Este estudo avaliou pacientes portadores de cromoblastomicose, sendo feita uma categorização clínica em dois grupos, de acordo com a forma clínica da lesão dermatológica: o primeiro composto por indivíduos com lesões elevadas e o segundo formado por casos com lesões planas, com biópsias realizadas antes e depois dos tratamentos. Através de critérios semiquantitativos, os elementos anatomopatológicos foram analisados, constatando-se a presença do padrão granulomatoso chamado granuloma micótico misto organizado, com baixa intensidade em lesões planas e alta em elevadas. Evidenciou-se que pacientes com lesões planas evoluíram bem clinicamente, com exames micológicos negativos e sem recidivas (bons respondedores), porém aqueles com lesões elevadas apresentaram evolução clínica desfavorável, com exames micológicos positivos e doença recidivante ou recalcitrante, apesar dos tratamentos recebidos (maus respondedores). E, entre os componentes histopatológicos reacionais à invasão fúngica, verificou-se associação significativa para fibrose, podendo levar a um pior prognóstico. Estes achados clínicos e histopatológicos conferem a esta patologia uma idéia de polaridade, à guisa dos fenômenos das formas polares da hanseníase, da fagocitose, e dos agentes de baixa virulência. Os autores propõem uma classificação morfológica dos granulomas da CBM em dois tipos polares: granuloma micótico misto organizado (GMMO) polar com alta intensidade dos elementos celulares (que corresponderia ao polar não tuberculóide) e GMMO polar com baixa intensidade (que corresponderia ao polar tuberculóide). / Patients with chromoblastomycosis were studied and dichotomized into two groups according to the clinical lesions: flat and elevated ones which were biopsied before and after treatments. Histopathological structures underwent through semiquantitatively analisys evidencing the mixed organized mycotic granuloma with low intensity of histopathological elements in flat lesions and high in elevated ones. Flat lesions have improved clinically with negative micological studies (good responders) while elevated lesions’ patients did not (bad responders). It was found significant association between evidence of fungus and fibrosis with a poor prognosis. Clinical and histopathological findings suggest a polarity concept to this disease based on the fenomenal polar forms of hanseniasis, fagocitosis and the low virulence agents. The authors proposed a morphological classification of the chromoblastomycosis’ granulomas into two polar types: polar mixed organized mycotic granuloma (MOMG) with high intensity of the cellular elements (like the polar non tuberculoid type) and the polar MOMG with low intensity (like the polar tuberculoid type).

No processo de classificação de uma imagem digital, o atributo textura pode ser uma fonte importante de informações. Embora o processo de caracterização da textura em uma imagem seja mais difícil, se comparado ao processo de caracterização de atributos espectrais, sabe-se que o emprego daquele atributo pode aumentar significativamente a exatidão na classificação da imagem. O objetivo deste trabalho de pesquisa consiste em desenvolver e testar um método de classificação supervisionado em imagens digitais com base em atributos de textura. O método proposto implementa um processo de filtragem baseado nos filtros de Gabor. Inicialmente, é gerado um conjunto de filtros de Gabor adequados às freqüências espaciais associadas às diferentes classes presentes na imagem a ser classificada. Em cada caso, os parâmetros utilizados por cada filtro são estimados a partir das amostras disponíveis, empregando-se a transformada de Fourier. Cada filtro gera, então, uma imagem filtrada que quantifica a freqüência espacial definida no filtro. Este processo resulta em um certo número de imagens filtradas as quais são denominadas de "bandas texturais". Desta forma, o problema que era originalmente unidimensional passa a ser multi-dimensional, em que cada pixel passa a ser definido por um vetor cuja dimensionalidade é idêntica ao número de filtros utilizados. A imagem em várias "bandas texturais" pode ser classificada utilizando-se um método de classificação supervisionada. No presente trabalho foi utilizada a Máxima Verossimilhança Gaussiana. A metodologia proposta é então testada, utilizandose imagens sintéticas e real. Os resultados obtidos são apresentados e analisados.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014 / Introdução: A doença de Jorge Lobo (DJL) é infecção fúngica crônica de acometimento da pele e há uma prevalência inusitada entre os índios Caiabi, povo que habita a região central do Brasil. Objetivos: 1) Descrever e revisar a epidemiologia da DJL entre os índios Caiabi desde os primeiros relatos até o presente momento. 2) Avaliar e comparar os aspectos histopatológicos e a resposta imune tecidual nas diferentes lesões cutâneas de um mesmo doente, assim como nos nódulos de doentes com formas localizadas e disseminadas. Métodos: 1) Realizada revisão da literatura indexada, de livros e registros de todos os casos da DJL entre os índios Caiabi, desde os primeiros relatos até os dias de hoje. 2) Numa amostra de 24 índios Caiabi com DJL, foram realizados os exames histopatológicos e imunohistoquímicos com marcadores de respostas imunológicas em amostras de diferentes lesões cutâneas num mesmo doente e de nódulos de doentes com formas localizadas e disseminadas. Resultados: 1) O número total de casos da DJL entre os índios Caiabi, desde os primeiros relatos até o presente momento, é de 63. A forma localizada foi significantemente mais presente no sexo feminino e a forma disseminada significantemente mais presente no sexo masculino. 2) Nas diferentes lesões cutâneas (nódulo, úlcera e atrofia), os dados que apresentaram significância estatística (p<0,05) foram: maior presença de células CD68+, CD3+, CD54+ e maior número de fungos no nódulo que na atrofia; maior presença de células CD3+, CD8+, CD20+ e CD25+ na úlcera que na atrofia; maior presença de células CD25+ na úlcera que no nódulo; maior presença de células CD8+ nas formas localizadas que nas formas disseminadas. Discussão e Conclusões: 1) A DJL apresenta uma única e impressionante prevalência entre os índios Caiabi, além de um comportamento distinto entre os sexos, predominando formas disseminadas nos homens e localizadas nas mulheres. 2) A atrofia parece representar uma regressão da atividade da doença e a úlcera parece representar maior atividade imunológica de padrão Th1. Há maior expressão de linfócitos T CD8+ nas formas localizadas, sendo uma das possíveis diferenças de resposta imunológica do hospedeiro que justificam essa apresentação clínica em alguns doentes / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Submitted by Gabriela Araujo (gabriela.denise@unifesp.br) on 2017-09-12T21:02:52Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO - GABRIELA DENISE DE ARAUJO.pdf: 1482312 bytes, checksum: 96da3bfe95afe2bd4424ada9c8c7b89a (MD5) / Approved for entry into archive by Diogo Misoguti (diogo.misoguti@gmail.com) on 2017-09-20T14:18:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO - GABRIELA DENISE DE ARAUJO.pdf: 1482312 bytes, checksum: 96da3bfe95afe2bd4424ada9c8c7b89a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-20T14:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO - GABRIELA DENISE DE ARAUJO.pdf: 1482312 bytes, checksum: 96da3bfe95afe2bd4424ada9c8c7b89a (MD5) Previous issue date: 2014-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivo: Construir um método de classificação de sentimento, aqui denominado Sentiment Descriptor Indexing (SDI) ou Indexador de Descritores Sentimentais, para ser aplicado em mensagens do Twitter em português brasileiro relacionadas a temas de saúde possibilitando oferecer uma análise de sentimento com caracterização de aspectos da popularidade e repercussão dos temas. Métodos: A primeira etapa considerou a construção do algoritmo SDI que se baseia na coocorrência de termos do Twitter com descritores do vocabulário ANEW-BR. Emoticons e tratamento de negação foram incorporados no SDI. Na segunda etapa foi realizada uma avaliação do desempenho do algoritmo SDI para mensagens sobre o tema “câncer” de um pe-ríodo de três semanas. As mensagens foram classificadas por voluntários como sa-úde ou não saúde, e positiva, negativa ou neutra e em paralelo pelo SDI. As classifi-cações foram pareadas gerando uma avaliação de desempenho. Também foram geradas análise de sentimento e nuvem de termos. Na terceira etapa foi realizado um experimento de análise de sentimento para os temas “câncer” e “diabetes” em um período de seis meses, com análises de repercussão e popularidade. Resulta-dos: As classificações humana e SDI concordaram na classificação majoritária posi-tiva. Os valores de precisão e revocação resultaram 0,68 e 0,67 respectivamente, gerando melhor desempenho com f0,5-measure 0,68. No experimento coletou-se um total de 25.230 mensagens sobre o tema "câncer" com classificação de sentimento positiva (71%). Pela nuvem de palavras foi possível observar que celebridades, insti-tutos, hospitais, campanhas de saúde e tipos de câncer são assuntos populares so-bre o tema. Para o tema "diabetes" 3.328 mensagens foram coletadas com classifi-cação de sentimento positiva (78%). Para este tema as palavras mais frequentes, indicadas na nuvem de palavras, estavam relacionadas a alimentos e doenças como obesidade e hipertensão. Conclusão: Os resultados obtidos na etapa de avaliação do classificador SDI mostrou que o SDI teve um bom desempenho na tarefa de clas-sificar mensagens do Twitter sobre saúde comparada a classificação realizada por humanos. Entretanto, o tema escolhido retornou mensagens difíceis de serem rotu-ladas até mesmo pelos humanos, gerando discordâncias nas classificações. As con-tribuições deste trabalho visam suprir a falta de métodos de análise de sentimentos para a língua portuguesa brasileira bem como incentivar sua aplicação na melhoria de outras atividades em processamento de linguagem natural. / Objective: Build a sentiment classification method, named Sentiment Descriptor In-dexing (SDI), to be applied in Twitter’s messages in brazilian portuguese related to health topics, providing sentiment analysis with characterization of aspects of the popularity and impact of issues. Methods: The first step regarded the SDI algorithm construction that it is based on the cooccurence of Twitter's terms with descriptors of ANEW-BR vocabulary. Emoticons and deny treatment were embedded in the SDI. In the second step, an evaluation was performed in the algorithm SDI for messages related the topic "cancer" collected in a period of three weeks. The messages were classified by volunteers in topic about health or not health, and positive, negative or neutral and in parallel by the SDI. The ratings were paired generating a performance evaluation, sentiment analysis and cloud of terms. In the third step an experiment of sentiment analysis was performed for the topics "cancer" and "diabetes" in a period of six months, with analysis of impact and popularity. Results: The human and SDI classifications agreed in positive majority classification. The values of precision and recall resulted 0.68 and 0.67 respectively, the best performance was in f0,5-measure 0,68. In experiment, it was collected a total of 25,230 messages on "cancer" and the sentiment classification of these messages was positive (71%). Through the cloud of words was possible to observe that celebrities, institutes, hospitals, health campaigns and types of cancers are popular subjects on the topic. For the topic "diabetes", 3,328 messages were collected and the sentimental classification was positive (78%). For this topic the most frequent words, given the cloud of words were related to food and diseases such as obesity and hypertension. Conclusions: The results obtained in the evaluation step showed that the SDI had a good performance in the task of classifying Twitter’s messages about health topics compared the classification performed by humans. However, the topic chosen brought messages difficult to be labeled even by humans, causing disagreements in the classifications among them. The contributions of this work aims to meet the lack of sentiment analysis methods for the brazilian portuguese language and encourage its application in improving oth-er activities in natural language processing.

OLIVEIRA, D. P. Gênese de cambissolos desenvolvidos de rocha calcária na Chapada do Apodi - CE. 2012. 103 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Solos e Nutrição de Plantas) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-08-19T18:56:57Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_dpoliveira.pdf: 3402446 bytes, checksum: 81751e7a97b4712d2d2669cc8ae58bcc (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-08-27T17:36:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_dpoliveira.pdf: 3402446 bytes, checksum: 81751e7a97b4712d2d2669cc8ae58bcc (MD5) / Made available in DSpace on 2014-08-27T17:36:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_dpoliveira.pdf: 3402446 bytes, checksum: 81751e7a97b4712d2d2669cc8ae58bcc (MD5) Previous issue date: 2012 / The Apodi Plateau, located in the semi arid region of Brazil, is caracterized by, eutrophic soils calcareous and flat terrain large agricultural enterprises in the region. However, studies that address the genesis of these soils are required, in order to explain the variation of soil types found in the region. It is hypothesized that the surface microrelief associated with subsurface relief, determine the movement of water in the soil, resulting in different environments pedogenic. The aim of this study was to evaluate the influence of the microrelief surface and subsurface on the genesis from soils in the Apodi Plateau. An area of 102 ha was studied soil profile were colected and analised microrelief features (concave, convex and plain). All soil samples were analised chemical analysis, particle size and mineralogy. Undisturbed soil samples were collected from the diagnostic horizons for micromorphological analysis. Based on chemical data, soils were characterized by high base saturation, (eutrophic) and near neutral to alkaline reaction. The morphological description and radargrams indicate that the soil located on the concave surface are thicker, probably as a result of a high intensity of water soil formation. The soil oxides, the Ki ratio indicates the presence of soil more weathered on the concave surface. Micromorphological descriptions indicate soils with lower pedalidade in the convex surface Features of calcium carbonate precipitations were not identified in the concave surface, however, precipitation of calcite was identified in soil plain,surface, thus indicating a different environments pedogenesis. The ratio G / F indicates a lower contents of coarse particles in profiles 4 and 5. The XRD showed the presence of expandable clayminerlas’s in convex and plain terrain, and the dominance of kaolinite in the concave surface. As to iron oxides, it is noted that the environment favors goethite in however with a co-dominance hematite. / A Chapada do Apodi, localizada na região semiárida do Brasil, destaca-se por apresentar solos calcários eutróficos, relevo plano e de grandes empreendimentos agrícolas na região. No entanto, estudos que contemplem com maior riqueza de detalhes a gênese destes solos, são necessários, em função da variação de classes de solo encontradas na região. Aventa-se a hipótese que o microrelevo de superfície associado ao relevo de subsuperfície, condicionem o movimento diferenciado de soluções no solo, resultando em distintos ambientes de pedogênese. O objetivo do presente estudo foi avaliar a influência do microrrelevo de superfície e de subsuperfície na gênese dos solos da Chapada do Apodi. Em uma área de 102 ha amostras de solo foram coletadas e analisada em relação as diferentes feições do microrrelevo (côncavo, convexo e retilíneo). Em todas as amostras de solo foram realizadas análises químicas, granulométricas e mineralógicas. Amostras de solo indeformadas foram coletadas nos horizontes diagnósticos para análises micromorfológicas. Com base nos dados da caracterização química, observa-se que os solos apresentam elevada saturação por bases, sendo caracterizados como eutróficos e com classe de reação de neutra a alcalina. As descrições morfológicas e os radargramas indicam que os solos situados na superfície côncava apresentam-se mais espessos, como resultado de uma intensa ação da água na formação do solo. Os óxidos do solo e a relação Ki indicam a presença de solos mais intemperizados na superfície côncava. As informações das descrições micromorfológicas indicam solos com menor pedalidade na superfície convexa, distinguindo-se dos solos da superfície côncava. Feições de carbonato de cálcio não foram identificadas na superfície côncava, no entanto, precipitações de calcita foram identificadas em solos situados na superfície retilínea, indicando desta forma ambientes distintos de pedogênese. A relação g/f indica um menor conteúdo de partículas grosseiras nos perfis 4 e 5. Os DRX evidenciam a presença de argiliminerais expansíves nas superfícies convexa e retilínea, e a dominância de caulinitas na superfície côncava. Quanto aos óxidos de ferro, observa-se que o ambiente favorece a presença de goethita nos solo, no entanto, ela coexiste com a hematita.

Made available in DSpace on 2016-01-07T13:39:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 nilceia_ramos_ioc_2014.pdf: 985413 bytes, checksum: d50610d797598fa42cb546cf07dafa32 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O gênero Klebsiella compreende bactérias em forma de bastonete, gram-negativas e imóveis que pertencem à família Enterobacteriaceae. As espécies Klebsiella pneumoniae e Klebsiella oxytoca, patógenos oportunistas, são as mais importantes, sob o ponto de vista da clínica. Estas espécies têm sido relacionadas a um número crescente de infecções hospitalares multirresistentes. K. pneumoniae é classificada em três grupos filogenéticos: KpI, KpII e KpIII e os genes que codificam as \03B2-lactamases de classe A cromossômicas SHV, OKP e LEN, estão relacionadas à estes grupos, respectivamente. Da mesma forma, o gene blaOXY codifica a \03B2\2013lactamase de classe A cromossômica que caracteriza a espécie K. oxytoca. blaSHV é um gene cromossômico e plasmidial que codifica \03B2\2013lactamases de espectro restrito (NSBLs) e estendido (ESBL). Até o momento, 183 alelos de blaSHV foram identificados, mas o espectro de atividade de vários destes alelos ainda não foi determinado. As \03B2-lactamases LEN são codificadas em cromossomos e são NSBLs. Recentemente a espécie K. variicola foi identificada. Esta espécie se caracteriza pela fixação de nitrogênio e nenhum gene constitutivo de \03B2-lactamase foi associado à esta espécie. Este estudo objetivou determinar o espectro de resistência de alelos de blaSHV identificados em K. pneumoniae e também identificar, em nível de espécie, isolados carreadores do gene blaLEN. Por PCR e sequenciamento, alelos de blaSHV e blaLEN foram definidos comparando suas sequências com bancos de dados usando as ferramentas blastN e blastP Estes genes foram clonados e expressos em sistema heterólogo, e o espectro de resistência dos transformantes foi avaliado. A taxonomia genômica dos isolados deste gênero foi realizada com base em sequências de genes recuperados de genomas de espécies de Klebsiella e aplicou-se as abordagens MLSA, rMLST e cgMLST. Identificamos blaSHV-28 (n=2), blaSHV-110 (n=1) e alelos novos de blaSHV (n=3). Os transformantes para estes genes apresentaram resistência à amoxicilina, ampicilina e piperacilina, o que corresponde a um espectro restrito de resistência. Quanto a blaLEN, foram identificados oito novos alelos em nove isolados. Dois deles eram idênticos aos encontrados no genoma de K. variicola AT-22 e todos estes alelos codificam NSBLs. A taxonomia genômica de Klebsiella definiu três grupos: K. variicola, K. pneumoniae e K.oxytoca. Curiosamente, alguns isolados de K. pneumoniae agruparam com o K. variicola AT-22, sugerindo pertencerem à esta espécie. Todos os isolados do grupo K. variicola albergavam o gene blaLEN indicando que esta seria a \03B2-lactamase constitutiva de K. variicola, e, por conseguinte, que o grupo KpIII é composto por isolados de K. variicola. Aqui nós determinamos que alelos de blaSHV cromossômicos, incluindo blaSHV-28 e blaSHV-110, previamente identificados como ESBLs, são NSBLs e concluímos que K. variicola pode estar sendo subestimada em infecções humanas / The genus Klebsiella comprises non - motile, g ra m - negative, rod - shaped bacteria, presenting a polysaccharide - based capsule, belonging to the Enterobacteriaceae family. The two most clinically i mport ant species from the genus are the opportunistic pathogens Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca . These species have been related to an increasing number of multiresistant hospital - acquired infections. K. pneumoniae is classified into three phylogen etic groups: KpI, KpII and KpIII. Three chromosomal class A β - lactamase genes were recognized in K pneumoniae : bla SHV , bla OKP and bla LEN , which are related to KpI, KpII and KpIII groups, respectively. Similarly, the bla OXY gene is the chromosomal class A β - lactamase that characterizes the K. oxytoca species. The bla SHV is a chromosomal - and plasmid - borne gene encoding narrow (NSBLs) and extended spectrum β - lactamases (ESBLs). So far, 183 bla SHV alleles were identified but the activity spectrum of dozen of a lleles remain to be determined. LEN enzymes are chromosomal encoded with restrict activity against β - lactams and confers resistance only to penicillins. More recently, K. variicola species were identified and this species has the ability of fixing nitrogen . There are few studies concerning this species and no constitutive β - lactamase gene has been described in this species. This study aimed to determine the resistance spectrum of bla SHV alleles identified in K. pneumoniae strains and also to identify, at sp ecies level, strains carrying bla LEN chromosomal class A β - lactamase gene. PCR and sequencing were performed and bla SHV , and bla LEN alleles were determined by comparing their sequences with the database using blastN and blastP tools. These genes were clone d and expressed in a heterologous system, and the antibiotic resistance spectrum of the transformants was evaluated by susceptibility test. The genomic taxonomy of strains from this genus were performed based on genes from draft and complete genome sequenc es from Klebsiella species using MLSA, rMLST and cgMLST approaches. Strains harboring bla SHV - 28 (n=2), bla SHV - 110 (n=1) and new bla SHV alleles (n=3) were identified. All the transformants showed resistance to amoxicillin, ampicillin, piperacill in, ticarcil lin , which correspond to a restricted spectrum of resistance. Concerning bla LEN alleles, here were identified eight new alleles in nine strains. Two of them were identical to the one found in K. variicola AT - 22 genome. The antibiotic resistance profile pre sented by the transformants indicated that all these bla LEN alleles encode for NSBLs. The Klebsiella genomic taxonomy revealed three groups corresponding to K. variicola , K. pneumoniae and K. oxytoca species. Curiously, some K. pneumoniae grouped with the K. variicola AT - 22, suggesting that those strains, in fact, belong to K. variicola species and had been misidentified as K. pneumoniae . Moreover, it was observed that all strains from K. variicola cluster harbored the bla LEN gene. This finding indicated th at the bla LEN gene is a constitutive K. variicola β - lactamase, and therefore, the KpIII group is composed by K. variicola strains. Here we determined that different chromosomal bla SHV alleles, including bla SHV - 28 e bla SHV - 110 , previously labeled as ESBLs, and the new ones, are NSBLs. Also, we concluded th at K. variicola can play an underestimated role in human infections .

Made available in DSpace on 2016-01-07T13:41:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 jonathan_oliveira_ioc_mest_2014.pdf: 2250142 bytes, checksum: 1ef72016a6815c4200fb3797c82d3e75 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A Mata Atlântica é um dos biomas de maior biodiversidade e um dos mais ameaçados, principalmente pelo processo de fragmentação florestal. Roedores e marsupiais formam o grupo mais diversificado dentre os mamíferos e exercem influência no dinamismo de florestas neotropicais, sendo bons indicadores de alterações na paisagem. Além disso, este grupo é de grande interesse para saúde humana, pois diversas espécies estão envolvidas em ciclos zoonóticos. Os roedores em particular, são hospedeiros específicos dos hantavírus, e o acompanhamento do seu ciclo de transmissão em áreas silenciosas para hantavirose contribui para estudos epidemiológicos sobre a doença. Os objetivos desse estudo foram: a) levantar a fauna de pequenos mamíferos de áreas fragmentadas de Mata Atlântica predominantemente na região noroeste fluminense; b) identificar os indivíduos por taxonomia integrativa; c) avaliar a influência de variáveis geográficas e de habitat na composição de espécies; d) avaliar a infecção por hantavírus nos roedores capturados e a preferência de habitat das espécies infectadas. Foram capturados 128 roedores e 81 marsupiais em 11 fragmentos florestais e em áreas de matriz alterada nos municípios de Cambuci, Miracema, Sumidouro e Varre-sai A identificação taxonômica dos animais capturados foi feita por morfologia externa, cariotipagem e análises moleculares para os gêneros Trinomys, Calomys, Oligoryzomys e Akodon. A composição de espécies foi relacionada ao tamanho, forma e grau de isolamento dos fragmentos florestais, distância entre fragmentos e também a características do habitat (complexidade e heterogeneidade) por regressão múltipla de matrizes de similaridade. A similaridade na composição de espécies nos fragmentos e nos municípios foi então avaliada por dendrogramas de dissimilaridade. As amostras sorológicas dos roedores capturados foram submetidas ao teste imunoenzimático (ELISA) para detectar a infecção por hantavírus. A preferência do hábitat da única espécie sororreativa para infecção por hantavírus (Akodon 2 cursor) foi avaliada por modelo linear generalizado utilizando as variáveis de habitat (os três primeiros componentes de uma análise de componentes principais) como variáveis independentes e a abundância de A. cursor nas estações de captura como variável dependente. A composição de espécies de pequenos mamíferos não foi influenciada pelos descritores geográficos e de hábitat. No dendrograma gerado pela similaridade na composição de espécies nos fragmentos observou-se que fragmentos que continham apenas espécies mais generalistas agruparam-se separadamente dos que continham ao menos uma espécie especialista Similarmente, paisagens amostradas que eram mais conservadas agruparam-se separadamente daquelas mais perturbadas. Akodon cursor, única espécie sororreativa, prefere áreas com dossel mais aberto e mais baixo, com sub-bosques abertos e com mais caules herbáceos e lenhosos, mostrando que esta espécie está adaptada a ambientes alterados. A ocorrência de circulação de hantavírus neste roedor e sua preferência por habitat alterado,sinaliza a importância da continuidade nos estudos sobre a circulação de hantavírus no estado do Rio de Janeiro, especialmente em áreas estudadas onde a paisagem encontra-se fragmentada e composta por espécies em sua maioria generalistas / he Atlantic rainf orest is one of the species’ richest biomes and one of the most threate ned, mainly by forest fragmentation. Marsupials and rodents are most diverse group among the mammals and influence the dynamics of N eotropical forests, being g reat indicators of landscape changes. Furthermore, this group is important to human health,becaus e s ome species are involved in zoonotic cycles . Some rodents , in particular , ar e specific hosts for hantaviru s; the monitoring of such species and the parasite transmission cycle in silent areas for hantavirus contributes to epidemiolog ical studies of the disease. The objectives of this study were: a) to perform an inventory of sm all mammal s in fragmented A tlantic f orest areas predominantly in the northwest region of the Rio de Janeiro state ; b) to identify specimens by integrative taxonomy; c) to evaluate the influence of geographic variables and habitat characteristics in species composition; d) to evaluate the hantavirus infection in rodents and to investigate habitat preference of the infected species. T he captured animals were identified by external mo rphology, karyotyp e and molecular analy s es for the genus Trinomys , Calomys , Akodon and Oligoryzomys . The influence of fragment size, shape and degree of isolation , distance between fragmentsand habitat features (complexity and heterogeneity) on species com position was tested using a multiple regression of dissimilarity matrices . S pecies composition in fragments and fragmented landscapes as a whole was then evaluated by cluster analysis using Jaccard similarity index and Wad’s method of linkage . The serum sa mples of rodents were subjected to enzyme - linked immuno no sorbent assay (ELISA) to detect hantavirus infection. The habitat preference of Akodon cursor (the only species infected with hantavirus) was tested by generalized linear model with habitat features (the first three principal components of a Principal Component Analysis) as independent variables and A. cursor abundance in capture stations as the dependent variable . We obtained 128 rodents and 81 marsupials captured in 11 forest fragments and areas in the disturbed matrix in the municipalities of Cambuci, Miracema, Sumidouro e Varre - sai . The species composition of small mammals was not influenced by any geographic and habitat descriptors. In the dendrogram generated by the similarity in species composit ion in fragments , we observed t hat fragments containing only generalist species w ere clustered separately from those that had at least one specialist species. Similarly, conserved landscapes clustered separately from disturbed ones . A kodon cursor prefer red areas with more open and low canopy height, with open understory , more herbaceous cover and woody stems, showing that this species is adapted to disturbed habitats. The oc currence of hantavirus circulation in this rodent and its preference for altered hab itat, signals the importance of monitoring studies about the this zoonosis in the s tate of Rio de Janeiro, especially in areas where the landscape is fragmented and composed of generalist species

Made available in DSpace on 2016-02-26T13:26:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 114.pdf: 3235095 bytes, checksum: 41070b0433fde8973aa5f9cae8c4bbcd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Introdução: Estudos em vários países mostram frequência elevada de Eventos Adversos a Medicamentos (EAM) entre os pacientes hospitalizados. Os bancos de dados administrativos e de óbitos são fonte importante de informação quando se empregam os códigos da CID-10 sugestivos de EAM neles registrados. Objetivo: Compreender o papel dos EAM ocorridos em pacientes hospitalizados e identificar a magnitude, o tipo e o impacto potencial dos mesmos no Brasil.Métodos: A metodologia compreendeu três etapas: Revisão sistemática da literatura com meta-análise de estudos sobre a ocorrência de EAM durante hospitalização; Definição da lista de códigos CID-10relativos aos EAM; Estudo retrospectivo de identificação de EAM nos sistemas de informação em saúde de dados hospitalares e de mortalidade.A revisão incluiu estudos observacionais de EAM ocorridos em paciente adultos em hospitais. A busca dos artigos compreendeu Medline, Embase, Lilacs e Google Scholar e portal de teses. Utilizando-se o modelo de efeitos aleatórios, estimou-se a proporção de pacientes com EAM por método de identificação de eventos: Notificação Estimulada (NE), Monitoramento Retrospectivo(MR) e Monitoramento Prospectivo (MP). Metarregressão foi utilizada para explorar as fontes de heterogeneidade nas estimativas. A lista de códigos da CID-10 relacionados aos EAM foi sintetizada apartir da revisão da literatura e da opinião de especialistas. A lista foi aplicada numa avaliação retrospectiva, entre 2008 e 2012, de pacientes de todas as idades. As fontes de dados foram as bases de dados nacionais de hospitalização (SIH-SUS e CIHA) e da mortalidade (SIM). Proporções de EAM e taxas de mortalidade por milhão foram calculadas por ano, faixas etárias, características da hospitalização e categorias dos eventos. (...) / Conclusão: As estimativas encontradas na meta-análise indicam que a incidência de EAM durante a hospitalização é elevada e que o número de eventos identificados varia entre os estudos a depender do método de identificação. Os resultados das análises das bases de dados (SIH-SUS, CIHA e SIM)indicam subnotificação dos casos de EAM. Mas, ainda assim, os resultados revelam informações com abrangência nacional, num período de cinco anos, incluindo internações financiadas e não financiadas pelo SUS, além dos casos fatais (SIM).

SILVA, R. C. Gênese e classificação de solos em ambientes de planícies da região Nordeste do Brasil. 2012. 162 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Solos e Nutrição de Plantas) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-09-17T20:29:18Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_rcsilva.pdf: 4834087 bytes, checksum: 2760e469569b0e1ed77a250b7c635d2b (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-09-24T17:29:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_rcsilva.pdf: 4834087 bytes, checksum: 2760e469569b0e1ed77a250b7c635d2b (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-24T17:29:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_rcsilva.pdf: 4834087 bytes, checksum: 2760e469569b0e1ed77a250b7c635d2b (MD5) Previous issue date: 2012 / Soils formed by sediments in lowland environments have distinct genetic characteristics according to the parent material, which can be basically composed of mineral and organic sediments. The first is formed from the weathering of rocks, and the chemical, physical and mineralogical properties are inherited from the source material. The organic sediments are influenced by the type of vegetation dominant in the landscape, and the addition of organic material under water saturation conditions, that favors the accumulation and thickening of organic sediment layers, which can lead to the genesis of organic soils. This study aimed to evaluate the morphological, physical and chemical properties of six organic soil profiles developed in the coastal region of the States of Ceará, Rio Grande do Norte and Paraíba; besides these attributes and the mineralogical and micromorphological characteristics of four soil profiles from alluvial sediments in the lower course of Acaraú river Basin - CE. The properties evaluated were: color, density, texture, fiber content, degree of decomposition of organic matter, C content, organic matter, N, P and micronutrients, sum of bases, T and V value, humic fractions, degree of water repellency, electrical conductivity, soluble salts, X-ray diffraction, among others. For the Histosols, it was found a positive correlation of the C levels with the soil density, with subsidence, potential acidity, N content and hydrophobicity; as well as influencing the CTC and the content of H+ from the organic acids. The different methods for measuring organic carbon were positively correlated with each other. The C content of humin fraction were higher due to the presence of fibers in this fraction, while the fulvic acid contents were lower compared to the humic acids, indicating increased stability of organic compounds present in these soils. With respect to the soils from alluvial sediments, there were observed high levels of soluble salts, conferring them the saline and sodic characters. This is due to the marine influence and the high water table, besides the presence of weatherable minerals. The micromorphological description showed some aspects related to the soil genesis, such as clay illuviation in depth, the allochthonous origin of the parent material and in situ alteration of the alluvial sediments. The geomorphology was the main factor in the greatest expression of pedogenetic processes in the landscape, and the position where the soils are located is a strong indicator of their environmental fragility. / Solos formados por sedimentos em ambientes de planície apresentam características genéticas distintas quanto ao material de origem, podendo ser compostos basicamente por sedimentos minerais e orgânicos. O primeiro é formado a partir do intemperismo das rochas, e as propriedades químicas, físicas e mineralógicas são herdadas do material que lhe deram origem. Já os sedimentos orgânicos são influenciados pelo tipo de vegetação predominante na paisagem, e o aporte de material orgânico em condição de saturação de água, que favorece o acúmulo e o espessamento das camadas de sedimentos orgânicos, podendo levar à gênese dos solos orgânicos. Este estudo teve por objetivo avaliar as características morfológicas, físicas e químicas de seis perfis de solos orgânicos desenvolvidos na região litorânea dos Estados do Ceará, Rio Grande do Norte e Paraíba; e avaliar os mesmos atributos e as características mineralógicas e micromorfológicas de quatro perfis de solos originados de sedimentos aluviais do baixo curso da Bacia do rio Acaraú - CE. Foram avaliadas propriedades tais como: cor, densidade, textura, teores de fibras, grau de decomposição da matéria orgânica, teores de C, matéria orgânica, N, P e micronutrientes, soma de bases, valor T e V, frações húmicas, grau de repelência à água, condutividade elétrica, sais solúveis, difratometria de raio-X, dentre outras. Para os Organossolos, foi verificado que os teores de C estabeleceram correlações positivas com a densidade do solo, com a subsidência, acidez potencial, com os teores de N e com a hidrofobicidade, além de influenciar na CTC e no teor de H+ proveniente dos ácidos orgânicos. Os diferentes métodos para a determinação dos teores de carbono orgânico apresentaram correlação positiva entre si. Os teores de C da fração humina foram mais elevados devido à presença de fibras nesta fração, enquanto que os teores de ácidos fúlvicos foram os menores em relação aos teores de ácidos húmicos, indicando maior estabilidade dos compostos orgânicos presentes nestes solos. Com relação aos solos de sedimentos aluviais, foram observados elevados teores de sais solúveis, conferindo-lhes caráter salino e sódico. Isso se deve à influência marinha e do lençol freático elevado, além da presença de minerais intemperizáveis. Na descrição micromorfológica foram verificados alguns aspectos relacionados à gênese desses solos, tais como a iluviação de argila em profundidade, a origem alóctone do material de origem e a alteração in situ desses sedimentos aluviais. A geomorfologia foi o principal fator na maior expressão dos processos pedogenéticos na paisagem, e a posição em que os solos se encontram é um forte indicativo de sua fragilidade ambiental.

O melasma é uma hipermelanose adquirida que incide, predominantemente, na face e em mulheres. Pode estar associado à gravidez e ao uso de anticoncepcionais orais, porém a maior parte dos casos é de etiologia desconhecida, e todos são exacerbados pela exposição às radiações solares não ionizantes. Pelos níveis de concentração de melanina à histopatologia, os melasmas têm sido classificados em epidérmicos e dérmicos e, pela topografia de suas lesões, em centrais e periféricos. OBJETIVOS - A partir de uma série histórica de melasmas em mulheres, selecionados no arquivo do Setor de Anatomia Patológica do Serviço de Dermatologia da Universidade Federal do Rio Grande do Sul na Irmandade Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre, desenhou-se um estudo transversal, com o objetivo de classificá-los, clínica e histopatologicamente, pela análise da distribuição dos depósitos dérmicos de melanina, grupando-os conforme características dessa distribuição. MATERIAL E MÉTODO - Identificados os casos de melasma, foram separados as lâminas histológicas, os blocos de parafina e os prontuários clínicos de cada doente selecionada. Novas lâminas foram preparadas, sempre na dependência de material suficiente no bloco, e coradas pela hematoxilina-eosina e pelo método de Schmorl. O total de casos selecionados constituiu a amostra original (N1); a segunda amostra (N2) foi composta pelos casos em que foi possível a obtenção de novos cortes histológicos. A quantificação da melanina na derme foi determinada pelos índices de concentração desse pigmento na derme superficial e na reticular, e pelo de densidade, que refletiu o tamanho dos grumos encontrados. A quantidade de melanina foi expressa por um índice, a que se convencionou chamar índice de concentração dérmica de melanina (ICDM), obtido por uma fórmula empírica, baseada na média ponderada das medianas dos índices parciais obtidos. Distribuídos pelo ICDM, os casos foram classificados em epidérmicos (baixos índices) e dérmicos (altos índices). O ponto de corte que dicotomizou o grupo assim determinado, foi obtido na amostra N1 e correspondeu ao percentil de melasmas epidérmicos, pela classificação histopatológica realizada, caso a caso, por ocasião da respectiva biópsia. RESULTADOS - A amostra N1 foi constituída por 73 casos, e a N2, por 50. Na N1, os casos foram distribuídos pela freqüência, segundo a faixa etária, a cor da pele, a profissão, o tempo de evolução do melasma, a idade de ocorrência da menarca, a freqüência de gestações concebidas e a termo, o uso de anticoncepcionais orais (ACO) e outros medicamentos, a regularidade menstrual e o fator causal atribuível. Quanto a esta última variável, identificaram-se, como fatores associados, a gravidez (27,4% dos casos) e o uso de ACO (12,3%); o restante (60,3%) foi catalogado como melasma idiopático. Essa amostra foi classificada pela topografia das lesões (81% centrais e 19% periféricos), pela histopatologia (57% epidérmicos, 18% dérmicos e 25% mistos) e pelo exame sob a lâmpada de Wood (58,3% epidérmicos, 26,7% dérmicos e 15% mistos). A amostra N2 foi classificada pelo JCDM em melasmas dérmicos e epidérmicos, obtendo-se, respectivamente, 12 e 38 casos. O valor do ICDM que permitiu essa classificação é 1 ,467, e correspondeu ao 76º percentil. Essa amostra, assim dicotomizada, foi testada para as mesmas varáveis analisadas na amostra N1. Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas entre os dois grupos considerados, mercê da exigüidade da amostra. Constatou-se, no entanto, a tendência de os melasmas dérmicos serem os que evoluem há mais tempo e incidem em mulheres mais velhas, predominantemente, nas de cor preta e com maior número de gestações. A sensibilidade, a especificidade e, por conseqüência, a acurácia do exame sob a lâmpada de Wood para diagnosticar os melasmas dérmicos, tendo como padrão a classificação pelo ICDM, foram, respectivamente, de 25%, 73% e 62%. CONCLUSÕES - A melanina está presente na derme, em maior ou menor grau, em todos os casos de melasmas femininos. A quantificação dos depósitos dérmicos desse pigmento pode ser expressa por um índice, cuja distribuição permite classificar os melasmas em epidérmicos e dérmicos. Estes últimos, correspondendo aos ICDM superiores a 1 ,467, são os que evoluem há mais tempo e que incidem em mulheres que engravidaram mais vezes, sugerindo distribuição espectral da doença. A classificação pelo exame á lâmpada de Wood mostrou que esse método é moderadamente acurado, sendo mais útil quando exclui os melasmas epidérmicos ou quando confirma os dérmicos. Não foi observado aumento de melanina na camada basal dos folículos pilosos, em nível mais profundo do que o da derme superficial, na região infundibular. Esse achado pode ser incluído entre os critérios histopatológicos para o diagnóstico dos melasmas. / The melasma is an acquired hypermelanosis that predominantly occurs on the face and in women. lt may be associated to pregnancy and to the use of oral contraceptives. However, most cases are of unknown etiology, and ali of them are exacerbated by exposure to non-ionizing solar radiation. The melasmas have been classified in epidermic or dermic by the leveis of concentration of melanin by histopathology, and in central and peripheral by the topography of their lesions. OBJETIVES -From a historical series of melasmas in women, selected from the records of the Pathological Anatomy Sector of the Dermatology Service of the Federal University of Rio Grande do Sul at Irmandade Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre, a transversal study was designed with the object of clinical and histopathological classification of the melasmas by analysis of the distribution of the dermic deposits of melanin, grouping them according to the characteristics of that distribution. MATERIAL ANO METHOD - Once the cases of melasma were identified, the histologic slides, the paraffin blocks and the clinicai records of each patient were separated. New slides were prepared, always depending on sufficient material in the block, and then stained by haematoxilin-eosin, and by the Schmorl method. The total number of selected cases constituted the original sample (N1); the second sample (N2) was composed by the cases in which new histological cuttings were possible to obtain. The quantification of melanin in the dermis was determined by the concentration rates of this pigment in the superficial and in the reticular dermis, and by the density rate, which reflected the size of the granules found. The quantity of melanin was expressed by a rate which was named melanin dermic concentration rate (ICDM), obtained through an empirical formula, based on the mean average of the median value of the partial rates obtained. Distributed by their ICDM, the cases were classified in epidermic (low rates) and dermic (high rates). The cutting point that the group thereby determined was obtained in the sample N1, and corresponded to the percentile of epidermic melasmas by the histopathological classification undertaken in each case during the respective biopsy. RESULTS -The sample N1 was constituted by 73 cases, and the N2 by 50 cases. In N1 the cases were distributed by frequency according to age, skin colour, profession, time of evolution of the melasma, age of menarche, frequency of conceived and term pregnancies, use of oral contraceptives (OC) and other medicines, regularity of menstrual cycles, and the attributed cause factor. As for the last variable, pregnancy (in 27.4% of the cases) and the use of OC (12.3%) were identified as associated factors; the remaining cases (60.3%) were catalogued as idiopathic melasmas. This sample was classified by topography of the lesions (81% central and 19% peripheral), by the histopathology (57% epidermic, 18% dermic and 25% mixed) and by Wood's light examination (58.3% epidermic, 26.7% dermic and 15% mixed). The sample N2 was classified by ICDM in dermic and epidermic melasmas, and 12 and 38 cases respectively were obtained. The ICDM figure that allowed this classification is 1.467, and corresponded to the 76º percentile. This sample, thereby divided, was tested for the same variables analysed in sample N1. No statistically significant differences were observed in the two groups considered, due to the exiguity of the sample. lt was noted, however, that the dermic melasmas tend to develop for a longer period of time, and appear in older women, and predominantly in black women, and with larger number of pregnancies. The sensitivity, the specificity and, consequently, the accuracy of the Wood's light examination in diagnosing the dermic melasmas, using the ICDM classification as gold standard, were, respectively, 25%, 73% and 62%. CONCLUSIONS - The melanin is present in the derrnis, in higher or lower degree, in ali the cases of female melasmas. The quantification of the dermic deposits of this pigment can be expressed by a rate whose distribution allows classification of the melasmas in epidermic and dermic. Dermal melasmas, corresponding to ICDMs higher than 1.467, have a tendence to have a long term durantion and olso they have na incrised incidence in women who have had multiples pregnancies, suggesting a spectral distribution of the disease. The classification by Wood's light examination showed that this method is moderately accurate, being more useful when it disconsiders (or "rules out") the epidermic melasmas or when it confirms (or "rules in") the dermic melasmas. No increase in melanin was observed in deeper leveis than the superficial derrnis of the basal layer of the hair follicles, in the infundibulum area. This finding may be added to the histopathological criteria for the diagnosis of melasmas.