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Caracterização da diversidade genética de Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville por marcador molecular AFLP e transferência de microssatélites

Mendonça, Patrícia Calligioni de [UNESP] 09 December 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-09Bitstream added on 2014-06-13T19:43:14Z : No. of bitstreams: 1 mendonca_pc_dr_botfca.pdf: 892807 bytes, checksum: c81f229a150e1ff79516536ed6fe7f98 (MD5) / A espécie Stryphnodendron adstringens (Leguminosae) é conhecida popularmente como barbatimão e o extrato das cascas é utilizado como cicatrizante. O objetivo deste trabalho foi estudar a variabilidade genética da espécie utilizando o marcador molecular de polimorfismo de comprimento amplificado (AFLP) e testar a transferência de microssatélites de Anadenanthera colubrina, Hymenaea courbaril e Copaifera langsdorffii. Foram coletados acessos localizados nos municípios de Cristalina, São João D’Aliança, Campo Alegre e Caldas Novas (GO); Delfinópolis, Luislândia, Lagoa Formosa, Sacramento e Araxá (MG) e Paranapanema, Cristais Paulista e Botucatu (SP). O DNA genômico foi extraído de folhas e as análises de polimorfismo seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Os produtos AFLP foram separados em gel desnaturante de poliacrilamida 6% com tampão TBE 1X. A eletroforese foi realizada em voltagem constante de 80W em temperatura máxima de 50ºC por 4 horas. O gel foi corado com solução de nitrato de prata e revelado em carbonato de sódio. Na análise por marcador AFLP foram produzidas 237 bandas polimórficas. A variabilidade dentro das populações foi maior (70,93%) que entre as populações (29,06%) com um valor de Fst 0.2906 indicando alta estruturação populacional. A população de Luislândia apresentou maior porcentagem de loci polimórficos (87,35), seguida da população de Cristalina (45,85). A menor variabilidade foi encontrada em Caldas Novas (22,92) e as demais ficaram na média (34,3). O Método da Média Aritmética não Ponderada (UPGMA) reuniu as populações em três grupos. Quanto aos testes de transferência de microssatélites, dos 20 iniciadores de A. colubrina testados, dez apresentaram resultados de transferência, porém somente um... / Stryphnodendron adstringens a Leguminosae species is popularly known as barbatimão and the extract of its barks is widely used as healing agent. The genetic variation of 12 populations of S. adstringens was determined in this study by using Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) molecular markers transference of microsatellites of Anadenanthera colubrina, Hymenaea courbaril and Copaifera langsdorffii. Accessions were collected in the cities of Cristalina, São João D’Aliança, Campo Alegre and Caldas Novas (GO), Delfinópolis, Luislandia, Lagoa Formosa, Sacramento and Araxá (MG) and in Paranapanema, Cristais Paulista and Botucatu (SP). The genomic DNA was extracted from the leaves and the polymorphism analysis followed multiple steps including DNA digestion, ligation, pre-amplification and amplification. Amplification products were analyzed on denaturing polyacrylamide sequencing gel and running electrophoretic steps at 80 W with maximum temperature at 50ºC for 4 h. The gel was stained with silver nitrate solution and developed in sodium carbonate. The AFLP analysis conducted with three primer combinations using the EcoRI and MseI restriction enzymes generated 237 polymorphic bands. The AFLP binary data were used to determine allele frequencies. Population structure was evaluated performing analysis of molecular variance (AMOVA) which allowed the estimation of the total genetic variance among and inside populations. A descriptive analysis of the total variability was obtained by calculating the percentage of polymorphic loci. Genetic variance 4 within populations was higher (70,93%) compared to the differentiation estimated among populations (29,06%). The fixation index (Fst) was 0.2906 indicating highly significant population structuring. The population from Cristalina... (Complete abstract click electronic access below)
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Caracterização da diversidade genética de Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville por marcador molecular AFLP e transferência de microssatélites /

Mendonça, Patrícia Calligioni de, 1971- January 2011 (has links)
Orientador: Ana Maria Soares Pereira / Coorientador: Bianca Waleria Berton / Banca: Giuseppina Pace Pereira Lima / Banca: Sonia Marli Zingaretti / Banca: Laurival Antonio Villas-Boas / Banca: Rosa de Belem Neves Alves / Resumo : A espécie Stryphnodendron adstringens (Leguminosae) é conhecida popularmente como barbatimão e o extrato das cascas é utilizado como cicatrizante. O objetivo deste trabalho foi estudar a variabilidade genética da espécie utilizando o marcador molecular de polimorfismo de comprimento amplificado (AFLP) e testar a transferência de microssatélites de Anadenanthera colubrina, Hymenaea courbaril e Copaifera langsdorffii. Foram coletados acessos localizados nos municípios de Cristalina, São João D'Aliança, Campo Alegre e Caldas Novas (GO); Delfinópolis, Luislândia, Lagoa Formosa, Sacramento e Araxá (MG) e Paranapanema, Cristais Paulista e Botucatu (SP). O DNA genômico foi extraído de folhas e as análises de polimorfismo seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Os produtos AFLP foram separados em gel desnaturante de poliacrilamida 6% com tampão TBE 1X. A eletroforese foi realizada em voltagem constante de 80W em temperatura máxima de 50ºC por 4 horas. O gel foi corado com solução de nitrato de prata e revelado em carbonato de sódio. Na análise por marcador AFLP foram produzidas 237 bandas polimórficas. A variabilidade dentro das populações foi maior (70,93%) que entre as populações (29,06%) com um valor de Fst 0.2906 indicando alta estruturação populacional. A população de Luislândia apresentou maior porcentagem de loci polimórficos (87,35), seguida da população de Cristalina (45,85). A menor variabilidade foi encontrada em Caldas Novas (22,92) e as demais ficaram na média (34,3). O Método da Média Aritmética não Ponderada (UPGMA) reuniu as populações em três grupos. Quanto aos testes de transferência de microssatélites, dos 20 iniciadores de A. colubrina testados, dez apresentaram resultados de transferência, porém somente um... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Stryphnodendron adstringens a Leguminosae species is popularly known as barbatimão and the extract of its barks is widely used as healing agent. The genetic variation of 12 populations of S. adstringens was determined in this study by using Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) molecular markers transference of microsatellites of Anadenanthera colubrina, Hymenaea courbaril and Copaifera langsdorffii. Accessions were collected in the cities of Cristalina, São João D'Aliança, Campo Alegre and Caldas Novas (GO), Delfinópolis, Luislandia, Lagoa Formosa, Sacramento and Araxá (MG) and in Paranapanema, Cristais Paulista and Botucatu (SP). The genomic DNA was extracted from the leaves and the polymorphism analysis followed multiple steps including DNA digestion, ligation, pre-amplification and amplification. Amplification products were analyzed on denaturing polyacrylamide sequencing gel and running electrophoretic steps at 80 W with maximum temperature at 50ºC for 4 h. The gel was stained with silver nitrate solution and developed in sodium carbonate. The AFLP analysis conducted with three primer combinations using the EcoRI and MseI restriction enzymes generated 237 polymorphic bands. The AFLP binary data were used to determine allele frequencies. Population structure was evaluated performing analysis of molecular variance (AMOVA) which allowed the estimation of the total genetic variance among and inside populations. A descriptive analysis of the total variability was obtained by calculating the percentage of polymorphic loci. Genetic variance 4 within populations was higher (70,93%) compared to the differentiation estimated among populations (29,06%). The fixation index (Fst) was 0.2906 indicating highly significant population structuring. The population from Cristalina... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Diversidade de líquens em leguminosas da Reserva Biológica de Mogi-Guaçu, SP

Santos, Janaína Maria Gonçalves dos [UNESP] 13 July 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-13Bitstream added on 2014-06-13T20:04:40Z : No. of bitstreams: 1 santos_jmg_dr_botib.pdf: 895282 bytes, checksum: 0c35f9663fd942b07f94d336af95df45 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho teve o objetivo de verificar a distribuição de espécies de fungos liquenizados sobre 573 troncos de onze espécies de leguminosas encontradas em área de cerrado, tanto nativas quanto estranhas ao ecossistema e plantadas num arboreto ao lado de uma área de vegetação natural. O levantamento de dados para estudo fitossociológico foi feito com método do elástico e os cálculos realizados em programa especialmente desenvolvido para esse trabalho. Cálculos de similaridade, diversidade, análises de variância e análise multivariada foram realizadas para descrever as comunidades de liquens e relacioná-las com forófitos e ambiente. O estudo da distribuição dos 4561 liquens (144 espécies) em 122 troncos de Copaifera langsdorffii (copaíba) do cerrado, cerradão e arboreto mostrou comunidades diferentes para os habitats, tipos de cascas e lados dos troncos. As espécies de maior valor de importância variam sua estratégia de ocupação com o ambiente. Embora localizado ao lado da vegetação nativa, a comunidade liquênica do arboreto é menos rica e abundante. O estudo da distribuição das 8840 ocorrências, incluindo 5535 liquens (176 espécies) em 157 troncos de cinco espécies de leguminosas do arboreto mostrou comunidades diferentes nos forófitos e maior agregação de espécies e indivíduos a cerca de um metro de altura. Liquens são mais importantes em todas as árvores, exceto no pau-brasil, onde as briófitas dominam. Umidade do ar, luminosidade, pH e diâmetro do tronco explicam as preferências por habitat. A habilidade de dispersão é o fator de sucesso da grande maioria das espécies. Cassia ferruginea (cássia) é o forófito com mais espécies e indivíduos de liquens enquanto Caesalpinia ferrea (pau-ferro) tem os menores números. Usnea spp. e formas crostosas preferem claramente troncos de cássia... / This works deals with the lichen distribution on 573 trunks of eleven Leguminosae species found in a cerrado forest region, both native and strange to the ecosystem and grown in an arboretum nearby. The phytosociological data were obtained by the rubber method and treated by software specially developed for. Similarity, variance and multivariate analysis were used to characterize the communities and related them to phorophyte species and environment. The study of the 4561 lichens (144 species) on 122 trees of Copaifera langsdorffii from cerrado and cerradão vegetation, as well from the arboretum, revealed distinct communities for habitats, bark types and aspect. The species of greater Importance changes its strategy of substrate occupation according the environment. Nevertheless located just beside the natural vegetation, the lichen community of the arboretum has lower values of richness and abundance. The study of the distribution of the 8840 occurrences that included 5535 lichens (176 species) on 157 trunks of five tree Leguminosae in the arboretum showed a greater species and individual aggregation about one meter above the ground. Here, lichens are the most important epiphytes on all tree species except on Caesalpinia ferrea, where bryophytes dominate. Air humidity, luminosity, bark pH and diameter explain the habitat preferences. The skill to efficient dispersion might be the success factor of the great majority of the lichen species. Cassia ferruginea is the phorophyte bearing more lichen species and individuals, while Caesalpinia ferrea exhibit the lower numbers. Usnea spp. as well crustose forms clearly prefer trunks of C. ferruginea, which is indicate here to form ecological corridors across anthropized areas and linking preservation areas. The study of the distribution of the 3157 occurrences of lichenized... (Complete abstract click electronic access below)
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Guia para representação de coleção viva temática de plantas medicinais em jardins botânicos

Britto, Yara Lucia Oliveira de 28 September 2015 (has links)
Submitted by Yara Lucia Oliveira de Britto (yaraoliveirabritto@gmail.com) on 2015-12-15T15:32:50Z No. of bitstreams: 1 dissertação versao final capítulos 1 2 3 4 (11 trabalho.pdf: 68807282 bytes, checksum: 76035488a396a271e8011939260a263c (MD5) / Approved for entry into archive by Rafael Aguiar (rafael.aguiar@fgv.br) on 2016-01-19T18:56:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertação versao final capítulos 1 2 3 4 (11 trabalho.pdf: 68807282 bytes, checksum: 76035488a396a271e8011939260a263c (MD5) / Approved for entry into archive by Marcia Bacha (marcia.bacha@fgv.br) on 2016-01-21T13:05:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertação versao final capítulos 1 2 3 4 (11 trabalho.pdf: 68807282 bytes, checksum: 76035488a396a271e8011939260a263c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-21T13:05:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertação versao final capítulos 1 2 3 4 (11 trabalho.pdf: 68807282 bytes, checksum: 76035488a396a271e8011939260a263c (MD5) Previous issue date: 2015-09-28 / The world setting which started to take shape in the second half of the XX century as regards our environment, impacting on the state of living beings, led our authorities to figure out strategic actions seeking to ensure life. A new commitment from the part of botanic gardens resulted from this concern so as to develop programs on vegetable diversification conservation and environmental education to promote changes in the way to think over matters related to the environment. The living collections in botanic gardens act both as an instrument and a setting for these subjects to be dealt with in environmental issues by fostering debates and discussions on matters which affect life. In this sense, the medicinal collection is, in face of its features, a facilitator to the constructive work, articulations and connections necessary to awaken the public s interest by means of the acknowledgement of its meanings in daily life. The experience of running the collection, its continuous observation and the development of activities related to it made evidence of the potential of the medicinal collection as the place for experiment which enables the work with an array of target publics: the public in general, community groups, folk knowledge groups as well as the scientific community in the fields of medicine, pharmacology, scientific knowledge in education, environmental education, ethnobotany and biology. A guide which comprises items that facilitate the curators work is, in this way, a means to stimulate the representation of a collection of this kind in botanic gardens thus allowing that such a garden does its duty as an interlocutor between science and society and performs its leading role in a new relationship with natural resources. / O cenário mundial que foi se desenhando na segunda metade do século XX, relacionado às questões do ambiente e cujos reflexos se fizeram sentir no estado das espécies vivas, despertou as autoridades a pensarem em ações estratégicas garantidoras da vida. Dessa preocupação emergiu o compromisso assumido por jardins botânicos, voltado para o desenvolvimento de programas de conservação da diversidade vegetal e educação ambiental, capazes de promover mudanças na forma de pensar as questões relacionadas com o ambiente. As coleções vivas em jardins botânicos se colocam como instrumentos e cenário para trabalhar questões ambientais, promovendo debates e discussões sobre questões que afetam a vida. Neste sentido, a coleção medicinal, por sua constituição, facilita o trabalho construtivo, as articulações e conexões necessárias para despertar interesse do público através do reconhecimento dos seus significados da vida cotidiana. A experiência na condução da coleção, a observação ostensiva e o desenvolvimento de atividades evidenciaram o potencial da coleção medicinal como lugar de experiência, que permite trabalhar com uma diversidade de grupos: o público em geral, grupos comunitários, de saber popular, comunidade científica na área da medicina, da farmácia, da divulgação científica, da educação ambiental, da etnobotânica e da biologia. Assim, um guia contemplando os itens que facilitam o trabalho do curador é uma maneira de estimular a representação dessa tipologia de coleção em jardins botânicos e, por conseguinte, permitir que seu jardim desempenhe o papel de interlocutor entre ciência e sociedade e venha a ser protagonista da mudança para uma nova forma de relação com os recursos naturais.
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Etnobotânica de plantas alimentícias em comunidades indígenas multiétnicas do baixo rio Uaupés - Amazonas /

Gonçalves, Gabriela Granghelli, 1985- January 2017 (has links)
Orientador: Lin Chau Ming / Coorientador: Valdely F. Kinupp / Banca: Fatima Chechetto / Banca: Sandra Maria Pereira da Silva / Banca: Filipe Pereira Giardini Bonfim / Banca: Isabel de Carvalho / Resumo: A região do Baixo Rio Uaupés - Amazonas, habitada por diferentes etnias indígenas, possui rico e pouco explorado conjunto de plantas alimentícias, utilizadas por essas comunidades, através de sistema tradicional de cultivo e complementada com a coleta de espécies da floresta. Nesse contexto, e com o propósito de valorizar o conhecimento tradicional associado a essas plantas, o trabalho teve o objetivo de pesquisar a diversidade de plantas cultivadas e coletadas utilizadas como alimento e os fatores ambientais e sociais que influenciam na diversidade dessas espécies, em comunidades indígenas multiétnicas dessa região. Foram identificadas 163 plantas alimentícias, pertencentes a 51 famílias botânicas e 106 gêneros. As comunidades praticam a horticultura de subsistência em roças e capoeiras, tendo como cultivo predominante a mandioca e em seguida o abacaxi. O cultivo de espécies é complementado nos quintais, principalmente por espécies frutíferas, observando-se o predomínio do açaí-do-pará, cupuaçu, açaí-do-mato e outras espécies em menor número. Outros ambientes para a obtenção de alimento são: igapó, terra firme, caatinga e beira de rio ou igarapé, onde as comunidades realizam o extrativismo. Essas comunidades apresentam um significativo conhecimento sobre as plantas alimentícias cultivadas ou coletadas na floresta, inúmeras formas de consumo e preparo desde técnicas que transformam espécies tóxicas em comestíveis a técnicas de conservação, utilizadas em diversas comidas trad... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The region of LowerUaupés River - Amazon, inhabited by different indigenous ethnic groups, has a rich and little explored set of food plants, used by these communities, through a traditional system of cultivation and complemented by the collection of forest species. In this context, and with the purpose of valuing the traditional knowledge associated with these plants, the objective of this work was to investigate the diversity of cultivated and collected plants used as food and the environmental and social factors that influence the diversity of these species in indigenous multiethnic communities. A total of 163 food plants belonging to 51 botanical families and 106 genera were identified. The communities practice subsistence itinerant horticulture in fields and capoeiras, having as predominant cultivation cassava and then pineapple. The cultivation of species is complemented in the backyards, mainly by fruit species, observing the predominance of açaí-do-para, cupuaçu, açaí-do-mato and other species in lower numbers. Other environments for obtaining food are: igapó, terra firme, caatinga and river border or igarapé, where the communities accomplish the extractivism. These communities present a significant knowledge about the food plants cultivated or collected in the forest, numerous forms of consumption and preparation from techniques that transform toxic species in edible to conservation techniques, used in several traditional foods that are part of the daily life of the ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Diversidade de líquens em leguminosas da Reserva Biológica de Mogi-Guaçu, SP /

Santos, Janaína Maria Gonçalves dos. January 2012 (has links)
Orientador: Marcelo Pinto Marcelli / Banca: Patrícia Jungbluth / Banca: Adriana de Mello Gugliotta / Banca: Marcos Junji Kitaura / Banca: Michel Navarro Benatti / Resumo: Este trabalho teve o objetivo de verificar a distribuição de espécies de fungos liquenizados sobre 573 troncos de onze espécies de leguminosas encontradas em área de cerrado, tanto nativas quanto estranhas ao ecossistema e plantadas num arboreto ao lado de uma área de vegetação natural. O levantamento de dados para estudo fitossociológico foi feito com método do elástico e os cálculos realizados em programa especialmente desenvolvido para esse trabalho. Cálculos de similaridade, diversidade, análises de variância e análise multivariada foram realizadas para descrever as comunidades de liquens e relacioná-las com forófitos e ambiente. O estudo da distribuição dos 4561 liquens (144 espécies) em 122 troncos de Copaifera langsdorffii (copaíba) do cerrado, cerradão e arboreto mostrou comunidades diferentes para os habitats, tipos de cascas e lados dos troncos. As espécies de maior valor de importância variam sua estratégia de ocupação com o ambiente. Embora localizado ao lado da vegetação nativa, a comunidade liquênica do arboreto é menos rica e abundante. O estudo da distribuição das 8840 ocorrências, incluindo 5535 liquens (176 espécies) em 157 troncos de cinco espécies de leguminosas do arboreto mostrou comunidades diferentes nos forófitos e maior agregação de espécies e indivíduos a cerca de um metro de altura. Liquens são mais importantes em todas as árvores, exceto no pau-brasil, onde as briófitas dominam. Umidade do ar, luminosidade, pH e diâmetro do tronco explicam as preferências por habitat. A habilidade de dispersão é o fator de sucesso da grande maioria das espécies. Cassia ferruginea (cássia) é o forófito com mais espécies e indivíduos de liquens enquanto Caesalpinia ferrea (pau-ferro) tem os menores números. Usnea spp. e formas crostosas preferem claramente troncos de cássia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This works deals with the lichen distribution on 573 trunks of eleven Leguminosae species found in a cerrado forest region, both native and strange to the ecosystem and grown in an arboretum nearby. The phytosociological data were obtained by the rubber method and treated by software specially developed for. Similarity, variance and multivariate analysis were used to characterize the communities and related them to phorophyte species and environment. The study of the 4561 lichens (144 species) on 122 trees of Copaifera langsdorffii from cerrado and cerradão vegetation, as well from the arboretum, revealed distinct communities for habitats, bark types and aspect. The species of greater Importance changes its strategy of substrate occupation according the environment. Nevertheless located just beside the natural vegetation, the lichen community of the arboretum has lower values of richness and abundance. The study of the distribution of the 8840 occurrences that included 5535 lichens (176 species) on 157 trunks of five tree Leguminosae in the arboretum showed a greater species and individual aggregation about one meter above the ground. Here, lichens are the most important epiphytes on all tree species except on Caesalpinia ferrea, where bryophytes dominate. Air humidity, luminosity, bark pH and diameter explain the habitat preferences. The skill to efficient dispersion might be the success factor of the great majority of the lichen species. Cassia ferruginea is the phorophyte bearing more lichen species and individuals, while Caesalpinia ferrea exhibit the lower numbers. Usnea spp. as well crustose forms clearly prefer trunks of C. ferruginea, which is indicate here to form ecological corridors across anthropized areas and linking preservation areas. The study of the distribution of the 3157 occurrences of lichenized... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Sistema de reprodução e distribuição da variabilidade genética de Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) em diferentes biomas /

Souza, Danilla Cristina Lemos, 1985. January 2017 (has links)
Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Celso Luiz Marino / Banca: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Leo Zimback / Banca: Bruno Cesar Rossini / Banca: Evandro Vagner Tambarussi / Resumo: Myracrodruon urundeuva (Anacardiaceae) é uma espécie arbórea de ampla distribuição geográfica. Por possuir madeira de reconhecido valor econômico, associada à alta taxa de fragmentação dos seus habitats, encontra-se ameaçada de extinção. Com o intuito de manter a variabilidade genética existente das populações fragmentadas e reduzir perdas na base genética da espécie, sementes de polinização aberta de M. urundeuva foram coletadas em diferentes regiões, no Brasil, para formação do banco de conservação ex situ da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira, em Selvíria-MS. Esse trabalho foi realizado com o objetivo de caracterizar o sistema de reprodução e estimar parâmetros genéticos populacionais em progênies de M. urundeuva, procedentes de diferentes biomas brasileiros, por meio de caracteres quantitativos de crescimento e marcadores moleculares do tipo microssatélites. Os caracteres altura, diâmetro a altura do peito (DAP), diâmetro médio de copa e sobrevivência (SOB) foram utilizados para avaliar cinco populações: Aquidauana-MS, Selvíria-MS, Itarumã-GO, Paulo de Faria-SP e Seridó-RN. Os valores altos a medianos observados para SOB (96,4% - 70,8%) indicam boa adaptação das populações de M. urundeuva e potencial para uso em reflorestamentos. As estimativas do coeficiente de variação genética oscilaram de 3% a 24,6%, em nível de indivíduo, e de 1,5% a 12,3%, entre progênies, com os maiores valores obtidos para o DAP da população de Seridó. As herdabilidades individuais variaram ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myracrodruon urundeuva (Anacardiaceae) is a tree species with a wide geographic distribution. Because it has wood of recognized economic value, associated with the high rate of fragmentation of its habitats, it is threatened with extinction. In order to maintain the existing genetic variability of the fragmented populations and reduce losses in the genetic base of the species, M. urundeuva seeds were collected in different regions in Brazil for the formation of the ex situ conservation bank of the Faculty of Engineering of Ilha Solteira (FEIS/UNESP), in Selvíria-MS. This work was conducted with the aims to characterize the mating system and estimate population genetic parameters in M. urundeuva offsprings from different Brazilian biomes, using quantitative growth traits and molecular markers of the microsatellite type. The height, diameter at breast height (DBH), mean crown diameter and survival were used to evaluate five populations: Aquidauana-MS, Selvíria-MS, Itarumã-GO, Paulo de Faria -SP and Seridó-RN. The values high to median observed for survival (96.4% - 70.8%) indicate good adaptation of populations of M. urundeuva and potential for use in reforestation. Estimates of the coefficient of genetic variation ranged from 3% to 24.6%, at the individual level, and from 1.5% to 12.3%, among progenies, with the highest values obtained for the DBH of the Seridó population. The individual heritabilities ranged from moderate (0.41) to low (0.01) for the characters. Using the gen... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Análise da diversidade genética em erva baleeira (Varronia curassavica Jacq.) baseada no marcador ISSR / Genetic diversity analysis of Varronia curassavica Jacq. accessions by using ISSR markers

Brito, Fabiany de Andrade 26 February 2016 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Varronia curassavica Jacq. is a medicinal and aromatic plant from Brazil, with significant economic importance. Studies on genetic diversity in Active Germplasm Banks (AGB) are essential for conservation and breeding programs. The aim of this study was to analyze the genetic diversity of V. curassavica accessions of the Active Germplasm Bank of Medicinal and Aromatic Plants of the Federal University of Sergipe, using the Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) molecular marker. DNA was extracted from 28 individuals by the CTAB 2% method. Twenty-four primers were tested, and 14 of them were polymorphic and informative, resulting in 149 bands amplified with 97,98% polymorphism. The Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean divided the accessions into Cluster I and II. In the Jaccard similarity matrix, variation ranged between 0,24 and 0,78. The pairs of accessions VCUR- 001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 and VCUR-104/VCUR-501 showed higher diversity (0,24), and the pair of accessions VCUR-402/VCUR-403 showed medium diversity (0,78). Twenty-eight accessions were divided into three distinct clusters, according to the Structure analysis. According to the Principal Component Analysis (PCA), the first principal component accounted for 13,19% of the total variance, and the second principal component accounted 9,38% of the total variance. The genetic diversity of the Active Germplasm Bank of UFS is low to medium, and it requires expansion. VCUR-802 accession is the most suitable for selection in breeding program of this species, since it clearly represents all the diversity present in the germplasm Bank. / A erva baleeira (Varronia curassavica Jacq.) é uma planta medicinal e aromática nativa do Brasil, com importância econômica relevante. Estudos de diversidade genética em Bancos Ativos de Germoplasma são essenciais em programas de conservação e melhoramento genético. O objetivo do presente estudo foi analisar a diversidade genética dos acessos de V. curassavica do Banco Ativo de Germoplasma de Plantas Medicinais e Aromáticas da Universidade Federal de Sergipe através do marcador molecular Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Foi extraído DNA de 28 indivíduos, através do método CTAB 2%. Foram testados 24 primers, onde 14 deles foram polimórficos e informativos, resultando em 149 bandas amplificadas com 97,98% de polimorfismo. O método de agrupamento da Média Aritmética Não Ponderada dividiu os acessos em dois Grupos, I e II. Na matriz de similaridade de Jaccard houve variação de 0,24 a 0,78. Os pares de acessos VCUR- 001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 e VCUR-104/VCUR-501, apresentaram maior diversidade (0,24) e os pares VCUR-402/VCUR-403, apresentaram média diversidade (0,78). Houve a separação dos 28 acessos em três grupos distintos, de acordo com a análise do Structure. Conforme a Análise de Componente Principal (ACP), o componente principal primário representou 13,19% da variância total, e o componente principal secundário representou 9,38% da variância total. A diversidade genética do Banco Ativo de Germoplasma de erva-baleeira da UFS é de baixa a média, sendo necessária sua ampliação. O acesso VCUR-802 é o mais indicado para seleção em programa de melhoramento dessa espécie, por representar claramente toda diversidade presente no BAG.
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Consequências das práticas agrícolas na diversidade vegetal em Parauapebas, Pará

SANTOS, Alessio Moreira dos 11 April 2011 (has links)
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O objetivo deste estudo foi conhecer e avaliar o impacto antrópico das práticas agrícolas na biodiversidade vegetal de uma comunidade de pequenos agricultores familiares e de discutir a possibilidade de conservar algumas espécies resistentes e úteis nos sistemas cultivados. A pesquisa foi desenvolvida no Projeto de Assentamento Palmares II em Parauapebas, sudeste do Pará, Brasil. O levantamento da biodiversidade vegetal foi conduzido em 45 pontos demarcados em 9 propriedades de agricultores familiares. Os dados de estrutura da vegetação e a composição florística foram analisados utilizando-se a Análise de Componentes Principais (ACP). Foi calculado o IVI (índice de valor de importância) para todas as espécies encontradas nos estratos intermediário e superior. No total, considerando os três estratos: inferior, intermediário e superior, foram registradas 707 espécies e respectivas riquezas específicas por atividade agrícola: Floresta explorada (77,8 ± 18,6); Floresta queimada (65,1 ± 23,5); Roça de arroz (24 ± 2); Roça de milho (33,6 ±9); Roça de mandioca (31,5); Pastagem limpa (20,1 ± 8,9); Pastagem invadida (44 ± 12,3); Terra gradeada (21), Capoeira jovem (42,8 ± 10,7) e Capoeira velha (45 ± 5,6). As espécies que apresentaram maior IVI foram: Vernonia brasiliana, Cecropia palmata, Solanum crinitum, Trema micrantha, Solanum rugosum, Oenocarpus distichus, Rollinia exsucca, Vismia baccifera, Alexa grandiflora e Pueraria phaseoloides. ACP da estrutura da vegetação indicou que o tipo de uso do solo foi determinante, ligado a uma oposição entre altos valores de riqueza, densidade e área basal do estrato superior, altos valores de riqueza e área basal do estrato intermediário e baixos valores destas variáveis. Já a ACP da composição florística mostrou que as parcelas de floresta se opõem a outras parcelas de floresta e parcelas de capoeira, indicando diferença na composição florística até mesmo entre as florestas. As roças de milho, mandioca e arroz foram consideradas como áreas que geram mais impacto na biodiversidade. O tamanho reduzido dos lotes do assentamento Palmares II, favorece a utilização intensiva do solo e o desmatamento acelerado. Deve-se incentivar e apoiar práticas agroflorestais no Projeto de Assentamento Palmares II, no sentido de preconizar técnicas agrícolas que preservem os recursos naturais, como a conservação de espécies arbóreas úteis e resistentes em áreas abertas. A espécie Pueraria phaseoloides quando associada aos cultivos agrícolas, deve manter a produção e conservar as áreas cultivadas, funcionando como adubo verde e minimizando a degradação das áreas cultivadas. / Agricultural activities in the project of nesting in the Amazon region are important in food production. The aim of this study was to identify and assess the human impact of agricultural practices on plant biodiversity of a community of small family farmers and to discuss the possibility of retaining some resistant species and useful in the tillage systems. The research was conducted at Project of Nesting Palmares II, city of Parauapebas, southeastern Pará, Brazil. The survey of plant biodiversity was conducted in 45 points on 9 demarcated family farms. Data on vegetation structure and floristic composition were analyzed using the Principal Component Analysis (PCA). Was calculated IIV (Index Importance Value) for all species found in intermediate and upper stratum. In total, considering the three strata: low, intermediate and higher, there were 707 species and their specific riches by agriculture: logged forest (77,8 ± 18,6); burned forest (65,1 ± 23,5); rice field (24 ± 2); corn field (33,6 ± 9); cassava field (31,5); clean cattle pasture (20,1 ± 8,9); invaded cattle pasture (44 ± 12,3) ; grade earth (21), young secondary forests (42,8 ± 10,7) Old secondary forests (45 ± 5,6). The species with the highest IVI were Vernonia brasiliana, Cecropia palmata, Solanum crinitum, Trema micrantha, Solanum rugosum, Oenocarpus distichus, Rollinia exsucca, Vismia baccifera, Alexa grandiflora and Pueraria phaseoloides. PCA vegetation structure indicated that the type of land use was the determining factor, linked to an opposition between high levels of richness, density and basal area of the upper stratum, high values of richness and basal area of the stratum intermediate and low values of these variables. Since the PCA of the floristic composition showed that the forest plots are opposed to other forest plots and plots of poultry, indicating differences in floristic composition even between forests. The corn field, cassava field and rice field were considered as areas that generate the most impact on biodiversity. The small size of the lots of the nesting Palmares II favors the intensive land use and deforestation accelerated. It should promote and support agroforestry practices in Project of Nesting Palmares II, to advocate farming techniques that protect natural resources, such as the conservation of tree species useful and robust in open areas. The species Pueraria phaseoloides when associated with agricultural crops, should maintain production and save the cultivated areas, functioning as green manure and minimizing degradation of cultivated areas.

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