Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-05T20:01:47Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T20:01:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) Previous issue date: 2001-01-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Isolinhas de feijoeiro-comum obtidas por cruzamentos em que o cultivar Rudá foi o genitor recorrente foram inoculadas com diferentes patótipos de ferrugem, antracnose e mancha-angular, analisadas com marcadores moleculares de DNA e avaliadas por meio de características quantitativas. As inoculações feitas em isolinhas RC n F 2:3 indicaram que as proporções entre as famílias heterozigotas e homozigotas para a resistência foram 2:1 em todos os cruzamentos. Para resistência à ferrugem e antracnose simultaneamente, foram selecionadas 13 isolinhas do retrocruzamento Rudá x Ouro Negro. Para resistência à antracnose, foram selecionadas, ainda, outras 16 isolinhas, sendo 10 isolinhas provenientes do retrocruzamento Rudá x TO e seis do retrocruzamento Rudá x AB 136. Cinco isolinhas homozigotas do retrocruzamento Rudá x AND 277 foram selecionadas para resistência à mancha-angular. De todas as isolinhas homozigotas, foram selecionadas aquelas geneticamente mais próximas do genitor recorrente, pela utilização de marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Essas isolinhas foram utilizadas para avaliar a reação de resistência a ferrugem, antracnose e mancha-angular causadas pelos patótipos Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum e Phaeoisariopsis griseola , respectivamente. A s isolinhas ON-25-99 e ON-48-99 se comportavam como resistentes a todos os patótipos de ferrugem inoculados. As isolinhas TO-41-5-6-24 e AB-74-1-13 foram resistentes a todos os patótipos de antracnose testados. A isolinha AN-7-2-9-4-6 foi resistente aos seis isolados de mancha-angular testados. As isolinhas mais próximas geneticamente do recorrente foram caracterizadas com marcadores moleculares fortemente ligados aos genes de resistência dos genitores doadores. Treze marcadores foram testados, e oito deles (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 e Satt174) podem ser potencialmente utilizados para dar continuidade ao processo de piramidização dos genes de resistência no cultivar Rudá. Os outros cinco marcadores sofreram recombinação no processo de retrocruzamento. As isolinhas foram, ainda, testadas para características quantitativas, em que foram estimados diferentes parâmetros genéticos, correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais e efeitos diretos e indiretos de cada característica sobre a produção, mediante o uso da análise de trilha conduzido em dois ambientes diferentes. Os caracteres “número de vagens por planta” e “número de sementes por vagem” apresentaram maiores correlações genotípicas com a produção por planta. A média das características e a precisão experimental foram semelhantes nos dois ensaios. Os resultados encontrados neste trabalho são importantes para dar continuidade ao processo de piramidização de genes visando à resistência a ferrugem, antracnose e mancha- angular no cultivar Rudá atualmente sendo conduzido pelo BIOAGRO/UFV. / Common bean isolines obtained from crosses in which cultivar Rudá was the recurrent parent were inoculated with different rust, anthracnose, and angular leaf spot pathotypes, and also characterized with DNA molecular markers and evaluated for quantitative traits. The inoculations done in BC n F 2:3 isolines showed that the proportion between heterozygous and homozygous resistant plants was 2:1 for all crosses. Thirteen homozygous isolines resistant to rust and anthracnose simultaneously were selected from the cross Rudá x Ouro Negro. Sixteen isolines resistant to anthracnose were selected, 10 from the cross Rudá x TO, and six isolines from the cross Rudá x AB 136. Six homozygous isolines resistant to angular leaf spot were selected from the cross Rudá x AND 277. The isolines genetically closer to the recurrent parent were identified with the use of the random amplified DNA (RAPD) technique. These lines were tested against different pathotypes of the causing agents of rust, anthracnose and angular leaf spot, Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum and Phaeoisariopsis griseola , respectively. Isolines ON-25-99 and ON-48-99 were resistant to all rust pathotypes tested. Isolines TO-41-5-6-24 and AB-74-1-13 were resistant to all anthracnose pathotypes tested. Isoline AN-7-2-9-4-6 was resistant to six angular spot pathotypes tested. The isolines which were genetically closer to the recurrent parent were characterized with molecular markers previously shown to be tightly linked to disease resistance genes in the donor parents. Thirteen markers were tested and eight of them (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 and Satt174) proved to be potentially useful in a breeding program to pyramid the resistance genes in the same cultivar. The other five markers separated from the resistance loci due to recombinations during the backcrossing process. The isolines were also tested for quantitative traits and different genetic parameters, phenotypic, genotypic and environmental correlations, and the direct effect of each characteristic on productivity by using path analysis in two different environments. The characters ‘number of pods per plant’ and ‘number of seeds per pod’ presented the highest correlations with productivity per plant. The mean values for the traits and the experimental precision were similar for both assays. Our results will be important to continue the pyramidation process of resistance genes for rust, anthracnose, and angular leaf spot in the cultivar Rudá presently being conducted at BIOAGRO/UFV.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-17T14:22:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 774323 bytes, checksum: b6cf6fb63a7b4fe8f1931ff6b345b7f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-17T14:22:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 774323 bytes, checksum: b6cf6fb63a7b4fe8f1931ff6b345b7f3 (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Desde o contato inicial até o estabelecimento dos sintomas da doença, C. lindemuthianum regula a expressão diferencial de genes essenciais para a patogenicidade que vão possibilitar a colonização do tecido hospedeiro e a finalização do seu ciclo de infecção. Nesse trabalho, o gene pacCl, que codifica o regulador transcricional de resposta ao pH ambiental, foi isolado e caracterizado estrutural e funcionalmente. Uma sequência de 2.546 pb foi isolada do banco genômico de C. lindemuthianum, correspondente ao gene pacCl. Esta sequência apresenta uma ORF de 1.746 pb, codificando, portanto, uma proteína de 581 resíduos de aminoácidos. Foram identificados na sequência, três íntrons putativos, contendo 60, 58 e 74 pb, cada um deles. O alinhamento múltiplo da sequência deduzida da proteína, com as sequências disponíveis nos bancos de dados, demonstrou elevado grau de identidade e similaridade da proteína identificada com o regulador transcricional PacC/Him101 de fungos filamentosos e leveduras, respectivamente. Além disso, a proteína PacCl se mostrou eficiente como marcador filogenético em fungos, pois agrupou de forma coerente os organismos taxonomicamente relacionados. A hibridização de DNA usando o gene pacCl como sonda, mostrou que o gene encontra- se em uma única cópia no genoma de C. lindemuthianum. Do mesmo modo, a análise do mutante Mutpac2 por hibridização de DNA, confirmou que o gene pacCl havia sido inativado por um evento de recombinação homóloga do tipo troca gênica. Por fim, a técnica de PCR quantitativo em tempo real mostrou que o gene pacCl é expresso em todas as fases do ciclo de infecção, porém, os maiores níveis foram encontrados no final da fase necrotrófica. Pode-se sugerir que um dos fatores responsáveis por esse aumento, seja a alcalinização do tecido vegetal, decorrente do envelhecimento do tecido, e/ou até mesmo da própria atividade do fungo, que em muitos casos secreta substâncias alcalinizantes, como por exemplo, amônia. / From the initial contact to the establishment of the symptoms of the disease, C. lindemuthianum regulates the differential expression of the genes that are essential to the pathogenicity and will make possible the colonization of the host tissue and the conclusion of its infection cycle. In this study, the pacCl gene codifying the transcriptional regulator of the response to the environmental pH was isolated and structurally and functionally characterized. A 2.546 pb sequence was isolated from the genomic bank of C. lindemuthianum, corresponding to the gene pacCl. This sequence shows an ORF with 1.746 pb, therefore codifying a protein containing 581 residues of amino acids. In the sequence, three putative introns containing 60, 58 and 74 pb each one were identified. The multiple alignment of the protein-deduced sequence with the sequences available in the data file showed both high identity level and similarity of the protein identified with the PacC/Him101 transcriptional regulator of filamentous fungus and yeasts, respectively. In addition, the PacCl protein was shown to be efficient as a phylogenetic marker in fungus, since it coherently grouped those taxonomically related organisms. The DNA hybridization by using the pacCl gene as probe showed the gene is found in one single copy in the genome of C. lindemuthianum. In the same way, the mutant Mutpac2 analysis by hybridization of DNA corroborated the gene pacCl was inactivated by an event of the genic exchange-type homologous recombination. Finally, the quantitative PCR technique in real time showed the pacCl gene to be expressed in all phases of the infection cycle, but the highest levels were found at the end of the necrotrophic phase. It can be suggested that one of the factors responsible for this increase to be the alkalization of the vegetal tissue due to the aging of the tissue and/or even from the activity of the fungus, since in many cases it secretes some alkalinizing substances such as the ammonia.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2013-07-16T00:34:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 260989.pdf: 556735 bytes, checksum: d4e21055c33e628d5e6ec0a6b64fcd4a (MD5) / Realizou-se bioprospecção de espécies de macroalgas marinhas e plantas aquáticas com o objetivo de encontrar pelo menos um extrato eficiente para o controle da antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) do feijoeiro. Para tanto, foram coletadas e identificadas 17 espécies de macroalgas marinhas: Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata; e duas espécies de plantas aquáticas: Lemna sp. e Spartina juncea. Posteriormente, o material foi seco em estufa e os compostos foram extraídos em etanol e concentrados por evaporação. Os extratos foram testados in vitro, avaliando a influência sobre o índice de velocidade de crescimento micelial (IVCM) em meio de cultura, sobre a germinação de conídios e o padrão de germinação conidial (PGC) de C. lindemuthianum, em lâminas escavadas. Em ambos os testes, a concentração utilizada foi de 50 mg peso seco/ mL. Realizaram-se também testes em casa-devegetação onde os extratos foram testados por meio de pulverizações preventivas em plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com posterior inoculação dessas plantas com uma suspensão de C. lindemuthianum (1,2x106 conídios/ mL). Para a verificação do efeito local e residual, plantas tratadas foram inoculadas 4 horas e 7 dias após o tratamento, respectivamente, e foram avaliadas as plantas inteiras. Para a verificação do efeito sistêmico, plantas tratadas foram inoculadas 7 dias após o tratamento e somente o trifólio não tratado foi avaliado. A severidade da antracnose foi avaliada aos 5 e 11 dias após inoculação. O extrato de H. spinella apresentou forte ação sobre o crescimento vegetativo de C. lindemuthianum, reduzindo o IVCM em 74% comparado à testemunha. Os extratos de Lemna sp. e S. stenophyllum inibiram a germinação de conídios de C. lindemuthianum em 100% e 99%, respectivamente. Nos testes in vivo, verificou-se que sob efeito local o extrato de B. seaforthii reduziu 35% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i.. Embora sem apresentar efeito local, o extrato de Ulva fasciata reduziu 24% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i. sob efeito residual e 42% a severidade da antracnose aos 5 d.a.i. sob efeito sistêmico. A indução de resistência foi considerada para explicar a redução de doença pelo extrato de Ulva fasciata. Dados de avaliações in vitro não correlacionaram com os dados obtidos nos experimentos com plantas. bioprospecting work was performed with species of marine macroalgae and aquatic plants, in order to screen at least an extract able to control the bean anthracnose. For that, it was collected and identified 17 marine macroalgae species, i.e. Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata as well as two aquatic plant species, i.e. Lemna sp. and Spartina juncea. Thereafter, these species were dried in a chamber and, their compounds were extracted with ethanol and concentrated by solvent evaporating. The extracts were tested in vitro for evaluating the effect of them on the mycelial growth velocity index (IVCM) in culture medium and the conidial germination as well as the pattern of conidial germination (PGC) of C. lindemuthianum in well slides. The extract concentration used in both tests was always 50 mg dry wheight/ mL. Experiments were also carried out under greenhouse conditions where bean plants cv. Uirapuru were previously sprayed with the extracts and inoculated with a conidial suspension of C. lindemuthianum (1,2x106 conidia/ mL). To verify the presence of local effect and residual effect, treated plants were inoculated 4 hours and 7 days after treatment, respectively, and whole plants were evaluated. To investigate the systemic effect, treated plants were treated 7 days after treatment, but the disease was evaluated only on the non-treated uppermost three-leaflet leaf. Anthracnose severity was determined on 5th and 11th day after inoculation (dai). The extract of H. spinella presented a strong action towards the mycelial growth of C. lindemuthianum, reducing the IVCM by 74% when compared to the control. The extracts of Lemna sp. and S. stenophyllum inhibited the fungus conidial germination by 100% and 99%, respectively. In greenhouse tests the B. seaforthii revealed local effect, reducing the disease severity by 35% on the 11 dai. Although without showing local effect, the extract of Ulva fasciata reduced the anthracnose severity on the 11th dai by 24% in whole plants and on the 5th dai systemically by 42% as well. The induction of resistance was taken in consideration to explain the disease severity reduction by the extract of Ulva fasciata. In vitro data did not correlate with those obtained from greenhouse experiments.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-04-18T13:46:37Z No. of bitstreams: 1 Jessica Morais da Silva.pdf: 1089549 bytes, checksum: d1e717e2066bd3fd9f3853ff0b4f184e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:46:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jessica Morais da Silva.pdf: 1089549 bytes, checksum: d1e717e2066bd3fd9f3853ff0b4f184e (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / The cowpea is a major source of income in the North/Northeast of Brazil. But the same can be affected by a wide range of plant pathogens can damage production and productivity. Currently it is common to use resistance inducers as a means to combat the pathogens attack. This work aimed to evaluate resistance inducers, as well as the biochemical mechanisms in controlling anthracnose of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp.). We conducted an antagonistic test with various strains of Trichoderma URM front of Colletotrichum lidemuthianum URM3149, the greenhouse was applied four abiotic inducers (salicylic acid, chitosan, amino butyric acid, acibenzolar-S-methyl) and biotic (Trichoderma) in cowpea plants. The severity of the disease, as well as enzymatic activities performed leaves was evaluated (catalase, peroxidase, polyphenol oxidase, β-1,3-glucanase and protease). Trichoderma aureorivide URM5158 showed a high rate of antagonism as well as the activity of chitinase was high. Among all the inductors in the end of the experiment only acibenzolar-S-methyl severity showed high rate and did not differ from control. Salicylic acid stood out among the abiotic inducers and T. aureorivide URM5158. The Trichoderma aureoviride URM5158 species has the potential antagonistic to Colletotrichum lindemuthianum URM3149; show potential inducers against severity of bean anthracnose. / O feijão caupi é uma das principais fontes de renda do Norte/Nordeste. Porém o mesmo pode ser afetado por uma diversidade de fitopatógenos podendo prejudicar na produção e produtividade. Atualmente, é comum o uso de indutores de resistência como meio de combater esse ataque de micro-organismos. Este trabalho teve como objetivo avaliar indutores de resistência, assim como os mecanismos bioquímicos no controle da antracnose do feijão caupi (Vigna unguiculata L. Walp.). Foi realizado um teste antagônico com diversas espécies de Trichoderma URM frente ao Colletotrichum lidemuthianum URM3149. Em casa de vegetação foi aplicado quatro indutores abióticos (ácido salicílico, quitosana, ácido amino butírico, acibenzolar-S-metil) e um biótico (Trichoderma) em plantas de feijão caupi. Foi avaliado a severidade da doença, assim como também realizado atividades enzimáticas das folhas (catalase, peroxidase, polifenoloxidase, β-1,3-glucanase e protease). Trichoderma aureorivide URM5158 apresentou uma alta taxa de antagonismo assim como a atividade da quitinase foi elevada, sendo este selecionado para os testes in vivo. Entre os indutores avaliados apenas o acibenzolar-S-metil apresentou alta taxa de severidade não diferindo do controle. O ácido salicílico se destacou entre os indutores abióticos, assim como T. aureorivide URM5158. A espécie Trichoderma aureoviride URM5158 apresenta potencial antagônico ao Colletotrichum lindemuthianum URM3149; os indutores mostram potencial contra a severidade da antracnose do feijão.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-06-28T15:02:41Z No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:36:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:38:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-03T18:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) Previous issue date: 2018-03-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / O presente trabalho teve por objetivo: a) avaliar o efeito de diferentes doses e fontes de Si por meio do recobrimento de sementes sobre a qualidade física, fisiológica e sanitária de sementes assim como, determinar a concentração de silício e cálcio absorvidos em plântulas de feijão; b) avaliar o desempenho de plântulas inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e recobertas com diferentes fontes de Si, durante a emergência e na expressão dos mecanismos bioquímicos, envolvidos nas respostas pós infecção em diferentes momentos e; c) avaliar o efeito do recobrimento de sementes com Si em resposta à infecção em uma cultivar suscetível e resistente ao Colletotrichum lindemuthianum, sobre o potencial fisiológico e sanitário de sementes e plântulas, durante o desenvolvimento inicial da cultura do feijão. Testou-se diferentes doses (0; 45; 90; 135 e 180g Si 100 kg-1 de sementes) e fontes de Si [Agrosilício®, silicato de cálcio e casca de arroz carbonizada (CAC)] via recobrimento de sementes, inoculados ou não pelo método de restrição hídrica. O recobrimento das sementes composto por Agrosilício®, CAC e silicato de cálcio não altera a qualidade física das sementes e proporciona plântulas vigorosas, sem comprometer a emergência final. Sementes recobertas com doses de silicato de cálcio e CAC elevam a concentração de Si nas raízes, mas reduzem a concentração de cálcio (Ca), enquanto que o Agrosilício® aumenta a concentração de Si em folhas e do Ca nas raízes. Diferentes fontes e doses de Si não controlam patógenos associados às sementes de feijão. A associação do F. oxysporum f. sp. phaseoli nas sementes prejudica a emergência e crescimento das plântulas. O Si tem pouco efeito nas respostas em plântulas não inoculadas, mas eleva a concentração de lignina. Na presença do F. oxysporum f. sp. phaseoli, o Si desencadeia melhor desempenho inicial das plântulas, favorece e potencializa os mecanismos de defesa. A fonte de Si fornecido pelo Agrosilício® proporciona uma antecipação rápida inicial da peroxidase o que pode ter amenizado e atrasado os danos do patógeno nas plântulas. A CAC como fonte de Si, embora tenha contribuído para a potencialização das enzimas de defesa nos períodos mais avançados da infecção, não se mostrou eficiente no controle da incidência da doença. O recobrimento das sementes com Si diminui a incidência e a severidade de C. lindemuthianum e proporciona maior crescimento das plântulas de feijão. O efeito de respostas potencializadas pelo Si tem maior expressividade na cultivar de maior suscetibilidade. / The a im of this study was: a) to evaluate the effect of different doses and sources of Si through the coating of seeds on the physical quality, physiological and sanitary conditions of seeds as, to determine the concentration of silicon and calcium absorbed in bean seedlings; b) to evaluate the performance of seedlings inoculated with Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and covered with different sources of Si, during emergence and in the expression of biochemical mechanisms, involved in post-infection responses at different times and; c) to evaluate the effect of seed coating with Si in response to infection in a susceptible and resistant Colletotrichum lindemuthianum, on the physiological and sanitary potential of seeds and seedlings, during the initial development of the bean culture. Different doses were tested (0; 45; 90; 135 and 180g Si 100 kg-1 of seeds) and sources of Si [Agrosilício®, calcium silicate and rice husk ash (AHC)] by seed coating, whether or not inoculated by the water restriction method. The covering of seeds composed of Agrosilício®, AHC and calcium silicate, does not change the physical quality of the seed, provides vigorous seedlings, without compromising the end emergency. Seeds coated with doses of calcium silicate and AHC, increase the concentration of Si in roots, but reduce the concentration of calcium (Ca), while the Agrosilício® increases the concentration of Si in leaves and Ca in the roots. Different sources and doses of Si do not control pathogens associated with bean seeds. The association of F. oxysporum f. sp. phaseoli in seeds impairs seedling emergence and growth. Si has little effect on responses in uninoculated seedlings, but raises lignin concentration. In the presence of F. oxysporum f. sp. phaseoli, Si triggered better initial seedling performance, favored and enhanced the defense mechanisms. The Si source supplied by Agrosilício® provides early rapid anticipation of peroxidase, which may have ameliorated and delayed the damage of the pathogen in the seedlings. The AHC as a source of Si, although it has contributed to the potentiation of defense enzymes in the later stages of infection was not efficient in controlling the incidence of the disease. The seed coating with Si decreases the incidence and severity of C. lindemuthianum and provides greater growth of the bean seedlings. The effect of responses potentiated by Si has greater expressiveness in the cultivar of greater susceptibility.

Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T18:39:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2869939 bytes, checksum: 08096f9e604c1fe651e880958476ddb4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T18:39:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2869939 bytes, checksum: 08096f9e604c1fe651e880958476ddb4 (MD5) Previous issue date: 2004-08-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O principal objetivo deste trabalho foi caracterizar, fenotipicamente, linhagens de feijão do cruzamento Ouro Negro x Pérola, quanto à reação a Colletotrichum lindemuthianum (raças 73, 81 e 89) e Uromyces appendiculatus (mistura das raças 15, 35, 45, 49, 50 e 59) e avaliar, em campo, o desempenho das linhagens que mostraram-se resistentes. Paralelamente, objetivou-se também avaliar a eficiência dos marcadores moleculares SCARF10 1050 (relacionado à resistência à antracnose e à ferrugem) e OPX11 550 (relacionado à resistência à ferrugem), identificados e mapeados em outras populações, com vistas à seleção assistida na população Ouro Negro x Pérola. Inicialmente, 400 linhagens (progênies F 7:8 ) do cruzamento Ouro Negro x Pérola foram inoculadas com a raça 89 de C. lindemuthianum. Dentre as linhagens resistentes, 68 com grãos de boa aceitação comercial foram inoculadas com as raças 73 e 81 de C. lindemuthianum e com a referida mistura de raças de U. appendiculatus. No experimento de campo, foram avaliadas 75 linhagens, que, sob inoculação artificial, mostraram-se resistentes à raça 89 de C. lindemuthianum. As testemunhas, constituídas pelos genitores (Pérola e Ouro Negro), o cultivar Talismã e as linhagens Vi 4899, VC4, e Rudá-Piramidado foram, também, avaliadas em campo. utilizou-se um látice quadrado triplo, com parcelas constituídas de duas linhas com 2m de comprimento cada uma. Na avaliação da eficiência dos marcadores moleculares, foram caracterizadas 150 linhagens do cruzamento Ouro Negro x Pérola, fenotipicamente, por meio de inoculação artificial de C. lindemuthianum (raça 89). Paralelamente, uma planta de cada linhagem foi genotipada, utilizando-se os marcadores SCARF10 1050 e OPX11 550 . A partir da inoculação artificial, foram identificadas 42 linhagens resistentes às raças de C. lindemuthianum e de U. appendiculatus, utilizadas no estudo. Considerando os resultados da caracterização fenotípica e da avaliação de campo, foram identificadas 10 linhagens que apresentaram grãos de bom aspecto comercial, iguais ou superiores àqueles do cultivar Pérola quanto à produtividade de grãos. Estas linhgens mostraram-se resistentes à antracnose e ferrugem, além de, moderadamente resistentes à mancha- angular. Das 150 linhagens avaliadas por meio de inoculação artificial, 61 mostraram-se resistentes às raças 73, 81 e 89 de C. lindemuthianum, sendo que, 42 destas foram resistentes a uma mistura de raças de U. appendiculatus. Vinte e cinco linhagens apresentaram as bandas correspondentes aos marcadores SCARF10 1050 e OPX11 550 . A eficiência de seleção para resistência à antracnose, com base na genotipagem de 150 linhagens utilizando o marcador SCARF10 1050 foi de 78%. Considerando que este marcador encontra-se a uma distância de 19,6 cM do gene de resistência, esperava-se uma eficiência de 72%, portanto, próxima àquela obtida no presente estudo. Para o marcador OPX11 550 , verificou-se uma eficiência de 85%. Esta maior eficiência era esperada, em razão de este marcador localizar-se mais próximo (11,6 cM) dos genes ou do bloco gênico, os quais conferem resistência à antracnose e ferrugem, presentes no cultivar Ouro Negro. Além disso, foi observado que o marcador OPX11 550 também pode ser utilizado no monitoramento do gene de resistência à antracnose. Embora estivessem a uma distância relativamente grande dos genes de resistência, esses marcadores proporcionaram boa eficiência de seleção. / The main objective of this study was to phenotypically characterize the common bean lines from the crossing Ouro Negro x Pérola for the reaction to Colletotrichum lindemuthianum (races 73, 81 and 89) and Uromyces appendiculatus (a mixture of races 15, 35, 45, 49, 50 and 59), as well as to evaluate the performance of the lines showing to be resistant ones. Another target was to evaluate the efficiency of the molecular markers SCARF10 1050 (related to the resistance against anthracnose and rust) and OPX11 550 (associated to the resistance against rust), which were identified and mapped in other populations and targeted to the assisted selection in the population Ouro Negro x Pérola. Initially, all 400 lines (progenies F 7:8 ) from the Ouro Negro x Pérola crossing were inoculated with the race 89 of C. lindemuthianum. Sixty eight lines of the resistant ones, from which the common beans are commercially well accepted, were inoculated with the races 73 and 81 from C. lindemuthianum and with the mixture of races from U. appendiculatus. In the field experiment, the evaluations were performed for 75 lines, which under artificial inoculation showed to be resistant to the race 89 of C. lindemuthianum. The controls constituted by genitors (Pérola and Ouro Negro), the Talisman cv. and the lines Vi 4899, VC4, and Rudá-Piramidado were also inoculated. The triple square lattice design was used with the plots consisting into two rows with 2m each one. When evaluating the efficiency of the molecular markers, 150 lines from the crossing Ouro Negro x Pérola were phenotypically characterized, by artificial inoculation of C. lindemuthianum (race 89). At the same time, one plant of each line was genotyped, by using the markers SCARF10 1050 and OPX11 550 . From the artificial inoculation, 42 lines which were resistant to either races of C. lindemuthianum and U. appendiculatus were identified. Taking into account the results of both the phenotypic characterization and field evaluation, ten 10 lines were identified which were provided with commercially good beans, that were equal or superior to the Pérola cv. for bean productivity. These lines showed to be resistant to either anthracnose and rust, and moderately resistant to the angular leaf spot. From those 150 lines evaluated by artificial inoculation, 61 were resistant to the races 73, 81 and 89 of C. lindemuthianum, and 42 lines from these ones showed to be resistant to the mixture of the U. appendiculatus races. Twenty-five lines exhibited the bands corresponding to the markers SCARF10 1050 and OPX 11550 . The selection efficiency for the resistance to anthracnose, based upon genotyping of 150 lines, using the marker SCARF10 1050 was 78%. By considering this marker is at 19.6 cM distance from the resistance gene, an efficiency of 72% was expected, therefore the obtained value was close to the expected one. An efficiency of 85% was found for the marker OPX11 550 . This higher efficiency was expected because this marker is located near (11.6 cM) the genes or the gene block that confers resistance to both anthracnose and rust in Ouro Negro cv. Moreover, it was shown what this marker can be made useful, in the targeted of the resistance gene to anthracnose. These markers provided good selection efficiency, although they were at a relatively long distance from the resistance genes.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:16:23Z : No. of bitstreams: 1 frigeri_t_me_jabo.pdf: 214550 bytes, checksum: a1c65c9e88fd5fc622a8f30d3f3a9e22 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O objetivo dessa pesquisa foi verificar a influência de Macrophomina phaseolina, Colletotrichum dematium f. truncata e Colletotrichum lindemuthianum na qualidade fisiológica de sementes de feijoeiro, em especial nos resultados do teste de condutividade elétrica. Foram utilizadas sementes das cultivares Carioca e FT Nobre. As sementes foram infectadas com os fungos em meio de cultura BDA sem e com restrição hídrica (acrescido de manitol a -1,0 MPa). Nos tratamentos testemunhas foram utilizados os mesmos meio de cultura, porém, sem a presença dos fungos. Para cada tratamento as sementes foram sobrepostas nos meios de cultura por 16 horas para M. phaseolina e por 48 horas para o caso de C. dematium f. truncata e C. lindemuthianum. Após secagem natural foram realizados testes de sanidade, germinação em areia e de vigor, como, índice de velocidade de emergência, peso da matéria seca da plântula, teste de frio, teste de envelhecimento acelerado e condutividade elétrica. Também foram realizadas análises na água de embebição das sementes no teste de condutividade elétrica, determinando-se as concentrações de potássio, cálcio e magnésio, assim como nos meios de cultura utilizados com e sem a sobreposição de sementes, para verificação da hipótese de consumo de nutrientes das sementes pelos fungos... / The aim of this research was to verify the influence of Macrophomina phaseolina, Colletotrichum dematium f. truncata and Colletotrichum lindemuthianum in the physiological quality of bean seeds, special in the results of electrical conductivity test. There were used seeds from Carioca and FT Nobre cultivars. The seeds were artificially inoculated with fungi M. phaseolina, C. dematium f. truncata and C. lindemuthianum in BDA medium culture with and without hydric restriction (it was added -1,0 MPa manitol). In the control treatment there was used the same medium culture without the presence of the fungi. For each treatment the seeds were placed on the medium culture for 16 hours for M. phaseolina and 48 hours for C. dematium f. truncata and C. lindemuthianum. After a nature dry, seeds were evaluated, by the blotter test, sand germination and vigor tests: speed of emergence index, seedlings dry weigh, cold, accelerated aging and electrical conductivity tests. Analyses from the imbibition water of the seeds in the electrical conductivity test, were also done a measuring of concentrations of potassium, calcium and magnesium, as well as in the medium culture used with and without the seeds, to verify the hypothesis of seeds nutrients consumption by the fungi...(Complete abstract, click electronic address below)

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-11-22T17:51:25Z No. of bitstreams: 2 Omari DF Dildey 2017.pdf: 1365505 bytes, checksum: cb552699fd45b8b24d3b14fefe36a796 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-22T17:51:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Omari DF Dildey 2017.pdf: 1365505 bytes, checksum: cb552699fd45b8b24d3b14fefe36a796 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-05-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study aimed to purify by chromatography elicitors from Trichoderma longibrachiatum culture filtrate and mycelium extract and to test them in phytoalexin phaseolin inducing and resistance induced to anthracnose in common bean. The sodium phosphate buffer at 0.05 M (SPB) was used as the control treatment and the ASM (Acibenzolar-S-Metil) was used as the standard induction treatment. Ion Exchange Chromatography (IEC) and Gel Filtration Chromatography (GFC) were performed to separate fractions with eliciting power from the culture filtrate (CF) and T. longibrachiatum mycelium extract (TME). For the purification of elicitors by IEC, from GFC, it were obtained one glycidic and five glycoproteins fractions, totaling six fractions. For purification from TME, it were obtained three protein, one glycidic and two glycoproteins fractions, totaling six fractions. In both, were obtained twelve fractions from IEC. These, in turn, were purified in GFC, being obtained a total of thirty seven fractions. Among these, there were fourteen fractions of TME were classified according to their nature, being three proteins, two glycogen and nine glycoproteins. There were twenty-three fractions from TME, wich were classified according to their nature, being four proteins, nine glycogen and ten glycoproteins. Of the fractions purified in CFG from FTC and TME, eight presented phaseolin inducer potential (F17, F23, F25, F27, F31, F38 and F46). The 10 treatments consisted of the eight fractions and two controls: ASM and control (TAP). Treatments were applied in one of the primary leaves (treated leaf (TL)), and the other primary leaf was not treated (untreated leaf (UL)) to verify the systemic effect. Three leaf samples were taken for determination of enzymatic activity: before applying the fractions, after application of the fractions and after the pathogen inoculation. The defense enzyme analysis was performed for Peroxidase (POX), Polyphenoloxidase (PFO), Catalase (CAT), Phenylalanine ammonia-lyase (PAL) and β-1,3-glucanase (β-GASE). At the end, it was performed an evaluation of severity in the primary leaf of common bean, on the fifth day after inoculation. The in vivo test data were subjected to analysis of variance. The purification of samples from FTC and EXM of T. longibrachiatum, from IEC and GFC indicated fractions with the presence of eliciting molecules. The fractions F17, F23 and F25 from FTC and F27, F29, F31, F38 and F46 from EXM were able to induce phaseolin synthesis in common bean hypocotyls. The POX, PFO and β-GASE Increased when applied in the TL after application of the fractions and after inoculation of the pathogen. The fractions did not alter CAT and FAL enzymatic activity. The fractions F17, F23 and F27 reduced the anthracnose severity in the local effect. / O trabalho teve por objetivo purificar por cromatografia moléculas eliciadoras a partir de filtrado de cultura e extrato de micélio de Trichoderma longibrachiatum e testá-las na indução de fitoalexina faseolina e com potencial indutor de resistência contra antracnose no feijoeiro. O tampão fosfato de sódio 0,05 M (TAP) foi utilizado como tratamento controle e ASM (Acibenzolar-S-Metil) foi utilizado como tratamento padrão de indução. Cromatografia de troca iônica (CTI) e cromatografia de filtração em gel (CFG) foram realizadas para separar frações com poder eliciador a partir de filtrado de cultura (FTC) e extrato de micélio (EXM) de T. longibrachiatum. Para a purificação de eliciadores por CTI, a partir de FTC, foram obtidos uma fração glicídica e cinco glicoproteicas, total de seis frações. Para a purificação a partir de EXM, forma obtidos três frações proteicas, uma glicídica e duas glicoproteicas, total de seis frações, em ambos foi totalizado doze frações obtidas por CTI. Estas, por sua vez, foram purificadas em CFG, sendo obtidos um total de trinta e sete frações. Entre essas, quatorze frações para FTC, as mesmas foram classificadas de acordo com sua natureza, sendo três proteicas, duas glicídicas e nove glicoproteicas. E vinte e três frações para EXM, as mesmas foram classificadas com sua natureza, sendo quatro proteicas, nove glicídicas e dez glicoproteicas. Das frações purificadas na CFG a partir de FTC e EXM, oito apresentaram potencial indutor de faseolina (F17, F23, F25, F27, F31, F38 e F46. Os 10 tratamentos constituíram de oito frações e dois controles: ASM e controle (TAP). Foram aplicados os tratamentos em uma das folhas primária (folha tratada (FT)), sendo que outra folha primária não recebeu tratamento (folha não tratada (FNT)) para verificar o efeito sistêmico. Foram realizadas três coletas de folhas para determinação da atividade enzimática, antes da aplicação das frações, depois da aplicação das frações e coleta após a inoculação do patógeno. Foi realizada análise enzimática (peroxidase (POX), polifenoloxidase (PFO), catalase (CAT), fenilalanina amônia-liase (FAL) e β-1,3-glucanase (β-GASE)) e ao final, realizada avaliação de severidade no quinto dia após a inoculação da folha primária de feijoeiro. A purificação de amostras provenientes de FTC e EXM de T. longibrachiatum, por CTI e CFG indicaram frações com presença de moléculas eliciadoras. As frações F17, F23 e F25 de origem FTC e F27, F29, F31, F38 e F46 de origem EXM foram capazes de induzir a síntese de faseolina em hipocótilos de feijoeiro. A atividade de POX, PFO e β-GASE aumentou quando aplicado na FT após a aplicação das frações e após a inoculação do patógeno. As frações não alteraram a atividade enzimática de CAT e FAL. As frações F17, F23 e F27 reduziram a severidade da antracnose no efeito local.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T17:41:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 461198 bytes, checksum: 1983c9ff254d751fb9f67e35fbabb1fc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T17:41:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 461198 bytes, checksum: 1983c9ff254d751fb9f67e35fbabb1fc (MD5) Previous issue date: 2004-08-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Visando piramidar genes de resistência à ferrugem (Uromyces appendiculatus), antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) e mancha-angular (Phaeoisariopsis griseola) em cultivar de feijão do tipo carioca, foram intercruzadas quatro isolinhas de feijoeiro-comum. As isolinhas foram obtidas por meio de retrocruzamento nos quais foi utilizado o cv. Rudá como genitor recorrente. As isolinhas continham os seguintes genes de resistência: linha ON-48-99 - genes Co-10 e Ur-ON provenientes do cultivar Ouro Negro, linha AB-74-1-18 - gene Co-6 proveniente do cultivar AB-136, linha TO- 41-5-6-24 - gene Co-4 proveniente do cultivar TO e linha AND-7-2-9-7-10 - gene Phg- 1 proveniente do cultivar AND 277. Após seleção para homozigose e avaliação das características altura de plantas, número de dias para floração, número de dias para maturação, produtividade de grãos, peso de 100 sementes, número de sementes por vagens, número de vagens por plantas, e da reação de resistência aos patótipos de Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum e Phaeoisariopsis griseola, as isolinhas foram intercruzadas duas a duas. Em seguida, as plantas F 1 foram intercruzadas para obter os híbridos duplos. Os marcadores moleculares SCAR-F10 1150a , SCAR-BA8 560a , OPX11 550a , OPY20 830a , OPB03 1800r , OPAZ20 940a e OPH13 490a associados aos respectivos genes de resistência Ur-ON, Co-10, Co-6, Co-4 e Phg-1 proveniente foram utilizados para identificar as plantas contendo todos os genes de interesse as quais foram autofecundadas para obtenção de sementes F 2 . As sementes F 2 foram semeada em casa de vegetação, e as plantas F 2 foram genotipadas utilizando-se de marcadores moleculares ligados aos genes de resistência. A resistência das plantas foi também confirmada por inoculação dos patógenos. Na geração F 3 foi feita nova avaliação com os marcadores moleculares, selecionando-se apenas as plantas que apresentavam todas as marcas. Este procedimento foi também utilizado na geração F 4 . No final deste processo foi obtida uma população constituída de 40 famílias F 4 denominadas genericamente por ́Rudá R`. Paralelamente, foi feito o cruzamento de ́Rudá R` com o cv. Pérola, obtendo-se 30 famílias F 4 . Sementes das famílias F 4:5 foram multiplicadas para realização de experimento a campo. As famílias F 4:6 foram testadas quanto ao seu desempenho agronômico em ensaio em condição de campo e foram selecionadas 4 e 3 linhagens F 4:7 de cada população, respectivamente. Estas famílias foram avaliadas quanto à resistência a diferentes patótipos de U. appendiculatus, C. lindemuthianum e P. griseola. As inoculações feitas em famílias F 4:7 mostraram que as famílias R-127-10-14, R-97-13-5, R-97-13-6, R-127-4-13, P-33-5-1, P-49-8-2 e P-49-2- 2 se comportaram como resistentes a todos os patótipos de U. appendiculatus e C. lindemuthianum, e a cinco dos sete patótipos de P. griseola inoculados. As melhores familias serão avaliadas em uma rede de ensaio de Valor de Cultivo e Uso (VCU) para uma possível recomendação de um novo cultivar de feijão tipo carioca. A seleção de linhagens de feijão com grãos do tipo carioca, resistentes à ferrugem, antracnose e mancha-angular confirmam o grande potencial e a importância do uso da seleção assistida por marcadores moleculares em programas de piramidação de genes de resistência. / The objective of this work was to pyramid resistance genes to rust (Uromyces appendiculatus), anthracnose (Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (Phaeoisariopsis griseola) in the "carioca-type" common bean cultivar Rudá. Four isolines were obtained in four backcross programs and intercrossed. The isolines contained the following resistance genes: isoline ON-48-99 - genes Co-10 and Ur-ON from cultivar Ouro Negro (ON), isoline AB-74-1-18 - gene Co-6 from cultivar AB 136, isoline TO-41-5-6-24 - gene Co-4 from cultivar TO and isoline AND-7-2-9-7-10 - gene Phg-1 from cultivar AND 277. After selection for homozygosis and evaluation of different quantitative, morphologic, and molecular characteristics, and for resistance to rust, anthracnose and angular leaf spot, the isolines were intercrossed. The F 1 plants were intercrossed to obtain the double hybrid. The molecular markers SCAR-F10 1150a , SCAR-BA8 560a , OPY20 830a , OPAZ20 940a , OPH13 490a , OPX11 550a and OPB03 1800r associated to the resistance genes were used to identify the plants containing all the genes of interest which were selfed to obtain the F 2 seeds. The F 2 seeds were sown, and the corresponding plants were selected with molecular markers linked to the resistance genes and resistance was confirmed by inoculation of the pathogens. The selection based on molecular markers was repeated in the F 3 and F 4 generations, only plants containing all the markers were selected. At the end of this process a population of 40 families was obtained and designated ́Rudá R`. In a parallel procedure, ́Rudá R` were crossed with cv. Pérola. Thirty F 4 families ( ́Rudá R` x Pérola) were obtained. Seeds of the F 4:5 families were multiplied and used for agronomic evaluation in preliminary field tests. Four and three lines were selected from populations ́Rudá R` and ́Rudá R` x Pérola, respectively. These lines were tested against different pathotypes of U. appendiculatus, C. lindemuthianum and P. griseola. The inoculations done in F 4:7 lines showed that the lines R-127-10-14, R-97-13-5, R-97-13-6, R-127-4-13, P-33-5-1, P-49- 8-2 and P-49-2-2 were resistant to all pathotypes of U. appendiculatus and C. lindemuthianum, and to five of the seven pathotypes of P. griseola tested. The lines are xstill being analyzed for quantitative characteristics in field trials. The best lines will be tested in an official trial to be released as new varieties of "carioca-type" bean. The selection of bean lines with "carioca-type" grains, resistant to rust, anthracnose and angular leaf spot confirm the power and importance of the use of marker assisted selection in breeding programs aiming to pyramid disease resistance genes.