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Cristalização e resolução da estrutura tridimensional da lectina de Canavalia maritima (Conm) complexada com o primer da interleucina - 1 beta

Vieira, Derek Barroso Holanda Asp 15 August 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-01T14:16:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2925990 bytes, checksum: c09f8e05395a813c660d9c2568ea71c5 (MD5) Previous issue date: 2014-08-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Legume lectins are historically recognized as carbohydrate-binding proteins, and this property is roughly linked to the majority of their biological activities, such as pro and antiinflamatory processes, apoptosis and mitogenic mechanisms. However, several studies have demonstrated the capability of these proteins to bind diverse other compounds, such as phytohormones and hydrophobic molecules, although the biological relevance of these interactions remains elusive. Many biological reactions involve proteins interactions with nucleic acids and the protein interaction with DNA plays a key role in the cellular regulation and all vital functions. In the present work, it is reported the crystal structure of ConM, a lectin isolated from Canavalia maritima seeds, in complex with Interleukine 1β primer. A cubic crystal, belonging to the F23 space group, was obtained by the diffusion vapor method and submitted to X-ray diffraction. In the structure, an electron density map corresponding to four nucleotides from the interleukin-1β primer was found in the interface of ConM non-canonical dimer. The nucleotides stabilization involves H-bonds and electrostatic forces with the amino acids His127, Ser110, Lys114, Ser190, Asp192, Thr194, His51 and Ser190. Based on these crystallographic results and in a molecular docking simulation, it is hypothesized that the lectin may function as a transcription factor, which could help us to understand some of their biological activities. / Lectinas de leguminosas são historicamente reconhecidas como proteínas de ligação a carboidratos e essa propriedade é ligada à maioria das suas atividades biológicas, tais como pró e antiinflamatórias, apoptose e mecanismos mitogênicos. No entanto, vários estudos demonstraram a capacidade destas proteínas de se ligarem a diversos outros compostos, tais como fitohormônios e moléculas hidrofóbicas, embora a relevância biológica destas interações permaneça indefinida. Muitas reações biológicas envolvem a interação de proteínas com ácidos nucleicos e a interação da proteína com o DNA desempenha um papel chave em toda a regulação celular e das funções vitais. No presente trabalho relatamos a estrutura cristalina da ConM, uma lectina isolada de sementes de Canavalia maritima, em complexo com o primer da Interleucina 1β. Um cristal cúbico, pertencente ao grupo espacial F23, foi obtido através do método da difusão de vapor e submetido à difração de raios X. Na estrutura, o mapa de densidade eletrônica correspondente a quatro nucleotídeos do primer da interleucina-1β foi encontrado na interface do dímero não-canônico. A estabilização dos nucleotídeos envolve pontes de hidrogênio e forças eletrostáticas com os aminoácidos His127, Ser110, Lys114, Ser190, Asp192, Thr194, His51 e Ser190. Com base nestes resultados cristalográficos e em uma simulação de docking molecular, é hipotetizado que a lectina pode funcionar como um fator de transcrição, o que poderia nos ajudar a entender algumas de suas atividades biológicas.
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Efeito anti-inflamatório do MHTP, uma nova molécula do tipo alcaloide tetrahidroisoquilínico

Oliveira, Maria Talita Pacheco de 15 August 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-01T14:16:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2906785 bytes, checksum: 669811c645486b1217a0d8548223c9fc (MD5) Previous issue date: 2014-08-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / A inflamação é uma resposta imune que visa estabelecer a homeostase tecidual durante uma infecção ou lesão. Reconhecida como um processo benéfico, a inflamação pode tornar-se prejudicial quando em excesso. Assim, estratégias terapêuticas que possam atuar na resolução da inflamação são estudadas e desenvolvidas, tendo os produtos naturais e seus derivados um papel de destaque para as descobertas de novas moléculas anti-inflamatórias. Nesse contexto, o alcalóide 1 (3 metoxi-4-hidroxifenil)-7-metoxi-1,2,3,4 tetrahidroisoquinolina (MHTP) foi sintetizado para prospecção de novos compostos com propriedades terapêuticas. Desta forma, o objetivo desse estudo foi avaliar o pontencial anti-inflamatório do MHTP, in vitro e in vivo, utilizando modelo murino de inflamação aguda. Inicialmente, foi avaliada a viabilidade celular em cultura de macrófagos peritoniais tratados com várias concentrações de MHTP. Observou-se que o alcalóide não apresentou citoxidade nas concentrações de 10, 25 ou 50 μM. Nestas concentrações o MHTP inibiu (p < 0,001) em 24%, 47% e 39% respectivamente, a produção de NO de macrófagos estimulados com LPS (1 μg/mL). Além disso, o tratamento com 10 μM de MHTP diminuiu (p < 0,001) os níveis das citocinas IL-1β, IL-6 e IL-10 em 35,7%, 31,0% e 33,4% respectivamente, sem alterar os níveis da quimiocina MCP-1/CCL2 no sobrenadante da cultura de macrófagos. Adicionalmente foi avaliado o efeito anti-inflamatório do MHTP in vivo. O pré-tratamento oral com MHTP (2,5, 5 ou 10 mg/kg) apresentou efeito anti-edematogênico (p < 0,05) no edema de pata induzido por carragenina inibindo a ação da PGE2 mas independente da desgranulação de mastócitos ou atividade da histamina. O alcalóide (2,5 mg/kg) também foi capaz de inibir (p < 0,01) a migração de leucócitos totais em 41,4% para a cavidade peritonial durante a inflamação induzida com carragenina, diminuindo o número de células polimorfonucleares (PMN) (59,6%) e proteínas totais (29,4%), sem alterar células mononucleares (MNs) e os níveis de MCP-1/CCL2, IL-1β, IL-6 e IL-10. Após caracterização do efeito anti-inflamatório, prosseguimos o estudo avaliando a atividade do MHTP no modelo experimental de lesão pulmonar aguda, onde o pré-tratamento com o MHTP (2,5 mg/kg) inibiu (p < 0,001) a migração de células inflamatórias totais e PMNs para os pulmões em 58% e 67,5%, respectivamente, sem alterar os MNs e a quantidade de proteínas totais. Os resultados obtidos nesse estudo nos permite concluir que a molécula MHTP apresenta efeito anti-inflamatório por inibir vários componentes do processo inflamatório inclusive parâmetros relacionados a lesão pulmonar aguda. Portanto, respaldamos o MHTP como um protótipo de molécula com atividade anti-inflamatória no desenvolvimento de novos fármacos a serem utilizados na resolução do processo inflamatório.
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Modulação da resistência a drogas por óleos essenciais em linhagens de Staphylococcus aureus

Cirino, Isis Caroline da Silva 24 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-01T14:16:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1728060 bytes, checksum: 29c473da9426832816bbcb073e84e4f1 (MD5) Previous issue date: 2014-10-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Bacterial resistance to drugs can happen due to different mechanisms. Among these, efflux bombs highlights and these structures are integrant part of membran cell. The increasing incidence of resistant bacteria has undermined the therapeutic value of available antibacterials, creating the necessity, increasingly, the search for alternatives that can reverse or decrease the resistance, as the search for inhibitors of resistance mechanisms. In order to resolve this problem, products from plants (extracts, essencial oils and phytoconstituents) rise as rich research source on drug resistance modulators , that is, drugs that increase antibiotics activity or even revert bacterial resistance. In this work, we investigated how modifiers of antibiotic activity act in Staphylococcus aureus strains that are efflux bombs carriers. The essencial oils used were extracted from Rosmarinus officinalis L., Illicium verum Hook., Cananga odorata, Eucalytus globulus, Pelargonium graveolens , Citrus paradisi, Cymbopogon flexuosus, Melaleuca alternifolia, Mentha Spicata, Origanum vulgare, Cymbopogon Martini, and their major constituents used were 1,8-cineol, Anetol, Trans-Caryophyllene, Citronelol, Limoneno, Citral, Terpenen-4-ol, L-carvone, Carvacrol and Geraniol. Our results show that the natural products evaluated, in general, present significant antibacterial activity, and probably they operate as modifiers of antibiotic activity, strains through reduction of CIM of tested antibiotics (tetracycline, erythromycin and norfloxacin) from 2 to16 fold. The results show that natural products from plants are in fact potential antibiotics adjuvants. / A resistência bacteriana a drogas pode ser ocasionada por diferentes mecanismos. Dentre esses, podemos destacar as chamadas bombas de efluxo as quais são partes integrantes da membrana plasmática. A crescente incidência de bactérias resistentes tem minado o valor terapêutico dos antibacterianos existentes, criando a necessidade, cada vez maior, da busca por alternativas capazes de reverter ou diminuir a resistência. Na tentativa de encontrar uma solução para esse problema, os produtos de origem vegetal (extratos, óleos essenciais e fitoconstituintes) surgem como uma rica fonte de pesquisa na busca de potenciais moduladores da resistência à droga , ou seja, drogas que aumentam a atividade de certos antibióticos ou mesmo revertem a resistência bacteriana. Neste trabalho, avaliamos o efeito modificador da atividade antibiótica em linhagens de Staphylococcus aureus - portadoras das bombas de efluxo - o óleo essencial de Rosmarinus officinalis L., Illicium verum Hook., Cananga odorata, Eucalytus globulus, Pelargonium graveolens , Citrus paradisi, Cymbopogon flexuosus, Melaleuca alternifólia, Mentha Spicata, Origanum vulgare, Cymbopogon Martini e seus constituintes majoritários, 1,8 cineol, Anetol, Trans-Caryophyllene, Citronelol, Limoneno, Citral, Terpinen-4-ol, L-carvone, Carvacrol e Geraniol. Como resultado, observou-se que os produtos naturais avaliados, de maneira geral, apresentaram significativa atividade antibacteriana e podem atuar como modificadores da atividade antibiótica ao reduzirem a CIM dos antibióticos testados (tetraciclina, eritromicina e norfloxacina) de 2 a 16 vezes. Os resultados indicam que produtos naturais de origem vegetal são, de fato, potenciais adjuvantes de antibióticos.
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Dieta do ouri?o-branco, Tripneustes ventricosus (Lamarck, 1816), no Arquip?lago de Fernando de Noronha, PE

Cavalcanti, Augusto Muniz 07 December 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AugustoMC.pdf: 592613 bytes, checksum: 225d64aaa5fdd2313487f3c6c109454b (MD5) Previous issue date: 2007-12-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Sea urchins are benthic macroinvertebrates that inhabit shallow coastal waters in tropical and temperate zones. Urchins are usually classified as generalists or omnivores as they can adjust their diet according to the food resources available in the environment. Due to the strong grazing pressure they may exert, urchins have an important role in marine ecosystems, occupying different trophic levels and stimulating the intensification of the dynamics of communities where they occur. In 2004, a monitoring program focused on the population dynamics of the white sea urchin, Tripneustes ventricosus, has been initiated in the Fernando de Noronha Archipelago. At the same time, a surprisingly lack of information on the species biology has been noted, despite their wide geographical distribution and economic importance in many parts of its range. Hence, this work was developed to provide information on the feeding habits of T. ventricosus in the archipelago. Ten specimens were collected between December 2006 and July 2007 at two sites of the archipelago, Air France and Sueste Bay for biometrics and analysis of gut contents. Test diameters ranged from 9.19 cm (? 1.1) to 10.08 cm (? 0.58). Calculated stomach repletion index (IRE) was higher (p <0.05) in the Air France site and also during January and July. The IRE was not correlated to the gonad index. Fifteen different species of algae were detected in a total of 120 stomachs examined: 4 Chlorophytas, 4 Phaeophytas and 6 Rhodophytas. Food diversity (p <0.05) was higher in December 2006 and January 2007. Although several items had a high frequency of occurrence, they were low represented in terms of weight, and consequently, had a low level of relative importance. The brown algae Dictyopteris spp and Dictyota spp, followed by the green algae Caulerpa verticillata accounted for the greatest importance in T. ventricosus diet, comprising about 90% of the consumed items / Os ouri?os-do-mar s?o macroinvertebrados bent?nicos que habitam ?guas rasas costeiras em zonas tropicais e temperadas. Os ouri?os s?o geralmente classificados como generalistas ou on?voros por adaptarem sua dieta de acordo com a disponibilidade dos recursos alimentares dispon?veis no ambiente. Devido ? forte press?o de pastagem que exercem, os ouri?os possuem importante papel em ecossistemas marinhos ocupando diversos n?veis tr?ficos e estimulando a intensifica??o da din?mica das comunidades onde ocorrem. Em 2004 foi dado in?cio a um programa de monitoramento das popula??es do ouri?o-branco, Tripneustes ventricosus, quando se percebeu a car?ncia de informa??es sobre a esp?cie, apesar de sua ampla distribui??o e import?ncia econ?mica. Dessa forma, o presente trabalho visou obter informa??es referentes aos h?bitos alimentares de T. ventricosus no arquip?lago de Fernando de Noronha. Durante os meses de dezembro de 2006, janeiro, fevereiro, abril, maio e julho de 2007 foram amostrados 10 indiv?duos de T. ventricosus nas regi?es do Air France e na ba?a do Sueste. Foram realizadas biometrias e an?lises dos itens presentes no conte?do estomacal dos organismos. O di?metro m?dio de carapa?a dos ouri?os amostrados variou entre 9,19 cm (? 1,1) e 10,08 cm (? 0,58). Os ?ndices de reple??o dos conte?dos estomacais (IRE) foram mais elevados (p<0,05) na regi?o do Air France e durante os meses de janeiro e julho de 2007. Foi verificado que o IRE variou independentemente do ?ndice gonadal. Quinze diferentes esp?cies de algas foram encontradas nos 120 conte?dos estomacais analisados: 4 Chlorophytas, 4 Phaeophytas e 6 Rhodophytas, sendo que a maior (p<0,05) diversidade alimentar foi observada nos meses de dezembro de 2006 e janeiro de 2007. Apesar da freq??ncia de ocorr?ncia de alguns dos itens ser alta, suas representatividades em peso foram bastante baixas o que lhes confere um baixo ?ndice de import?ncia relativa. As algas pardas dos g?neros Dictyopteris e Dictyota, seguidas da alga verde Caulerpa verticillata representaram a maior import?ncia na dieta de T. ventricosus nas ?reas amostradas, compondo aproximadamente 90% da dieta da esp?cie no local
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An?lise do comportamento e crescimento do camar?o branco Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) em diferentes substratos inconsolidados

Santos, Daniele Bezerra dos 05 December 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DanieleBS.pdf: 1633795 bytes, checksum: 941be4e366543e177b0a19391d2eeb19 (MD5) Previous issue date: 2007-12-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / The aim of this study was to test the sediment preference of L. vannamei shrimp. It was observed shrimp visit frequency, swimming and burying behaviour at different sediment compositions for 24h. Juvenile (0.93 ? 0.29g) and sub-adult shrimps (10.0 ? 1.18g) were obtained from the aquaculture station at Universidade Federal Rural do Semi-?rido UFERSA, and held in a plastic tank (water volume 500 L) supplied with aerated water and kept at constant temperature, pH, and salinity. Shrimp was fed by commercial shrimp dry food. The experimental substrates were composed by A: medium sand + thick sand + very thick sand + gravel; B: very fine sand + fine sand; and C: silt + clay. Thus, six different substrate combinations were tested: A, B, C, A+B, A+C, B+C. To test preference, it was used a cylindrical tank (40 l) divided into six differently substrate compartments. A single shrimp was introduced each tank and the frequency at which this shrimp visited each compartment was recorded over a 24h study period. It was tested 54 shrimp (18 sub-adult males, 18 subadult females and 18 juveniles). For each trial, sediment and water were changed to avoid pheromones and residues influence. Shrimp were weighted and sub-adults were divided by sex: males present petasma and females present thelycum. Data were collected on the experimental day at 19:30; 20:30; 00:30; 1:30; 05:30; 06:30; 13:30 and 14:30 h. At each time point, shrimp were observed for 20-min periods, in which we noted down which compartment the shrimp was occupying at 2-min intervals. Thus, for each period we had eleven observations (88 observations per day). For observations at night, it was used dim red light that did not affect shrimp behaviour. At each 20-min period, it was observed visit frequency in each substrate, if shrimp was burred or not or if it was swimming. There was not significant difference between light and dark burry activity for females. Swimming activity was significantly higher at night, mainly at 00:30 and 01:30 h. All L. vannamei shrimp showed preference for sediment B. This animal presents cyclic activity, spends the day light period buried and swims at night / Este trabalho visou caracterizar a freq??ncia de visita e enterramento como prefer?ncia de sedimento em diferentes sedimentos e a atividade natat?ria dos camar?es Litopenaeus vannamei durante 24 horas. Camar?es juvenis (0,93 g ? 0,29) e pr?-adultos (10,05 g ? 1,18) foram coletados da Esta??o de Aq?icultura da Universidade Federal Rural do Semi-?rido UFERSA, e mantidos por 10 dias em tanques de 500 L, com alimenta??o, aera??o constante, temperatura, pH e salinidade est?veis. Tr?s grupos granulom?tricos foram pr?-estabelecidos como substratos experimentais: C= silte + argila; B = areia muito fina + areia fina; A= areia m?dia + areia grossa + areia muito grossa + cascalho. Seis diferentes combina??es de substratos foram testadas: A, B, C, A+B, A+C, B+C. Utilizou-se tanques cil?ndricos (40L), com fundo preenchido por 6 bandejas. A cada bateria, trocou-se os sedimentos e ?gua, evitando a influ?ncia de ferom?nios e caracter?sticas alteradas do sedimento. Inicialmente pesou-se os camar?es individualmente e os organismos pr?-adultos separados por sexo, com base em caracteres externos: presen?a do petasma nos machos e t?lico nas f?meas. Colocou-se 1 camar?o/tanque, tendo livre e imediato acesso aos diferentes tipos de sedimentos. Para observa??o na fase escura, utilizou-se o aux?lio de luz vermelha. O m?todo de observa??o foi o Animal Focal Instant?neo, com registro a cada 2 minutos, em janelas de 20 minutos, em 8 hor?rios ao longo do dia: 19:30 h; 20:30 h; 00:30 h; 1:30 h; 05:30 h; 06:30 h;13:30 h; 14:30 h, totalizando 88 registros em 24 horas. Utilizou-se 54 camar?es de L. vannamei (18 machos, 18 f?meas e 18 juvenis). Observou-se: a) freq??ncia de visita; b) comportamento de enterramento e desenterrado; c) Atividade natat?ria. Diante dos dados obtidos, observou-se maior freq??ncia de visita??o do L. vannamei, tanto jovem quanto pr?-adulto, no sedimento B. Este animal apresenta atividade c?clica, permanecendo enterrado durante o dia na maior parte dos hor?rios observados e exercendo nata??o durante a noite. N?o houve diferen?a significativa no comportamento de enterramento das f?meas. O comportamento de nata??o foi mais freq?ente na fase escura quando comparada ? fase clara, principalmente nos hor?rios de 00:30 e 01:30 horas
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Eutrofiza??o do reservat?rio Engenheiro Armando Ribeiro Gon?alves, no Rio Grande do Norte: implica??es para o abastecimento p?blico e para a piscicultura intensiva em tanques-rede

Mosca, Vanessa Pereira 03 June 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:01:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VanessaPM.pdf: 789049 bytes, checksum: e9d13460761970df0bf00132d5df08ec (MD5) Previous issue date: 2008-06-03 / ?This study aimed to describe the spatial and temporal patterns of variation in trophic state and its relation with the structure and dynamics of planktonic community of a large reservoir located in semi-arid tropical region of Northeast Brazil. The reservoir Armando Ribeiro Gon?alves is the biggest reservoir of the Rio Grande do Norte State and is responsible for about 53% of all surface water accumulated in the State. The samples of water and plankton were taken monthly in 10 points distributed throughout the longitudinal axis of the reservoir and over a full hydrological cycle. The samples were collected to determine concentrations of total phosphorus, total nitrogen, chlorophyll a and suspended solids (fixed and volatile) and for determining the composition and abundance of phytoplanktonic and zooplanktonic species. During the study period, the reservoir was characterized as eutrophic and there was no trend of increasing the trophic state of the reservoir in the period of drought. The concentrations of total phosphorus and suspended fixed solids decreased towards the dam while the N:P ratios increased in the same direction due to the reduction in the phosphorus concentrations and relative constancy in the nitrogen concentrations. The N:P ratios observed were indicative of greater limitation by phosphorus than by nitrogen. However, as concentrations of both nutrients were high and the water transparency was very low, with secchi depth usually lower than one meter, it seems likely that the planktonic primary production of the reservoir is more limited by the availability of light than the availability of nutrients. High nutrient concentrations coupled with low availability of light may explain the continuing dominance of filamentous cyanobacteria such as Cylindrospermopsis raciborskii in the plankton of the reservoir.These cyanobacteria are potentially toxic and pose a serious environmental problem because it compromises the water quality for public supply, recreation and fishing when present in high densities as in this study. The mesozooplankton of the reservoir was dominated by the calanoid Notodiaptomus cearensis and the cladoceran Diaphanosoma spinulosum. In general, the structure of zooplankton community seems to be particularly influenced by the spatial variation of cyanobacteria. The results of the regression analyses show that both the chlorophyll a concentrations and the cyanobacteria biovolume were more strongly correlated with the nitrogen than with phosphorus and that the water transparency was more strongly correlated with algal biomass than with other sources of turbidity. The maximum load of phosphorus to attain the maximum permissible concentration of total P in the reservoir was estimated in 63.2 tonnes P/ year. The current external P load to the reservoir is estimated in 324 tonnes P / year and must be severely reduced to improve the water quality for water supply and allow the implementation of aquaculture projects that could contribute to the socio-economic development of the region / ?O presente estudo teve como objetivo descrever os padr?es espaciais e temporais de varia??o do estado tr?fico e sua rela??o com a estrutura e din?mica da comunidade planct?nica de um grande reservat?rio localizado na regi?o tropical semi-?rida do Nordeste Brasileiro. O reservat?rio Armando Ribeiro Gon?alves ? o maior reservat?rio do Estado do Rio Grande do Norte e ? respons?vel pela acumula??o de cerca de 53 % de toda a ?gua doce superficial represada no Estado. As amostragens de ?gua e de pl?ncton foram realizadas mensalmente em 10 pontos de coleta distribu?dos ao longo do eixo longitudinal do reservat?rio e ao longo de um ciclo hidrol?gico completo. As amostras foram coletadas para determina??o das concentra??es de f?sforo total, nitrog?nio total, clorofila a e s?lidos suspensos (fixos e vol?teis) e para determina??o da composi??o e abund?ncia de esp?cies fitoplanct?nicas e zooplanct?nicas. Durante o per?odo de estudo, o reservat?rio caracterizou-se como eutr?fico e n?o houve tend?ncia de aumento do estado tr?fico do reservat?rio no per?odo de estiagem. As concentra??es de f?sforo total e de s?lidos fixos em suspens?o diminu?ram no sentido da montante para a jusante do reservat?rio enquanto que as raz?es N:P aumentaram no mesmo sentido devido ? redu??o nas concentra??es de f?sforo e relativa const?ncia nas concentra??es de nitrog?nio. As raz?es N:P observadas foram indicativas de maior limita??o por f?sforo do que por nitrog?nio. No entanto, como as concentra??es de ambos os nutrientes foram elevadas e a transpar?ncia da ?gua muito reduzida, geralmente n?o ultrapassando um metro de profundidade do disco de Secchi, ? muito prov?vel que a produ??o prim?ria planct?nica do reservat?rio seja mais limitada pela disponibilidade de luz do que pela disponibilidade de nutrientes. Elevadas concentra??es de nutrientes aliadas ? baixa disponibilidade de luz podem explicar a persistente domin?ncia de cianobact?rias filamentosas como Cylindrospermopsis raciborskii, no pl?ncton do reservat?rio. Tais cianobact?rias s?o potencialmente t?xicas e representam um grave problema ambiental pois comprometem a qualidade da ?gua para o abastecimento p?blico, a recrea??o e a pesca quando presentes em elevadas densidades, assim como as observadas neste estudo. O mesozoopl?ncton do reservat?rio foi dominado pelo cop?podo calan?ida Notodiaptomus cearensis e pelo clad?cero Diaphanosoma spinulosum. Em geral, a estrutura da comunidade zooplanct?nica parece ser especialmente influenciada pela varia??o espacial das cianobact?rias. Os resultados das an?lises de regress?o mostram que tanto a clorofila a quanto o biovolume de cianobact?rias estiveram mais fortemente correlacionados com o nitrog?nio do que com o f?sforo e que a transpar?ncia da ?gua esteve mais fortemente correlacionada com a biomassa algal do que com as demais fontes de turbidez. A carga m?xima de f?sforo que pode ser lan?ada no reservat?rio visando manter a concentra??o m?xima de P total permitida foi estimada em 63,2 toneladas P/ano. A carga atual que entra no reservat?rio, estimada em 324 ton P/ano, precisa ser drasticamente reduzida a fim de possibilitar a implanta??o de atividades de piscicultura que contribuiriam para o desenvolvimento s?cio-econ?mico da regi?o
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Taxonomia e filogenia das serpentes do g?nero Typhlops Oppel, 1811 (Squamata: Typhlopidae) ocorrentes na Mata Atl?ntica brasileira

Brito, Polyanne Souto de 21 March 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:10:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PolyanneSB_DISSERT.pdf: 1686015 bytes, checksum: 0312d18624e0bc02c340a83074efe56f (MD5) Previous issue date: 2011-03-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Dentre os t?xons de serpentes distribu?dos ao longo da Mata Atl?ntica, os Scolecophidia permanecem como um dos mais ca?ticos quanto ? taxonomia. Das tr?s fam?lias de Scolecophidia, Typhlopidae ? a mais diversa com 265 esp?cies confinadas nas partes mais quentes do mundo e com mais de 70% pertencendo ao g?nero Typhlops. O maior problema taxon?mico e filogen?tico das esp?cies de Typhlops brasileiras, parece estar entre aquelas ocorrentes na Mata Atl?ntica: Typhlops brongersmianus e Typhlops paucisquamus, tendo em vista o baixo n?mero de exemplares utilizados para a descri??o desta ?ltima e a grande similaridade quanto ? folidose entre essas esp?cies em simpatria. Assim sendo, este estudo teve como objetivo revisar taxonomicamente e propor a filogenia para as esp?cies de serpentes da fam?lia Typhlopidae ocorrentes na Mata Atl?ntica brasileira, tratadas pela literatura como T. brongersmianus e T. paucisquamus, utilizando caracteres mer?sticos e morfom?tricos, com o aux?lio de an?lise estat?stica univariada e multivariada, al?m de buscas heur?sticas por ?rvores filogen?ticas mais parcimoniosas. Com base nas an?lises dos dados mer?sticos e morfom?tricos, comparados aos descritos pela literatura, foram identificadas tr?s esp?cies na amostra: T. brongersmianus, T. paucisquamus e T. amoipira, ampliando significativamente a distribui??o geogr?fica das duas ?ltimas, al?m da designa??o de novos caracteres distintivos entre as esp?cies analisadas. Tamb?m foi revelada a exist?ncia de um monofiletismo envolvendo as esp?cies T. amoipira, T. brongersmianus e T. paucisuquamus, sendo que estas duas ?ltimas formam uma topologia de um grupoirm?o mais estreitamente relacionado dentro deste cladograma
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Preval?ncia da infec??o por papilomav?rus humano, herpes simplex tipo 1 e 2 e Chlamydia trachomatis em um segmento da popula??o feminina da grande Natal/RN

Pereira, Valeska Santana de Sena 25 April 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:10:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ValeskaSSP_DISSERT.pdf: 1719910 bytes, checksum: a382c3b69b1e4909a64666f4822bff10 (MD5) Previous issue date: 2011-04-25 / Sexually transmitted diseases (STDs) are among the largest public health problems, especially in developing countries. The acquisition of these infections during early sexual activity is common and many infections have a benign course. However, in some pathogens remain in the state of latency can be reactivated and cause productive infection that may progress to severe forms. In addition, some of them are transmitted vertically resulting in congenital infection, causing immediate damage or long-term child. The classic risk factors for sexually transmitted agents are: early onset of sexual and reproductive health, multiple sexual partners throughout life, use of oral contraceptives and co-infections with different pathogens. We present the results of a cross-sectional study aimed to estimate the prevalence of genital infection by human papillomavirus (HPV), Herpes simplex virus (HSV) and Chlamydia trachomatis (CT) in a segment of the female population of the metropolitan area Christmas, among those who enrolled voluntarily sought, Basic Health Units for the examination of cancer screening cervix in the period 2008 to 2010. All participants, a total of 261 women answered a standard questionnaire by which identified the socio-demographic characteristics, classical risk factors for STDs, reproductive and sexual activity and smoking. Of each patient were obtained two samples, one for the completion of the Pap test for detection of cellular changes and the other processed for DNA extraction and analyzed by PCR (polymerase chain reaction) to detect the three pathogens studied. The population of the study was composed of sexually active women aged between 13 and 79 years, mean 38.7 years, most of them being married, low education levels and low incomes. The majority (87%) had normal results on cytology and only 2.7% had low-grade cytological abnormalities. Prevalence rates were 37.9% for HPV, 4.6% for CT and 26% for HSV. HPV prevalence was higher in women under 25, unmarried and in those who had multiple sexual partners. Women with simultaneous infection by HSV-1 and 2 had higher prevalence of HPV infection. The prevalence of HSV infection showed no association whatsoever with the risk factors analyzed and HSV-1 was the predominant type among the cases of genital HSV infection. The overall prevalence of C. Trachomatis was relatively low, thus providing greater value in younger women aged less than or equal to 20 years / As doen?as sexualmente transmiss?veis (DSTs) est?o entre os maiores problemas de sa?de p?blica, especialmente em pa?ses em desenvolvimento. A aquisi??o dessas infec??es durante o in?cio da atividade sexual ? freq?ente, por?m muitas dessas infec??es t?m curso benigno. Entretanto, em algumas o pat?geno permanecer em estado de lat?ncia podendo ser reativado e causar infec??o produtiva que podem evoluir para formas graves. Al?m disso, alguns delas se transmitem verticalmente, resultando em infec??o cong?nita, causando danos imediatos ou em longo prazo ? crian?a. Os fatores de risco cl?ssicos para agentes sexualmente transmiss?veis s?o: in?cio precoce da vida sexual e reprodutiva, m?ltiplos parceiros sexuais ao longo da vida, uso de contraceptivos orais e co-infec??es por diferentes pat?genos. N?s apresentados os resultados de um estudo transversal, que teve como objetivo, estimar a preval?ncia de infec??o genital pelo Papilomav?rus humano (HPV), pelo v?rus Herpes simples (HSV) e por Chlamydia trachomatis (CT) em um segmento da popula??o feminina da regi?o metropolitana de Natal, arroladas entre aquelas que procuraram voluntariamente, Unidades B?sicas de Sa?de para a realiza??o do exame de rastreamento do c?ncer de colo do ?tero no per?odo de 2008 a 2010. Todas as participantes, num total de 261 mulheres, responderam a um question?rio padronizado por meio do qual foram identificadas ?s caracter?sticas s?cio-demogr?ficas, fatores de risco cl?ssicos para DSTs, atividade sexual e reprodutiva e tabagismo. Foram obtidas duas amostras de cada paciente, uma destinada a realiza??o do exame citol?gico de Papanicolaou para a detec??o de altera??es celulares e a outra processada para a extra??o de DNA, e analisadas por PCR (rea??o em cadeia de polimerase) para a detec??o dos tr?s pat?genos estudados. A popula??o alvo do estudo foi composta por mulheres sexualmente ativas, com idade entre 13 e 79 anos, m?dia de 38,7 anos, sendo a maioria delas casadas, com baixo grau de instru??o e baixa renda. A maioria (87%) apresentou resultado normal no exame citol?gico e apenas 2,7% apresentaram altera??es citol?gicas de baixo grau. Foram encontradas taxas de preval?ncia de 37,9% para HPV, 4,6% para CT e 26% para o HSV. A preval?ncia do HPV foi maior nas mulheres com at? 25 anos, nas solteiras e naquelas que tiveram m?ltiplos parceiros sexuais. As mulheres com infec??o simult?nea por HSV-1 e 2 aprestaram maior preval?ncia de infec??o por HPV. A preval?ncia da infec??o pelo HSV n?o apresentou ind?cio de associa??o com os fatores de risco analisados e o HSV-1 foi o tipo predominante entre os casos de infec??o genital pelo HSV. A preval?ncia geral da C. Trachomatis foi relativamente baixa, apresentado maior valor nas mulheres mais jovens, com idade menor ou igual a 20 anos
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Análise da influência dos polimorfismos rs2228570 e rs1544410 do gene vdr na ocorrência de fissuras labiopalatinas não sindrômicas

Dantas, Vanessa de Melo Cavalcanti 18 July 2017 (has links)
Submitted by Leonardo Cavalcante (leo.ocavalcante@gmail.com) on 2018-04-24T18:00:16Z No. of bitstreams: 1 Arquivototal.pdf: 3392960 bytes, checksum: a273c094efc977ba3eee34158bfcd659 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-24T18:00:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arquivototal.pdf: 3392960 bytes, checksum: a273c094efc977ba3eee34158bfcd659 (MD5) Previous issue date: 2017-07-18 / The cleft lip and palate can be classified according to the affected structures in CL, CP or CLP (combination of both), can be classified into syndromic or non-syndromic fissures, presenting several risk factors. Vitamin D is considered a steroid hormone of great importance because it is involved in fundamental physiological processes. Vitamin D insufficiency is associated with several complications in pregnancy including pre-eclampsia and premature birth, suggesting an important role of this vitamin in maintaining pregnancy and fetal development. The VDR gene is located on the long arm of chromosome 12 and more than 470 polymorphisms were identified in the human VDR gene, among them rs2228570 and rs1544410. The objective of this work was to determine the allelic and genotypic frequencies and the associations of rs2228570 and rs1544410 with the susceptibility for the development of CL/P and CP. A control case study was used, involving 127 double tests of patients attended by the Lauro Wanderley University Hospital, being 74 CL/P and 53 CP with their respective mothers, and 82 healthy doublets attended at the Hospital Cândida Vargas. Genomic DNA from children and mothers was obtained from oral mucosal cells. The genotypes were identified by the Restriction Fragment Length technique (PCR-RFLP) and analyzed using the chi-square test. The difference of the mean age of the mothers presented difference between the control group and the CP group. The percentage of fissured children who presented a family history of clefts compared to control presented significance (p = 0.0001). The genotypic distribution and allelic frequency of rs2228570 in mothers groups and the affected groups was not different from the control group. For the rs1544410 polymorphism the comparison between the children of the CP and control groups showed a significant difference in the genotypic distribution (p = 0.017) and allele frequency presented (p = 0.008) with a predominance of the b allele in the FP group. No significant differences were found for genotypes and allelic frequency of rs1544410 in the mother group. The results of this study suggest that the b allele of rs1544410 may act as a risk factor for development and that the BB genotype may act as a protective factor for CP. / As fissuras labiopalatinas podem ser classificadas, com base nas estruturas afetadas, em fissura labial (FL), fissura palatina (FP) e fissura labiopalatina (FLP), todas podendo constituir anomalias sindrômicas ou não-sindrômicas, apresentando vários fatores de risco. A vitamina D é considerado um hormônio esteróide de grande importância por estar envolvido em processos fisiológicos fundamentais. A insuficiência de vitamina D está associada a várias complicações na gravidez incluindo pré-eclâmpsia e nascimento prematuro, sugerindo um papel importante desta vitamina na manutenção da gravidez e desenvolvimento fetal. O gene VDR está localizado no braço longo do cromossomo 12 e mais de 470 polimorfismos foram identificados no gene VDR humano, dentre eles o rs2228570 e rs1544410. O objetivo deste trabalho foi determinar as frequências alélicas e genotípicas e as associações de rs2228570 e rs1544410 com a suscetibilidade para o desenvolvimento de FL/P e FP. Foi desenvolvido um estudo de caso controle, envolvendo 127 duplas de pacientes atendidos no Serviço de Fissurados do Hospital Universitário Lauro Wanderley, sendo 74 FL/P e 53 FP com suas respectivas genitoras, e 82 duplas de crianças e genitoras saudáveis atendidas no Hospital Cândida Vargas. O DNA genômico de crianças e genitoras foi obtido a partir de células de mucosa oral. Os genótipos foram identificados pela técnica de Comprimento de Fragmentos de Restrição (PCR-RFLP) e analisados utilizando o teste qui-quadrado. A diferença da idade média das mães apresentou diferença entre grupo controle e grupo FP. A porcentagem de filhos fissurados que apresentaram ter histórico familiar de fissuras comparado ao controle apresentou significância (p= 0,0001). A distribuição genotípica e frequência alélica de rs2228570 tanto no grupo de genitoras quanto de afetados não foi diferente do grupo controle. Para o polimorfismo rs1544410 a comparação entre crianças do grupo FP e controle mostrou diferença significativa na distribuição genotípica (p = 0,017) e frequência alélicas apresentou (p= 0,008) com predominância do alelo b no grupo FP. Não foram encontradas diferenças significantes para os genótipos e frequência alélica de rs1544410 no grupo de genitoras. Os resultados deste estudo sugerem que o alelo b do rs1544410 pode atuar como fator de risco de desenvolvimento e que o genótipo BB pode atuar como fator protetor para FP.
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MicroRNA no vírus Epstein-Barr: identificação, predição de alvos e rede de proteínas

Carlos , Angélica Cardoso 27 October 2017 (has links)
Submitted by Leonardo Cavalcante (leo.ocavalcante@gmail.com) on 2018-04-25T12:06:32Z No. of bitstreams: 1 Arquivototal.pdf: 2117961 bytes, checksum: 458d516added97ab516b1c8ae4ec5ddd (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-25T12:06:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arquivototal.pdf: 2117961 bytes, checksum: 458d516added97ab516b1c8ae4ec5ddd (MD5) Previous issue date: 2017-10-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The microRNAs are of great interest in studies on viral infections. In the context of the Epstein-Barr virus (EBV), they act as important regulators of the expression of viral and cellular genes, facilitating viral persistence and oncogenesis. The present work aims to identify viral microRNAs, their target mRNAs and the essential target proteins specifically for Human gammaherpesvirus 4 tipo 2. First, we used the StructRNAfinder and IntaRNA programs to perform the identification tasks of miRNAs and target mRNAs, respectively. Subsequently, we created a network of proteins from the data obtained from the tool online virusmentha and visualized in the program cytoscape. In addition, we performed a topological analysis of the protein interaction network with the cytoscape tool. We found 55 viral miRNAs and 46 mRNAs and identified 10 proteins that were prominent in the protein interaction network. The BTRF1 and BSFR1 proteins exert a greater control in the protein network, although they are proteins of the integument with unknown functions. Thus, we suggest that the BTRF1 and BSRF1 proteins are potential targets for understanding and controlling EBV infections. / Os microRNAs são de grande interesse em estudos sobre infecções virais. No contexto do vírus Epstein-Barr (EBV), eles atuam como importantes reguladores da expressão de genes virais e celulares, facilitando a persistência viral e a oncogênese. O presente trabalho objetiva identificar microRNAs virais, seus mRNAs alvos e as proteínas alvos essenciais específicas para o Human gammaherpesvirus 4 tipo 2. Primeiramente, utilizamos os programas StructRNAfinder e o IntaRNA para realizar as tarefas de idenficação de miRNAs e mRNAs alvos, respectivamente. Posteriormente, criamos uma rede de proteínas a partir dos dados obtidos da ferramenta online virusmentha e visualizamos no programa cytoscape. Além disso, realizamos uma análise topológica da rede de interação de proteínas com a ferramenta cytoscape. Encontramos 55 miRNAs virais e 46 mRNAs e identificamos 10 proteínas que se destacavam na rede de interação de proteínas. As proteínas BTRF1 e BSFR1 exercem um maior controle na rede de proteínas, embora sejam proteínas do tegumento com funções desconhecidas. Assim, sugerimos que as proteínas BTRF1 e BSRF1 sejam alvos potenciais para compreender e controlar as infecções por EBV.

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