Orientadores: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira, Odalys Garcia Cabrera / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-21T17:42:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ambrosio_AlinneBatista_D.pdf: 4013772 bytes, checksum: 30fca05155be94194f624c02d6697d87 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O cacaueiro (Theobroma cacao L., Sterculiaceae), planta nativa da região amazônica, é aprincipal espécie dentre as 22 do gênero que é comercialmente explorada para aprodução de sementes, as quais tem grande importância econômica principalmente porser usado na produção de chocolate.Por conta disso, a produção das sementes sempre foiuma grande preocupação para as regiões produtoras, e o fator que causa o maior declínioda produção de cacau é o aparecimento de doenças. No Brasil, o cacaueiro apresentacomo principais doenças causadoras de perdas na produção a vassoura-de-bruxa e o maldo-facão. A vassoura-de-bruxa é causa pelo fungo Moniliophthora perniciosa e tem comosintomas característicos a hiperplasia e hipertrofia das células que dão lugar a tecidosanômalos chamados de vassoura. O mal-do-facão, causado pelo fungo Ceratocystiscacaofunesta, é uma doença assintomática, sendo detectada somente com a morte daplanta. As duas doenças foram estudadas neste trabalho atravez de ferramentas dagenômica na tentativa de identificação de mecanismos de interação patógenohospedeiro.Em Ceratocystis cacaofunesta foi feita uma análise global da mitocôndriaintegrando dados de genômica, transcritômica e proteômica. Foi gerado o primeiroinventário de proteinas mitocondriais de um fitopatógeno, sendo preditas um total de1.124 proteinas, das quais 304 foram identificadas experimentalmente. Dentre asproteinas listadas no inventário, 117 tem função desconhecida e 7 parecem ser específicasdeste fungo.Análises dos dados do genoma de M. perniciosa sugerem que o fungo poderiaestar produzindo giberelina, o que explica muito dos eventos que acontecem durante ainteração M. perniciosa-cacaueiro durante a fase biotrófica do fungo. Este trabalho demonstrou a importância desse hormônio na progressão da doença, assim como aalteração do metabolismo de giberelina na planta durante a interação. Os dados obtidosneste trabalho geraram conhecimento para desenvolvimento de estrátégias de controledas duas doenças, além de direcionar estudos com outros fitopatógenos / Abstract: Cacao tree (Theobroma cacao L., Sterculeaceae) is a native plant from Amazon region andthe main species commercially exploited for seed production among the 22 of the genus.This plant has a great economic importance because of its use in the production ofchocolate. Due to this, producing regions always has been concern to seed production,and diseases are the most important factors of decline in cocoa production. In Brazil,cacao witches' broom and ceratocystis wilt are major diseases causing production losses.The witches' broom is caused by the fungus Moniliophthora perniciosa and thecharacteristic hyperplasia and hypertrophy symptoms of cells gives rise to anomaloustissue called broom. Meanwhile, the ceratocystis wilt caused by Ceratocystis cacaofunestais an asymptomatic disease; it is detected only with the death of the plant. Both diseaseswere studied using genomic tools in an attempt to identify mechanisms of host-pathogeninteraction. In Ceratocystis cacaofunesta, a mitochondrial global analysis integrating datafrom genomics, transcriptomics and proteomics was made. This work generated the firstinventory of mitochondrial proteins of a plant pathogenic fungus, in which 1,124 proteinswere predicted and 304 were identified experimentally. Among the proteins listed in theinventory, 117 have unknown function and 7 appear to be specific to this fungus. Dataanalysis of the genome of M. perniciosa suggests that the fungus could be producinggibberellin, it may explain much of the events that happen during the interaction M.perniciosa-cacao in biotrophic phase of the fungus. Therefore, this work showed theimportance of this hormone in disease progression, as well as altered metabolism ofgibberellin in the plant during the interaction. The data obtained in this work generatedknowledge to develop strategies to control these two diseases, and can drive studies withother pathogens / Doutorado / Genetica de Microorganismos / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-22T11:43:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3061093 bytes, checksum: 5af4cd5ec886c8001e3e331f2bd2e133 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-22T11:43:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3061093 bytes, checksum: 5af4cd5ec886c8001e3e331f2bd2e133 (MD5) Previous issue date: 2016-10-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Recentemente, Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted foi relatado em Tectona grandis L. f (teca) e Carapa guianensis Aubl. (andiroba) no Brasil. Em teca, o fungo provoca descoloração do lenho e morte das plantas afetadas, o que compromete a produção de madeira nobre para serraria. Em andiroba, infecta e mata sementes e mudas, o que pode afetar negativamente sua regeneração natural e consequentemente sua biodiversidade. A identificação de C. fimbriata nessas hospedeiras foi baseada apenas em características morfológicas e em sequências gênicas da região ITS. Além disso, não foram analisadas suas relações filogenéticas com outros isolados e espécies de Ceratocystis e nem a variabilidade genética e fisiológica de suas populações. Tais estudos são fundamentais para embasar as estratégias de controle da doença. Deste modo, o presente estudo teve como objetivos: 1) Avaliar as relações entre os isolados do fungo de ambas as espécies hospedeiras com isolados de outros hospedeiros do Clado da América Latina por meio dos genes “mating type” e da região ITS rDNA. 2) Avaliar a interesterilidade por meio de cruzamentos entre isolados obtidos de diferentes espécies hospedeiras. 3). Determinar a variabilidade genética nas populações de C. fimbriata, por meio de marcadores microssatélites e sua especialização fisiológica por meio de inoculações cruzadas. Dentre 24 isolados do fungo, obtidos de teca de quatro localidades do Mato Grosso e 73 isolados de C. fimbriata de andiroba do Acre, Roraima e Amazonas, foram identificados novos haplótipos de ITS e mating type, distribuídos entre outros isolados dentro do Clado da América Latina (CAL), que residem em um único grupo juntamente com isolados de batata doce, a partir do qual a espécie foi originalmente descrita. Os isolados oriundos de teca e andiroba foram inter férteis com outras linhagens de C. fimbriata ̧ mostrando que pertencem a uma única espécie biológica de C. fimbriata. As análises de microssatélites da população do fungo em teca mostraram uma baixa variabilidade genética. Nas inoculações, apesar das mudas de teca apresentarem lesões relativamente pequenas, dois isolados de teca diferiram da testemunha. Os isolados de eucalipto não foram patogênicos em teca. As populações de C. fimbriata de andiroba dos três estados (AC, RR e AM) apresentaram 14 genótipos e variabilidade genética intermediária em relação a outras populações nativas do fungo. Inoculações cruzadas do fungo em andiroba, teca, eucalipto e mangueira, sugerem que os isolados de C. fimbriata destas espécies são hospedeiro-específicos e que existe variabilidade em agressividade entre os isolados do fungo de andiroba. / Recently, Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted was reported in Tectona grandis L. f (teak) and Carapa guianensis Aubl. (andiroba) in Brazil. In teak, the fungus causes death and wood discoloration, which affects the production of high valuable timber. In andiroba, the fungus infects and kills seeds and seedlings, which may affect negatively its natural regeneration and, probably, its biodiversity. The identification of C. fimbriata on these hosts was based only on morphological characteristics and analysis of ITS rDNA sequences. Furthermore, the genetic and physiological variability of C. fimbriata populations as well as their phylogenetic relationships with other isolates and species of Ceratocystis were not analyzed . Such studies are essential to support disease management strategies. Therefore, this study aimed to: 1) Assess the relationship among isolates of the fungus from both host species with isolates from other hosts of the Latin American Clade (LAC) by using mating type genes and ITS rDNA region. 2) Assess the interesterility through crossings between isolates from different host species. 3) Determine the genetic variability in populations of C. fimbriata through microsatellite markers and their physiological especialization by f cross-inoculation experiments. Out of 24 isolates of the fungus obtained from teak from of locations in the state of Mato Grosso, and of 73 isolates of C. fimbriata from andiroba in the states of Acre, Roraima and Amazonas, new ITS haplotypes and mating types identified were distributed among other isolates within the LAC and reside in a single group that includes isolates from sweet potato, from which the species was originally described. Teak and andiroba isolates were inter fertile with other strains of C. fimbriata, showing that this is a single biological species of C. fimbriata. Microsatellite analysis of the fungal population on teak showed low genetic variability. In cross-inoculations, although teak plants presented relatively small lesions, two isolates differed from the control. The eucalyptus isolates were not pathogenic on teak. The populations of C. fimbriata from andiroba of the three states (AC, AM, and RR) showed 14 genotypes and intermediary levels of genetic variability compared to other native populations of the fungus in Brazil. Cross-inoculations of andiroba, teak, eucalyptus and mango isolates suggest that the isolates of C. fimbriata from these species are host specific and that there is variability in aggressiveness among isolates of the fungus from andiroba.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-22T14:47:34Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 596060 bytes, checksum: 195f188842585dea52237c6d939b0231 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-22T14:47:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 596060 bytes, checksum: 195f188842585dea52237c6d939b0231 (MD5) Previous issue date: 2015-10-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A manga (Mangifera indica L.) é uma das frutas tropicais mais consumidas no mundo e a murcha-de-Ceratocystis causada por Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted é um dos fatores limitantes para sua produção. Embora esforços têm sido empregados na seleção e identificação de materiais resistentes à doença, a base genética da resistência à murcha-de-Ceratocystis em mangueira, informação essencial para direcionar programas de melhoramento que visem desenvolver cultivares resistentes, não é conhecida. Nos estudos sobre o controle genético da resistência, devem-se usar preferencialmente famílias segregantes oriundas de cruzamentos controlados. No entanto, em mangueira, o pequeno tamanho das flores associado à alta abscisão dos frutos torna os cruzamentos manuais muito trabalhosos e com baixo rendimento. Assim, tem-se adotado o uso de polinização aberta a qual pode apresentar indivíduos contaminantes ou oriundos de autofecundação. Portanto, o presente estudo teve como objetivos: 1) confirmar por meio de marcadores microssatélites a origem híbrida de seis progênies obtidas via cruzamentos naturais; 2) estudar o controle genético da resistência à murcha-de-Ceratocystis em mangueira. Na primeira parte, plantas isoladas das cultivares Coquinho, Espada, Haden, Keitt, Palmer e Van Dyke foram identificadas dentro de pomares comerciais estabelecidos com a cultivar Tommy Atkins. Frutos de cada uma destas seis cultivares foram colhidos para a produção das mudas que posteriormente foram levadas para o campo. Folhas das progênies e dos genitores foram coletadas, o DNA foi extraído e a caracterização dos híbridos foi feita utilizando seis marcadores microssatélites. A percentagem de híbridos confirmados nos cruzamentos (33 a 89 %) foi maior que a relatada na literatura usando polinização manual e a estratégia adotada mostrou-se eficiente na obtenção e caracterização dos híbridos. Na segunda parte do estudo, avaliou-se a resistência à murcha-de- Ceratocystis nas cultivares Coquinho, Espada, Haden, Keitt, Palmer, Van Dyke e Tommy Atkins e estudou-se o controle genético da resistência à doença em 197 plantas derivadas de cruzamentos de cada uma dessas cultivares com a “Tommy Atkins”. As cultivares Keitt, Palmer, Tommy Atkins e Van Dyke foram mais resistentes e as cultivares Coquinho, Espada e Haden mais suscetíveis à doença. Os resultados deste estudo mostram que a herança da resistência à murcha-de-Ceratocystis em mangueira é poligênica com uma prevalência de genes com efeitos de dominância e epistasia. O ganho genético obtido com a seleção das 10 melhores plantas, ou seja, as mais resistentes, foi de 46%, o que significa uma redução de 46% na severidade da doença. Em geral, observou-se baixa frequência de alelos favoráveis à resistência a doença na população estudada o que indica a necessidade de introdução de novos materiais genéticos. / The mango (Mangifera indica L.) is one of the most consumed tropical fruit in the world and Ceratocystis wilt caused by Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted is a limiting factor for its production. Although efforts have been employed in the selection and identification of materials resistant to Ceratocystis wilt, the genetic basis of resistance to the disease in mango is unknown. This information is essential to guide breeding programs aiming the development of resistant cultivars. In studies on the genetic control of resistance, segregating families, derived from controlled crossings, should be used, preferably. However, the small size of mango flowers associated with a high fruit abscission make artificial crossings laborious and with low yield. Therefore, this study aimed to: 1) to confirm by microsatellite markers the hybrid origin of six progenies obtained via natural crossings; 2) study the genetic control of resistance to Ceratocystis wilt in mango. In the first part of this work, isolated plants of cultivars Coquinho, Espada, Haden, Keitt, Palmer and Van Dyke were identified in commercial orchards established with the cultivar Tommy Atkins. Open pollinated progenies from each cultivar were planted in the field. Leaves from these progenies and parents were collected, DNA was extracted and the characterization of the hybrids was done using six microsatellite markers. The percentage of confirmed hybrids for the crossings (33-89%) was higher than expected by manual pollination, which indicates that the adopted strategy is efficient in obtaining and characterization of the hybrids. In the second part of the work, we evaluated the resistance to Ceratocystis wilt in the cultivars Coquinho, Espada, Haden, Keitt, Palmer, Van Dyke and Tommy Atkins. Subsequently, we studied the genetic control of resistance to the pathogen on 197 plants derived from crossings between the remaining cultivars and “Tommy Atkins”. The cultivars Keitt, Palmer, Tommy Atkins and Van Dyke were more resistant and the cultivars Coquinho, Espada and Haden were more susceptible. The results of this study show that the inheritance of resistance in mango is polygenic with a prevalence of genes with effects of dominance and epistasis. The genetic gain by selecting the ten more resistant plants was 46%, which means a 46% reduction in disease severity. In general, there was a low frequency of favorable alleles for resistance to the disease in the population studied indicating the need to introduce new sources of genetic materials.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-16T16:32:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3032222 bytes, checksum: f5e945d1678398b9cf549f0362f62191 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-16T16:32:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3032222 bytes, checksum: f5e945d1678398b9cf549f0362f62191 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Objetivou-se neste trabalho: (i)determinar a dinâmica espaço-temporal da seca da mangueira e de seu inseto vetor bem como o papel desses besouros nessa dinâmica e (ii) identificar os locais no mundo que estão sobre o risco de ocorrência da seca da mangueirae quais os fatores climáticos que estão associados a distribuição da doença. Para tanto,dois pomares com a ocorrência do agente causador da seca da mangueira, o fungo Ceratocystisfimbriata, e de seu besouro vetor, Hypocryphalusmangiferae, foram monitoradas entre o inverno de 2012 e inverno de 2015. Além disso, foram levantados os locais de ocorrência da doença no mundo para modelagem por meio de um modelo de correlação (MaxEnt).A infestação de novas plantas pela seca da mangueira foi normalmente precedida pelo ataque dos besouros. A colonização de novas mangueiras nos pomares pelo besouro e pelo fungo ocorreupelo ataque de novas plantas atacadas distantes e próximas a aquelas anteriormente atacadas. Isto possivelmente levou a grande sobreposição dos locais de ocorrência do besouro e do fungo. Ao contrário do que se supõe, esse trabalho demonstra que não são os besouros que vão em busca de plantas doentes, mas são eles que transmitem o fungo levando a disseminação da doença.O modelo previu áreas suscetíveis em países onde a doença ainda não ocorre, mas onde a manga é cultivada. Entre essas áreas estão os maiores produtoresde manga como: Índia, China, Tailândia, Indonésia e México. Observou-se que a seca da mangueira ocorre em locais com temperatura média anual entre 20,4 e 28,5 °C, precipitação média anual entre 73 e 2093 mm e altitudes inferiores a 620m acima do nível do mar. A temperatura média anual (54,3 %), precipitação durante o trimestre mais frio do ano (13,7 %), sazonalidade da precipitação (12,9%), e precipitação no mês mais seco do ano (7,2%) foram as variáveis climáticas que mais contribuíram para a probabilidade de ocorrência da seca da mangueira em um determinado local. / The aims of this study were: (i) to study the spatio-temporal dynamics of MSD and of its vector as well as the role of these vectors on the dynamics of the disease, and (ii) to identify the places in the world that are under the risk of Mango Sudden Decline (MSD) establishment and the climatic factors associated with MSD distribution. To reach this aimswe monitored two orchards with the occurrence of the causal agent of MSD, the fungus Ceratocystis fimbriata, and of its vector, the beetleHypocryphalusmangiferae,from the winter of 2012 to the winter of 2015. Also, we obtained the occurrence points of the disease in the world and modeled the potential distribution of the species using a correlative model (MaxEnt).The beetles attack to the plantspreceded the appearance of MSD.The colonization of new plants by the beetles and fungus occurred in places far and near previous colonized plants.This led to a high overlap of the places with the occurrence the beetles and the fungus in the maps.Contrary to what people say about MSD, this study demonstrates that the beetles do not search for diseased trees, but they transmit the fungus to healthy tree causing the spread of the disease.Our model predicted highly susceptible areas in countries where the disease does not occur but the mango is grown. It includes the biggest mango producers in the world such as: India, China, Thailand, Indonesia e Mexico. MSD disease occurs in areas with mean annual temperature between 20.4-28.5°C, mean annual precipitation between 73- 2093mm, and below 620m of elevation. The Mean annual temperature (54.3 %), precipitation of coldest quarter (13.7 %), precipitation seasonality (12.9%), and precipitation of driest month (7.2%) were the climatic variables that most contributed to MSD disease potential distribution.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-18Bitstream added on 2014-06-13T19:24:03Z : No. of bitstreams: 1 firmino_ac_dr_botfca.pdf: 1014828 bytes, checksum: f1c203aae7e0cc4bc61805a8c6c0836f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O gênero Ceratocystis engloba diversas espécies amplamente distribuídas pelo mundo. No Brasil ocorrem relatos da existência de três espécies: Ceratocystis cacaofunesta, C. paradoxa e C. fimbriata, sendo esta última a de maior relevância e causadora de doenças em muitas plantas lenhosas e em algumas herbáceas de grande importância econômica. Diante desta situação e da alta incidência deste patógeno na cultura do eucalipto, o presente trabalho teve como objetivos: (i) caracterizar aspectos patogênicos, culturais, morfológicos, enzimáticos e genéticos de isolados de Ceratocystis sp. coletados de diferentes hospedeiros; (ii) estudar a reação de diferentes genótipos de eucalipto à inoculação de isolados de Ceratocystis sp., com objetivo de se encontrar uma fonte de resistência á murcha-de-ceratocistis; (iii) verificar a sensibilidade a diferentes fungicidas “in vitro” e “in vivo” deste fungo. Nos testes de patogenicidade todos os isolados de Ceratocystis trabalhados foram patogênicos aos seus hospedeiros originais. Foi observada ainda a ocorrência de patogenicidade cruzada. Esta patogenicidade foi comprovada por meio de análises realizadas em microscópio eletrônico de varredura, onde foi constado que o isolado de eucalipto, cacau, manga, teca e atemóia foram capazes de colonizar, se desenvolver e se reproduzir nos vasos de xilema de plantas de eucalipto. Nos experimentos de caracterização morfológica, os isolados foram agrupados segundo comprimento médio do rostro do peritécio, podendo esta característica ser usada como ferramenta para diferenciar isolados de Ceratocystis de cacau dos outros isolados de eucalipto, manga, teca e atemóia. Ainda nestes experimentos, foi notada a produção de conídios doliformes em alguns isolados de eucalitpto / The genus Ceratocystis includes several species widely distributed all over the world. In Brazil, there are reports of threes species: Ceratocystis cacaofunesta, C. paradoxa and C. fimbriata, the latter being most relevant and causer of diseases in a large number of woody plants and in some herbaceous plants of great economic importance. Based on this situation and on the high incidence of this pathogen in eucalyptus culture, this study aimed to: (i) characterize pathogenic, cultural, morphological, enzymatic and genetic aspects of Ceratocystis sp. isolates collected from different hosts; (ii) study the reaction of different eucalyptus genotypes to the inoculation of Ceratocystis sp. isolates, in order to find a source of resistance to ceratocystis wilt; (iii) verify the sensitivity of this fungus to different fungicides “in vitro” and “in vivo”. In the pathogenicity tests, all studied Ceratocystis isolates were pathogenic to their original hosts. Cross pathogenicity was also observed. This pathogenicity was proved by means of analyses under scanning electron microscope, which indicated that eucalyptus, cacao, mango, teak and atemoya isolates were able to colonize, grow and reproduce in the xylem of eucalyptus plants. In the experiments for morphological characterization, the isolates were grouped according to the mean length of the rostrum of the perithecium, and this trait may be used as a tool to differentiate Ceratocystis and cacao isolates from other eucalyptus, mango, teak and atemoya isolates. In these same experiments, the production of doliform conidia was noted in some eucalyptus isolates. The differentiation of Ceratocystis and cacao isolates from the other studied isolates was also possible based on the growth rate

Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Julinana Cristina Sodario Cruz / Banca: Ivan Herman Fischer / Banca: Nelson Sidnei Massola / Banca: Adriana Zanin Kronka / Resumo: O gênero Ceratocystis engloba diversas espécies amplamente distribuídas pelo mundo. No Brasil ocorrem relatos da existência de três espécies: Ceratocystis cacaofunesta, C. paradoxa e C. fimbriata, sendo esta última a de maior relevância e causadora de doenças em muitas plantas lenhosas e em algumas herbáceas de grande importância econômica. Diante desta situação e da alta incidência deste patógeno na cultura do eucalipto, o presente trabalho teve como objetivos: (i) caracterizar aspectos patogênicos, culturais, morfológicos, enzimáticos e genéticos de isolados de Ceratocystis sp. coletados de diferentes hospedeiros; (ii) estudar a reação de diferentes genótipos de eucalipto à inoculação de isolados de Ceratocystis sp., com objetivo de se encontrar uma fonte de resistência á murcha-de-ceratocistis; (iii) verificar a sensibilidade a diferentes fungicidas "in vitro" e "in vivo" deste fungo. Nos testes de patogenicidade todos os isolados de Ceratocystis trabalhados foram patogênicos aos seus hospedeiros originais. Foi observada ainda a ocorrência de patogenicidade cruzada. Esta patogenicidade foi comprovada por meio de análises realizadas em microscópio eletrônico de varredura, onde foi constado que o isolado de eucalipto, cacau, manga, teca e atemóia foram capazes de colonizar, se desenvolver e se reproduzir nos vasos de xilema de plantas de eucalipto. Nos experimentos de caracterização morfológica, os isolados foram agrupados segundo comprimento médio do rostro do peritécio, podendo esta característica ser usada como ferramenta para diferenciar isolados de Ceratocystis de cacau dos outros isolados de eucalipto, manga, teca e atemóia. Ainda nestes experimentos, foi notada a produção de conídios doliformes em alguns isolados de eucalitpto / Abstract: The genus Ceratocystis includes several species widely distributed all over the world. In Brazil, there are reports of threes species: Ceratocystis cacaofunesta, C. paradoxa and C. fimbriata, the latter being most relevant and causer of diseases in a large number of woody plants and in some herbaceous plants of great economic importance. Based on this situation and on the high incidence of this pathogen in eucalyptus culture, this study aimed to: (i) characterize pathogenic, cultural, morphological, enzymatic and genetic aspects of Ceratocystis sp. isolates collected from different hosts; (ii) study the reaction of different eucalyptus genotypes to the inoculation of Ceratocystis sp. isolates, in order to find a source of resistance to ceratocystis wilt; (iii) verify the sensitivity of this fungus to different fungicides "in vitro" and "in vivo". In the pathogenicity tests, all studied Ceratocystis isolates were pathogenic to their original hosts. Cross pathogenicity was also observed. This pathogenicity was proved by means of analyses under scanning electron microscope, which indicated that eucalyptus, cacao, mango, teak and atemoya isolates were able to colonize, grow and reproduce in the xylem of eucalyptus plants. In the experiments for morphological characterization, the isolates were grouped according to the mean length of the rostrum of the perithecium, and this trait may be used as a tool to differentiate Ceratocystis and cacao isolates from other eucalyptus, mango, teak and atemoya isolates. In these same experiments, the production of doliform conidia was noted in some eucalyptus isolates. The differentiation of Ceratocystis and cacao isolates from the other studied isolates was also possible based on the growth rate / Doutor

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-10-20T10:16:00Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1174025 bytes, checksum: 8531234a544f4edd35c28acd81052d2a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-20T10:16:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1174025 bytes, checksum: 8531234a544f4edd35c28acd81052d2a (MD5) Previous issue date: 2014-09-22 / Vale / Este trabalho teve como objetivo avaliar a intensidade da murcha-de-ceratocystis em mangueiras submetidas a diferentes níveis de salinidade, em três variedades consideradas resistentes à doença. Plantas das variedades Tommy Atkins, Dura e Ubá foram cultivadas em vasos com 20 L de areia lavada e submetidas à irrigação diária com 3 L de Solução de Hoagland modificada. Após o período de aclimatação ao sistema hidropônico, foi adicionado NaCl à solução nutritiva. Aos 50 dias depois de submetidas ao estresse salino, as plantas das três variedades foram inoculadas. As avaliações foram feitas no 1o, 14o, 28o e 42o dias após a inoculação. Foram avaliadas a incidência e a evolução dos sintomas do fungo Ceratocystis nas plantas, trocas gasosas, fluorescência da clorofila e teores de macronutrientes nas folhas e ramos da variedade Tommy Atkins e nas folhas, ramos e raízes das variedades Tommy Atkins, Ubá e Dura. O experimento foi realizado em arranjo fatorial (4 x 2), no delineamento em blocos ao acaso, sendo quatro concentrações de sal (0, 30, 60 e 90 mmol L-1 NaCl) e plantas inoculadas e não inoculadas com o fungo Ceratocystis fimbriata Ellis & Halst., isolado CEBS15, em cinco repetições, sendo cada parcela formada por um vaso com uma planta por vaso. Para análise dos dados, utilizou-se a estatística descritiva. Das três variedades, a Ubá foi a que apresentou menor comprimento de lesão no caule das plantas, seguida das variedades Tommy Atkins e Dura. Observou-se, nas plantas das três variedades estudadas e em todos os níveis de salinidade, que houve incidência da doença com diferentes níveis de severidade. Os sintomas da murcha-de-ceratocystis nos ramos e hastes ocorreram em todos os níveis de salinidade, mas, de modo geral, não houve tendência clara da evolução dos sintomas em razão dos níveis de salinidade testados. Quanto aos teores de nutrientes, observaram-se, de maneira geral, as mesmas tendências entre plantas inoculadas e não inoculadas, mas não foi possível verificar padrão definido de aumento ou diminuição em razão das concentrações salinas e da inoculação. Não houve diferença, entre plantas inoculadas e não inoculadas, nas trocas gasosas, potencial hídrico e eficiência fotoquímica do fotossistema II, independentemente da concentração de NaCl utilizada. A variedade Ubá foi a mais resistente ao fungo C. fimbriata e a ‘Tommy Atkins’, a mais sensível à salinidade, seguida pela ‘Dura’ e ‘Ubá’, esta a menos sensível à salinidade. / This study aimed to assess the intensity of ceratocystis-wiltin mango trees under differents levels of salinity in three mango trees varieties considered resistant to the disease. Plants of Tommy Atkins, Dura and Ubá were grown in vases with 20 L of washed sand and submitted to daily irrigation with 3 L of modified Hoagland solution. After the acclimation period of the hydroponic system, NaCl was added to the nutrient solution. 50 days after being submitted to salt stress, plants of the three varieties were inoculated. The assessments were performed 1, 14, 28 and 42 days after inoculation. We evaluated the incidence and progression of the symptoms of the Ceratocystis fungus in plants, gas exchange, chlorophyll fluorescence, and macronutrient content in leaves and branches of the Tommy Atkins variety and leaves, branches and roots of the Tommy Atkins, Ubá and Dura varieties. The experiment was performed in a factorial arrangement (4 x 2), randomized block design, four salt concentrations (0, 30, 60 and 90 mmol L-1NaCl) and inoculated and not inoculated plants with the fungus Ceratocystis fimbriata Ellis & Halst., isolated CEBS15, in five repetitions, each plot being formed by a vase with one plant per vase. For data analysis, we used descriptive statistics. Of the three varieties, Ubá showed the smallest lesion length in the stems of the plants, followed by Tommy Atkins and Dura. It was observed in the three studied varieties of plants and at all levels of salinity that there was incidence of the disease with different levels of severity. The symptoms of ceratocystis-wilt in the branches and stems occurred in all salinity levels, but, in general, there was no clear trend in the evolution of symptoms due to the tested salinity levels. As for the nutrient contents, there were, in general, the same trends between inoculated and not inoculated plants, but it was not possible to verify a defined standard of increase or decrease due to the salt concentrations and inoculation. There was no difference between inoculated and not inoculated plants, gas exchange, water potential and photochemical efficiency of photosystem II, regardless of the NaCl concentration used. The Ubá variety was the most resistant to the fungus C. fimbriata and ‘Tommy Atkins’ was the most sensitive to salinity, followed by ‘Dura’ and 'Ubá', the last one being the less sensitive to salinity.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-13T15:45:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2152936 bytes, checksum: 2084bfa7ee7e4d0fef05d022e0eab8b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-13T15:45:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2152936 bytes, checksum: 2084bfa7ee7e4d0fef05d022e0eab8b0 (MD5) Previous issue date: 2014-10-24 / A mangueira (Mangifera indica) é uma frutífera de importância comercial no Brasil e no mundo. É cultivada em diversas regiões, incluindo o semiárido e árido irrigados, tais como no Vale do São Francisco, no Brasil, e países como Omã e Paquistão. Nesses locais o déficit hídrico é considerado um dos principais fatores que limitam o desenvolvimento vegetal. Além disso, a murcha-de-ceratocystis, causada por Ceratocystis fimbriata, é uma das principais doenças da mangicultura do Brasil e em Omã e Paquistão. Não há fungicidas eficientes, sendo o método de controle mais eficiente é o uso de variedades resistentes. Levanta-se a hipótese de que o déficit hídrico possa causar da predisposição de infecção de C. fimbriata em variedades de mangueira resistentes. No entanto, até o momento não há estudos sobre a interação entre C. fimbriata e mangueiras submetidas a déficit hídrico. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do déficit hídrico na incidência e severidade da doença em variedades de mangueiras consideradas resistente à C. fimbriata. Para isso, três variedades de mangueira, „Ubá‟, „Dura‟ e „Manila‟, foram avaliadas quanto à resistência em diferentes condições de déficit hídrico. As mudas de mangueira conduzidas em vaso com substrato comercial a base de pinus foram submetidas a quatro níveis de déficit hídrico e inoculadas com C. fimbriata (CEBS15). Plantas não inoculadas e submetidas aos mesmos regimes hídricos serviram de testemunha. As mudas das variedades „Ubá‟ e „Dura‟ foram conduzidas na mesma época, enquanto que „Manila‟ foi conduzida posteriormente. Cada vaso contendo uma planta foi considerado como uma unidade experimental. Os vasos foram preenchidos com a mesma quantidade (6,8 kg) de substrato. Avaliou-se a mortalidade de mudas mortas, número médio de dias da inoculação até a morte das plantas; potencial hídrico foliar (Ψw), diâmetro de caule (DC), comprimentos das lesões no sentido longitudinal ao caule, área da lesão no sentido radial do caule, severidades das lesões nos sentidos longitudinal e radial, trocas gasosas e na „Manila‟ também se avaliou a fluorescência da clorofila a. Os resultados foram submetidos à análise estatística descritiva. Não houve morte de plantas não inoculadas. A mortalidade foi baixa na „Ubá‟ e alta na „Dura‟, mesmo em condições consideradas sem déficit hídrico. Já na „Manila‟ a viii mortalidade foi alta em déficit hídrico severo apresentando o maior número de dias entre a inoculação e morte. De forma geral, a „Ubá‟ apresentou os menores valores de severidade e comprimento de lesão, sendo que o déficit hídrico influenciou no aumento da lesão. A „Dura‟ apresentou maior severidade e comprimento de lesão, não influenciados pelo nível de déficit hídrico. A „Manila‟ apresentou a maior severidade e o maior comprimento de lesão em 15% da Cp. Houve redução do Ψw e DC das plantas que morreram. As trocas gasosas foram comprometidas nas plantas inoculadas, principalmente nas plantas mantidas sob déficit hídrico severo. Os valores das variáveis de fluorescência da clorofila a apresentaram reduções severas em plantas da variedade „Manila‟ inoculadas e mantidas a 15% da Cp. Concluiu-se que a variedade „Ubá‟ permaneceu resistente, mesmo em condições de déficit hídrico; a „Dura‟ não foi resistente ao isolado CEBS15, mesmo em condições ótimas de irrigação; e a „Manila‟ foi suscetível em condições de déficit hídrico severo. / The mango tree (Mangifera indica) is a fruitful of commercial importance in Brazil and worldwide. It is cultivated in several regions, including the semi-arid and arid irrigated, as São Francisco Valley in Brazil, and countries like Pakistan and Oman. In these places the water deficit is considered one of the main factors that limit plant growth. Moreover, Ceratocystis wilt, caused by Ceratocystis fimbriata, is a major disease of mango in Brazil and Oman and Pakistan. There are no effective fungicides, and then the most efficient method of control is the use of resistant varieties. Raises the hypothesis that water deficit may cause predisposition to infection of C. fimbriata on varieties of mango trees resistant. However, until now there are no studies on the interaction between C. fimbriata and mango trees exposed to water deficit. The aim of this study was to evaluate the effect of drought on the incidence and severity of disease in mango varieties considered resistant C. fimbriata. For this, three varieties of mango, 'Ubá', 'Dura' and 'Manila', were evaluated for resistance in different conditions of water deficit. Seedlings potted mango conducted with commercial substrate base pine were treated with four levels of water deficit and inoculated with C. fimbriata (CEBS15). Plants not inoculated and subjected to the same water regimes served as witness. The seedlings of the varieties 'Ubá' and 'Dura' were conducted at the same time, while 'Manila' was conducted later. Each pot contains a plant and was regarded as an experimental unit. The pots were filled with the same amount (6.8 kg) of substrate. Were evaluated the mortality, average number of days from inoculation to death of plants, leaf water potential (Ψw), trunk diameter (DC), lengths of lesions in the longitudinal direction to the stem, the lesion area in the radial direction of the stem, severity of lesions in longitudinal and radial directions, gas exchange and in the 'Manila' also evaluating the fluorescence of chlorophyll a. The results were submitted to descriptive statistical analysis. No deaths of non-inoculated plants. The mortality was low in 'Ubá' and high in 'Dura', even in conditions considered without water deficit. In the 'Manila' mortality was high in severe water deficit presenting the highest number of days between inoculation and death. In general, the 'Ubá' showed the lowest values of severity and lesion length, and water deficit influenced the increase in lesion size. x The 'Dura' showed greater severity and length of lesion and were not influenced by the level of water deficit. The 'Manila' had the highest severity and lesion length at 15% of Cp. Decreased in the Ψw and DC of plants that died. Gas exchanges were compromised in the inoculated plants, especially in plants grown under severe drought. The parameters of chlorophyll a fluorescence showed severe reductions in inoculated plants of the variety 'Manila' and maintained at 15% of Cp. It was concluded that the variety 'Ubá' remained resilient, even in conditions of water deficit; the 'Dura' was not resistant to the isolated CEBS15, even under optimal irrigation conditions; and the 'Manila' was susceptible in severe water deficit conditions.

Granbarkborren, Ips typographus, är den mest destruktiva skadeinsekten för svensk barrskog och orsakar årligen stora ekonomiska förluster för landets skogsägare. Granbarkborren kan endast föröka sig i döda träd. För att döda ett stående friskt träd kan de med feromoner signalera till andra granbarkborrar att tillsammans inleda en massattack. Granbarkborren är även beroende av blånadssvampar för att kunna slå ut friska träd. Med dessa blånadssvampar kombinerat med en massattack kan granbarkborren döda trädet inom några veckor. Blånadssvampen ger en missfärgning i virket vilket innebär en värdeminskning av den erhållna veden. I detta examensarbete har de tillväxthämmande effekterna mellan blånadssvamparterna Ophiostoma picea, Grosmannia penicillata och Ceratocystis polonica undersökts. De tillväxthämmande effekter svamparna utövar på varandra har studerats visuellt med odlig i artificiellt såväl som naturligt medium representerad av bark. Tillväxthastigheterna hos respektive svamp har uppmätts. G. penicillata fanns ha den högsta tillväxthastigheten samt de största tillväxthämmande effekterna mot de andra svamparna. Kemiska analyser har utförts med SPME och GCMS för att se vilka ämnen svamparna och barken producerar. Resultaten tyder på att vissa ämnen som produceras av barken inte finns närvarande efter att svampen vuxit i barken. Många ämnen produceras av alla tre svampar men en del är även unika för en viss svampart. Som exempel var G. penicillata ensam om att producera seskviterpenen β-Guaiene, det aromatiska kolvätet m-Cymene och terpenen Borneol. Barken producerade ämnen, bland dessa seskviterpen-alkoholen δ-Cadinol, som sedan inte gick att finna när svamparna var närvarande. Detta tyder på att svamparna konsumerat dessa ämnen alternativt att barken inte producerar samma ämnen i svamparnas närvaro. / The spruce bark beetle, Ips typographus, is the most destructive insect pest of Swedish pine forests and causes major economic losses annually for the forest owners. The spruce bark beetle can only reproduce in dead trees. To kill a healthy tree they can, with pheromones, signal other spruce bark beetles to launch a mass attack. The spruce bark beetle is also dependent on the blue stain fungi in order to beat out healthy trees. With these blue stain fungus combined with a mass attack, the spruce bark beetles can kill the tree within a few weeks. The fungus causes a discoloration in the wood, resulting in a reduction in economic value of the obtained wood. In this thesis, the growth inhibitory effects of blue stain fungi species Ophiostoma picea, Grosmannia penicillata and Ceratocystis Polonica have been investigated. The growth inhibitory effects that the fungi have on each other have been studied visually by cultivation in an artificial as well as a natural medium represented by bark. The growth rates of the respective fungi have been measured. G. penicillata were found to have the highest growth rate and the largest growth inhibitory effects on other fungi. Chemical analyses were performed with SPME and GCMS to see what chemical substances fungi and bark produces. The results show that some substances produced by the bark are not present when the fungi are growing in the bark. Various substances are produced by all three fungi, but there are also many unique compounds from a particular fungal species. For example, G. penicillata was the only one that produced the sesquiterpene β-Guaiene, the aromatic hydrocarbon m-cymene and the terpene Borneol. The bark also produced unique substances, among these the sesquiterpenoid alcohol δ-Cadinol, which then could not be found when the fungi were present. This suggests that the fungi consume these substances or that the bark does not produce the same substances in fungi presence.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-13T14:20:21Z No. of bitstreams: 1 Iwanne Lima Coelho.pdf: 1395783 bytes, checksum: bfb69bfcc0a83cb3f0e7ff59aade864a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T14:20:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Iwanne Lima Coelho.pdf: 1395783 bytes, checksum: bfb69bfcc0a83cb3f0e7ff59aade864a (MD5) Previous issue date: 2013-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The occurrence of stem bleeding, caused by Ceratocystis paradoxa (Anamorphic: Thielaviopsis paradoxa), compromises the productivity of green dwarf coconut and poses a threat to the entire production chain of green coconut. There are no fungicides registered in the Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento (MAPA) for the management of this disease, the indiscriminate use of the fungicide thiophanate methyl may result in the emergence of resistant pathogenic strains, environmental contamination and to human health. Biological control using yeast, promising biocontrol agents, may represent an efficient and applicable solution when aggregated to crop management. Work on yeasts not recovered in control of the causal agent of this disease, as well as studies related to its field control. The study aimed to select yeasts from fruits of the green dwarf coconut, with potential for biocontrol of stem bleeding coconut on the seedlings of green dwarf coconuts. Thirty-seven yeasts, isolated from immature coconuts, were evaluated in vivo for their potential to reduce the symptoms of stem bleeding in seedlings of green dwarf coconuts, packed in a greenhouse under 40 ± 2 ° C and 60 % RH, for two methods of application: spray (10 mL de 1x107 cells mL-1) and injection (1 mL de 1x107 cells mL-1); and in vitro (28 ± 2 °C, 12 h photoperiod), as for inhibition of mycelial growth, volatile metabolic action, parasitism, antibiosis and "killer" activity. Fifteen yeast strains in vivo reduced the percentage of the area damaged by C. paradoxa isolated Moju - PA. In vitro, the isolates identified as Pichia guilliermondii (LEV 25) and Candida dosseyi (LEV47), stood out as potentially promising antagonists, because of the diameter of the inhibited mycelial growth , competing for space and nutrients, and reduced production of conidia by the action of volatile metabolites on pathogenic isolates of Moju - PA, Neópolis- SE and Sousa –PB. This is the first report of reduction of the symptoms of stem bleeding in seedlings of green dwarf coconuts by the antagonistic action of yeast on C. paradoxa. The isolates of P. guilliermondii and C. dosseyi have potential as a component of integrated management of coconut stem bleeding / A ocorrência da resinose, causada por Ceratocystis paradoxa (Anamorfo: Thielaviopsis paradoxa), compromete a produtividade do coqueiro-anão-verde e representa ameaça para toda a cadeia produtiva do coco-verde. Não há registros no Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento (MAPA) de fungicidas para o manejo dessa doença, o uso indiscriminado do fungicida tiofanato metílico pode resultar no surgimento de linhagens patogênicas resistentes, contaminação ambiental e à saúde humana. O controle biológico utilizando-se leveduras, promissores agentes de biocontrole, pode representar uma solução eficiente e aplicável quando agregada ao manejo da cultura. Não foram recuperados trabalhos sobre leveduras no controle do agente causal dessa enfermidade, assim como estudos referentes ao seu controle em campo. O trabalho teve por objetivo selecionar leveduras, obtidas de frutos do coqueiro-anão-verde, com potencial para o biocontrole da resinose do coqueiro, em mudas de coqueiro-anão-verde. Trinta e sete leveduras, isoladas de cocos imaturos, foram avaliadas in vivo quanto ao potencial de redução dos sintomas de resinose em mudas de coqueiro-anão-verde, acondicionadas em telado sob 40±2 °C e 60% UR, por dois métodos de aplicação: aspersão (10 mL de 1x107 células mL-1) e injeção (1 mL de 1x107 células mL-1); e in vitro (28±2 °C, 12 h fotoperíodo), quanto inibição de crescimento micelial, ação de metabólitos voláteis, parasitismo, antibiose e atividade “killer”. Quinze cepas de leveduras, reduziram in vivo o percentual de área lesionada por C. paradoxa isolado de Moju-PA. In vitro, os isolados identificados como Pichia guilliermondii (LEV 25) e Candida dosseyi (LEV 47), destacaram-se como os antagonistas potencialmente promissores, pois inibiram o diâmetro de crescimento micelial, competindo por espaço e nutrientes, e reduziram a produção de conídios, pela ação de metabólitos voláteis sobre os isolados patogênicos de Moju-PA, Neópolis-SE e da Sousa-PB. Este é o primeiro relato da redução dos sintomas de resinose em mudas de coqueiro-anão-verde pela ação antagônica de leveduras sobre C. paradoxa. Os isolados de P. guilliermondii e C. dosseyi apresentam potencialidade como componente do manejo integrado da resinose do coqueiro.