Orientador: Fernando Bastos / Banca: Ana Tiyomi Obara / Banca: Roberto Nardi / Resumo: Atualmente é cada vez mais presente, nos livros e manuais didáticos, a utilização da História das Ciências nos conteúdos a serem trabalhados. Entretanto, muitos professores não tiveram contato com essa abordagem em sua formação inicial. Como consequência, essa lacuna gera inseguranças, dúvidas e dificuldades que criam obstáculos para a autonomia docente. Diante desse contexto, a presente pesquisa objetivou contribuir para a formação continuada de uma professora de Biologia e Ciências, de uma escola pública em um município do interior do Estado de São Paulo, que não teve em sua formação inicial contato com a História da Ciência. Na metodologia adoramos o trabalho colaborativo, entre pesquisadores e os sujeitos envolvidos, no intuito de compartiharmos os conhecimentos e experiências para o processo de formação e desenvolvimento dos participantes. Para tanto, utilizamos como tema a história das pesquisas que envolveram a elucidação da estrutura do DNA. Também foram efetuadas entrevistas abertas, reuniões registradas em notas de campo e observação das aulas ministradas pela professora participante da pesquisa. Na análise e discussão dos resultados, utilizamos como referenciais norteadores os Saberes Docentes e a História da Ciência. Os resultados demonstraram que, mesmo com dificuldades provenientes das lacunas da formação inicial, a professora recorreu aos seus saberes experiencias para suprir essas lacunas além de apropriar de saberes provenientes dos programas e livros didáticos e dos saberes produzidos a partir do trabalho colaborativo da presente pesquisa. Também observamos que o trabalho colaborativo entre os envolvidos na pesquisa contribuiu com a formação continuada da professora e favoreceu sua autonomia docente. Assim, essas informações nos conduzem a uma reflexão sobre a importância da relação Universidade e Escola / Abstract: Today it is increasingly necessary in books and texbooks, the use of the History of Science in content to be worked. However, many teachers had no contact with this approach in their initial training. Consequently, this gap creates insecurities, doubts and difficulties that create obstacles to teaching autonomy. In this context, this research aimed to contribute to the continuing education of a teacher of Biology and Science, a public school in a municipality in the state of Sao Paulo, which was not contact with the History of Science in his initial training. In the methodology we adopt we adopt the collaborative work between researchers and those involved in order to share knowledge and experiences to the process of formation and development of the participants. The study used as its theme the history of research involving the elucidation of the structure of ADN. Were also conducted open interviews, meetings recorded in field notes and observation of classes taught by the teacher survey participant. In the analysis and discussion of results, use as benchmarks guiding the Teacher Knowledges and History of Science. The results showed that even with difficulties arising from gaps in initial training, the teacher to their experimental knowledge to address these gaps in addition to appropriate knowledge from programs and textbooks and the knowledge produced from the collaborative work of this research. We also observed that the work involved in collaborative research contributed to the continuing education of teacher and favored teaching autonomy. Thus, this information leads us to reflect on the importance of the University and School / Mestre

Ureases (EC 3.5.1.5) são metaloenzimas que hidrolisam uréia para produzir amônia e dióxido de carbono. Estas enzimas, que são amplamente encontradas em fungos, bactérias e plantas, compartilham de estruturas similares. A presença de urease em várias bactérias patogênicas (Helicobacter pylori e Proteus mirabilis, p.e) está fortemente correlacionada com a patogênese em doenças humanas. Muitos fungos de importância médica possuem atividade ureásica, entre eles citamos Cryptococcus neoformans, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Sporothrix schenckii, e espécies de Trichosporon e Aspergillus. C. neoformans é uma levedura que produz vários fatores de virulência conhecidos, como presença de cápsula polisacarídica, produção de melanina e capacidade de desenvolvimento a 37ºC. A maioria de isolados clínicos produz grandes quantidades de urease e muitos autores sugerem que a urease de Cryptococcus exerça uma função importante na patogênese, porém com mecanismos ainda não esclarecidos. Cryptococcus gattii – sorotipo B, tipo molecular VGII, linhagem R265, com capacidade de infectar pacientes imunocompetentes, causou uma epidemia na Ilha de Vancouver (Canadá) entre 1999 e 2003. Neste trabalho desenvolvemos um procedimento de purificação e apresentamos a caracterização físico-química e cinética da urease de C. gattii, cepa R265, após ter sido purificada na razão de 539 vezes. A massa molecular estimada foi de 120 kDa, Km 2,0 mM para uréia, pH ótimo 8,0. O ácido acetohidroxâmico demonstrou ser um bom inibidor em concentrações micromolares, enquanto ρ-hidroximercuriobenzoato causou inibição em concentrações mais altas, comparado a outras ureases. Espera-se que estudos adicionais com essa urease purificada permitam investigar propriedades biológicas independentes da atividade ureolítica e estabelecer sua contribuição para a patogênese da criptococose. / Ureases (EC 3.5.1.5) are metalloenzymes that hydrolyze urea to produce ammonia and carbon dioxide. These enzymes, which are found in fungi, bacteria, and plants show very similar structures. The presence of urease in many pathogenic bacteria (Helicobacter pylori and Proteus mirabilis) is strongly correlative with pathogenesis in human diseases. Many medically important fungi have urease activity, among which are Cryptococcus neoformans, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Sporothrix schenckii, and species of Trichosporon and Aspergillus. C. neoformans is a heterothallic yeast with several known virulence factors, including a polysaccharide capsule, melanin production, and the ability to grow at 37°C.The majority of clinical isolates produce large amounts of urease and several authors suggest that Cryptococcal urease play an important role in pathogenesis but with unclear mechanisms but probably by different routes dependent and independent of ureolytic activity, althought many questions are unclear. We wanted to further investigate the role of urease in biological properties by using Cryptococcus gattii as a pathogen model. C. gatti – serotype B, molecular type VGII, R265 strain, which has capacity to infect immunocompetent individuals, caused an outbreak on Vancouver Island in Canada from 1999 to 2003. This work presents the physicochemical characterization of a urease from C. gatti strain R265 after a 539 fold purification. The estimated native molecular mass was 120 kDa, Km 2.0 mM urea, pH optimum 8.0. Aceto hydroxamic acid was a strong inhibitor at low concentration while ρ-hidroxy mercuribenzoate needed higher concentrations for inhibition compared to other ureases.

O arroz é umas das mais importantes plantas cultivadas no mundo, sendo constituinte da dieta básica de mais da metade da população humana, inclusive no Brasil. Entretanto, o arroz é um cereal nutricionalmente pobre, apresentando baixas concentrações de metais essenciais, como o ferro e o zinco. Programas de melhoramento e de engenharia genética têm sido empregados na tentativa de melhorar o teor nutritivo dos grãos de arroz. Entretanto, para se alcançar este objetivo é essencial conhecer os mecanismos que envolvem a aquisição de metais, transporte interno e armazenamento nas plantas. A literatura recente tem revelado a existência de diversas famílias de genes candidatos a desempenharem função na homeostase de metais em arroz (genes Yellow Stripe Like, IRT, FRO, MTP, etc). Entre estes, a família Yellow Stripe Like é forte candidata a possuir genes envolvidos na alocação de ferro para o grão, visto que é uma família numerosa (18 genes) de transportadores de ferro, com diferentes isoformas capazes de transportar ferro ligado a fitossideróforos ou a nicotiamina (o principal quelante de ferro intracelular), e com expressão comprovada de pelo menos uma isoforma em células de floema. No entanto, a alocação de minerais para o grão é um processo altamente regulado, que provavelmente requer a atividade de outros genes, com funções ainda desconhecidas. Neste estudo visamos avaliar a contribuição de genes YSL em plantas de arroz e identificar novos genes potencialmente envolvidos com o transporte de metais aos grãos de arroz utilizando diferentes ferramentas: análise de plantas mutantes no gene OsYSL15 por inserção do retroelemento TOS17; avaliação da expressão de genes YSL em folhas bandeira e panículas de arroz em dois estádios de desenvolvimento; construção de uma biblioteca de hibridização subtrativa (SSH) de panículas em dois estádios de desenvolvimento, visando identificar genes com expressão induzida no enchimento dos grãos. Estas diferentes abordagens nos permitiram concluir que: o gene OsYSL15 é fortemente induzido em raízes sob deficiência de ferro, mas não necessário para o desenvolvimento das plantas nas condições estudadas; a função do gene OsYSL15 provavelmente possui sobreposição com as de outros transportadores de ferro, que podem compensar a sua falta; o gene OsYSL18 é um forte candidato a participar dos processos de alocação de minerais para os grãos de arroz. Além disso, foi possível identificar um novo gene, com função ainda desconhecida, com alta expressão em panículas de arroz durante o enchimento do grão. / Rice is one of the most important crops worldwide. Although being a poor source of nutrients, such as iron and zinc, rice is the dietary basis of over half the world's population, including Brazil. Breeding and genetic engineering programs have been employed with the intent to improve the nutritive characteristics in rice grains, including the increase of mineral nutrients, such as iron and zinc. To reach this objective, it is necessary to understand how metal homeostasis occurs in plants, including rhizosphere uptake, internal transport and storage. The recent literature has revealed several families of genes which are candidates to be involved in metal homeostasis in rice (Yellow Stripe Like, IRT, FRO, MTP, etc). Among them, the Yellow Stripe Like family is a strong candidate to contain genes involved with iron allocation to the grain. This is a large family (18 genes) of iron transporters, with different isoforms being able to transport iron chelated to siderophores or to nicotianamine (the main intracellular iron ligand in plants), and with at least one isoform being expressed in phloem cells. However, mineral allocation to the grain is a highly regulated process, which probably requires the activity of other genes, with functions that are still unknown. This study aimed at the evaluation of the contribution of YSL genes and at the identification of new genes potentially involved with metal transport to the rice grain, making use of three different tools: analysis of OsYSL15 mutant plants, containing TOS17 retroelement insertion; gene expression evaluation of YSL genes in rice flag leaves and panicles during two reproductive stages; construction of a panicle subtractive library (SSH) comparing two reproductive stages, in order to identify genes up-regulated during grain filling. These diverse approaches allowed us to reach the following conclusions: the OsYSL15 gene is strongly induced in roots under iron deficiency, but is not necessary for plant development under control conditions; probably there is function overlap between the OsYSL15 gene and other iron transporters, which can compensate for its absence; the OsYSL18 gene is a strong candidate to participate in mineral allocation to the rice grain. Moreover, it was possible to identify a new gene, with still unknown function, which is highly up-regulated in panicles after anthesis.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Vegetal. / Made available in DSpace on 2013-07-16T01:32:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Este estudo tem como principal objetivo investigar as relações filogenéticas das espécies de Phellinus Quélet (Hymenochaetaceae, Basidiomycota) no sul do Brasil (Estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul). Baseia-se, principalmente, nas descrições morfológicas citadas na bibliografia dos dois Estados e, em menor proporção, na análise de espécimes de herbários. No total existem 21 táxons em Santa Catarina e 26 no Rio Grande do Sul. A partir das descrições foram selecionados 20 caracteres e seus respectivos estados para serem analisados com relação a cada táxon. As análises dos dados para os dois Estados, aplicando os métodos neighbor-joining e parcimônia, foram realizadas por separado e posteriormente combinadas. Os resultados obtidos suportam o polifiletismo do gênero e a existência de prováveis grupos monofiléticos menos inclusivos. Assim, algumas espécies tradicionalmente consideradas para o gênero são transferidas para gêneros mais homogêneos como Fomitiporia Murrill e Fuscoporia Murrill. Outros assuntos pertinentes, como o desenvolvimento de sistemas de classificação, de conceitos de espécie e da formação dos agrupamentos dentro de Hymenochaetaceae, além dos atuais e possíveis usos de algumas espécies de Phellinus, são tratadas ao longo do trabalho.

PEREIRA, Clodovagner José Evaristo. O uso de práticas laboratoriais de biologia no ensino médio :um estudo em torno das competências e habilidades. Dissertação (Mestrado Profissional em Ensino de Ciências e Matemática) – Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Rocilda Sales (rocilda@ufc.br) on 2013-02-07T16:07:08Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_cjepereira.pdf: 3647052 bytes, checksum: c74061dc3b8cbeacb52edc6aa8637b18 (MD5) / Approved for entry into archive by Rocilda Sales(rocilda@ufc.br) on 2013-02-07T16:09:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_cjepereira.pdf: 3647052 bytes, checksum: c74061dc3b8cbeacb52edc6aa8637b18 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-07T16:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_cjepereira.pdf: 3647052 bytes, checksum: c74061dc3b8cbeacb52edc6aa8637b18 (MD5) Previous issue date: 2012 / The law number 9394/96 - Law of guidelines and bases for education (LDB) – represents a distinguishable mark in the history of Brazilian education reforms and comes up with the result of the work carried out by different national education sectors. These renovation efforts happened during globalization movement and aimed, mainly, to improve the provided education quality, based on UNESCO established pillars of education. In that moment, there was a pressing urgency to create mechanisms leading to public politics implementation with the aim to upgrade basic education, rising the national index scores to reach the global statistics average. This work was done under the scientific, technological and social education perspectives and presents a study of practical biology lessons driven by abilities and skills development purpose. The research was conducted as a case-study and data was collected in a state public school, located at Fortaleza metropolitan region. Data was collected applying questionnaires to seven biology teachers and also, to fifteen classes of students from high school: five from the first grade, five from the second grade and five from the third one. These data was used to prepare graphs and charts that were employed for further analysis and discussion. Theoretical basis and discussion were based on a plentiful bibliography, containing documents such as LDB, PCN, PCNEM, articles, books, monographs, dissertations and thesis produced by the researchers KRASILCHIK, MOREIRA, NÓVOA, GIL-PÉREZ, LUDKE & ANDRÉ, DEMO, BIZZO, PERRENOUD, PILETTI, MENEGOLLA and others. Obtained results analysis lead us to conclude that biology practical lessons occurred infrequently and their performance and occurrence was under the teacher criterion; there is not a specific time schedule for the practical lessons; teachers and students recognize the importance of experimental activities to enhance students‟ abilities and skills. The present work aims to create a blog containing practical lessons for experiments within PCN required references. / A lei 9394/96 – Lei de Diretrizes e Bases da Educação - (LDB), representa um marco na história das reformas educacionais no Brasil e reproduz em seus artigos o resultado do trabalho exercido pelos diferentes setores do sistema educacional do País. Essa reforma ocorreu em pleno movimento de globalização e teve como principio focal, melhorar a qualidade da educação ofertada, tendo por base os pilares da educação estabelecidos pela UNESCO. Dessa forma, nesse período fica evidente a necessidade da criação de mecanismos que possibilitassem a implementação de políticas públicas, objetivando alavancar a educação básica e elevar os índices estatísticos aos padrões globais. Foi dentro da perspectiva da educação científica, tecnológica e social que o presente trabalho foi desenvolvido e carrega em seu bojo um estudo em torno das aulas práticas de biologia no contexto do desenvolvimento das competências e habilidades. A pesquisa foi realizada dentro da concepção do estudo de caso e para esse fim procedeu-se a coleta de dados em uma escola pública da rede estadual do Ceará, localizada na região metropolitana de Fortaleza. A coleta de dados foi realizada através da aplicação de questionários a sete professores de biologia e a quinze turmas do ensino médio: cinco do primeiro ano; cinco do segundo ano e cinco do terceiro ano. Esses dados foram utilizados na confecção de quadros e gráficos que serviram de fonte para a análise e discussão dos resultados. A fundamentação teórica e a discussão acercaram-se de vasta bibliografia que envolve documentos como a LDB, os PCN, os PCNEM, artigos, livros, monografias, dissertações e teses produzidas por pesquisadores como KRASILCHIK, MOREIRA, NÓVOA, GIL-PÉREZ, LUDKE & ANDRÉ, DEMO, BIZZO, PERRENOUD, PILETTI, MENEGOLLA, entre outros. Através da análise dos resultados obtidos constatou-se que: as aulas práticas de biologia ocorreram sem muita frequência; a realização das mesmas ficou a critério do professor da disciplina; não existe uma carga horária específica para as aulas práticas; professores e alunos reconhecem a importância das atividades experimentais no processo de desenvolvimento das competências e habilidades. O presente trabalho tem o propósito de gerar um blog que disponibilize roteiros de práticas dentro das características exigidas nos pressupostos teóricos dos PCN.

O tratamento com antimicrobianos é a principal estratégia de controle da tuberculose (TB). Entretanto, o aumento do número de casos de TB com cepas de Mycobacterium tuberculosis resistente aos antimicrobianos cria um cenário que dificulta a cura do paciente e o controle da doença. Embora várias mutações em loci específicos tenham sido identificadas como base de resistência, outros mecanismos, como o sistema de efluxo, podem contribuir para a resistência e o estabelecimento dessas mutações. O objetivo deste estudo foi avaliar a contribuição do mecanismo de efluxo em isolados clínicos de M. tuberculosis resistentes aos principais antimicrobianos do esquema básico (isoniazida, INH; e rifampicina, RIF) e de multirresistência (ofloxacina, OFX; e amicacina, AMK). Três clássicos inibidores de bombas de efluxo - EPI - (verapamil, VP; tioridazina, TZ; e clorpromazina, CPZ) foram selecionados para detectar o efluxo. Primeiramente, foram analisadas três cepas MDR, duas pré-XDR e a cepa sensível de referência H37Rv. Foi utilizada a metodologia de checkerboard combinada com o tetrazolium microplate-based assay para analisar a interação entre os EPIs com os fármacos. Foi observado que os EPIs diminuem efetivamente a resistência aos antibióticos utilizados, com reduções de 4 a 64 vezes. Para avaliar a atividade do efluxo em tempo real foi utilizado o método fluorimétrico com o brometo de etídio (BrEt), em presença dos EPIs. Foi demonstrado que todas as cepas apresentaram efluxo intrínseco, porém a acumulação e o efluxo do BrEt foi mais evidente na cepa pre-XDR com resistência adicional a AMK. A quantificação transcricional do RNAm dos genes de bombas de efluxo (mmpl7, mmr, Rv1258, p55, efpA, Rv2459) e do regulador transcricional whib7, quando as cepas foram expostas às concentrações subinibitórias dos antibióticos, foi analisada por RT-qPCR. Houve um aumento do nível transcricional de todos os genes em uma cepa MDR e na cepa Pre-XDR com resistência adicional a OFX, quando expostas a pelo menos um dos fármacos envolvidos na resistência. / Treatment with antimicrobials is the main TB control strategy. However, the increase in the number of TB cases with Mycobacterium tuberculosis strains resistant to antimicrobial creates a scenario that hinders patient's healing and disease control. Although several genetic mutations in specific loci involved in drug resistance have been identified as base of resistance, other mechanisms such as efflux system may contribute to resistance and to the establishment of these mutations. The main goal of this study was to assess the overall contribution of efflux mechanism in M. tuberculosis clinical isolates resistant to the main first line drugs (isoniazid, INH; and rifampicin, RIF) and second line (ofloxacin, OFX; and amikacin, AMK). Three classical inhibitors of efflux pumps -EPI- (verapamil, VP; thioridazine, TZ; and chlorpromazine, CPZ) were selected to detect the efflux. Firstly, we analyzed three MDR strains, two Pre-XDR and an H37Rv reference susceptible strain. We used the checkerboard method combined with the tetrazolium microplate-based assay to analyze the interaction between EPIs and drugs. It was observed that EPIs effectively reduce the MIC of antibiotics, with four-fold to 64-fold reduction. Efflux activity was evaluated in real-time by fluorimetric method with ethidium bromide (EtBr), in the presence of EPIs. All strains showed intrinsic efflux, however the accumulation and efflux of EtBr was evident most in the pre-XDR strain with additional resistance to AMK. The quantification of mRNA transcriptional level of efflux pump genes (mmpl7, mmr, Rv1258, p55, efpA, Rv2459) and the transcriptional regulator, whib7, when strains were exposed to antibiotics subinibitory concentrations was examined by RT-qPCR. There was an increase in the transcriptional level of all genes in a MDR strain and pre-XDR strain with additional OFX resistance, when exposed to at least one of the drugs involved in resistance, INH, RIF or OFX. However, there was no correlation between the reduction of antibiotic resistance levels with the EPI and the expression of genes encoding the pumps. Finally, in order to demonstrate the time to detection (TTD) of the bacterial growth in the antimicrobial environment in presence and absence of EPI, were applied BACTECTM MGITTM system 960 and Epicenter V5.53A equipped with software TB eXiST. Were used the MDR strains, a pre-XDR strain with additional resistance to AMK, and a monorresistant to OFX strain. In general, strains have showed a slower grew in the presence of VP, TZ and/or CPZ when combined with INH or RIF. This suggests that efflux is essential for the strain to grow faster in the presence of certain antibiotics. In addition, the efflux can act synergistically with the presence of mutations in order to reduce the biological cost of the bacteria and promoting growth at high drug concentrations. In conclusion, the described results demonstrated that the efflux system plays an important role in resistance to antibiotics used in the treatment of TB, and that the use of efflux inhibitors may potentiate the antimicrobial activity.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:50:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 323101.pdf: 5463378 bytes, checksum: 1c6eb8d937cfd4eb3a8800de90f97364 (MD5) Previous issue date: 2013 / Realizou-se a análise anatômica da folha e ramicaule em quinze espécies de orquídeas epífitas pertencentes à subtribo Pleurothallidinae, sendo três espécies do gênero Anathallis Barb. Rodr. (Anathallis dryadum (Schltr.) F. Barros, Anathallis linearifolia (Cogn.) Pridgeon & M. W. Chase, Anathallis sp.); oito espécies do gênero Octomeria (R. Br.) Pridgeon & M. W. Chase (Octomeria crassifolia Lindl., Octomeria diaphana Lindl., Octomeria gracilis Lodd. ex Lindl., Octomeria grandiflora Lindl. Octomeria sp1, Octomeria sp2, Octomeria brevifolia Cogn., Octomeria warmingii Rchb.f.,); uma Pabstiella fusca Lindl.; duas espécies de Specklinia Lindl.(Specklinia podoglosa (Hoehne) Luer e Specklinia punctatifolia (Barb.Rodr.) Luer) e uma Trichosalpinx montana (Barb.Rodr.) Luer, afim de se diagnosticar caracteres que possam ser utilizados na distinção entre os gêneros e/ou espécies fornecendo subsídios à taxonomia do grupo. Utilizou-se como caracteres morfo-anatômicos para distinção entre os gêneros: Presença ou ausência de idioblastos contendo algum tipo de cristal prismático, ornamentação na cutícula, presença ou ausência de barras de espessamento, presença ou ausência de tricomas em depressão na epiderme, disposição do mesofilo, presença ou ausência de feixes diferenciados no bordo foliar, morfologia da folha e ramicaule em secção transversal, formato de células epidérmicas, presença e ausência de hipoderme no ramicaule. Tendo em vista, que o número de espécies estudadas para os gêneros Anathallis, Specklinia, Pabstiella e Trichosalpinx foi relativamente baixo, algumas das características anatômicas levantadas para estas espécies podem ser consideradas próprias da família ou do gênero, consequentemente, não podem ser utilizadas para fins taxonômicos. Entretanto, em algumas espécies do gêneros Octomeria, foi possível identificar caracteres específicos, como a ocorrência de ráfides, presença de parênquima paliçádico, ausência de tricomas em depressão e ausência de células epidérmicas com parede periclinal plana na face abaxial, são características importantes na identificação de cada uma delas.<br>

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:53:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 325242.pdf: 3637864 bytes, checksum: 0ee3a47dd4cef3e28e4e38a685b72625 (MD5) Previous issue date: 2013 / As algas calcárias não articuladas compreendem cerca de 600 espécies e estão amplamente distribuídas em todos os oceanos, desde regiões tropicais até regiões polares e encontram-se da zona entre marés até 268m de profundidade. Muitas espécies são reconhecidas por ter uma ampla distribuição. Contudo, o uso de epítetos para espécimes morfologicamente semelhantes provenientes de localidades distantes, deve ser utilizado com cautela. Barreiras impostas à dispersão pela distância e condições ecofisiológicas, ou ainda, morfologias semelhantes como resultante de convergência evolutiva podem ter levado ao surgimento de espécies crípticas entre as Hapalidiaceae. No presente estudo, uma nova espécie de Mesophyllum é descrita para a província tropical brasileira e duas novas espécies de Lithothamnion para o estado do Espírito Santo, com base em dados morfológicos e moleculares. M. cf. incisum e M. cf. engelhartii também foram identificadas. Contudo, as divergências encontradas para os marcadores psbA e rbcL, quando comparadas a sequências disponíveis no GenBank, sugere a existência de espécies distintas sob o mesmo epíteto. Os espécimes brasileiros, incluindo a localidade tipo de M. erubescens, foram caracterizados morfologicamente e molecularmente. Após exaustiva comparação morfoanatômica, não foram observadas características diagnósticas de eventuais diferenças intra ou interespecíficas. Por outro lado, os dados de DNA plastidial indicam que as características morfológicas utilizadas na delimitação de M. erubescens não refletem a diversidade do taxa, este que deverá ser subdividido em pelo menos 12 novas espécies. Dessa forma, o uso da técnica de DNA Barcoding como uma ferramenta é fundamental na determinação de espécies e, eventualmente, de representantes deste complexo em outras regiões do planeta.<br> / Abstract : Non-geniculate coralline algae comprise about 600 species and are widely distributed in all oceans, from the tropics to the polar regions and are found from the intertidal zone to 268m depth. Many species are recognized to have a wide distribution. However, using epithets to morphologically similar specimens from distant localities should be used with caution. Barriers imposed to dispersal by distance and ecophysiological conditions, or even similar morphologies as the result of convergent evolution may have led to the emergence of cryptic species among Hapalidiaceae. In the present study, a new species of Mesophyllum is described for the Tropical Brazilian Province and two new species of Lithothamnion for the Espírito Santo state based on morphological and molecular data. Mesophyllum cf. incisum and Mesophyllum cf. engelhartii were also identified. However, the differences found for the markers psbA and rbcL compared to sequences available in GenBank, suggesting the existence of distinct species under the same epithet. Brazilian specimens, including the type locality of M. erubescens, were characterized morphologically and molecularly. After exhaustive morphological and anatomical comparison, diagnostic features were not found of any intra or interspecific differences. Plastidial DNA data indicate that morphological characteristics used in the delimitation of M. erubescens do not reflect the diversity of the taxa, which must be subdivided into at least 12 new species. In so doing, the use of DNA Barcoding is critical in determining species and eventually representatives of this complex in other regions of the world.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:08:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326354.pdf: 3198757 bytes, checksum: 56434bf89de770ca5875a57e0d968a3d (MD5) Previous issue date: 2014 / O conhecimento sobre os fungos boletoides nas regiões tropicais e subtropicais do hemisfério sul ainda é bastante limitado, havendo escassez de dados acerca da diversidade e distribuição dos mesmos. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento de Boletaceae foram estudados materiais coletados em diferentes regiões do Brasil. Quatorze táxons foram identificados em cinco gêneros (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella e Tylopilus), sendo que sete são espécies novas: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA) e T. versiformis (PB). Tylopilus balloui foi registrado pela primeira vez para o Brasil. Fistulinella cinereoalba foi registrada pela primeira vez para o Brasil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus foi registrado pela primeira vez para o Espírito Santo e A. festivus é o primeiro registro para Santa Catarina. Boletellus ananas e B. cf. lepidospora foram recoletados nas florestas brasileiras. Para todos os táxons são apresentadas fotografias dos basidiomas, descrições macro e micromorfológicas com ilustrações e microscopia eletrônica de varredura (MEV) dos basidiosporos. Os resultados mostraram uma diversidade pouco conhecida de Boletaceae nas florestas brasileiras e uma indicação de que ainda há mais novidades para a ciência no que diz respeito a essa família. O incremento no conhecimento dos táxons de Boletaceae e a importância ecológica da família devido à associação com plantas hospedeiras dá subsídios importantes para planos de conservação em áreas onde esses táxons ocorrem.<br> / Abstract : Knowledge about boletoid fungi in tropical and subtropical regions of the southern hemisphere is still quite limited and few data regarding their diversity and distribution are available. In order to contribute to the knowledge of the diversity of Boletaceae, specimens from different regions of Brazil were studied. A total of 14 taxa belonging to five genera (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella and Tylopilus) have been identified, from which seven are new species: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA), and T. versiformis (PB). Tylopilus balloui was registered for the first time for Brasil. Fistulinella cinereoalba was registered for the first time for Brazil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus was registered for the first time for Espírito Santo, and A. festivus is a new record for Santa Catarina. Boletellus ananas and B. cf. lepidospora were recollected in the Brazilian forests. Photographs of the basidiomes, fully macro and microscopic descriptions with illustrations, and Scanning Electron Microscopy (SEM) of the basidiospores are presented for each species. The results showed that the diversity of Boletaceae in Brazilian forests is still not very well known and indicates that there are more new species for science to be described. The increase in the knowledge about the Boletaceae and the ecological importance of the family due to the association with plants provides data to build conservation plans in areas where these taxa grow.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:39:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328006.pdf: 3134045 bytes, checksum: 0c529b95db533c6fce2e97dff34a4b67 (MD5) Previous issue date: 2014 / Phellinus s.l., um agrupamento artificial e heterogêneo, compreende muitas espécies e complexos taxonômicos. Um dos casos mais clássicos é o complexo Phellinus rimosus, táxon que em um senso morfológico amplo compreende espécimes com basidiomas ungulados, superfície rimosa e negra, 3-5 poros/mm, ausência de setas e esporos subglobosos e marrons. A partir desta ampla delimitação morfológica o táxon é considerado também de ampla distribuição geográfica. Entretanto, alguns autores sugerem que a espécie apresenta uma distribuição restrita a regiões semiáridas da América do Norte e Central, África e Ásia. Sendo improvável inclusive a sua ocorrência na América do Sul. Nesse contexto, registros de outras regiões representariam outras espécies. No entanto, espécimes com morfologia semelhante, encontrados nas regiões semiáridas neotropicais, ainda são tradicionalmente determinados como P. rimosus. No presente trabalho, com intuito de realizar uma revisão taxonômica do táxon, foram estudados espécimes oriundos de regiões semiáridas da região Neotropical (Caatinga no Brasil, Bosques Tropicais Estacionalmente Secos do Peru e Chaco Argentino) e comparados com materiais Tipos e/ou de táxons próximamente relacionados ao complexo (Phellinus robiniae, P. coffeatoporus, P. resinaceus, P. merrillii e P. piptadeniae). Dos 102 materiais estudados, dos caracteres morfológicos analisados em detalhe, foram observados um sistema hifal monomítico no contexto e dimítico nos tubos, assim como a reação xantocroica dos esporos. Ainda, todos os espécimes apresentaram estados de caracter que os distanciaram do lectótipo de P. rimosus na Análise de Componentes Principais, representando inclusive grupos morfológicos distintos entre si. Além disso, a análise filogenética (nucLSU e ITS) dos materiais apresenta clados em/ou próximos a Fomitiporella, Fulvifomes e Inocutis. Também, foi observada a correlação de espécimes/espécies com hospedeiros em particular e/ou agrupamentos relacionados a uma distribuição geográfica mais restrita. Entre as espécies relacionadas ao complexo P. rimosus, P. piptadeniae é caracterizada principalmente por apresentar uma evidente linha negra no contexto e os espécimes morfologicamente semelhantes, coletados em diferentes hospedeiros de leguminosas no Peru, ampliam a distribuição do táxon para além da Mata Atlântica e Caatinga. Por fim, dentre os materiais estudados, procedentes das regiões semiáridas neotropicais, há espécies distintas, que representam inclusive novidades científicas (espécies e/ou gêneros), e nenhuma delas necessariamente corresponde à P. rimosus.<br> / Abstract : Phellinus s.l., an artificial and heterogeneous group of many species and taxonomic complex. Phellinus rimosus complex is a classic case that in a broad morphological sense comprises specimens with ungulate basidiomata, black and rimose upper surface, 3-5 pores/mm, absence of setae and subglobose and brown reddish spores. In this context is also considered a widely distributed taxon. However, some authors suggest that the species has restricted distribution for semiarid regions of North and Central America, Africa and Asia, being its occurrence probably not possible for South America and records from other regions represent other species. However, specimens with similar morphology, found in neotropical semiarid regions, are still traditionally determined as P. rimosus. In the present work, in order to review taxonomic this taxon, specimens from semi-arid regions of the Neotropics were studied (Caatinga in Brazil, Seasonally Tropical Dry Forests of Peru and Chaco in Argentina) and compared with type and/or related taxa material (Phellinus robiniae, P. coffeatoporus, P. resinaceus, P. merrillii and P. piptadeniae). Morphological analysis in detail of 102 materials reveled for all specimens a monomitic hyphal system in the context and dimitic in the trama of tubes, as well as xanthocroic spores. Still, all specimens present different character states of the P. rimosus lectotype on Principal Component Analysis, including representatives and distinct morphological groups among them. Furthermore, phylogenetic analysis (nucLSU and ITS) present clades in/or near Fomitiporella, Inocutis and Fulvifomes. The correlation of specimen/species with particular hosts and/or groups related to a geographical distribution was also observed. Among the species related to P. rimosus complex, P. piptadeniae is characterized mainly by presenting a distinct black line in the context and morphologically similar specimens, collected in different legume hosts in Peru, extend the distribution of the taxon beyond the Atlantic Forests and Caatinga biome. Finally, among the studied materials from neotropical semiarid regions, there are different species, some of them are new (species and/or genera) and none necessarily correspond to P. rimosus.