Chez une bactérie, la régulation de l’expression génétique est essentielle afin de maintenir l’équilibre, s’assurer du bon fonctionnement des processus cellulaires et mieux s’adapter aux changements environnementaux. Elle peut s’effectuer à plusieurs niveaux (la transcription, la traduction et la synthèse ou la dégradation des protéines), et par le bais de différents mécanismes, dont les protéines, font le plus grand part de cette régulation. Cependant, au début des années 2000, une découverte fascinante a mis en évidence un nouveau mécanisme de régulation dont l’ARN est l’acteur principal. Ce sont les riborégulateurs (riboswitches). Ces derniers sont localisés dans la partie non traduite de certains ARNmessagers (ARNm) et capable de lier un ligand spécifique sans l’intervention des protéines, afin de réguler l’expression génique du gène d’intérêt. Aujourd’hui, plusieurs familles de riborégulateurs sont caractérisées, entre autres les riborégulateurs c-di-GMP. Ces derniers sont présents chez plusieurs espèces bactériennes notamment les bactéries pathogènes telles que Clostridium difficile, une bactérie nosocomiale opportuniste qui a causé des problèmes majeurs durant les dernières années, vu sa multirésistance aux antibiotiques. Le séquençage de son génome a révélé la présence de 66 riborégulateurs dont 16 sont des riborégulateurs c-di-GMP. Il a été proposé que parmi ces derniers, certains régulent l’expression des gènes impliqués dans deux phénotypes essentiels chez C. difficile : la motilité et la formation du biofilm. La présente étude porte sur la caractérisation structurale et fonctionnelle de deux riborégulateurs c-di-GMP chez le C. difficile, le Cdi1-1 et Cdi1-12, qui se trouvent en amont du gène CD1990 et le gène CD2830 (ZmpI) respectivement. Au début, nous avons prédit les deux structures liées (en présence du ligand) et non liées (en absence du ligand). Nous avons ainsi démontré qu’un des deux riborégulateurs (Cdi1-12) est fonctionnel et capable de lier le c-di-GMP in vitro. Ensuite, nous avons caractérisé les changements structuraux potentiels lors de l’interaction riborégulateur Cdi1-12/ligand. Nous avons également caractérisé le mécanisme de régulation en cis du riborégulateur Cdi1-12 in vitro et nous avons constaté que c’est un riborégulateur transcriptionnel Rho-indépendant. À la fin de notre étude, nous avons confirmé le mode de régulation de ce riborégulateur in vivo dans la bactérie modèle Bacillus subtilis.

The decay B → K*l^+l^-, where the l^+l^- can be e^+e^- or μ^+μ^-, resulting from the b → s flavour changing neutral current decay is highly sensitive to the presence of new physics. The angular observables describing the K* polarisation (FL) and the forward backward asymmetry (AFB) are first measured in two regions of di-lepton mass squared using a dataset of 384 million BB pairs collected by the BaBar detector on the PEP-II rings at SLAC. A second measurement was made in four regions of di-lepton mass squared using a dataset of 468 million BB pairs.

Seafood is known for its valuable and healthy nutrients; however scientific studies demonstrated the unavoidable presence of contaminants in fish and shellfish. Authorities strongly recommend fish consumption, especially to sensible groups of population (pregnant or nursing women, infants and children), and ask the scientific community for novel and coherent data to establish clear guidelines for consumers. There is also a serious need to extend the monitoring to emerging chemical pollutants, other than methylmercury, dioxins and polychlorinated biphenyls, to better understand the level of seafood contamination. An innovative UHPLC-MS/MS method for the quantification of glycine betaine (GB) in Tapes philippinarum was developed and validated, taking the 2002/657 European Decision as guideline; GB is an endogenous osmolyte abundant in molluscs, and represent a vital methylating agent in humans. Moreover, a previously developed and validated UHPLC-MS/MS method was used to conduct a preliminary monitoring of the presence of the two main perfluorinated contaminants, perfluorooctane sulfonate (PFOS) and perfluorooctanoic acid (PFOA), in six fish species from Italian markets (Dicentrarchus labrax, Merluccius merluccius, Mugil cephalus, Pleuronectes platessa, Scomber scombrus and Sparus aurata). The daily contribution of seafood to PFOS and PFOA dietary intake in Italian population was calculated and data were compared to the corresponding Tolerable Daily Intakes established by EFSA in 2008. Results revealed that the risk of contamination related to fish consumption is unlikely, but suggested the need to conduct further surveys focused on certain species from different sampling site. Subsequently, a mono-specie monitoring was carried out in 140 farmed and wild subjects of Dicentrarchus labrax, from 14 different locations in the Mediterranean area. The obtained results showed that wild subjects are sensibly more contaminated than farmed ones, and that levels of fish contamination are strongly influenced by their geographical origin and the proximity to polluted areas.

In the big data era, a wide amount of data has been generated in different domains, from social media to news feeds, from health care to genomic functionalities. When addressing a problem, we usually need to harness multiple disparate datasets. Data from different domains may follow different modalities, each of which has a different representation, distribution, scale and density. For example, text is usually represented as discrete sparse word count vectors, whereas an image is represented by pixel intensities, and so on. Nowadays plenty of Data Mining and Machine Learning techniques are proposed in literature, which have already achieved significant success in many knowledge engineering areas, including classification, regression and clustering. Anyway some challenging issues remain when tackling a new problem: how to represent the problem? What approach is better to use among the huge quantity of possibilities? What is the information to be used in the Machine Learning task and how to represent it? There exist any different domains from which borrow knowledge? This dissertation proposes some possible representation approaches for problems in different domains, from text mining to genomic analysis. In particular, one of the major contributions is a different way to represent a classical classification problem: instead of using an instance related to each object (a document, or a gene, or a social post, etc.) to be classified, it is proposed to use a pair of objects or a pair object-class, using the relationship between them as label. The application of this approach is tested on both flat and hierarchical text categorization datasets, where it potentially allows the efficient addition of new categories during classification. Furthermore, the same idea is used to extract conversational threads from an unregulated pool of messages and also to classify the biomedical literature based on the genomic features treated.

Gli anni di piombo sono un periodo storico che ha lasciato una traccia indelebile nella società italiana. La presente tesi è un`analisi del modo in cui gli eventi degli anni di piombo vengono rappresentati e riproposti nella cinematografia prodotta nei quarant`anni successivi. Nell`analizzare una così vasta ed eterogenea filmografia si é cercato di individuare l`esistenza di una tendenza di carattere generale che fosse comune alla maggioranza delle pellicole prodotte sull`argomento, in modo da rivelare che tipo di correlazione esiste tra i film analizzati ed il contesto storico, sociale e culturale in cui sono stati prodotti. I film analizzati sono stati raggruppati in tre aree tematiche riguardanti, rispettivamente, i film dedicati al terrorismo di sinistra, quelli dedicati al terrorismo di destra e, infine, la cinematografia che affronta l`eredità lasciata dagli eventi degli anni di piombo sulla società italiana. Nel corso di tale analisi, ciò che è emerso è una produzione cinematografica che risulta estremamente sintomatica del contesto storico e culturale entro il quale è stata prodotta. I film in esame, tutti, seppur in modalità estremamente differenti, alle prese con la ricerca di quel superamento del trauma che gli eventi degli anni di piombo avevano causato, risultano infatti sintomatici delle circostanze storiche e culturali in cui sono emersi: si tratta, quindi, di un corpus cinematografico che rappresenta eventi, circostanze e sentimenti che sono tutti profondamente ancorati nel proprio contesto storico e culturale.

O presente trabalho cuida das técnicas comumente referidas como cláusula de proteção à dispersão acionária, empregadas pelas companhias brasileiras. Tais técnicas foram apelidadas pela comunidade jurídica nacional de poison pills (pílulas de veneno). A expressão já é utilizada na experiência norte-americana para se referir a um conjunto de medidas defensivas contra a tomada de controle hostil, com as quais a poison pill à brasileira guarda pouca semelhança. O tema insere-se no contexto mais amplo da tomada de controle da companhia aberta (takeover) e as técnicas de defesa usualmente empregadas para impedi-la ou dificultá-la, quando indesejada. Tais técnicas são principalmente empregadas por companhias com capital disperso no mercado mobiliário e cujo poder de controle é exercido com a detenção de parcela reduzida do capital social. A busca pela maior dispersão acionária, bem como a presença apenas de ações votantes, fez com que a pílula brasileira se tornasse especialmente comum nas companhias listadas no Novo Mercado da BM&F-Bovespa S.A. Bolsa de Valores, Mercadorias e Futuros. A análise proposta circunscreve-se a tais companhias e à defesa por elas adotada. Dessa forma, parte-se da análise da disciplina jurídica das ofertas públicas voluntárias (artigo 257 da Lei das Sociedades por Ações), principal instrumento para a tomada de controle da companhia aberta, passa-se pelos dois principais sistemas de regulação da tomada de controle, com destaque para os modelos norte-americanos e inglês/europeu, para enfim chegar à apreciação da medida defensiva denominada poison pill tanto como originalmente concebida, na prática forense norte-americana, quanto em sua versão brasileira. É tema recente na literatura jurídica brasileira, ainda pouco explorado, mas bastante conhecido, estudado e vivenciado pela doutrina e experiência estrangeira, com apoio na qual o presente trabalho foi desenvolvido / Il presente lavoro si occupa delle tecniche comunemente citate come clausola di protezione alla dispersione azionaria, usate dalle società brasiliane. Dette tecniche sono state soprannominate dalla comunità giuridica nazionale di poison pills (pillole di veleno). Lespressione già è utilizzata nellesperienza nordamericana per riferirsi a un insieme di misure difensive contro la scalata ostile, con la quale la poison pill alla brasiliana si somiglia molto poco. Il tema si inserisce nel contesto più ampio della scalata della società cotata (takeover) e le tecniche di difesa usualmente impiegate per impedirla o tornarla più difficile, quando non desiderata. Tali tecniche sono principalmente usate da società con capitale disperso sul mercato mobiliare e il cui potere di controllo è praticato con il controllo di porzione ridotta del capitale sociale. La ricerca per una maggiore dispersione azionaria, così come la presenza solamente di azioni votanti, ha fatto con che la pillola brasiliana si tornassi specialmente comune nelle società elencate nel Nuovo Mercato della BM&F-Bovespa S.A. Borsa Valori, Borsa Merce e Mercato a termine. Lanalisi proposta è circoscritta a dette società e alla difesa da loro adottate. In questo modo, si parte dallanalisi della disciplina giuridica delle offerte pubbliche volontarie (articolo 257 della Legge di Società per Azioni), principale strumento per la scalata del controllo di società cotata, passiamo per i due principali sistemi di regolazione della scalata, con distacco ai modelli nordamericani e inglese/europeo, per infine arrivare alla valutazione della misura difensiva denominata poison pill tanto come originalmente concepita, nella pratica forense nordamericana, quanto nella sua versione brasiliana. È tema recente nella letteratura giuridica brasiliana, ancora poco investigata, ma abbastanza conosciuta, studiata e vissuta dalla dottrina ed esperienza straniera, con base nella quale il presente lavoro è stato sviluppato.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:58:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 412507.pdf: 13924046 bytes, checksum: 433987dc1c1898ad93ebbc38ebb8c66f (MD5) Previous issue date: 2009-03-18 / O trabalho versa sobre a an?lise experimental das intera??es CO2-rocha-fluido das amostras de reservat?rio (arenito) coletadas do campo de Buracica, Bacia do Rec?ncavo, Brasil. Neste campo, realiza-se inje??o de CO2 desde 1991 para recupera??o avan?ada ou terci?ria de petr?leo. Foram realizados experimentos em autoclaves de a?o sob condi??es do campo e tamb?m supercr?ticas. Modelagem geoqu?mica de equil?brio foi realizada para comparar com os dados obtidos experimentalmente. An?lises no Microsc?pio Eletr?nico de Varredura (MEV) foram realizadas para identificar a dissolu??o e precipita??o de fases minerais a partir das rea??es ocorridas no sistema estudado. An?lises por Espectroscopia de Emiss?o At?mica por Plasma Indutivamente Acoplado (ICP AES) foram realizadas na solu??o resultante dos experimentos para identificar os ?ons presentes na solu??o. Os resultados indicaram a integridade mineral?gica do reservat?rio estudado para fins de armazenamento geol?gico de carbono.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:58:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 412503.pdf: 4373576 bytes, checksum: 22ddb62c7d2930b54f20b7ab9486a6c9 (MD5) Previous issue date: 2009-03-30 / Atualmente, a preocupa??o com o meio ambiente est? em todas as atividades humanas, por?m, nos ?ltimos anos, as quest?es associadas ?s mudan?as clim?ticas e ao efeito estufa tem se tornado objeto principal de estudo e discuss?es cient?ficas e governamentais. O di?xido de carbono (CO2), que ? um dos gases de efeito estufa, tem gerado grande preocupa??o devido ao fato de estar diretamente relacionado ao aquecimento global. Muita pesquisa tem sido feita com o intuito de reduzir as emiss?es atmosf?ricas desse g?s, dentre elas pode-se citar o uso de biocombust?veis, o armazenamento geol?gico, o armazenamento oce?nico, a carbonata??o mineral e a carbonata??o de res?duos alcalinos. O objetivo deste projeto foi o de desenvolver um m?todo de captura e armazenamento de CO2 utilizando um res?duo de pouco valor agregado, a saber, a esc?ria de aciaria el?trica. Este res?duo possui um alto teor de ?xidos de c?lcio e magn?sio, compostos essenciais para o armazenamento em longo prazo desse g?s de efeito estufa. O m?todo consiste na lixivia??o dos componentes principais e posterior carbonata??o atrav?s da passagem do fluxo de CO2 pela solu??o. O rendimento global do processo entre extra??o e carbonata??o para a obten??o de carbonato de c?lcio mostrou ser bem significativo (at? 83%). A pureza dos carbonatos de c?lcio obtidos foi de 97%, mostrando que ? poss?vel que se obtenha produtos comerciais a partir da carbonata??o indireta da esc?ria.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 460801.pdf: 2534757 bytes, checksum: 19453f2740e782d108d6c7205685694f (MD5) Previous issue date: 2014-06-26 / With low cost and still abundant, fossil coal remains a source of energy used worldwide. The gases emitted during the extraction of coal, generally consist of mixtures of methane, carbon dioxide, nitrogen dioxide and other hydrocarbons. However, methane is the most emitted in proportion. The use of natural gas as fuel is advantageous from an environmental point of view and has become economically attractive. The collection of gas samples is still a problem faced in related coal mine gas studies. Some products known as Tedlar? sampling bags for example, are efficient but, they have some drawbacks. In this work we tested an alternative means to collect gaseous samples, Vacutainers?. For identification and quantification of gases (CH4, CO2 and CO), analyses of gas chromatography with flame ionization detector were performed. Gaseous samples from the air of underground mines and waste piles of coal, in addition to standard mixtures, were analyzed after different periods of storage using Vacutainer? container type collectors. These collectors compared to Tedlars? were not efficient for the quantification of real samples containing CH4 and CO2. However, when accepting a 5 % error, it was effective for CO found in real samples. Results related to the concentration of CH4 in coal mine showed a concentration ranging from 117 ppm to 1,8 %, indicating a potential recovery and use of this gas as an energy source. On the other hand, alert to the need of periodic monitoring in order to ensure safety in the mine / Com baixo custo e ainda abundante, o carv?o f?ssil continua sendo uma fonte de energia utilizada mundialmente. Os gases emitidos durante a extra??o de carv?o, geralmente, consistem em misturas de metano, di?xido de carbono, nitrog?nio e outros hidrocarbonetos. Todavia, o metano ? o mais emitido em propor??o. A utiliza??o de g?s natural como combust?vel ? vantajosa do um ponto de vista ambiental e tornou-se economicamente atraente. A coleta de amostras gasosas ? um problema ainda enfrentado em estudos relacionados ao g?s de minas de carv?o. Alguns produtos j? conhecidos como os sacos de amostragem Tedlar?, por exemplo, s?o eficientes, mas apresentam alguns inconvenientes. Neste trabalho foi testado um meio alternativo para coletar amostras gasosas, os Vacutainers?. Para identifica??o e quantifica??o dos gases (CH4, CO2 e CO) foram realizadas an?lises de cromatografia gasosa, com detector de ioniza??o em chama. Amostras gasosas do ar de minas subterr?neas e pilhas de rejeitos de carv?o, al?m de misturas padr?es, foram analisadas ap?s diferentes per?odos de estocagem utilizando frascos coletores do tipo Vacutainer?. Estes coletores quando comparados aos Tedlars? n?o se mostraram eficientes para a quantifica??o de amostras reais contendo CH4 e CO2. No entanto, aceitando um percentual de erro de 5 %, se mostrou eficaz para o CO encontrado em amostras reais. Os resultados referentes ? concentra??o de CH4 em mina de carv?o mostraram uma concentra??o variando de 117 ppm at? 1,8 %, indicando um potencial de recupera??o e utiliza??o deste g?s como fonte de energia. Por outro lado alerta a para a necessidade de monitoramento peri?dico, visando garantir a seguran?a na mina

La prospettiva moderna sull’obbligo di motivazione delle decisioni giudiziali rappresenta soltanto un passaggio nella strada per una nuova identità in costruzione. Non ci sono dubbi, nonostante la persistenza delle vecchie formule, che il modello teorico risultante del pensiero del moderno sulla motivazione non adempie più le esigenze dello Stato Costituzionale contemporaneo, rivelando una crisi di legittimità veramente preoccupante. La tesi contribuisce per la riflessione critica sull’obbligo di motivazione delle decisioni giudiziali, denudando l’inadeguatezza di parametri in argomento presenti nella giurisprudenza delle Corti Superiori e proponendo criteri per l’effettivo controllo, con lo scopo di rendere sostanziale la norma giuridica fondamentale che lo afferma nella Costituzione brasiliana (art. 93, IX).