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Caracterização de rizobactérias e eficiência do Rizolyptus® no enraizamento e crescimento de eucalipto / Rhizobacteria characterization and Rizolyptus® efficiency in eucalyptus rooting and growth

Zarpelon, Talyta Galafassi 21 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 773271 bytes, checksum: 5ed57ecb4813981953390fb685f8c806 (MD5) Previous issue date: 2007-03-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Since the late 90s, experiments have shown the beneficial effects of rhizobacteria isolates obtained from the rhizosphere of seedlings of different clones of Eucalyptus grandis, Eucalyptus urophylla and their hybrids, when inoculated to the substratum with a saline suspension. To make its use operationally viable, the most promising isolates were formulated in canadian turf and in stabilizing solution, as well as morphological and molecular characterizations and tests of sensibility to antibiotics. After 24-h incubation, the colonial characteristics elevation and color of allowed the differentiation of isolates of all studied species. Besides the isolates S1, S2 and 3918 of Bacillus subtilis, MF2 and MF4 of Pseudomonas sp. and Ca of Pseudomonas fulva were differentiated by their morphological characteristics and the sensibility to antibiotics. PCR-RFLP analysis allowed the differentiation among isolates CIIb of Stenotrophomonas maltophilia, R1 of Frateuria aurantia and FL2 of Pseudomonas aeruginosa and between the groups of Bacillus isolates S1, S2 and 3918 and Pseudomonas MF2, MF4 and Ca. The efficiency of inoculants in the production of eucalyptus seedlings varied with clones, types of tested formulation and isolate. In general, clones of E. grandis (11) gave better response to rhizobacterization (Alfenas et al., 2004) than E. grandis x E. urophylla (409). The turf formulation provided larger increases for the variables rooting speed, biomass of aerial part and root system. Isolates R1, FL2, S1 and S2 stood out for showing larger rooting increase and isolated S2 for increasing the biomass of the aerial part and root system. Both the turf and the liquid formulations were shown to be efficient in inducing minicutting rooting and seedling growth, being a practical and viable alternative to be adopted in eucalyptus seedling production. / A partir de uma série de experimentos iniciados no final da década de 90, comprovaram-se os efeitos benéficos de isolados de rizobactérias, obtidos da rizosfera de mudas de diferentes clones de Eucalyptus grandis, Eucalyptus urophylla e seus híbridos, quando inoculados na forma de suspensão salina ao substrato. Para que sua utilização se tornasse operacionalmente viável, formularam-se os isolados mais promissores em turfa canadense e em solução estabilizante, e realizou-se sua caracterização morfológica, molecular e a sensibilidade a antibióticos. Após 24 horas de incubação, as características de elevação e coloração das colônias permitiram a diferenciação dos isolados de todas as espécies estudadas. Ademais os isolados S1, S2 e 3918 de Bacillus subtilis, MF2 e MF4 de Pseudomonas sp. e Ca de Pseudomonas fulva foram diferenciados por suas características morfológicas e pela sensibilidade a antibióticos. A análise de PCR-RFLP permitiu a diferenciação entre os isolados CIIb de Stenotrophomonas maltophilia, R1 de Frateuria aurantia e FL2 de Pseudomonas aeruginosa e entre os grupos dos isolados S1, S2 e 3918 de Bacillus e MF2, MF4 e Ca de Pseudomonas. A eficiência dos inoculantes na produção de mudas de eucalipto variou de acordo com o clone, tipo de formulação e isolado testado. Em geral, o clone de E. grandis (11) respondeu melhor à rizobacterização (Alfenas et al., 2004) que o de E. grandis x E. urophylla (409). A formulação turfosa propiciou maiores incrementos para as variáveis velocidade de enraizamento, biomassa da parte aérea e do sistema radicular. Os isolados R1, FL2, S1 e S2 destacaram-se por apresentarem maior incremento de enraizamento e o isolado S2 para o incremento da biomassa da parte aérea e do sistema radicular. Tanto a formulação turfosa quanto a líquida mostraram-se eficientes na indução de enraizamento de miniestacas e no crescimento de mudas, sendo seu uso uma alternativa prática e viável a ser adotada na produção de mudas de eucalipto.
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Taxonomia e epidemiologia comparativa de Botryosphaeriaceae associada à gomose do cajueiro

BRITO NETTO, Mariote dos Santos 29 July 2016 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-24T13:20:38Z No. of bitstreams: 1 Mariote dos Santos Brito Netto.pdf: 3540374 bytes, checksum: ee89d890558eed9701de9441d70f0cc0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-24T13:20:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mariote dos Santos Brito Netto.pdf: 3540374 bytes, checksum: ee89d890558eed9701de9441d70f0cc0 (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / The gummosis out as a major disease reported in all producing regions of cashew in Brazil. In this study we identify, characterize and evaluate the comparative epidemiology of species Botryosphaeriaceae associated with gummosis in Anacardium in Brazil. A total of 138 isolates were sampled and identified using a combination of morphological analysis and phylogenetic based on the partial sequence of the translation elongation factor 1-α sequence (EF-1α), internal transcribed spacers (ITS) and sequence of the β-tubulin. ten species were identified Botryosphaeriaceae: Lasiodiplodia brasiliense, L. euphorbicola, L. gonubiensis, L. iraniensis, L. jatrophicola, L. gravistriata sp. nov., L. pseudotheobromae, L. theobromae, Neofusicoccum batangarum and Pseudofusicoccum stromaticum. Only L. theobromae previously described in cashew tree, while all other species are reported for the first time in association with cashew trees in Brazil and worldwide. Lasiodiplodia theobromae was the prevalent species. All species of pathogenic Botryosphaeriaceae were highlighted in branches of cashew. There were significant differences between species with N. batangarum, L. iraniensis, L. jatrophicola and L. gravistriata being the most aggressive species, while L. euphorbicola, L. pseudotheobromae were less aggressive. All species of Botryosphaeriaceae caused symptoms in alternative hosts tested except P. stromaticum, L. brasiliense and L. iraniensis had the highest injury in avocado, banana, guava, papaya, mango and passion fruit. L. jatrophicola showed lower aggressive in the hosts, as N. batangarum was not pathogenic in passion fruit and only L. gravistriata caused symptoms in melon. Our results suggest that these alternate hosts serve as a potential source of inoculum. Species Botryosphaeriaceae demonstrated reduction in mycelial growth in the presence of Thiophanate-methyl fungicides, difenoconazole and azoxystrobin. The response sensitivity present variation according to the species of the fungicides and Botryosphaeriaceae. / A gomose destaca-se como uma das principais doenças relatadas em todas as regiões produtoras de caju no Brasil. No presente estudo identificamos, caracterizamos e avaliamos a epidemiologia comparativa das espécies de Botryosphaeriaceae associadas a gomose em Anacardium no Brasil. Um total de 138 isolados foram amostrados e identificados usando uma combinação de analise morfológica e filogenética baseados na sequencia parcial do translation elongation factor 1-α sequence (EF-1α), internal transcribed spacers (ITS) e sequencia do β-tubulin. dez espécies de Botryosphaeriaceae foram identificadas: Lasiodiplodia brasiliense, L. euphorbicola, L. gonubiensis, L. iraniensis, L. jatrophicola, L. gravistriata sp. nov., L. pseudotheobromae, L. theobromae, Neofusicoccum batangarum e Pseudofusicoccum stromaticum. Somente L. theobromae foi previamente descrito em cajueiro, enquanto que todas outras espécies são reportadas pela primeira vez em associação com cajueiro no Brasil e no mundo. Lasiodiplodia theobromae foi a espécie prevalente. Todas espécies de Botryosphaeriaceae foram patogênicas em ramos destacados de cajueiro. Houve diferença significativa entre as espécies, com N. batangarum, L. iraniensis, L. jatrophicola e L. gravistriata sendo as espécies mais agressivas, enquanto L. euphorbicola, L. pseudotheobromae foram as menos agressivas. Todas as espécies de Botryosphaeriaceae causaram sintomas nos hospedeiros alternativos testados exceto, P. stromaticum. L. brasiliensee L. iraniensis apresentaram as maiores lesões em abacate, banana, goiaba, mamão, manga e maracujá. L. jatrophicola mostrou os menores valores de agressividade nos hospedeiros, já N. batangarum não foi patogênico em maracujá e somente L. gravistriata causou sintomas em melão. Nosso resultado sugere que esses hospedeiros alternativos servem com uma fonte de inóculo potencial. L. gravistriata apresentou crescimento nas temperaturas de 5°C e 10°C. As espécies de Botryosphaeriaceae demostraram redução no crescimento micelial na presença dos fungicidas Tiofanato-metilico, difenoconazole e azoxistrobin, apresentando diferentes níveis de sensibilidade a cada um dos princípios ativos utilizados.
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Caracterização epidemiológica e manejo da podridão pós-colheita por Aspergillus em uva de mesa

DAMBRÓS, Daniela 27 February 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T13:54:18Z No. of bitstreams: 1 Daniela Dambros.pdf: 1123648 bytes, checksum: 7957dada7599c282694fc633775a8539 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T13:54:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Daniela Dambros.pdf: 1123648 bytes, checksum: 7957dada7599c282694fc633775a8539 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The grapevine is one of the oldest plants cultivated by human and has significant social and economic importance worldwide. The Submedio San Francisco Valley has a key role in the production and export of the grape, however, the culture has a high susceptibility to postharvest fungal infections generating significant losses from cultivation to marketing. Aspergillus niger is a common fungal species in the region today, especially when harvesting occurs during rainy periods. In general, there is darkening and softening of the berries, in the fruit storage period, resulting in depreciation of the commercial value of the grape. There is a strong need to explore alternative measures in the postharvest that are safe and effective to reduce decay and increase shelf life. Thus, the objective of this study was to evaluate the inoculum concentration (102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídia.mL-1), the wetness period (0, 12, 24, 36 e 48 h) and temperature (2, 5, 10, 15, 20 e 25 °C) that are optimal for disease establishment in table grape cv. Italy, evaluate the effect of Ca, K, Cu, Mg and Zn phosphites salts applied at postharvest by dipping the clusters in solutions at different concentrations (0,3; 0,9; 1,25; 1,7 and 2,0 g.L-1) in two inoculation periods of A. niger (12 and 24 h), and in vitro tests, by mycelial growth and conidia germination as well the chemical characteristics of the grape. The highest inoculum concentrations (106 and 107 conídia.mL-1), wetness period 48 h and temperature 25 °C showed the greatest mean lesion size, it means, that these are optimal conditions for the development of Aspergillus rot in Italy table grape. The phosphites inhibit mycelial growth and germination of conidia. Zn phosphite had significantly lower EC50 values to the others, as well as phosphite Ca for micelial growth. The lowest EC50 values are represented by K and Ca phosphite for conidial germination. There was no significant interaction between the salts in the applied concentrations and is not effective in reducing the severity of the disease in table grape. The Ca phosphite showed lower average size values of the lesion when the berries were treated 12 hours before inoculation, and could be relevant in future research. / A videira é uma das mais antigas plantas cultivadas pelo homem e apresenta significativa importância social e econômica no mundo todo. O Submédio do Vale do São Francisco tem papel primordial na produção e exportação da uva. Porém, essa cultura apresenta grande suscetibilidade a infecções fúngicas pós-colheita gerando perdas significativas desde o cultivo até a comercialização. Aspergillus niger é uma espécie fúngica freqüente na região principalmente quando a colheita ocorre em períodos chuvosos e os sintomas geralmente aparecem no período de armazenamento dos frutos. É um patógeno de grande importância, pois causa escurecimento e amolecimento das bagas depreciando o valor comercial da uva e resultando em sérios prejuízos. Há uma forte necessidade de explorar medidas alternativas na pós-colheita que sejam seguras e eficazes para reduzir os danos e aumentar o tempo de conservação de frutas e hortaliças em geral. Desta forma, o objetivo do trabalho foi avaliar, para dois isolados de A.niger, a concentração de inóculo (102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídios.mL-1), o período de molhamento (0, 12, 24, 36 e 48 h) e a temperatura (2, 5, 10, 15, 20 e 25 °C) ideais para o estabelecimento da doença em uva de mesa cv. Itália, verificar o efeito de sais de fosfitos de Ca, K, Cu, Mg e Zn aplicados na pós colheita através da imersão dos cachos nas soluções em diferentes concentrações (0,3; 0,9; 1,25; 1,7 e 2,0 g.L-1) em dois tempos de inoculação do A. niger (12 e 24 h), bem como, avaliar o efeito desses sais in vitro através da mensuração do crescimento micelial e da germinação de conídios, sendo também avaliados os atributos químicos da uva. Em relação aos aspectos epidemiológicos verificou-se que as maiores concentrações de inóculo (106 e 107 conídios.mL-1), período de molhamento de 48 h e temperatura de 25 °C apresentaram as maiores médias de tamanho da lesão, ou seja, são as condições ótimas para o desenvolvimento da podridão em uva de mesa cv. Itália. As aplicações dos fosfitos inibiram o crescimento micelial e a germinação dos conídios. O fosfito de Zn apresentou valor de CE50 significativamente menor aos demais, assim como o fosfito de Ca para o crescimento micelial. Os menores valores de CE50 foram representados pelos fosfitos de K e Ca para a germinação de conídios. Em relação a aplicação dos fosfitos como manejo alternativo na pós-colheita, não houve interação significativa entre os sais com as concentrações aplicadas e não foram eficientes em reduzir a severidade da doença. O fosfito de Ca apresentou menores valores de tamanho médio da lesão quando tratados 12 h antes da inoculação podendo ser relevante em pesquisas futuras.
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Diversidade de espécies de Colletotrichum causadoras de antracnose em chuchuzeiro

COSTA, Christiane Almeida da 25 February 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T14:20:37Z No. of bitstreams: 1 Christiane Almeida da Costa.pdf: 1520147 bytes, checksum: 6d69c020c39cd94f4b4d123eff29fb58 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T14:20:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Christiane Almeida da Costa.pdf: 1520147 bytes, checksum: 6d69c020c39cd94f4b4d123eff29fb58 (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose caused by Colletotrichum species is the most important disease of chayote in Brazil. In this study, Colletotrichum species associated with anthracnose on fruits and leaves of chayote, from various producing regions in Brazil, were collected and characterized by molecular, morphology and cultural methods. Neighbor-Joining analysis based on sequences of the β-tubulin genomic region (TUB2) of 75 Colletotrichum isolates were analyzed as a first measure of genetic diversity. A subset of 32 isolates were sequenced using the partial sequences of actin (ACT), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), calmodulin (CAL) genes and rDNA ITS (ITS) region. Maximum Likelihood (ML) was performed using the concatenated sequences. The multilocus sequence analysis, associated with phenotypic characteristics revealed four previously described species (Colletotrichum brevisporum, C. cliviae, C. fructicola and C. karstii) and two unidentified species, in eight morphotypes. All isolates selected to represent each haplotype, in pathogenicity test were able to induce typical symptoms of anthracnose in chayote but varied in their virulence . All these species are reported for the first time associated with chayote Brazil and worldwide. C. orbiculare is not the causal agent of anthracnose chayote in Brazil. / A antracnose causada por espécies de Colletotrichum é uma das doenças mais importantes da cultura do chuchu no Brasil. Neste estudo, espécies de Colletotrichum associadas à antracnose em frutos e folhas de chuchuzeiro, de algumas regiões produtoras no Brasil, foram coletados e caracterizados a partir de métodos moleculares, morfologia e características culturais. Análise de Neighbor-Joining baseadas em sequências da região genômica da β-tubulina (TUB2), de 75 isolados de Colletotrichum, foram analisadas como uma primeira medida de diversidade genética. Um subgrupo de 32 isolados foram sequenciados usando os genes parcial actina (ACT), gliceraldeído-3-fosfato-desidrogenase (GAPDH), parcial actina (ACT) calmodulina (CAL) e genes rDNA- região ITS (ITS). Máxima verossimilhança (ML) foi realizada utilizando as sequências concatenadas. A análise multilocus das sequências, juntamente com um exame dos caracteres fenotípicos, revelou quatro espécies descritas anteriormente (Colletotrichum brevisporum, C. cliviae, C. fructicola e C. karstii) e duas espécies desconhecidas em oito morfotipos. Todos os isolados selecionados para representar cada haplótipo, no teste de patogenicidade foram capazes de induzir sintomas típicos de antracnose em chuchuzeiro, entretanto com variação em sua virulência. Todas estas espécies são relatadas pela primeira vez em associação ao chuchuzeiro e no Brasil e no mundo. C. orbiculare não é o agente causal da antracnose em chuchuzeiro no Brasil.
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Viroma de plantas de amendoim (Arachis hypogaea) provenientes do Estado de São Paulo

REIS, Luciane de Nazaré Almeida dos 29 February 2016 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T13:54:02Z No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T13:54:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / The peanut (Arachis hypogaea L.) is an important source of protein and oil, and considered one of the most cultivated plants in Brazil and worldwide, that provide products consumed in different ways. It is the fourth world largest oleaginous in seed production, cultivated in over 30 countries, where China leads with 40.8%, followed by India with 14% and Nigeria with 7.5%. Brazil occupies the 17th position, concentrated in the Southeast and South regions, and the State of São Paulo accounts for 91.4% of national production. Among the factors that limit the development of this crop, there are several viruses, which cause reduction on productivity and the value of the product for marketing. Up to now, 31 viral species, classified in the following genera and respective families have been recorded naturally infecting peanut: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Of these genera, Potyvirus has more species. The advent of metagenomics, combined with high-performance technologies (Next Generation Sequencing - NGS) provides the exploration of micro-universe in various areas of science, including the Plant Virology. These techniques, together with bioinformatics, act as excellent tools for detection and characterization of novel viruses, as well as, all the viral genomes of different species or strains present in certain samples. The objective of this work was to study the virome of peanut plants exhibiting typical virus symptoms, obtained from producing areas of 10 counties of the State of São Paulo by NGS. The viral isolates were maintained by successive passages to peanut plants by grafting, under greenhouse conditions at the University of Brasilia (UnB). To perform the NGN, samples were semipurified aiming enrichment of virus particles, followed by total RNA extraction and sequencing carried out by Illumina platform. The metagenomic analysis permitted the detection the complete genome of Peanut mottle virus virus - PeMoV (Potyvirus) and Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Biological (indicator plants), serological (Dot-ELISA) and molecular (RT-PCR) tests were performed in order to characterize some GRSV isolates from peanut, which sequences were identified by metagenomic. Molecular analysis of the gene encoding the N protein, used for species taxonomy within Tospovirus genus, was also carried out with the selected isolates A1, N1 and O1. These three isolates induced symptomatic response in at least one of the indicator species (Datura stramonium L.) used in this work and widely cited in the literature. Positive results for these isolates were also confirmed by serology, indicating the presence of GRSV in peanut producing counties in the State of São Paulo. Phylogenetic analyzes of the segments L, M and S of tospoviruses revealed that the peanut GRSV isolates studied in this work grouped with sequences of GRSV isolate from watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) and a recombinant isolate of GRSV and Tomato chlorotic spot virus - TCSV obtained from tomato (Solanum lycopersicum L.). However, the phylogenetic analysis using the N protein sequence, demonstrated that the present peanut isolate grouped with sequences of GRSV isolates previously studied in Brazil. After phylogenetic analysis for proteins of all GRSV segments, it is believed that the species GRSV and TCSV share the same M segment. The comparison of PeMoV coat protein sequences revealed that the Brazilian peanut isolate reported in this work is more phylogenetically related with the isolate from South Korea, obtained from soybean (Glycine max L.) with 98% identity. This is the first report in Brazil and in the world of the complete genome sequences of PeMoV and GRSV in peanuts, by using NGS. / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma importante fonte de proteína e óleo, sendo considerada uma das plantas mais cultivadas no Brasil e no mundo, com grande diversidade de formas de consumo de seus produtos. É a quarta oleaginosa com maior produção mundial, cultivada em mais de 30 países, em que a China lidera com 40,8%, seguida pela Índia com 14% e Nigéria com 7,5%. O Brasil ocupa a 17ª posição, concentrada nas regiões Sudeste e Sul, sendo o Estado de São Paulo responsável por 91,4% da produção nacional. Dentre os fatores que limitam o desenvolvimento dessa cultura, encontram-se diversos vírus, os quais ocasionam a redução da produtividade e valor do produto para comercialização. Até o momento, já foram registradas, infectando naturalmente o amendoim, 31 espécies virais, classificadas nos seguintes gêneros e respectivas famílias: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Destes, o gênero Potyvirus é o que agrega maior número de espécies. O advento da metagenômica, aliada às tecnologias de alto desempenho (Next Generation Sequencing - NGS) vêm propiciando a exploração do universo de microrganismos em várias áreas das ciências, inclusive na Virologia Vegetal. Estas técnicas, juntamente com a bioinformática, atuam como excelentes ferramentas para detecção e caracterização de novos vírus e de todos os genomas virais presentes em determinadas amostras, sejam de diferentes espécies ou estirpes. O objetivo desse trabalho foi realizar estudo de viroma de plantas de amendoim exibindo sintomas típicos de viroses, obtidas de áreas produtoras de 10 municípios do Estado de São Paulo por NGS. Os isolados virais foram mantidos por sucessivas passagens para plantas de amendoim por meio de enxertia, em casa de vegetação da Universidade de Brasília (UnB). Para a realização do NGS, as amostras foram semipurificadas objetivando um enriquecimento de partículas virais seguido de extração de RNA total e o sequenciamento, realizado pela Plataforma Illumina Miseq. A análise metagenômica permitiu a detecção do genoma completo do Peanut mottle virus - PeMoV (Potyvirus) e do Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Análises biológicas (plantas indicadoras), sorológicas (Dot-ELISA) e moleculares (RT-PCR) foram realizadas com intuito de caracterizar alguns isolados de GRSV de amendoim cuja sequência foi identificada por metagenômica. Análises moleculares do gene que codifica a proteína N, amplamente utilizado em trabalhos de taxonomia no gênero Tospovirus, foram também realizadas com os isolados selecionados A1, N1 e O1. Estes três isolados induziram reação sintomatológica em pelo menos uma das espécies indicadoras (Datura stramonium L.) utilizadas nesse trabalho e amplamente citada na literatura. Resultados positivos para estes isolados foram também confirmados por sorologia, evidenciando a presença de GRSV em municípios produtores de amendoim no Estado de São Paulo. Análises filogenéticas para os segmentos L, M e S de tospovírus revelaram que o isolado de GRSV de amendoim estudado neste trabalho agrupou-se com sequências de um isolado de GRSV de melancia (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) e um isolado recombinante de GRSV e Tomato chlorotic spot virus - TCSV, obtido de tomate (Solanum lycopersicum L.). Entretanto, com a análise filogenética feita com a sequência da proteína N, ficou demonstrado que o presente isolado de amendoim se agrupou com sequências de isolados de GRSV previamente estudado no Brasil. Após análises filogenéticas para as proteínas de todos os segmentos de GRSV, acredita-se que as espécies de GRSV e TCSV compartilham o mesmo segmento M. Comparação das sequências da capa proteica de PeMoV, revelaram que o isolado brasileiro de amendoim relatado neste trabalho está mais relacionado filogeneticamente com um isolado obtido de soja (Glycine max L.), encontrado na Coréia do Sul, apresentando 98% de identidade. Este é o primeiro relato no Brasil e no Mundo das sequências do genoma completo de PeMoV e GRSV em amendoim, por meio do uso de NGS.
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Análise filogenética e patogênica do agente causal da fusariose do abacaxizeiro no Brasil

TSUJI, Susan Satie 29 February 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T15:24:11Z No. of bitstreams: 1 Susan Satie Tsuji.pdf: 801633 bytes, checksum: f830ce7fba5b8d7999b6897bb595841a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T15:24:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Susan Satie Tsuji.pdf: 801633 bytes, checksum: f830ce7fba5b8d7999b6897bb595841a (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fusarium guttiforme (sin. Fusarium subglutinans f. sp. ananas) is the causal agent of fusariosis on pineapple (Ananas comosus). This disease, considered the most important to this crop, has the exudation of gum as the most common symptom. Most of the published studies focus on the evaluation of the resistance of pineapple varieties against F. guttiforme. The estimative of genetic diversity in Fusarium populations is fundamental to understand the population structure, the movement of pathogen genetic material between producing regions, as well as understanding the processes that lead to resistance against pesticides and overcoming genetics resistance of pineapple cultivars. This fungus, which can be found in most regions of the country, does not have a known teleomorph and belongs to the Gibberella fujikuroi species complex, a group with heterogeneous characteristics. This study aimed: a) to obtain a collection of Fusarium isolates associated with pineapple fusariosis in the country; b) to reconstruct the phylogeny of Fusarium isolates that causes fusariosis on pineapple from Northeast and Southeast regions; c) to test the pathogenicity of isolates. DNA sequences of translation elongation fator 1-α (tef1) and calmodulin (cmd) were analyzed, and the history of the alleles was inferred by phylogenetic methods. Tef1 gene sequences were used to estimate the number of haplotypes from isolates collected in different regions. It was observed that the F. guttiforme is the causal agent of fusariosis on pineapple in Brazil, and the tef1 gene allowed a better infraspecific group distinction than cmd gene. / A fusariose do abacaxizeiro (Ananas comosus) tem como agente etiológico o fungo Fusarium guttiforme (sin. Fusarium subglutinans f. sp. ananas). Esta doença, considerada a mais importante da cultura, tem como sintoma a exsudação de goma, sendo conhecida também como gomose ou resinose fúngica. A maior parte dos estudos publicados avaliou a resistência de variedades de abacaxizeiro a F. guttiforme. A estimativa da diversidade genética em populações de Fusarium é fundamental para o entendimento da estrutura populacional, do movimento de material genético do patógeno entre regiões produtoras através da disseminação do mesmo, bem como do entendimento dos processos que levam a resistência a defensivos e superação da resistência genética de cultivares de abacaxi. Esse fungo, que se encontra disseminado por todas as regiões produtoras do país, ainda não possui o teleomorfo conhecido e pertence ao complexo Gibberella fujikuroi, um grupo com características heterogêneas. O presente trabalho teve como objetivos: a) obter uma coleção de isolados de Fusarium associados à fusariose do abacaxizeiro no país; b) avaliar a filogenia de isolados de Fusarium das regiões Nordeste e Sudeste; c) testar a patogenicidade dos isolados obtidos. Foram analisadas sequências parciais de DNA dos genes fator de elongação 1-α (tef1) e calmodulina (cmd), inferindo-se a história dos alelos através de métodos filogenéticos. Sequências parciais do gene tef1 foram utilizadas para estimar o número de haplótipos dos isolados coletados em diferentes regiões produtoras. Observou-se que a espécie F. guttiforme é o agente causal da gomose do abacaxizeiro no Brasil e que o gene tef1 possibilitou uma melhor distinção de grupos infraespecíficos que o gene cmd.
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Controle alternativo da ramulose do algodoeiro via utilização de óleos fixos e essenciais

LIMA, Waléria Guerreiro 27 February 2007 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T16:00:00Z No. of bitstreams: 1 Waleria Guerreiro Lima.pdf: 1037853 bytes, checksum: 76b8dc4974744a728c0fae8cae99709c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T16:00:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Waleria Guerreiro Lima.pdf: 1037853 bytes, checksum: 76b8dc4974744a728c0fae8cae99709c (MD5) Previous issue date: 2007-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Colletotrichum gossypii South. var. cephalosporioides Costa is the causal agent of one of the most important cotton diseases, the ramulosis. The disease is characterized by necrotic lesions on leaves and petioles mainly on young leaves. As the disease progresses, shortening of the internódios, apical death and overbudding are also observed. The main way of fungal dissemination is through the seeds, but also able to be externally propagated, in the form of conidia, or internally, by dormant mycelia. The pathogen control has been achieved through the use of healthy seeds, use of resistant cultivars and chemical control. However, some of these control practices not only of limited efficiency, but also cause unwanted side in natural environments. The use of the biological activity of secondary compounds obtained from plant crude extracts and their essential oils can be an effective way to control plant diseases. Preliminary tests toevaluate the fungistatic and fungicidal effect of these products are essential for revealing new alternatives of control. The effect of different oil dosages (0, 500, 1000, 1500, 2000 and 2500 ppm) prepared from leaves of Hibiscus cannabinus, Cymbopogus nardus, Eucalptus citriodora, Pipper marginatum, Malpighia glabra, and Lippia gracillis were evaluated in the inhibition of C. gossypii var. cephalosporioides mycelia growth, conidia germination, and apressorium formation. The oils of Pipper marginatum, Lippia gracillis and Cymbopogus nardus presented the greatest mycelia growth inhibition effects. The oils of citronela, lípia, and eucalipto showed significant control when conidial germination and apressorium formation were analyzed. When the mycelia growth inhibition was evaluated, piper oil presented lower DL50, followed by the lípia oil. The best results in the inhibition of apressorium formation were presented bycitronela and eucalipto with lower DL50 in relation to other oils. The kenaf oil did notpresent any effect on the micelial growth, conidial germination and apressorium formation. In a second experiment it was evaluated the curative and preventive effect of citronela oil on the control of the cotton ramulosis based on epidemiological components. The Area Below the Curve of Disease Progress and Rate of Disease Progress, showed significant differences when compared with the control treatment. However, the parameter Index of Disease Final in the curative treatment did not differ significantly from control treatment. When the variables Area Below the Curve of Disease Progress, Index of Disease Final, and Rate of Disease Progress were analyzed, it was observed that the preventive treatments that used citronela oil and fungicide differed significantly from the control, showing that citronela oil had an excellent preventive effect on the cotton ramulosis under greenhouse conditions. / Colletotrichum gossypii South. var. cephalosporioides Costa é o agente causal de uma das mais importantes doenças do algodoeiro. Caracteriza-se pelo surgimento de manchas necróticas nas folhas e pecíolos, com predominância nas folhas mais jovens. Ao longo do tempo, também são observados encurtamento dos internódios, morte do broto apical e superbrotamento. A principal via de disseminação do fungo é a semente, podendo ser veiculado externamente, na forma de conídios, ou internamente, na forma de micélio dormente. O controle do patógeno tem sido feito através do uso de sementes sadias, cultivares resistentes e controle químico. Entretanto, em função da ineficácia desses métodos de controle e dos malefícios provocados pelo uso dos pesticidas na natureza, a exploração da atividade biológica de compostos secundários, presentes no extrato bruto ou óleos essenciais de plantas, pode constituir uma forma efetiva de controle de doenças em plantas cultivadas. Testes preliminares para avaliar o efeitofungistático e fungicida desses produtos são imprescindíveis para descobertas de novas alternativas de controle. Foram avaliados os efeitos de diferentes dosagens (0, 500, 1000, 1500, 2000 e 2500 ppm) dos óleos essenciais extraídos de folhas de kenaf (Hibiscus cannabinus), citronela (Cymbopogus nardus), eucalipto (Eucalptus citriodora), Pipper marginatum, acerola (Malpighia glabra), e lípia (Lippia gracillis) na inibição do crescimento micelial, germinação dos conídios e formação do apressório de C. gossypii var. cephalosporioides. Os óleos de piper, lípia e citronela foram os que apresentaram maior efeito na inibição do crescimento do fungo que o de acerola. Os óleos de eucalipto e acerola tiveram comportamento intermediário e semelhantes de inibição de crescimento, apesar do óleo de eucalipto ter apresentado um melhor controle do fungo. Em relação à germinação dos conídios e formação de apressórios, os óleos de citronela, lípia e eucalipto ocasionaram um significativo controle do fungo. Verificou-seque, para a inibição do crescimento micelial, o óleo de piper foi o que apresentou a menor DL50, seguido pelo óleo de lípia. Para a formação de apressórios, verificou-se que os valores das DL50 dos óleos de citronela, eucalipto foram os menores em relação aos outros óleos. O óleo de kenaf não apresentou nenhum efeito no crescimento micelial, germinação dos conídios e formação de apressórios. Em um segundo experimento, objetivou-se avaliar o efeito curativo e preventivo do óleo de citronela para controle da ramulose do algodoeiro com base em componentes epidemiológicos, contribuindo assim para redução dos níveis de poluição ambiental decorrentes do uso de agrotóxicos. No que diz respeito à Área Abaixo da Curva de Progresso das Doença (AACPD) e Taxa de Progresso da Doença (TPD), houve diferença significativa quando comparada ao tratamento testemunha. Entretanto, ao avaliar os parâmetros índice de Doença Final (IDF) sob o efeito do tratamento curativo, observa-se que o mesmo não diferiu significativamente da testemunha. Ao analisar as variáveis AACPD, IDF, PI e TPD, observou-se que os tratamentos preventivo do óleo de citronela e fungicida diferiram significativamente da testemunha, verificando assim, que o óleo de citronela apresentou um ótimo efeito preventivo da ramulose do algodoeiro sob condições de casa de vegetação.
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Epidemiologia da podridão negra do abacaxi e efeito de extratos vegetais no manejo da doença

ALVES, Maria Zilderiana 06 March 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T12:47:24Z No. of bitstreams: 1 Maria Zilderlania Alves.pdf: 802465 bytes, checksum: 50bccde0568d4d4f957001a618583593 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T12:47:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Zilderlania Alves.pdf: 802465 bytes, checksum: 50bccde0568d4d4f957001a618583593 (MD5) Previous issue date: 2009-03-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The black rot of pineapple fruit (Chalara paradoxa), is considered the main postharvest disease in the world. In this work we analyzed the influence of the inoculation method (disc and suspension), temperature (10, 15, 20, 25, 30 and 35 ºC), period of exposure to humidity (0, 6, 12, 24, 36 hours), and of the inoculums concentration (10, 102, 103, 104, 105, 106 and 107 conidia/mL) of three isolates of C. paradoxa (CFM-1183, CFM-1188 and CFM-1029) on the severity of the disease. It was also evaluated the effect of plant extracts in terms of physical and chemical changes. Three treatments were applied (plant extracts, Ecolife® and a fungicide) in concentrations of 25% (D1), 50% (D2), 75% (D3) and 100% (D4) for the plant extracts and 50, 100, 150, 200, 300 μL.mL-1 for the Ecolife® (citric extract) and a fungicide. Healthy pineapples were disinfected and immersed in a solution of the different treatments for five minutes. After 24 hours, inoculation with wounding on pineapple fruit with suspension of C. paradoxa in the concentration of 106 conidia/mL. After inoculation, fruits were kept in a moist chamber for 24 h. The severity was evaluated 5 days after inoculation. The diameter of the lesion in two diametrically opposite directions was measured. For the physiochemical factors of the treated fruits, it was evaluated tenors of vitamin C (mg of ascorbic acid.100 mg-1), titratable acidity(ATT), total soluble sugars (SST) and pH. Before the results obtained all isolates were found to be pathogenic. No significant differences in the method of inoculation and area of inoculation of the pineapple (stalk and equatorial), inoculated with wounds were observed. There was a significant influence of the inoculums concentration of C. paradoxa in the severity of the disease, being larger in the concentrations 106 and 107 conidia /mL. The establishment of the disease, may occur under 25 °C and 24 h of humidity period. All tested extracts showed fungitoxic properties. The treatments caused no significant changes in levels of TSS and TTA. There was a significant reduction in levels of vitamin C and pH compared to the control but remained within an acceptable for commercialization. / A podridão negra do fruto do abacaxizeiro é considerada a principal doença pós-colheita do abacaxizeiro no mundo, respondendo por perdas elevadas em frutas destinadas ao consumo in natura e a industria. Neste trabalho foi analisada a influência do método de inoculação (disco de micélios e suspensão de conídios), da temperatura (10, 15, 20, 25, 30 e 35 o C), do período de molhamento (0, 6, 12, 24, 36 horas em câmara úmida) e da concentração de inóculo (10, 102, 103, 104, 105, 106 e 107 conídios/mL) de três isolados de C. paradoxa (CMM-1183, CMM-1188 e CMM-1029) sobre a severidade da doença, assim como ensaios para avaliar o efeito de extratos vegetais no controle da doença e as alterações físico-químicas das frutas. Os extratos de alho, cebola, melão-de-São-Caetano, alecrim, gengibre e da polpa e casca do abacaxi foram aplicados nas concentrações de 25%, 50%, 75%, e 100% para os extratos vegetais e 50; 100; 150; 200; 300 μL.mL-1 para o Ecolife® (extrato cítrico) e para o prochloraz. As frutas foram desinfestadas e submetidas à imersão em solução dos tratamentos por um período de cinco minutos. Após 24 horas foi realizada inoculação com ferimento sobre o abacaxi com suspensão de C. paradoxa na concentração de 106 conídios/mL. A testemunha constou de frutas imersas em água destilada. Após a inoculação, as frutas foram mantidas em câmara úmida por 24 h. A severidade foiavaliada cinco dias após a inoculação. O diâmetro da lesão foi medido em dois sentidos opostos. Para os fatores físico-químicos da fruta tratada foram avaliados teores de ácido ascórbico (vitamina C), acidez total titulável (ATT), sólidos solúveis totais (SST) e pH. Diante dos resultados obtidos verificou-se que todos os isolados de C. paradoxa testados mostraram-se patogênicos ao abacaxi cv. Perola. Os isolados de C. paradoxa não apresentaram diferença significativa quanto aos métodos de inoculações (disco e suspensão) e às regiões de inoculação no abacaxi (peduncular e equatorial). Houve uma influência significativa quanto à concentração do inóculo de C. paradoxa na severidade da doença, sendo maior nas concentrações 106 e 107 con./mL. Quanto às condições ótimas para o estabelecimento da doença, estas se situam em 25 °C e 24 h de período de molhamento. Todos os extratos testados demonstraram propriedades antifúngicas. Os tratamentos com extratos vegetais não causaram alteração nos teores de SST e ATT. Ocorreu uma redução significativa nos teores de vitamina C e pH quando comparados com as testemunhas, permanecendo, no entanto dentro da faixa aceitável para a comercialização.
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Identificação e caracterização de espécies de Botryosphaeriaceae na cultura da mangueira no nordeste do Brasil

MARQUES , Marília Wortmann 22 February 2013 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T13:59:01Z No. of bitstreams: 1 Marilia Wortmann Marques.pdf: 1506911 bytes, checksum: 4d0a22b2b791255d8d7c2170ea10a2e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T13:59:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marilia Wortmann Marques.pdf: 1506911 bytes, checksum: 4d0a22b2b791255d8d7c2170ea10a2e9 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Dieback and stem-end rot are diseases caused by species of Botryosphaeriaceae have been associated with serious yield losses to mango culture in northeastern Brazil and worldwide. Considering the increasing importance of these diseases and recent discovery of several species of Botryosphaeriaceae, the objective of this study was (i) to identify species of Botryosphaeriaceae associated with dieback and stem-end rot of mango in the semi-arid region of northeastern Brazil and (ii) compare the species in relation to mycelial growth, pathogenicity and virulence. A total of 235 isolates of Botryosphaeriaceae were identified using morphological and DNA sequence data (ITS and EF1-α). The following species were found: Botryosphaeria dothidea, B. mamane, Lasiodiplodia crassispora, L. egyptiacae, L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, Lasiodiplodia sp., L. theobromae, Fusicoccum fabicercianum, Neofusicoccum parvum, Neofusicoccum sp., Neoscytalidium dimidiatum e Pseudofusicoccum stromaticum. Only B. dothidea, L. theobromae, N. parvum and P. stromaticum had been previously reported, while the other species represent the first report associated with the mango diseases in this country. L. theobromae, B. dothidea and P. stromaticum were the most frequently isolated species. There were significant differences in mycelial growth rates among the Botryosphaeriaceae species and also in the optimum temperature for growth. The optimum temperature and mycelial growth rates for species Lasiodiplodia vary from 28.2 to 31.1 ºC and from 36.4 a 49.1 mm/day, respectively. While in the other species, the variation was from 25.4 to 30.8 ºC and 19.7 to 41.2 mm/day. All species were pathogenic in mango fruit. There were significant differences in virulence among the species. L. hormozganensis and Lasiodiplodia sp. were the most virulent. For the other species within the Botryosphaeriaceae family, N. dimidiatum and N. parvum were the most virulent species, B. mamane, L. crassispora e L. viticola are reported for the first time associated with mango diseases worldwide. / A morte descendente e a podridão peduncular são doenças causadas por espécies de Botryosphaeriaceae e vêm causando sérios prejuízos à cultura da mangueira no Nordeste do Brasil e do mundo. Tendo em vista a importância crescente dessas doenças e as descobertas recentes de novas espécies de Botryosphaeriaceae, o presente trabalho teve como objetivos: (i) identificar espécies de Botryosphaeriaceae associadas à morte descendente e podridão peduncular na cultura da mangueira no Nordeste do Brasil e (ii) comparar as espécies em relação ao crescimento micelial, patogenicidade e virulência. Um total de 235 isolados de Botryosphaeriaceae foram identificados a partir de características morfológicas e dados de sequências de DNA (ITS, BT e EF1-α), sendo encontradas as seguintes espécies: Botryosphaeria dothidea, B. mamane, Lasiodiplodia crassispora, L. egyptiacae, L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, Lasiodiplodia sp., L. theobromae, Fusicoccum fabicercianum, Neofusicoccum parvum, Neofusicoccum sp., Neoscytalidium dimidiatum e Pseudofusicoccum stromaticum. Somente L. theobromae, N. parvum, B. dothidea e P. stromaticum tinham sido relatadas em mangueira no Brasil, enquanto as outras espécies representam o primeiro relato associadas à esta cultura no país. L. theobromae, B. dothidea e P. stromaticum foram as espécies prevalentes. Houve diferenças significativas na taxa de crescimento micelial entre as espécies de Botryosphaeriaceae e também em relação à temperatura ótima para o crescimento. A temperatura ótima e a taxa de crescimento micelial para as espécies de Lasiodiplodia variaram de 28,2 a 31,1 ºC e de 36,4 a 49,1 mm/dia, respectivamente. Nas demais espécies, a variação foi de 25,4 a 30,8 ºC e de 19,7 a 41,2 mm/dia. Todas as espécies foram patogências em manga. Houve diferenças significativas na virulência entre as espécies. Em relação às espécies de Lasiodiplodia, L. hormozganensis e Lasiodiplodia sp. foram as mais virulentas. Nas demais espécies dentro da família Botryosphaeriaceae, N. dimidiatum e N. parvum foram as espécies mais virulentas. B. mamane e L. crassispora representam o primeiro relato dessas espécies na cultura da mangueira no mundo.
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Diversidade e estrutura genética de Begomovírus que infectam plantas daninhas no Nordeste brasileiro

SILVA, Sarah Jaqueline Cavalcanti da 25 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T15:03:54Z No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T15:03:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The incidence and severity of diseases caused by begomoviruses has increase rapidly in many areas of the world, including Brazil, where they are limiting factors to tomato and common bean production. Begomoviruses are also associated with a wide range of weed plants which in some cases act as inoculum sources for cultivated plants. It is believed that begomoviruses infecting weed hosts can be horizontally transferred to crop plants and that in the new host they will rapidly evolve by recombination and pseudorecombination, giving rise to novel species. Acting as reservoirs these plants can play a relevant role in viral epidemics in several crops species. The study of plant virus epidemics is greatly facilitated when a population genetics approach is employed. The first step to study viral population is to define their genetic structure, which refers to their degree of variability. Knowledge of the dynamics of genetic variability is essential to understand the potential of the population to evolve, which directly affects the durability of disease management strategies based on the deployment of resistance genes. Studies to understand the genetic structure and dynamics of begomovirus populations in wild reservoirs and the possible effects on epidemics in crop species are scarce. Thus, the aim of this study was to determine the species diversity and population genetic structure of begomoviruses infecting weeds in Northeastern Brazil, as a step towards assessing their role as begomovirus reservoirs. Weed samples belonging to the family Fabaceae and Capparaceae displaying typical symptoms of begomovirus infection were collected in Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) and Sergipe (SE) states from May/2005 to July/2010. A total of 59 leguminous weeds including 42 samples of Macroptilium spp. and 23 samples of Cleome affinis (fam. Caparaceae) were collected. Total DNA was extracted from the samples and full-length begomovirus genomes were amplified and cloned by rolling circle amplification. Clones were completely sequenced and the sequences were used for comparisons with previously described begomoviruses, for phylogenetic analysis and for the determination of the genetic structure of viral populations. Sequence comparisons indicated the presence of six begomoviruses in leguminous weeds (five in Macroptilium spp.), four of them representing novel species. Sequence features indicate that all four novel species are typical New World, bipartite begomoviruses which clustered with Brazilian begomoviruses in the phylogenetic tree. In contrast, only one begomovirus was found infecting C. affinis, suggesting low species diversity in this host phylogenetic reticulate analysis was used to detected possible recombination events in begomovirus populations in leguminous weeds and C. affinis. Putative recombination events were confirmed by RDP3 package analysis. We detected recombination events in Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) and Cleome leaf crumple virus (ClLCrV) populations. Analysis of the genetic structure of these virus populations indicates a high degree of genetic variability in both cases. Mutation and recombination are important processes involved in the high genetic variability found in MaYSV and ClLCrV populations. Together, these results suggest that Macroptilium spp. and Cleome affinis can be important begomovirus reservoirs. / A incidência e severidade de doenças causadas por begomovírus (família Geminiviridae) têm aumentado rapidamente em muitas áreas do mundo, incluindo o Brasil, onde são fatores limitantes à produção de feijão e tomateiro. Begomovírus são também associados a uma ampla gama de plantas daninhas e silvestres, as quais em alguns casos podem atuar como fonte de inóculo para plantas cultivadas. Acredita-se que begomovírus que infectam plantas daninhas podem ser transferidos horizontalmente para plantas cultivadas, e que no novo hospedeiro eles podem evoluir rapidamente por meio de recombinação e pseudo recombinação, dando origem a novas espécies. Atuando como reservatórios, estas plantas podem desempenhar um importante papel nas epidemias virais em várias culturas. O estudo de epidemias de vírus de plantas é grandemente facilitado quando uma abordagem baseada em genética de populações é empregada. O primeiro passo para estudar populações virais é definir sua estrutura genética, o que se refere ao seu grau de variabilidade genética. O conhecimento da dinâmica da variabilidade genética é essencial para entender o potencial das populações para evoluir, o que afeta diretamente a durabilidade de estratégias de manejo da doença baseadas na resistência do hospedeiro. Estudos para entender a estrutura genética e dinâmica de populações de begomovírus em plantas daninhas e possíveis efeitos sobre epidemias em espécies cultivadas são escassos. Dessa forma, o objetivo desse estudo foi determinar a diversidade e estrutura genética de begomovírus que infectam plantas daninhas no Nordeste do Brasil, como passo para avaliar seu papel como reservatório de begomovírus. Plantas daninhas pertencentes às famílias Fabaceae e Capparaceae com sintomas típicos de infecção por begomovírus foram coletadas nos estados de Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) e Sergipe (SE) de maio de 2005 a julho de 2010. Um total de 59 amostras de fabáceas, incluindo 42 amostras de Macroptilium spp., e 23 amostras de Cleome affinis (fam. Capparaceae) foram coletadas. DNA total foi extraído a partir das amostras e genomas completos dos begomovírus foram amplificados e clonados por amplificação por círculo rolante. Os clones foram completamente sequenciados e as sequências foram usadas para comparações com begomovírus previamente descritos, para análise filogenética e para determinação da estrutura genética das populações virais. Comparações de sequências indicaram a presença de seis begomovírus em fabáceas (cinco em Macroptilium spp.), incluindo quatro representando novas espécies. As características das sequências indicam que todas as novas espécies são begomovírus bissegmentados típicos do Novo Mundo que agruparam com begomovírus brasileiros na árvore filogenética. Em contraste, apenas uma espécie de begomovírus foi encontrada infectando plantas de Cleome affinis, sugerindo um baixo grau de diversidade de espécies nessa hospedeira. Filogenia reticulada foi usada para detectar possíveis eventos de recombinação nas populações begomovírus em fabáceas e em C. affinis. Esses prováveis eventos de recombinação foram confirmados por análise no programa RDP3. Foram detectados eventos de recombinação ocorrendo naturalmente nas populações de Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) e Cleome leaf crumple virus (ClLCrV). A análise da estrutura genética das populações de MaYSV e ClLCrV indica um alto grau de variabilidade genética em ambos os casos. Mutação e recombinação são importantes processos envolvidos na alta variabilidade genética encontrada nas populações desses vírus. Em conjunto, os resul

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