Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1802890 bytes, checksum: 0b75928115b5c4403a010430868a5dbc (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Ralstonia solanacearum (RS) is a bacterial complex species that causes the bacterial wilt in hundreds of plant hosts, inducing heavy losses mainly on cultivated solanaceus species in tropical and subtropical countries. The race 3 biovar 2 (R3B2) of the pathogen causes not only direct losses but latent infections in many hosts, like the geranium, which facilitates its dissemination in and between countries. In the last decade, it was introduced in USA by infected geranium from Kenya and Guatemala, causing great concerns due the adaptation of this variant to the potato crop. In USA, the R3B2 of RS acquired the status of bioterrorism agent and now faces strong quarantine restrictions in the country. In this work we evaluated the pathogenicity of 36 Brazilian RS strains to geranium, most of them of R3B2. These strains were evaluated to their capacity of infecting geranium (Pelargonium peltatum and P. hortorum), potato and tomato. Seedlings were inoculated by xylem penetration with a pin contaminated at the time of inoculation by touching it onto the selected colony. Ten strains of biovar 1, 22 of biovar 2 and two of biovar 3 were used for comparison proposes. The disease incidence was measured every two days by the percentage of symptomatic plants. The strains were identified in order to analyze the eventual correlations among host of origin, biovar and phylotype. All the five geranium cultivars tested were susceptible, but with different responses among strains. The geraniums were less susceptible than solanaceous hosts tested. Nineteen strains infected one or two of the hosts and 17 infected at least one of the three hosts. The races 1 and 3, biovars 1, 2 and 3, phylotypes I and II, were all capable of infecting geranium. The capacity of R3B2 Brazilian strains to infect the geranium requires special methods for identification and detection of the bacteria in greenhouses for plants produced for export. It was not possible to group the strains according to pathogenic and molecular characteristics; therefore, it is proposed that complete genome analysis be performed to unveil eventual host specificity for some isolates. / Ralstonia solanacearum (RS) é uma espécie bacteriana complexa que causa a murcha bacteriana em centenas de plantas hospedeiras, provocando grandes perdas principalmente em solanáceas cultivadas em países de clima tropical e subtropical. Especificamente a raça 3 biovar 2 (R3B2) do patógeno, além de causar perdas diretas, causa infecções latentes em diversas hospedeiras, como o Pelargonium sp., o que facilita sua disseminação dentro e entre países. Por exemplo, na última década, esta bactéria foi introduzida nos EUA desta forma, causando preocupação em virtude da adaptação dessa variante à cultura da batata. Face à sua forte restrição quarentenária principalmente em países da América do Norte, onde adquiriu status de agente de bioterrorismo, avaliou-se a patogenicidade a gerânio de 36 isolados brasileiros, com ênfase na R3B2 de RS. Esses isolados foram avaliados quanto à sua capacidade de infectar gerânios (P. peltatum, P. hortorum), batata e tomate. Plantas jovens foram inoculadas pela penetração do xilema com um alfinete esterilizado contaminado pelo toque em colônia de RS de cada isolado. Foram usados 36 isolados, sendo 10 da biovar 1, 22 da biovar 2, dois da biovar 3 e dois de gerânio. A incidência da doença foi medida a cada dois dias pela porcentagem de plantas com sintomas da doença. Além do teste de patogenicidade a gerânio, os isolados foram identificados em filotipos com a finalidade de verificar se os isolados capazes de infectar estas hospedeiras se agrupavam de maneira a explicar alguns dos comportamentos. Todas as cinco cultivares de gerânio foram suscetíveis, porém ocorreram variações quanto à resposta entre isolados. Os gerânios, em geral, são menos suscetíveis a todos os isolados quando comparados com batata e tomate. Dezenove dos 36 isolados infectaram uma ou duas das espécies testadas e 17 infectaram ao menos uma planta de todas as espécies hospedeiras avaliadas. Isolados das raças 1 e 3, biovares 1, 2 e 3, filotipos I e II, foram capazes de infectar o gerânio. A capacidade de isolados brasileiros da R3B2 de RS de infectar o gerânio faz com que sejam necessários métodos especiais para identificação e detecção da bactéria em viveiros de plantas visando a exportação. Não foi possível agrupar os isolados segundo suas características patogênicas e moleculares; então, é proposto que análises de genoma completo sejam realizadas para que pequenos deste, possam revelar a gama de hospedeiras.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 431416 bytes, checksum: ef204dc49faf9dccd4e32266cf30edf7 (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Plants have substances known as secondary metabolites which have diverse functions, among them to protect the plant against attack by pathogens. The use of plants as nematicides for nematode control has been extensively studied and the use of essential oils is an alternative for controlling nematodes in small areas. This study aimed to evaluate the effect of essential oils of wormwood, peppermint, oregano and thyme on the control of Meloidogyne javanica. Initially was assessed in vitro the nematicidal potential of these oils on hatching and mortality of juvenile nematodes. The essential oils were solubilized in dimethyl sulfoxide 2% and applied at the concentrations 0.05%, 0.25% or 0.5% in hatching and juvenile mortality tests. All oils tested reduced hatching and increased mortality of juveniles of M. javanica comparing to the control, for the three concentrations analyzed. Subsequently, the potential of these same oils was tested in a greenhouse in the suppression of the number of root galls and nematode eggs. Two methods were tested: foliar spray on tomato plants and direct addition of essential oils solutions into the soil. The essential oils were solubilized in 2% dimethyl sulfoxide and applied at the concentrations 0.05%, 0.25% or 0.5%, when applied by foliar sprays, and 0.25% and 0.5%, when added to soil. The oils were applied weekly for eight weeks. Sixty days after transplanting, plants were evaluated for shoot mass, root mass, number of galls and number of eggs. None of the oils suppressed the number of galls or eggs when they were applied by foliar sprays or when they were added directly into the soil. / As plantas possuem substâncias denominadas metabólitos secundários que possuem diversas funções, dentre elas a de proteger a planta contra o ataque de organismos patogênicos. O emprego de plantas com propriedades nematicidas para o controle de fitonematoides vem sendo muito estudado e o uso de óleos essenciais representa mais uma alternativa no controle de fitonematoides em pequenas áreas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito dos óleos essenciais de losna, hortelã-pimenta, orégano e tomilho no controle de Meloidogyne javanica. Inicialmente avaliou-se o potencial nematicida in vitro destes óleos sobre a eclosão e a mortalidade de juvenis do nematoide. Os óleos essenciais foram solubilizados em dimetil sulfóxido 2% e aplicados nas concentrações 0,05%, 0,25% ou 0,5%, nos testes de eclosão e de mortalidade dos juvenis. Todos os óleos testados reduziram a eclosão e aumentaram a mortalidade dos juvenis de M. javanica em relação à testemunha, nas três concentrações analisadas. Posteriormente, o potencial destes mesmos óleos foi testado em casa de vegetação na supressão do número de galhas radiculares e de ovos do nematoide. Dois métodos foram testados: pulverização foliar de tomateiros e adição direta ao solo das soluções dos óleos essenciais. Os óleos essenciais foram solubilizados em dimetil sulfóxido 2% e aplicados nas concentrações 0,05%, 0,25% ou 0,5%, quando aplicados via pulverização foliar, e 0,25% e 0,5%, quando adicionados ao solo. Os óleos foram aplicados semanalmente por oito semanas. Sessenta dias após o transplantio, as plantas foram avaliadas quanto à massa de parte aérea, massa de raiz, número de galhas e número de ovos. Nenhum dos óleos suprimiu o número de galhas ou de ovos quando foram aplicados via pulverização foliar nem quando foram adicionados diretamente ao solo.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1763198 bytes, checksum: a6cae95e6f8012cb14ce5b308bc9307a (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Mango wilt, caused by C. fimbriata, is a limiting factor to mango production in Oman, is here salinized soils predominant. As effect of salinity on disease intensity is unknown, we aimed to evaluate the effect of salinity on the disease in mango plants with different combinations rootstock x graft. Two experiments were carried out, E1 and E2. In both, we used five concentrations of NaCl (0, 15, 30, 45 and 60 mmol L-1) and three inoculation treatments (plants either uninoculated, inoculated in the rootstock, or inoculated in the graft). In E1, three cultivars were used as rootstocks ('Espada', 'Imbu' and 'Uba') and one as graft ('Haden'). In E2, Uba was used as rootstock and three cultivars were used as graft ('Palmer', 'Haden' and 'Tommy Atkins'). C. fimbriata was inoculated 10 cm above (graft inoculation) or below (rootstock inoculation) the grafting. The seedlings were kept in Hoagland solution in aerated hydroponic system. We run each experiment twice, each one in a completely randomized factorial design with four replicates (onde plant = one experimental unit). We assessed the time for the plants to wilt and die, length of lesions, and calculated the area under the disease progress curve and the rate of disease progression. At 0 and 90 days of exposure of the plant to the salt stress, we evaluated: plant height and diameter, and at 90 days the chlorophyll fluorescence and stomatal conductance. At the end of the experiments, we also determined: dry mass of the root and leaves, total dry matter, and content of N, P, K, Ca, Mg, Na and Cl in the root, stem, and leaves. The mango wilt intensity in the plants was greater when C. fimbriata was inoculated in the rootstock. There was a decrease in height, diameter, dry matter, and N, P, K, Ca and Mg with increasing concentrations of NaCl. In all cultivars evaluated disease symptoms were observed. In all situations in which Uba' was used as rootstock and 'Tommy Atkins' as graft, we detected lesser sensibility to salt stress and susceptibility to mango wilt. / A seca da mangueira, causada por Ceratocystis fimbriata, é o principal fator limitante à mangicultura em Omã. Nesse país, predominam os solos salinizados, e não se conhece o efeito da salinização na intensidade da doença. Assim, avaliou-se o efeito da salinidade sobre a doença em mudas de mangueiras, em diferentes combinações porta-enxerto x enxerto. Executaram-se dois ensaios, E1 e E2. Em ambos, usaram-se cinco concentrações de NaCl (0, 15, 30, 45 e 60 mmol L-1) e três condições de inoculação (sem inoculação, inoculação do porta-enxerto e inoculação do enxerto). Em E1, usaram-se três cultivares como porta-enxerto ( Espada , Imbu e Ubá ) e um como enxerto ( Haden ). Em E2, adotou-se Ubá como porta-enxerto e três cultivares ( Palmer , Haden e Tommy Atkins ) como enxerto. Inocularam-se as mudas, conduzidas em solução de Hoagland em sistema hidropônico aerado, com C. fimbriata a 10 cm acima (inoculação do enxerto) ou abaixo (inoculação do porta-enxerto) da marcação da enxertia. Executou-se cada ensaio por duas vezes, em esquema fatorial no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições (uma muda=uma unidade experimental). Avaliaram-se os tempos para murcha e morte das plantas e o comprimento de lesões, e se calcularam a área abaixo da curva de progresso e a taxa de progresso da doença. Aos 0 e 90 dias após exposição ao estresse salino, avaliaram-se: altura e diâmetro das plantas, calculando-se o incremento na altura e no diâmetro no período, e aos 90 dias, avaliaram-se o índice SPAD e a condutância estomática. Ao final dos ensaios, determinaram-se: massa seca da raiz, do porta-enxerto, do enxerto, das folhas, e total, bem como os teores de N, P, K, Ca, Mg, Na e Cl na raiz, caule do porta-enxerto, caule do enxerto e folhas. A intensidade da seca foi maior quando se inoculou o porta-enxerto. Houve menor crescimento, em termos de altura e diâmetro, decréscimo da massa seca e dos teores de N, P, K, Ca e Mg com o aumento das concentrações de NaCl. Em todos os cultivares avaliados, observaram-se sintomas da doença. No conjunto das características avaliadas, Ubá usada como porta-enxerto e Tommy Atkins como enxerto, foram menos sensíveis ao estresse salino e à doença.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 564659 bytes, checksum: 31244befb1d4ed5d4db341b47bfe84a9 (MD5) Previous issue date: 2009-07-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to determine the effect of silicon (Si) to reduce the symptoms of Panamá disease, caused by Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), on banana, besides the potentialization of some biochemical mechanisms of defense. Plants from cultivars Grande Naine (resistant) and Maçã (susceptible), were grown on plastic pots amended with 0 (-Si) and 0.39 g Si (+Si) per kg of soil and inoculated with Foc at 60 days after transplanting. Panamá disease progress (indirect and direct evaluations) and some biochemical determinations were performed. There was no difference between cultivars for Si concentration on the root system and on the rhizome-pseudostem, but Si concentration was higher on plants supplied with Si than on plants non-supplied with this element. Plants from cultivar Maçã showed the highest Si concentration on the pseudostem as compared to plants from cultivar Grande Naine . Calcium concentration on the root system and on the rhizomepseudostem was similar between plants from the two cultivars. The values for the variables area under reflex symptoms progress curve on leaves, area under symptoms progress on root system progress curve, and area under dark pseudostem progress curve were reduced in the presence of Si. Plants supplied with Si from both cultivars also showed reduced values for area under asymptomatic fungic colonization progress curve, area under relative lesion length progress curve, and area under Panamá disease progress curve. The concentration of pigments on leaves from the two cultivars supplied with Si was greater as compared to plants non supplied with this element. The concentration of malonic aldehyde and hydrogen peroxide was not different between the two cultivars supplied or not with Si. The concentration of total soluble phenolics and lignin-thioglycolic acid derivatives was greater on root system of plants from the two cultivars supplied with Si. The activities of the enzymes phenylalanine ammonia lyase, peroxidase, polyphenoloxidase, glucanase, and chitinase on the root system of the two cultivars were not potentiated by Si. The results of this study show an effect of Si to potentiate defense responses of banana to Foc, especially for the susceptible cultivar through the reduction of disease symptoms in association with a greater lignification and production of phenolics on the root system. / O objetivo deste trabalho foi estudar o efeito do silício (Si) em reduzir os sintomas do mal do Panamá, causado por Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), em bananeira, além da potencialização de mecanismos bioquímicos de defesa. Plantas das cultivares Grande Naine (resistente) e Maçã (suscetível), foram crescidas em solo contendo 0 (-Si) e 0,39 g Si (+Si)/kg de solo e foram inoculadas com Foc aos 60 dias após o transplantio. A avaliação do progresso do mal do Panamá (avaliado de forma indireta e direta) e as determinações bioquímicas foram realizadas posteriormente. Não houve diferença na concentração de Si no sistema radicular e no rizomapseudocaule entre as duas cultivares de bananeira, mas a concentração desse elemento foi maior em plantas supridas com Si quando comparadas com as não supridas. Plantas da cultivar Maçã apresentaram maior concentração de Si no rizoma-pseudocaule quando comparadas com plantas da cultivar Grande Naine. A concentração de cálcio no sistema radicular e no rizoma-pseudocaule foi similar entre as plantas das duas cultivares. As variáveis área abaixo da curva do progresso dos sintomas reflexos nas folhas, área abaixo da curva do progresso dos sintomas no sistema radicular e a área abaixo da curva do progresso do escurecimento do rizoma foram reduzidas somente nas plantas supridas com Si. O fornecimento de Si às plantas das duas cultivares também reduziu as variáveis área abaixo da curva do progresso da colonização fúngica assintomática, área abaixo da curva do progresso do comprimento relativo de lesão e a área abaixo da curva do progresso do mal do Panamá. A concentração de pigmentos nas folhas das plantas das duas cultivares supridas com Si foi maior em comparação com as plantas não supridas. A concentração de aldeído malônico e peróxido de hidrogênio não diferiu entre as duas cultivares supridas ou não com Si. A concentração de CFST e dos DLATG foi maior no sistema radicular das plantas das duas cultivares supridas com Si. Não houve efeito pronunciado do Si em potencializar a atividade das enzimas FAL, PER, PFO, GLU e QUI no sistema radicular das plantas das duas cultivares. Os resultados deste trabalho sugerem um efeito do Si em potencializar respostas de defesa da bananeira à Foc, principalmente para a cultivar suscetível, através da redução dos sintomas da doença associada com uma maior lignificação e produção de compotos fenólicos no sistema radicular.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1555014 bytes, checksum: 0c6c5a8ef13ff1e9dfba0b83360516de (MD5) Previous issue date: 2007-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Evidence is presented to show that Hemileia vastatrix, the causal agent of coffee leaf rust, has two types of teliospores in the life cycle: thin and smooth-walled, globose to napiform teliospores typically germinating with a four-celled promycelium (basidium), each cell producing a sterigma and basidiospore; thick-walled, ornamented, sub-reniform uredinioid teliospores. Caryological studies using Giemsa staining and image cytometry demonstrate that the first division of meiosis occurs in the uredinioid teliospores, and the second division only takes place after germination in the appressorium (delayed meiosis). The intent of examining the caryological status of H. vastatrix spores through flux cytometry was not implemented because this technique dependended on protoplast isolations that proved impossible with the treatments that were attempted for this fungus. Factors affecting the frequency and type of germination (mycelial versus appressorial) and of the uredinioid teliospores were investigated and analysed. Most germinate in the dark at temperatures between 22 and 26 oC, and appressorial formation is obtained under low temperatures (22 oC), in the dark. Teliospores were recorded from various localities in Minas Gerais, confirming the previous dubious record of the occurrence of this spore type in Brazil, and their occurrence appeared to be conditioned by the changing humidity during periods of lower temperatures in the winter and spring. A significant proportion of teliospores showed abnormal germination; the number of promycelial cells varying from three to seven, with or without the production of sterigmata and basidiospores. This body of information may explain the high number of races identified thus far in H. vastatrix, a supposedly functionally asexual fungus that produces non-functional basidiospores, according to the current views. The existence of an additional process allowing genetic recombination might explain the emergence of new races and the continuing breakdown of resistance in new coffee varieties. / Produziram-se evidências de que Hemileia vastatrix, o agente etiológico da ferrugem do cafeeiro, tem dois tipos de teliósporos no seu ciclo de vida: teliósporos globosos a napiformes de paredes finas e lisas e que germinam tipicamente pela formação de um promicélio (basídio) com quatro células, cada qual produzindo um esterigma sobre o qual um basidiósporo é produzido e teliósporos uredinóides subreniformes com parede espessa lisa ventralmente e equinulada dorsalmente. Estudos cariológicos usando corante Giemsa e citometria de imagem demonstraram que em teliósporos uredinóides a primeira divisão da meiose ocorre nos esporos e a segunda divisão ocorre apenas depois da germinação no apressório. A proposta de examinar o status cariológico de esporos de H. vastatrix pela citometria de fluxo não foi implementada, pois dependia do prévio isolamento de protoplastos, que foi impossível com os tratamentos testados para este fungo. Fatores que afetam a freqüência e o tipo de germinação (micelial versus apressorial) dos teliósporos uredinóides foram investigados e analisados. A maior proporção de germinação foi obtida no escuro entre 22 e 26 oC e a formação de apressorios foi obtida sob temperaturas amenas próximo de 22 oC no escuro. Teliósporos foram coletados em várias localidades em Minas Gerais, confirmando o relato, até então duvidoso, de ocorrência deste tipo de esporo no Brasil. Sua ocorrência pareceu condicionada a mudanças em condições de umidade em períodos de temperatura mais baixa no inverno e na primavera. Uma significativa proporção dos teliósporos apresentou um padrão de germinação anormal com um número de células no promicélio variando de três a sete, com ou sem produção de esterigmas e basidiósporos. O conjunto de observações efetuadas neste trabalho pode contribuir para explicar a ocorrência de um número relativamente grande de raças reconhecido para H. vastatrix que seria de acordo com o conceito usualmente aceito funcionalmente estritamente assexuado, produzindo basidiósporos não funcionais. A existência de um processo adicional para promoção da recombinação genética poderia explicar o aparecimento de novas raças e a continuada quebra de resistência em novas variedades de cafeeiro.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 776205 bytes, checksum: bdeb274d6dc080817dbbde35d5621b65 (MD5) Previous issue date: 2012-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cucumber plants grown in greenhouse conditions are often infected by Botrytis cinerea, which causes the gray mold. The disease is controlled by successive applications of fungicides. In the perspective of integrated management of gray mold, we studied the effects of the interaction Clonostachys rosea, Silicon (Si) and Botrytis cinerea on disease severity. When Si and C. rosea were applied alone or together, the incubation period of disease was increased. When C. rosea was applied, the incubation period increased about 63h and gray mold severity and electrolyte leakage were significantly reduced. The application of either C. rosea or Si alone increased the activity of poliphenoloxidase, peroxidase, chitinase and β-1,3- glucanase, and reduce disease severity, area under the curve of progress of disease (AUCPD), and rate of gray mold progress. The application of just C. rosea was promoted plant growth, considering the dry mass of root system, stem length and dry mass of stems. The antagonist colonized endophytically cucumber plants; the frequency of colonization was higher in the inoculated with B. cinerea then in the uninoculated plants. We conclude that C. rosea is a potential biological control agent of cucumber gray mold that can be endophytic and can promote the growth of cucumber plants. / Plantas de pepino sob cultivo protegido são frequentemente infectadas por Botrytis cinerea, que causa o mofo cinzento. Controla-se a doença com sucessivas aplicações de fungicidas. No contexto do manejo integrado do mofo cinzento, estudou-se o efeito da interação Clonostahcys rosea, Silício (Si) e B. cinerea na severidade da doença. Quando se aplicaram Si e C. rosea isolados ou em conjunto, aumentou-se o período de incubação da doença. Com a aplicação de C. rosea, o período de incubação aumentou-se em aproximadamente 63 h e se reduziram significativamente a severidade do mofo cinzento e o extravasamento de eletrólitos. Com a aplicação isolada de C. rosea ou de Si aumentou-se a atividade de polifenoloxidase, peroxidade, quitinase e β-1,3-glucanase e reduziram-se a severidade, a área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) e a taxa de progresso do mofo cinzento. Quando se aplicou C. rosea isoladamente, ocorreu promoção do crescimento de plantas, considerando-se a massa seca do sistema radicular, o comprimento da parte aérea, e a massa seca da parte aérea. O antagonista colonizou plantas endofiticamente e a frequência de colonização foi maior nas plantas inoculadas com B. cinerea que nas não inoculadas. Conclui-se que C. rosea é um potencial agente de controle biológico do mofo cinzento do pepino, que pode ser endofítico em plantas de pepino e promover seu crescimento.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T12:12:51Z No. of bitstreams: 1 Edilaine Alves de Melo.pdf: 1863538 bytes, checksum: 476bedde1fcd3c589dccc20a040c7c20 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T12:12:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edilaine Alves de Melo.pdf: 1863538 bytes, checksum: 476bedde1fcd3c589dccc20a040c7c20 (MD5) Previous issue date: 2016-07-27 / The black rot (Xanthomonas campestris pv. campestris) has caused great losses on brassica crops in the state of Pernambuco, Brazil. The knowledge of genetic diversity of this pathogen, population structure and pathogenic variability in the producing areas are very important because it will support disease control strategies, mainly the development and use of resistant cultivars. The objectives of the present study were: a) to analyze the genetic structure of populations of 159 isolates of Xanthomonas campestris pv. campestris from the state of Pernambuco, through genomic profiles of BOX-PCR; b) to infer phylogenetic relationship among these isolates and other X. campestris pathovars (aberrans, armoraciae, raphani, barbareae e incanae) using the MLSA technique with six housekeep genes (atpD, dnaK, gyrB, rpoD, tpiA e fyuA). The 159 isolates of brassica (broccoli, cabbage-leaf, cauliflower and cabbage) were obtained from the main producing cities of Pernambuco. Through the genotyping of BOX-PCR showed a high variability of X. campestris pv. campestris. Population analysis revealed a high richness of haplotypes and genetic diversity of this bacteria. It was possible to observe the migration of these haplotypes between cities. There were strong indications of random mating and therefore high recombinogenic capacity in this species. It was not observed the structure of populations related to cities or hosts. Also have not existed genetic differentiation among populations and the analysis of molecular variance (AMOVA) showed that most of the variation was within subpopulations. The MLSA analysis demonstrated a high diversity in X. campestris pv. campestris isolates revealing two groups in this patovar, its close relationship with patovar aberrans, and its distinction from pathovars raphani, barbareae and incanae. / A podridão negra, causada pela bactéria Xanthomonas campestris pv. campestris, tem causado grandes perdas aos cultivos de brássicas no estado de Pernambuco, Brasil. Portanto, é de extrema importância obter conhecimentos sobre a diversidade genética e estrutura de população do patógeno que forneçam dados relevantes para direcionar as estratégias de controle da podridão negra em brássicas, principalmente o desenvolvimento e uso de cultivares resistentes ao patógeno. O presente estudo teve como objetivos: a) analisar a estrutura genética de populações de 159 isolados de Xanthomonas campestris pv. campestris do estado de Pernambuco, utilizando perfis genômicos de BOX-PCR; b) inferir relações filogenéticas entre isolados de X. campestris pv. campestris do estado de Pernambuco e outros patovares da espécie (aberrans, armoraciae, raphani, barbareae e incanae) através de seis genes housekeeping (atpD, dnaK, gyrB, rpoD, tpiA e fyuA) utilizando a técnica MLSA. Os 159 isolados de brássicas (brócolis, couve-comum, couve-flor e repolho) foram obtidos dos principais municípios produtores no estado de Pernambuco. A genotipagem através de BOX-PCR revelou uma alta variabilidade de X. campestris pv. campestris. Análises de populações revelaram uma alta riqueza de haplótipos e diversidade genética dessa bactéria. Foi possível observar a migração desses haplótipos entre municípios. Houve forte indício de acasalamento aleatório e, consequentemente, alta capacidade recombinogênica dessa espécie. Não foi possível observar a estrutura das populações para municípios ou hospedeiros. Também não existiu diferenciação genética entre as populações e a análise de variância molecular (AMOVA) demonstrou que grande parte da variação ocorreu dentro das subpopulações. As análises MLSA demonstraram uma alta diversidade para os isolados de X. campestris pv. campestris revelando dois grupos desse patovar, o estreito relacionamento do mesmo com o patovar aberrans, e a distinção do patovar campestris dos patovares raphani, barbareae e incanae.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T12:42:51Z No. of bitstreams: 1 Walkiria Alves da Silva.pdf: 874748 bytes, checksum: 5da61c26a69ee185c1ff223877497242 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T12:42:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Walkiria Alves da Silva.pdf: 874748 bytes, checksum: 5da61c26a69ee185c1ff223877497242 (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / The onion is the third vegetable in economic importance on the world, with emphasis on Brazil as one of the most economically important vegetable, both by the volume and the income produced. This culture can be affected by various diseases, especially the scale rot, caused by bacteria of the Burkholderia cepacia complex. In an attempt to determine the favorable conditions for the development of epidemics, the knowledge of host-pathogen-environment interaction is essential. Thus, the appropriate inoculum concentration, the temperature range, the period of humidification exposure and the age, which the plant host becomes more susceptible to the establishment of high levels of disease, should be identified for each host-pathogen association. Although these epidemiological characteristics are the key factors for infection and subsequent development of rot in scale, there is no consistent information about the influence of these parameters on the behavior of the disease. Therefore, this study aimed to select and identify six isolates of B. cepacia complex, and determine the in vitro temperature, evaluate the effect of the inoculum concentration, temperature, presence and exposure to moisture chamber and the age of the bulbs in the severity of scale rot onion. Through Bayesian inference, the isolates CRMB31, and CRMB109 CRMB259 were identified as B. cenocepacia, while the isolates CRMB76, and CRMB199 CRMB222 were identified as B. arboris. The optimum temperature for in vitro growth of the isolates B. cenocepacia was 30°C, while for the isolates of B. arboris was 28°C. The conditions that predispose the occurrence of rot severity scale at higher inoculum were load of 108 CFU/mL, together on a wetness of 48 h, temperature between 35 and 40°C and more young tissues. To our knowledge, this is the first study to determine the environmental factors favorable to the development of rot in onion scale. In addition, the information obtained in this study will be useful for understanding the epidemics of the rot in scale and will assist in the implementation of strategies to control the disease. / A cebola é a terceira hortaliça em importância econômica no mundo, tendo destaque no Brasil como uma das hortaliças economicamente mais importantes, tanto pelo volume produzido como pela renda gerada. Esta cultura pode ser acometida por várias doenças, destacando-se a podridão em escama causada por bactérias do complexo Burkholderia cepacia. Na tentativa de determinar as condições favoráveis ao desenvolvimento de epidemias, o conhecimento da interação patógeno-hospedeiro-ambiente é imprescindível. Assim sendo, a concentração de inóculo adequada, a faixa de temperatura, o período de exposição à umidificação e a idade em que a planta hospedeira se torna mais suscetível para o estabelecimento de altos níveis de doença devem ser definidos para cada associação patógeno-hospedeiro. Embora essas características epidemiológicas sejam fatores primordiais para infecção e posterior desenvolvimento da podridão em escama, não existem informações consistentes a respeito da influência desses parâmetros sobre o comportamento da doença. Portanto, o presente trabalho teve como objetivos selecionar e identificar seis isolados do complexo B. cepacia e determinar a temperatura in vitro, avaliar o efeito da concentração de inóculo, temperatura, presença e tempo de exposição à câmara úmida e idade dos bulbos na severidade da podridão em escama da cebola. Por meio de Inferência Bayesiana, os isolados CRMB31, CRMB109 e CRMB259 foram identificados como B. cenocepacia, enquanto os isolados CRMB76, CRMB199 e CRMB222 foram identificados como B. arboris. A temperatura ideal de crescimento in vitro para os isolados de B. cenocepacia foi de 30°C, enquanto para os isolados de B. arboris foi de 28°C. As condições que predispuseram a ocorrência de severidade da podridão em escama mais elevadas foram carga de inóculo de 108 UFC/mL, em conjunto com um período de molhamento de 48 h, temperaturas entre 35 e 40°C e tecidos mais novos. Para o nosso conhecimento, este é o primeiro estudo realizado para determinação dos fatores ambientais favoráveis ao desenvolvimento da podridão em escama da cebola. Além disso, as informações obtidas neste estudo serão úteis para o entendimento de epidemias da podridão em escama e auxiliarão a implementação de estratégias para o controle da doença.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T12:59:54Z No. of bitstreams: 1 Dyana de Albuquerque Tenorio.pdf: 1359840 bytes, checksum: 2d9414b172e6c51ef868267286f6ef2b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T12:59:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dyana de Albuquerque Tenorio.pdf: 1359840 bytes, checksum: 2d9414b172e6c51ef868267286f6ef2b (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / The damping-off and stem rot caused by the soil pathogen Rhizoctonia solani, is considered one of the most important diseases of common bean (Phaseolus vulgaris) and cowpea (Vigna unguiculata), being one of the factors that contribute to the low productivity of these crops. This study aimed to characterize isolates of the causal agent of damping-off and stem rotof beans in the rural area of Pernambuco State, using microsatellite markers and phylogenetic analysis; and evaluate the use of yeasts in the control of the causal agent of damping-off and stem rot of beans. In bean growing areas of the southern region of Pernambuco, there were collections of plants with symptoms of damping-off and stem rot. Thirty-four fungal isolates were identified as Rhizoctonia. In the phylogenetic analysis, the sequences of ITS rDNA region of isolates were similar to at least three anastomosis groups (AG4 HG-I, AG3-PT and AG4 HG-III). In microsatellite analysis, five sets of primers (TC_AG3_1, TC01, TC06, TC11 and TC_AG3_09) amplified a total of 13 bands, showing genetic variation. Seventy R. solani were evaluated for aggressiveness, being the isolate CMM-3643 selected to the biological control trials. Seventy yeast isolates were obtained from apparently asymptomatic bean plants. From these, were chosen only isolates where the disease severity index was ≤ 25%. Experimental tests showed that the three yeast isolates (C6A, FVF10 (R1), FVC10) were selected as promising biocontrol agents of damping-off and stem rot of cowpea (cv. IPA-207), being efficient in controlling the disease caused by isolated CMM -3643. Increases in the levels of POX and CAT enzymes by treating the seeds with FVF10 yeast (R1), as well as, the absence of antibiosis mechanisms suggests that the biocontrol mechanism in question is the induction of disease resistance. In view of the results it is concluded that the AG4 HG-I is the primary anastomosis group causing damping-off and stem rot of beans in the São João municipality, Pernambuco State. In addition, this is the first report of damping-off and stem rot symptoms reduction in cowpea seedlings due to the antagonistic action of yeasts against R. solani. / A rizoctoniose, causada pelo fungo de solo Rhizoctonia solani, é considerada uma das doenças mais importantes do feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) e do feijoeiro-caupi (Vigna unguiculata), sendo um dos fatores responsáveis pela baixa produtividade da cultura. O presente trabalho teve como objetivos: caracterizar isolados do agente causal da rizoctoniose do feijoeiro na região do agreste de Pernambuco, utilizando marcadores microssatélites e análise filogenética; e avaliar o uso de leveduras no controle do agente causal da rizoctoniose do feijoeiro. Em áreas de cultivo do feijoeiro da região do agreste meridional de Pernambuco, realizaram-se coletas de plantas com sintomas da rizoctoniose. Sendo obtidos 34 isolados fúngicos identificados como Rhizoctonia. Na análise filogenética, as sequências gênicas da região ITS do rDNA destes isolados foram similares a pelo menos três grupos de anastomose (AG4 HG-I, AG3-PT e AG4 HG-III). Na análise de microssatélites, cinco conjuntos de iniciadores (TC_AG3_1, TC01, TC06, TC_AG3_09 e TC11) amplificaram um total de 13 bandas, observando-se variação genética. Setenta isolados de R. solani foram avaliados quanto a agressividade, sendo selecionado o isolado CMM-3643 para o ensaio de controle biológico. Foram obtidos 70 isolados de leveduras de plantas de feijoeiro aparentemente assintomáticas, destes foram escolhidos os que proporcionaram índice de severidade da doença ≤ 25%. Ensaios experimentais demonstraram que os três isolados de leveduras (C6A, FVF10 (R1), FVC10) selecionados foram promissores como agentes de biocontrole da rizoctoniose do feijoeiro-caupi (cv. IPA-207), apresentando eficiência no controle da doença causada pelo isolado CMM-3643. Aumentos nos níveis das enzimas POX e CAT pelo tratamento das sementes com a levedura FVF10 (R1), assim como a ausência de mecanismos de antibiose, sugere que o mecanismo de biocontrole em questão é a indução de resistência da planta. Com base nas avaliações realizadas concluiu-se que o AG4 HG-I é o principal grupo de anastomose da rizoctoniose do feijoeiro no município de São João. Além disso, este é o primeiro relato da redução dos sintomas da rizoctoniose em plântulas de feijoeiro-caupi pela ação antagônica de leveduras sobre R. solani.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T13:13:21Z No. of bitstreams: 1 Celma Cardoso Peixoto.pdf: 1809049 bytes, checksum: 2c1b8859bd46d99b602026bcba5684c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T13:13:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Celma Cardoso Peixoto.pdf: 1809049 bytes, checksum: 2c1b8859bd46d99b602026bcba5684c1 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Early blight caused by species from Alternaria genus affects several solanaceous of economic importance. Previous studies have shown that the species A. tomatophila and A. grandis prevail as causal agents of disease on tomato and potato, respectively. The control of this disease is based on the use of protective and systemic fungicides. However, there are reports of the existence of other species of Alternaria causing early blight in plants of the Solanácea family. This study aimed to perform molecular, morphological and biological characterization of Alternaria isolates from cultivated and wild solanaceous from different regions of Brazil. Molecular characterization of the isolates was done by sequencing and phylogenetic analysis of the genes Alt a1, GPD and Calmodulin. Morphological characterization was performed by measurement of dimensions of the conidia and quantification of the number of septa and rostrums. Biological characterization of Alternaria isolates was done by evaluation of host range and by the in vitro sensitivity to tebuconazole. Phylogenetic analysis of the genes Alt a1, GPD and Calmodulin allowed the identification of the species A. tomatophila, A. mimicula and A. dauci from tomato, and the species A. grandis and A. solani from potato and from lobeira, respectively. Morphologic caracteristics of most isolates corroborate the molecular characterization. The isolate EH1642-BA, identified as A. solani, was able to cause early blight on all solanaceous hosts evaluated except the sweet pepper. EH1823-CE of the specie A. tomatophila and EH1548-DF of A. grandis isolates from tomato and potato, respectively, had not specificity for their original host plants. However, the isolates EH1143-RS of the specie A.dauci and EH1377-CE of A. mimicula showed specificity for original host causing typical symptoms of early blight only on tomato. Alternaria isolates from tomato and eggplant caused disease on wild invasive solanaceous Datura stramonium and Physalis pubescens and isolates from D. stramonium and Nicandra physaloides caused symptoms of early blight on tomato, potato and jiló. In the sensitivity tests to the fungicide tebuconazole in general the isolates showed high sensitivity under in vitro conditions. The results obtained in this study confirmed the occurrence of A. tomatophila and A. grandis as causal agents of early blight on tomato and potato, respectively, and in this work were detected for the first time in Brazil the presence of A. dauci and A. mimicula associated with the disease on tomato. It has been found that some wild solanaceous can act as pathogen inoculum sources and the tebuconazole was efficient in the in vitro control for the isolates evaluated. / A pinta-preta, causada por fungos do gênero Alternaria, afeta diversas solanáceas importantes economicamente e as espécies A. tomatophila e A. grandis prevalecem como agentes causais da doença em batateira e tomateiro, respectivamente. O controle se baseia no uso de fungicidas protetores e sistêmicos. Todavia, existem relatos da existência de outras espécies de Alternaria causando pinta-preta em plantas da família Solanácea. O presente trabalho teve como objetivos realizar a caracterização molecular, morfológica e biológica de isolados de Alternaria oriundos de solanáceas cultiváveis e silvestres de diferentes regiões do Brasil. A caracterização molecular foi feita mediante sequenciamento e análises filogenéticas das regiões Alt a 1, GPD e Calmodulina. A caracterização morfológica foi conduzida por meio da mensuração das dimensões dos conídios e quantificação do número de septos e rostros. Na caracterização biológica realizou-se a avaliação da gama de hospedeiras solanáceas e testes in vitro de sensibilidade ao fungicida tebuconazole. As análises filogenéticas dos genes Alt a 1, GPD e Calmodulina possibilitaram a identificação das espécies A. tomatophila, A. mimicula e A. dauci oriundos de tomateiro, e também das espécies A. grandis e A. solani provenientes de batateira e lobeira. As características morfológicas da maioria dos isolados concordaram com a caracterização molecular. O isolado EH1642-BA identificado como A. solani foi capaz de causar pinta-preta em todos os hospedeiros exceto o pimentão. Já o EH1823-CE da espécie A. tomatophila e o EH1548-DF de A. grandis provenientes de tomateiro e batateira não apresentaram especificidade para as duas plantas hospedeiras originais. Contudo, os isolados EH1143-RS da espécie A.dauci e EH1377-CE de A. mimicula mostraram especificidade por hospedeira de origem ocasionando sintomas típicos da pinta-preta apenas em tomateiro. Isolados obtidos de tomateiro e berinjela causaram doença nas invasoras silvestres Datura stramonium e Physalis pubescens e isolados originários de D. stramonium e Nicandra physaloides provocaram sintomas em tomateiro, batateira e jiló. Em relação à sensibilidade ao tebuconazole verificou-se que em termos gerais os isolados apresentaram alta sensibilidade ao produto sob condições in vitro. Os resultados obtidos no presente estudo confirmaram a ocorrência de A. tomatophila e A. grandis como agentes causais da pinta-preta em tomateiro e batateira e foram detectadas pela primeira vez no Brasil a presença das espécies A. dauci e A. mimicula associadas à doença em tomateiro. Verificou-se ainda que solanáceas invasoras podem atuar como fontes de inóculo do patógeno e que o tebuconazole apresentou eficiência no controle in vitro para todos os isolados avaliados.