Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Celso Luiz Marino / Banca: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Leo Zimback / Banca: Bruno Cesar Rossini / Banca: Evandro Vagner Tambarussi / Resumo: Myracrodruon urundeuva (Anacardiaceae) é uma espécie arbórea de ampla distribuição geográfica. Por possuir madeira de reconhecido valor econômico, associada à alta taxa de fragmentação dos seus habitats, encontra-se ameaçada de extinção. Com o intuito de manter a variabilidade genética existente das populações fragmentadas e reduzir perdas na base genética da espécie, sementes de polinização aberta de M. urundeuva foram coletadas em diferentes regiões, no Brasil, para formação do banco de conservação ex situ da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira, em Selvíria-MS. Esse trabalho foi realizado com o objetivo de caracterizar o sistema de reprodução e estimar parâmetros genéticos populacionais em progênies de M. urundeuva, procedentes de diferentes biomas brasileiros, por meio de caracteres quantitativos de crescimento e marcadores moleculares do tipo microssatélites. Os caracteres altura, diâmetro a altura do peito (DAP), diâmetro médio de copa e sobrevivência (SOB) foram utilizados para avaliar cinco populações: Aquidauana-MS, Selvíria-MS, Itarumã-GO, Paulo de Faria-SP e Seridó-RN. Os valores altos a medianos observados para SOB (96,4% - 70,8%) indicam boa adaptação das populações de M. urundeuva e potencial para uso em reflorestamentos. As estimativas do coeficiente de variação genética oscilaram de 3% a 24,6%, em nível de indivíduo, e de 1,5% a 12,3%, entre progênies, com os maiores valores obtidos para o DAP da população de Seridó. As herdabilidades individuais variaram ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myracrodruon urundeuva (Anacardiaceae) is a tree species with a wide geographic distribution. Because it has wood of recognized economic value, associated with the high rate of fragmentation of its habitats, it is threatened with extinction. In order to maintain the existing genetic variability of the fragmented populations and reduce losses in the genetic base of the species, M. urundeuva seeds were collected in different regions in Brazil for the formation of the ex situ conservation bank of the Faculty of Engineering of Ilha Solteira (FEIS/UNESP), in Selvíria-MS. This work was conducted with the aims to characterize the mating system and estimate population genetic parameters in M. urundeuva offsprings from different Brazilian biomes, using quantitative growth traits and molecular markers of the microsatellite type. The height, diameter at breast height (DBH), mean crown diameter and survival were used to evaluate five populations: Aquidauana-MS, Selvíria-MS, Itarumã-GO, Paulo de Faria -SP and Seridó-RN. The values high to median observed for survival (96.4% - 70.8%) indicate good adaptation of populations of M. urundeuva and potential for use in reforestation. Estimates of the coefficient of genetic variation ranged from 3% to 24.6%, at the individual level, and from 1.5% to 12.3%, among progenies, with the highest values obtained for the DBH of the Seridó population. The individual heritabilities ranged from moderate (0.41) to low (0.01) for the characters. Using the gen... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Varronia curassavica Jacq. is a medicinal and aromatic plant from Brazil, with significant economic importance. Studies on genetic diversity in Active Germplasm Banks (AGB) are essential for conservation and breeding programs. The aim of this study was to analyze the genetic diversity of V. curassavica accessions of the Active Germplasm Bank of Medicinal and Aromatic Plants of the Federal University of Sergipe, using the Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) molecular marker. DNA was extracted from 28 individuals by the CTAB 2% method. Twenty-four primers were tested, and 14 of them were polymorphic and informative, resulting in 149 bands amplified with 97,98% polymorphism. The Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean divided the accessions into Cluster I and II. In the Jaccard similarity matrix, variation ranged between 0,24 and 0,78. The pairs of accessions VCUR- 001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 and VCUR-104/VCUR-501 showed higher diversity (0,24), and the pair of accessions VCUR-402/VCUR-403 showed medium diversity (0,78). Twenty-eight accessions were divided into three distinct clusters, according to the Structure analysis. According to the Principal Component Analysis (PCA), the first principal component accounted for 13,19% of the total variance, and the second principal component accounted 9,38% of the total variance. The genetic diversity of the Active Germplasm Bank of UFS is low to medium, and it requires expansion. VCUR-802 accession is the most suitable for selection in breeding program of this species, since it clearly represents all the diversity present in the germplasm Bank. / A erva baleeira (Varronia curassavica Jacq.) é uma planta medicinal e aromática nativa do Brasil, com importância econômica relevante. Estudos de diversidade genética em Bancos Ativos de Germoplasma são essenciais em programas de conservação e melhoramento genético. O objetivo do presente estudo foi analisar a diversidade genética dos acessos de V. curassavica do Banco Ativo de Germoplasma de Plantas Medicinais e Aromáticas da Universidade Federal de Sergipe através do marcador molecular Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Foi extraído DNA de 28 indivíduos, através do método CTAB 2%. Foram testados 24 primers, onde 14 deles foram polimórficos e informativos, resultando em 149 bandas amplificadas com 97,98% de polimorfismo. O método de agrupamento da Média Aritmética Não Ponderada dividiu os acessos em dois Grupos, I e II. Na matriz de similaridade de Jaccard houve variação de 0,24 a 0,78. Os pares de acessos VCUR- 001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 e VCUR-104/VCUR-501, apresentaram maior diversidade (0,24) e os pares VCUR-402/VCUR-403, apresentaram média diversidade (0,78). Houve a separação dos 28 acessos em três grupos distintos, de acordo com a análise do Structure. Conforme a Análise de Componente Principal (ACP), o componente principal primário representou 13,19% da variância total, e o componente principal secundário representou 9,38% da variância total. A diversidade genética do Banco Ativo de Germoplasma de erva-baleeira da UFS é de baixa a média, sendo necessária sua ampliação. O acesso VCUR-802 é o mais indicado para seleção em programa de melhoramento dessa espécie, por representar claramente toda diversidade presente no BAG.

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O objetivo deste estudo foi conhecer e avaliar o impacto antrópico das práticas agrícolas na biodiversidade vegetal de uma comunidade de pequenos agricultores familiares e de discutir a possibilidade de conservar algumas espécies resistentes e úteis nos sistemas cultivados. A pesquisa foi desenvolvida no Projeto de Assentamento Palmares II em Parauapebas, sudeste do Pará, Brasil. O levantamento da biodiversidade vegetal foi conduzido em 45 pontos demarcados em 9 propriedades de agricultores familiares. Os dados de estrutura da vegetação e a composição florística foram analisados utilizando-se a Análise de Componentes Principais (ACP). Foi calculado o IVI (índice de valor de importância) para todas as espécies encontradas nos estratos intermediário e superior. No total, considerando os três estratos: inferior, intermediário e superior, foram registradas 707 espécies e respectivas riquezas específicas por atividade agrícola: Floresta explorada (77,8 ± 18,6); Floresta queimada (65,1 ± 23,5); Roça de arroz (24 ± 2); Roça de milho (33,6 ±9); Roça de mandioca (31,5); Pastagem limpa (20,1 ± 8,9); Pastagem invadida (44 ± 12,3); Terra gradeada (21), Capoeira jovem (42,8 ± 10,7) e Capoeira velha (45 ± 5,6). As espécies que apresentaram maior IVI foram: Vernonia brasiliana, Cecropia palmata, Solanum crinitum, Trema micrantha, Solanum rugosum, Oenocarpus distichus, Rollinia exsucca, Vismia baccifera, Alexa grandiflora e Pueraria phaseoloides. ACP da estrutura da vegetação indicou que o tipo de uso do solo foi determinante, ligado a uma oposição entre altos valores de riqueza, densidade e área basal do estrato superior, altos valores de riqueza e área basal do estrato intermediário e baixos valores destas variáveis. Já a ACP da composição florística mostrou que as parcelas de floresta se opõem a outras parcelas de floresta e parcelas de capoeira, indicando diferença na composição florística até mesmo entre as florestas. As roças de milho, mandioca e arroz foram consideradas como áreas que geram mais impacto na biodiversidade. O tamanho reduzido dos lotes do assentamento Palmares II, favorece a utilização intensiva do solo e o desmatamento acelerado. Deve-se incentivar e apoiar práticas agroflorestais no Projeto de Assentamento Palmares II, no sentido de preconizar técnicas agrícolas que preservem os recursos naturais, como a conservação de espécies arbóreas úteis e resistentes em áreas abertas. A espécie Pueraria phaseoloides quando associada aos cultivos agrícolas, deve manter a produção e conservar as áreas cultivadas, funcionando como adubo verde e minimizando a degradação das áreas cultivadas. / Agricultural activities in the project of nesting in the Amazon region are important in food production. The aim of this study was to identify and assess the human impact of agricultural practices on plant biodiversity of a community of small family farmers and to discuss the possibility of retaining some resistant species and useful in the tillage systems. The research was conducted at Project of Nesting Palmares II, city of Parauapebas, southeastern Pará, Brazil. The survey of plant biodiversity was conducted in 45 points on 9 demarcated family farms. Data on vegetation structure and floristic composition were analyzed using the Principal Component Analysis (PCA). Was calculated IIV (Index Importance Value) for all species found in intermediate and upper stratum. In total, considering the three strata: low, intermediate and higher, there were 707 species and their specific riches by agriculture: logged forest (77,8 ± 18,6); burned forest (65,1 ± 23,5); rice field (24 ± 2); corn field (33,6 ± 9); cassava field (31,5); clean cattle pasture (20,1 ± 8,9); invaded cattle pasture (44 ± 12,3) ; grade earth (21), young secondary forests (42,8 ± 10,7) Old secondary forests (45 ± 5,6). The species with the highest IVI were Vernonia brasiliana, Cecropia palmata, Solanum crinitum, Trema micrantha, Solanum rugosum, Oenocarpus distichus, Rollinia exsucca, Vismia baccifera, Alexa grandiflora and Pueraria phaseoloides. PCA vegetation structure indicated that the type of land use was the determining factor, linked to an opposition between high levels of richness, density and basal area of the upper stratum, high values of richness and basal area of the stratum intermediate and low values of these variables. Since the PCA of the floristic composition showed that the forest plots are opposed to other forest plots and plots of poultry, indicating differences in floristic composition even between forests. The corn field, cassava field and rice field were considered as areas that generate the most impact on biodiversity. The small size of the lots of the nesting Palmares II favors the intensive land use and deforestation accelerated. It should promote and support agroforestry practices in Project of Nesting Palmares II, to advocate farming techniques that protect natural resources, such as the conservation of tree species useful and robust in open areas. The species Pueraria phaseoloides when associated with agricultural crops, should maintain production and save the cultivated areas, functioning as green manure and minimizing degradation of cultivated areas.

Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pablo Diego Silva Cabral.pdf: 1590375 bytes, checksum: 450ea2f7d825ff599531fe2d9aff4e11 (MD5) Previous issue date: 2010-02-22 / O feijoeiro (Phaseolous vulgaris L.) é uma cultura importante no aspecto socioeconômico, pois é fonte de proteínas e emprega em seu cultivo mão de obra da agricultura familiar. O Brasil é o maior produtor de grãos de feijão e no estado do Espírito Santo essa cultura assume o terceiro lugar em importância. A produtividade da cultura ainda é baixa, mas pode ser aumentada, corrigindo-se o manejo inadequado ainda adotado e utilizando sementes comerciais adaptadas a cada região. Nesse sentido, torna-se necessário conhecer a diversidade genética existente entre as cultivares selvagens e comerciais para subsidiar programas de melhoramento da cultura adaptada às condições climáticas de regiões específicas. Com objetivo de estimar a divergência genética entre 57 genótipos de feijoeiro foram realizados três experimentos, sendo um no ano agrícola de 2008/09 e dois no de 2009/2010. Do total de genótipos utilizados, 31 foram resgatados na localidade de Fortaleza, 20 fornecidos pela EMBRAPA e seis cultivares comerciais. Para estimar a diversidade genética foram utilizadas análises morfoagronômicas e moleculares. As análises morfoagronômicas foram feitas, utilizando 19 caracteres quantitativos e 27 qualitativos, por sua vez, nas moleculares, foram utilizados 16 primers de marcadores moleculares SSR e 11 primers ISSR. Os caracteres qualitativos, quantitativos e moleculares mostraram-se eficientes na diferenciação dos genótipos, comprovados pelo valor do coeficiente de correlação cofenética (CCC), sendo que todos foram significativos, a 1% de probabilidade pelo teste t . O maior e o menor CCC foram observados, respectivamente, nas análises por SSR (0,923) e ISSR (0,833). Não foi observada concordância entre os agrupamentos feitos pelos três tipos de caracteres. Nas análises por marcadores SSR, observaram-se 14 grupos, pelas ISSR, 11 e pela combinação dos marcadores, 14. Já pelas análises dos caracteres quantitativos, observou-se a formação de 4 grupos e pelos qualitativos, 11. Sendo essa discordância no número de grupos formados esperada, devido à diferença de avaliação de cada caracter. Verificou-se ampla variabilidade entre os genótipos de feijoeiro estudados. Nos genótipos provenientes da comunidade Fortaleza (locais) foi observada uma significativa diversidade genética, mas entre os genótipos provenientes da EMBRAPA, a diversidade foi estreita. As análises por caracteres quantitativos mostraram que nas cultivares comerciais estudadas houve pequena dissimilaridade com menor valor (24,96), entre as cultivares Iapar 81 e Iapar 44, representando 1,08%. Não houve a identificação de duplicatas genéticas e a correlação de apenas 0,22 entre as matrizes de dissimilaridade, obtida pelos marcadores SSR e ISSR demonstram que a utilização desses marcadores em conjunto reflete na melhor eficiência no poder discriminatório dos genótipos. A combinação dos marcadores foi mais eficiente na separação dos genótipos, discriminando diferença entre os mesmos, por outro lado, as análises separadas classificaram esses genótipos como iguais geneticamente. A correlação moderada / alta (0,57) entre os marcadores SSR e os caracteres quantitativos demonstra que a dissimilaridade por meio de marcadores SSR ligados a características de interesse agronômico pode substituir as análises por caracteres quantitativos, já que as análises por esses marcadores não são afetadas pelo ambiente, pois são fáceis, rápidas e requerem menor quantidade de mão de obra e espaço físico / The bean (Phaseolous vulgaris L.) is an important crop in the socioeconomic aspect, it is a source of proteins and employed its cultivation, labor of family farming. The Brazil is the largest producer of beans and in the state, of the Espírito Santo that culture takes third place in importance. The yield is still low, but can be increased by correcting the improper management has adopted and using commercial seed adapted to each region. In this sense, it is necessary to know the genetic diversity between wild and commercial cultivars to support programs to improve the culture adapted to the conditions of specific regions. To estimate the genetic differences among 57 bean genotypes were performed three experiments, one in the agricultural year of 2008/09 and two in 2009/2010. Of the genotypes, 31 were rescued in the town of Fortaleza, 20 supplied by EMBRAPA and six cultivars. To estimate the genetic diversity were used morphological and molecular analysis. The morphological analysis were made using 19 quantitative characters and 27 qualitative, in turn, the molecular primers were used 16 primers of molecular markers SSR and 11 ISSR primers. The characters qualitative, quantitative and molecular techniques were effective in differentiating the genotypes, as evidenced by the value of cophenetic correlation coefficient (CCC), all of which were significant, at 1% probability by t test. The highest and lowest CCC were observed, respectively, the analysis by SSR (0.923) and ISSR (0.833). There wasn t correlation between the groupings made by the three types of characters. In the analysis by SSR markers, there were 14 groups, the ISSR, 11 and the combination of markers, 14. In the analysis of quantitative characters, we observed the formation of 4 groups and the qualitative, 11. This discrepancy in the number of groups formed expected, due to the difference in valuation of each character. There was wide variation among bean genotypes studied. In the genotypes from community Fortaleza (local) was a significant genetic diversity, but among the genotypes from EMBRAPA, the diversity was narrow. The analysis of quantitative traits showed that the cultivars studied was small dissimilarity with lower value (24.96) among the cultivars Iapar 81 and lapar 44, representing 1.08%. There wasn t identification of duplicates and genetic correlation of only 0.22 between the dissimilarity matrices obtained by SSR and ISSR markers show that these markers together reflected in greater efficiency in discriminating power of the genotypes. The combination of markers was more efficient in the separation of the genotypes, distinguishing difference between them, on the other, the separate analysis classified the genotypes as genetically identical. The correlation moderate / high (0.57) between the SSR markers and quantitative traits shows that the dissimilarity using SSR markers linked to desirable agronomic characteristics can replace the analysis of quantitative traits, since the analysis for these markers aren t affected by the environment as they are easy, fast and require less amount of manpower and physical space