Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T12:25:45Z No. of bitstreams: 1 Genira Pereira de Andrade.pdf: 531734 bytes, checksum: 9dc28c82bfccaa852aa4dbc98b012e2d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T12:25:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Genira Pereira de Andrade.pdf: 531734 bytes, checksum: 9dc28c82bfccaa852aa4dbc98b012e2d (MD5) Previous issue date: 2007-03-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The yam (Dioscorea spp.) is affected by several diseases and pests occurring in field and/or during transport and storage. It is a crop with a high social economic importance in Northeast of Brazil, showing a good expansion potential by tuber export, especially to Europe. An evaluation of disease and pest development in important producing areas was undertaken, as well as a study on the quality of tuber seed used by the growers. Visits to seven counties of Pernambuco and three of Paraíba, totaling 30 farms were done. In order to evaluate the occurrence of diseases and the damages caused by pests under field conditions, in each field five lines of 10 plants were marked, while for virus evaluation, 30 plants were randomly selected. The plants were analyzed 30 days before and at the harvest day. The nematodes were extracted by association the Jenkins method and identified by their structures under light microscope. For fungus identification, isolation and inoculation were doneand the structures were observed under light microscope. For the viruses, observation under electron microscopy, triple antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay” (TAS-ELISA), with polyclonal and monoclonal antibodies specific to Yam mosaic virus (YMV), from IITA, Nigeria, and a polymerase chain reaction (PCR) with degenerated primers for detecting badnavirus and duplex reverse transcription (RT-PCR) with specific primers to YMV and Yam mild mosaic virus (YMMV) were used. The PCR and RT-PCR products were purified and sequenced in order to validate the tests used for detecting badnavirus andidentification of the potyviruses by the comparative analyses of the sequences available in the GenBank. It was observed the leaf spot caused by Curvularia eragrostidis in all areas studied, with a higher intensity on cv. Inhame-da-Costa of D. cayennensis-D. rotundata complex, whereas the damages caused by leaf wor (Pseudoplusia oo), present in all fields, were higher on cv. São Tomé of D. alata plants. The seed tubers of both yam species, collected in five farms representative of the growing areas of Pernambuco and Paraíba, after 60 days of storage, presented serious problems of green rot caused by Penicilium sclerotigenum, mealybugs (Planoccocus sp.) and tuber worms (Araecerus fasciculatus). It was identified the potyviruses YMV and YMMV, occurring in single and mixed infections with badnavirus, consisting the first detailed report with molecular information on theseviruses in Brazil. / O inhame (Dioscorea spp.) tem sido afetado por a vários problemas fitossanitários, que se manifestam na lavoura e durante o transporte e/ou armazenamento. É uma cultura de elevada importância sócio-econômica para a região Nordeste do Brasil, inclusive com potencial de expansão via exportação de túberas, especialmente para a Europa. Foi efetuada uma avaliação do desenvolvimento de doenças e pragas em importantes áreas produtoras, bem como um estudo da qualidade do material de propagação utilizado pelos produtores. Foram visitados sete municípios de Pernambuco e três da Paraíba, totalizando 30 propriedades. Para avaliação da ocorrência das doenças da parte aérea e danos causados por lagarta, foram marcadas em cada campo, 5 fileiras de 10 plantas e mais 30 plantas, escolhidas aleatoriamente, para análise de viroses, as quais foram avaliadas um mês antes e no período da colheita. Para extração dos nematóides foi usado método de centrifugação rápida associadoao de Jenkins, os quais foram identificados por suas estruturas observadas ao microscópio ótico. Os fungos detectados foram isolados e identificados e observando-se suas estruturas reprodutivas. Para identificação dos vírus foram efetuadas observações ao microscópio eletrônico de transmissão, teste “triple antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay” (TAS-ELISA), com anti-corpos policlonais e monoclonais específicos para Yam mosaic virus (YMV), obtidos do IITA, Nigéria e reaçaão de PCR (“polimerase chain reaction”) com oligonucleotídeos degenerados paradetecção de badnavírus e duplex reverse transcription (RT)-PCR com oligonucleotídeos específicos para YMV e Yam mild mosaic virus (YMMV). Os produtos de PCR e RT-PCR foram purificados e seqüenciados para validação dos testes usados na detecção de badnavírus e identificação dos potyvírus, por análise comparativa com as seqüências disponíveis no GenBank. Ficou comprovada a ocorrência de pinta preta, causada por Curvularia eragrostidis em todas as áreas estudadas, com maior intensidade na cv. Inhame-da-Costa do complexo D. cayennensis-D. rotundata, enquanto que o ataque de lagarta das folhas (Pseudoplusia oo), presente em todos os campos, teve maior severidade na cv. São Tomé de D. alata. As túberas-semente de ambas as espécies de inhame, coletadas em cinco propriedades representativas das áreas de cultivo em Pernambuco eParaíba, após 60 dias de armazenamento, apresentaram sérios problemas de Podridão Verde, causada por Penicillium sclerotigenum, cochonilhas (Planoccocus sp.) e brocas das túberas (Araecerus fasciculatus). Foram identificados os potyvírus YMV e YMMV, ocorrendo em infecção simples e mista com badnavírus, constituindose o primeiro registro detalhado com informações moleculares destes vírus no Brasil.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T13:55:35Z No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T13:55:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isadora Fernandes de Franca.pdf: 1420687 bytes, checksum: 6cec52a0fb3778ca5533af6c71262265 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The yam (Dioscorea spp.) has great social importance for the Northeast region of Brazil, due to the excellent nutritional quality and energy of their tubers and very useful for human alimentation. Leaf-spots on white yam, caused by the fungus Curvularia eragrostidis, is responsible for damage to yam in northeast Brazil, mainly in the states of Paraíba and Pernambuco. The aim of this study was to analyze the population structure of isolates of C. eragrostidis pathogenic to yam, D. cayennensis, in the states of Alagoas, Pernambuco and Paraiba, and to study the phylogenetic relationships of these with other species in the genus Cochliobolus. In the first study, 151 isolates were obtained from leaves of yam, which were analyzed the sequences of part of the ITS region and -tubulin gene and gpd and the profiles of DNA with ISSR. It was observed that the DNA sequences had no variation, and ISSR data showed the presence of six haplotypes. The pathogen population is characterized by low genotypic diversity, predominance of one or two genotypes evenly distributed, the predominance of asexual reproduction, and the presence of genotypic flow between the regions of cultivation. In the second study, it was conducted phylogenetic analysis sequences of 81 isolates of species of the family Pleosporaceae using the methods of maximum likelihood and Bayesian inference. The 16 isolates of C. eragrostidis from yam analyzed are related to the genus Cochliobolus species which has smaller conidia and they are phylogenetically closer to the species C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae and C. intermedia. / A cultura do inhame (Dioscorea spp.) apresenta grande importância socioeconômica para a região Nordeste do Brasil, devido à excelente qualidade nutritiva e energética de suas túberas e a utilidade para a alimentação humana. A queima das folhas, conhecida também como pinta preta, causada pelo fungo Curvularia eragrostidis, é responsável por grandes prejuízos à cultura do inhame no Nordeste brasileiro, principalmente nos Estados da Paraíba e Pernambuco, que são os maiores produtores. Este trabalho teve como objetivos analisar a estrutura populacional de isolados de C. eragrostidis patogênicos ao inhame, D. cayennensis, nos estados de Alagoas, Pernambuco e Paraíba, bem como estudar as relações filogenéticas destes com as demais espécies do gênero Cochliobolus. No primeiro estudo, foram obtidos 151 isolados, dos quais foram analisados as sequências de parte da região ITS, e dos genes -tubulina e gpd e os perfis de DNA com marcadores ISSR. Observou-se que as sequências de DNA não apresentaram variabilidade, e os dados de ISSR mostraram a presença de seis haplótipos. A população do patógeno é caracterizada por baixa diversidade genotípica, predominância de um ou dois genótipos uniformemente distribuídos, predominância de reprodução assexual, presença de fluxo genotípico entre as regiões de cultivo. No segundo estudo, foram realizadas analises filogenéticas de sequências de 81 isolados de espécies da família Pleosporaceae, através dos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana. Os 16 isolados de C. eragrostidis de inhame analisados estão relacionados com espécies do gênero Cochliobolus que apresentam conídios menores e mais próximos filogeneticamente de C. clavata, C. brachyspora, C. oryzae e C. intermedia.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T15:01:49Z No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix.pdf: 2202729 bytes, checksum: 8bf95b820172f7d6b51dfd5e4ca39314 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T15:01:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix.pdf: 2202729 bytes, checksum: 8bf95b820172f7d6b51dfd5e4ca39314 (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The soft rot caused by Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum is the main bacterial disease of Chinese cabbage and lettuce in Brazil and the world. Chemical control of this disease has not been efficient, being necessary to search for new alternatives of control. Given the growing importance of soft rot as a limiting factor for the production of these vegetables in the regions of the Agreste and Mata of Pernambuco state, Brazil and the difficulty of effective control measures, the present study aimed to: (i) determine the effect Calcium in the control of soft rot in Chinese cabbage, (ii) select lettuce cultivars as promising sources of resistance to soft rot. Were tested two sources of calcium in different concentrations, calcium nitrate [Ca(NO3)2] a 0.00; 0.15 and 0.3 g L-1 and calcium chloride [CaCl2] a 0.00; 1 and 5 g L-1 applied leaf spraying and soil drench. When applied with both methods, Ca(NO3)2 was effective in controlling soft rot, as it reduced the disease severity by up to 48.5% when sprayed onto the leaves (0.15 g L-1). A significant increase in the leaf calcium content was observed only in the plants that were sprayed with higher doses of Ca(NO3)2 and CaCl2. In all of the calcium treatments, light microscopy analyses revealed an increased number of chloroplasts and improved structuring of the palisade parenchyma, while transmission electron microscopy analyses revealed an increased cell wall thickness that was especially evident for the 0.15 g L-1 Ca(NO3)2 treatment applied by leaf spraying and soil drenching. Of the 41 genotypes tested, 14 were moderately resistant when inoculated with Pcc-C, with severity scores ranging from 3.5 to 4.0; 27 genotypes were susceptible. Eleven of these genotypes, four susceptible and seven moderately resistant were selected to test their resistance stability against three pathogen isolates with different degrees of virulence (Pcc-36, Pcc-A1.1 and Pcc-23). Most of the genotypes evaluated (77%) exhibited the same reaction observed in the selection assays only against isolate Pcc-36: Veneza Roxa was susceptible, while Alface Grega, Mimosa Salad Bowl Roxa, Livia, Livinia, Salad Bowl, Vitória de Santo Antão and Saia Veia were moderately resistant. Vitória de Santo Antão was the only genotype that was also moderately resistant to isolates Pcc-A1.1 and Pcc-23. This genotype can be used as a promising source of stable and durable soft rot resistance. / A podridão mole causada por Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum é a principal fitobacteriose das culturas da couve-chinesa e alface no Brasil e mundo. O controle químico dessa doença não tem sido eficiente, sendo necessária a busca por novas alternativas de controle. Tendo em vista a crescente importância da podridão mole como fator limitante para a produção destas hortaliças nas mesorregiões do Agreste e Mata do estado de Pernambuco, Brasil e a dificuldade de medidas efetivas de controle, o presente trabalho teve como objetivos: (i) verificar o efeito do cálcio no controle da podridão mole em couve-chinesa; (ii) selecionar cultivares de alface como fontes de resistência à podridão mole. Foram testadas duas fontes de cálcio em diferentes concentrações, nitrato de cálcio (Ca(NO3)2) a 0,00; 0,15 e 0,3 g L-1) e cloreto de cálcio (CaCl2) a 0,00; 1 e 5 g L-1, aplicadas via pulverização foliar e rega do solo. Ca(NO3)2, nas duas formas de aplicação foi eficiente no controle da podridão mole, reduzindo a severidade da doença em até 48,5% via aplicação foliar (0,15 g L-1). Verificou-se aumento significativo do conteúdo de cálcio foliar apenas nas plantas pulverizadas com as maiores doses de Ca(NO3)2 e CaCl2. Em todos os tratamentos com cálcio, a microscopia de luz revelou aumento do número de cloroplastos e melhor estruturação do parênquima paliçádico, enquanto a microscopia eletrônica de transmissão evidenciou aumento de espessura da parede celular, com destaque para o tratamento Ca(NO3)2 a 0,15 g L-1 via pulverização foliar e rega do solo. De acordo com os resultados obtidos, Ca(NO3)2 a 0,15 e 0,3 g L-1, aplicado via pulverização foliar e rega do solo, apresentou potencial para o controle da podridão mole em plantas de couve-chinesa, estando essa eficiência associada a melhor estruturação e integridade da parede celular. Dos 41 genótipos de alface avaliados quanto à reação à podridão mole, visando identificar fontes de resistência, 14 apresentaram reação como moderadamente resistentes, com severidade variando de 3,5 a 4,0, enquanto 27 genótipos foram suscetíveis. Destes genótipos, 11 foram selecionados para o ensaio de estabilidade da resistência em relação a três isolados do patógeno com diferentes níveis de virulência, sendo quatro suscetíveis e sete moderadamente resistentes. A maioria dos genótipos avaliados (77%) voltou a expressar a mesma reação do ensaio de seleção em relação ao isolado Pcc-36, ou seja, reação susceptível (Veneza Roxa) e moderadamente resistente (Alface Grega, Mimosa Salad Bowl Roxa, Livia, Livinia, Salad Bowl, Vitória de Santo Antão e Saia Veia). Apenas o genótipo Vitória de Santo Antão manteve a reação de moderadamente resistente também para os isolados Pcc-A1.1 e Pcc-23. Portanto, esse genótipo pode ser utilizado como uma fonte promissora de resistência estável e durável contra a podridão mole.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T11:47:13Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza.pdf: 1990421 bytes, checksum: 18cb117ba50c4733f5f4993b3f387024 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T11:47:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza.pdf: 1990421 bytes, checksum: 18cb117ba50c4733f5f4993b3f387024 (MD5) Previous issue date: 2013-02-15 / The southern blight, caused by Sclerotium rolfsii soilborne fungi, is an important disease in the culture of cowpea (Vigna unguiculata). The present work aimed: a) select, identify and verify the stability of antagonistic yeast isolates to S. rolfsii for biological control potential of rot southern blight in cowpea; b) elucidate the possible antagonistic activity in vitro of the yeast S. rolfsii, and the ability of yeast for growth promotion of cowpea plants. The experiments were conducted under conditions of a green house and in vitro assays. A total of five isolates, among 74 evaluated yeasts were selected in order to reduce the severity of southern blight in cowpea plants caused by an isolate of S. rolfsii pre selected in pathogenicity tests. Experimental tests showed that four out of five selected strains of yeast were stable in reducing disease severity in plants against three different isolates of S. rolfsii. There was a significant decrease in disease control was reduced when the concentration of these isolates yeast suspensions for seed treatment. The five selected yeast isolates were submitted to classification by classical taxonomy, considering the morphological, physiological and biochemical, as well as identifying the level of molecular biology, through sequencing of genomic regions ITS1 and ITS4. The five selected yeast isolates were identified as belonging to species Kodamaea ohmeri. In assays in vitro, all five strains of K. ohmeri showed activity "killer" positive, and observed an inhibition of mycelial growth of isolates of S. rolfsi grown on culture medium containing filtered extracted from strains of K. ohmeri for the majority of interactions tested. In tests of colonies pairings, only one isolate of K. ohmeri was effective in inhibiting the mycelial growth of two isolates of S. rolfsii between three pathogen strains evaluated. The tests of promoting plant growth, all five isolates K. ohmeri selected have generated significant gains in Shoot biomass of plants from seed treatment. The use of isolated K. ohmeri selected been shown as a promising tool for biological control to be incremented in the management of diseases caused by S. rolfsii in cowpea culture / A podridão-de-esclerócio, causada pelo fungo habitante do solo Sclerotium rolfsii, é uma importante doença na cultura do feijão caupi (Vigna unguiculata). O presente trabalho teve como objetivos: a) selecionar, identificar e verificar a estabilidade antagônica de isolados de leveduras a S. rolfsii no potencial de controle biológico da podridão-de-esclerócio em feijão caupi; b) elucidar as possíveis atividades antagônicas in vitro de leveduras sobre S. rolfsii, bem como a capacidade destas leveduras na promoção de crescimento de plantas de feijão caupi. Os experimentos foram conduzidos em condições de casa-de-vegetação e em ensaios in vitro. Um total de cinco isolados, dentre 74 leveduras avaliadas, foram selecionados visando a redução da severidade da podridão-de-esclerócio em plantas de feijão caupi ocasionada por um isolado de S. rolfsii pré-selecionado em testes de patogenicidade. Ensaios experimentais demonstraram que quatro dos cinco isolados de leveduras selecionados foram estáveis na redução da severidade da doença em plantas perante três diferentes isolados de S. rolfsii. Ocorreu uma significativa diminuição do controle da doença quando foi reduzida a concentração de suspensões destes isolados leveduras no tratamento de sementes. Os cinco isolados de leveduras selecionados foram submetidas à classificação por taxonomia clássica, considerando os caracteres morfológicos, fisiológicos e bioquímicos, bem como por identificação à nível de biologia molecular, através do sequenciamento das regiões genômicas ITS1 e ITS4. Os cinco isolados de leveduras selecionados foram identificados como pertencentes à espécie Kodamaea ohmeri. Em ensaios in vitro, todos os cinco isolados de K. ohmeri apresentaram atividade “killer” positiva, sendo observada uma inibição do crescimento micelial de isolados de S. rolfsi crescidos sobre meio de cultivo contendo filtrados extraídos dos isolados de K. ohmeri para a maioria das interações testadas. Em testes de pareamentos de colônias, somente um isolado de K. ohmeri foi eficiente na inibição do crescimento micelial de dois isolados de S. rolfsii entre três isolados do patógeno avaliado. Nos testes de promoção de crescimento de plantas, todos os cinco isolados de K. ohmeri selecionados geraram ganhos significativos na biomassa de parte aérea de plantas a partir do tratamento de sementes. O uso de isolados K. ohmeri selecionados, se demonstrou como uma ferramenta promissora de controle biológico a ser incrementada no manejo de doenças causadas por S. rolfsii na cultura caupi.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T13:46:53Z No. of bitstreams: 1 Liliane Dias Nascimento.pdf: 4084810 bytes, checksum: 75a96b10bb37fdfc009fceb0465dd541 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T13:46:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Liliane Dias Nascimento.pdf: 4084810 bytes, checksum: 75a96b10bb37fdfc009fceb0465dd541 (MD5) Previous issue date: 2003-02-28 / The Begomovirus (family Geminiviridae) are characterized by infecting dicotyledonous plants, present twinned icosahedral particles with genomes composed of one or two components of circular single-stranded DNA (DNA-A and DNA-B). In addition to cultivated plants, the begomoviruses are also associated with a wide range of weeds. This study aimed to characterize the begomoviruses associated with weed families Malvaceae (Herissantia crispa, Waltheria indica, Sidastrum paniculatum, Sida rhombifolia e Triumfetta semitriloba), Solanaceae (Physalis sp.) and Lamiaceae (Hyptis sp.) In northeastern Brazil to assess their diversity and importance as sources of new virus to cultivated plants. Samples of weeds with symptoms typical of begomovirus infection were collected in the states of Alagoas, Pernambuco and Bahia during the years 2010-2012. We obtained a total of 28 genomic components (18 DNA-A and 10 DNA-B). Analysis of the sequences indicated the presence of eight species of begomovirus, six new species (HeYMV, TrYMV, PaYNV, PhYSV, HyRMV1 and HyRMV2). In phylogenetic analyzes between viruses obtained malvaceous weeds. indicate that all new species clustered with Brazilian begomoviruses. Evidence of recombination were detected manifold where the begomoviruses from Sida spp. and tomato were identified as parents. In weed Hyptis sp. and Physalis sp. Sequence analyzes indicated the presence of three new species of begomoviruses, the two found in the same sample Hyptis sp. (Mixed infection) and another found initially Physalis sp. and subsequently detected in Hyptis sp. In phylogenetic analyzes of these three new species formed a single monophyletic branch. The analyzes showed strong evidence of recombination between HyRMV1 and HyRMV2, and the like parental HyRMV1. The ToRMV was identified as a possible parental species HyRMV1 and PhYSV. Therefore, these results indicate that the weeds are important reservoirs of begomoviruses and that recombination events have apparently contributed to the emergence of new species in some hosts. / Os Begomovirus (família Geminiviridae) são caracterizados por infectarem plantas dicotiledôneas, apresentarem partículas icosaédricas geminadas, com genoma composto por um ou dois componentes de DNA circular de fita simples (DNA-A e DNA-B). Além de plantas cultivadas, os begomovírus estão também associados a uma ampla gama de plantas daninhas. Esse estudo teve como objetivo caracterizar os begomovírus associados a plantas daninhas das famílias Malvaceae (Herissantia crispa, Waltheria indica, Sidastrum paniculatum, Sida rhombifolia, Triumfetta semitriloba), Solanaceae Physalis sp.) e Lamiaceae (Hyptis sp.) no nordeste brasileiro para avaliar sua diversidade e importância como fontes de novos vírus para plantas cultivadas. As amostras de plantas daninhas com sintomas típicos de infecção por begomovírus foram coletadas nos estados de Alagoas, Pernambuco e Bahia durante os anos de 2010 a 2012. Foram obtidos um total de 28 componentes genômicos (18 DNA-A e 10 DNA-B). Análises das sequências indicaram a presença de oito espécies de begomovírus, sendo 6 novas espécies (HeYMV, TrYMV, PaYNV, PhYSV, HyRMV1 e HyRMV2). Nas análises filogenéticas entre os vírus obtidos das malváceas daninhas. indicam que todas as novas espécies se agruparam com begomovírus brasileiros. Evidências múltiplas de recombinação foram detectadas onde os begomovírus provenientes de Sida spp. e do tomateiro foram identificados como parentais. Nas daninhas Hyptis sp. e Physalis sp. análises das sequências indicaram a presença de três novas espécies de begomovírus, duas encontradas numa mesma amostra de Hyptis sp. (infecção mista) e a outra encontrada inicialmente em Physalis sp. e posteriormente detectada em Hyptis sp. Nas análises filogenéticas essas três novas espécies formaram um único ramo monofilético. As análises de recombinação indicaram uma forte evidência de recombinação entre HyRMV1 e HyRMV2, tendo o HyRMV1 como parental. O ToRMV foi identificado como possível parental para as espécies HyRMV1 e PhYSV. Portanto, esses resultados indicam que as plantas daninhas constituem importantes reservatórios de begomovírus e que eventos de recombinação tem aparentemente contribuído para o surgimento de novas espécies nessas hospedeiras.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T14:48:52Z No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 826962 bytes, checksum: 4c267bd8c50631dcb8bdf8b7b2c1cc47 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T14:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 826962 bytes, checksum: 4c267bd8c50631dcb8bdf8b7b2c1cc47 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Rhizoctonia canker, caused by Rhizoctonia solani, is an important cowpea disease in Northeastern region of Brazil. This thesis aimed: a) to evaluate the potential of crop rotation and green manures in inducing suppressiveness to Rhizoctonia canker in cowpea; b) to identify the biotic factors related to suppression; and c) to analysis the stability of the disease suppression by selected crop rotation in relation to different isolates and inoculum density of the pathogen, and soils from different locations. The experiments were conducted in microplots in the field. In relation to crop rotations, Initially, 14 treatments were compared in four growing seasons, including different combinations of cowpea (CA) in rotation with cotton (AL), sunflower (AL), castor bean (MA), corn (MI) and sorghum (SO), and in combination with fallow (PO) and cowpea monoculture. The rotations CA-MI-SO-CA, CA-GI-SO-CA and CA-MI-PO-CA provided reductions of 77.6%, 74.0% and 73.9% in the disease severity, respectively. When the stability of disease control by CA-MI-SO-CA rotation was evaluated in relation to different pathogen isolates, inoculum densities and soils, in all situations the disease severity was significantly (P0,0001) lower under crop rotation as compared to cowpea monoculture, indicating the potential of the crop rotation for controlling the Rhizoctonia canker. In relation to green manures, 13 treatments were compared in five growing seasons, considering different combinations of cowpea and green manures (sunn hemp, breviflora crotalaria, showy crotalaria, jack bean, velvet bean, dwarf mucuna, lablab bean, dwarf pigeon pea, forage pigeon pea, corn, millet and sorghum). For the two evaluations after green manures cultivation, the incorporation of sorghum into the soil led to smallest levels of severity of cowpea Rhizoctonia canker, reducing by 81.3% and 83.3% the disease severity. There was no significant correlation from levels of disease severity with microbiological variables. / A rizoctoniose, causada por Rhizoctonia solani, é uma importante doença do feijão-caupi na região Nordeste do Brasil. Essa tese teve como objetivos: a) avaliar o potencial da utilização de rotações de culturas e adubos verdes na indução da supressividade à rizoctoniose do feijão-caupi; b) identificar os possíveis fatores bióticos dos solos responsáveis pela supressividade; e c) analisar a estabilidade do controle pela rotação de cultura selecionada em relação a diferentes isolados e densidades de inóculo do patógeno, bem como solos de diferentes localidades. Os experimentos foram realizados em microparcelas no campo. Em relação à rotação de culturas, inicialmente foram comparados 14 tratamentos em quatro ciclos de cultivo, incluindo diferentes combinações de feijão-caupi (CA) em rotação com as culturas de algodão (AL), girassol (GI), mamona (MA), milho (MI) e sorgo (SO), bem como em combinação com pousio (PO) e feijão-caupi em monocultura. As rotações CA-MI-SO-CA, CA-GI-SO-CA e CA-MI-PO-CA propiciaram reduções na severidade da doença de 77,6%, 74,0% e 73,9%, respectivamente. Quando avaliada a estabilidade do controle da doença pela rotação CA-MI-SO-CA a diferentes isolados, densidades de inóculo e solos, em todas as situações a severidade foi significativamente inferior (P0,0001) sob a rotação de culturas comparada à monocultura, indicando o potencial de utilização da rotação no controle da rizoctoniose. Em relação aos adubos verdes, foram comparados 13 tratamentos, considerando diferentes combinações de feijão-caupi e adubos verdes (crotalária breviflora, crotalária juncea, crotalária spectabilis, feijão-de-porco, guandu anão, guandu forrageiro, labe-labe, mucuna anã, mucuna preta, milho e sorgo), em cinco ciclos de cultivo. Nas duas avaliações realizadas após o cultivo de adubos verdes, a incorporação de sorgo ao solo propiciou os maiores níveis de controle da doença, reduzindo em 81,3% e 83,3% a severidade. Não houve correlação significativa dos níveis de severidade da rizoctoniose com as variáveis microbiológicas avaliadas nos solos.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T15:01:07Z No. of bitstreams: 1 Luiz Augusto Martins Peruch.pdf: 694087 bytes, checksum: 27f67eb702a71e64c5b03780e75fe68e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T15:01:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Augusto Martins Peruch.pdf: 694087 bytes, checksum: 27f67eb702a71e64c5b03780e75fe68e (MD5) Previous issue date: 2004-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The brassica cultivation has been of high importance in Brazil. However, the profitable crop production can be limited by occurrence of diseases such as Alternaria black spot, caused by Alternaria brassicicola and/or Alternaria brassicae, and black rot, caused by Xanthomonas campestris pv. campestris. In that context, the present study had as objectives to evaluate the intensity of Alternaria black spot and of black rot diseases on brassica under organic cultivation in the states of Pernambuco and Santa Catarina, and the spore production longevity of A. brassicicola in leaf debris of broccolis. The intensity of the diseases was evaluated from November 2001 to February 2002, in 103 fields under organic farming systems, including broccoli, Chinese cabbage, cauliflower, kale and cabbage. High prevalence of the diseases was registered in both states, except on Chinese cabbage in Santa Catarina. Prevalence of Alternaria black spot was 100% on broccoli fields in Pernambuco, as well as on cauliflower in the two states, while the black rot reached that level on broccoli and cauliflower fields in Santa Catarina. In the average of the different brassica species, the diseases were more prevalent in Pernambuco than in Santa Catarina. However, when considered severity averages of each disease, no significant differences were verified between the two states, although the climatic conditions have been sharply different. The levels ofdisease severity were low, considering that 98% of the fields presented severity lower than 5%. The Alternaria black spot severity varied among the brassica species in Pernambuco, being higher on Chinese cabbage and lower on kale. In Santa Catarina no significant differences were verified among the brássicas species. In relation to the black rot, only in Santa Catarina there was difference in the disease severity among the brassicas, being registered the lowest level on Chinese cabbage. No significant correlations were verified between severity levels of Alternaria black spot and black rot, neither between disease severity and total number of plants or plant age. The spore production longevity of A. brassicicola was investigated in leaves debris of broccoli, considering different depths of debris incorporation, periods of the year, and systems of soil handling, in two experiments carried out in Urussanga city, State of Santa Catarina, Brazil. Infected leaves debris of broccoli were conditioned in bags of polyethylene and distributed in portions in the field, on the soil surface and at depths of 5 and 10 cm. Periodically, the debris in the bags were collected and conidia concentrations were quantified for longevity of spore production andextinction rate. In both experiments there was higher spore production longevity in leaves debris in the period I, characterized by lighter temperatures, higher air relative humidity and lower pluvial precipitation than in the period II. Depth of debris incorporation influenced directly on A. brassicicola spores production, being lower when incorporation was made at 10 cm depth. In relation to soil handling systems, when the inoculum source was deposited on the soil surface there was not difference in the rate of spore production extinction between the soils under conventional and organic handling. However, at depths of 5 and 10 cm, the rate was significantly higher in the soil under conventional handling. The management of Alternaria black spot on broccoli at the area under study can be accomplished by integrated control, including the incorporation of infected leaves debris in the soil, at least 10 cm depth, along with crop rotation, for no less than a 60-day interval in subsequent brassica plantings. / O cultivo de brássicas tem destacada importância na olericultura brasileira. No entanto, a produção dessas olerícolas pode ser limitada pela ocorrência de doenças, dentre as quais se destacam a alternariose, causada por Alternaria brassicicola e/ou Alternaria brassicae, e a podridão negra, causada por Xanthomonas campestris pv. campestris. Nesse contexto, o presente estudo teve como objetivos realizar o levantamento da intensidade da alternariose e da podridão negra em cultivos orgânicos de brássicas nos Estados de Pernambuco e Santa Catarina, bem como avaliar a longevidade da esporulação de A. brassicicola em restos foliares de brócolis. Os levantamentos foram realizados no período de novembro de 2001 a fevereiro de 2002, num total de 103 cultivos orgânicos, incluindo brócolis, couve-chinesa, couve-flor, couve-manteiga e repolho. Foram registradas elevadas prevalências das doenças nos dois Estados, com exceção em couve-chinesa em Santa Catarina. A prevalência da alternariose foi de 100% nos cultivos de brócolis em Pernambuco, bem como em couve-flor nos dois Estados, enquanto a podridão negra atingiu esse nível nos cultivos de brócolis e couve-flor em Santa Catarina. Na média das diferentes espécies de brássicas, as doenças foram mais prevalentes em Pernambuco que Santa Catarina. Entretanto,quando consideradas as médias de severidade de cada doença no conjunto das brássicas, não foram constatadas diferenças significativas entre os dois Estados, embora as condições climáticas tenham sido nitidamente distintas. Os níveis de severidade das doenças foram baixos, tendo em vista que 98% dos cultivos apresentaram severidade inferior a 5%. A severidade da alternariose variou entre as espécies de brássicas em Pernambuco, com maior severidade registrada em couve-chinesa e menor em couve-manteiga, enquanto em Santa Catarina não foram constatadas diferenças significativas entre as brássicas. Em relação à podridão negra, somente em Santa Catarina houve diferença na severidade entre as brássicas, sendo registrados os menores níveis em couve-chinesa. Não foram constatadas correlações significativas entre os níveis de severidade da alternariose e da podridão negra, bem como da severidade destas com o número total de plantas e a idade das plantas nos cultivos. Foi também investigada a longevidade da esporulação de A. brassicicola em restos foliares de brócolis, considerando diferentes profundidades de incorporação dos restos, períodos do ano e sistemas de manejo do solo, em dois experimentos realizados em Urussanga - SC. Restosfoliares de brócolis infectados pelo patógeno foram acondicionadas em sacolas de polietilenoperfuradas e distribuídos em parcelas no campo, na superfície do solo e nas profundidades de 5 e 10 cm. Nos dois experimentos foi verificada uma maior longevidade da esporulação nos restos foliares no período I, caracterizado por temperaturas mais amenas, maior umidade relativa do ar e menor precipitação pluvial que no período II. A profundidade de incorporação dos restos influiu diretamente na esporulação de A. brassicicola, que foi inferior quando a incorporação foi efetuada a 10 cm de profundidade. Em relação aos sistemas de manejo, quando a fonte de inóculo foi depositada na superfície do solo não houve diferença na taxa de extinção da esporulação entre os solos sob manejo convencional e orgânico. No entanto, nas profundidades de 5 e 10 cm, essa taxa foi significativamente superior no solo sob manejo convencional. O manejo da alternariose em brócolis na região do estudo pode ser realizado pela combinação de vários métodos de controle, inclusive pela incorporação dos restos foliares infectados no solo, à profundidade mínima de 10 cm, combinado com rotação de culturas, visando um intervalo mínimo de 60 dias entre cultivos de brássicas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-21T13:49:42Z No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 741943 bytes, checksum: 78412f9372d9818a63e65dee4cf2dfdb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T13:49:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 741943 bytes, checksum: 78412f9372d9818a63e65dee4cf2dfdb (MD5) Previous issue date: 2012-03-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Lasiodiplodia Theobromae is responsible for numerous diseases in many economically important crops that may be infected in both pre and postharvest, may cause different symptoms. In grapevine, the pathogen infects the berries, causing Lasiodiplodia rot, causing injuries that impair or prevent the marketing of the fruit. Given the importance of this pathogen and the high levels of infection in the Lower Basin producing area of Submédio do Vale São Francisco, a region important in the production of fine table grapes, this study aimed to evaluate the epidemiological parameters of Lasiodiplodia rot in berries of grape cvs. Italy Muscat and Thompson Seedless. We conducted pathogenicity and aggressiveness of 10 isolates of L. theobromae (L1, L2, L3, L4, L5, L7 L6, L8, L9 and L10), inoculated on wounds produced by a punch with eight needles 2 mm deep on cv. Italy Muscat at a concentration of 106 spores/mL. All isolates tested were pathogenic to grape. In the test of aggression L1 isolate was more aggressive, with higher average compared to other injuries, which is used in subsequent tests. We studied the influence of region inoculation inoculum (equatorial and stalk), methods of inoculation (spray and drop) in addition to epidemiological parameters: concentration of inoculum (103, 104, 105, 106 and 107 spores/ml), a period of wetting (0, 12, 24, 36, 48h) and temperature (2, 5, 10, 15, 20, 25 ° C). Regarding to the inoculum concentration, for both cvs. Italy Muscat and Thompson Seedless, 107 conidia/ml was the best, using 10 μl applied on the equatorial region by droplet inoculation method promoting the highest development of lesions on grape berries. Concerning to the epidemiological parameters, temperature and wetness, there has been a further development of lesions in about 25 ° C under a 48 h wetting period. / Lasiodiplodia theobromae é responsável por inúmeras doenças em diversas culturas de importância econômica que podem vir a ser infectadas tanto em pré como em pós-colheita, podendo causar diferentes sintomas. Na videira, o patógeno infecta as bagas, causando a podridão por lasiodiplodia, provocando lesões que prejudicam ou inviabilizam a comercialização do fruto. Diante da relevância deste fitopatógeno e dos altos níveis de infecção na região produtora do Submédio São Francisco, região importante na produção de uvas finas de mesa, este trabalho buscou avaliar os parâmetros epidemiológicos da podridão por lasiodiplodia em bagas de uvas das cultivares Itália Muscat e Thompson Seedless. Realizou-se teste de patogenicidade e agressividade com 10 isolados de L. theobromae (L1, L2, L3, L4, L5, L6 L7, L8, L9 e L10), inoculados sobre ferimentos produzidos por um furador com oito agulhas de 2 mm de comprimento em uvas da cv. Itália Muscat na concentração de 106 conídios/mL. Todos os isolados testados foram patogênicos a uva. O isolado L1 foi o mais agressivo, apresentando maiores médias de lesões em comparação aos demais, sendo este utilizado nos testes posteriores. Estudou-se a influência da região de deposição do inoculo (equatorial e peduncular), métodos de inoculação (gota e pulverização) além dos parâmetros epidemiológicos: concentração de inóculo (103, 104, 105, 106 e 107 conídios/mL), período de molhamento (0, 12, 24, 36, 48 h), e temperatura (2, 5, 10, 15, 20, 25ºC). Em relação à concentração de inóculo foi verificado que tanto para a cv. Itália Muscat quanto na cv Thompson Seedless a melhor concentração de 107 conídios/mL, aplicado 10 μL na região equatorial pelo método de inoculação de gota foi o que proporcionou maior desenvolvimento de lesão sobre as bagas de uva. Em relação aos aspectos epidemiológicos, temperatura e período de molhamento, verificou-se um maior desenvolvimento de lesão em torno de 25°C sob um período de 48 horas de molhamento.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-21T14:38:30Z No. of bitstreams: 1 Luiz Henrique Rocha Lopes.pdf: 2118185 bytes, checksum: 93ff9ca19a00eb532e526f9d4c773b3a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Henrique Rocha Lopes.pdf: 2118185 bytes, checksum: 93ff9ca19a00eb532e526f9d4c773b3a (MD5) Previous issue date: 2015-07-27 / One of the main onion crop diseases in Brazil is anthracnose, caused by especies of genus Colletotrichum. In this work it was used several Colletotrichum isolates obtained from plants do Allium genus with symptoms of anthracnose. The isolates were obtained from different regions of Brazil and characterized with the aid of morphological methods, molecular and cultural features. The Bayesian Analysis Method of inference was used for an initial analysis involving the genomic region β-tubulin (tub2). A representative group of isolates, selected in the first analysis, was sequenced for the partial region of actin (act) and ApMat. Two groups of haplotypes were generated and analyzed separately, one by concatenating tub2 and act and Other tub2, act and ApMat. The analysis revealed along with morphological analyzes that onion anthracnose is probably caused by several Colletotrichum species belonging to complexes acutatum and gloesporioides. All the representative isolates used in this study were pathogenic on onion, being able to cause of induce typical symptoms of anthracnose, especially on bulbs with variable aggressiveness range. All the results obtained in this work lead us to believe that onion anthracnose is caused by several species different of what has been reported so far. / Uma das principais doenças no cultivo de cebola no Brasil é a antracnose, causada por espécies do gênero Colletotrichum. Neste trabalho foram utilizados 42 isolados obtidos de plantas do gênero Allium com sintomas de antracnose de todas as regiões geográficas do Brasil e caracterizados com o auxílio de métodos morfológicos, moleculares e de características culturais. O método de análise de inferência Bayesiana foi utilizado para uma análise inicial envolvendo o gene β-tubulina (tub2). Um outro grupo, oriundo desta análise, foi seqüenciado para os genes parciais actina (act) e ApMat. Dois grupos de haplótipos foram gerados e analisados separadamente, um concatenando tub2 e act e outro tub2, act e ApMat. A análise revelou juntamente com análises morfológicas que a antracnose em cebola é causada, por várias espécies inseridas dentro dos complexos acutatum e gloesporioides. Todos os isolados representativos usados no estudo foram patogênicos sendo capazes de induzir sintomas típicos de antracnose, sobretudo em bulbos de cebola com variação de agressividade. Todas as informações deste trabalho levam a crer que, a antracnose em cebola é causada por um conjunto de espécies, diferente do que se tem relatado até o momento.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-21T14:50:39Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Garcia de Oliveira.pdf: 229150 bytes, checksum: cb960836d78efca26b86c65b585f44af (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:50:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Garcia de Oliveira.pdf: 229150 bytes, checksum: cb960836d78efca26b86c65b585f44af (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / The Rhizoctonia canker, caused by Rhizoctonia solani, is an important disease of cowpea in northeastern Brazil. This work aimed to select cowpea rhizobacteria as biocontrol agents of Rhizoctonia canker and to assess the stability of the control by promising isolates for different isolates and inoculum densities of the pathogen, and soil types. Samples of cowpea plants with no symptoms of root diseases were collected in 22 fields and 87 bacterial isolates were obtained from their rhizoplane, with 59 strains of Bacillus spp. and 28 strains of fluorescent Pseudomonas spp. These strains were evaluated for their efficacy in reducing the severity of Rhizoctonia canker of cowpea under greenhouse conditions. In a preliminary screening cowpea seeds (cv. IPA-206) were immersed in bacterial suspension(approximately 108 cells/mL) prepared in 0.1 M MgSO4 solution and sown in trays containing unsterilized soil (Camaragibe) previously infested (isolated CMM-2656) with 150 mg of substrate (rice) colonized/kg soil. The assessment of disease severity was determined after 15 days, using a scale from 0 to 4, where 0 = no symptoms and 4 = non-germinated seeds and/or non-emerged plantlets. Only five bacterial strains (B-05, B-13, B-63, B-65 and B-71), all from the genus Bacillus, reduced levels of disease severity above 45% and were evaluated in relation to five isolates (CMM-2651, CMM-2654, CMM-2666, CMM-2675 and CMM-2682) and three inoculum densities (200, 250 and 300 mg/kg soil) of R. solani, and five soil types (Aldeia, Goiana, Itapirema, Pombos and Vitória). Only the bacterial strain B-71 showed similar levels of Rhizoctonia canker control induced by different isolates of the pathogen, with an average of 24.5% in the reduction of severity levels. The strain B-65 had the highest levels of disease control at the three inoculum densities of R. solani, with an average of 22.2%. It was evident the influence of soil on the effectiveness of the strains. The great variability of results in the control of Rhizoctonia canker due to different isolates and inoculum densities of R. solani as well as the unstable response in different soil types may be factors limiting the use of Bacillus spp. in the treatment of cowpea seeds in field conditions. / A rizoctoniose, causada pelo fungo Rhizoctonia solani, é uma importante doença do caupi no Nordeste brasileiro. Esta dissertação teve como objetivos efetuar a prospecção de rizobactérias de caupi como agentes de biocontrole da rizoctoniose e avaliar a estabilidade do controle por isolados promissores em relação a diferentes isolados e densidades de inóculo do patógeno, e tipos de solos. Foram efetuadas coletas de plantas de caupi sem sintomas de doenças radiculares em 22 áreas de plantio. Destas plantas, foram obtidos 87 isolados bacterianos do rizoplano, sendo 59 isolados de Bacillus spp. e 28 isolados de Pseudomonas spp. do grupo fluorescente. Esses isolados foram avaliados quanto à eficácia na redução da severidade da rizoctoniose do caupi em casa de vegetação. Na seleção preliminar, sementes de caupi (cv. IPA-206) foram imersas nas suspensões bacterianas (aproximadamente 108 células/mL) preparadas em solução de MgSO4 0,1M e semeadas em bandejas contendo solo não esterilizado (Camaragibe) previamente infestado com o patógeno (isolado CMM-2656), na densidade de 150 mg de substrato (arroz) colonizado/kg de solo. A avaliação da severidade da doença foi efetuada após 15 dias, utilizando-se escala de notas de 0 a 4, onde 0 = sem sintomas e 4 = sementes não germinadas e/ou plântulas não emergidas. Somente cinco isolados bacterianos (B-05, B-13, B-63, B-65 e B-71), todos do gênero Bacillus, propiciaram níveis de redução da severidade da doença superiores a 45% e foram avaliados em relação a cinco isolados (CMM-2651, CMM-2654, CMM-2666, CMM-2675 e CMM-2682) e três densidades de inóculo (200, 250 e 300 mg/kg de solo) de R. solani, bem como cinco tipos de solos (Aldeia, Goiana, Itapirema, Pombos e Vitória). Somente o isolado bacteriano B-71 apresentou níveis similares de controle da rizoctoniose induzidos pelos diferentes isolados do patógeno, com redução média de 24,5% nos níveis de severidade. O isolado bacteriano B-65 apresentou os maiores níveis de controle da doença nas três densidades de inóculo de R. solani, com média de 22,2%. Ficou evidente a influência do solo na eficácia dos isolados bacterianos. A grande variabilidade dos resultados no controle da rizoctoniose em função dos diferentes isolados e densidades de inóculo de R. solani, assim como da resposta instável em diferentes tipos de solos, podem ser fatores limitantes à utilização dos isolados de Bacillus spp. no tratamento de sementes de caupi em condições de campo.