O mapeamento da atividade científica é essencial para o desenvolvimento da pesquisa e definição de políticas. Na presente pesquisa, foi analisada a convergência entre a produção de artigos científicos da área da Saúde Pública e a Agenda Nacional de Prioridades de Pesquisa em Saúde (ANPPS) implementada pelo Ministério da Saúde em 2005. Nessa perspectiva, faz-se uma breve apresentação do campo científico da Saúde Pública, o histórico de sua constituição, suas principais linhas teóricas e epistemológicas, o contexto atual e suas relações interdisciplinares. A análise foi realizada pelo mapeamento temático de artigos indexados na base de dados LILACS (Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde), desenvolvida pela BIREME, com apoio da rede colaborativa da Biblioteca Virtual de Saúde. O estudo recorreu, metodologicamente, à combinação dos procedimentos de Organização da Informação com as técnicas propostas pelos Estudos métricos da Informação. O corpus da pesquisa foi constituído de 7603 registros de artigos selecionados de 37 títulos de periódicos indexados na base de dados LILACS. Os descritores dos artigos, publicados no período de 2003 e 2007, foram comparados com as 24 subagendas da ANPPS para obter indicadores sobre o grau de convergência ente produção científica nacional e política de pesquisa em saúde. Os resultados mostraram que a convergência é positiva, tendo destaque o tema DOENÇAS TRANSMISSÍVEIS, cuja produção é significativamente mais elevada do que a dos demais temas da ANPPS. Os temas EPIDEMIOLOGIA E PESQUISA CLÍNICA apresentam também elevada produção, revelando a predominância destas duas abordagens epistemológicas na área da saúde. As subagendas SAÚDE DA POPULAÇÃO NEGRA e SAÚDE DOS POVOS INDÍGENAS apresentaram crescimento após a implementação da agenda. As subagendas SISTEMAS E POLÍTICAS DE SAÚDE e SAÚDE, AMBIENTE, TRABALHO E BIOSSEGURANÇA destacaram-se, demonstrando que as pesquisas sobre a gestão da saúde e a questão ambiental são estratégicas na área da Saúde Pública. / The mapping of scientific activity is essential for the development of research and policy definition. In this study, we examined the convergence of scientific articles in the area of Public Health and the National Agenda on Health Research (ANPPS) implemented by the Ministry of Health in 2005. From this perspective, it is made a brief presentation of the scientific field of Public Health, the history of its constitution, its main theoretical and epistemological lines, the current context and their interdisciplinary relation. The analysis was carried out by the thematic mapping of articles indexed in LILACS database (Latin American and Caribbean Health Sciences Literature), developed by BIREME, with support from the collaborative Virtual Library This survey used, methodologically, the combination of procedures from Organization of Information with the techniques proposed by the Metric Studies of Information. The corpus of the research consisted of 7603 records of articles selected from 37 titles of journals indexed in LILACS database. The descriptors of the articles published between 2003 and 2007 were compared with the 24 sub-agendas ANPPS for obtain indicators on the degree of convergence between national scientific production and health policy research. The results showed that the convergence is positive, and highlight the theme COMMUNICABLE DISEASES, whose production is significantly higher than other themes of ANPPS. Topics like EPIDEMIOLOGY e CLINICAL RESEARCH also have high production, revealing the prevalence of these two epistemological approaches in health. The agendas BLACK POPULATION HEALTH and INDIGENOUS PEOPLES\' HEALTH grew after the implementation of the agenda. The sub-agendas SYSTEMS AND HEALTH POLICY e HEALTH, ENVIRONMENT, LABOR AND BIOSECURITY stood out, demonstrating that the research on the management of health and environmental issues are strategic in the area of Public Health.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2014-09-08T15:43:32Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao Leonardo T Queiroz.pdf: 3060512 bytes, checksum: 9db02d07b1a185dc6a2000968c571ae9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-08T15:43:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao Leonardo T Queiroz.pdf: 3060512 bytes, checksum: 9db02d07b1a185dc6a2000968c571ae9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-08-02 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / One of the concerns in test Applications Database (ADB) is to keep the operating and computational costs low. In the context of the ADB, one way to collaborate with this assumption is ensuring that the Test Databases (TDB) are small, but effective in revealing defects of SQL statements. Such bases can be constructed or obtained by the reduction of Production Databases (PDB). In the reductions case, there are combinatorial aspects involved that require the use of a specific technique for their implementation. In this context, in response to a deficiency identified in the literature, this work aims to build and provide a benchmark to enable performance evaluation, using SQL Mutation Analysis, any search technique that intends to conduct databases reductions. Therefore, to exercise the search techniques, the benchmark was built with two scenarios where each one is composed of a PDB and a set of SQL statements. In addition, as a reference for search techniques, it also contains performance of data database randomly reduced. As a secondary objective of this work, from the experiments conducted in the construction of the benchmark, analyses were made with the results obtained to answer important questions about what factors are involved in the complexity of SQL statements in the context of Test Mutation. A key finding in this regard was on the restrictiveness of SQL commands, and this is the factor that most influences the complexity of statements. / Uma das preocupações no teste de Aplicações de Bancos de Dados (ABD) é manter o custo operacional e computacional baixo. No contexto das ABD, uma das maneiras de colaborar com essa premissa é garantir que as bases de dados de teste (BDT) sejam pequenas, porém, eficazes na revelação de defeitos de instruções SQL. Tais bases podem ser construídas ou obtidas pela redução de grandes bases de dados de produção (BDP). No caso da redução, estão envolvidos aspectos combinatórios que exigem o uso de alguma técnica para a sua realização. Neste contexto, em resposta a uma carência identificada na literatura, o presente trabalho tem como objetivo construir e disponibilizar um benchmark para possibilitar a avaliação de desempenho, utilizando a Análise de Mutantes SQL, de qualquer técnica de busca que se proponha a realizar reduções de bases de dados. Sendo assim, para exercitar as técnicas de busca, o benchmark foi construído com dois cenários, onde cada um é composto por uma BDP e um conjunto de instruções SQL. Além disso, como uma referência para as técnicas de busca, ele é composto também por resultados de desempenho de bases de dados reduzidas aleatoriamente. Como objetivo secundário deste trabalho, a partir dos experimentos conduzidos na construção do benchmark, foram feitas análises dos resultados obtidos para responder importantes questões sobre quais fatores estão envolvidos na complexidade de instruções SQL no contexto da Análise de Mutantes. Uma das principais conclusões neste sentido foi sobre a restritividade dos comandos SQL, sendo este o fator que mais influencia na complexidade das instruções.

Objetivos. Reflexos das transformações sociais promovidas pela Sociedade do Conhecimento são percebidos no contexto da gestão em saúde no Brasil. Apresentam-se referencial teórico sobre essas mudanças, gestão do SUS, sistemas de informação em saúde, produção científica e uso da informação na gestão. Foi analisada a produção científica brasileira em saúde pública como fonte de apoio à tomada de decisão em saúde. Metodologia. Foram feitos estudo exploratório qualitativo e análise documental em três áreas: bases de dados bibliográficas disponíveis na Biblioteca Virtual em Saúde, agendas estaduais de saúde e sites das Secretarias Estaduais de Saúde. Resultados. Os principais resultados foram: as bases de dados LILACS e MEDLINE foram as fontes de apoio mais abrangentes para localizar produção brasileira publicada no país e no exterior, respectivamente; a produção científica brasileira destaca-se nessa área, correspondendo a 39 por cento dos registros da LILACS-SP; as principais instituições produtoras são universidades e organismos governamentais; a produção de saúde pública encontra-se distribuída em revistas de outras áreas da saúde; a internet, já utilizada pelo ministério e pelas secretarias de saúde, seria favorável para disseminação de conhecimento científico para a gestão em saúde. Conclusões e recomendações. A informação científica e técnica disponível poderia apoiar os processos de tomada de decisão, mas o caminho entre sua produção e uso não é linear e precisa ser estimulado. São apresentadas sugestões para promover integração e articulação entre pesquisa científica e decisão política. / Objectives. Social changes introduced by Knowledge Society are perceptible in the health management context in Brazil. Literature on these social changes, on National Health System - SUS legislation, on health information systems, on the health scientific production and on its use for decision making was reviewed. Brazilian public health scientific literature as support to health decision making was analyzed. Methods. Qualitative exploratory methods and document analysis were used to study bibliographic databases available at the Virtual Health Library, health agendas and sites of the State Secretaries of Health. Results. The main results were: LILACS and MEDLINE databases were the most comprehensive sources for searching Brazilian public health literature; 39 per cent of LILACS-SP records corresponds to Brazilian public health literature; universities and government institutions are the main producers of public health scientific literature; public health journal articles are published also in journals from other health fields; Internet, which is already being used by Ministry and State Secretaries of Health for communication, could be a favorable environment for dissemination of scientific information for health decision making. Conclusions and recommendations. Available health scientific and technical information could support health decision making processes but the channels between its production and use are not linear and need to be strengthened. Recommendations to improve relationship and interaction between health research and policy were presented.

Desde a definção do problema de obtenção de regras de associação, vários algoritmos eficientes foram introduzidos para tratá-lo. Entretanto, ainda hoje o problema apresenta várias dificuldades práticas para os mineradores, como a determinação de limiares adequados de suporte mínimo e confiança mínima, a manipulação de grandes conjuntos de regras, e a compreensão de regras (especialmente aquelas contendo muitos itens). Para tratar estes problemas, pesquisadores têm investigado a aplicação de técnicas interativas, sumarização (de conjuntos de regras) e representações visuais. Entretanto, nenhuma abordagem na qual os usuários podem entender e controlar o processo por meio da interação com o algoritmo analítico ao longo de sua execução foi introduzida. Neste trabalho, é introduzida uma abordagem interativa para extração e exploração de regras de associação que insere o usuário no processo por meio de: execução interativa do Apriori ; seleção interativa de itemsets freqüentes; extração de regras baseada em itemsets e orientada por agrupamentos de itemsets similares; e exploração de regras aos pares. Para validar a abordagem, foram realizados diversos estudos, apoiados pelo Sistema \'I IND.2\' E, com o objetivo de: comparar a abordagem interativa, sob diversos aspectos, com uma abordagem convencional de obtenção de regras de associação; avaliar o efeito de variar alguns parâmetros do processo nos resultados finais; e mostrar a aplicação dos recursos oferecidos em situações reais e com usuários reais. Os resultados indicam que a abordagem apresentada é adequada, tanto em cenários exploratórios quanto em cenários em que há um direcionamento inicial para o processo, à execução de certas tarefas de extração de regras de associação, pois: provém recursos capazes de evitar execuções inteiras do algoritmo antes que os resultados sejam analisados; gera conjuntos de regras mais compactos; preserva a cobertura de itemsets; favorece a reformulação de tarefas ou a formulação de novas tarefas; e provê meios para comparação visual de regras, aumentando o poder de análise do minerador / Since the definition of the association rule mining problem, many efficient algorithms have been introduced to deal with it. However, the problem still presents many practical difficulties to the miners, such as the determination of suitable minimum support and minimum confidence thresholds, manipulation of large rule sets, and comprehension of rules (specially those containing many items). In order to deal with these problems, researchers have been investigating the application of interactive techniques, sumarization (of rule sets) and visual representations. Nonetheless, no approach in which users can understand and control the process through interaction with the analytical algorithm along its execution has been introduced. We introduce an interactive approach to extract and explore association rules that inserts the user into the process through: interactive execution of the Apriori ; interactive selection of frequent itemsets; itemset-based and cluster-oriented extraction of rules; and pairwise exploration of rules. To validate the approach, several studies have been conducted, supported by the \'I IND.2\' E System, aiming at: comparing the interactive approach, under several aspects, with a conventional approach to obtain association rules; evaluate the effect of different execution parameters in the final results; and illustrate its application in real situations and with real users. Results of these studies indicate that the approach is adequate, both in exploratory scenarios and in scenarios in which there is an initial guidance for the process, to the execution of certain association rule extraction tasks, because: it provides resources to avoid complete algorithm executions before results are analyzed; generates more compact rule sets for exploration; preserves rule diversity; favors the reformulation of tasks; and provides support for rule comparison, enhancing analysis capability for miners

Made available in DSpace on 2016-04-04T18:36:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodolfo Coutinho Moreira Xavier.pdf: 468596 bytes, checksum: 945fbd0efcc49829e3535f5e233dbb7b (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / This work deals with the issue on the economic relations settled among the stages of production, distribution and information use in the productive chain of the knowledge, available on the on-line providers helping on the understanding of the economic logic which sustains that industry. First, the elements on the History of the Information are discussed, interrelating the description of the Science of the Information, of the Society of the Information and the certified scientific editions. Next, supply and demand and its relations in the market of the scientific knowlegde are presented by showing the particularities of that market with relation to the conventional markets. Finally, it treats the productive chain and databases, specially the Dialog provider and some of its databases by offering quantitative data. The problem is how to demonstrate the contraditory logic in the productive chain of the scientific knowledge, information access was not an spontaneous consequence of the commercial liberalization, but it has created technical and economical gaps for almost totality of the scientific community, intensified and perpetuated by the oligopoly of the big on-line access providers, which gather in themself the biggest private databases. / O trabalho aborda a quest?o das rela??es econ?micas estabelecidas entre as etapas de produ??o, distribui??o e uso da informa??o na cadeia produtiva do conhecimento, dispon?vel nos provedores em linha, para compreender a l?gica econ?mica que sustenta essa ind?stria.Discutem-se primeiramente elementos sobre a Hist?ria da Informa??o, inter-relacionando o hist?rico da Ci?ncia da Informa??o, da Sociedade da Informa??o e das edi??es cient?ficas certificadas. Apresentam-se, em seguida, a oferta, a demanda e suas rela??es no mercado do conhecimento cient?fico, mostrando as particularidades desse mercado com rela??o aos mercados convencionais.Finalmente aborda-se a cadeia produtiva e as bases de dados, particularmente do provedor Dialog e algumas de suas bases de dados, oferecendo dados quantitativos. O problema ? mostrar a l?gica contradit?ria na cadeia produtiva do conhecimento cient?fico, o acesso ? informa??o n?o foi uma conseq??ncia espont?nea da liberaliza??o comercial, mas criou gargalos t?cnicos e econ?micos para quase toda a comunidade cient?fica, recrudescidos e perpetuados pelo oligop?lio dos grandes provedores de acesso em linha, os quais agrupam em si as grandes bases de dados privadas.

No Aprendizado de Máquina Supervisionado - AM - é apresentado ao algoritmo de indução um conjunto de instâncias de treinamento, no qual cada instância é um vetor de features rotulado com a classe. O algoritmo de indução tem como tarefa induzir um classificador que será utilizado para classificar novas instâncias. Algoritmos de indução convencionais baseam-se nos dados fornecidos pelo usuário para construir as descrições dos conceitos. Uma representação inadequada do espaço de busca ou da linguagem de descrição do conjunto de instâncias, bem como erros nos exemplos de treinamento, podem tornar os problemas de aprendizado difícies. Um dos problemas centrais em AM é a Seleção de um Subconjunto de Features - SSF - na qual o objetivo é tentar diminuir o número de features que serão fornecidas ao algoritmo de indução. São várias as razões para a realização de SSF. A primeira é que a maioria dos algoritmos de AM, computacionalmente viáveis, não trabalham bem na presença de muitas features, isto é a precisão dos classificadores gerados pode ser melhorada com a aplicação de SSF. Ainda, com um número menor de features, a compreensibilidade do conceito induzido pode ser melhorada. Uma terceira razão é o alto custo para coletar e processar grande quantidade de dados. Existem, basicamente, três abordagens para a SSF: embedded, filtro e wrapper. Por outro lado, se as features utilizadas para descrever os exemplos de treinamento são inadequadas, os algoritmos de aprendizado estão propensos a criar descrições excessivamente complexas e imprecisas. Porém, essas features, individualmente inadequadas, podem algumas vezes serem, convenientemente, combinadas gerando novas features que podem mostrar-se altamente representativas para a descrição de um conceito. O processo de construção de novas features é conhecido como Construção de Features ou Indução Construtiva - IC. Neste trabalho são enfocadas as abordagens filtro e wrapper para a realização de SSF, bem como a IC guiada pelo conhecimento. É descrita uma série de experimentos usando SSF e IC utilizando quatro conjuntos de dados naturais e diversos algoritmos simbólicos de indução. Para cada conjunto de dados e cada indutor, são realizadas várias medidas, tais como, precisão, tempo de execução do indutor e número de features selecionadas pelo indutor. São descritos também diversos experimentos realizados utilizando três conjuntos de dados do mundo real. O foco desses experimentos não está somente na avaliação da performance dos algoritmos de indução, mas também na avaliação do conhecimento extraído. Durante a extração de conhecimento, os resultados foram apresentados aos especialistas para que fossem feitas sugestões para experimentos futuros. Uma parte do conhecimento extraído desses três estudos de casos foram considerados muito interessantes pelos especialistas. Isso mostra que a interação de diferentes áreas de conhecimento, neste caso específico, áreas médica e computacional, pode produzir resultados interessantes. Assim, para que a aplicação do Aprendizado de Máquina possa gerar frutos é necessário que dois grupos de pesquisadores sejam unidos: aqueles que conhecem os métodos de AM existentes e aqueles com o conhecimento no domínio da aplicação para o fornecimento de dados e a avaliação do conhecimento adquirido. / In supervised Machine Learning - ML - an induction algorithm is typically presented with a set of training instances, where each instance is described by a vector of feature values and a class label. The task of the induction algorithm (inducer) is to induce a classifier that will be useful in classifying new cases. Conventional inductive-learning algorithms rely on existing (user) provided data to build their descriptions. Inadequate representation space or description language as well as errors in training examples can make learning problems be difficult. One of the main problems in ML is the Feature Subset Selection - FSS - problem, i.e. the learning algorithm is faced with the problem of selecting some subset of features upon which to focus its attention, while ignoring the rest. There are a variety of reasons that justify doing FSS. The first reason that can be pointed out is that most of the ML algorithms, that are computationally feasible, do not work well in the presence of a very large number of features. This means that FSS can improve the accuracy of the classifiers generated by these algorithms. Another reason to use FSS is that it can improve comprehensibility, i.e. the human ability of understanding the data and the rules generated by symbolic ML algorithms. A third reason for doing FSS is the high cost in some domains for collecting data. Finally, FSS can reduce the cost of processing huge quantities of data. Basically, there are three approaches in Machine Learning for FSS: embedded, filter and wrapper approaches. On the other hand, if the provided features for describing the training examples are inadequate, the learning algorithms are likely to create excessively complex and inaccurate descriptions. These individually inadequate features can sometimes be combined conveniently, generating new features which can turn out to be highly representative to the description of the concept. The process of constructing new features is called Constructive Induction - CI. Is this work we focus on the filter and wrapper approaches for FSS as well as Knowledge-driven CI. We describe a series of experiments for FSS and CI, performed on four natural datasets using several symbolic ML algorithms. For each dataset, various measures are taken to compare the inducers performance, for example accuracy, time taken to run the inducers and number of selected features by each evaluated induction algorithm. Several experiments using three real world datasets are also described. The focus of these three case studies is not only comparing the induction algorithms performance, but also the evaluation of the extracted knowledge. During the knowledge extraction step results were presented to the specialist, who gave many suggestions for the development of further experiments. Some of the knowledge extracted from these three real world datasets were found very interesting by the specialist. This shows that the interaction between different areas, in this case, medical and computational areas, may produce interesting results. Thus, two groups of researchers need to be put together if the application of ML is to bear fruit: those that are acquainted with the existing ML methods, and those with expertise in the given application domain to provide training data.

Em virtude de uma elevada expectativa de vida mundial, faz-se crescente a probabilidade de ocorrer acidentes naturais e traumas físicos no cotidiano, o que ocasiona um aumento na demanda por reabilitação. A terapia física, sob o paradigma da reabilitação robótica com serious games, oferece maior motivação e engajamento do paciente ao tratamento, cujo emprego foi recomendado pela American Heart Association (AHA), apontando a mais alta avaliação (Level A) para pacientes internados e ambulatoriais. No entanto, o potencial de análise dos dados coletados pelos dispositivos robóticos envolvidos é pouco explorado, deixando de extrair informações que podem ser de grande valia para os tratamentos. O foco deste trabalho consiste na aplicação de técnicas para descoberta de conhecimento, classificando o desempenho de pacientes diagnosticados com hemiparesia crônica. Os pacientes foram inseridos em um ambiente de reabilitação robótica, fazendo uso do InMotion ARM, um dispositivo robótico para reabilitação de membros superiores e coleta dos dados de desempenho. Foi aplicado sobre os dados um roteiro para descoberta de conhecimento em bases de dados, desempenhando pré-processamento, transformação (extração de características) e então a mineração de dados a partir de algoritmos de aprendizado de máquina. A estratégia do presente trabalho culminou em uma classificação de padrões com a capacidade de distinguir lados hemiparéticos sob uma precisão de 94%, havendo oito atributos alimentando a entrada do mecanismo obtido. Interpretando esta coleção de atributos, foi observado que dados de força são mais significativos, os quais abrangem metade da composição de uma amostra. / As a result of a higher life expectancy, the high probability of natural accidents and traumas occurences entails an increasing need for rehabilitation. Physical therapy, under the robotic rehabilitation paradigm with serious games, offers the patient better motivation and engagement to the treatment, being a method recommended by American Heart Association (AHA), pointing the highest assessment (Level A) for inpatients and outpatients. However, the rich potential of the data analysis provided by robotic devices is poorly exploited, discarding the opportunity to aggregate valuable information to treatments. The aim of this work consists of applying knowledge discovery techniques by classifying the performance of patients diagnosed with chronic hemiparesis. The patients, inserted into a robotic rehabilitation environment, exercised with the InMotion ARM, a robotic device for upper-limb rehabilitation which also does the collection of performance data. A Knowledge Discovery roadmap was applied over collected data in order to preprocess, transform and perform data mining through machine learning methods. The strategy of this work culminated in a pattern classification with the abilty to distinguish hemiparetic sides with an accuracy rate of 94%, having eight attributes feeding the input of the obtained mechanism. The interpretation of these attributes has shown that force-related data are more significant, comprising half of the composition of a sample.

Made available in DSpace on 2018-06-18T13:12:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015 / Com o advento das novas tecnologias são crescentes as formas de publicação e acesso à informação científica na área da saúde. Estudos apontam que existem algumas barreiras encontradas pelos usuários para buscar, acessar e avaliar a informação científica de maneira eficaz. A área da saúde apresenta uma grande gama informacional disponível na Internet e os pesquisadores devem obter subsídios para selecionar o que realmente é importante, absorver e gerar conhecimento para que, através da pesquisa, possam organizar e direcionar seus estudos voltados a uma produção intelectual consistente, em conformidade com a evolução científica. Neste sentido, o objetivo deste estudo foi analisar o comportamento de busca em bases de dados dos pós-graduandos do Programa de Pós-Graduação de Ensino em Ciências da Saúde. Nesta investigação, optou-se por uma pesquisa qualitativa, que inclui uma abordagem descritiva do sujeito de pesquisa e a busca de caráter exploratório na literatura científica nacional e internacional existente acerca da temática proposta. Os instrumentos utilizados para a coleta de dados foram questionário eletrônico e discussão em grupo para um melhor aprofundamento da realidade, visando mais entendimento sobre o processo de busca por parte dos pós-graduandos. Os dados foram analisados à luz do referencial teórico, onde foram destacados três núcleos temáticos: o processo de busca de informação pelos pós graduandos; dificuldades encontradas pelos pós-graduandos na busca de informação em bases de dados; facilidades encontradas pelos pósgraduandos na busca de informação em bases de dados. Identificados os três núcleos temáticos, emergiram as principais barreiras encontradas nas etapas da pesquisa, ficando estas evidenciadas neste estudo. Identificou-se a necessidade de ações que potencializem a competência informacional nas várias etapas do processo de pesquisa, o que poderá impactar diretamente na qualidade das publicações científicas. / With the advent of new technologies are increasing forms of publication and access to scientific information in health. Studies show that there are some barriers encountered by users to search, access and evaluate scientific information effectively. The health sector has a wide informational range available on the Internet and researchers must obtain subsidies to select what is really important, absorb and generate knowledge, so that, through research, can organize and direct their studies aimed at a consistent intellectual production, in accordance with the scientific progress. In this sense, the objective of this study was to analyze the search behavior of post graduate students of Programa de Pós-Graduação de Ensino em Ciências da Saúde. In this investigation, we chose a qualitative research that includes a descriptive approach to the research subject and the search for exploratory in existing national and international scientific literature on the proposed theme. The instruments used for data collection were electronic questionnaire and group discussion for better understanding of reality, seeking more agreement on the search process by the post graduate students. The data were analyzed based on the theoretical framework, which were highlighted three central themes: the process of searching for information by post graduate students; difficulties encountered by post graduate students in the search for information in databases; facilities found by post graduate students in the search for information in databases. It was identified the need for actions that enhance information literacy at various stages of the research process, which could directly impact the quality of scientific publications.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-07-20T17:10:28Z No. of bitstreams: 1 prisicila_mo_costa_ioc_bp_0037_2006.pdf: 2669544 bytes, checksum: 9b2e6aaf65027a066f8ad3713540db99 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-20T17:10:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 prisicila_mo_costa_ioc_bp_0037_2006.pdf: 2669544 bytes, checksum: 9b2e6aaf65027a066f8ad3713540db99 (MD5) Previous issue date: 2006 / Cnpq / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / O estudo de tripanosomatídeos de plantas teve início em 1909, quando foram encontradas formas flageladas em látex, sendo depois encontradas em floema, frutas e flores. Desde a refutada tentativa de Donovan de criar o gênero Phytomonas, temos atualmente, várias espécies classificadas dentro do gênero Phytomonas, incluíndo Phytomonas serpens, organismo alvo de nosso estudo. O ciclo de vida de P. serpens compreende planta e inseto. A transmissão é feita do tomate para inseto, do inseto para tomate. O vetor natural é o hemíptero Phthia picta (Hemiptera: Coriidae) que quando se alimenta de tomates infectados, se torna infectado após 10 a 15 dias, apresentando parasitos nas fezes, urina, tubo digestivo e glândulas salivares. Pouco se sabe sobre P. serpens e o conhecimento é ainda mais escasso se levarmos em conta todos os organismos dentro do gênero Phytomonas. O objetivo deste projeto é explorar o genoma de P. serpens gerando e analisando seqüências de seu genoma, aumentando o conhecimento deste organismo e comparando seu genoma com outros organismos. A cepa 9T de P. serpens (CT–IOC-174) foi cultivada a 27oC em meio Schneiders ́insect medium suplementado com 10% de soro fetal bovino. O DNA genômico foi extraído por lise alcalina para a construção da biblioteca genômica. O DNA foi parcialmente digerido com a enzima de restrição Sau3A. Os fragmentos de DNA com tamanhos entre 1-3 kb foram recuperados do gel de agarose e purificados. Os fragmentos de DNA foram clonados no sítio BamHI do vetor de clonagem pUC18. A reação de sequenciamento foi realizada na plataforma de sequenciamento ABI3730 – 48 capilar PDTIS/FIOCRUZ e na plataforma MegaBase na UERJ. Todas as seqüências foram armazenadas em banco de dados “open source” nos servidores Linux no Laboratório de Biologia Molecular de Tripanosomatídeos e Flebotomíneos (DBBM/IOC/FIOCRUZ). Foram seqüenciados 829 clones da biblioteca de DNA genômico obtendo-se um total de 379 seqüências GSS (Genomic Sequence Survey) de alta qualidade. Foram utilizadas para a complementação deste estudo, as seqüências do projeto EST de P. serpens que estavam disponíveis no GenBank. Os 221 clusters GSS e os 697 clusters de EST (Expressed Sequence Tag) foram comparados com o programa de busca de similaridade Blast a diferentes bancos de dados, utilizando como parâmetro evalue 10 -5, gerando 599 clusters com entradas positivas (Hits) e 303 clusters com nenhum hit, representando possíveis genes espécie específicos. Os clusters foram anotados de acordo com sua função quando comparados ao banco de dados Gene Ontology (GO) representando uma análise inédita no genoma de P.serpens. Inferências filogenéticas e de similaridade com o banco “Taxonomy” do NCBI foram realizados, usando inclusive seqüências do genoma ambiental, para verificar se as mesmas pertencem a Kinetoplastida, o que não se comprovou. As inferências filogenéticas realizadas com genes concatenados mostraram que P. serpens é mais próximo de T. cruzi, enquanto que inferências com genes individuais apontaram para L. major. Com base na literatura, inferimos que a análise da árvore de genes concatenados é correta. Foram encontradas com o GLIMMER 20 genes hipotéticos nas seqüências de GSS. Encontramos 22 cluters em GSS que não foram encontrados anteriormente em EST, como por exemplo, Piroglutamil-peptidase I, antígeno nuclear de proliferação celular (PCNA) e Peptidase_M8. / The study of trypanosomatids of plants began in 1909, when flagellate forms were found in latex from Euphorbiaceae, being later found in phloem, fruits/seeds and flowers in a wide variety of plants species. Since the refuted attempt of Donovan to create the genus Phytomonas, a great number of species were classified in the genus Phytomonas, including Phytomonas serpens, the major organism of our study. The described life cycle of P. serpens involves plant (tomato) and insect. The natural vector is the Coreid bug, Phthia picta (Hemiptera: Coriidae), that becomes infected 10 a 15 days after feeding on infected tomatoes, presenting the parasite in excrements, urine, digestive tube and salivary glands. Very little is known about these organisms and even less is known about the genus Phytomonas. The goal of this project is to explore the P. serpens genome by generating and analyzing sequences of its genome aiming to increase the knowledge of this organism and to analyze comparatively with genomes of other organisms. P. serpens infects tomatoes but we still have doubts about its pathogenicity. A strain of P. serpens 9T (CT-IOC-174) was cultured at 27oC in Schneiders ́insect medium supplemented with 10% heat-inactivated fetal bovine serum. The DNA was extracted by alkaline lyses for the construction of a genomic library. Genomic DNA was partially digested with the restriction enzyme Sau3A. DNA fragments with an average size of 1.0-3.0 kb were recovered and purified from agarose gel. DNA inserts were cloned into the BamHI restriction site of pUC18 cloning vector. The sequencing reaction was made at the Sequencing Platform ABI3730 - PDTIS/FIOCRUZ and MegaBase platform at UERJ. All the sequences were stored in an open source database in the Linux server in the Laboratory of Molecular Biology of Trypanosomatids and Phlebotomines (DBBM/IOC/FIOCRUZ). 829 clones of the P. serpens genomic DNA library were sequenced obtaining a total of 379 high quality sequences GSS (Genome Sequence Survey). Sequences from the EST (Expressed Sequence Tag) project of P. serpens available at GenBank were used for the complementation of this study. 221 GSS clusters and 697 EST clusters were compared with different databases with the similarity search program Blast, using evalue 10 -5 as default, obtaining 599 clusters with positive hits and 303 clusters without hit, indicating possible species-specific genes. 357 clusters that were identified when compared with Gene Ontology (GO) had their function classified, representing the first analysis of P. serpens genome using GO. Phylogenetics and similarity studies with Taxonomy database from NCBI were carried out confirming the position of P. serpens in relations to the others trypanosomatids and disclosing similarity with T. cruzi genome. The phylogenetic study included sequences of the enviromental genome, in order to verify if these sequences belong to the Kinetoplastid, what was not proven to be true. Phylogenetic studies using concatenated genes showed that P. serpens is phylogenetically closer to T. cruzi, but studies with individuals genes pointed to L. major. Based on literature, we infer that the analysis of the tree of concatenated genes is correct. 20 hypothetical genes in the GSS sequences were found with the GLIMMER. We found 22 clusters in GSS sequences that were not found in EST before, among others, Pyroglutamil-peptidase I, proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and Peptidase_M8.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-09-19T13:39:08Z No. of bitstreams: 1 renato_s_junior_ioc_bp_0048_2011.pdf: 2131023 bytes, checksum: c67826382b4b8b6c00b329a3f8c712d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-19T13:39:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 renato_s_junior_ioc_bp_0048_2011.pdf: 2131023 bytes, checksum: c67826382b4b8b6c00b329a3f8c712d2 (MD5) Previous issue date: 2011 / Universidade Federal Fluminense. Centro de Estudos Gerais. Instituto de Biologia. Niteroi, RJ, Brasil / A família Trypanosomatidae inclui parasitas de uma grande variedade de vertebrados, invertebrados (principalmente insetos), plantas e algumas espécies de protozoários, sendo, depois do nematóides, os de maior distribuição de hospedeiros na natureza. No presente trabalho, um novo isolado foi obtido por coprocultivo de trato intestinal de Leptoglossus stigma Herb, 1784 (Hemiptera, Coreidae), capturado no município de Itaguaí/RJ. O isolado original e três clones (obtidos por citometria de fluxo) foram depositados na "Coleção de Flagelados do Laboratório de Transmissores de Leishmanioses." Um clone foi caracterizado por diversas abordagens em comparação com espécies de referência de diferentes gêneros. Foi analisado o crescimento em meio de cultivo em intervalos de 24 h, entre 48-144 h, a diferenciação celular e a morfometria dos principais estágios evolutivos encontrados. A análise de isoenzimas foi realizada utilizando-se os seguintes sistemas: GPI, PGM, 6PGDH, HK, ACON, MPI, FUM, IDH, MDH e ACON. RAPD-PCR foi realizado utilizando-se 6 iniciadores, conjuntamente com outros tripanosomatídeos. Os dados destas análises foram processados numericamente e submetidos à análise computacional utilizando-se o coeficiente de associação Jaccard e o algoritmo de agrupamento UPGMA. Realizou-se seqüenciamento do amplicon do gene de SSU rRNA e o fragmento analisado foi alinhado com vinte e uma seqüencias depositadas no GenBank, gerando uma árvore filogenética resultante do pareamento. O conjunto de resultados deste trabalho sugere que a amostra obtida constitui nova espécie, pertencendo a um novo gênero, nomeada Vickermania itaguaiensis. / The Trypanosomatidae family includes parasites of a wide variety of vertebrates, invertebrates (mainly insects), plants and some species of protozoa, and after the nematodes, the highest distribution of hosts in nature. In this study, an isolate was obtained by coproculture from Leptoglossus stigma Herb, 1784 (Hemiptera, Coreidae) intestinal tract, captured in the city of Itaguaí/RJ. The original isolate and clones (obtained by flow cytometry) were deposited in the "Coleção de Flagelados do Laboratório de Transmissores de Leishmaniose". One clone was characterized by several approaches in comparison with the reference species of different genus. Growth was analyzed in culture medium at 24 h intervals between 48-144 h, cell differentiation and morphometric parameters of the main evolutionary stages matches. The isoenzyme analysis was performed using the following systems: GPI, PGM, 6PGDH, HK, ACON, MPI, FUM, IDH, MDH and ACON. RAPD-PCR was performed using 6 primers, together with other trypanosomatids. The analysis of these data were numerically processed and submitted to computer analysis using the Jaccard association coefficient and UPGMA clustering algorithm. We carried out sequencing of the amplicon from SSU rRNA gene and the fragment analyzed was aligned with twenty-one sequences deposited in GenBank, generating a phylogenetic tree resulting from the pairing. The result set of this work suggests that the sample obtained represents a new species belonging to a new genus, named Vickermania itaguaiensis.