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Recovery of strains of Vibrio parahaemolyticus inoculated in marine shrimp Litopenaeus vannamei exposed to the cooling and freezing temperatures / RecuperaÃÃo de cepas de vibrio para haemolyticus inoculadas em camarÃo marinho litopenaeus vannamei submetido Ãs temperaturas de resfriamento e congelamento

Dannielle Batista Rolim Sousa 13 April 2007 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de NÃvel Superior / The aim of this study was to evaluate the survival of Vibrio parahaemolitycus inoculated in meat homogenate of shrimp Litopenaeus vannamei at different temperatures of refrigeration (refrigerator, freezer and isothermic box with ice) during ten days and on the 15th, 20th and 25th days. The experiment was repeated six times during October 2005 to March 2006. Shrimps were obtained on fish market located at Praia do Mucuripe, Fortaleza, CearÃ. In the laboratory, the shrimps were washed with distilled water and from immersed in boiling water for five minutes in order to eliminate any other Vibrio the sample. The sample inoculation happened with the contact between the shrimps and the V. parahaemolyticus culture during five minutes. Then, the sample was divided in 40 portions with 25 g each. One of the portions was used as zero time. The other 39 portions were separated in 3 batches and mantained on freezer (- 21ÂC), refrigerator (11ÂC) and isothermic box with ice (-1ÂC to 13ÂC). The number of V. parahaemolyticus was monitored for 10 days and on 15th, 20th and 25th days by the plate count method on TCBS and PCA media. All temperatures were efficient to control the viable cells of V. parahaemolyticus. The action of cold produced by ice, refrigerator and freezer inhibit the bacterial growth on shrimps. The freezer was the most efficient treatment to reduce the V. parahaemolyticus on shrimp samples. / O presente trabalho teve como objetivo recuperar Vibrio parahaemolyticus, inoculado em homogenato de camarÃo marinho, Litopenaeus vannamei livre de vÃbrios, submetido a diferentes temperaturas de refrigeraÃÃo (caixa isotÃrmica com gelo, geladeira e freezer) por dez dias, e nos 15o, 20o e 25o dias. Foram realizadas seis repetiÃÃes do experimento, no perÃodo de outubro de 2005 a marÃo de 2006. O camarÃo foi adquirido na feira de pescado da Praia do Mucuripe, Fortaleza-CearÃ. Em laboratÃrio, 1.500 g de camarÃo eram lavados com Ãgua destilada e imersos em Ãgua fervente por cinco minutos para eliminar qualquer Vibrio presente na amostra. A contaminaÃÃo do camarÃo era feita mediante o contacto dos animais com a cultura de V. parahaemolyticus, por cinco minutos. A amostra era dividida em 40 fraÃÃes de 25 g sendo uma delas usada para contagem no tempo zero e as restantes divididas em trÃs lotes sendo estocadas em trÃs temperaturas: caixa isotÃrmica com gelo (-1 a 13ÂC), geladeira (11ÂC) e freezer (-21ÂC). Por dez dias seguidos, e nos 15o, 20o e 25o dias, V. parahaemolyticus eram quantificados nos camarÃes atravÃs do MÃtodo de Contagem PadrÃo em Placas, em meios de TCBS e PCA. Todas as trÃs temperaturas foram eficientes no controle da viabilidade de V. parahaemolyticus. A aÃÃo do frio gerado por gelo, geladeira e freezer inibe o crescimento dessa bactÃria em camarÃes, sendo a temperatura do freezer, a mais eficiente na reduÃÃo dessa espÃcie bacteriana em camarÃes.
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The biochemical, biological and structural characterization of a recombinant chitinase from chromobacterium violaceum / CaracterizaÃÃo bioquÃmica, biolÃgica e estrutural de uma quitinase recombinante de chromobacterium violaceum.

Marina Duarte Pinto Lobo 16 February 2012 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Chromobacterium violaceum is a Gram-negative, saprophytic, non-pathogenic and free living bacterium. The complete sequencing of its genome has revealed many genes encoding products of biotechnological interest. Among these products are several chitinases. Chitinases, enzymes capable of degrading chitin, an insoluble polymer of β(1,4)-linked N-acetyl-β-D-glucosamine (GlcNAc), are of great biotechnological interest, because they can be used to convert chitin in useful derivatives as well as being exploited for the control of fungi and insects that cause damages in crops. This study aimed to carry out the biochemical, biological and structural characterization of a recombinant chitinase, belonging to family GH18, from C. violaceum ATCC 12472. The ORF CV2935 was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and cloned into the vectors pET303/CT-His and pPICZαA, for expression in Escherichia coli and Pichia pastoris, respectively. In both systems, the enzyme was secreted into the culture medium, in its soluble and functional form, and purified to homogeneity by affinity chromatography on a chitin matrix followed by size-exclusion chromatography on Superdex75 matrix. The yields of pure chitinase expressed in E. coli and P. pastoris were 2.6 and 44 mg per liter of culture, respectively. The recombinant chitinase produced in both microrganisms showed optimal activity at pH 3.0 and it was active after treated at temperatures up to 60 ÂC. The enzyme produced in P. pastoris (45 kDa) was N-glycosylated as revealed by Schiffʼs reagent and digestion with N-glycosidase F. Moreover, the glycosylated chitinase was found to be slightly more thermostable than the enzyme produced in E. coli (43 kDa). The rCV2935 showed hydrolytic activity against colloidal chitin, crab shell, and synthetic substrates containing p-nitrophenol. It was also able to hydrolyse glycol-chitin in SDS-PAGE and showed low chitosanase activity. The fluorescence spectra revealed that the proteins were produced in their folded conformation. The crystal structure of the recombinant chitinase produced in P. pastoris was determined by X-ray crystallography at a resolution of 2.1Ǻ. Its catalytic domain adopts an (β/α)8 triose-phosohate isomerase (TIM) barrel fold, and the residues essential for catalysis are conserved. The recombinant chitinase reduced the growth of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani, and bioassays with cowpea weevil Callosobruchus maculatus showed that the rCV2935 possibly interfered with the insect feeding, which resulted in decreased weight of adults. The biochemical, biological and structural studies of rCV2935 may be useful for biotechnological application of this enzyme. / Chromobacterium violaceum à uma bactÃria Gram-negativa, saprÃfita, nÃo patogÃnica e de vida livre. O seqÃenciamento completo do genoma dessa espÃcie revelou muitos genes codificando produtos com potenciais aplicaÃÃes em diversas Ãreas. Dentre esses produtos, estÃo vÃrias quitinases. Quitinases, enzimas capazes de degradar a quitina, um biopolÃmero de N-acetil-β-D-glucosamina bastante insolÃvel, sÃo de grande interesse biotecnolÃgico, podendo ser utilizadas para converter quitina em derivados Ãteis, e tambÃm para o controle de fungos e insetos que causam danos em culturas agrÃcolas. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar bioquÃmica, biolÃgica e estruturalmente uma quitinase recombinante (CV2935), da famÃlia 18 das glicosÃdeo hidrolases, de C. violaceum ATCC 12472. A ORF codificando a proteÃna CV2935 foi amplificada por reaÃÃo em cadeia da polimerase (PCR) e clonada nos vetores pET303/CT-His e pPICZαA, para expressÃo em Escherichia coli e Pichia pastoris, respectivamente. Em ambos os sistemas, a enzima foi secretada para o meio de cultura, na sua forma solÃvel e funcional, sendo purificada a homogeneidade por cromatografia de afinidade em matriz de quitina, seguida de cromatografia de exclusÃo molecular em matriz de Superdex75. Os rendimentos da quitinase pura, expressa em E. coli e P. pastoris, foram 2,6 e 44 mg por litro de cultura, respectivamente. A quitinase produzida em ambos os microorganismos mostrou atividade Ãtima em pH 3,0 e foi ativa quando tratada a temperaturas de atà 60 ÂC. A enzima produzida em P. pastoris (45 kDa) foi N-glicosilada, como revelado por coramento com reagente de Schiff e digestÃo com N-glicosidase F, mostrando-se ligeiramente mais termoestÃvel do que a enzima nÃo glicosilada, produzida em E. coli (43 kDa). A rCV2935 apresentou atividade hidrolÃtica (endoquitinÃsica) frente a quitina coloidal, matriz de carapaÃa de caranguejo obtida comercialmente, glicol-quitina (em gel SDS-PAGE), substratos sintÃticos solÃveis contendo p-nitrofenol, alÃm de apresentar pequena atividade quitosanÃsica. Os espectros de fluorescÃncia revelaram que as proteÃnas foram produzidas na sua conformaÃÃo enovelada. A enzima teve sua estrutura cristalogrÃfica resolvida a uma resoluÃÃo de 2.1à e seu domÃnio catalÃtico apresentou um dobramento do tipo barril (β/α)8 (barril TIM) e resÃduos essenciais para catÃlise conservados, caracterÃsticas essas, comuns Ãs proteÃnas da mesma famÃlia. A quitinase recombinante retardou o crescimento do fungo fitopatogÃnico Rhizoctonia solani, e, em bioensaios com o caruncho Callosobruchus maculatus, a rCV2935 possivelmente interferiu com a alimentaÃÃo do inseto, o que acarretou na diminuiÃÃo do peso dos mesmos. Os estudos bioquÃmicos, biolÃgicos e estruturais da rCV2935 poderÃo ser Ãteis para aplicaÃÃo biotecnolÃgica dessa enzima.
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QuantificaÃÃo de bactÃrias entÃricas em sÃtios anatÃmicos e lÃquido intervalvar de ostras (Crassostrea rhizophorae) e caracterizaÃÃo de isolados de Escherichia coli / Quantification of enteric bacteria in anatomic sites and intervalvar liquor of oysters (Crassostrea rhizophorae) and characterization of Escherichia coli isolations.

Rayza Lima AraÃjo 03 May 2013 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Os coliformes termotolerantes tÃm sido descritos como um dos melhores indicadores de contaminaÃÃo de ambientes aquÃticos por resÃduos humanos, sendo amplamente utilizado como parÃmetro para classificaÃÃo de Ãreas onde se cultiva ou extrai ostras. Dentre os membros deste grupo, a Escherichia coli se destaca como uma espÃcie potencialmente patogÃnica, representando risco para a saÃde pÃblica quando associada ao consumo de moluscos bivalves crus ou parcialmente cozidos. Entretanto, pouco à sabido sobre a colonizaÃÃo nos tecidos desses moluscos e/ou distribuiÃÃo dessas bactÃrias entÃricas. O presente estudo teve como objetivos:(i) quantificar coliformes termotolerantes do fluido corporal e dos sÃtios anatÃmicos, separadamente;(ii) isolar e identificar E. coli de amostras de ostras comercializadas in natura na Praia do Futuro, Fortaleza-CearÃ;(iii) avaliar o perfil de virulÃncia e resistÃncia a antimicrobianos dos isolados de E. coli. Foram realizadas dez coletas no perÃodo de fevereiro a abril de 2012, sendo analisadas dez ostras por coleta, divididas em um fluido corporal (lÃquido intervalvar) e dois sÃtios anatÃmicos (mÃsculo e trato gastrointestinal). Os resultados apontaram trÃs amostras com contagens de coliformes acima do limite estabelecido pela legislaÃÃo n 12 de 2001 da ANVISA, tendo o lÃquido intervalvar apresentado o NMP mais elevado em seis amostras. Das 137 cepas de E. coli isoladas, verificou-se maior incidÃncia de resistÃncia à tetraciclina e oxitetraciclina (19%), com variaÃÃo do Ãndice de MÃltipla ResistÃncia (MAR) entre 0,250 e 0,625. Observou-se ainda a presenÃa de cepas produtoras de enzimas beta-lactamases de espectro estendido, porÃm nenhuma das cepas testadas apresentou produÃÃo de biofilme. A elevada frequÃncia de resistÃncia à oxitetraciclina sugere uma pressÃo seletiva sobre a microbiota do ecossistema manguezal, que pode ser afetada diretamente pela atividade de carcinicultura, praticada na regiÃo prÃxima à cidade de ParnaÃba, localizada no Estado do PiauÃ, de onde as ostras sÃo extraÃdas. AlÃm disso, a presenÃa de mÃltipla resistÃncia aos antimicrobianos observada pode ser indicativa de risco para os consumidores de ostra in natura. / Fecal coliforms have been described as one of the best indicators of pollution in the aquatic environments by human wastes, and it is widely used as a parameter for classifying areas where oysters are farmed or extracted. Among Enterobacteriaceae members, E. coli stands out as potential pathogenic specie, representing risk for public healthy when associated with consumption of raw or undercooked bivalves. However, little is known about this colonization in the bivalve tissues and/or distribution of these enteric bacteria. The objective of the present study was to: (i) quantify fecal coliforms from body fluid and anatomical sites, separately; (ii) isolate and identify E. coli in oysters commercialized in natura in Praia do Futuro beach, Fortaleza-CearÃ; (iii) evaluate the virulence profile and resistance to antimicrobial agents of E. coli isolates. The study covered ten samples, from February to April 2012, by analyzing twelve oysters for sample, divided into a body fluid (intervalvar liquor) and two anatomical sites (mantle and gastrointestinal tract). Fecal coliforms concentration was higher than allowed by legislation n 12/2001 of ANVISA in three samples, and intervalvar liquor presented higher MPN in six samples. Out of 137 E. coli strains isolated, 19% was resistant to both tetracycline and oxytetracycline, and MAR ranged from 0,250 to 0,625. It is further noted producing expended spectrum beta lactamases strains, however none showed biofilm production. The major frequency resistance to oxytetracycline suggests a selective pressure to mangrove ecosystem microbiota that could be directly affected by farming shrimp activity, practiced in a region next to ParnaÃba city, located in Piauà state, where oysters are extracted. In addition, the presence of multiple resistance can be a risk for in natura oyster consumers.
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DetecÃÃo de microorganismos utilizando a tÃcnica de pcr em sequÃncias palindrÃmicas extragÃnicas repetidas (REP-PCR) no monitoramento da qualidade do leite de cabra em sala de ordenha / Detention of microorganisms using the technique of pcr in repetitive extragenic palindromic (REP-PCR) sequences in tracking of the quality of goat milk in milking room.

Cellyneude de Souza Olivindo 26 February 2008 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O presente estudo foi realizado, com o objetivo de aplicar a tÃcnica de PCR em seqÃÃncias palindrÃmicas extragÃnicas repetidas (REP-PCR) no monitoramento da qualidade do leite de cabra, atravÃs da detecÃÃo de Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa e Streptococcus spp., em amostras de mÃos de ordenhadores, tetos das cabras, leite, ordenhadeira e Ãgua, para o futuro estabelecimento e implantaÃÃo do sistema de AnÃlise de Perigos e Pontos CrÃticos de Controle (APPCC). Verificou-se vÃrios fingerprints de todos os isolados coletados das diferentes fontes estudadas (mÃos de ordenhadores, tetos das cabras, leite, ordenhadeira e Ãgua). Observou-se comportamentos muito similares das bandas indicando que os isolados podem ser relatados como clones epidemiolÃgicos. A Ãgua sem tratamento, utilizada para a lavagem das mÃos dos ordenhadores, caracterizou-se como um ponto crÃtico de controle (PCC), pois se destaca como iniciador de contaminaÃÃo nas amostras Streptococcus spp., Escherichia coli e Pseudomonas aeruginosa,. Outro PCC seria as mÃos do ordenhador, pois nas amostras de Staphylococcus aureus, aparece tambÃm como indicador de contaminaÃÃo. A tÃcnica demonstrou ser eficiente para a anÃlise da similaridade entre indivÃduos da mesma espÃcie, no caso, do Staphylococcus aureus, Streptococcus spp., Escherichia coli e Pseudomonas aeruginosa, sendo, portanto, uma ferramenta Ãtil para investigaÃÃo de falhas no manejo e consequentemente, na busca de um controle mais eficiente para evitar ou minimizar a disseminaÃÃo de microrganismos patogÃnicos causadores de sÃrias enfermidades em humanos e animais, que muitas vezes podem ser transmitidas atravÃs de produtos como o leite e seus derivados. / The present study was carried out, with the objective of applying the PCR technique in repetitive extragenic palindromic (REP-PCR) sequences in the monitoring of the quality of goat milk, through the detection of Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Streptococcus spp., in samples of milking handlers, goats teats, milk, milk machine and water, for the future establishment and implantation of the system of Hazard Analysis Critical Control Points (HACCP). Several fingerprints was verified of all the isolates collected of the different studied sources (milking handlers, goats teats, milk, milk machine and water). It was observed very similar behaviors of the bands indicating that the isolates can be related as epidemic clones. The water without treatment, used for the wash milking handlers, it was characterized as a critical point of control (PCC), because stands out as starter contamination in the Streptococcus spp., Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa samples. Another PCC would be the hands of the milking handlers, because in the Staphylococcus aureus samples, it is also appears as initial point of contamination. The technique demonstrated to be efficient for the similarity analysis among individuals of the same species, in case, of the Staphylococcus aureus, Streptococcus spp., Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa, being, therefore, an useful tool for investigation of fails on management and consequently, in the search of more efficient control to avoid or to minimize the spread of pathogenic microorganisms that cause serious illnesses in humans and animals, and can be transmitted through products as the milk and your products.
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FacilitaÃÃo como atenuante do estresse ambiental entre populaÃÃes microbianas imobilizadas. / Facilitation as attenuating of environmental stress on immobilized microbial populations

Suzana ClÃudia Silveira Martins 14 December 2012 (has links)
A facilitaÃÃo como atenuante do estresse ambiental, resultante de atividades antrÃpicas, entre populaÃÃes microbianas imobilizadas, Ã o principal objetivo do presente estudo, que foi dividido em cinco capÃtulos. O primeiro consta do estado da arte sobre imobilizaÃÃo microbiana, importÃncia das interaÃÃes facilitadoras entre espÃcies sob estresse ambiental e a imobilizaÃÃo celular como ferramenta para aumentar a eficiÃncia de tratamento de poluentes tÃxicos em Ãguas residuÃrias de origem industrial. No segundo capÃtulo, foi definido o tipo de espuma de poliuretano e meio de cultura a ser usado para imobilizaÃÃo natural. No terceiro, testes qualitativos e quantitativos foram realizados para seleÃÃo de linhagens microbianas ambientais com potencial para adesÃo celular. O quarto capÃtulo constou da avaliaÃÃo do efeito de estresse ambiental sobre populaÃÃes microbianas imobilizadas em monocultivo. No quinto e Ãltimo capÃtulo, as linhagens microbianas selecionadas foram imobilizadas consorciadas e foi testado o efeito de estresse fisiolÃgico, sobre o valor adaptativo de populaÃÃes microbianas, indicativo do tipo de interaÃÃo predominante entre espÃcies. O potencial das linhagens para processos de biotransformaÃÃo de poluentes quÃmicos tÃxicos tambÃm foi investigado. Os resultados mostraram a espuma de poliuretano de 23 kg/m3 e caldo Luria-Bertani 1/10 como adequados para retenÃÃo de aproximadamente 107 UFC/cm2 cÃlulas da bactÃria Pseudomonas aeruginosa ATCC 25619. Entre as linhagens microbianas de origem ambiental a bactÃria Serratia marcescens e a levedura C. rugosa mostraram melhor potencial de adesÃo. As cÃlulas dessas culturas, imobilizadas sobre espuma de poliuretano, foram mais resistentes ao fenol que as respectivas cÃlulas em suspensÃo. Quando consorciadas, as duas linhagens apresentaram melhor valor adaptativo na presenÃa do fenol, em relaÃÃo Ãs mesmas cÃlulas imobilizadas em cultivo individual, comprovando a prevalÃncia das interaÃÃoes facilitadoras entre as populaÃÃes avaliadas / The attenuating influence of facilitate or positive interactions between immobilized and associated microbial populations under environmental stresse conditions is the main objective of this study. In this perspective, five chapters were developed. The first shows the state of the art of microbial immobilization, importance of facilitating interactions between species under environmental stress and cell immobilization as a tool to increase the efficiency of treatment of toxic pollutants in industrial wastewaters. In the second chapter was defined the type of polyurethane foam and the culture medium to be used for natural immobilization. In the third, qualitative and quantitative tests were conducted for selection of environmental microbial strains with potential for cell adhesion. The fourth chapter consisted of the evaluation of the effect of environmental stress on microbial populations immobilized in monoculture. In the fifth and last chapter, the selected microbial strains were immobilized in consortium and tested the effect of a physiological stress on the adaptive value of microbial populations, indicative of the predominant type of interaction between the species. The potential of strains for biotransformation processes of toxic chemical pollutants was also investigated. The results showed polyurethane foam of 23 kg/m3 immersed in Luria-Bertani broth diluted ten fold, as appropriate for cell retention of about 107 cells of Pseudomonas aeruginosa ATCC 25619. Among environmental microbial strains the Serratia marcescens bacterium and the yeast C. rugosa showed better adhesion potential. Individual microbial cells immobilized on polyurethane foam were more resistant to phenol than the respective cell suspensions. When associated, the two strains showed better adaptive value in the presence of phenol, compared to the same cells immobilized in individual cultivation, proving the prevalence of facilitative interactions between microbial populations.
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AvaliaÃÃo do potencial antimicrobiano de lectinas e outras substÃncias naturais frente a bactÃrias orais / Antimicrobial potencial analysis of lectins and other natural substances against oral bacteria

Theodora Thays Arruda Cavalcante 26 March 2012 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Os biofilmes sÃo uma forma mais resistente de vida microbiana comparada à forma planctÃnica, em vida livre. Essa resistÃncia està diretamente relacionada Ãs caracterÃsticas naturais de sobrevivÃncia das cÃlulas microbianas vivendo nesse tipo de comunidade. A doenÃa cÃrie capaz de acometer os tecidos dentais està diretamente relacionada com a formaÃÃo de comunidades microbianas e ainda apresenta grande impacto social e econÃmico sobre a sociedade atual. O presente trabalho teve como objetivo investigar a potencialidade de compostos vegetais como insumos biotecnolÃgicos a serem aplicados na prevenÃÃo e tratamento da cÃrie dental. Para tanto, foram realizadas metodologias de verificaÃÃo da atividade antimicrobiana e antibiofilme de lectinas vegetais do gÃnero Canavalia e Ãleos essenciais de Croton zehntneri assim como de seus componentes majoritÃrios frente a bactÃrias envolvidas na cÃrie. AlÃm disso, foi verificada a possÃvel aÃÃo simultÃnea de lectinas e diterpeno casbano (DC) sobre a expressÃo de genes de virulÃncia relacionados à formaÃÃo de biofilmes de Streptococcus mutans. Dentro dos limites das metodologias realizadas no presente trabalho pode-se concluir que: lectinas vegetais do gÃnero Canavalia podem interferir no fator micro-organismos relacionado à cÃrie dental; Ãleos essenciais e seus componentes majoritÃrios apresentaram atividade antimicrobiana significativa sobre S. mutans e ainda que as soluÃÃes da lectina ConM e ConM/DC atuando simultaneamente foram capazes de alterar a expressÃo de genes relacionados a formaÃÃo de biofilmes por S. mutans, podendo vir a ser usado em estudos prÃ-clÃnicos no intuito de instituir novas alternativas de prevenÃÃo e terapÃutica para doenÃa cÃrie. / Biofilms are more resistant form of microbial life compared to planktonic form, in the wild. This resistance is related to the natural characteristics of survival of microbial cells living in this type of community. The caries that can affect the dental tissues is directly related to the formation of microbial communities and still has great social and economic impact on society. This study aimed to investigate the potential of plant compounds as biotechnological inputs to be applied in prevention and treatment of dental caries. To this end, methods were performed to verify the antimicrobial and antibiofilme activity of plant lectins of the genus Canavalia and essential oils of Croton zehntneri as well as its major components against bacteria involved in caries. Furthermore, was verified the possible simultaneous action of lectins and casban diterpene (DC) on the expression of virulence genes related to biofilm formation of Streptococcus mutans. Within the methodology undertaken in this work can be concluded that: lectins of the genus Canavalia can interfere with the factor micro-organisms related to dental caries; essential oils and their major components showed significant antimicrobial activity against S. mutans and that solutions of ConM lectin and ConM/DC acting simultaneously were able to alter the expression of genes related to biofilm formation by S. mutans, and may be used in preclinical studies in order to develop new alternatives for prevention and therapy for caries.
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Monitoramento da Microbiota Bacteriana da Ãgua em um Sistema Fechado de Cultivo em uma EstaÃÃo de Piscicultura Marinha / Monitoring of bacterial microbiota in water in a closed system of cultivation in a Marine Fish Culture Station

Ricardo Albuquerque RebouÃas 15 September 2010 (has links)
O desenvolvimento de cultivos eficientes utilizando sistemas fechados de cultivo com recirculaÃÃo de Ãgua à necessÃrio para uma aquicultura sustentÃvel. Esta pesquisa visou quantificar, identificar grupos bacterianos e realizar antibiograma das espÃcies do gÃnero Vibrio presentes na Ãgua de recirculaÃÃo usada para cultivo de uma estaÃÃo de piscicultura marinha experimental. As amostras de Ãgua foram coletadas do sistema de cultivo no perÃodo entre setembro de 2007 e maio de 2008, perfazendo um total de 8 coletas envolvendo o perÃodo de chuva e estiagem. Os parÃmetros ambientais ficaram dentro dos padrÃes estabelecidos pela legislaÃÃo brasileira. Os nÃmeros mais provÃveis (NMP) de coliformes totais e termotolerantes variam em P1 e P6 respectivamente: (P1) de < 1,8 a 3,4 por 10 e de padrÃo em placa (CCP) das Unidades Formadoras de ColÃnias (UFC) por mililitro das bactÃrias heterotrÃficas entre os pontos oscilaram de < 10 a 2,5X10 (7) UFC/mL. O nÃmero de colÃnias de Vibrio em P1, P2 e P6 oscilou de 10 a 2,37 X 10 (4) UFC/mL. Forma identificadas 40 cepas das 51 isoladas de amsotras de Ãgua entre as bactÃrias heterotrÃficas. Estas se mostraram pertencentes a 13 gÃneros distintos, sendo Aeromonas, Leuconostoc e Vibrio, as mais frequentes. As culturas com capacidade de nitrificaÃÃo provindas de amostras de Ãgua se distribuiram em 8 gÃneros diferentes, sendo encontrados com maior freqÃÃncia Arthorbacter, Alcaligenes Paracoccus e Vibrios. Em Agar Tiossulfato Citrato Bili-Sacarose (TCBS) foram isoladas e identificadas espÃcias da famÃlia Vibrionaceae. Dos 28 isolados das amostras de Ãgua foram identificadas 20 estirpes. As estirpes identificadas pertenciam a 10 diferentes espÃcies V. coralliitycus, V. metschnikovii e V. orientalis, tiveram maior freqÃÃncia. Os isolados identificados foram submetidos a antibiograma. Todas as cepas foram sensÃveis ao sulfazotrim, ao cloranfenicol, a estreptomicina, oxitetraciclina, e a nitrofurantoina. Entre a microbiota de vibrios da Ãgua no sistema forma encontrados 40% das estirpes sendo resistentes ao Ãcido nalidÃxico, 30% a cefotaxina e a ampicilina, 5% ao florfenicol, a tetraciclina, a cefalotina e agentamicina. O perfil mais freqeunte de resistÃncia dos isolados foi o CTX-NAL (44,5%) (4/9). Do total de estirpes isoladas, nove (45%) (9/20) se mostraram com um perfil de resistÃncia mÃltipla a seis classes diferentes de antimicrobianos. Foi observada nessa pesquisa a resistÃncia aos antimicrobianos: cefotaxima, Ãcido nalidÃxico, gentamicina, cefalotina, ciprofloxacino, ampicilina, tetraciclina e florfenicol, podendo estar relacionada à caracterÃstica plasmidial. Estudos sobre a diversidade da microbiota com particular Ãs populaÃÃes de Vibrio nesses ambientes sÃo de extrema importÃncia para a avaliaÃÃo da extensÃo da gravidade em eventos de doenÃas bacterianas. Pesquisas sobre bactÃrias nitrificantes entre a populaÃÃo de bactÃrias heterotrÃficas dentro do sistema de cultivo de organismos marinhos sÃo importantes para estabelecer os parÃmetros biolÃgicos e garantir a sustentabilidade do cultivo / This research aimed to quantify, identify and perform antibiotic bacterial groups of the genus Vibrio in the water recirculation to the growing of a marine fish experimental station. Water samples were collected from the cultivation system in the period between September 2007 and May 2008, a total of eight collections involving the rainy and dry seasons. Environmental parameters were within the standards established by Brazilian legislation. The most probable number (MPN) of total coliforms and thermotolerant vary in P1 and P6, respectively: (P1) <1.8 to 3.4 per 10 sqm and standard plate (CCP) of colony forming units (CFU) per milliliter of heterotrophic bacteria between points ranged from <10 to 2.5 x 10 (7) CFU / mL. The number of colonies of Vibrio P1, P2 and P6 ranged from 10 to 2.37 X 10 (4) CFU / mL. Form identified 40 strains isolated from 51 amsotras water between heterotrophic bacteria. These proved to belong to 13 distinct genres, and Aeromonas, Vibrio, and Leuconostoc, the most frequent. Cultures with nitrification capacity coming from water samples were distributed in eight different genera, being found more frequently Arthorbacter, Alcaligenes, and Paracoccus Vibrios. Bili agar Thiosulfate citrate-sucrose (TCBS) were isolated and identified species of the family Vibrionaceae. Of the 28 water samples isolated from 20 strains were identified. The strains identified belonged to 10 different species V. coralliitycus, V. metschnikovii and V. orientalis, had a higher frequency. The isolates identified were subjected to sensitivity. All strains were sensitive to sulfazotrim, chloramphenicol, streptomycin, oxytetracycline and nitrofurantoin. The profile over freqeunte resistance of isolates was CTX-NAL (44.5%) (4 / 9). Of the total isolates, nine (45%) (9 / 20) is shown with a profile of multiple resistance to six different classes of antimicrobials. Was observed in this study antimicrobial resistance: cefotaxime, nalidixic acid, gentamicin, cephalothin, ciprofloxacin, ampicillin, tetracycline, and florfenicol, and may be related to the characteristic plasmid.
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Diversidade microbiolÃgica e rendimento da produÃÃo fermentativa de hidrogÃnio a partir de glicerol / Microbial diversity and yield of the fermentative hydrogen production from glycerol

QuÃzia Maia Viana 04 June 2013 (has links)
A crescente demanda por energias alternativas torna o hidrogÃnio (H2) interessante por possuir alta concentraÃÃo de energia por unidade de massa. Aliado a isso, futuramente, o glicerol, subproduto da geraÃÃo de biodiesel, passarà de resÃduo a passivo ambiental, devido à crescente produÃÃo de biodiesel.Unindo as duas perspectivas, a produÃÃo fermentativa de hidrogÃnio a partir de glicerol residual à uma alternativa atraente, pois pode-se à gerar energia limpa a partir de um resÃduo. A grande questÃo que envolve a otimizaÃÃo da produÃÃo biolÃgica de H2 à a seleÃÃo de inÃculos com diversidade microbiana que maximize os rendimentos. TÃcnicas de prÃ-tratamento do inÃculo selecionam microrganismos especÃficos para a produÃÃo de H2 e enriquecem a comunidade com bactÃrias produtoras de H2. Por isso, esses distÃrbios controlados no ambiente sÃo utilizados amplamente.Com base no que foi exposto, este trabalho teve como objetivos: (i) selecionar uma microbiota com potencial elevado de produÃÃo de H2 e analisar sua diversidade; (ii) avaliar o impacto dos prÃ-tratamentos sobre a diversidade microbiana e o rendimento da produÃÃo de H2 (&#414;H2); (iii) e relacionar diversidade microbiana com &#414;H2(na Ecologia este termo à conhecido como produtividade). Foram testados diferentes inÃculos submetidos a diferentes prÃ-tratamentos (choque de calor, choque Ãcido e adiÃÃo de clorofÃrmio). Pelos resultados, pode-se concluir que a diversidade microbiana tem relaÃÃo direta com a produtividade em H2. Da mesma forma,o impacto do prÃ-tratamento sobre a microbiota depende do tipo de inÃculo. No entanto, as maiores diversidade e produtividade foram alcanÃadas com lodo proveniente da estaÃÃo de tratamento de esgoto domÃstico sem prÃ-tratamento. Os prÃ-tratamentos resultaram em diferentes Ãndices de diversidade, o que mostra que o grau do distÃrbio, pode nÃo sà afetar os microrganismos metanogÃnicos, mas tambÃm os demais presentes. Concluiu-se que a aplicaÃÃo de prÃ-tratamentos se tornou redundante, pois apenas a aplicaÃÃo de carga orgÃnica elevada e ausÃncia de soluÃÃo tampÃo promovem reduÃÃo do pH para a faixa ideal das produtoras de H2, inibindo a atividade metanogÃnica. / The growing demand for alternative energy makes hydrogen (H2) an interesting fuel because of its high concentration of energy per unit mass. Moreover, in the future, the glycerol derived from the biodiesel industry can become an environmental liability due to the increasing production of biodiesel. Therefore, the fermentative production of hydrogen from residual glycerol is an attractive alternative because it will be possible to generate clean energy from a waste. The issue on the optimization of biological production of H2 is the selection of microbial population with an adequate diversity that improves the hydrogen yields. Techniques for pre-treatment of the inoculum select specific microorganisms to produce H2 and enrich the community with H2-producing bacteria. Therefore, these controlled environmental disturbs are widely used. Based on the above, this study aimed to: (i) select a microbiota with high potential for the production of H2 and analyse its diversity, (ii) evaluate the impact of pre-treatments on microbial diversity and hydrogen yield, (iii) evaluate the relationship between microbial diversity and hydrogen yield. Different inocula were tested at different pre-treatments (heat shock, acid shock and chloroform addition). The results show that the microbial diversity is directly related to hydrogen yield. Likewise, the impact of the pre-treatment depends on the type of inoculum. However, the highest diversity and yield were achieved with sludge withdrawn from a municipal wastewater treatment plant without any pre-treatment. In general, the pre-treatments resulted in different diversity index, which shows that the degree of disturb may not only affect the methanogenic microorganism, but also the remaining in the inoculum. The pre-treatments became redundant because only the imposed high organic load and the absence of buffer promoted reduction of pH to the optimum range for H2 production, inhibiting the methanogenic activity and improving the hydrogen yield.
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ObservaÃÃes Sobre o FitoplÃncton de Lagoas de EstabilizaÃÃo e AvaliaÃÃo de RemoÃÃo Algal Via FlotaÃÃo com Ar Dissolvido / Observations on phytoplankton of Stabilization Ponds and Evaluation of Algal Removal Via Dissolved Air Flotation

Expedito RÃmulo Amado de Oliveira 08 May 2013 (has links)
nÃo hà / A composiÃÃo, variaÃÃo semanal, e avaliaÃÃo de remoÃÃo de biomassa fitoplanctÃnica por FlotaÃÃo com Ar Dissolvido de um sistema de lagoas de estabilizaÃÃo da EstaÃÃo de Tratamento de Esgoto de Aquiraz â CE foi estudada durante o perÃodo de maio a dezembro de 2011. Analisando-se dados de eficiÃncia de remoÃÃo de SÃlidos, DQO, DBO, Turbidez, Coliformes e densidade de organismos. Qualitativamente o fitoplÃncton apresentou-se composto por 36 tÃxons especÃficos, distribuÃdos por 14 clorofÃceas, 11 euglenofÃceas, 7 cianobactÃrias, 2 bacilariofÃceas, uma criptofÃcea e apenas uma clamidofÃcea. Apesar do nÃmero de espÃcies de algas verdes, o destaque em densidadade e frequÃncia foi de Planktotrhix agardhii, espÃcie conhecida como produtora de toxinas, dominando durante todo o perÃodo estudado. Esta espÃcie foi suplantada em pouquÃssimas semanas por algas verdes cocÃides. Ocorreu decrÃscimo do nÃmero de classes entre as lagoas ao longo da pesquisa com reduÃÃo e piora da riqueza de espÃcies entre as lagoas, culminando com a concentraÃÃo de mais de 90% da composiÃÃo dos organismos pertencentes a uma Ãnica espÃcie de cianobactÃria. Cyanophyceae foram encontradas com mÃdias de 7,9x105 a 1,6 x 106 org./mL. Os resultados sÃo preocupantes no que tange à potencialidade tÃxica da espÃcie dominante e que à lanÃada no Rio Pacoti alÃm de as lagoas se comportarem como estoque de hormogÃnios e replicaÃÃo desses organismos para o ambiente. Nos ensaios de remoÃÃo, o efluente da Lagoa de MaturaÃÃo B possuÃa 5,7 x 104 ind/mL, 132 NTU de turbidez, 4,8x103 NMP de E. coli. Os testes de flotaÃÃo com ar dissolvido mostram-se promissores. ApÃs flotaÃÃo, caÃram para 291,4 org/L, 2,7 NTU, 102NMP de E. Coli/100mL. A menor eficiÃncia foi de DBO, alcanÃando mÃdias de 73%. A DQO foi removida em 80%. A flotaÃÃo teve que ser auxiliada por coagulantes. Foi removido 98% dos organismos fitoplanctÃnicos, 98,8% de coliformes e 98% da turbidez. E. coli foi reduzida em duas unidades logarÃtmicas, resultando em <600 NMP/100mL. A baixa concentraÃÃo bacteriana permite indicar, apÃs desinfecÃÃo simples, o reÃso para fins de irrigaÃÃo urbana, lavagem de automÃveis e outros usos de contato humano restrito. / The composition, weekly change, and evaluation of removal of phytoplankton biomass by Dissolved Air Flotation with a system of stabilization ponds Station Wastewater Treatment Aquiraz - EC was studied during the period from May to December 2011. Analyzing data removal efficiency of solids, COD, BOD, Turbidity, Coliform and density of organisms. Qualitatively the phytoplankton is composed of 36 specific taxa spread over 14 green algae, 11 euglenoids, 7 cyanobacteria, 2 bacilariofÃceas, 1 criptofÃcea and only one clamidofÃcea. Although the number of species of green algae, the highlight densidadade and frequency was Planktotrhix agardhii, species known as producing toxins, dominating throughout the study period. This species has been supplanted in a very few weeks a coccoid green algae. Decrease occurred in the number of classes among the ponds along the survey reduction and worsening of species richness among lakes, culminating with the concentration of more than 90% of the composition of organisms belonging to a single species of cyanobacteria. Cyanophyceae were found with averages of 7.9 x105 to 1.6 x 106 org./mL. The results are worrying regarding the toxic potential of the dominant species and is thrown into the River Pacoti plus ponds behave like stock hormogon and replication of these organisms to the environment. In tests of removal, effluent Maturation Pond had 5.7 x 104 ind / mL, 132 NTU turbidity, 4,8 x103 NMP E. coli. The flotation tests with dissolved air show to be promising. After flotation, fell to 291,4 org/L, 2.7 NTU, 102 NMP E. Coli/100mL. The lowest efficiency of BOD, reaching averages of 73%. The COD was removed at 80%. Flotation had to be helped by coagulants. Was removed 98% of the phytoplanktonic organisms, 98.8% of fecal and 98% turbidity. E. coli was reduced by two logarithmic units, resulting in <600 NMP/100mL. The low bacterial concentration allows state after simple disinfection, reuse for irrigation, urban car washing and other uses of human contact restricted.
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AvaliaÃÃo do comportamento bacteriano e alteraÃÃes sensoriais em tilÃpias do Nilo (Oreochromis niloticus) durante estocagem em gelo / PERFORMANCE EVALUATION AND BACTERIAL CHANGES IN SENSORY NILE TILAPIA (Oreochromis niloticus) DURING STORAGE IN ICE

Lana Oliveira Leite 27 February 2013 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / O pescado à um alimento susceptÃvel à deterioraÃÃo devido Ãs suas caracterÃsticas intrÃnsecas, sendo necessÃrio o monitoramento bacteriano no armazenamento pÃs-morte. Dessa forma, objetivou-se quantificar bactÃrias, psicrotrÃficas, psicrÃfilas e mesÃfilas em tilÃpias do Nilo (Oreochromis niloticus) durante 21 dias de estocagem sob aÃÃo do gelo. Foram realizados quatro experimentos, separados em dois grupos, nÃo eviscerados e eviscerados, cada um com oito amostras perfazendo um total de 32 amostras. A cada trÃs dias era retirado um exemplar de tilÃpia para as anÃlises do experimento: sensorialmente, conforme a avaliaÃÃo do MÃtodo do Ãndice de Qualidade (MIQ), adaptado à tilÃpia do Nilo e microbiologicamente. Na anÃlise sensorial do peixe cru foram avaliados os atributos: aspecto geral, olhos, brÃnquias, textura e musculatura dos peixes, segundo os somatÃrios dos caracteres sensoriais (S.C.S). De cada exemplar foram quantificados os grupos bacterianos: psicrotrÃficos (7ÂC), psicrÃfilos (23ÂC), e mesÃfilos (35ÂC), na superfÃcie e no mÃsculo, pelo mÃtodo de Contagem PadrÃo em Placas (CPP). NÃo houve diferenÃa estatÃstica entre os trÃs grupos bacterianos analisados à um nÃvel de significÃncia de 5% dentro dos mesmos tratamentos e entre os grupos. O tempo de estocagem apresentou alta correlaÃÃo com a contagem dos grupos bacterianos e o aumento do MIQ, tanto para os peixes eviscerados, quanto para os nÃo eviscerados. Foi considerado que o processo de evisceraÃÃo no local de venda dos peixes nÃo aumentou sua vida Ãtil. Sugere-se, portanto, uma maior atenÃÃo no processo de evisceraÃÃo em peixarias que comercializam peixes vivos, pois esse processo nÃo foi realizado de forma eficaz para seguranÃa e valorizaÃÃo do produto. / Fish is a food susceptible to deterioration due their intrinsic characteristics, requiring bacterial monitoring in postmortem storage. Thus, the objective was to quantify mesophilic, psychrotrophic, psychrophilic bacteria in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) during to 21 days of storage under the action of ice at temperature refrigeration. Four experiments were conducted, separated to two groups, gutted and ungutted, with eight samples totaling 32 samples. Every three days was taken a exemplar of tilapia for analyzes of the trial: sensory evaluation according to the Quality Index Method (QIM) adapted to the Nile tilapia and heterotrophic bacterial count of cultivable. In sensory analysis of raw fish attributes were assessed: general appearance, eyes, gills, muscles and texture of the fish, according to the Sensory Characters Sum (S.C.S). To each specimen were quantified bacterial groups: psychrophilic (23 ÂC), psychrotrophic (7 ÂC) and mesophilic (35 ÂC), the surface and the muscle, using the method of standard plate count (SPC). There was no statistical difference between the three bacterial groups analyzed the significance level of 5% within the same treatments and between groups. The storage time was highly correlated with the counting of bacterial groups and increased QIM for both eviscerated fish, and for those not drawn. It was considered that the process of evisceration on the premises of the fish did not increase its useful life. It is suggested, therefore, greater attention in the process of gutting fish markets that sell live fish, because this process was not carried out effectively to security and recovery product.

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