Este trabalho teve como objetivo comparar diferenças entre as progênies de touros representativos raça Nelore e de três grupos genéticos, Nelore, Angus x Nelore e Brahman x Nelore, quanto ao desempenho pós desmame e quanto às características de carcaça medidas in vivo por ultra-som. Foram selecionados 14 touros representativos da raça Nelore, dois da raça Aberdeen Angus e um touro Brahman. Estes touros foram acasalados com 400 vacas Nelore, que deram origem a uma progênie de 158 machos e 148 fêmeas. Os animais foram criados e recriados a pasto até os 19 meses de idade e, então, terminados em confinamento recebendo dieta com 14,2% de PB e 71,2% de NDT, numa relação volumoso:concentrado de 23:77. Durante a fase de recria foram realizadas três pesagens e uma medida de carcaça por ultra-sonografia, aos 483 dias de idade em média. A fase de terminação em confinamento compreendeu cinco pesagens, realizadas aproximadamente a cada 28 dias, e três medidas de carcaça por ultra-sonografia, sendo que os animais apresentavam as seguintes idades médias em cada avaliação: 570, 598 e 677 dias, respectivamente. As medidas tomadas foram: área de olho de lombo (AOL, no músculo Longissimus dorsi) e espessura de gordura subcutânea entre a 12ª e 13ª costela (EG) e na garupa (P8, sobre o músculo Biceps femoris). Os animais permaneceram confinados até atingirem aproximadamente 5 mm de espessura de gordura subcutânea medida entre as 12ª e 13ª costelas no músculo Longissimus dorsi, no caso, por 127 dias, entre os meses de julho e novembro de 2004. Os animais foram abatidos com 24 a 26 meses de idade. Após o abate, foram coletados medidas de peso da carcaça quente (PCQ) e rendimento de carcaça. O grupo genético com melhor desempenho pós-desmama foi o grupo Angus x Nelore, seguido de Brahman x Nelore e por fim os animais Nelore puros, sendo que os machos foram superiores às fêmeas. Entretanto, durante o período de terminação em confinamento, as fêmeas apresentaram ganho de peso semelhante aos machos castrados, porém tiveram taxas de ganho de músculo e gordura superiores, em conseqüência da sua maior taxa de maturação. Foram verificados maiores ganhos em AOL nos Angus x Nelore, mostrando a aptidão para produção de carne da raça taurina. As diferenças em ganhos de gordura foram pequenas, provavelmente devido à qualidade da dieta que não permitiu que todo o potencial genético para terminação fosse expressado. Quando o estudo se baseou somente na raça Nelore, foram verificadas diferenças nas características de crescimento pós-desmama e durante a terminação em confinamento, entre as progênies dos touros da raça Nelore, indicativas da existência da variabilidade genética, o que permitiria esperar uma resposta à seleção de animais para as mesmas. Entretanto não houve efeito de touro para velocidade de acabamento e crescimento muscular entre as progênies estudadas. / This work aimed to evaluate differences among sires selected to represent the Nellore breed and among three breed groups (Nellore, Angus x Nellore, Brahman x Nellore) as to their progenies’ post-weaning performance and carcass traits, measured by real time ultrasound. A total of 14, two and one sires of the Nellore, Angus and Brahman breeds, respectively, were mated to 400 Nellore cows, producing a progeny of 158 steers and 148 heifers. The animals were raised on pasture until 19 months of age, then finished in feedlot on a diet containing 14.2% crude protein and 71.2% TDN, with a roughage:concentrate ratio of 23:77. During the growing phase on pasture, the animals were weighed three times and scanned at 483 days of age for Longissimus muscle area (LMA), back fat thickness over the 12th - 13th ribs (backfat) and rump fat (P8 fat). During the finishing phase in feedlot, between July and November 2004, cattle were weighed every 28 days and scanned for LMA, backfat and P8 fat at 570, 598 and 677 days of age. The backfat thickness end-point (5 mm) was reached after 127 days on feed, Animals were slaughtered at 24 to 26 months of age. At slaughter, hot carcass weight and dressing percentage were measured. There were effects of breed group on performance during the growing phase. Angus-sired calves had better performance than Brahman-sire and Nellore-sired calves and Brahman x Nellore calves were superior to straight bred Nellore. Males had better performance than females. However, during the finishing phase, there was no sex effect on weight gain and females had greater muscle and fat gain rate than males, perhaps due to their greater maturity rate. Angus x Nellore animals had greater LMA, showing the meat producing ability of Bos taurus breeds. Breed differences as to backfat gains were slight. This was likely due to diet quality which didn’t allow the animals’ genetic potential to be fully expressed. Within the Nellore breed, post-weaning growth traits were different among the sires, indicating existence of genetic variability. Nevertheless, there were no effects of sire on backfat gain and muscle growth among the progenies studied.

Made available in DSpace on 2016-08-17T17:11:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_CELSO HENRIQUE SOUZA COSTA BARROS.pdf: 1419210 bytes, checksum: a1822ff5960d1998e001de7cc8bb7379 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective was to evaluate the effect of inhibition of Angiotensin Converting Enzyme (ACE) with enalapril maleate in follicular development, gene expression of granulosa cells and in vivo production of embryos in cattle. In Experiment 1, we used four Girolando (Bos taurus x Bos indicus) cows to evaluate the potential suppression of cardiocirculatory system and validation of the effective dose of Enalapril Maleate. Was administered 0.2, 0.3, 0.4 and 0.5 mg / kg of enalapril maleate and measured mean arterial pressure (MAP). The best effective dose was 0.4 mg / kg and was used in the experiments 2 and 3. In Experiment 2, we used 20 Nelore (Bos indicus) cows to measure the MAP and ovarian vascular density at 0, 2, 4 7, 10 and 24 hours after Enalapril administration. In Experiment 3, twelve Nelore (Bos indicus) cows were used. These were distributed homogeneously in two treatments: a) Enalapril Group; females subjected to superovulation protocol receiving enalapril maleate (20 mg / 5 ml) from D3 to D7 of protocol and b) Control Group; females subjected to superovulation protocol received placebo (saline 0.9 %) on the same dates and volume. In Experiment 4, follicular fluid and granulosa cells were collected in vivo by ultrasound guided follicular aspiration. Then was performed mRNA extraction and RT-PCR for the expression of enzymes P450 aromatase, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and MAS receptor. No effect of enalapril on MAP in animals treated with up to 0.3 mg / kg. Doses of 0.4 and 0.5 significantly decreased MAP in a dose-dependent level (P <0.05). There was no significant effect of enalapril maleate or the harvest time in MAP of Bos indicus cows. Enalapril significantly reduced vascular density ovarian up to 24 hours after administration. No effect of Enalapril on anovulatory follicles and corpora lutea (P> 0.05). The ovulation rate was significantly higher in the Enalapril group (P <0.001). Gene expression was similar between treated and untreated cows. The ACE inhibition through administration of Enalapril Maleate reduced MAP and ovarian vascular density, but not improved follicular growth did not increase the expression of genes associated with follicular development and did not increases in vivo production of embryos in superstimulated cows. / Objetivou-se avaliar o efeito da inibição da Enzima Conversora de Angiotensina (ECA) com Maleato de Enalapril no desenvolvimento folicular, expressão gênica de células da granulosa e produção in vivo de embriões em bovinos. No Experimento 1, utilizou-se quatro fêmeas da raça Girolando (Bos taurus x Bos indicus), para avaliação do potencial efeito supressivo cardiocirculatório e validação da dose efetiva de Maleato de Enalapril. Foram administrados 0,2, 0,3, 0,4 e 0,5 mg/Kg de maleato de enalapril e mensurada a pressão arterial média (PAM). A melhor dose efetiva foi de 0,4mg/ Kg e foi utilizada nos experimentos 2 e 3. No Experimento 2, utilizou-se 20 fêmeas da raça Nelore (Bos indicus) para aferir a PAM e a desnidade vascular ovariana 0, 2, 4, 7, 10 e 24 horas após a administração do Enalapril. No Experimento 3, foram utilizadas 12 fêmeas da raça Nelore (Bos indicus) homogeneamente distribuidas em dois diferentes tratamentos: a) grupo enalapril; fêmeas submetidas ao protocolo de superovulação que receberam solução de maleato de enalapril na concentração de 20 mg/5 mL/via subcutânea, do dia D3 a D7 e o grupo controle, fêmeas submetidas ao protocolo de superovulação, receberam placebo (solução fisiológica 0,9%) nas mesmas datas e volume. No Experimento 4, foi realizada a recuperação in vivo de fluido folicular e células da granulosa através da aspiração folicular, extração de RNAm e RT-PCR para avaliação da expressão da enzima P450 aromatase, enzima conversora de angiotensina 2 (ECA2) e para o receptor MAS. Não houve efeito do Enalapril sobre a PAM em animais tratados com até 0,3 mg/kg. As doses de 0,4 e 0,5 diminuiram significativamente a PAM em escala dose-dependente (P<0,05). Não houve efeito significativo da administração do Maleato de Enalapril nem do horário de colheita na PAM das fêmeas Nelore estudadas. O Enalapril diminuiu significativamente a densidade vascular ovariana por até 24 horas após a administração. Não houve efeito do Enalapril no número de folículos anovulatórios e número de corpos lúteos no D15 (P>0,05). A taxa de ovulação foi significativamente maior no grupo tratado (P<0,001). A expressão de genes foi similar entre as fêmeas tratadas ou não tratadas. A inibição da ECA por meio da administração do Maleato de Enalapril reduziu a PAM e a densidade vascular ovariana, porém não melhorou o crescimento folicular, não aumentou a expressão de genes associados ao desenvolvimento folicular e não potencializou a produção in vivo de embriões em vacas da raça Nelore (Bos indicus) superestimuladas.

This study was developed in order to explore chromosomal regions associated with carcass and meat traits in Nellore cattle breed, identifying metabolic and genetic pathways related to its characteristics expression, as well as generate additional phenotypes for future genome association studies, in order to fully describe parameters related to final product quality. Thereunto, 995 bulls were genotyped for more than 770,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs), were evaluated for body weight at birth, weight gain at weaning and yearling, conformation, finishing precocity and muscling at weaning and yearling. These traits are correlated, therefore, genomic mapping method were applied in order to identify pleiotropic regions. Results highlighted previously described genomic regions associated to beef cattle weight gain and growth traits, particularly PLAG1 gene, sheltered by the most significantly associated marker region, which in other studies were associated to weight, height and sexual precocity in Nellore breed. To evaluate carcass and meat quality traits, 576 young bulls were evaluated for hot carcass weight, ribeye area, fat thickness, pH 24 hours after slaughter and color parameters (L*, a*, b*), for shearing force, dripping and cooking loss, evaluations were performed for different maturation times (7, 14 and 21 days). Animals were genotyped on two platforms, Illumina&reg; BovineHD BeadChip (HD) and Bovine GeneSeek&reg; Genomic Profiler &trade; HD Illumina Infinium&reg; (GGP). Animals genotyped at a lower density (GGP) were imputed to high density chip (HD). Shear force, dripping and cooking loss measures which relates to meat tenderness, were associated to cytoskeleton structure and proteolytic enzymes activity, pointing to serine/serpin enzyme complex as main candidates for regulate proteolysis and muscle fiber structure degradation. Were performed an evaluation of Longissimus thoracis et lumborum intramuscular fat content of 148 animals. It was approached by a human health perspective where samples received a classification regarding fatty acids effects on human organism (\"beneficial\", \"evil\" or \"neutral\"), as well as provided phenotypic information for future genome association studies. The identification of 42 fatty acids and 16 indexes, generated detailed information on these animals\' meat fat composition. Principal component analysis (PCA) results showed that large variation proportion between samples fat composition occurs due to expression differences among desaturase and elongase enzymes. Thus, it is expected that generated data, information and knowledge hereby, can assist animal breeding programs to improve Brazilian herds according meat chain interests. / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de explorar regiões cromossômicas associadas à características de carcaça e carne em bovinos da raça Nelore, explorar suas funções em vias metabólicas e gênicas relacionadas às manifestações dessas características, assim como gerar novos fenótipos para futuros estudos de associação genômica, com vistas a descrever, de forma completa, as características relacionadas à qualidade do produto final. Para isso, 995 animais machos não castrados, genotipados para mais de 770.000 marcadores de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP), foram avaliados quanto ao peso corporal ao nascimento, ganho de peso à desmama e ao sobre ano, conformação, precocidade de terminação e musculosidade à desmama e ao sobre ano. Como estas características são correlacionadas, foram aplicadas metodologias de mapeamento genômico com o objetivo de identificar regiões pleiotrópicas. Os resultados destacaram regiões do genoma bovino que contêm genes descritos por influenciarem em características de crescimento e ganho de peso nestes animais, com destaque para o gene PLAG1, pertencente à região do marcador mais significativo associado aos fenótipos, anteriormente associado ao peso, altura e precocidade sexual em animais dessa raça. Para acessar atributos de qualidade de carcaça e carne, 576 machos não castrados foram avaliados quanto ao peso de carcaça quente, área de lombo, espessura de gordura subcutânea, pH após 24 horas do abate, cor (L*, a*, b*) e perdas de peso por exsudação e cozimento e força de cisalhamento em diferentes tempos de maturação (7, 14 e 21 dias). Os animais foram genotipados em duas plataformas, Illumina&reg; BovineHD BeadChip (HD) e GeneSeek&reg; Genomic Profiler Bovine HD&trade; Illumina Infinium&reg; (GGP), sendo os genótipos deste último imputados para o conjunto de maior densidade. As avaliações de perdas de peso por exsudação e cozimento e força de cisalhamento, utilizada para mensurar maciez, revelam a influencia da estrutura do citoesqueleto e da ação das enzimas proteolíticas, apontando o complexo enzimático serinas/serpinas como candidato na regulação do processo de proteólise e degradação da estrutura da fibra muscular. Foi realizada avaliação dos ácidos graxos no músculo Longissimus thoracis et lumborum de 148 animais com vistas à classificação das amostras quanto aos efeitos esperados no organismo humano (\"benéfico\", \"maléfico\" ou \"neutro\"), assim como prover informação fenotípica para futuros estudos de associação genômica. A identificação de 42 ácidos graxos e 16 índices gerou informação detalhada sobre a gordura presente na carne destes animais, sendo observado, por análise de componentes principais (PCA), que a maior variação entre a composição das amostras avaliadas parece ser em decorrência da diferença de expressão das enzimas elongases e dessaturases. Dessa forma, espera-se que os dados, informações e conhecimento gerados por este trabalho, possam auxiliar os programas de melhoramento genético animal a aprimorar o rebanho brasileiro segundo características de interesse da cadeia produtiva de carne.

O efeito da injeção do lactato de potássio associado ao uso de atmosfera modificada com alto oxigênio sobre músculos Longissimus lumborum de bovinos machos inteiros foi avaliado. Foram utilizados animais anelorados (com características fenotípicas de Nelore) com diferentes faixas de pH final (pHf - 48h post mortem). Foram coletados 18 músculos e divididos em 3 grupos, sendo eles: baixo (controle; 5,4 < pHf < 5,8), intermediário (5,81 < pHf < 6,3) e alto (pHf > 6,3). Na primeira etapa, foi injetada em cada músculo uma solução de lactato de potássio a 2,5%, em seguida foram cortados em bifes, embalados em atmosfera modificada contendo 80% de oxigênio e 20% de gás carbônico e estocados no escuro a 2 ± 1ºC durante 5 dias. Posteriormente, estes seguiram para um expositor refrigerado com iluminação e temperatura controlada (2 ± 1ºC), onde permaneceram por 9 dias, completando 14 dias de vida útil. Análises de composição gasosa, pH, composição centesimal, sensorial de odor, avaliação microbiológica, oxidação lipídica e cor instrumental foram realizadas nos dias: 0, 5, 8, 11 e 14. Os resultados estatísticos obtidos foram analisados pelo método de medidas repetidas no tempo e também utilizando análise não-paramétrica. A oxidação lipídica foi menor (P < 0,05) e apresentou maior estabilidade em músculos com pHf alto. Não houveram diferenças (P > 0,05) na análise sensorial de odor entre os grupos. A contagem microbiana permaneceu dentro dos limites aceitáveis para consumo humano. Os grupos de pHf intermediário e alto apresentaram uma maior (P < 0,05) estabilidade da cor (maiores valores de a*, croma e oximioglobina). Nas condições do presente estudo, a injeção do lactato de potássio associada à atmosfera com alto oxigênio atuou beneficamente na estabilidade da cor e vida útil de músculos de pHf intermediário e alto. Pode-se concluir que a injeção desta solução é uma alternativa viável para tornar a aparência de bifes provenientes de músculos L. lumborum mais atrativa para o consumidor por meio da estabilização da cor, sem prejudicar a vida útil mesmo nas condições de embalagem utilizadas. / The effect of potassium lactate enhancement in a high oxygen modified packaging on bulls\' Longissimus lumborum was studied. Zebu animals (with phenotypic characteristics of Nellore) animals with different range of ultimate pH (pHu - 48h post mortem) were used. Eighteen muscles were collected and segregated into three groups, wich were: low (control; 5.4 < pHu < 5.8), intermediate (5.81 < pHu < 6.3) and high (pHu > 6.3). In the first stage, a 2.5% potassium lactate solution was injected into each muscle, then they were cut into steaks, packaged in a modified atmosphere containing 80% oxygen and 20% carbon dioxide and stored in the dark at 2 ± 1ºC for 5 days. Later, they were displayed with light and controlled temperature (2 ± 1ºC), where remained for 9 days, completing 14 days of shelf life. Gas composition, pH, proximate analysis, odor sensory, microbiological evaluation, lipid oxidation and instrumental color analysis were performed on days: 0, 5, 8, 11 and 14. The statistical results were analyzed by the method of repeated measurements over time and also using non-parametric analysis. The lipid oxidation decreased (P < 0.05) and showed greater stability on high pHu treatment. There were no differences (P > 0.05) between the treatments on odor sensory analysis. Microbial counts remained within acceptable limits for human consumption. The intermediate and high pHu groups had a higher (P < 0.05) color stability (higher values of a*, chroma and oxymyoglobin). Under the conditions of this study, the potassium lactate enhancement associated with high oxygen atmosphere (Hi-Ox MAP) can be an alternative to increase color stability and shelf life of intermediate and high pHu muscles. It can be concluded that the injection of this solution is a viable alternative to make L. lumborum steaks appearance more attractive to the consumer through the color stabilization, without sacrificing shelf life even under packaging conditions used.

A espécie Bos indicus, particularmente a raça Nelore, é grande maioria no rebanho bovino da região acima do trópico no Brasil. Embora a habilidade desses animais em resistir às doenças parasitárias, condições climáticas e pastagens de baixa qualidade enalteçam a utilização em larga escala desta raça, estes animais não são considerados bons conversores de alimento e, conseqüentemente, precoces em comparação aos seus homólogos Bos taurus. Durante a formação das raças zebuínas brasileiras, houve uma participação das linhas maternas de Bos taurus, que pode ser demonstrada pela contribuição majoritária do genoma mitocondrial desta subespécie. Embora em escala muito menor, estima-se que exista também uma participação destas linhas maternas no genoma nuclear. O objetivo deste trabalho foi iniciar os estudos para estimar esta participação. Para os estudos foram utilizados 104 animais da raça Nelore e 8 animais de diferentes raças européias. Cinco regiões do DNA que produzem fragmentos microssatélites taurus/indicus específicos (HEL1, HEL9, ETH225, ILSTS005 e INRA063) foram amplificadas com a utilização de primers marcados com sondas fluorescentes. Os fragmentos foram submetidos à eletroforese em gel de poliacrilamida desnaturante 6% e visualizados após excitação com laser. No total foram encontrados 23 alelos para os microssatélites analisados o que representa uma média de 4,6±1,82 alelos por locus. Amplificou-se também uma região do DNA satélite 1711b que posteriormente foi digerida com a enzima de restrição Msp I. Verificou-se a existência de três possíveis genótipos entre os animais Nelore mtDNA Bos taurus e mtDNA Bos indicus. Os animais europeus analisados apresentaram sempre o mesmo padrão de restrição. A comparação dos componentes de variância do tamanho dos alelos intra e inter população usando os fragmentos microssatélites permitem a separação dos animais Bos taurus dos animais Nelore, mas não dos Nelore de origem materna distinta. No entanto, a freqüência de alelos indicus específicos nos microssatélites e de padrões de digestão do DNA satélite também indicus específicos sugerem uma participação da ordem de aproximadamente 6% do genoma taurus na população de gado Nelore. / Bos indicus specie, especially Nellore breed is responsible for the majority of Brazilian tropical herd. These animals are notably capable to endure parasite infection as well as hot weather and low quality feed. In one hand this qualities suggest the large scale application of this breed, but in other hand this same breed is well characterized as bad food converter and consequently far from having good precocity status compared with its Bos taurus homologues. It has been reported a matrilineal European participation in Zebu cattle since its introduction in American lands. This hybridization is confirmed by the majority contribution of Bos taurus mtDNA in these animals. Although in a much lower frequency, we hypothesize a Bos taurus cow participation in nuclei genome. The main aim of this work was to give the firsts steps towards the estimation of this participation. A total of 104 Nellore and 8 animals of different European breeds were used for DNA analysis. Five microsatellites fragments (HEL1, HEL9, ETH225, ILSTS005 e INRA063) were amplified applying primers with fluorescent dye. Amplified fragments were used in 6% polyacrilamide electrophoresis and visualized after laser excitation. Overall 23 alleles were detected averaging 4.6±1,82/locus. Variance components of microsatellites allele size comparisons allowed the formation of two clusters separating both subspecies. No significant variation was observed between Nellore with different maternal origins. A satellite 1711b DNA was also amplified and digested with the restriction enzyme Msp I. Three possible genotypes were identified in Nellore animals harboring B. taurus and B. indicus mtDNA. European originated animals always showed the same restriction pattern. Finally B. indicus specific microsatellite allele and satellite 1711b digestion patterns frequency allowed the estimation of 6% of B. taurus contribution in purebred Nellore. These results are discussed in terms of application in cattle genetic improvement.

The cattle tick, Rhipicephalus Boophilus microplus (formerly Boophilus microplus), is the most significant parasite of cattle in Australia and threatens the improvement of cattle production in tropical and subtropical countries worldwide. Some cattle breeds of mainly Bos indicus origin develop a strong resistance to infestation with R. B. microplus, while other breeds of mainly Bos taurus origin will succumb to anaemia and ‘tick worry’ in tick-infested pastures. Resistance to cattle tick infestation is primarily manifest against the larval stage and results in the immature tick failing to make a successful attachment and obtain a meal. It is widely accepted that resistance to tick infestation in cattle is immunologically mediated and involves both cell-mediated and humoral immune responses. Previous research has demonstrated a role for the hypersensitivity response in the rejection of larvae from resistant B. taurus cattle. The immune response to R. B. microplus infestation in B. indicus and B. indicus × B. taurus cattle has not been studied in great detail and this thesis aimed to describe those responses of highly tick-resistant cattle that differ from those of tick-susceptible cattle. A pilot trial was conducted using six tick-resistant Brahman heifers (B. indicus) and six tick-susceptible Holstein-Friesian heifers (B. taurus). The animals were artificially infested for several weeks and blood samples obtained weekly for three weeks during the height of infestation, and on one occasion, skin biopsies obtained. It was found that significant differences existed between the two breeds with respect to the percentage of cellular subsets comprising the peripheral blood mononuclear cell (PBMC) population, cytokine expression by peripheral blood leukocytes (PBL), and levels of tick-specific immunoglobulin G1 (IgG1) antibodies measured in the peripheral circulation. These results in combination with whole genome expression analysis of circulating PBL suggested that the B. indicus cattle had developed a stabilised T cell-mediated response to tick infestation evidenced by their cellular profile and leukocyte cytokine spectrum. The B. taurus cattle demonstrated cellular and gene expression profiles consistent with a sustained innate, inflammatory response to infestation, although high tick-specific IgG1 levels suggested that these animals had also developed a T cell response to infestation. Gene expression analyses using quantitative PCR (qPCR) and whole genome expression platforms indicated that the B. taurus cattle elicited an innate inflammatory response in the skin at the site of larval attachment. This was supported by histological examination of the tick-attachment sites. Conversely, the B. indicus cattle appeared to limit the inflammatory response and instead exhibited increased expression of genes involved in wound healing and the structural integrity of the skin. A second trial was conducted using a group of tick-naïve Santa-Gertrudis heifers to eliminate any innate breed differences that may have confounded the results obtained in the pilot trial. Thirty-five animals were obtained from a tick-free region of Australia; thirty animals were artificially infested weekly for thirteen weeks while five animals remained at a tick-free quarantine property to serve as a control group. Following thirteen weeks of tick infestation the animals in this trial exhibited divergent tick-resistance phenotypes and those carrying the lowest and highest numbers of ticks were classified into tick-resistant (n = 6 animals) and tick-susceptible (n = 6 animals) groups, respectively. The larger number of animals in this study and repeated measurements over the course of the trial enabled a detailed analysis of the effect of tick infestation across all animals, and also within the groups identified as highly resistant or highly susceptible. A cell-mediated response to tick-infestation was detected in all tick-infested animals by twenty-one days after the initial infestation, a response which waned towards the end of the trial when the antibody response became more dominant. Similar to the pilot trial, the tick-susceptible animals developed significantly higher levels of tick-specific IgG1 antibodies compared with the tick-resistant group. Some differences were observed between tick-resistant and tick-susceptible animals with respect to the percentage of cellular subsets comprising the PBMC population. Skin biopsies were taken from these animals prior to initial infestation and then at twenty-one days and ninety-one days after the initial infestation and whole genome expression profiles were produced and analysed. At twenty-one days post infestation both tick-resistant and tick-susceptible animals demonstrated an upregulation of genes involved in leukocyte migration and complement activation, suggestive of an inflammatory response. While this response persisted in the tick-susceptible group at ninety-one days post-infestation, it appeared to lessen in the tick-resistant group. A dominant interleukin-8 (IL-8) response was observed in the skin of the tick-susceptible animals at both time points post-infestation that was not observed in the tick-resistant animals. This thesis demonstrates that tick-susceptible animals respond to infestation with R. B. microplus with an apparently non-protective antibody response, and that tick-resistant animals demonstrate different structural responses in the skin at the tick-attachment site compared with the intense inflammatory response observed in tick-susceptible animals. The results presented here suggest that the extreme susceptibility of pure B. taurus and some B. taurus × B. indicus individuals may be due to their heightened ability to recognise and respond to tick antigens introduced into the host via tick saliva during the blood feeding process. These animals’ increased ability to recognise and respond to these proteins may act to set up a chronic state of inflammation that is beneficial to the tick through increased capillary permeability providing a suitable environment for tick feeding and survival.

Submitted by Fabieli Loise Braga Feitosa (bifeitosa@hotmail.com) on 2018-09-28T15:30:30Z No. of bitstreams: 1 Tese_Fabieli_Feitosa.pdf: 5506988 bytes, checksum: 8a7ab208cd6c4f7e30cb5680429f2990 (MD5) / Rejected by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: PORTARIA Nº 206, DE 4 DE SETEMBRO DE 2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES O PRESIDENTE DA COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR, no uso das atribuições que lhe foram conferidas pelo art. 26 do (a) Estatuto, aprovado (a) pelo Decreto nº 8977, de 30/01/2017, e CONSIDERANDO o indicado nos Editais da CAPES, nos Termos de Compromisso de Bolsista, nos regulamentos de bolsas no exterior e de bolsas no país, no Manual de AUXPE, e no termo de adesão ao Portal de Periódicos; CONSIDERANDO o constante dos autos do processo nº 23038.013648/2018-51, resolve: Art. 1º Os trabalhos produzidos ou publicados, em qualquer mídia, que decorram de atividades financiadas, integral ou parcialmente, pela CAPES, deverão, obrigatoriamente, fazer referência ao apoio recebido. Art. 2º Para fins de identificação da fonte de financiamento fica autorizada a utilização do código 001 para todos os financiamentos recebidos. Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 Agradecemos a compreensão on 2018-09-28T16:51:12Z (GMT) / Submitted by Fabieli Loise Braga Feitosa (bifeitosa@hotmail.com) on 2018-09-28T16:56:13Z No. of bitstreams: 1 Tese_Fabieli_Feitosa.pdf: 5506988 bytes, checksum: 8a7ab208cd6c4f7e30cb5680429f2990 (MD5) / Rejected by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: PORTARIA Nº 206, DE 4 DE SETEMBRO DE 2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES O PRESIDENTE DA COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR, no uso das atribuições que lhe foram conferidas pelo art. 26 do (a) Estatuto, aprovado (a) pelo Decreto nº 8977, de 30/01/2017, e CONSIDERANDO o indicado nos Editais da CAPES, nos Termos de Compromisso de Bolsista, nos regulamentos de bolsas no exterior e de bolsas no país, no Manual de AUXPE, e no termo de adesão ao Portal de Periódicos; CONSIDERANDO o constante dos autos do processo nº 23038.013648/2018-51, resolve: Art. 1º Os trabalhos produzidos ou publicados, em qualquer mídia, que decorram de atividades financiadas, integral ou parcialmente, pela CAPES, deverão, obrigatoriamente, fazer referência ao apoio recebido. Art. 2º Para fins de identificação da fonte de financiamento fica autorizada a utilização do código 001 para todos os financiamentos recebidos. Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 "This study was financed in part by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Finance Code 001" Agradecemos a compreensão on 2018-09-28T17:56:09Z (GMT) / Submitted by Fabieli Loise Braga Feitosa (bifeitosa@hotmail.com) on 2018-09-28T18:41:40Z No. of bitstreams: 1 Tese_Fabieli_Feitosa_2.pdf: 5507005 bytes, checksum: 3602bdd9aaa7e2f1dcb29be2e822d8ff (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-10-01T17:11:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 feitosa_flb_dr_jabo.pdf: 5507005 bytes, checksum: 3602bdd9aaa7e2f1dcb29be2e822d8ff (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-01T17:11:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 feitosa_flb_dr_jabo.pdf: 5507005 bytes, checksum: 3602bdd9aaa7e2f1dcb29be2e822d8ff (MD5) Previous issue date: 2018-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste estudo foram realizar associação genômica ampla (GWAS) e predição genômica utilizando haplótipos como marcadores genéticos para o perfil de ácidos graxos da gordura intramuscular do músculo Longissimus dorsi em bovinos Nelore. Foram utilizados dados de 963 machos da raça Nelore terminados em confinamento, provenientes de fazendas que integram três programas de melhoramento genético. O grupo de contemporâneo foi formado por animais nascidos na mesma fazenda e safra, e do mesmo grupo de manejo ao sobreano. Para a determinação do perfil de ácidos graxos foi utilizado para a extração dos lipídeos o método Folch e para a metilação o método Kramer. Para a genotipagem foi utilizado um painel com mais de 777.000 SNPs do BovineHD BeadChip (High-Density Bovine BeadChip) da Illumina. O controle de qualidade foi feito considerando MAF < 0,05 e Call rate < 90%. Após o CQ, 469.981 SNPs permaneceram nas análises. A imputação dos “missing” e o “phasing” do genótipo foram realizados utilizando o software FImpute. A definição dos blocos de haplótipos foi realizada baseada no desequilíbrio de ligação utilizando o software HaploView. No capítulo 2 as análises estatísticas incorporando as informações dos haplótipos foram realizadas utilizando o software ASREML implementando o método REML. O modelo incluiu efeitos fixos do grupo contemporâneo (62 níveis), haplótipo (regressão linear no número de cópias) e idade ao abate como covariável linear. Os valores de p foram ajustados pelo método de FDR. Os haplótipos associados significativamente foram selecionados ao nível de 10% de significância. Para a prospecção dos genes foi utilizado o banco de dados do NCBI na versão UMD3.1 do genoma bovino, Ensembl Genome Browser, DAVID. Foram associados significativamente (p <0,05), 4, 3, 5, 1, 6, 2 e 7 haplótipos com AGS, AGMI, AGPI, AGPI/AGS, n3, n6 e n6/n3, respectivamente. Estes haplótipos significativos abrigam genes envolvidos no metabolismo lipídico, fatores de alongamento e síntese de ácidos graxos de cadeia longa, receptores de hormônios reprodutivos, transporte e uso de ácidos graxos e colesterol, biossíntese e hidrólise de fosfolipídios e constituintes de membrana, constituintes de membranas celulares, metabolismo energético e síntese de proteína quinase. Assim, a identificação desses haplótipos associados pode contribuir para estudos adicionais para validar essas regiões e prospectar genes candidatos que seriam úteis para programas de melhoramento genético para melhorar a qualidade da carne de bovino Nelore. No capítulo 3, o modelo utilizado para estimar componentes de variância, parâmetros genéticos e predizer os valores genômicos incluiu efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade ao abate como uma covariável linear, e o efeito genético aleatório aditivo. A acurácia utilizando haplótipos variou de 0,07 a 0,31 e a utilizando SNPs variou de 0,06 a 0,33. O coeficiente de regressão usando os haplótipos variou de 0,07 a 0,74 e utilizando SNPs variou de 0,08 a 1,45. Apesar da precisão de predição não ter sido alta para ambas as abordagens, podemos considerar a utilização da abordagem SNP na seleção genômica, pois é um método computacional mais eficiente. / The aim of this study were genome-wide association (GWAS) and genomic prediction using haplotypes approach for fatty acid profile of intramuscular fat of longissimus dorsi muscle in Nellore cattle. The investigated dataset contained records from 963 Nellore bulls, finished in feedlot (90 days) and slaughter with about two years old. Meat samples of Longissimus dorsi muscle, between the 12th and 13th ribs of the left half-carcasses, were taken to measure the fatty acids (FAs). FAs were quantified by gas chromatography (GC-2010 Plus - Shimadzu AOC 20i autoinjector) using SP-2560 capillary column (100 m x 0.25 mm diameter with 0.02 mm thickness, Supelco, Bellefonte, PA). The animals were genotyped using the high-density SNP panel (BovineHD BeadChip assay 777k, Illumina Inc., San Diego, CA). Those SNP markers with minor allele frequency less than 0.05, call rate less than 90%, monomorphic, located on sex chromosomes, and those with unknown position were removed from the analysis. After genomic quality control, 469,981 SNPs and 892 animals were available for the analyses. Missing genotypes were imputed and genotypes were phased to haplotypes using FImpute software. Haplotype blocks were defined based on linkage disequilibrium using HaploView software. In chapter 2, statistical analyzes incorporating the haplotype information were performed using ASREML software implementing the REML method. The model included fixed effects of the contemporary group (62 levels), haplotype (linear regression in number of copies) and age at slaughter as a linear covariate. The p values were adjusted by FDR method. Haplotypes significantly associated were selected at 10% significance level. For the prospection of the genes, the NCBI database was used in the UMD3.1 version of the bovine genome, the Ensembl Genome Browser and DAVID. There were significantly (p <0.05), 4, 3, 5, 1, 6, 2 and 7 haplotypes associated with SFA, MUFA, PUFA, PUFA/SFA ratio, n3, n6 and n6/n3 ratio, respectively. These significant haplotypes harboring genes involved in lipid metabolism elongation factors and long-chain fatty acid synthesis, reproductive hormone receptors, transport and use of fatty acids and cholesterol biosynthesis and hydrolysis of phospholipids and constituents membrane, cell membrane constituent , energetic metabolism and protein kinase synthesis. Thus, the identification of these associated haplotypes may contribute to further studies to validate these regions and prospect candidate genes that would be useful for breeding programs to improve the quality of Nellore beef. In chapter 3, the model used to estimate variance components, genetic parameters and predict the genomic values included fixed effects of contemporary group and age at slaughter as a linear covariate, and the additive random genetic effect. The accuracy using haplotype approach ranged from 0.07 to 0.31 and using SNP approach ranged from 0.06 to 0.33. The regression coefficient using haplotype approach ranged from 0.07 to 0.74 and using SNP approach ranged from 0.08 to 1.45. Despite prediction accuracy was not high for both approach we can consider use SNP approach in genomic selection because is more efficient computational. / FAPESP: 2015/25304-8/Bolsa de doutorado no país / FAPESP: 2016/24085-3/Bolsa de estágio e pesquisa no exterior / CAPES: 001

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-08-09Bitstream added on 2014-06-13T20:04:46Z : No. of bitstreams: 1 hadlich_jc_dr_botfmvz.pdf: 425826 bytes, checksum: 851cc90401c88b4b9f86ddc4b378c705 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Este trabalho foi conduzido com o objetivo de estudar o padrão de crescimento do tecido muscular por caracterização das fibras musculares durante o desenvolvimento animal e suas conseqüências na maciez final da carne de bovinos da raça Nelore. Foram utilizados 20 animais da raça Nelore criados no modelo biológico superprecoce. Durante o crescimento foi realizada biopsia nos animais para analisar a composição do tecido muscular no animal in vivo e sua influência na qualidade da carne postmortem. A área e diâmetro das fibras SO, FOG e FG (fibras oxidativas, oxidativas-glicolíticas e glicolíticas) apresentaram correlações (P<0,01) entre elas demonstrando que o crescimento é um evento que ocorre concomitantemente para os diferentes tipos de fibras. Com relação aos parâmetros de qualidade de carne foi encontrada correlação positiva entre a área e diâmetro das fibras FG e valores de força de cisalhamento (rp=0,68, P<0,05; rp=0,81, P<0,01 respectivamente) e correlações negativas entre área e diâmetros das fibras FG e índice de fragmentação miofibrilar, ambos medidos na carne com 48 horas de resfriamento (rp= -0,75, P<0,01; rp= -0,58, P>0,05 respectivamente). Desta maneira podemos inferir que o tamanho da fibra muscular pode influenciar negativamente nas características de qualidade de carne, em especial a maciez. / The present work was lead with objective to study the standard of growth of the tissue muscular by characterization of the muscular fibers during the animal development and the consequences in the final meat tenderness of bovines of Nellore breed. Twenty animals of Nellore breed had been feedlot in the superprecoce' biological model. During the growth samples were collected by biopsy in animals to analyze the composition of muscular tissue in living animal and the influence in the meat quality on the postmortem. The area and diameter of fibers SO, FOG and FG (slow oxidative, fast oxidative-glicolitic and fast glicolitic), had showed correlations (P<0,01) between them demonstrating that growth is an event which occurs concomitantly for different types of fibers. In relation to the characteristics of meat quality it was found a positive correlation between the area and diameter of fibers FG and shear force values (rp=0,68, P<0,05; rp=0,81, P<0,01 respectively) and negative correlations between FG area and diameters of fibers and myofibrilar fragmentation index, both measured in the meat with 48 hours of cooling (rp= -0,75, P<0,01; rp= -0,58, P>0,05 respectively). In this way we can infer which size of muscular fiber can influence negatively in meat quality characteristics of, tenderness especially.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-07Bitstream added on 2014-06-13T18:31:17Z : No. of bitstreams: 1 batista_eos_me_araca.pdf: 385042 bytes, checksum: a09da05bf31ae74120f8fbc231868087 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foi avaliada a variação na concentração de GH em resposta a agonistas ou antagonistas de neurotransmissores durante o período pré-púbere em 10 novilhas da raça Nelore. A administração de um antagonista gabaérgico (picrotoxina, 0,18 mg/kg, I.V., amostras a cada 15 min por 10 h) aumentou a concentração de GH aos 10 meses de idade, mas não aos 14 e 17 meses. Tanto no grupo Picrotoxina, como no Controle a concentração média de GH foi maior aos 10 meses do que aos 17 meses de idade. O grupo picrotoxina apresentou aos 17 meses maior área de concentração de GH que o controle. O grupo picrotoxina apresentou aos 14 meses maior área total de picos que o controle. Aos 10 e 14 meses no grupo Picrotoxina houve maior amplitude de picos do que aos 17 meses. Bloqueando o receptor (D2) dopaminérgico (sulpiride, 0,59 mg/kg, SC, amostras a cada 15 min por 10 h) houve aumentou na concentração de GH aos 8 e 12 meses, mas não aos 16 meses de idade, comparado ao grupo controle. No grupo Sulpiride a concentração média de GH foi maior aos 8 e 12, comparado com os 16 meses de idade. Em relação à área total de secreção, área total de picos, e amplitude máxima de picos de secreção de GH não houve diferença entre os grupos. Aos 8 meses o grupo Sulpiride apresentou menor tempo, porém aos 12 meses o tempo foi maior para o primeiro pico em relação ao controle. O tempo para o primeiro pico foi menor aos 8 e 16 meses que aos 12 meses no grupo Sulpiride. No grupo controle aos 12 meses o tempo para o primeiro pico foi menor que aos 8 e 16 meses. Aos 16 meses o grupo Sulpiride apresentou maior freqüência de picos que o Controle. A aplicação de um estimulador alfa-adrenérgico (clonidina, 10 µg/kg, I.V., amostras a cada 15 min por 4 h) aumentou a concentração média de GH aos 8 e 15 meses em relação ao grupo Controle e em alguns intervalos aos 12 meses... / This study evaluated the GH concentration after neurotransmitter agonist or antagonists injection in prepubertal Nelore heifers at different ages. A gabaergic antagonist (picrotoxin, 0.18 mg/kg,I.V., samples every 15 min for 10h) promoted an increase on GH concentration at 10 months of age but not at 14 and 17 mo. In both Picrotoxin and Control groups GH average concentration was higher at 10 mo than at 17 month of age. At 17 mo the picrotoxin group had a larger GH concentration area than control. There was no difference among the groups on the time for the first GH surge, but at 14 mo the Picrotoxin group had a higher total peak area than control. At 10 and 14 mo the Picrotoxin group had an higher peak amplitude than at 17 months. Blocking the D2-dopaminergic receptor (Sulpiride 0.59 mg/kg, SC, samples every 15 min for 10 h) there was an increase on GH secretion at 8 and 12 months, but not at 16 mo of age, compared to control group. Inside Sulpiride group the average GH concentration was higher at 8 and 12 mo than at 16 month of age. For both total area, peaks total area, time for first peak, and peak maximal amplitude there was no difference among groups. The time for the first GH peak was lower for Sulpiride compared to Control group at 8 mo, but at 12 mo the time was higher than in Control. Inside Sulpiride group time was lower at 8 and 16 month compared to 12. In the control group time for the first peak was lower at 12 than 8 and 16 months. At 16 month the Sulpiride group had higher peak frequency than Control. An alpha adrenergic stimulation (Clonidine, 10 µg/kg, IV, samples every 15 min for 4 h) increased mean GH concentration at 8 and 15 months compared to Control group and at some intervals at 12 months. At 8 months Clonidine group had higher total secretion area, total peak area, maximum peak amplitude and lowe time for the first GH secretion peak, compared... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Luis Artur Loyola Chardulo / Banca: Maurício Medeiros Cabral / Banca: Saulo da Luz e Silva / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Paulo Roberto Rodrigues Ramos / Resumo: Este trabalho foi conduzido com o objetivo de estudar o padrão de crescimento do tecido muscular por caracterização das fibras musculares durante o desenvolvimento animal e suas conseqüências na maciez final da carne de bovinos da raça Nelore. Foram utilizados 20 animais da raça Nelore criados no modelo biológico superprecoce. Durante o crescimento foi realizada biopsia nos animais para analisar a composição do tecido muscular no animal in vivo e sua influência na qualidade da carne postmortem. A área e diâmetro das fibras SO, FOG e FG (fibras oxidativas, oxidativas-glicolíticas e glicolíticas) apresentaram correlações (P<0,01) entre elas demonstrando que o crescimento é um evento que ocorre concomitantemente para os diferentes tipos de fibras. Com relação aos parâmetros de qualidade de carne foi encontrada correlação positiva entre a área e diâmetro das fibras FG e valores de força de cisalhamento (rp=0,68, P<0,05; rp=0,81, P<0,01 respectivamente) e correlações negativas entre área e diâmetros das fibras FG e índice de fragmentação miofibrilar, ambos medidos na carne com 48 horas de resfriamento (rp= -0,75, P<0,01; rp= -0,58, P>0,05 respectivamente). Desta maneira podemos inferir que o tamanho da fibra muscular pode influenciar negativamente nas características de qualidade de carne, em especial a maciez. / Abstract: The present work was lead with objective to study the standard of growth of the tissue muscular by characterization of the muscular fibers during the animal development and the consequences in the final meat tenderness of bovines of Nellore breed. Twenty animals of Nellore breed had been feedlot in the superprecoce' biological model. During the growth samples were collected by biopsy in animals to analyze the composition of muscular tissue in living animal and the influence in the meat quality on the postmortem. The area and diameter of fibers SO, FOG and FG (slow oxidative, fast oxidative-glicolitic and fast glicolitic), had showed correlations (P<0,01) between them demonstrating that growth is an event which occurs concomitantly for different types of fibers. In relation to the characteristics of meat quality it was found a positive correlation between the area and diameter of fibers FG and shear force values (rp=0,68, P<0,05; rp=0,81, P<0,01 respectively) and negative correlations between FG area and diameters of fibers and myofibrilar fragmentation index, both measured in the meat with 48 hours of cooling (rp= -0,75, P<0,01; rp= -0,58, P>0,05 respectively). In this way we can infer which size of muscular fiber can influence negatively in meat quality characteristics of, tenderness especially. / Doutor