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Notre objectif était de mieux comprendre la régulation de la biosynthèse des parois secondaires lors de la formation du bois chez l'Eucalyptus, le feuillu le plus planté au monde et le deuxième dont le génome est séquencé. Nous avons caractérisé trois facteurs de transcription de la famille MYB-R2R3 et montré que EgMYB137 était un nouveau régulateur de la biosynthèse des parois secondaires. Nous avons aussi démontré que l'activité transcriptionnelle de EgMYB1, un répresseur de la biosynthèse des lignines, était régulée par une interaction protéine-protéine impliquant une histone linker (EgH1.3). Enfin, nous avons mis au point une méthode de transformation homologue chez l'Eucalyptus via A. rhizogenes. Les " hairy roots " transgéniques sont adaptées à la caractérisation fonctionnelle de gènes reliés à la formation du xylème. Nos résultats ont permis de découvrir de nouveaux acteurs impliqués dans la régulation des parois secondaires, mettant en lumière la complexité de ce processus mais aussi offrant de nouvelles perspectives pour l'amélioration du bois pour des applications industrielles comme la production de bioéthanol de deuxième génération. / Our objective was to better understand the regulation of the biosynthesis of the lignified secondary cell walls during wood formation in Eucalyptus, the most planted hardwood tree, and the second whose genome has been sequenced. We functionally characterized three Eucalyptus transcription factors of the R2R3-MYB family and identified EgMYB137 as a new regulator of secondary cell wall deposition. We also showed that the transcriptional activity of EgMYB1, a repressor of lignin biosynthesis was modulated by protein-protein interactions involving a linker histone (EgH1.3). Finally, we set up a homologous transformation system for Eucalyptus using Agrobacterium rhizogenes. The transgenic hairy roots are suitable for high throughput functional characterization of cell wall-related genes. Our findings not only allowed getting new insights into the complexity of the network regulating secondary cell walls but also open new avenues to improve wood quality for industrial applications such as second-generation bioethanol.

Ce mémoire analyse la question de la désaffiliation et les concepts afférents chez les évangéliques de deuxième génération au Québec nés de parents convertis et socialisés dans le milieu évangélique. Au Canada depuis 2011, on remarque une tendance générale à une croissance modérée, si ce n’est une stabilité des groupes évangéliques. Derrière cette relative stabilité, l’on trouve notamment le phénomène de la désaffiliation religieuse, à savoir une désadhésion, un désengagement et une désidentification du milieu évangélique. Cette recherche est menée selon une approche qualitative biographique et semi-directive auprès de douze désaffiliés issus du milieu évangélique québécois. L’analyse des données prend appui sur les cadres théoriques conceptualisant la succession des générations, la déconversion et la désaffiliation. Il ressort que du point de vue générationnel la désaffiliation constitue un produit de la modernité tardive autour de la question du choix religieux, de la mobilité géographique et de l’adaptation des nouvelles églises urbaines. Du point de vue des enjeux spécifiquement liés au milieu évangélique, la désaffiliation survient pour certains interrogés suite à des difficultés à reproduire un modèle de conversion dominant véhiculé par la première génération et central à l’identité évangélique. À la fin des années 1990, le passage de l’école chrétienne publique, ou de l’école à la maison, vers l’univers de l’éducation publique déconfessionnalisée, produit une forme de « choc scolaire » amorçant une remise en question suscitant un début de « désadhésion ». Au mode de vie évangélique « tout ou rien », s’imbrique l’idéal de la pureté sexuelle et du mariage dont l’échec vient aussi agir comme déclencheur de désaffiliation engendrant le « désengagement » religieux. Au fil de la vie de ces membres, la désaffiliation se produit selon une chronologie marquée généralement par un désengagement suivi d’une « désidentification ». Enfin, par son examen de la trajectoire des trois quarts des interrogés s’orientant vers la non-religion, cette recherche contribue à l’élargissement des connaissances concernant la manière dont la désaffiliation évangélique contribue à la croissance du phénomène des sans-religions. Elle comble un manque de données empiriques concernant le sujet de la désaffiliation religieuse au sein des milieux du Réveil évangélique et québécois. / This master thesis analyzes the issue of disaffiliation and related concepts among second- generation evangelicals in Quebec born of converted parents and socialized in the evangelical milieu. In Canada since 2011, there has been a general trend of moderate growth, if not stability, among evangelical groups. Behind this relative stability lies the phenomenon of religious disaffiliation, that is, disadhesion, disengagement, and disidentification from the evangelical milieu. This research is conducted using a qualitative biographical and semi-directive approach with twelve disaffiliated persons from the evangelical milieu in Quebec. The analysis of the data is based on theoretical frameworks that conceptualize disaffiliation, deconversion, and generational succession. It emerges that from a generational point of view, disaffiliation is a product of late modernity around the issue of religious choice, geographic mobility, and the adaptation of new urban churches. From the point of view of issues specifically linked to the evangelical milieu, disaffiliation occurs for some respondents as a result of difficulties in reproducing a dominant conversion model conveyed by the first generation and central to evangelical identity. At the end of the 1990s, the transition from public Christian schools, or homeschooling, to the world of deconfessionalized public education produced a form of "school shock" that initiated a questioning that led to the beginning of disadhesion. To the evangelical way of life "all or nothing" is interwoven with the ideal of sexual purity and marriage whose failure also acts as a trigger of disaffiliation generating religious disengagement. Throughout these members' lives, disaffiliation occurs according to a chronology generally marked by disengagement followed by disidentification. Finally, by examining the trajectory of three- quarters of respondents moving toward non-religion, this research contributes to the expansion of knowledge about how evangelical disaffiliation contributes to the growth of the phenomenon of the non-religious. It fills a gap in empirical data concerning the subject of religious disaffiliation within the Evangelical Revival in Quebec milieu.

Cette thèse traite de la résistance du VIH-1 aux antirétroviraux, en particulier de l'activité antivirale de plusieurs inhibiteurs non nucléosidiques de la transcriptase inverse (INNTI) ainsi que des inhibiteurs de protéase (IP). Nous avons exploré l’émergence et la spécificité des voies de mutations qui confèrent la résistance contre plusieurs nouveaux INNTI (étravirine (ETR) et rilpivirine (RPV)) (chapitres 2 et 3). En outre, le profil de résistance et le potentiel antirétroviral d'un nouvel IP, PL-100, est présenté dans les chapitres 4 et 5. Pour le premier projet, nous avons utilisé des sous-types B et non-B du VIH-1 pour sélectionner des virus résistants à ETR, et ainsi montré que ETR favorise l’émergence des mutations V90I, K101Q, E138K, V179D/E/F, Y181C, V189I, G190E, H221H/Y et M230L, et ce, en 18 semaines. Fait intéressant, E138K a été la première mutation à émerger dans la plupart des cas. Les clones viraux contenant E138K ont montré un faible niveau de résistance phénotypique à ETR (3,8 fois) et une diminution modeste de la capacité de réplication (2 fois) par rapport au virus de type sauvage. Nous avons également examiné les profils de résistance à ETR et RPV dans les virus contenant des mutations de résistance aux INNTI au début de la sélection. Dans le cas du virus de type sauvage et du virus contenant la mutation unique K103N, les premières mutations à apparaître en présence d’ETR ou de RPV ont été E138K ou E138G suivies d’autres mutations de résistance aux INNTI. À l’inverse, dans les mêmes conditions, le virus avec la mutation Y181C a évolué pour produire les mutations V179I/F ou A62V/A, mais pas E138K/G. L'ajout de mutations à la position 138 en présence de Y181C n'augmente pas les niveaux de résistance à ETR ou RPV. Nous avons également observé que la combinaison de Y181C et E138K peut conduire à un virus moins adapté par rapport au virus contenant uniquement Y181C. Sur la base de ces résultats, nous suggérons que les mutations Y181C et E138K peuvent être antagonistes. L’analyse de la résistance au PL-100 des virus de sous-type C et CRF01_AE dans les cellules en culture est décrite dans le chapitre 4. Le PL-100 sélectionne pour des mutations de résistance utilisant deux voies distinctes, l'une avec les mutations V82A et L90M et l'autre avec T80I, suivi de l’addition des mutations M46I/L, I54M, K55R, L76F, P81S et I85V. Une accumulation d'au moins trois mutations dans le rabat protéique et dans le site actif est requise dans chaque cas pour qu’un haut niveau de résistance soit atteint, ce qui démontre que le PL-100 dispose d'une barrière génétique élevée contre le développement de la résistance. Dans le chapitre 5, nous avons évalué le potentiel du PL-100 en tant qu’inhibiteur de protéase de deuxième génération. Les virus résistants au PL-100 émergent en 8-48 semaines alors qu’aucune mutation n’apparaît avec le darunavir (DRV) sur une période de 40 semaines. La modélisation moléculaire montre que la haute barrière génétique du DRV est due à de multiples interactions avec la protéase dont des liaison hydrogènes entre les groupes di-tétrahydrofuranne (THF) et les atomes d'oxygène des acides aminés A28, D29 et D30, tandis que la liaison de PL-100 est principalement basée sur des interactions polaires et hydrophobes délocalisées à travers ses groupes diphényle. Nos données suggèrent que les contacts de liaison hydrogène et le groupe di-THF dans le DRV, ainsi que le caractère hydrophobe du PL-100, contribuent à la liaison à la protéase ainsi qu’à la haute barrière génétique contre la résistance et que la refonte de la structure de PL-100 pour inclure un groupe di-THF pourrait améliorer l’activité antivirale et le profil de résistance. / This thesis focuses on HIV-1 drug resistance and on the antiviral activity of several non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) and protease inhibitors (PIs). We have explored the mutational pathways and resistance patterns of several new NNRTIs (etravirine (ETR) and rilpivirine (RPV)) (Chapters 2 and 3). In addition, the drug resistance profile and potential of a novel protease inhibitor (PI) PL-100 is presented in Chapters 4 and 5. In the first project, we used both B and non-B subtypes of HIV-1 to select for ETR resistance and showed that ETR selected for mutations at positions V90I, K101Q, E138K, V179D/E/F, Y181C, V189I, G190E, H221H/Y and M230L within 18 weeks of commencing drug pressure. Interestingly, E138K was the first mutation to emerge in most instances. Viral clones containing E138K displayed low-level phenotypic resistance to ETR (3.8-fold) and modestly impaired replication capacity (2-fold) compared to wild-type virus. We also examined resistance patterns to ETR and RPV in viruses containing NNRTI mutations at baseline. In wild-type (wt) viruses and viruses containing K103N alone, E138K or E138G mutations were observed in the presence of either ETR or RPV drug pressure followed by the appearance of other NNRTI resistance mutations. Alternatively, subtype B viruses containing Y181C generated V179I/F or A62V/A on exposure to ETR or RPV drug pressure, respectively, but not E138K. The addition of mutations at position 138 to Y181C did not significantly enhance levels of resistance to ETR or RPV. We also observed that the combination of Y181C and E138K may lead to a less fit virus compared to virus containing Y181C alone. Based on these findings, we suggest that Y181C may be antagonistic to E138K. The tissue culture drug resistance analysis of PL-100 in subtype C and CRF01_AE viruses is described in Chapter 4. PL-100 selected for PI resistance mutations along either of two distinct pathways, one of which involved resistance mutations at positions V82A and L90M while the other involved a mutation at position T80I, with other mutations being observed at positions M46I/L, I54M, K55R, L76F, P81S and I85V. An accumulation of at least three mutations in the protease flap and enzyme active sites were required in each case for high-level resistance to occur, demonstrating that PL-100 has a high genetic barrier against the development of drug resistance. In Chapter 5, we evaluated the potential of PL-100 as a second generation HIV-1 protease inhibitor. PL-100 resistant variants emerged within 8-48 weeks while darunavir (DRV) did not select for resistance mutations over a period of 40 weeks. Structural modeling demonstrated that the high genetic barrier of DRV is due to numerous interactions with protease that include hydrogen-bonding to PR backbone oxygens at amino acid positions A28, D29 and D30 via di-tetrahydrofuran (THF) groups, while binding of PL-100 was predominantly based on polar interactions and delocalized hydrophobic interactions through its diphenyl groups. Our data suggest that hydrogen bonding contacts and the di-THF group in DRV, as well as the hydrophobic nature of PL-100, contribute to PI binding and a high genetic barrier for resistance and that redesigning the structure of PL-100 to include a di-THF group might improve it antiviral potency and drug resistance profile.

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Ce mémoire porte sur la deuxième génération issue de l’immigration, plus précisément sur ces Québécois dont les parents sont issus de l’immigration algérienne des années 90. Cette vague d’immigration offre un cadre légitime pour se pencher sur la deuxième génération, car les parents de ces Québécois ont immigré dans une temporalité et une géographie données, tout en provenant d’un même milieu social. Ce faisant, ces Québécois ont été socialisés à travers deux ensembles culturels, celui du Québec et celui de leurs parents. Ces deux ensembles peuvent sembler contradictoires ou en tension concernant les normes et les valeurs qui guident et encadrent la vie de ces derniers. Ce mémoire s’est donc intéressé à comprendre comment ces enfants, qui ont grandi au Québec, composent avec les attentes de leurs parents concernant le respect des valeurs et des traditions familiales et religieuses. Pour ce faire, nous allons explorer deux grandes thématiques. La première va se focaliser sur la relation de ces Québécois avec leur histoire familiale. La deuxième va se concentrer sur le positionnement de ces derniers vis-à-vis de différentes dynamiques familiales (école, religion et interdits). / This thesis investigates second-generation immigrants, more precisely the Quebecers whose parents are from Algerian immigration from the 90s. This wave of immigration offers a legitimate framework to examine the second generation, because the parents of these Quebecers immigrated in a given temporality and geography, while also coming from the same social background. Thus, these Quebecers were socialized through two cultural groups, that is, that of Quebec and that of their parents. These two groups may seem in contradiction or in tension regarding the social norms and values that guide and frame their lives. This thesis is therefore interested in understanding how this new generation, who grew up in Quebec, deal with their parents’ expectations regarding the respect of family and religious values and traditions. To do so, we will explore two main themes. The first one focuses on the relationship between these Quebecers and their family history. The second one focuses on the position held by these Quebecers regarding different family dynamics (school, religion, what is forbidden). / اخترت فى هذا البحث التحدث عن الجيل الثاني للهجرة من اصل جزائري في حقيقة الأمر سوف أحاول مناقشة بعض الامور التي تخص ابناء المهاجرين خلال فترة التسعينيات ‘’90’’هده الموجة من الهجرة المقننة تدفعنا الى الاهتمام بالجيل الثاني لهده الفئة وأعني بدلك أبناء الجيل الاول ومن البديهي والمعقول ان يكون اختلاف بين الاباء والابناء . عاشوا ظروفا مختلفة عن الابناء اللذين ازدادوا في (Québec)هدا الاختلاف يتجلى في بعض المجلات:جغرافيًا ،عادات و تقاليد وايضا الجانب الديني مما يجعلنا نلاحظ ان الجيل الثاني يعيش ثقافتين مختلفتين في نفس الوقت:الثقافة الجزائرية فى البيت بكل مكونتها الاجتماعية والدينية اضافة الى ما يعيشه الجيل الثاني في المجتمع الكبيكى وأقصد بدلك الشارع العام ،المدرسة و العمل ة،المناخ العام. فهدا الموضوع مركز على إبراز كيفية التعايش الجيل الثاني مع العادات ،التقاليد والتعامل الاجتماعية ،الثقافية والدينية داخل البيت وخارجه

Dans cette étude, j’examine la propension à former une union interethnique parmi les Canadiens arabes de seconde génération et de génération 1.5 en utilisant les données du recensement canadien de 2016. L’analyse descriptive montre que les unions interethniques sont fréquentes au sein de cette population. Environ la moitié des hommes (56%) et des femmes (49%) sont dans une union interethnique avec une personne non-Arabe d’origine immigrante ou un(e) Canadien(ne) de troisième génération ou des générations suivantes. La régression logistique multinomiale révèle que les hommes et les femmes avec un niveau d’éducation plus élevé, une ascendance partiellement arabe et un statut d’immigrant de deuxième génération sont significativement plus enclins à être en union interethnique qu’à être en union intraethnique avec un immigrant de première génération. Conformément à la théorie de l’assimilation segmentée, ces résultats suggèrent que l’intégration socioéconomique et l’acculturation contribuent à la propension des descendants arabes à former des unions avec des individus non-arabes. La propension des descendants arabes à être en union intraethnique avec des immigrants de première génération ou des descendants est aussi une problématique dont je discute. / In this study, I examine the propensity to form interethnic unions among the 1.5 and second generations of Arab Canadians using the 2016 Canadian census data. The descriptive analysis shows that interethnic unions are common within this population. About half the men (56%) and the women (49%) are in an interethnic union with a non-Arab person with an immigrant background or a Canadian of third generation or subsequent generations. The multinomial logistic regression reveals that men and women with higher educational attainment, part Arab ancestry and second-generation immigrant status are significantly more prone to be in an interethnic union than in an intraethnic union with a first-generation immigrant. In accordance with the segmented assimilation theory, these results suggest that socioeconomic integration and acculturation contribute to the propensity of Arab descendants to form unions with non-Arab individuals. The propensity of Arab descendants to be in intraethnic unions with first generation-immigrants or with descendants of immigrants (1.5 and second generations) is also discussed in this thesis.

Ce mémoire vise à comprendre comment les personnes de minorité vietnamienne de deuxième génération au Québec négocient leur rapport au groupe majoritaire au prisme de leur expérience socioscolaire. Cette recherche part du constat d’un écart entre l’image de la communauté vietnamienne au Québec comme une minorité modèle, c’est-à-dire un groupe minoritaire qui a connu une intégration réussie, et la présence d’une barrière entre le « nous » vietnamien et le « eux » québécois. Je m’intéresse ainsi à saisir ces tensions sous l’angle de rapports majoritaires-minoritaires. Deux concepts principaux ont été mobilisés pour rendre compte de ces négociations : celui de la blanchité et de la racialisation. Les concepts des frontières ethniques et de l’identification ont aussi été retenus dans le but de comprendre comment ces négociations s’articulent au processus d’identification de cette population. Cette recherche qualitative se base sur treize entretiens semi-dirigés et sur une analyse thématique de ceux-ci. Les résultats de la recherche montrent des négociations avec la blanchité et le vécu d’expériences de racialisation dans les interactions avec les acteurs significatifs de la sphère scolaire, tels que les pairs et le personnel enseignant. La blanchité est principalement vécue comme une norme imposée et inatteignable pour les personnes racialisées. Les témoignages des jeunes Vietnamien·ne·s soulignent par ailleurs la racialisation des personnes asiatiques comme étant à la fois des minorités modèles et des éternel·le·s étranger·ère·s. De plus, les récits des participant·e·s mettent en évidence les processus d’exclusion, d’infériorisation et de hiérarchisation auxquels font face les personnes de minorité vietnamienne de deuxième génération au Québec. Ces processus s’articulent également au processus d’identification des participant·e·s et limitent leur choix d’identification. Ces négociations affectent aussi la manière dont les personnes de minorité vietnamienne de deuxième génération appréhendent la culture vietnamienne et la culture québécoise. / This master’s thesis aims to understand how second-generation Vietnamese people in Quebec negotiate their relationship with the majority group through the lens of their socio-educational experience. This research begins with the observation that there is a gap between the image of the Vietnamese community in Quebec as a model minority, that is, a minority group that has successfully integrated, and the presence of a barrier between the Vietnamese “us” and the Quebec “them.” I am interested in understanding these tensions and will be examining them through the lens of majority-minority relations. Two main concepts have been mobilized to examine these negotiations: whiteness and racialization. The concepts of ethnic boundaries and identification were also used in order to understand how these negotiations relate to the identification process of this population. This qualitative research is based on thirteen semi-structured interviews and a thematic analysis of them. The research results show negotiations with whiteness and lived experiences of racialization in the participants’ interactions with key actors in the educational sphere, such as peers and teachers. Whiteness is primarily experienced as an imposed and unattainable norm for racialized individuals. The participants’ stories also highlight the racialization of Asian people as both model minorities and perpetual foreigners. In addition, the participants' narratives bring to light the processes of exclusion, inferiorization and hierarchization faced by second-generation Vietnamese people in Quebec. These processes are also articulated in the participants' identification process and limit their choices of identification. These negotiations also affect the way in which second-generation Vietnamese people view Vietnamese culture and Quebec culture.