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Durchflusszytometrische Epitop-Kartierung von HCMV-spezifischen T-Zellen herz- und lungentransplantierte PatientenHoffmeister, Bodo 18 May 2004 (has links)
HINTERGRUND: Die Reaktivierung des Humanen Cytomegalievirus (HCMV) ist immer noch eine häufige Ursache für Morbidität und Mortalität unter immunsupprimierten Patienten. Eine effiziente T-Zell-Antwort vermag die unkontrollierte Ausbreitung des Virus zu verhindern. Vieles über diese T-Zell-Antwort ist aber noch unklar. Im Rahmen dieser Studie wurden daher bei HCMV-seropositiven herz- (n = 17) und lungentransplantierten (n = 3) Patienten Epitope in zwei wichtigen T-Zell-Zielen, den HCMV-Proteinen IE-1 (UL123) und pp65 (UL83), identifiziert, die Frequenzen der für diese Epitope spezifischen T-Zellen gemessen und die Klonalität ausgewählter starker CD8+ T-Zell-Antworten untersucht. METHODEN: Dazu wurden Pentadecapeptide, die die gesamte Aminosäure-Sequenz von IE-1 bzw. pp65 umfassten und sich um jeweils 11 Aminosäurereste überlappten, in Pools von 25 bis 30 Peptiden so zusammengefasst, dass jedes Peptid in einer einzigartigen Kombination von drei Pools enthalten war. PBMC der Patienten wurden dann mit den Peptid-Pools stimuliert und die resultierenden T-Zell-Reaktionen durch Färbung von intrazellulär zurückgehaltenem Interferon-gamma durchflusszytometrisch sichtbar gemacht. Immunogene Peptide konnten anhand der jeweiligen drei Pools, die zu IFN-gamma-Produktion führten, eindeutig identifiziert werden. Einige dieser T-Zell-Populationen wurden durch einen IFN-gamma-Sekretions-Assay, magnetische Zellseparation und durchflusszytometrische Feinsortierung aus PBMC isoliert und ihre Klonalität mit Hilfe einer Polymerase-Kettenreaktion zum Nachweis klonal expandierter gamma-T-Zell-Rezeptor-Rearrangements (TCR-PCR) und anschliessender Fragmentanalyse fluoreszenzmarkierter PCR-Amplifikate untersucht. ERGEBNISSE: Bei den Patienten bestanden grosse Unterschiede hinsichtlich des jeweils immundominanten Proteins, der Dominanz von CD4+ bzw. CD8+ T-Zell-Subpopulation, der antigenen Determinanten, der gemessenen Peptid-spezifischen T-Zell-Frequenzen sowie der Anzahl der identifizierten Epitope. Zehn zuvor noch nicht beschriebene Epitope wurden eben-falls identifiziert und die präsentierenden HLA-Allele der meisten in der Patientengruppe identifizierten Epitope bestimmt. Die mittels TCR-PCR untersuchten CD8+ T-Zell-Reaktionen waren auf einen oder wenige Klone fokussiert. Die Korrelation der experimentellen Daten mit den klinischen Verläufen der Patienten hinsichtlich HCMV-Reaktivierung und -Erkrankung erbrachte jedoch keine Hinweise auf einen konkreten Zusammenhang. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Zusammenfassend ermöglichen die hier vorgestellten Methoden die Untersuchung des Langzeitverlaufes der CD4+ und CD8+ T-Zell-Antwort gegen immundominante Proteine auf Epitop-Ebene nach initialer Identifizierung der antigenen Determinanten, die direkte Bestimmung der Frequenzen der Epitop-spezifischen T-Zellen sowie die Untersuchung der Klonalität dieser Reaktionen aus ca. 2 x 20 ml Blut. Die Langzeit-Untersuchung von Patienten mit hohem Risiko für HCMV-Reaktivierung und -Erkrankung kann so zu einem besseren Verständnis der komplexen HCMV-spezifischen T-Zell-Anwort und damit möglicherweise auch zur Verbesserung von Diagnose, Prophylaxe und Therapie dieser Patienten beitragen. / BACKGROUND: Human cytomegalovirus (HCMV) reactivation is still a leading cause of morbidity and mortality among immunosuppressed patients. Uncontrolled viral spread is prevented by an efficient T-cell response. However, little is known about the nature of this T-cell response. In this study we identified epitopes in two immunodominant HCMV-proteins, IE-1 (UL123) and pp65 (UL83), measured the frequencies of T-cells specific for these, and studied the clonotypic composition of selected T-cell responses in a group of HCMV-seropositive heart (n = 17) and lung (n = 3) transplant patients. METHODS: For both proteins overlapping pentadecapeptides covering the entire respective amino acid sequences were arranged in pools of 25 peptides each in such a way that every peptide was contained in exactly 3 pools. PBMC were stimulated with the resulting 15 pools for IE-1 or 16 pools or pp65, respectively, as well as with pools containing all peptides of the corresponding protein. Individual peptides leading to a positive T-cell response were identified by flow cytometric detection of intracellular interferon-gamma, each single peptide corresponding to a unique combination of 3 peptide pools. Selected T-cell populations specific for the previously identified single peptides were purified by performing an IFN-gamma secretion assay prior to magnetic cell separation and subsequent fluorescence-activated cell sorting. The clonality of these highly purified peptide-specific T-cell populations was then investigated by a T-cell receptor-gamma rearrangement-PCR and subsequent fragment analysis of fluorescence-labelled PCR amplificates. RESULTS: We observed broad heterogeneity among the patients in terms of the immunodominant protein, number of epitopes, predominance of CD4 or CD8 T-cell responses, and epitope-specific T-cell frequencies. 10 previously unknown epitopes were identified, and the HLA-restriction of most of the identified epitopes could be determined. The investigated T-cell responses showed a high degree of clonal focussing. These data were correlated to the patients episodes of HCMV reactivation, but a correlation between differences in the T-cell responses and a different clinical outcome in terms of HCMV-reactivation could not be established. CONCLUSIONS: In summary, this novel approach allows the rapid identification of epitopes contained in a given protein, direct determination of T-cell frequencies, and investigation of the T-cell clonality in the CD4 and CD8 T-cell subsets from as little as 2 times 20 ml of blood. Long-term follow-up of patients at risk for HCMV reactivation and disease may thus allow a more detailed insight into the complexity of the T-cell response to HCMV and may thus lead to improved diagnosis, prophylaxis and therapy.
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Einfluss von Anbau- und Pflegemaßnahmen auf die Hexenbesenkrankheit (Crinipellis perniciosa (Stahel) Singer) bei Kakaoklonen im Siedlungsgebiet Alto Beni - BolivienMilz, Joachim 12 February 2008 (has links)
Die Hexenbesenkrankheit (Crinipellis perniciosa) ist eine Pilzkrankheit, die nur meristematisches Pflanzengewebe des Kakaobaumes befällt. Sie tritt bisher ausschließlich auf dem Lateinamerikanischen Kontinent auf. Für die Region des Alto Beni im feuchttropischen Tiefland Boliviens wurden die Interaktionen zwischen Witterung, Inokulum und Phänologie der Wirtspflanze untersucht, um effiziente und ökonomisch vertretbare Kontroll- und Bekämpfungsprogramme zu entwickeln. Von 1994 bis 97 wurden zudem die Kakaoklone ICS 1, ICS 6, ICS 8, ICS 95 und TSH 565 unter Feldbedingungen auf Hexenbesentoleranz und Ertrag untersucht. Zusätzlich wurden unterschiedliche Baumschnittfrequenzen auf ihre Effizienz hinsichtlich des Ertragsverhaltens der Klone und der Auswirkung auf Hexenbeseninfektionen überprüft. Die Ergebnisse zeigen einen Zusammenhang zwischen Niederschlagsereignissen und der Ausbildung von Fruchtkörpern an Hexenbesen. Es konnte im gesamten Untersuchungszeitraum jedoch kein kausaler Zusammenhang zwischen der Intensität von Fruchtkörperbildungen an Hexenbesentrieben und der Anzahl an Hexenbeseninfektionen der untersuchten Bäume festgestellt werden. Die fünf Klone zeigten sowohl signifikante Unterschiede in Bezug auf ihre Anfälligkeit gegenüber Hexenbesen als auch in ihrem Ertragsverhalten. Die unterschiedliche Schnitthäufigkeit zeigte dagegen weder statistisch abgesicherte Differenzen hinsichtlich der Anzahl von Hexenbeseninfektionen noch hatte sie Einfluss auf den Ertrag. Die gängigen Bekämpfungsmethoden wie Baumschnitt und der Einsatz von tolerantem Pflanzenmaterial stellen keine grundsätzliche Lösung des Problems dar. Die bisher gewonnen Erfahrungen im Landbau unter Anwendung der Prinzipien sukzessionaler Agroforstsysteme zeigten, dass diese möglicherweise eine langfristige Perspektive für die Landnutzung in tropischen Regionen und zur Reduzierung phytosanitärer Probleme darstellen könnten. / The witches’ broom disease (Crinipellis perniciosa) is a fungal infection which only affects the meristematic plant tissues of the cocoa tree. To date it has been restricted to the Latin American continent. The aim of this work was to examine scientifically the measures undertaken in the Alto Beni region in the humid tropical lowlands of Bolivia, to curb the witches’ broom disease (Crinipellis perniciosa) by phytosanitary pruning measures and by the use of various tolerant clones From 1994 to 97, the cocoa clones ICS 1, ICS 6, ICS 8, ICS 95 and TSH 565 were also studied under field conditions at the Sapecho location for witches’ broom tolerance and yield. In addition, various pruning frequencies were examined for their efficiency with regard to the yields of the clones and the effects on witches’ broom infection The results show a connection between rainfall levels and the formation of basidiocarps on the witches’ broom. However, over the whole of the investigation period, no causal connection was found between the intensity of basidiocarp production on the witches’ broom shoots and the number of witches’ broom infections on the trees under investigation. The five clones showed significant differences both in relation to their susceptibility to witches’ broom and in their yields. The different pruning frequencies, on the other hand, did not show any statistically provable differences in terms of the number of witches’ broom infections, nor did they influence the yields. It has become clear that neither the own studies nor the many research works undertaken at an international level were able to find a fundamental solution to the witches’ broom problem. Agriculture using the principles of successional agroforestry systems could represent a long-term perspective for land use in these areas, with the emphasis on more than short-term economic, social or structural objectives.
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Biohemijski mehanizmi otpornosti klonova topole (Populus spp.) na vodni stres / Biochemical aspects of resistence of poplar (Populus spp) clones on water streessŽdero Pavlović Ružica 09 November 2017 (has links)
<p>Cilj ove doktorske disertacije predstavljalo je ispitivanje uticaja vodnog stresa izazvanog sa polietilen glikolom (PEG) 6000 na biohemijske osobine klonova topole. Reznice tri klona topole (M-1, B-229 i PE19/66) su hidroponski gajene i izložene 100 mOsm i 200 mOsm PEG 6000 tokom šest dana. Nakon tretmana u kontrolnim i stresiranim<br />biljkama su ispitane promene aktivnosti antioksidantnih enzima, aktivnost dva<br />enzimska markera polifenolnog metabolizma, fenolni profil, antioksidantna aktivnost, kao i sadržaj prolina i glicin betaina (GB). Takođe, ispitan je biohemijski odgovor kulture tkiva klona M-1 na vodni stres izazvan sa PEG 6000.</p><p>U oba eksperimenta uočeno je da je akumulacija prolina i GB u uslovima vodnog stresa izazvanog sa PEG 6000 najvažnija strategija u otpornosti na stres i prevazilaženju vodnog deficita, tako da se ovi parametri mogu definisati kao najbolji indikatori otpornosti topole na sušu.</p><p>Rezultati ovog istraživanjaupotpunjavaju saznanja o povezanosti oksidativnog stresa uzrokovanog vodnim stresom sa antioksidantnim odgovorom, nivoom oštećenja lipida i proteina, uključivanjem osmolita kao i promenama u polifenolnom profilu. Takođe, dobijeni rezultati su značajni za odabir klonova topola tolerantnih na vodni stres i za<br />pošumljavanje sušnih staništa, kojih će biti sve više usled negativnog uticaja klimatskih promena.</p> / <p>The aim of presented doctoral thesis was investigation of the impact of water deficit caused by polyethylene glycol (PEG) 6000 on biochemical features of poplar clones. During six days, cuttings of three poplar clones (M-1, B-229 and PE 19/66) were grown in hydroponics and subjected to 100 and 200 mOsm PEG 6000. Changes in the activity of antioxidant enzymes, polyphenol characterization, two enzymatic markers of polyphenol metabolism, antioxidant capacity, as well as proline and glycine betaine content were investigated in stressed plants. Furthermore, assessment of biochemical response of poplar clone M-1 tissue culture to water stress induced by PEG 6000 was performed.</p><p>In both experiments, the most important strategy for stress resistance and overcoming water deficiency was accumulation of proline and glycine betaine so these parameters can be defined as the best indicators of poplar resistance to drought.</p><p>The results of this study complete the findings on the oxidative stress caused by water stress and their relationship with the antioxidant response, the level of lipid andprotein damage, accumulation of the osmolites and changes in the polyphenol profile. Also, the obtained results may be important for the selection of poplar clones resistant to water stress and for afforestation in arid sites, which appeared to be more numerous due to the effects of global climate change.</p>
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Modelling of Biomass Production Potential of Poplar in Short Rotation Plantations on Agricultural Lands of Saxony, Germany / Modellierung der Ertragspotentiale von Pappelklonen in Kurzumtriebsplantagen auf sächsischen AckerflächenAli, Wael 16 March 2009 (has links) (PDF)
The interest in renewables for energy has increased in the last 2-3 decades because of the negative environmental impact caused by the burning of fossil fuels, the raising prices of traditional fuels, the dependence on foreign oil, and the decrease in fossil fuels resources. Biomass energy represents one of the most promising alternatives. Many studies worldwide were devoted to investigate growth and yield of short rotation forestry plantations for energetic use and several empirical and process-based models were developed to predict the potential production of biomass. The current work was concentrated on modelling site productivity (potential of biomass production) of specific poplar clones planted on arable Saxon land under different stocking densities. Empirical data collected from several experimental areas were used. Site productivity has been predicted depending on stand age and site variables using a two-step model. In step one age and site variables were used to model stand dominant height and in step two the constructed dominant height was involved with stocking density to predict stand oven dried biomass. Depending on data availability the model was parameterized for four different groups of poplar clones: Androscoggin (clone Androscoggin), Matrix (Matrix and hybrid 275), Max (Max 1 …Max 5) and Münden (clone Münden). Both stand dominant height and stand dry biomass were modelled for ages 2 – 9 years for clone groups: Matrix and Max and for ages 2 – 7 years for clone groups: Androscoggin and Münden. The model has been tested and validated using several statistical and graphical methods. The relative bias (ē %) in the dominant height estimates ranged between 0.5 % &gt; ē % &gt; - 0.5 % in all clone groups and had a maximum bias of 10.41 % in stand biomass estimates. Model accuracy (mx %) in the dominant height estimates ranged between 12.25 and 17.56 % and between 8.05 and 27.32 % in stand biomass estimates. Two different scenarios were presented to show the potential of biomass that can be produced from poplar plantations on arable and former fallow Saxon lands at different stocking densities. ArcGIS has been used to visualize model application results. In order to produce a mean annual increment ≥ 8 [dry t/ha/a] from poplar plantations (Max group) for more than 50 % of arable or former fallow lands in the first rotation at least 9 years are required under stocking density of 4000 stems/ha and 7 years for both stocking densities 8333 and 10,000 stems/ha. / Die Nachfrage nach Holz für energetische Zwecke nimmt in Deutschland und ganz Europa zu. Um diesen Bedarf künftig besser befriedigen zu können, müssen verstärkt Ressourcen aus verschiedenen Quellen wie z. B. Holz aus Niederwäldern oder Durchforstungsreserven im Hochwald mobilisiert und ergänzend Holz in Kurzumtriebsflächen produziert werden (Guericke, M. 2006). Ziel dieser Arbeit war es, das Ertragspotential von Pappelklonen in Kurzumtriebsplantagen unterschiedlicher Baumdichte auf sächsischen Ackerflächen zu untersuchen. Hierzu wurden die potentiellen Erträge anhand empirischer, auf verschiedenen Versuchsflächen erhobener Daten modelliert. Zur Schätzung des Ertragspotentials wurde ein zweistufiges Modell entwickelt: Im ersten Schritt erfolgte die Modellierung der Oberhöhe eines Bestandes (ho, m) in Abhängigkeit von Bestandesalter und Standortfaktoren unter Verwendung einer multiplen linearen Regressionsanalyse, dabei wurden Bestimmtheitsmaße (R²) von 0,975 bis 0,989 erreicht. In einem zweiten Schritt lässt sich dann der Biomassevorrat [tatro/ha/a] mittels nichtlinearer Regressionsanalyse durch die Bestandesoberhöhe schätzen. Das Bestimmtheitsmaß von R² ≥ 0,933 weist auch hier auf eine hohe Anpassungsgüte hin. Die Modellparametrisierung erfolgte für folgende vier Gruppen von Pappelklonen: • Max-Gruppe: Klone Max 1, Max 2, Max 3, Max 4 und Max 5, Altersbereich 2 – 9 Jahre, Baumdichten von 1150 – 13000 Stämmen/ha; • Matrix-Gruppe: Klon Matrix und Hybride 275, Altersbereich 2 – 9 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha; • Androscoggin-Gruppe: Klon Androscoggin, Altersbereich 2 – 7 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha; und • Münden-Gruppe: Klon Münden, Altersbereich 2 – 7 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha. Die Güte des Modells wurde mit Hilfe verschiedener statistischer Verfahren überprüft. Bei der Validierung anhand des Datensatzes, welcher für die Modellkonstruktion Verwendung fand, zeigte das Modell eine Verzerrung bzw. einen Bias von 0,5 % &gt; ē % &gt; - 0,5 % bei der Bestandesoberhöhenschätzung und einen maximalen Bias von 10,41 % bei der Schätzung der Bestandesbiomasse. Die Treffgenauigkeit (mx %) des Modells hingegen variierte zwischen 12,25 % und 17,56 % bzw. 8,05 und 27,32 % (bei Schätzung der Bestandesoberhöhe bzw. der Bestandesbiomasse). Zudem wies das Modell keinen systematischen Fehler zwischen den geschätzten und den realen Werten auf. Bei der Validierung mit einem unabhängigen Datensatz betrug die Treffgenauigkeit (mx %) für die Schätzung der Bestandsoberhöhe und des Biomassevorrates 15,72 bzw. 26,68 %. Um das Ertragspotenzial von Pappelplantagen für die gesamte sächsische Ackerfläche bzw. die gesamte ehemalige Stilllegungsfläche zu bestimmen, wurden die zu Schätzung erforderlichen Standortvariablen auf Gemeindebasis kalkuliert, mittels ArcGIS dargestellt sowie Simulationsrechungen für verschiedene Bestandsdichten vorgenommen und ebenfalls visualisiert. Den Ergebnissen der Simulationsrechnungen zufolge wäre bei einer Stammzahl von 4000 N/ha eine Rotationslänge von 9 Jahren, bei 8333 bis 10.000 N/ha von 7 Jahren erforderlich, um einen durchschnittlichen Gesamtzuwachs (dGz) von ≥ 8 [tatro/ha/a] auf mehr als 50 % der sächsischen Ackerflächen bzw. ehemaligen Stilllegungsflächen in erster Rotation zu erreichen. Würde die gesamte ehemalige sächsische Stilllegungsfläche mit einer Baumdichte von 10.000 Stämmen/ha bepflanzt werden, könnten Pappelplantagen im Alter 9 einen dGz von 520.000 [tatro/a] (entsprechend 250.000 Kubikmeter Diesel) erreichen. Bei Bestockung aller sächsischen Ackerflächen würde sich der Ertrag auf bis zu 9.087.000 [tatro/a] (entsprechend 4.367.000 Kubikmeter Diesel) erhöhen.
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La rentabilité de la fidélisation du consommateur : 3 essais complémentaires.Vallaud, Thierry, Vallaud, Thierry 19 June 2013 (has links) (PDF)
Dans cette thèse sur travaux, l'auteur part de deux travaux précédents sur la rentabilité de la fidélisation et la détermination du potentiel client pour faire un constat : une partie de la rentabilité de la fidélisation et du potentiel pour une marque est basée sur la part captable du chiffre d'affaire fait à la concurrence ; le taux de captation.Dans ce nouveau travail il s'agit de montrer que le taux de captation est basé sur l'élasticité du taux de nourriture. A partir d'une analyse de la littérature et de plusieurs modélisations sur des données de panel scannérisées, l'auteur démontre, sur plusieurs marchés, que l'élasticité du taux de nourriture est contrainte et prévisible.C'est donc en tenant compte de cet écart limité qu'une marque peut estimer le taux de captation et donc la rentabilité de la fidélisation ainsi que le potentiel client.
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Qualidade e atividade antioxidante total em pedúnculos de clones de cajueiros anão precoce em diferentes estádios de maturação / Bioactive compounds and total antioxidant capacity of cashew apples of early dwarf cashew clones at different maturity stagesLopes, Mônica Maria de Almeida January 2011 (has links)
LOPES, Mônica Maria de Almeida. Qualidade e atividade antioxidante total em pedúnculos de clones de cajueiros anão precoce em diferentes estádios de maturação. 2011. 101 f. : Dissertação (Mestrado em Bioquímica)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-06-22T14:00:59Z
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Previous issue date: 2011 / Rich sources of antioxidants are important for the maintenance of human health, and in recent years, increasing attention has been given to the antioxidants found in fruits, this is due to epidemiological studies that have shown that high intake of fruit is associated with reduced mortality due to vascular diseases and cancers, as justified by the antioxidant activity in these products. This work aimed at to physical characterization, quality and total antioxidant activity of four early dwarf cashew clones: CCP 09, CCP 76, BRS 189 and BRS 265 were harvest from the Experimental Farm of Pacajus-CE, selecting among these clones that presenting the best results when analysed in seven different stages of maturation. The clones were characterized to results: size, weight, firmness, color, pH, soluble solids (SS), titrable acidity (AT), SS/TA ratio, vitamin C, total carotenoids (TC), total anthocyanins (TAN), yellow flavonoids (YF), extractable polyphenols (EP), total antioxidant capacity (TAC), catalase (CAT), superoxide dismutase (SOD) and ascorbate peroxidase (APX). Activity antioxidant the cashew apples analysed are mainly attributed contents of extrable polyphenols, and this therefore considered as relevant sources of antioxidant compounds, which are necessary for the maintenance of human health. Positive and significant correlations were found between extrable polyphenols and antioxidant activity. The clones that had prominence were the BRS 265 and the CCP 09. The highest ascorbic acid contents were found in the BRS 265 clone, throughout growth and maturation of the cashew apples. The highest levels extrable polyphenols and antioxidant capacity were found in CCP 09 in first five maturity stages. These cashew apples are consumed fresh, which means a potential, and untapped, market for them exists. Therefore, these cashew apples represent a real potential for the development of new products with functional properties, may be explored for antioxidant supplements industry or usefully studied by the industry food for the development of diverse products. / Fontes ricas em compostos antioxidantes são importantes para a manutenção da saúde humana, e nos últimos anos, uma maior atenção tem sido dada aos antioxidantes encontrados nos frutos, isso se deve a estudos epidemiológicos que demonstraram que uma alta ingestão de frutos está estritamente associada à redução da mortalidade por doenças vasculares e cânceres, sendo justificado pela atividade antioxidante presente nesses produtos. Com isso, esse experimento objetivou a caracterização física, qualidade e atividade antioxidante total de quatro clones de cajueiro anão precoce: CCP 09, CCP 76, BRS 189 e BRS 265, oriundos do Campo Experimental de Pacajus-CE, selecionando entre esses clones os que apresentam os melhores resultados quando analisados em sete diferentes estádios de maturação. Sendo caracterizados quanto à: tamanho, peso, firmeza, coloração, pH, sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT), SS/AT, vitamina C, carotenóides totais (CT), antocianinas totais (ANT), flavonóides amarelos (FA), polifenóis extraíveis (PE), atividade antioxidante total (AAT), atividade da catalase (CAT), da dismutase do superóxido (SOD) e da peroxidase do ascorbato (APX). A atividade antioxidante dos pedúnculos de caju analisados deve-se, sobretudo ao conteúdo de polifenóis extraíveis, e são, portanto, considerados fontes relevantes de compostos antioxidantes, que são necessários para a manutenção da saúde humana. Correlações positivas e significativas foram encontradas entre polifenóis extrable e atividade antioxidante. Os clones que tiveram destaque foram o BRS 265 e o CCP 09. Os maiores teores de ácido ascórbico foram encontrados no clone BRS 265, durante todo o crescimento e maturação dos pedúnculos. Os mais elevados níveis de polifenóis extraíveis e capacidade antioxidante total foram encontrados em CCP 09 nos primeiros cinco estádios de maturação. Os pedúnculos são consumidos frescos, o que significa que um potencial de mercado, inexplorado para eles existe. Portanto, os clones representam um potencial real para o desenvolvimento de novos produtos com propriedades funcionais, podendo ser explorados pela indústria de suplementos antioxidantes ou proveitosamente estudados pela indústria alimentar para o desenvolvimento de diversos produtos.
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Modelling of Biomass Production Potential of Poplar in Short Rotation Plantations on Agricultural Lands of Saxony, GermanyAli, Wael 03 March 2009 (has links)
The interest in renewables for energy has increased in the last 2-3 decades because of the negative environmental impact caused by the burning of fossil fuels, the raising prices of traditional fuels, the dependence on foreign oil, and the decrease in fossil fuels resources. Biomass energy represents one of the most promising alternatives. Many studies worldwide were devoted to investigate growth and yield of short rotation forestry plantations for energetic use and several empirical and process-based models were developed to predict the potential production of biomass. The current work was concentrated on modelling site productivity (potential of biomass production) of specific poplar clones planted on arable Saxon land under different stocking densities. Empirical data collected from several experimental areas were used. Site productivity has been predicted depending on stand age and site variables using a two-step model. In step one age and site variables were used to model stand dominant height and in step two the constructed dominant height was involved with stocking density to predict stand oven dried biomass. Depending on data availability the model was parameterized for four different groups of poplar clones: Androscoggin (clone Androscoggin), Matrix (Matrix and hybrid 275), Max (Max 1 …Max 5) and Münden (clone Münden). Both stand dominant height and stand dry biomass were modelled for ages 2 – 9 years for clone groups: Matrix and Max and for ages 2 – 7 years for clone groups: Androscoggin and Münden. The model has been tested and validated using several statistical and graphical methods. The relative bias (ē %) in the dominant height estimates ranged between 0.5 % &gt; ē % &gt; - 0.5 % in all clone groups and had a maximum bias of 10.41 % in stand biomass estimates. Model accuracy (mx %) in the dominant height estimates ranged between 12.25 and 17.56 % and between 8.05 and 27.32 % in stand biomass estimates. Two different scenarios were presented to show the potential of biomass that can be produced from poplar plantations on arable and former fallow Saxon lands at different stocking densities. ArcGIS has been used to visualize model application results. In order to produce a mean annual increment ≥ 8 [dry t/ha/a] from poplar plantations (Max group) for more than 50 % of arable or former fallow lands in the first rotation at least 9 years are required under stocking density of 4000 stems/ha and 7 years for both stocking densities 8333 and 10,000 stems/ha. / Die Nachfrage nach Holz für energetische Zwecke nimmt in Deutschland und ganz Europa zu. Um diesen Bedarf künftig besser befriedigen zu können, müssen verstärkt Ressourcen aus verschiedenen Quellen wie z. B. Holz aus Niederwäldern oder Durchforstungsreserven im Hochwald mobilisiert und ergänzend Holz in Kurzumtriebsflächen produziert werden (Guericke, M. 2006). Ziel dieser Arbeit war es, das Ertragspotential von Pappelklonen in Kurzumtriebsplantagen unterschiedlicher Baumdichte auf sächsischen Ackerflächen zu untersuchen. Hierzu wurden die potentiellen Erträge anhand empirischer, auf verschiedenen Versuchsflächen erhobener Daten modelliert. Zur Schätzung des Ertragspotentials wurde ein zweistufiges Modell entwickelt: Im ersten Schritt erfolgte die Modellierung der Oberhöhe eines Bestandes (ho, m) in Abhängigkeit von Bestandesalter und Standortfaktoren unter Verwendung einer multiplen linearen Regressionsanalyse, dabei wurden Bestimmtheitsmaße (R²) von 0,975 bis 0,989 erreicht. In einem zweiten Schritt lässt sich dann der Biomassevorrat [tatro/ha/a] mittels nichtlinearer Regressionsanalyse durch die Bestandesoberhöhe schätzen. Das Bestimmtheitsmaß von R² ≥ 0,933 weist auch hier auf eine hohe Anpassungsgüte hin. Die Modellparametrisierung erfolgte für folgende vier Gruppen von Pappelklonen: • Max-Gruppe: Klone Max 1, Max 2, Max 3, Max 4 und Max 5, Altersbereich 2 – 9 Jahre, Baumdichten von 1150 – 13000 Stämmen/ha; • Matrix-Gruppe: Klon Matrix und Hybride 275, Altersbereich 2 – 9 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha; • Androscoggin-Gruppe: Klon Androscoggin, Altersbereich 2 – 7 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha; und • Münden-Gruppe: Klon Münden, Altersbereich 2 – 7 Jahre, Baumdichte 1550 Stämme/ha. Die Güte des Modells wurde mit Hilfe verschiedener statistischer Verfahren überprüft. Bei der Validierung anhand des Datensatzes, welcher für die Modellkonstruktion Verwendung fand, zeigte das Modell eine Verzerrung bzw. einen Bias von 0,5 % &gt; ē % &gt; - 0,5 % bei der Bestandesoberhöhenschätzung und einen maximalen Bias von 10,41 % bei der Schätzung der Bestandesbiomasse. Die Treffgenauigkeit (mx %) des Modells hingegen variierte zwischen 12,25 % und 17,56 % bzw. 8,05 und 27,32 % (bei Schätzung der Bestandesoberhöhe bzw. der Bestandesbiomasse). Zudem wies das Modell keinen systematischen Fehler zwischen den geschätzten und den realen Werten auf. Bei der Validierung mit einem unabhängigen Datensatz betrug die Treffgenauigkeit (mx %) für die Schätzung der Bestandsoberhöhe und des Biomassevorrates 15,72 bzw. 26,68 %. Um das Ertragspotenzial von Pappelplantagen für die gesamte sächsische Ackerfläche bzw. die gesamte ehemalige Stilllegungsfläche zu bestimmen, wurden die zu Schätzung erforderlichen Standortvariablen auf Gemeindebasis kalkuliert, mittels ArcGIS dargestellt sowie Simulationsrechungen für verschiedene Bestandsdichten vorgenommen und ebenfalls visualisiert. Den Ergebnissen der Simulationsrechnungen zufolge wäre bei einer Stammzahl von 4000 N/ha eine Rotationslänge von 9 Jahren, bei 8333 bis 10.000 N/ha von 7 Jahren erforderlich, um einen durchschnittlichen Gesamtzuwachs (dGz) von ≥ 8 [tatro/ha/a] auf mehr als 50 % der sächsischen Ackerflächen bzw. ehemaligen Stilllegungsflächen in erster Rotation zu erreichen. Würde die gesamte ehemalige sächsische Stilllegungsfläche mit einer Baumdichte von 10.000 Stämmen/ha bepflanzt werden, könnten Pappelplantagen im Alter 9 einen dGz von 520.000 [tatro/a] (entsprechend 250.000 Kubikmeter Diesel) erreichen. Bei Bestockung aller sächsischen Ackerflächen würde sich der Ertrag auf bis zu 9.087.000 [tatro/a] (entsprechend 4.367.000 Kubikmeter Diesel) erhöhen.
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Fiziološki aspekti otpornosti hrasta lužnjaka (Quercus robur L.), cera (Quercus cerris L.) i crne topole (Populus nigra L.) u uslovima vodnog deficita / Physiological aspects of resistance of common oak (Quercus robur L.), the Turkey oak (Quercus cerris L.) and black poplar (Populus nigra L.) under conditions of water deficitTopić Mirjana 29 September 2015 (has links)
<p> U radu je ispitan uticaj vodnog deficita na fiziološke osobine klonova crne topole i<br />populacija hrasta lužnjaka i cera, kao i mogućnost oporavka ovih biljaka nakon ponovnog uspostavljanja optimalnog vodnog režima. Cilj istraživanja je bio da se ukaže na potencijal ispitivanih genotipova topole i hrastova za opstanak u promenljivim uslovima životne sredine, u skladu sa aktuelnim klimatskim promenama koje uključuju smanjenje količine padavina i ograničenu dostupnost vode. Dobijeni rezultati su pokazali specifično variranje ispitivanih morfo-anatomskih, fizioloških i biohemijskih parametara koje je zavisilo od momentalne vlažnosti zemljišta na primenjenom tretmanu (kontrola, suša praćena oporavkom, konstantna suša) i od genotipa biljke.<br /> Negativan uticaj vodnog deficita na tretmanu konstantne suše je u najmanjoj meri bio ispoljen na rastenje klona topole X/32, populaciju hrasta lužnjaka L1 i populaciju hrasta cera C1. Indeks tolerancije na stres izračunat na osnovu visine biljke (PHSI) takodje je potvrdio dobru morfološku prilagodjenost pomenutih genotipova<br />na uslove suše. Dobijene vrednosti indeksa stoma ukazuju da vodni status ispitivanih populacija hrastova nije bio naroĉito pogodjen vodnim deficitom na sušnim tretmanima.<br /> Tretman konstantne suše je u oba ogleda doveo do najvećeg smanjenja vrednosti<br />parametara razmene gasova kod skoro svih genotipova. S druge strane, primenjeni sušni tretmani nisu uslovili smanjenje sadržaja fotosintetiĉkih pigmenata, kao ni parametra Fv/Fm, kod većine ispitivanih biljaka. U odnosu na kontrolu, sadržaj prolina u listovima ispitivanih biljaka na tretmanu konstantne suše bio je znaĉajno povećan, a aktivnost enzima nitrat-reduktaze značajno smanjena, kod većine genotipova.<br /> Genotipovi kod kojih u uslovima jakog vodnog deficita nije došlo do značajne promene većine ispitivanih morfo-anatomskih, fizioloških i biohemijskih parametara mogu biti od velike važnosti kad je u pitanju njihov odabir i upotreba za uspešno pošumljavanje sušnih staništa, kojih će biti sve više usled negativnog uticaja brojnih ekoloških činilaca nastalih kao posledica klimatskih promena.</p> / <p>The impact of water deficit and recovery on physiological features of the black poplar clones, as well as of the oaks populations were analyzed. The aim of this research was to indicate the potential of the studied genotypes for survival under changing environmental conditions, in accordance with current climate changes, which include the reduction in amount of rainfall and limited water availability. Obtained results have shown a specific variation of studied morpho-anatomical, physiological and biochemical parameters which depended on soil humidity on the applied treatment (control, drought followed by recovery and permanent drought), as well as on plant genotype.</p><p>Water deficit on permanent drought treatment had little negative effect on plant growth of poplar clone X/32, as well as oak populations L1 and C1. Plant height stress tolerance index also confirmed good morphological adaptation to drought of these genotypes. Stomatal index was not negatively affected by water deficit in oak plants. In both experiments, a permanent drought treatment led to the largest reduction in the values of gas exchange parameters in almost all genotypes.</p><p>On the other hand, concentration of photosynthetic pigments was not considerably decreased in plants exposed to water deficit, as well as the parameter Fv/Fm, in most examined plants. Compared to the control, the impact of permanent drought treatment on biochemical parameters was expected, in the most cases. Compared to the control, proline content in leaves of most examined genotypes was significantly increased on permanent drought treatment, while nitrate reductase activity was significantly decreased.</p><p>Examined genotypes exhibiting slight or no reduction in values of the most examined parameters during severe drought stress, could be used for afforestation in arid sites. Arid habitats appeared to be more numerous due to the effects of global climate changes.</p>
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The influence of the environment on the volume growth, stem form and disease tolerance of Eucalyptus grandis clones in the summer rainfall areas of South AfricaPierce, Brian Thomas 04 1900 (has links)
Thesis (MPhil)--Stellenbosch University, 2000. / ENGLISH ABSTRACT: A thesis undertaken to quantify genotype-by-environment interaction within Eucalyptus
grandis clones growing in the eastern portion of South Africa. Thirty one sites were selected
to represent the "traditional" E. grandis growing areas of South Africa. Eleven common
macro- site variables and twelve common micro- site soil variables were recorded at each site.
Twenty seven E. grandis clones and four E. grandis hybrid clones were then evaluated over
these 31 sites. An incomplete latin square design was used to evaluate the 31 test clones, and
five E. grandis controls were incorporated into the trial design to link the 31 sites.
Volume production, stem form, stem defects and survival were assessed at two and five years,
as well as the disease infestation of three stem cankers at five years. The analytical methods
which were used to evaluate and quantify the GEl portion of the study are the analysis of
variance (ANOV A), correlation analysis, and joint regression analysis (IRA) together with
the analysis of co-variance (ACOV AR). The growth-site association for volume production,
stem form and Endothia disease infestation were investigated using factor analysis (FA), and
equations derived for the species and for the individual clones using a stepwise multiple
regression approach.
GEl, as evaluated through JRA, revealed that an increase in site productivity lead to a positive
linear response in productivity on a clonal level, and that there was a diverging or fanning
pattern among the regression lines of the clones. This tendency was also observed for both
the stem form and the Endothia infestation. Hence, no significant changes in the rankings of
the clones were found, and only relevant differences between the clones were found to change
significantly. Juvenile-mature genetic correlations for volume production and the stem form
showed moderate (rg = 0,66 and rg = 0,70) correlations between the two and the five year
assessments.
On a species level, rainfall was the main environmental factor responsible for volume
production, while latitude was the main influence on stem form and Endothia infestation. On
an individual clone basis, some micro-site soil factor interaction within the clones was found
for the growth-site response models.
Keywords: Eucalyptus grandis, genotype environment interaction, clones, site factors,
growth-site response, ANOV A, ACOV AR, GEl, FA, JRA, / AFRIKAANSE OPSOMMING: 'n Studie is ondemeem om die genotipe-omgewingsinteraksie van Eucalyptus
grandis klone, wat in die oostelike deel van Suid-Afrika groei, te kwantifiseer. Eenen-
dertig groeiplekke is geselekteer om die "tradisionele" E. grandis groeiplekke in
Suid-Afrika te verteenwoordig. Elf gemeenskaplike makro-groeiplek veranderlikes
en twaalf gemeenskaplike mikro-groeiplek veranderlikes is by elk van die groei areas
opgeteken. Sewe-en-twintig E. grandis klone en vier E. grandis basterklone is daama
oor hierdie 31 groeiplekke geevalueer. 'n Onvolledige Latynse roosterontwerp is
gebruik om die 31 toetsklone te evalueer en vyf kontroles is gebruik om die
groeiplekke gemeenskaplik te verbind.
Volume produksie, stamvorm, stamdefekte en oorlewing is op twee- en vyfjarige
ouderdomme geevalueer terwyl besmetting met drie stamkankers op vyf jaar
beoordeel is. Die analitiese metodes wat gebruik was om genotipeomgewingsinteraksie
te evalueer en te kwantifiseer is die variansie analise (ANOYA),
korrelasie analise, en gesamentlike regressie analise (JRA) tesame met ko-variansie
analise (ACOY AR). Die groeiplek assosiasie vir volume produksie, stamvorm en
Endothia besmetting is ondersoek deur gebruik te maak van faktor analise (FA), en
vergelykings is verkry vir die spesies en individuele klone deur gebruik van 'n
stapsgewyse meervoudige regressie benadering.
Genotipe-omgewingsinteraksie, soos geevalueer deur JRA, wys dat 'n toename in
groeiplek produktiwiteit lei tot 'n positiewe lineere reaksie in produktiwiteit op
klonale vlak en dat daar 'n divergerende patroon tussen die regressielyne van die
klone is. Hierdie tendens is ook vir beide die stamvorm en Endothia besmetting
waargeneem. Gevolglik is nie-beduidende veranderings in die rangorde van die klone
gevind en slegs reletiewe verskille tussen klone is gevind. Onvolwasse-volwasse
genetiese korrelasies vir volume produksie en stamvorm toon matige korrelasies
(rg =0.66 en rg =0.70) tussen die twee- en vyfjaar metings.
Op 'n spesiesvlak was reenval die oorheersende omgewingsfaktor verantwoordelik vir
volume produksie terwyl die breedtegraad ligging stamvorm en Endothia besmetting
bemvloed het. Op individuele kloonvlak het sommige mikro-groeiplek interaksie
binne klone bygedra tot die groei en groeiplek reaksie modelle.
Sleutelwoorde: Eucalyptus grandis, Genotipe-omgewingsinteraksie, klone, groeiplek
faktore, groeiplek reaksie, ANOY A, ACOY AR, FA, JRA
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Drug Resistance Mutations in Naive HIV-1 South African Patients, and Construction of Molecular Clones to Phenotype Putative Resistance MutationsMavhandu, Lufuno Grace 03 1900 (has links)
MSc (Microbiology) / Department of Microbiology / See the attached abstract below
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