Com o intuito de estudar o banco de dados da raça Pardo Suíço Corte no Brasil, foram estimados parâmetros genéticos para características de desenvolvimento ponderal e ganhos de peso pré e pós-desmama, perímetro escrotal e características de carcaça de animais dessa raça e seus cruzamentos, utilizando ultra-sonografia. As características de peso analisadas foram peso ao nascimento (PN), aos 120 dias (P120), aos 205 dias (P205), aos 365 dias (P365), aos 450 dias (P450) e peso aos 550 dias (P550), os ganho de peso analisados foram ganho de peso do nascimento aos 205 dias (GPN205), do nascimento aos 120 dias (GPN120), dos 120 aos 205 dias (GP120205), dos 205 aos 365 dias (GP205365), dos 205 aos 450 dias (GP205450), dos 205 aos 550 dias (GP205550), dos 365 aos 550 dias (GP365550), dos 365 aos 450 dias (GP365450) e ganho de peso dos 450 aos 550 dias (GP450550). Os perímetros escrotais foram analisados aos 205 dias (PE205), aos 365 dias (PE365), e aos 550 dias (PE550). Os componentes de co(variância) foram estimados utilizando-se metodologia de modelo animal completo, com o uso do programa MTDFREML. A matriz de parentesco continha 35.188 animais, sendo 18.688 com registros de produção. Para os pesos pré-desmama os coeficientes de herdabilidade aditiva direta e materna aumentaram sua magnitude do nascimento até a desmama. Nos pesos pós-desmama foi observada grande influência materna até os 550 dias de idade. Pode ser esperada boa resposta à seleção para perímetro escrotal tanto aos 205 como aos 365 dias de idade, havendo alta correlação genética entre estas características. O ganho de peso pré-desmama demonstrou grande influência materna até os 120 dias, e ambiental após esta data. Para o ganho pós-desmama foi observado importante efeito ambiental. A correlação genética entre os pesos foi maior quanto mais próximas foram as pesagens e não foi observada relação importante entre pesos e perímetro escrotal, indicando independência entre estas características. As correlações genéticas entre pesos e ganhos de peso foram maiores entre o ganho e o peso do limite superior do relativo ganho de peso. Devido ao pequeno volume de dados obtidos, estudos complementares são necessários para as características de carcaça. Este estudo possibilitará que seja melhor delineado o programa de melhoramento genético da raça Pardo Suíço Corte no Brasil. / The aim of this study was to investigate a database of the Braunvieh cattle in Brazil, to estimate genetic parameters for growth traits, preweaning and postweaning weight gains and scrotal circumference, as well as carcass traits in purebreed and crossbreed Braunvieh cattle. The growth traits analyzed were birth weight (PN), weight at 120 days (P120), 205 days (P205), 365 days (P365), 450 days (P450) and weight at 550 days (P550), Weight gains traits analyzed were, weight gain between birth and 205 days (GPN205), birth and 120 days (GPN120), 120 and 205 days (GP120205), 205 and 365 days (GP205365), 205 and 450 days (GP205450), 205 and 550 days (GP205550), 365 and 550 days (GP365550), 365 and 450 days (GP365450), 450 and 550 days (GP450550). The scrotal circumference was analyzed at 205 days (PE205), at 365 days (PE365), and at 550 days of age (PE550). The (co)variance components were estimated by full animal model, using MTDFREML program. The relationship matrix contained 35.188 animals, and 18.688 with production records. For the preweaning weights the coefficients of direct and maternal additive heritability increased your magnitude from the birth to weaning. In the postweaning weights were observed great maternal influence until the 550 days of age. Interesting response to selection can be expected to the selection for scrotal circumference realized at 205 and 365 days of age, due to high genetic correlation between these traits. The preweaning gain demonstrated great maternal influence until the 120 days, and environmental effect after this age. For postweaning gain great environmental effect was observed. Genetic correlation between the weights was larger for weights taken in shorter interval. Important relationship was not observed between weights and scrotal circumference, indicating independence between these characteristics. The genetic correlations between weights and weight gains were larger between the gain and the weight of the superior limit of the relative weight gain. Due to small amount of records for carcass traits, further studies are necessary to evaluate them. This study can contribute for the better delineated programs for genetic improvement of Braunvieh cattle in Brazil.

O estudo das características de temperamento e resistência de bovinos ao carrapato visa a obtenção de animais possuidores de genótipos que levam a altas produções mas que sejam também adaptados ao meio ambiente de criação extensiva no Brasil. Esses animais produtivos e adaptados poderiam otimizar os custos e tornar a produção mais rentável. O temperamento é uma característica importante dentro do sistema de produção de gado de corte. Animais nervosos ou muito reativos são indesejáveis, principalmente por apresentarem risco às pessoas que os manejam e para si próprios, gerando custos adicionais para sua produção. O carrapato que mais compromete a produtividade da pecuária bovina é o Boophilus microplus. A infestação com esses ectoparasitas é considerada, atualmente, um dos principais entraves à intensificação das pecuárias de leite e de corte. A validação de marcadores moleculares ligados ao temperamento e a resistência ao carrapato torna possível estudar com mais precisão os efeitos dos genes envolvidos nesta característica. A proposta do presente trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e caracterizar as frequências gênicas e genotípicas de vários polimorfismos e estudar seus efeitos nas características de temperamento e em várias maneiras de mensuração da resistência ao carrapato, em bovinos da raça Nelore. As estimativas de herdabilidade, no geral, tiveram média-baixa herdabilidade, com exceção de temperamento. Foi verificada a presença dos polimorfismos, desenvolvidos em bovinos de origem Bos taurus, nos animais da raça Nelore. Para diversos polimorfismos foi possível identificar o alelo favorável para uma dada característica. Justificando, assim, o uso de marcadores moleculares para um resultado mais acelerado em programas de melhoramento genético. / The study on traits like docility and resistante to ticks aims to help selection os animals with better genotypes to those traits, to increase productivity, but also keep adptation of those animals to the environment of extensive production systems used in the Brazilian beef production. Those animals, adapted to thse environmental conditions, should also optimize costs and increase profitability of the whole system. Docility, or temperament is an important trait in beef cattle production. Wild or nervous animals are very reactive, and can be risky to handle, not only to cattleman, but also for them, causing wounds and a decrease of their carcasses or production. The tick infestiation, specially with the species Boophilus microplus, can cause important losses for beef industry, being considered an important problem for that production. The validation of the use of genetic markers in selection for traits linked to temperament and tick resistance, by the study of association of the genotypes and the phenotypes or estimated genetic values allows to understand those relationships and indicate the possible use of those markers in selection of those traits. The objectives of this study were to estimate genetic parameters and define gene and genotype frequencies of several polymorphisms of single basis DNA markers (SNPs) of traits linked to docility and tick resistance, besides developing different methodologies to measure tick resistance in Nellore beef cattle reared in a tropical area on southeastern Brazil. Heritability estimates varied, in general, from low to medium for all traits, but temperament, where the estimates were high. Several markers, originally discovered in Bos Taurus, showed polymorphism in the Nellore population studied. For several os the studied markers, it was possible to indicate the allele that was favorable to the traits. In this study, the evidences suggest that the use of genetic markers should speed up the response to selection for those traits in breeding programs.

O objetivo do presente estudo foi avaliar o desempenho, características de carcaça e qualidade de carne de bovinos Nelore com diferentes potenciais genéticos para crescimento pós-desmama pela diferença esperada na progênie (DEP). Foram utilizados 147 machos não-castrados da raça Nelore, com peso corporal médio inicial de 412 ± 54kg e média de idade de 19 meses, provenientes de recria em sistema de pastejo contínuo. Os animais foram distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado e divididos dois tratamentos em função do potencial genético para crescimento: 1) alta taxa de crescimento (TC+) representada pela média de 11,50 kg e 2) baixa taxa de crescimento (TC-) representada pela média de -1,0 kg. Os animais foram confinados por um período de 100 dias, sendo os primeiros 21 dias de adaptação à dieta e as instalações. A dieta continha 73% de concentrado e 27% de volumoso (silagem de milho). No início do período experimental e a cada 28 dias todos os animais foram pesados e submetidos a avaliações de ultrassonografia. A ingestão de matéria seca foi avaliada diariamente, para ajuste da oferta e avaliação da eficiência alimentar. Ao fim do período de confinamento, todos animais foram abatidos, o peso de carcaça quente e a gordura pélvica, renal e inguinal foram pesados. Após 24 horas, foi avaliado o pH final e a meia carcaça esquerda foi seccionada entre a 12ª e 13ª costelas. As meias carcaças seguiram para desossa completa para análise de rendimentos dos cortes cárneos comerciais, em seguida amostras foram retiradas do contrafilé para posterior análise de cor, perdas de peso por cozimento, força de cisalhamento, comprimento de sarcômero e análise sensorial. Houve efeito da TC sobre o peso corporal final (P = 0,04), sendo que os animais de alta TC apresentaram maiores pesos. Não houve efeito da TC para AOL, EGS e espessura de gordura da picanha (Biceps femoris) avaliados pela ultrassonografia; no entanto, houve diferença significativa para o período de coleta das imagens (P < 0,05). Com relação ao rendimento dos cortes cárneos comerciais, animais de alta TC tiveram a ponta de peito (P = 0,01) e músculo traseiro (P = 0,07) mais pesados em relação aos animais de baixa TC. A DEP não influenciou a qualidade das características sensoriais da carne dos animais exceto para a cor, sendo que os valores de L* (P = 0,03) foram maiores para animais de baixa TC, no entanto, os maiores valores de a* (P = 0,06) foram expressados pelo grupo de alta TC. Além disso, para todas as variáveis de qualidade, houve efeito do tempo de maturação (P > 0,05). Em conclusão, o potencial genético para o crescimento pós-desmama não afetou a maioria das características, incluindo desempenho, produção de carne e qualidade no final do período de terminação. / The aim of this study was to evaluated the performance, carcass characteristics and meat quality of Nellore young bulls with different genetics potentials for post-weaning growth for expected progeny differences (EPD\'s). A total of 147 Nellore bulls with average initial body weight (412 ± 54kg) and 19 months old, were distributed in a completely randomized design and divided into two groups according with growth rate: 1) high growth rate (GR+) represented by the mean of 11.50 kg and 2) low growth rate (GR-) represented by the average of -1.0 kg . The animals were in a feedlot system for a total 100 days, with the first 21 days of adaptation to the diet and facilities. The finishing diet was composed by 73 % concentrate and 27 % corn silage. At the beginning of the experimental period and every 28 days all animals were weighed and submitted to ultrasound evaluations. Dry matter intake was measured daily. At the end of the feedlot period, all animals were slaughtered and the hot carcass weigth and internal fat were recorded. After 24 hours, the final pH was evaluated and the left half carcass was sectioned between the 12 th and 13 th ribs. The half carcass was completely deboning to analyze the wholesale cuts. In addition, longissimus was sampled to analyze color, cooking loss, tenderness, sarcomere length and sensory property. There was an effect of GR on the final body weight (P = 0.04), where the group of animals with high EPD presented higher weights. There was no effect of GR for longissimus muscle area (LMA), fat thickness (FAT) and rump fat (Biceps femoris) evaluated by ultrasonography; however, there was a significant difference for the collection period (P > 0.05). Regarding the wholesale cuts, animals of higher GR had the heavier (P = 0.01) and hind muscle (P = 0.07) weights than the animals of lower GR. The GR did not influence the quality sensory characteristics of the meat of the animals except for the color, and the values of L* (P = 0.03) were higher for animals with low GR, however, the highest values of a* (P = 0.06) were expressed by the high GR group. In addition, for all quality variables, there was an effect of maturation time (P > 0.05). In conclusion, the potential genetic for growth measured post-weaning did not affect most traits, including performance, meat production and quality at the end of finishing period.

Esta pesquisa teve como objetivo avaliar os efeitos da imunocastração e de diferentes beta-agonistas (BAA) sobre características de carcaça e rendimento dos cortes comerciais, de animais machos da raça Nelore, terminados em confinamento. Foram avaliados 96 bovinos, divididos em dois grupos, imunocastrados e não-castrados. Após 70 dias de confinamento, os animais foram divididos em três grupos e alimentados com uma das seguintes dietas: CON - dieta padrão, sem a adição de BAA; ZIL - dieta padrão acrescida Cloridrato de Zilpaterol (80 mg/animal/dia) e RAC - dieta padrão acrescida Cloridrato de Ractopamina (300 mg/animal/dia). Após 24 horas de resfriamento, foram obtidos o peso da carcaça fria (PCF) e rendimento de carcaça fria (RCF), além das perdas por refrigeração (PR). Em seguida foram obtidos os pesos e as percentagens do dianteiro, traseiro pistola e ponta de agulha de cada um dos cortes individuais e do total da porção comestível. Não houve interação entre a condição sexual e os tratamentos. Não houve efeito da condição sexual e de BAA sobre o PCF, PR e EGS, entretanto, animais do tratamento ZIL apresentaram maior RCF em comparação ao CON e RAC, que não diferiram entre si. Animais não castrados apresentaram maior peso dos cortes primários e dos cortes individuais. Com relação aos BAA, os maiores pesos e percentagens de cortes primários e individuais foram observados para o tratamento ZIL em comparação ao CON. O tratamento RAC apresentou valores intermediários em relação aos demais. Os BAA aumentam o peso e a percentagem dos cortes das carcaças em relação a animais sem BAA. / This research aimed to evaluate the effects of different immunocastration and beta-agonists on carcass traits of male Nellore, finished in feedlot. Evaluated 96 cattle and divided in two groups, non-castrated e immunocastrated. After 70 days of feedlot, the animals were divided into three groups and fed one of the following diets: STD - standard diet used, without addiction of BAA; ZIL - standard diet plus zilpaterol hydrochloride (80 mg/animal/day) e RAC - standard diet plus ractopamine hydrochloride (300 mg/animal/day). After 48 hours of cooling, the cold carcass weight (CCW) and cold dressing percentage (CDP) were obtained, in addition to cooling losses (CL) and subcutaneous fat thickness (SFT). Then the weights and percentages of the forequarter, hindquarter and side cut of each of the individual sections and the total edible portion were obtained. There was no interaction between sex condition and treatments. No effect of sex condition and BAA about the CCW, CL and SFT, however, the animals of ZIL treatment showed higher CDP compared to STD and RAC, which did not differ. Uncastrated animals showed greater weight of primal cuts and individual cuts. With respect to the BAA, the higher weight percentages of primary and individual sections were observed for treatment ZIL compared to CON. The RAC treatment showed intermediate values in relation to others. The BAA increases the weight and the proportion of the carcass cuts compared to animals without BAA.

Há grande preocupação por parte da população com o consumo de gorduras saturadas, e a carne bovina é geralmente tida como importante fonte da mesma. A gordura intramuscular não pode ser separada da carne para o consumo, por isso a manipulação do perfil de ácidos graxos da carne (AG's) se torna de suma importância para se obter uma carne bovina com riscos reduzidos a saúde humana. Este estudo teve como objetivo identificar regiões que influenciam na composição de AG's da carne de bovinos Nelore.para isso foi realizado análise de perfil de ácidos graxos para quantificação de ácido esteárico (C18:0), ácido palmítico (C16:0), ácido linoleico (C:18:2; 9,12 ω6), ácido linoleico conjugado (CLA) (C18:2; c9, t11), ácido linolênico (C18:3; 9,12,15 ω3), ácido oleico (C18:1; 9 ω9), do músculo Longissimus dorsi de 929 animais, que foram genotipados com o chip de alta densidade (Illumina SNP800 BeadChip).para a realização do estudo de associação ampla de genoma (GWAS), para a identificação de regiões associadas às características de interesse , e posterior identificação de genes candidatos posicionais. Para isto foram utilizados 929 bovinos da raça Nelore para a genotipagem com chip de 770K, amostras do músculo Longissimus dorsi foram coletadas para análise do perfil de AG's. Foram encontradas 148 regiões que explicam mais do que 0,04% da composição dos seis AG's avaliados. As regiões explicam em porcentagem da variação fenotípica: 1,24% para C18:0, 1,01% para C16:0, 2,31% para:18:2;, 1,34% para CLA C18:2;, 1,74% para C18:3, 1,83% para C18:1. Foram encontrados no presente estudo, 85 QTL's descritos na literatura relacionados a outras raças. Um total de 107 genes candidatos posicionais foram encontrados no presente estudo relacionados ao metabolismo de AG's. Os resultados deste estudo ajudam a elucidar as regiões que influenciam o perfil de AG da carne possibilitando sua utilização em programas de seleção assistida, com impacto a saúde humana / There is great concern among the population with the consumption of saturated fats, and beef is generally viewed as an important source of it. Intramuscular fat can not be separated from meat for consumption, so the handling of the meat fatty acid profile (AG's) becomes extremely important to obtain a beef with reduced risks to human health. This study aimed to identify regions that influence the AG's composition of Nelore meat there for was accomplished profile analysis of fatty acids for quantification of stearic acid (C18: 0), palmitic acid (C16: 0), linoleic acid (C: 18: 2; 9.12 - ω6), conjugated linoleic acid (CLA) (C18: 2; c9, t11), linolenic acid (C18: 3; 9,12,15 - ω3), oleic acid (C18 1; 9 ω9), of Longissimus dorsi of 929 animals genotyped with high density chip (Illumina BeadChip SNP800) for the realization of wide genome association study (GWAS), for identify regions associated with characteristics of interest, and subsequent identification of positional candidate genes. 929 Nelore bulls were genotyped with 770K chip, muscle Longissimus dorsi samples were collected for analysis of the AG's profile. 148 regions able to explaining more than 0.04% of the composition of the six AG's evaluated. The regions account for a percentage of the phenotypic variation: 1.24% for C18:0, 1.01% for C16:0, 2.31% for 18:2 ;, 1.34% CLA C18:2; 1 74% of C18: 3, 1.83% for C18:1. Were found in this study, 85 QTL described in the literature related to other breeds. A total of 107 positional candidate genes were foundin this study associated with fatty acids metabolism. The results of this study help to elucidate the regions that influence the AG profile of the meat allowing their use in assisted selection programs, impacting human health

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_eduardo_xavier.pdf: 298275 bytes, checksum: 4cac97edc215b060c626ac29a1665c09 (MD5) Previous issue date: 2007-05-29 / The objective of this work was to test the effect of the presence or absence of the calf in the activities of estrous, follicular dynamics and hormone secretion of Bos indicus cows. Forty and six cows were divided in 3 groups. In group with contact (CC), the calves were prevented from suckling by being confined into a pen, that allowed auditory, olfactory and visual contact of the cows with their own calves (n=17). In group without contact (SC), the calves were weaned and prevented from any contact. In control group (T), the calves weren t weaned, remaining with their mothers (n=12). The CC group showed greater ratio of cows in estrous (76.5%) when compared to T (16.7%), but no difference from SC (64.7%). The CC group showed greater ratio of ovulation (76.5%) when compared to T (33.3%) and an apparent difference (p=0.06) when compared to SC (64.7%). The duration of estrous was lesser (p = 0.04) in group CC (8.4 h + 4.4 h) than the SC (12.9 + 13.4 h), however the group T (11 + 1.4 h) was not different from the others. The average interval between weaning and onset of estrus (35 + 6.3 h), weaning and end of estrus (44.4 + 5.4 h), intensity of estrus behavior (26.6 + 24 mounts), weaning and time of ovulation (70 + 12.7 h), onset of estrus and time of ovulation (33.3 + 9.3 h) and the end of estrus and time of ovulation (23.3 + 10.3 h) were not observed differences.The T group achieved 48 + 8.4 h of interval between weaning and the LH peak while in the weaned groups (CC and SC) the average interval was of 45.3 + 10.4 h, showing no differences between the CC group (42.5 + 8.2 h) and the SC (47.5 + 11.8 h). The interval between the peak of LH and the time of the ovulation presented a general average of 24.8 + 7.7 h, showing no differences between the groups T (25.5 + 5.7 h), CC (24.9 + 8 h) and SC (24.5 + 8.6 h). It was found that the contact between cow and calf during weaning was not different from that of the cows without any contact and there was no advantage in restricting contact between cow and calf. It was confirmed that weaning has a beneficial effect on the percentage of estrous and ovulation when compared to cows not weaned. / O objetivo deste trabalho foi estudar o efeito da presença ou ausência do terneiro nas atividades de estro, dinâmica folicular e níveis hormonais em vacas de origem Bos indicus. Quarenta e seis vacas foram divididas em 3 grupos. No grupo com contato (CC), os terneiros foram desmamados e impedidos de mamar, mas mantidos em um curral, o qual permitia contato auditivo, olfativo e visual das vacas com sua cria (n=17). No grupo sem contato (SC), os terneiros foram desmamados e impedidos de qualquer contato (n= 17). No grupo T (n=12), as crias não foram desmamadas, permanecendo juntas às suas mães, constituindo o grupo testemunha. O grupo CC (76,5%) apresentou maior proporção de vacas em estro quando comparado ao T (16,7%), mas não diferente do SC (64,7%). O grupo CC possui maior porcentagem de vacas ovuladas (76,5%) quando comparado ao T (33,3%) e uma diferença aparente (p=0,06) quando comparado ao SC (64,7%). A duração do estro foi menor (p = 0,04) no grupo CC (8,4 h + 4,4 h) quando comparado ao SC (12,9 + 13,4 h). O intervalo entre o desmame e o início do estro (35 + 6,3 h), o desmame e o final do estro (44,4 + 5,4 h), a intensidade do estro (26,6 + 24 montas), o desmame e a ovulação (70 + 12,7 h), o início do estro e a ovulação (33,3 + 9,3 h) e o final do estro e a ovulação (23,3 + 10,3 h) não foram diferentes entre os tratamentos. As vacas do grupo T obtiveram 48 + 8,4 h de intervalo entre o desmame e o pico de LH enquanto que nos grupos desmamados (CC e SC) o intervalo médio foi de 45,3 + 10,4 h, não havendo diferença entre as vacas do grupo CC (42,5 + 8,2 h) e SC (47,5 + 11,8 h). O intervalo entre o pico de LH e o momento da ovulação apresentou uma média geral de 24,8 + 7,7 h, não havendo diferença entre os grupos T (25,5 + 5,7 h), CC (24,9 + 8 h) e SC (24,5 + 8,6 h). Verificou-se que o contato da vaca com a cria durante o desmame não foi diferente das vacas sem contato algum e não houve vantagem em restringir o contato da mãe com sua cria. Ficou confirmado que o desmame exerce um efeito benéfico na porcentagem de estro e ovulação quando comparado a vacas não desmamadas.

Beef quality in Brazil is important for both consumers and the food industry due to high demand and competitiveness in the domestic and international markets. Therefore, it is necessary to develop research to improve beef quality of Nellore cattle (Bos indicus), mainly tenderness, one of the main features to add value to meat. New-generation technologies provide accurate, rapid and inexpensive information on the entire genome, showing great advantage over conventional methods for sequencing and gene expression. However, these new technologies generate large database, which require the use of bioinformatics tools for data analyses of sequencing and for a better understanding of biological regulation mechanisms , cellular control, gene interactions, among other applications. In a previous study, samples were collected from the Longissimus dorsi muscle of 790 animals from Nellore cattle and shear force assessments were made 24 hours after slaughter, with seven and 14 days of aging. Aiming to identify differentially expressed (DE) genes, 34 samples from Nellore animals with extreme levels of estimated breeding value (EBV) for shear force (SF) were selected, sequenced by the method of RNA sequencing (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). This study performed the processing of data generated by RNA-Seq using software QuasiSeq and Cuffdiff. In the QuasiSeq analysis, 22 DE genes were found, while in the Cuffdiff analysis, 113 DE genes were found. To better understand the biological process involved in meat tenderness, integrative analysis identified possible regulators that can explain the activity of transcriptional regulation in this process using partial correlation coefficient with information theory (PCIT), phenotypic impact factor (PIF) and regulatory impact factor (RIF) methods. The genes found in the PCIT analysis USP2, GBR10, ANO1 and TMBIM4; microRNAs found in RIF analysis bta-mir-133a-2 and bta-mir-22, and the genes with high PIF value MB, ENO3, CA3 could be fundamental to unravel the complex molecular mechanisms that control the meat tenderness in Nellore cattle. / A qualidade da carne bovina no Brasil é importante tanto para o consumidor, como para a indústria alimentícia devido à alta competitividade e exigência do mercado nacional e internacional. Portanto, é necessário o desenvolvimento de pesquisas para melhorar a qualidade da carne bovina da raça Nelore (Bos indicus), principalmente a maciez, que é considerada uma das principais responsáveis por agregar valor à carne. Tecnologias de nova geração proporcionam informações precisas, rápidas e baratas de todo genoma, mostrando grande vantagem em relação aos métodos convencionais de sequenciamento e de estudos de expressão gênica. Essas novas tecnologias geram um grande volume de dados, sendo necessário o uso de ferramentas de bioinformática para realizar as análises de sequenciamento e ter uma maior compreensão de mecanismos biológicos de regulação, controle celular, interações gênicas, entre outras aplicações. Em um estudo prévio, foram coletadas amostras do músculo Longissimus dorsi de 790 animais da raça Nelore e foram realizadas avaliações da força de cisalhamento 24 horas após abate, e com sete e 14 dias de maturação. Com o objetivo de identificar genes diferencialmente expressos (DE), foram selecionadas no total 34 amostras de animais da raça Nelore com valores extremos de valor genético estimado (EBV) para força de cisalhamento (SF), e sequenciados pelo método de sequenciamento de RNA (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). Neste estudo foi realizado o processamento dos dados gerados pelo RNA-Seq através dos softwares QuasiSeq e Cuffdiff. Foram encontrados 22 genes DE para as análises do QuasiSeq e 113 genes DE para as análises do Cuffdiff. Para melhor compreensão dos processos biológicos envolvidos na maciez da carne, análises integrativas identificaram possíveis reguladores que podem explicar a atividade de regulação transcricional neste processo utilizando os métodos do Coeficiente de Correlação Parcial com Teoria da Informação (PCIT), Fator de Impacto Fenotípico (PIF) e Fator de Impacto Regulatório (RIF). Os genes encontrados nas análises análises do PCIT USP2, GBR10, ANO1 e TMBIM4, assim como os microRNAs encontrados nas análises do RIF, bta-mir-133a-2 e bta-mir-22 e os genes de maior valor de PIF MB, ENO3, CA3 podem ser fundamentais para desvendar os complexos mecanismos moleculares que controlam a maciez da carne na raça Nelore.

O objetivo do presente trabalho foi determinar a força de cisalhamento Warner-Bratzler do músculo Longissimus lumborum de animais zebuínos machos inteiros (Bos indicus) durante o período de maturação, nas faixas de pH final (pHf 48 horas post mortem) normal (pH entre 5,5 e 5,8) e anormal (pH entre 5,81 e 6,19) e temperaturas internas de cozimento. Concomitante com a avaliação de força de cisalhamento, foram avaliadas também a degradação da desmina e troponina T, o comprimento do sarcômero, o teor de colágeno total e solúvel, as temperaturas máximas de desnaturação das proteínas e a morfologia geral de agregação das fibras do músculo no cozimento. A degradação da desmina e troponina T foi maior no pHf normal, aparecendo produtos de degradação a partir do dia 7 nessa faixa de pHf. Não houve diferenças nos valores de comprimento do sarcômero, descartando-se assim, a contribuição desse parâmetro sobre a temperatura máxima de desnaturação (Tmáx) das proteínas, determinada utilizando calorímetro exploratório diferencial (DSC). Similarmente, não foram encontradas diferenças para os teores de colágeno total e solúvel, e os valores de colágeno total foram baixos, sugerindo que sua contribuição na segunda transição térmica e nos valores de força de cisalhamento foi mínima. As Tmáx1 e Tmáx2, correspondentes à desnaturação da meromiosina leve e pesada, respectivamente, foram menores no pHf normal, mas o efeito foi maior para a Tmáx2. A Tmáx3 da actina e titina aumentou até 14 dias post mortem na faixa de pHf normal, e posteriormente diminuiu significativamente após 21 dias, sugerindo possível degradação dessas proteínas nesse período de dias. Não foram encontradas diferenças nos valores de Tmáx no pHf anormal, em todos os dias post mortem, o que sugere a contribuição de um possível mecanismo de proteção que estabiliza as miofibrilas no aquecimento. Houve maior agregação das fibras do músculo no pHf normal nas temperaturas internas de cozimento de 65 e 80°C, provavelmente devido à maior desnaturação térmica das miofibrilas. Os valores de força de cisalhamento foram maiores com o aumento da temperatura interna de cozimento, devido ao aumento da desnaturação térmica das miofibrilas do músculo. Independente da temperatura interna de cozimento, os valores de força de cisalhamento foram altos em quase todos os dias post mortem para ambas as faixas de pHf, o que sugere a necessidade de utilizar métodos físicos ou químicos para aumentar a maciez do músculo Longissimus lumborum de animais zebuínos. / The aim of this work was to determine the Warner-Bratzler shear force of Longissimus lumborum muscle of Zebu bulls during ageing, at the normal (pH between 5.5 e 5.8) and abnormal (pH between 5.81 e 6.19) ultimate pH (pHu) groups (pH 48 hours post mortem) and internal temperatures of cooking. Concomitant with the Warner-Bratzler shear force evaluation, the degradation of desmin and troponin T, sarcomere length, total and soluble collagen content, maximum temperature of proteins denaturation, and aggregation of muscle fibers during cooking were also evaluated. The degradation of desmin and troponin T was higher in the normal pHu, appearing degradation products at day 7. There were no differences in the sarcomere length values, discarding the contribution of this parameter on the maximum temperature of proteins denaturation (Tmax) determined by differential scanning calorimeter (DSC). Similarly, no differences were found for total and soluble collagen contents, and the total collagen values were low, suggesting that its contribution in the second thermal transition and in the shear force values was minimal. The Tmax1 and Tmax2, corresponding to the denaturation of light and heavy meromyosin, respectively, were lower in the normal pHu group, but the effect was higher for Tmax2. The Tmax3 of actin and titin increased up to 14 days post mortem in the normal pHu group, which subsequently significantly decreased after 21 days, suggesting the possible degradation of these proteins in that period of time. No differences were found in the Tmax values for the abnormal pHu group at all days post mortem, suggesting the contribution of a possible protective mechanism that stabilizes the myofibrils during heating. There was higher aggregation of muscle fibers in the normal pHu, at internal temperatures of cooking of 65 and 80°C, probably due to a higher thermal denaturation of myofibrils. The shear force values were higher with the increase of the internal temperature of cooking due to the increased denaturation of the muscle myofibrils. Regardless of internal temperature of cooking, the shear force values were higher in almost all days post mortem for both pHu groups, which suggest the need of physical or chemical methods to increase the tenderness of Longissimus lumborum muscle of Zebu bulls.

Uma das razões da menor fertilidade dos touros europeus criados em regiões tropicais em relação a touros Bos indicus é uma maior índice de estresse oxidativo provocado por uma maior produção de espécies reativas de oxigênio (ROS), não compensada pela proteção antioxidante. Por outro lado, sabe-se que a célula espermática é extremamente susceptível ao estresse oxidativo devido à alta quantidade de ácidos graxos poli-insaturados (PUFA) em sua membrana plasmática, o que, no entanto, é muito importante para que o espermatozoide seja fértil e resistente ao choque frio. Sendo assim, tratamentos que interfiram no processo oxidativo, podem ser importantes para aumentar a produtividade destes animais, tanto à campo como em centrais de inseminação artificial. O presente experimento objetivou avaliar qual ROS seria a mais lesiva para touros europeus submetidos ao estresse térmico visando determinar um possível tratamento antioxidante direcionado para estes animais. Em um segundo momento visou então verificar a eficiência da interação entre uma dieta rica em PUFAs e o tratamento antioxidante sistêmico direcionado na qualidade espermática do sêmen ejaculado e epididimário (fresco e criopreservado) de touros europeus submetidos ao estresse térmico. Para isso, quatro touros Bos taurus adultos foram submetidos a insulação testicular (bolsa escrotal por 5 dias). Sessenta dias após a insulação o sêmen foi coletado por eletroejaculação. O sêmen de cada animal foi dividido em 4 alíquotas s submetidas à indução com quatro sistemas geradores de ROS: Ânion Superóxido (xantina/xantina oxidase), peróxido de hidrogênio, radical hidroxila (Ascorbato + Sulfato de Ferro) e malondialdeído (MDA; produto da peroxidação lipídica). As amostras foram incubadas por 1 hora e avaliadas através da análise espermática computadorizada (CASA), eoxina/nigrosina (integridade da membrana plasmática), fast-green/rosa bengala (integridade de acrossomo), 3, 3´ diaminobenzidina (atividade mitocondrial), ensaio da cromatina espermática (fragmentação de DNA) e substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico (TBARS; peroxidação lipídica). Os resultados indicaram ser o MDA, a substância mais deletéria aos animais Bos taurus submetidos ao estresse térmico aguda. Desta forma, 16 touros foram então submetidos á insulação testicular e divididos em 4 grupos: Controle (n=4; aplicação de óleo mineral; placebo); Grupo Vitamina E: (n=4; 5 ml de Monovin® E a cada 13 dias); Grupo PUFA: (n=4; 4 kg/dia Megalac® E1), Grupo PUFA+Vitamina E: (n=4; combinação entre os tratamentos dos grupos PUFA e Vitamina E). O sêmen destes animais foi coletado no dia da inserção da bolsa escrotal, no dia da retirada, 30 e 60 dias após. Os resultados indicaram que a vitamina E foi eficiente para a melhora nos danos causados pelo estresse térmico no DNA espermático e na mitocôndria, mas apenas nas amostras coletadas do epidídidmo. Da mesma forma, foi possível observar que a combinação entre a Vitamina E e a suplementação com PUFA foi eficiente na melhora dos padrões de motilidade espermática. Os resultados do presente estudo indicam que a combinação entre um tratamento antioxidante com Vitamina E e a suplementação com PUFA pode ser uma alternativa interessante para evitar os danos causados pelo estresse térmico agudo em touros europeus. No entanto, possivelmente este tratamento poderia ser ainda mais eficiente caso seja administrado de forma preventiva. / One reason for the lower fertility of European bulls bred in tropical regions is a higher rate of oxidative stress caused by increased production of reactive oxygen species (ROS) not compensated by antioxidant protection . On the other hand , it is known that the sperm cell is extremely susceptible to oxidative stress due to the high amount of polyunsaturated ( PUFA) on their plasma membrane. However the presence of these PUFAs is fundamental for the sperm to be fertile and resistant to cold shock. Thus, treatments that interfere with the oxidation process may be important to increase the productivity of these animals. This study aimed to evaluate which would be the most damaging ROS for European bulls subjected to heat stress to determine a possible antioxidant targeted treatment for these animals. In a second step we sought to verify the efficiency of the interaction between a diet rich in PUFAs and targeted-antioxidant treatment on sperm quality of ejaculated and epididymal sperm quality in European bulls subjected to heat stress. Four Bos Taurus bulls were submitted to testicular insulation (5 days). Sixty days after insulation semen was collected by electroejaculation. Semen from each animal was divided into 4 aliquots and submitted to the induction with four ROS generating systems: superoxide anion (xanthine / xanthine oxidase), hydrogen peroxide, hydroxyl radical (ascorbate + Ferrous Sulfate) and malondialdehyde (MDA; lipid peroxidation product). The samples were incubated for 1 h and assessed by computerized sperm analysis (CASA), eoxina / nigrosin (membrane integrity), fast-green/Bengal rose (acrosome integrity) , 3 , 3 \' diaminobenzidine (mitochondrial activity), sperm chromatin structure assay (DNA fragmentation) and thiobarbituric acid reactive substances (TBARS, lipid peroxidation). The results indicated that the MDA was the most deleterious substance to Bos Taurus semen subjected to an acute heat stress. Thus, 16 bulls were then subjected to testicular insulation and divided into 4 groups: control (n= 4; application of mineral oil; placebo); Group Vitamin E: (n= 4, 5 ml of Monovin ® E every 13 days); PUFA group: (n= 4; 4 kg/day Megalac ® E1 ); Group PUFA+Vitamin E (n=4; combination of groups PUFA and Vitamin E treatments). Semen was collected from these animals on the day of insertion of the thermal bag, on the day of withdrawal, 30 and 60 days after. The results indicated that vitamin E was effective for the improvement in damages caused by heat stress in sperm DNA and mitochondria, but only in samples collected from epididymis. Similarly, the combination of vitamin E and PUFA supplementation was effective in improving sperm motility patterns . The results of this study indicate that the combination of an antioxidant treatment with vitamin E and PUFA supplementation may be an interesting alternative to avoid the damage caused by acute heat stress in European bulls. However, possibly, this treatment would be more effective if performed preventively.

O efeito da injeção do lactato de potássio associado ao uso de atmosfera modificada com alto oxigênio sobre músculos Longissimus lumborum de bovinos machos inteiros foi avaliado. Foram utilizados animais anelorados (com características fenotípicas de Nelore) com diferentes faixas de pH final (pHf - 48h post mortem). Foram coletados 18 músculos e divididos em 3 grupos, sendo eles: baixo (controle; 5,4 < pHf < 5,8), intermediário (5,81 < pHf < 6,3) e alto (pHf > 6,3). Na primeira etapa, foi injetada em cada músculo uma solução de lactato de potássio a 2,5%, em seguida foram cortados em bifes, embalados em atmosfera modificada contendo 80% de oxigênio e 20% de gás carbônico e estocados no escuro a 2 ± 1ºC durante 5 dias. Posteriormente, estes seguiram para um expositor refrigerado com iluminação e temperatura controlada (2 ± 1ºC), onde permaneceram por 9 dias, completando 14 dias de vida útil. Análises de composição gasosa, pH, composição centesimal, sensorial de odor, avaliação microbiológica, oxidação lipídica e cor instrumental foram realizadas nos dias: 0, 5, 8, 11 e 14. Os resultados estatísticos obtidos foram analisados pelo método de medidas repetidas no tempo e também utilizando análise não-paramétrica. A oxidação lipídica foi menor (P < 0,05) e apresentou maior estabilidade em músculos com pHf alto. Não houveram diferenças (P > 0,05) na análise sensorial de odor entre os grupos. A contagem microbiana permaneceu dentro dos limites aceitáveis para consumo humano. Os grupos de pHf intermediário e alto apresentaram uma maior (P < 0,05) estabilidade da cor (maiores valores de a*, croma e oximioglobina). Nas condições do presente estudo, a injeção do lactato de potássio associada à atmosfera com alto oxigênio atuou beneficamente na estabilidade da cor e vida útil de músculos de pHf intermediário e alto. Pode-se concluir que a injeção desta solução é uma alternativa viável para tornar a aparência de bifes provenientes de músculos L. lumborum mais atrativa para o consumidor por meio da estabilização da cor, sem prejudicar a vida útil mesmo nas condições de embalagem utilizadas. / The effect of potassium lactate enhancement in a high oxygen modified packaging on bulls\' Longissimus lumborum was studied. Zebu animals (with phenotypic characteristics of Nellore) animals with different range of ultimate pH (pHu - 48h post mortem) were used. Eighteen muscles were collected and segregated into three groups, wich were: low (control; 5.4 < pHu < 5.8), intermediate (5.81 < pHu < 6.3) and high (pHu > 6.3). In the first stage, a 2.5% potassium lactate solution was injected into each muscle, then they were cut into steaks, packaged in a modified atmosphere containing 80% oxygen and 20% carbon dioxide and stored in the dark at 2 ± 1ºC for 5 days. Later, they were displayed with light and controlled temperature (2 ± 1ºC), where remained for 9 days, completing 14 days of shelf life. Gas composition, pH, proximate analysis, odor sensory, microbiological evaluation, lipid oxidation and instrumental color analysis were performed on days: 0, 5, 8, 11 and 14. The statistical results were analyzed by the method of repeated measurements over time and also using non-parametric analysis. The lipid oxidation decreased (P < 0.05) and showed greater stability on high pHu treatment. There were no differences (P > 0.05) between the treatments on odor sensory analysis. Microbial counts remained within acceptable limits for human consumption. The intermediate and high pHu groups had a higher (P < 0.05) color stability (higher values of a*, chroma and oxymyoglobin). Under the conditions of this study, the potassium lactate enhancement associated with high oxygen atmosphere (Hi-Ox MAP) can be an alternative to increase color stability and shelf life of intermediate and high pHu muscles. It can be concluded that the injection of this solution is a viable alternative to make L. lumborum steaks appearance more attractive to the consumer through the color stabilization, without sacrificing shelf life even under packaging conditions used.