biossíntese estão mais correlacionados com o conteúdo de prolina no genótipo tolerante, enquanto que em condições de baixa temperatura a correlação é maior no genótipo sensível. Os resultados obtidos permitem concluir que, sob estresse salino e por baixa temperatura, as plantas de arroz apresentam respostas diferenciais a nível bioquímico e molecular, sendo estas respostas dependentes do tempo, intensidade do estresse e composição genética dos genótipos. / Rice (Oryza sativa L.) is the second most cultivated cereal in the world, and Brazil is the 9th largest producer. However production is severely affected by adverse environmental conditions, among which the mains ones are the salinity and low temperatures. The aim of this study was to evaluate responses, biochemical and molecular triggered by salinity and low temperatures in rice plants with contrasting response. To achieve this goal there were three studies: In the first one, the anion content superoxide (O2•-) were quantified, hydrogen peroxide (H2O2), lipid peroxidation (MDA), enzyme activity and differential gene expression of isoforms of the enzyme superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), ascorbate peroxidase APX and reduced glutathione (GR) in genotypes with contrasting tolerance to salt. For the sensitive genotype (BRS Pampa), there was an increase in the enzymatic activity of SOD, CAT, APX and a decrease in MDA levels. In tolerant genotype (BRS Bojuru) was also observed an increased activity of enzymes SOD and CAT, but a decrease in MDA levels. The upregulation of the different isoforms of SOD, CAT and APX has demonstrated its contribution to the increase in the enzyme activity. In the second study, H2O2 levels were quantified, MDA, enzyme activity and gene expression of CAT, and promoter analysis and cis-elements, the same two contrasting genotypes against salinity stress and low temperature. The BRS Pampa genotype (sensitive) was the one that showed greater protection against oxidative damage compared to the stress by cold, as well as an increase in CAT activity and the number of transcripts OSCATA and OSCATB isoforms. In the third study evaluated the metabolism of proline in rice plants through the expression pattern of genes involved in biosynthesis and catabolism of amino-acid and was found to correlate with the proline content produced under stress by salinity and low temperature. The proline content was higher in BRS Bojuru genotype (tolerant) against the two tested stress conditions. Under salt stress, the biosynthesis gene transcript levels are more correlated with the proline content in tolerant genotype, whereas in low temperature conditions the correlation is highest in sensitive genotype. The results showed that under salt stress and low temperature, the rice plants have differential responses to biochemical and molecular level, which are dependent responses of time, stress intensity and genetic makeup of the genotypes.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:36:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 623531 bytes, checksum: 3e10a939648d01ae404b0a09438fda4c (MD5) Previous issue date: 2007-08-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The high acidity, the intense intemperism, and high aluminum content are limiting factors to plant development in Brazilian Cerrado Upon abiotic stress conditions the association with mycorrhizal fungi can assist the host plant in absorbing nutrients and water from soil. The high availability of these elements to the host plant improved by arbusculares mycorrhizal fungi (AMF) is determinant in plant survival and structuring of plant ecosystems. The presence of dark septate entophytic fungi in plant roots is another type of symbiotic association related to abiotic conditions such as low humid and day length. The reduced number of publications about these associationsin cerrado species is mainly a function of edaphic conditions and root structural characteristics of native species which difficult the in loco studies of these characters. In this work, it was aimed to study the association between AMF and cerrado native species. It was evaluated and adapted methods for fungal structures observation in symbiosis with Annonaceae, Anacardiaceae, Leguminosae, Melastomataceae, Myrsinaceae, Myrtaceae and Rubiaceae families, which were collected during dry season on senso strictu Cerrado in Floresta Nacional (FLONA) in the municipal district of Paraopeba, Minas Gerais State. Root samples were submitted to three protocols for fungal structures observationg. All evaluated species were colonized by AMF and dark septate fungi, except Xylopia aromatica, which not presented dark septate strutctures. The best diaphanization procedure was obtained when the root samples were autoclaved at 121ºC by 20 minutes in a 2% KOH solution and transferred to a 2% KOH solution by 24 hours at room temperature. This procedure was repeated twice and, after that, the samples were submerged in a 2% KOH solution for 2 hours. The arbuscules were observed with more detail after been included in resin, sectioned and stained with toluidine blue. The non-specific characteristic of AMF observed in sensu stricto Cerrado species was confirmed and suggested for dark septate associations. It indicates that these associations were important as adaptive strategies to cerrado conditions. Roupala montana Aubl. is a species from Proteaceae family which presents a large distribution on different phytophysiognomies of cerrado. Recent studies have been showed that several mycorrhizal fungi structures occurred in these species said to be typically non- mycorrhizal. The low pH and nutrients deficiency in cerrado soils propitiate good conditions for development and establishment of mycorrhizal association in R. montana, as observed in other Proteaceae species. Therefore, in this work it was also aimed to confirm the presence of AMF in R. montana specimens growing at natural cerrado conditions, and correlated the mycorrhizal frequency with nutritional status and edaphic conditions. Three individuals of R. montana were collected in FLONA on cerrado senso strictu, dense cerrado senso strictu, and cerradão during dry and rain seasons. The mycorrhizal occurrence was positively correlated with P, Al, and Mg contents in the soil, and P, K, and Ca in the leaves, and negatively correlated with Ca, Mn, and N contents in the soil. The cerrado soils are acid and have high Al contents which can inhibit the transport of Ca and K to the plants. In this way, the presence of mycorrhizal fungi in R. montana could be a adaptive mechanism for plant surviving under Brazilian cerrado conditions. / A elevada acidez, o intenso intemperismo e os altos teores de alumínio nos solos do Cerrado são fatores limitantes do desenvolvimento vegetal. Em condições de estresses abióticos a associação com fungos micorrízicos auxilia a planta hospedeira na absorção de nutrientes e água do solo. A maior disponibilidades desses elementos para a planta hospedeira pelos fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) é determinante na sobrevivência das plantas e na estruturação de formações vegetais. A presença de fungo endofítico do tipo dark septate (DSEF) nas raízes das plantas é outro tipo de associação simbiótica relacionada às condições abióticas como baixa umidade e comprimento do dia. O reduzido número de trabalhos encontrados na literatura dessas associações em espécies de cerrado se deve em parte, pelas condições edáficas e características estruturais radiculares das espécies nativas que dificultam a realização de estudos in loco. Neste trabalho teve-se por objetivo estudar a associação de FMAs em espécies de plantas nativas do cerrado. Para isso, foram testados e adaptados métodos para observação das estruturas fúngicas em simbiose em espécies das famílias Annonaceae, Anacardiaceae, Leguminosae, Melastomataceae, Myrsinaceae, Myrtaceae e Rubiaceae coletadas durante a estação seca em cerrado senso strictu na Floresta Nacional (FLONA) do município de Paraopeba, Minas Gerais. Amostras radiculares foram submetidas a três tipos de protocolos para observação de estruturas fúngicas. Todas as espécies investigadas encontravam-se colonizadas por FMAs e DSEF, exceto DSEF em Xylopia aromática. O melhor método de diafanização foi observado quando as raízes foram autoclavadas a 121 °C em KOH 2 %, por 20 min e, subseqüentemente transferidas para solução nova de KOH 2 % por 24 horas à temperatura ambiente. Este procedimento foi repetido por duas vezes e, em seguida, essas amostras foram imersas em H2O2 2 % por 2 horas. Os arbúsculos foram observados com maiores detalhes após as raízes serem incluídas em resina, seccionadas e coradas com azul de toluidina. O caráter generalista dos FMAs observado nas espécies vegetais do cerrado sensu stricto foi confirmado e sugerido para DSEFs, indicando a importância destas simbioses como estratégia adaptativa às condições de cerrado. Roupala montana Aubl. é uma espécie da família Proteaceae com ampla distribuição nas diferentes fitofisionomias do cerrado. Estudos recentes têm relatado estruturas típicas de fungos micorrízicos em condições de estresses abióticos em espécies dessa família tipicamente não micorrizável. A acidez e deficiência dos solos de cerrado provem apropriadas condições para o desenvolvimento e formação de associações micorrízicas em R. montana, como observado em outros espécies da família Proteaceae. Assim, este trabalho também teve por objetivo confirmar a presença de fungos micorrízicos arbusculares em R. montana crescidas naturalmente em cerrado, correlacionando a freqüência de micorrização com o estado nutricional e condições edáficas. Em três repetições, indivíduos de R. montana foram coletados na FLONA em cerrado senso strictu, cerrado senso strictu denso e cerradão nas estações seca e chuvosa. A micorrização em R. montana foi correlacionada positivamente com o teor de P, Al, e Mg, no solo e de P, K e Ca nas folhas, e negativamente com Ca, Mn e N no solo. Os solos de Cerrado são ácidos com altas concentrações de Al, os quais podem inibir o transporte de Ca e K para as plantas, sugerindo que a presença de fungos micorrízicos em R. montana é um mecanismo adaptativo de sobrevivência as condições do cerrado brasileiro.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:36:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 891731 bytes, checksum: f01a81cec277f616c4c03d6ff835d6ca (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The toxicity of arsenic (As) and its effects on antioxidant system were analyzed in S. intermedia. Plants treated in nutrient solution, pH 6.5, were exposed to increasing concentrations of As over a period of 24 hours. The objectives of this study were to evaluate the effects of toxic levels of As on production of reactive oxygen species (ROS), the antioxidative system and root external morphology. The increasing concentration of As was accompanied by higher production of reactive oxygen species and lipid peroxidation. There was a linear augmentation in the amount of superoxide anion and an increase in amount of hydrogen peroxide up to a concentration of 1.0 mg L-1 As. Augmentation in the amount of anthocyanins and higher activity of the enzymes superoxide dismutase (SOD), peroxidase ( POX), ascorbato peroxidase (APX), glutathione peroxidase (GPX) and glutathione reductase (GR) was also observed. In contrast, there was a slight decay in catalase activity. Despite the reduction in the concentration of hydrogen peroxide in higher concentrations of As, the activity of antioxidant enzymes was not enough to buffer the damage, since the concentration of superoxide anion and MDA increased linearly with the increase of As. In a second experiment, nitric oxide (NO) was supplied as sodium nitroprusside (SNP). Plants treated in nutrient solution, pH 6.5, ½ ion force, were subjected to four conditions: control (nutrient solution); SNP (15 mg L-1); As (2.0 mg L-1); As + SNP (2.0 and 15 mg L-1, respectively) over a period of 24 hours. It was evaluated the influence of nitric oxide (NO) on membrane damage and activity of antioxidant enzymes and NO production enzyme. In situ fluorescence detection was used to reveal NO presence. There was an increase in MDA content, membrane leakage, activity of antioxidative enzymes and nitrate reductase comparing 2.0 mg L-1 As conditions with As + SNP treatment. Therefore, it is considered that the protective effect of the application of SNP appears reflects direct reaction of NO with ROS. The plants under arsenic stress showed higher NO production, confirmed by the increase in nitrate reductase activity and augmentation in fluorescence levels. When provided exogenously, NO also acted directly in the removal of toxic metabolites generated in response to As. Therefore, it was found that NO, supplied by SNP, buffers As toxicity in S. intermedia. / A toxicidade do arsênio (As) e seus efeitos no sistema antioxidante enzimático e não enzimático foram analisados em Spirodela intermedia. As plantas, cultivadas em solução nutritiva, pH 6,5, foram expostas a concentrações crescentes de As por 24 horas. Os objetivos deste estudo foram avaliar os efeitos de níveis tóxicos de As sobre a produção de espécies reativas de oxigênio (EROs), o sistema antioxidante enzimático e não enzimático e a morfologia externa das raízes. O acréscimo na concentração de As nas plantas desencadeou danos como aumento na produção de espécies reativas de oxigênio e peroxidação lipídica. Houve aumento linear do ânion superóxido, porém o peróxido de hidrogênio aumentou somente até a concentração de 1,0 mg L-1 de As. Também foi observado incremento no teor de antocianinas e na atividade das enzimas dismutase do superóxido (SOD), peroxidase (POX), peroxidase do ascorbato (APX), peroxidase da glutationa (GPX) e redutase da glutationa (GR). Em contraste, houve pequena queda na atividade da enzima catalase. Foi visualizado alterações micromorfológicas na coifa da raiz. Apesar da redução no teor de peróxido de hidrogênio nas concentrações mais elevadas, a atividade das enzimas antioxidantes não foi suficiente para amenizar os danos, uma vez que a concentração do ânion superóxido e de MDA aumentou linearmente com o acréscimo de As. As alterações micromorfológicas visualizadas na coifa da raiz, provavelmente foram decorrentes do aumento de EROs e consequente aumento da peroxidação lipídica. Em um segundo experimento, óxido nítrico (NO) foi suprido na forma de nitroprussiato de sódio (SNP). As plantas, cultivadas em solução nutritiva, pH 6,5, ½ força iônica, foram expostas a quatro tratamentos, sendo eles controle e As com e sem SNP, permanecendo nessas condições por 24 horas. Avaliou-se a influência do óxido nítrico (NO) sobre o dano de membrana e a atividade das enzimas antioxidativas e produtora de NO. Realizou-se também a detecção de fluorescência in situ desencadeada por NO. Houve aumento no teor de MDA, extravasamento de eletrólitos, enzimas antioxidativas e redutase do nitrato ao comparar o tratamento As (2,0 mg L-1) com As na presença de SNP. Sendo assim, considera-se que o efeito protetor da aplicação de SNP parece ser resultado da reação direta do NO com os EROs. Nas plantas submetidas ao estresse por As, observou-se maior produção de NO, resultado comprovado pela redutase do nitrato e pelo aumento na fluorescência. Quando fornecido na forma exógena, o NO também agiu diretamente na remoção de metabólitos tóxicos gerados em resposta ao As. Assim, verificou-se que o NO, fornecido pelo SNP, ameniza a toxicidade do As sobre o metabolismo de S. intermedia.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:36:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 381629 bytes, checksum: ba2d77de1fafa6029bbd57e8ee35252d (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / Blast, caused by the fungus Pyricularia oryzae, has become an economically important disease in wheat. The objective of this study was to determine the effect of silicon (Si) on the photosynthetic gas exchange parameters (net CO 2 assimilation rate (A), stomatal conductance to water vapor (g s ), internal CO 2 concentration (C i ), and transpiration rate (E)) and chlorophyll fluorescence parameters (maximum quantum quenching (F v /F m and F v '/F m '), photochemical (q P ) and nonphotochemical (NPQ) quenching coefficients and electron transport rate (ETR)) in wheat plants grown in a nutrient solution containing 0 (-Si) or 2 mM Si (+Si) and inoculated with P. oryzae. The leaf Si concentration significantly increased for the +Si plants compared to the - Si plants and contributed to a decrease in the severity of blast symptoms. For the inoculated +Si plants, A was significantly higher at 72 (14%), 96 (12%) and 120 (58%) hours after inoculation (hai) when compared with their inoculated -Si counterparts. The g s and E were significantly higher by 60 and 42% at 120 hai for the inoculated +Si plants compared with the inoculated -Si plants, respectively. Significant differences between non-inoculated and inoculated plants were observed from 48 to 120 hai for A, g s and E and from 48 to 96 hai for C i . For the inoculated +Si plants, significant differences of F v /F m between the -Si and +Si treatments occurred at 48, 96 and 120 hai and at 72, 96 and 120 hai of F v '/F m '. The values of F v /F m significantly decreased by 1, 3 and 5% at 48, 96 and 120 hai, respectively, in the -Si plants compared with the +Si plants. Significant decreases of 10, 11 and 22% at 72, 96 and 120 hai, respectively, were observed for F v '/F m ' in the -Si plants when compared with the +Si plants. Significant differences between the non-inoculated and inoculated plants occurred from 48 to 120 hai for F v /F m and F v '/F m ', respectively. For the inoculated plants, significant differences between the -Si and +Si treatments occurred at 96 hai for both q P and NPQ and 72 and 120 hai for ETR. Significant differences between the non-inoculated and inoculated plants occurred at 120 hai for q P and at 96 and 120 hai for ETR. The total chlorophyll content (a + b) and the chlorophyll a/b ratio significantly decreased for the -Si plants compared with the +Si plants. The results of this study clearly demonstrate that the severity of blast symptoms decreased in wheat plants supplied with Si. These plants also exhibited improved gas exchange performance and less dysfunctions at the photochemical level. / A brusone, causada pelo fungo Pyricularia oryzae, tornou-se uma doença economicamente importante no trigo. Este estudo teve como objetivo determinar o efeito do silício (Si) sobre os parâmetros das trocas gasosas (taxa de assimilação líquida de CO 2 (A), condutância estomática ao vapor de água (g s ), a concentração interna de CO 2 (C i ) e taxa de transpiração (E)) e parâmetros de fluorescência da clorofila (eficiencia quântica máxima do fotosistema II (F v /F m e F v '/F m '), fotoquímica (q P ) e coeficiente de extinção não-fotoquimico (NPQ) e a taxa de transporte de eletrons (TTE)) em plantas de trigo crescendas em recipiente com solução nutritiva contendo 0 ou 2 mM de silício (Si) e inoculadas com P. oryzae. A concentração foliar de Si incrementou-se significativamente para plantas, contribuindo à dismunição da severidade da brusone. Para plantas inoculadas com +Si, A foi significativamente maior a 72 (14%), 96 (12%) e 120 (58%) hai do que em suas contrapartes inoculadas. A g s e E foram significativamente maiores em 60 e 42%, respectivamente, às 120 hai para as plantas inoculadas +Si em comparação com as plantas inoculadas -Si. Diferenças significativas entre as plantas inoculadas e não inoculadas ocorreu entre as 48 a 120 hai para A, g s e E e entre as 48 a 96 hai para C i . Para as plantas inoculadas +Si, diferenças significativas para F v /F m entre os tratamentos Si e +Si foram encontradas às 48, 96 e 120 dai e às 72, 96 e 120 hai para F v '/ F m '. Os valores de F v /F m diminuiram significativamente em 1, 3 e 5%, respectivamente, aos 48, 96 e 120 hai para plantas -Si, em comparação com as plantas de +Si. Reduções significativas de 10, 11 e 22%, respectivamente, às 72, 96 e 120 hai para F v '/F m ' ocorreu para as plantas -Si, em comparação com as plantas +Si. Diferenças significativas entre as plantas inoculadas e não inoculadas ocorreu às 48 a 120 hai para F v /F m e F v '/F m '. Para as plantas inoculadas, diferenças significativas entre os tratamentos -Si e +Si ocorreu apenas às 96 hai para ambos q P e NPQ e às 72 e 120 hai para TTE. Diferenças significativas entre as plantas inoculadas e não inoculadas só ocorreu em 120 hai para q P e às 96 e 120 hai para TTE. A concentração de clorofila total (a + b), e a razão de clorofil a/b diminuiu significativamente para as plantas -Si, em comparação com as plantas de +Si. Os resultados deste estudo demonstraram claramente que a severidade da brusone diminuiu em plantas de trigo supridas com Si em paralelo a um melhor desempenho das trocas gasosas e menores perdas disfuncionais ao nível fotoquímico.

CAPES; Fundação Araucária / O controle biológico e a adição de matéria orgânica ao solo representam as principais alternativas para o controle do nematoide-de-galhas. Os objetivos deste estudo foram avaliar o efeito do subproduto sólido da indústria vinícola (SSIV) sobre o desenvolvimento, in vitro, de Pochonia chlamydosporia e o efeito da associação do SSIV a esse fungo no manejo de Meloidogyne javanica em tomateiros, em casa de vegetação. Para avaliar o efeito direto do SSIV sobre o desenvolvimento do fungo, adicionaram-se as concentrações (0; 5; 10; e 15%) do extrato aquoso do SSIV em meio de cultivo batata-dextrose-ágar (BDA) fundente. Em seguida, a mistura foi vertida em placas de Petri e um disco de meio de cultivo ‘Corn Meal Ágar’ (CMA) colonizado pelo fungo foi colocado no centro de cada placa. Em outro estudo avaliou-se o efeito dos compostos voláteis do SSIV sobre o desenvolvimento de P. chlamydosporia. Para isto, utilizaram-se placas de Petri bipartidas, adicionando em um dos compartimentos as concentrações do SSIV (0,000; 0,065; 0,125; 0,250; e 0,500 g placa-1) e 2 mL de água destilada esterilizada placa-1. No centro do outro compartimento contendo meio de cultivo BDA, adicionou-se um disco de meio de cultivo CMA colonizado pelo fungo. As placas dos dois estudos foram armazenadas em câmara de crescimento, no escuro, a 21°C. Os dois estudos foram realizados duas vezes. Após 14 dias avaliaram-se o diâmetro das colônias e a produção de conídios do fungo. O SSIV reduziu de 9 a 21% o crescimento do fungo nos dois estudos, bem como reduziu a produção de conídios no primeiro estudo. Em casa de vegetação, avaliou-se a associação do SSIV (30 g kg-1 de substrato) às concentrações de P. chlamydosporia com clamidósporos (500; 1.500; 2.500; 3.500; 4.500; e 5.000 clamidósporos g-1 de substrato) ou sem clamidósporos (2,5; 5; 10; e 15 g de inóculo do fungo kg-1 de substrato). Três tratamentos foram utilizados como controle em cada ensaio: adição de P. chlamydosporia (5.000 clamidósporos g-1 de substrato ou 15 g de inóculo do fungo kg-1 de substrato), adição de SSIV (30 g do SSIV kg-1 de substrato) e apenas o substrato. Em seguida, cada saco contendo 4 kg de substrato esterilizado e os respectivos tratamentos foi infestado com 6.000 ovos de M. javanica kg-1 de substrato, homogeneizado e umedecido até 60% de capacidade de campo e armazenado por 14 dias no escuro, a 25 ºC. Depois, o substrato foi transferido para vasos de polipropileno de 500 mL, e uma muda de tomateiro foi transplantada para cada vaso. Após 60 dias foram avaliados a altura, a massa da parte aérea e das raízes frescas e o número de galhas e de ovos do nematoide. A associação do SSIV ao fungo, independentemente do tipo de inóculo do fungo, potencializou o desenvolvimento dos tomateiros e o controle do nematoide. As concentrações mais indicadas do fungo para se associar ao SSIV foram 3.500 clamidósporos g-1 de substrato e 15 g do inóculo sem clamidósporos kg-1 de substrato, pois, além de controlarem efetivamente o nematoide, também proporcionaram o desenvolvimento dos tomateiros. Conclui-se que a associação do SSIV ao fungo P. chlamydosporia potencializa o manejo do nematoide-de-galhas. / The biological control and the addition of organic matter to the soil represent the main alternatives for the control of root-knot nematode. The objectives of this study were to evaluate the effect of solid wine industry by-product (SSIV) on the development, in vitro, of Pochonia chlamydosporia and the effect of combining this fungus with the SSIV on the management of Meloidogyne javanica in tomatoes grown in a greenhouse. To evaluate the direct effect of the SSIV on fungal development, concentrations (0, 5, 10, and 15%) of the aqueous SSIV extract were applied to potato-dextrose-agar (BDA) culture medium. The mixture was then poured into Petri dishes and a disk of 'Corn Meal Agar' (CMA) culture medium colonized by the fungus was placed in the centre of each plate. A further study evaluated the effect of volatile SSIV compounds on the development of P. chlamydosporia. For this, twopart Petri dishes were utilised, to one of the compartments the concentrations of SSIV (0.000, 0.065, 0.125, 0.250, and 0.500 g plate-1) and 2 mL plate-1 sterile distilled water were added. To the other compartment, which contained BDA culture medium, a disc of CMA culture medium colonised by the fungus was added in the centre. The plates from the two studies were stored in a growth chamber in the dark at 21 °C. The two studies were performed twice. After 14 days, the diameter of the colonies and the production of fungal conidia were evaluated. The SSIV reduced fungal growth by 9 to 21% in the two studies, and reduced conidia production in the first study. In the greenhouse, the combination of SSIV (30 g kg-1 of substrate) with the concentrations of P. chlamydosporia with chlamydospores (500; 1,500; 2,500; 3,500; 4,500; and 5,000 chlamydospores g-1 of substrate) or without chlamydospores (2.5, 5, 10, and 15 g of inoculum of fungus kg-1 substrate) were evaluated. Three treatments were used as controls in each assay: the addition of P. chlamydosporia (5,000 chlamydospores g-1 substrate or 15 g of inoculum of fungus kg-1 of substrate), the addition of SSIV (30 g SSIV kg-1 of substrate) and only substrate. Following this, each bag containing 4 kg of sterilised substrate and the respective treatments were infested with 6,000 M. javanica eggs kg-1 of substrate, homogenized, moistened until 60% of field capacity and then stored for 14 days in the dark at 25 °C. The substrate was then transferred to 500 ml polypropylene pots, and one tomato seeding was transplanted into each pot. After 60 days the height, the shoot and fresh root masses, and the numbers of nematode galls and eggs were evaluated. The combination of SSIV and the fungus, independent of the type of fungal inoculum, increased the development of the tomato plants and the control of the nematodes. The fungal concentrations most recommended to combine with the SSIV were 3,500 chlamydospores g-1 of substrate and 15 g of inoculum without chlamydospores kg-1 of substrate, because, besides controlling effectively the nematode, they also improved the development of the tomato plants. It was concluded that the combination of SSIV and the fungus P. chlamydosporia improves the management of this root-knot nematode.

CAPES; Fundação Araucária / O controle biológico e a adição de matéria orgânica ao solo representam as principais alternativas para o controle do nematoide-de-galhas. Os objetivos deste estudo foram avaliar o efeito do subproduto sólido da indústria vinícola (SSIV) sobre o desenvolvimento, in vitro, de Pochonia chlamydosporia e o efeito da associação do SSIV a esse fungo no manejo de Meloidogyne javanica em tomateiros, em casa de vegetação. Para avaliar o efeito direto do SSIV sobre o desenvolvimento do fungo, adicionaram-se as concentrações (0; 5; 10; e 15%) do extrato aquoso do SSIV em meio de cultivo batata-dextrose-ágar (BDA) fundente. Em seguida, a mistura foi vertida em placas de Petri e um disco de meio de cultivo ‘Corn Meal Ágar’ (CMA) colonizado pelo fungo foi colocado no centro de cada placa. Em outro estudo avaliou-se o efeito dos compostos voláteis do SSIV sobre o desenvolvimento de P. chlamydosporia. Para isto, utilizaram-se placas de Petri bipartidas, adicionando em um dos compartimentos as concentrações do SSIV (0,000; 0,065; 0,125; 0,250; e 0,500 g placa-1) e 2 mL de água destilada esterilizada placa-1. No centro do outro compartimento contendo meio de cultivo BDA, adicionou-se um disco de meio de cultivo CMA colonizado pelo fungo. As placas dos dois estudos foram armazenadas em câmara de crescimento, no escuro, a 21°C. Os dois estudos foram realizados duas vezes. Após 14 dias avaliaram-se o diâmetro das colônias e a produção de conídios do fungo. O SSIV reduziu de 9 a 21% o crescimento do fungo nos dois estudos, bem como reduziu a produção de conídios no primeiro estudo. Em casa de vegetação, avaliou-se a associação do SSIV (30 g kg-1 de substrato) às concentrações de P. chlamydosporia com clamidósporos (500; 1.500; 2.500; 3.500; 4.500; e 5.000 clamidósporos g-1 de substrato) ou sem clamidósporos (2,5; 5; 10; e 15 g de inóculo do fungo kg-1 de substrato). Três tratamentos foram utilizados como controle em cada ensaio: adição de P. chlamydosporia (5.000 clamidósporos g-1 de substrato ou 15 g de inóculo do fungo kg-1 de substrato), adição de SSIV (30 g do SSIV kg-1 de substrato) e apenas o substrato. Em seguida, cada saco contendo 4 kg de substrato esterilizado e os respectivos tratamentos foi infestado com 6.000 ovos de M. javanica kg-1 de substrato, homogeneizado e umedecido até 60% de capacidade de campo e armazenado por 14 dias no escuro, a 25 ºC. Depois, o substrato foi transferido para vasos de polipropileno de 500 mL, e uma muda de tomateiro foi transplantada para cada vaso. Após 60 dias foram avaliados a altura, a massa da parte aérea e das raízes frescas e o número de galhas e de ovos do nematoide. A associação do SSIV ao fungo, independentemente do tipo de inóculo do fungo, potencializou o desenvolvimento dos tomateiros e o controle do nematoide. As concentrações mais indicadas do fungo para se associar ao SSIV foram 3.500 clamidósporos g-1 de substrato e 15 g do inóculo sem clamidósporos kg-1 de substrato, pois, além de controlarem efetivamente o nematoide, também proporcionaram o desenvolvimento dos tomateiros. Conclui-se que a associação do SSIV ao fungo P. chlamydosporia potencializa o manejo do nematoide-de-galhas. / The biological control and the addition of organic matter to the soil represent the main alternatives for the control of root-knot nematode. The objectives of this study were to evaluate the effect of solid wine industry by-product (SSIV) on the development, in vitro, of Pochonia chlamydosporia and the effect of combining this fungus with the SSIV on the management of Meloidogyne javanica in tomatoes grown in a greenhouse. To evaluate the direct effect of the SSIV on fungal development, concentrations (0, 5, 10, and 15%) of the aqueous SSIV extract were applied to potato-dextrose-agar (BDA) culture medium. The mixture was then poured into Petri dishes and a disk of 'Corn Meal Agar' (CMA) culture medium colonized by the fungus was placed in the centre of each plate. A further study evaluated the effect of volatile SSIV compounds on the development of P. chlamydosporia. For this, twopart Petri dishes were utilised, to one of the compartments the concentrations of SSIV (0.000, 0.065, 0.125, 0.250, and 0.500 g plate-1) and 2 mL plate-1 sterile distilled water were added. To the other compartment, which contained BDA culture medium, a disc of CMA culture medium colonised by the fungus was added in the centre. The plates from the two studies were stored in a growth chamber in the dark at 21 °C. The two studies were performed twice. After 14 days, the diameter of the colonies and the production of fungal conidia were evaluated. The SSIV reduced fungal growth by 9 to 21% in the two studies, and reduced conidia production in the first study. In the greenhouse, the combination of SSIV (30 g kg-1 of substrate) with the concentrations of P. chlamydosporia with chlamydospores (500; 1,500; 2,500; 3,500; 4,500; and 5,000 chlamydospores g-1 of substrate) or without chlamydospores (2.5, 5, 10, and 15 g of inoculum of fungus kg-1 substrate) were evaluated. Three treatments were used as controls in each assay: the addition of P. chlamydosporia (5,000 chlamydospores g-1 substrate or 15 g of inoculum of fungus kg-1 of substrate), the addition of SSIV (30 g SSIV kg-1 of substrate) and only substrate. Following this, each bag containing 4 kg of sterilised substrate and the respective treatments were infested with 6,000 M. javanica eggs kg-1 of substrate, homogenized, moistened until 60% of field capacity and then stored for 14 days in the dark at 25 °C. The substrate was then transferred to 500 ml polypropylene pots, and one tomato seeding was transplanted into each pot. After 60 days the height, the shoot and fresh root masses, and the numbers of nematode galls and eggs were evaluated. The combination of SSIV and the fungus, independent of the type of fungal inoculum, increased the development of the tomato plants and the control of the nematodes. The fungal concentrations most recommended to combine with the SSIV were 3,500 chlamydospores g-1 of substrate and 15 g of inoculum without chlamydospores kg-1 of substrate, because, besides controlling effectively the nematode, they also improved the development of the tomato plants. It was concluded that the combination of SSIV and the fungus P. chlamydosporia improves the management of this root-knot nematode.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_leticia_carvalho_benitez.PDF: 2280565 bytes, checksum: b42ec255c82d36f41734b4fa831b83a0 (MD5) Previous issue date: 2012-05-02 / In agricultural systems, production is hardly influenced by adverse environmental conditions, including salinity.... / Nos sistemas agrícolas, a produção é severamente influenciada por condições ambientais adversas, dentre as quais se destaca a salinidade....

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_luis_willian_pacheco_arge.pdf: 2893589 bytes, checksum: d2e275d77781d5e9508058a77fa20f96 (MD5) Previous issue date: 2012-08-31 / This study aimed to assess the diversity, structure and the genetic relationship, evaluated by phenotypic and molecular of 75 Prunus rootstocks collection belonging to EMBRAPA Clima Temperado. The phenotypic analyzes were conducted by the evaluation of 21 qualitative and 26 quantitative traits of different plant organs and molecular analyzes were based on evaluation of 17 SSR loci. The data of quantitative traits were categorized by Scott & Knott method and submitted along with the qualitative data to statistical analysis (hierarchical by Jaccard coefficient) and clustering of phenotypic relationship. Molecular data were first converted to different formats and subjected to various statistical analyzes. The UPGMA dendogram obtained by genetic distance matrix calculated by Li & Nei coefficient, using the data of SSR loci evaluated was not able to distinguish between Tsukuba-1, Tsukuba-2 and Tsukuba-3 accesses, however, showed phenotypic effective to distinguish them. The dendograms of both analyzes together with the results of Bayesian approaches allowed the identification of three pools with high relation with the different groups that make up the collection. It was found that principal coordinates analysis based on phenotypic data, proved most effective for the detection of three pools detected with the hierarchical and the Bayesian approach. With the molecular data, the principal coordinates analysis corroborated with results obtained by the dendogram and the Bayesian approach. The access of group South Brazilian originating from samples collected in orchards in the region of Pelotas, which have no known pedigree, had largely down genetic and phenotypic distance, low 0.49 per both analyzes, with Aldrighi and Capdeboscq, and other known access. These accesses were traditionally used in the past as rootstocks in the state of Rio Grande do Sul. For both phenotypic and molecular analyzes, the group access of other species contributed more to genetic and phenotypic diversity, as expected, because are different species and with low similarity of features. Phenotypic and genetic characterization proved effective for elucidating the diversity, structure and genetic, and phenotypic relationship of the rootstocks of Prunus collection. / O presente trabalho objetivou avaliar a diversidade, estrutura e relação genética, por avaliação molecular, e fenotípica de uma coleção de 75 acessos de porta-enxertos de Prunus da EMBRAPA Clima Temperado. As análises fenotípicas foram conduzidas com a avaliação de 21 caracteres qualitativos e 26 quantitativos de diferentes órgãos das plantas, e as análises moleculares foram baseadas na avaliação de 17 loci SSR. Os dados dos caracteres quantitativos foram categorizados pelo método de agrupamento Scott & Knott e submetidos juntamente com os dados qualitativos às análises estatísticas de agrupamento (hierárquica pelo coeficiente de Jaccard) e de relação fenotípica. Os dados moleculares foram convertidos primeiramente para diferentes formatos e submetidos às diferentes análises estatísticas. O dendograma UPGMA obtido a partir da matriz de distância genética calculada pelo coeficiente Nei & Li, utilizando os dados dos loci SSR, não foi capaz de distinguir os acessos Tsukuba-1, Tsukuba-2 e Tsukuba-3, no entanto, os dados fenotípicos mostraram-se eficazes para distingui-los. Os dendograma de ambas as análises, juntamente com a abordagem Bayesiana, possibilitaram a identificação de três pools, com alta relação com os diferentes grupos que compõem a coleção. Verificou-se que análise de coordenadas principais, baseada em dados fenotípicos, mostrou-se mais eficaz para a detecção dos três pools detectados com as abordagens hierárquica e Bayesiana. Com os dados moleculares, a análise de coordenadas principais corroborou parcialmente com os resultados obtidos pelo dendograma e pela análise Bayesiana. Os acessos do grupo sul-brasileiro originários de coletas realizadas em pomares da região de Pelotas, os quais não possuem genealogia conhecida, apresentaram em grande parte baixa distância genética e fenotípica, abaixo de 0,49 por ambas as análises, em relação aos acessos Aldrighi e Capdeboscq. Estes acessos foram tradicionalmente usados no passado como porta-enxertos no estado do Rio Grande do Sul. Por ambas as análises, fenotípicas e moleculares, o grupo de acessos de outras espécies foi nalmente quem mais contribuiu para a diversidade genética e fenotípica, como já era esperado, pois são espécies distintas e com baixa similaridade de características. A caracterização genética por ambas as técnicas de análise mostrou-se efetiva para a elucidação da diversidade, estrutura e relação genética e fenotípica da coleção de porta-enxertos de Prunus avaliada.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_andrea_martins.pdf: 691165 bytes, checksum: f498ef1dcfb8e8512d84fbdbc83741d1 (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / The seed quality is usually assessed by patterns of germination and vigor, however, on lots with a high degree of heterogeneity, these tests may show low sensitivity. So, it is necessary to obtain reliable results in short time, ensuring the speediness in decision in relation to the seed quality. Thus, this work was developed aiming to separate seed lots of soybean, bean and corn, according to its vigour through the respiratory activity. For this, three seed lots of crops, were submitted patterns of seed quality, such as germination, first count germination, germination speed index, electrical conductivity, emergency seedlings in the greenhouse, speed emergency, length and dry mass of shoots and roots of seedlings from the germination tests and emergency of seedlings and respiratory activity. According to the results of patterns of physiological quality of soybean seeds was evidenced lot two as the most vigorous and seeds of beans and corn, lots three corroborating with the results regarding the respiratory activity of the seeds. Therefore, we conclude that the respiratory activity allows to separate lots of seeds of of soybean, bean and corn according to its vigour. / A qualidade fisiológica de sementes é normalmente avaliada por testes padrão de germinação e vigor, contudo, em lotes com alto grau de heterogeneidade, estes testes podem apresentar baixa sensibilidade, sendo necessária a obtenção de resultados confiáveis em curto período de tempo, garantindo rapidez na tomada de decisões em relação à qualidade fisiológica de sementes. Diante disso, este trabalho teve como objetivo separar lotes de sementes de soja, feijão e milho quanto ao vigor, por meio da atividade respiratória. Para isso, três lotes de sementes destas culturas foram submetidas aos testes padrão de viabilidade e vigor, tais como germinação, primeira contagem da germinação, índice de velocidade de germinação, condutividade elétrica, emergência de plântulas e índice de velocidade de emergência em casa de vegetação, comprimento e massa seca da parte aérea e das raízes das plântulas oriundas dos testes de germinação e de emergência de plântulas e atividade respiratória. De acordo com os resultados dos testes padrão de qualidade fisiológica, para sementes de soja foi evidenciado o lote dois como o mais vigoroso e para as sementes de feijão e milho o lote três, corroborando com as respostas encontradas através da atividade respiratória das sementes. Portanto, é possível concluir que a atividade respiratória permite separar lotes de sementes de soja, feijão e milho quanto ao vigor.