Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T13:39:39Z No. of bitstreams: 1 Monique Bezerra Nascimento.pdf: 1822147 bytes, checksum: 8f2d6b8a88935d10d34decf26f6730b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T13:39:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Monique Bezerra Nascimento.pdf: 1822147 bytes, checksum: 8f2d6b8a88935d10d34decf26f6730b3 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The grapevine (Vitis spp.) virus diseases affect severely the production, the quality of the grape and reduce the life of the vineyards. In Brazil, among them, the complexes of rugose wood caused by Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB) and Grapevine virus D (GVD) and the leafroll, caused by Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV) and Grapevine leafroll-associated virus -1 to -4, -4 strain 5 (GLRaV-1 to -4, -4 strain 5) are very important. The first part of the present work had the objectives of evaluating the effects of these viruses on agronomic traits, such as, fresh weight of the bunch, °Brix, weight of pruned branches, stem diameters of rootstock and canopy, in symptomatic and asymptomatic plants in Niagara Rosada and Merlot vineyards, and to survey commercial nurseries for GRSPaV, GVA, GVB, Grapevine fleck virus (GFkV) and GLRaV-3. All plants were indexed by real-time RT-PCR. Asymptomatic infected grapevines, however, were affected negatively by the viral infection, but to a lesser intensity in comparison with the symptomatic ones. The nurseries presented a high incidence of GRSPaV and GVA, being characterized as sources of inoculum for vineyards formed with these materials. The second part of the work aimed the molecular characterization of isolates of the following viruses: Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), agent of rose mosaic (Rosa sp.), obtained from rose; GRSPaV, GVA and GLRaV-2, from symptomatic and asymptomatic grapevine plants. Despite the economic importance of PNRSV for stone fruit trees in Brazil, only peach isolates have been molecular characterized in Brazil, it was observed high percentages of identity, among the isolates GRSPaV, GVA and GLRaV-2, which made it difficult to explain the variation in symptom expression or their absence, based on the sequence differences. In this study, it was conducted, for the first time, the molecular characterization of the complete genes to the coat protein (CP) and movement protein (MP) of a Brazilian PNRSV isolate obtained from rose. The obtained results demonstrated the high importance of using virus-free propagative materials to achieve the highest agronomic potential of the grapevine cultivars and to reduce losses caused by these pathogens. / As viroses da videira (Vitis spp.) afetam severamente a produção, a qualidade da uva e diminuem a vida útil dos vinhedos. No Brasil, destacam-se, o complexo do lenho rugoso, causados por Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB) e Grapevine virus D (GVD), e o enrolamento das folhas, causado por Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine leafroll-associated virus -1 ao -4, -4 estirpe 5 (GLRaV-1 ao -4, -4 estirpe 5). A primeira parte do presente trabalho teve como objetivos avaliar os efeitos destes vírus sobre as variáveis agronômicas relacionadas ao vigor da planta, tais como, peso fresco do cacho, °Brix, peso de ramos podados, diâmetros do tronco do porta-enxerto e da copa, em plantas sintomáticas e assintomáticas em vinhedos das cultivares Niágara Rosada e Merlot, além do levantamento de vírus em matrizeiros comerciais para GRSPaV, GVA, GVB, Grapevine fleck virus (GFkV) e GLRaV-3. Todas as plantas foram indexadas por RT-PCR em tempo real. Videiras assintomáticas, porém infectadas, foram afetadas negativamente pela infecção viral, porém em menor intensidade, quando comparadas com as sintomáticas. Os matrizeiros testados apresentaram alta incidência de GRSPaV e GVA, ficando caracterizados como fontes de inóculo destes patógenos para vinhedos formados com esses materiais. Na segunda parte do trabalho, visou-se a caracterização molecular de isolados dos seguintes vírus: Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), agente do mosaico da roseira (Rosa sp.), obtido da roseira; GRSPaV, GVA e GLRaV-2, de videiras sintomáticas e assintomáticas. Apesar da importância econômica do PNRSV para as fruteiras de caroço no Brasil, apenas isolados brasileiros, obtidos de pessegueiro, tinham sido caracterizados molecularmente. Dentro de cada espécie, os isolados de GRSPaV, GVA e GLRaV-2 demonstraram altas porcentagens de identidade, de modo que, as diferenças entre eles, dificilmente, explicariam as variações na expressão e ausência de sintomas. Neste estudo, foi realizada pela primeira vez a caracterização molecular dos genes completos da capa proteica (CP) e da proteína de movimento (MP) de um isolado brasileiro do PNRSV, obtido em roseira no Brasil. Os resultados obtidos demonstraram a utilização de material propagativo livre de vírus como opção para atingir o melhor potencial agronômico das cultivares de videira e reduzir perdas ocasionadas por estes patógenos.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T14:07:58Z No. of bitstreams: 1 Michelle Barros Pantoja.pdf: 1641953 bytes, checksum: 3ccb5972f0e3ceb3779eebd3c7ee502f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T14:07:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Michelle Barros Pantoja.pdf: 1641953 bytes, checksum: 3ccb5972f0e3ceb3779eebd3c7ee502f (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The peanut (Arachis hypogaea) is an oleaginous plant belonging to the Fabaceae family, native to South America. Its kernels are widely used as a food source and the production of oil. The main producing countries are China, India and the United States, which occupy the 1st, 2nd and 3rd places, respectively, in the ranking of world production. Brazil occupies the 17th position, in which the State of São Paulo stands out with 95% of total production of the country. The peanut is infected by several virus species, which limit the development of the crop in different parts of the world. The objective of this study was to detect the presence of virus in peanut plants in 10 counties of the State of São Paulo. Thirty-five samples (s) from 18 fields (f) were analyzed from Santa Adélia (3f/6s), Lusitânia (1f/1s), Jaboticabal (3f/6s), Itápolis e Pindorama (1f/2s, each), Tupã (4f/8s), Rancharia e Marília (1f/2s, each), Guaimbê (2f/4s) and Guarantã (1f/2s). The maintenance of the virus isolates was done in peanut plants graft inoculated. The isolates were submitted to biological, serological e molecular analyses. For host range study, Lactuca sativa, Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum, N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana and Solanum sculentum were mechanically inoculated and the symptoms analyzed. Based on Dot-ELISA results, the presence of the tospoviruses Groundnut ringspot virus (GRSV) (16s), Tomato chlorotic spot virus (TCSV) (6s) and do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3s) was detected. The comparison of the sequence obtained in the RT-PCR test with those deposited in the GenBank, revealed the occurrence of the GRSV. Furthermore, the metagenomic analysis showed the presence of the GRSV, as well as, the potyvirus Peanut motlle virus (PeMoV), both with complete genome. / O amendoim (Arachis hypogaeae L.) é uma oleaginosa pertencente à família Fabaceae, originária da América do Sul. Seus grãos são muito utilizados como fonte de alimento e na produção de óleo. Os principais países produtores são China, Índia e Estados Unidos, que ocupam o 1°, 2° e 3º lugar, respectivamente. O Brasil situa-se na 17ª posição, tendo o Estado de São Paulo contribuído com 95% da produção total do país. O amendoim é hospedeiro de um grande número de espécies de vírus, que limitam o desenvolvimento da cultura em diferentes partes do mundo. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença de vírus em plantas de amendoim oriundas de 10 municípios paulistas, sendo analisadas amostras (am) de campos (cam) de Santa Adélia (3cam/6am), Lusitânia (1cam/1am), Jaboticabal (3cam/6am), Itápolis e Pindorama (1cam/2am, cada), Tupã (4cam/8am), Rancharia e Marília (1cam/2am, cada), Guaimbê (2cam/4am) e Guarantã (1cam/2am). Plantas de amendoim foram usadas para manutenção dos isolados virais, empregando-se transmissão sucessivas por meio de enxertias. Os isolados foram submetidos a análises biológicas em gama de hospedeiros, sorológicas pelo método Dot-ELISA e moleculares por RT-PCR e metagenômica. Os hospedeiros indicadores testado foram: Lactuca sativa, Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum, N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana e Solanum sculentum. Com base nos resultados do teste Dot-ELISA foi detectada a presença dos tospovírus Groundnut ringspot virus (GRSV) (16am), Tomato chlorotic spot virus (TCSV) (6am) e do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3am). Ao ser comparado os resultados obtidos no sequenciamento (Macrogen) do fragmento obtido no teste RT-PCR, com as sequências disponíveis no GenBank, ficou comprovada ocorrência do GRSV. Por outro lado, a análise metagenômica confirmou a presença do GRSV e detectou o potyvírus Peanut motlle virus PeMoV), ambos com genoma completo.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T12:20:35Z No. of bitstreams: 1 Ana Leticia Rocha Monteiro.pdf: 843207 bytes, checksum: 5edb6fa96d360ea08be8b1ddf9cade76 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T12:20:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Leticia Rocha Monteiro.pdf: 843207 bytes, checksum: 5edb6fa96d360ea08be8b1ddf9cade76 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose is a major post-harvest diseases of strawberry, causing various losses and limiting the quality of the fruit. Besides the lack of studies on climatic conditions that favor the disease, lack of active ingredients registered for the management of the disease in Brazil defines the need to search for alternative control. This study aimed to study the influence of inoculum concentration, temperature and leaf wetness period and to evaluate the effect of gamma radiation on the severity of anthracnose caused by Colletotrichum acutatum in postharvest strawberry, and influence of this treatment on the physical attributes -chemical such as pH, total soluble solids (TSS), titratable acidity (TA) and TSS / TA. Inoculum concentrations tested were 102, 10³, 104, 105,106 and 107 spores / mL, for the fruits wet period were submitted to: 0, 12, 24, and 36 h of incubation, the influence of temperature on disease severity The fruits were incubated under controlled temperature for 12, 15, 20 and 25 ° C. In the control fruits with gamma radiation received doses: 0.25, 0.50, 0.75, 1.0, and 1.25 kGy in two stages: immediate and six hours after the inoculation of the fungus. The control treatment did not receive doses of gamma radiation. Disease severity was significantly influenced by the higher concentration of inoculum (107 spores / ml), incubation temperature and the wetness of the fruit, with larger lesions in the fruits exposed to 25 ° C and 36 h. The irradiation the best treatments were performed immediately after inoculation, highlighting the dose of 1.25 kGy. Treatment with gamma radiation did not alter the chemical characteristics of fruits analyzed in this study. Thus, these treatments can be given for the post-harvest treatment of strawberry. / A antracnose é uma das principais doenças pós-colheita do morango, causando diversas perdas e limitando a qualidade do fruto. Além da falta de estudos das condições climáticas que favorecem a doença, a falta de princípios ativos registrados para o manejo da doença no Brasil define a necessidade da busca de controle alternativo. Neste estudo objetivou-se estudar a influência da concentração de inóculo, temperatura e do período de molhamento, bem como, avaliar o efeito da radiação gama na severidade da antracnose causada por Colletotrichum acutatum em morango pós-colheita, além da influência desse tratamento nos atributos físico-químicos como pH, sólidos solúveis totais (SST), acidez titulável (AT) e a relação SST/AT. As concentrações de inóculo testadas foram 102, 10³, 104, 105,106 e 107 conídios/mL, para o período de molhamento os frutos foram submetidos a: 0, 12, 24, e 36 h de incubação, na influência da temperatura na severidade da doença os frutos foram incubados com temperatura controlada para 12, 15, 20 e 25 °C. No controle com radiação gama os frutos receberam as doses de: 0,25, 0,50, 0,75, 1,0 e 1,25 kGy em dois tempos: imediatamente e seis horas após a inoculação do fungo. A testemunha não recebeu doses de radiação gama. A severidade da doença foi significativamente influenciada pela mais alta concentração de inóculo (107 conídios/mL), temperatura de incubação e pelo período de molhamento dos frutos, com maiores áreas de lesão nos frutos expostos a 25 ºC e 36 h. Quanto a irradiação os melhores tratamentos foram realizados imediatamente após as inoculações, com destaque para a dose de 1,25 kGy. Os tratamentos com a radiação gama não alteraram as características químicas das frutas analisadas neste estudo. Assim, estes tratamentos podem ser indicados para o tratamento pós-colheita de morango.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T12:35:21Z No. of bitstreams: 1 Carmem Lucia Pereira Abade.pdf: 1933557 bytes, checksum: 27df1005b3ffc581dac4c7e73d0fc677 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T12:35:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carmem Lucia Pereira Abade.pdf: 1933557 bytes, checksum: 27df1005b3ffc581dac4c7e73d0fc677 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / One of the main limiting factors for agricultural production is the plant parasitic nematodes, particularly Meloidogyne and Pratylenchus, because they parasite important crops causing high economic losses. Their control is very complex, after introduction, these nematodes cannot be eradicated. Therefore, understanding how management practices affects nematode community structure and the spatial variability of their populations will improve effectiveness of long term measures. This work had as objective to evaluate variations on plant-parasitic nematodes structure and spatial distribution and cultivation area of cowpea after guava orchard eradication. The study was carried out at Nossa Senhora do Rosário Farm in Pesqueira municipality in Pernambuco State. Soil and roots samples were collected in 2012 and 2015, in a 10×10-m mesh with 64 points, being data submitted to Geostatistical analysis. Before guava eradication, only Meloidogyne in soil presented high level of spatial dependence, fitting to exponential model. After cowpea cultivation, each Pratylenchus and Helicotylenchus populations turn to high level of spatial dependence in soil, with the exponential model as best fit, as well the bacterivorus, particularly Rhabditidae, except Gaussian model fitted best. Meloidogyne density in soil was low showing no spatial dependency, in contrast to roots, where Meloidogyne spatial dependency was moderate, fitting to spherical model. In both periods, the range of all nematode genera was longer than 10 m. The use of a non adequate management, as the introduction of a susceptible host, as cowpea, increased density and dissemination of important plant parasitic nematodes in the field. / Um dos principais fatores limitantes para a produção agrícola são os fitonematoides, especialmente Meloidogyne e Pratylenchus, por parasitarem importantes culturas agrícolas e causarem sérios prejuízos econômicos. O controle desses nematoides é complexo, pois uma vez estabelecidos, as populações não serão erradicadas. Dessa forma, o entendimento de como as práticas de manejo afetam a estrutura da comunidade dos nematoides e, consequentemente, a variabilidade espacial de suas populações, permitirá a adoção de medidas mais efetivas e duradouras. Este trabalho teve como objetivo analisar variações na estrutura e distribuição espacial de fitonematoides em área de cultivo de feijoeiro caupi após erradicação de goiabeiras. O estudo foi realizado na Fazenda Nossa Senhora do Rosário no município de Pesqueira-PE. As amostras de solo e raiz foram coletadas em 2012 e 2015, em malha de 10×10 m, com 64 pontos, e os dados submetidos à análise de Geoestatística. Durante o cultivo da goiabeira, exclusivamente a distribuição de Meloidogyne no solo apresentou forte grau de dependência espacial, ajustando-se ao modelo exponencial. Após a erradicação das goiabeiras e cultivo de feijoeiro, as populações de Pratylenchus e Helicotylenchus no solo passaram a apresentar forte dependência espacial, ajustando-se ao modelo esférico, enquanto os bacteriófagos, especialmente Rhabditidae, ajustaram-se ao modelo gaussiano. A densidade de Meloidogyne no solo foi baixa não apresentando dependência espacial, ao contrário da raiz, onde o nematoide mostrou dependência espacial moderada, ajustando-se ao modelo esférico. Todos os gêneros de nematoides encontrados nos dois períodos de estudo apresentaram alcance maior que 10 m. A falta de um manejo adequado, caracterizado pela introdução de hospedeira susceptível (feijoeiro) ao nematoide deu continuidade aos problemas, aumentando a densidade populacional e disseminação no solo de importantes fitoparasitas.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T12:48:57Z No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 836887 bytes, checksum: cbc505c9efbb7bb9c4a2a41195c6571e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T12:48:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luiz Gustavo de Lima Melo.pdf: 836887 bytes, checksum: cbc505c9efbb7bb9c4a2a41195c6571e (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fusarium guttiforme and Thielaviopsis ethacethica are responsible for numerous losses regarding the cultivation of pineapple. Despite the fusarium be considered a pre-harvest disease, the damage to the fruit, negatively reflecton marketing; T. ethacethica already responsible for black rot of pineapple fruit is typically a disease of post-harvest, causing losses mainly fruit for both industry and the fresh market. Thus the two plant pathogens in question cover the entire production chain of the pineapple. Given the importance of these etiological agents and the high level soft infection in the producing regions of the fruit this study evaluated effect of alternative products in the management of fusarium wilt of pineapple and black pineapple rot, as well as checking the possible physical-chemical and biochemical changes they can cause the fruit. In the first article, the effect of alternative products in the management of fusarium wilt was analyzed in the pre-harvest by natural infection in the field, as well as lifting incidence of fusarium wilt of pineapple. In these article, the effect of alternative products in the management of black rot was analyzed in post-harvest checking its action on these verities of the lesions in the fruits and possible changes in mycelia growth and sporulation of T. ethacethica. The products tested were potassium phosphite (FK), calcium phosphite (FCA), copper phosphide (FCU), Agro-Mos (AGM), calcium silicate (CAS), Biopirol®, Bion® and carbendazim CCAB 500 SC applied at recommended dosages by manufacturers. For the analysis of natural infection by Fusarium results show edth at FK, FCU and Biopirol were efficient in controlling the incidence of the disease. The physico-chemical analysis show edth at the treatments did not promote change in the pH of the fruit, while in biochemistry only FK promoted the expression of β-1,3-glucanase enzyme in pineapple fruit. Related to T. ethacethica, the results show edth at Bion®, agro- and FK we were able to control black rot in the fruit. FK inhibited mycelia growth and sporulation of the pathogen. The applied products provided changes in pH levels, SST and ATT. Biochemical changes were not observed by the application of the products. / Fusarium guttiforme e Thielaviopsis ethacethica são responsáveis por inúmeras perdas no que concerne o cultivo do abacaxi. Apesar da fusariose ser considerada uma doença de pré-colheita, seus danos ao fruto, refletem negativamente na comercialização; já T. ethacethica, responsável pela podridão negra do fruto do abacaxizeiro, é uma doença tipicamente de pós-colheita, causando perdas principalmente em frutos destinados tanto a indústria como ao consumo in natura. Dessa forma os dois fitopatógenos em questão abrangem toda a cadeia produtiva do abacaxi. Diante da relevância desses agentes etiológicos e dos altos níveis de infecção nas regiões produtoras do fruto este trabalho buscou avaliar efeito de produtos alternativos no manejo da fusariose do abacaxizeiro e da podridão negra do abacaxi, bem como verificar as possíveis alterações físico-quimicas e bioquímicas que estes possam causar nos frutos. No primeiro artigo, o efeito de produtos alternativos no manejo da fusariose foi analisado na fase pré-colheita, por infecção natural em campo, bem como levantamento de incidência da fusariose do abacaxizeiro. No segundo artigo, o efeito de produtos alternativos no manejo da podridão negra foi analisado na fase pós-colheita verificando sua ação sobre a severidade das lesões nos frutos e possíveis alterações no crescimento micelial e esporulação de T.ethacethica. Os produtos testados foram fosfito de potássio (FK), fosfito de cálcio (FCa), fosfito de cobre (FCu), Agro-Mós (AGM), silicato de cálcio (SCa), Biopirol®, Bion®e carbendazim ccab 500 sc, aplicados nas dosagens recomendadas pelos fabricantes. Para as análises de infecção natural por Fusarium os resultados mostraram que FK, FCu e biopirol foram eficientes no controle da incidência da doença. As análises físico-químicas mostraram que os tratamentos não promoveram alteração no pH dos frutos, enquanto que na bioquímica apenas FK promoveu a expressão da enzima β-1,3‑glucanases em frutos de abacaxi. Relacionado à T. ethacethica, os resultados mostraram que Bion®, Agro-mos e FK foram capazes de controlar a podridão negra no fruto. FK inibiu o crescimento micelial e a esporulação do patógeno. Os produtos aplicados proporcionaram alterações nos teores de pH, SST e ATT. Alterações bioquímicas não foram observadas pela aplicação dos produtos.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-01T13:10:00Z No. of bitstreams: 1 Francisco Conrado Queiroz Carvalho.pdf: 1495892 bytes, checksum: 4554af9eec8d39ab44f681710b62ea38 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-01T13:10:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco Conrado Queiroz Carvalho.pdf: 1495892 bytes, checksum: 4554af9eec8d39ab44f681710b62ea38 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Bacterial canker, caused by Xanthomonas campestris pv. viticola, has been responsible for significant economic losses on the grapevine crop in Brazilian states of Pernambuco and Bahia, located in the São Francisco river Valley. This work evaluated the effect of thermotherapy on cuttings of cultivars Isabel and Red Globe on the viability of plantlets and eradication of X. campestris pv. viticola, and the effect of combination of biological control agents (BCA) and thermotherapy on the pathogen eradication and disease severity reduction. The cuttings were treated at 50, 52 and 54°C during 30, 45 and 60 min, planted, and after 45 days the plantlets were analyzed for growth. The eradication of X. campestris pv. viticola was evaluated at 50 to 52°C and 45, 50 and 60 min by quantifying bacterial populations on cuttings before planting and epidemiological components of bacterial canker, 120 days after planting. Only the temperature of 54°C, mainly during 45 and 60 minutes, affected negatively leaf number, plant height, and length and volume of root system. The bacterial population was reduced in cuttings of both cultivars. No binomial temperature/time was able to eradicate X. campestris pv. viticola, but at 50 and 52°C during 45 to 60 min, canker symptoms on the branches were reduced from 65.5 to 95.9%. To evaluate the combined effect of BCA and thermotherapy, 23 BCA were sprayed on the leaves of 'Red Globe' and 24 h later the pathogen was inoculated. After 40 days, the incubation period and disease severity were evaluated. It was also determined the antibacterial activity of BCA to the pathogen, by testing for antibiotic production, detection of volatile substances, proteases and ammonia. Although not able to eradicate the pathogen, bacterial strains LCB 6, LCB 30, LCB 33, UNEB 27 and RAB 9 (108 CFU/mL), and yeast strains L7, L8 and LF (107 cel/mL) reduced bacterial canker, exhibiting at least one type of antibacterial activity. Two BCA (LCB 6 – Bacillus subtilis and LF - Saccharomyces cerevisiae) were combined with thermotherapy (50 and 52°C for 45, 50 and 60 min). The cuttings were subjected to thermotherapy, followed by immersion during two hours in the suspension of LCB 6 and LF, and the plantlets were sprayed weekly, through 15 weeks. The plantlets were evaluated 120 days after planting. No combination was able to eradicate X. campestris pv. viticola, but some of them reduced the disease severity on leaves and branches. The best results were obtained by combined use of LCB 6 –Bacillus subtilis and thermotherapy at 52°C during 45 min, which is recommended for the integrated management of bacterial canker of grapevine. / O cancro bacteriano, causado por Xanthomonas campestris pv. viticola, tem sido responsável por significativos prejuízos econômicos na cultura da videira no Submédio do Vale do São Francisco, estados de Pernambuco e Bahia, Brasil. Este trabalho avaliou o efeito da termoterapia em bacelos de videira das cultivares Isabel e Red Globe na viabilidade de mudas e na erradicação de X. campestris pv. viticola, e também a combinação de agentes de controle biológico (ACB) e termoterapia na erradicação do patógeno e na redução da severidade da doença. Os bacelos foram tratados a 50, 52 e 54°C nos tempos de 30, 45 e 60 min, plantados, e o crescimento das mudas avaliado após 45 dias. A erradicação de X. campestris pv. viticola foi determinada nas temperaturas 50 e 52°C e tempos de 45, 50 e 60 min, quantificando-se a população bacteriana nos bacelos antes do plantio e componentes epidemiológicos do cancro bacteriano, 120 dias após o plantio. Apenas a temperatura de 54°C, principalmente durante 45 e 60 min, interferiu negativamente no número de folhas, altura da planta, comprimento e volume do sistema radicular. A população bacteriana foi reduzida nos bacelos de ambas cultivares. Nenhum binômio temperatura/tempo foi capaz de erradicar X. campestris pv. viticola, mas os sintomas de cancros nos ramos foram reduzidos de 65,5 a 95,9% nos tratamentos a 50 e 52°C durante 45 e 60 min. No estudo do efeito combinado de biocontrole e termoterapia, 23 isolados de ACB foram pulverizados nas folhas de ‘Red Globe’, com inoculação do patógeno após 24 h. Após 40 dias, o período de incubação e a severidade da doença foram avaliados. Foi determinada a atividade antibacteriana dos ACB ao patógeno, detectando-se a produção de antibióticos, substâncias voláteis, proteases e amônia. Apesar de não serem capazes de erradicar o patógeno, cinco isolados de bactérias LCB 6, LCB 30, LCB 33, UNEB 27 e RAB 9 (108 UFC/mL), e três isolados de leveduras L7, L8 e LF (107 cel/mL) se destacaram na redução do cancro bacteriano, exibindo pelo menos um tipo de atividade antibacteriana. Dois isolados de ACB (LCB 6 – Bacillus subtilis e LF – Saccharomyces cerevisiae) foram combinados à termoterapia (50 e 52°C for 45, 50 e 60 min). Os bacelos submetidos aos tratamentos termoterápicos, foram imersos posteriormente, durante 2 h, na suspensão de LCB 6 e LF e as mudas foram pulverizadas semanalmente, por 15 semanas. As plântulas foram avaliadas 120 dias após o plantio. Nenhuma combinação foi capaz de erradicar X. campestris pv. viticola, mas reduções na severidade da doença nas folhas e ramos foram observadas, sendo os melhores resultados obtidos com o uso combinado do isolado da bactéria LCB 6 – Bacillus subtilis e termoterapia de 52°C durante 45 min, o qual é indicado para o manejo do cancro bacteriano.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-02T12:42:24Z No. of bitstreams: 1 Willams Jose de Oliveira.pdf: 1187273 bytes, checksum: 3d0f4978c0a4ad8c65c3b398bf1ec2aa (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T12:42:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Willams Jose de Oliveira.pdf: 1187273 bytes, checksum: 3d0f4978c0a4ad8c65c3b398bf1ec2aa (MD5) Previous issue date: 2015-02-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / It was produced approximately 1,601,767 tons of onions in the 2014 harvest in Brazil, and the northeastern region with approximately 23% of this production. The culture of the onion can be affected by various diseases, among them are the bacterial rot. Between the types of decay occurring in onion bulbs stands out the scales rot because it causes significant losses in Brazil. This disease is associated with bacteria from the Burkholderia cepacea complex, Burkholderia gladioli pv. alliicola, Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens. Given that for the application of efficient management measures it is necessary to understand the etiology of the disease and that it is not known for sure what the genera and species that are associated with the rot of onion scales in the semi-arid northeast, the present study have the following objectives: i) identify the bacteria involved with the disease in this region by sequencing and phylogenetic analysis of 16S rRNA region, ii) evaluate the behavior relatedness of the species identified by rep-PCR, and iii) evaluate the pathological behavior of different species identified. For this purpose, samples were taken in the main producing regions of onion in Pernambuco and Bahia semi-arid region, followed by the isolation and storage of strains in Culture Collection Rosa Mariano (CRM) of the Phytobacteriology Laboratory at the Federal Rural University of Pernambuco. We obtained 45 strains which were grouped into three clades: clade I, containing strains identified as B. cepacia complex (n = 29), clade II containing strains identified as B. gladioli (n = 10) and clade III containing strains identified as P. aeruginosa (n = 6). These strains were submitted to analysis of rep-PCR and were separated into 31 groups with level 70% of similarity. However, it was not possible to identify these three clades by this technique. When artificially inoculated in onion scales, strains of B. cepacia complex and B. gladioli were significantly more aggressive than P. aeruginosa strains. Based on phylogenetic identification performed in this study, it is concluded that the rot of onion bulb scales in the Brazilian semi-arid northeast is caused by the strains of B. cepacia complex, B. gladioli e P. aeruginosa. Moreover, more than one species of the B. cepacia complex may be associated with rot scales in this region. / O Brasil produziu aproximadamente 1.601.767 toneladas de cebola na safra de 2014, sendo a região nordeste responsável por 23% dessa produção. A cultura da cebola pode ser acometida por diversas doenças, destacando-se as podridões bacterianas. Dentre os tipos de podridões que ocorrem em bulbos de cebola destaca-se a podridão de escamas, a qual pode causar perdas de até 50% no Brasil. Essa doença está associada a bactrérias do complexo Burkholderia cepacea, Burkholderia gladioli pv. alliicola, Pseudomonas aeruginosa e Serratia marcescens. Visto que para aplicação de medidas de manejo eficientes faz-se necessário o conhecimento da etiologia da doença e que ainda não se sabe ao certo quais são os gêneros e espécies que estão associadas à podridão de escamas da cebola no semiárido nordestino, o presente estudo teve como objetivos: i) identificar as bactérias envolvidas com a doença nessa região por meio de sequenciamento e análise filogenética da região 16S rRNA, ii) avaliar o comportamento genético das espécies identificadas por meio de rep-PCR, e iii) avaliar o comportamento patológico das diferentes espécies identificadas. Para isto foram realizadas coletas nas principais regiões produtoras de cebola do semiárido Pernambucano e Baiano, seguindo-se o isolamento e depósito dos isolados na Coleção de Culturas Rosa Mariano (CRM) do Laboratório de Fitobacteriologia da Universidade Federal Rural de Pernambuco. Foram obtidos 45 isolados, os quais foram agrupados em três clados: clado I, contendo isolados identificados como sendo do complexo B. cepacia (n= 29), clado II, contendo isolados de identificados como B. gladioli (n=10) e clado III, contendo isolados identificados como P. aeruginosa (n=6). Esses isolados foram submetidos a análises de rep-PCR, sendo separados em 31 grupos ao nível de 70 % de similaridade. No entanto, não foi possível identificar esses três clados por meio desta técnica. Quando artificialmente inoculados em escamas de cebola, os isolados do complexo B. cepacia e de B. gladioli foram significativamente mais agressivos do que os isolados de P. aeruginosa. Com base na identificação filogenética realizada no presente estudo, conclui-se que a podridão de escamas de bulbos de cebola no semiárido nordestino brasileiro é causada por isolados do complexo B. cepacia, B. gladioli e P. aeruginosa. Além disso, mais de uma espécie do complexo B. cepacia pode estar associada à podridão de escamas nessa região.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-02T12:54:47Z No. of bitstreams: 1 Soraya de Lima e Silva.pdf: 781402 bytes, checksum: 6f6a41f42d5f65201486956ae0b36300 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T12:54:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Soraya de Lima e Silva.pdf: 781402 bytes, checksum: 6f6a41f42d5f65201486956ae0b36300 (MD5) Previous issue date: 2016-02-12 / Dieback and stem-end rot, caused by species of Botryosphaeriaceae, are important diseases of mango in the Brazilian Northeast. These diseases limit the production and drastically reduce fruit quality, directly affecting exports. In this study, was investigated the effects of wound, humidity and temperature in virulence of five Lasiodiplodia species prevalent in the orchards of northeastern Brazil (L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, L. theobromae and L. viticola). Lasiodiplodia hormozganensis, L. pseudotheobromae and L. theobromae did not induce symptoms in non-wounded fruits, but all Lasiodiplodia species induced symptoms in wounded fruits. There were differences between species in relation to virulence levels both in the absence and in the presence of wound. The wound age in fruits influenced the virulence of Lasiodiplodia species of all species has expressed increased virulence when inoculated immediately after the wound, reducing the virulence with increasing wound age. Lasiodiplodia pseudotheobromae was the most sensitive species to the wound age. The high relative humidity length influenced the virulence of the Lasiodiplodia species, with an increase in virulence with the lifting of the period under high humidity. Lasiodiplodia hormozganensis, L. iraniensis and L. theobromae induced symptoms in the absence of high humidity. The virulence of Lasiodiplodia species was significantly influenced by the time interval between the inoculation and beginning of high relative humidity. All species expressed increased virulence when exposed to high relative humidity immediately after inoculation and decreased virulence with increasing time interval to beginning of high humidity. Lasiodiplodia iraniensis and L. viticola were the species most sensitive to the delay in onset of high relative humidity. No Lasiodiplodia species induced symptoms in fruit stored at 5 ° C and only L. pseudotheobromae induced symptoms at 10 ° C. There was no significant difference between species in relation to the optimum temperature for maximum virulence expression, ranging between 29.6 and 31.3 ° C. In most experiments, the increased virulence was demonstrated by L. iraniensis while L. viticola was less virulent. / A morte descendente e a podridão peduncular, causadas por espécies de Botryosphaeriaceae, são importantes doenças da mangueira no Nordeste brasileiro. Essas doenças limitam a produção e reduzem drasticamente a qualidade dos frutos, afetando diretamente a exportação. Nesse estudo, foi investigado o efeito de ferimento, umidade e temperatura na virulência de cinco espécies de Lasiodiplodia prevalentes em pomares de mangueira do Nordeste brasileiro (L. hormozganensis, L. iraniensis, L. pseudotheobromae, L. theobromae e L. viticola). Lasiodiplodia hormozganensis, L. pseudotheobromae e L. theobromae não induziram sintomas em frutos sem ferimento, mas todas as espécies de Lasiodiplodia induziram sintomas em frutos feridos. Houve diferença entre as espécies em relação aos níveis de virulência tanto na ausência como na presença de ferimento. A idade do ferimento nos frutos influenciou no nível de virulência das espécies de Lasiodiplodia e todas as espécies expressaram a maior virulência quando inoculadas imediatamente após a realização do ferimento, reduzindo a virulência com a elevação da idade do ferimento. Lasiodiplodia pseudotheobromae foi a espécie mais sensível à idade do ferimento. O tempo de duração da umidade relativa elevada influenciou na virulência das espécies de Lasiodiplodia, havendo um aumento na virulência com a elevação do período em umidade elevada. Lasiodiplodia hormozganensis, L. iraniensis e L. theobromae induziram sintomas na ausência de umidade elevada. A virulência das espécies de Lasiodiplodia foi influenciada significativamente pelo intervalo de tempo entre a inoculação e o início da umidade relativa elevada. Todas as espécies expressaram a maior virulência quando submetidas à umidade relativa elevada imediatamente após a inoculação e reduziram a virulência com o aumento do intervalo de tempo para início da umidade relativa elevada. Lasiodiplodia iraniensis e L. viticola foram as espécies mais sensíveis à demora para início da umidade relativa elevada. Nenhuma espécie de Lasiodiplodia induziu sintomas em frutos armazenados a 5 ºC e somente L. pseudotheobromae induziu sintomas a 10 ºC. Não houve diferença significativa entre as espécies em relação à temperatura ótima para expressão da máxima virulência, que variou entre 29,6 e 31,3 ºC. Na maioria dos experimentos, a maior virulência foi evidenciada por L. iraniensis, enquanto L. viticola foi a menos virulenta.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-02T13:12:59Z No. of bitstreams: 1 Gabriela del Carmen Calderon Estrada.pdf: 1790318 bytes, checksum: 59a9ef3279b882660365d852f8a0f3a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T13:12:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gabriela del Carmen Calderon Estrada.pdf: 1790318 bytes, checksum: 59a9ef3279b882660365d852f8a0f3a1 (MD5) Previous issue date: 2015-12-11 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The rust, caused by the fungus Hemileia vastatrix Berk & Br., is the main disease of coffee (Coffea arabica L.) in Latin America. The principal damage caused is defoliation and death of lateral branches, which causes premature fruit losses. Guatemala produces coffee in 270,000 hectares, and near of the 82% is cultivated with susceptible varieties to coffee rust races. Coffee rust epidemic is a complex process based on the relationships between the environment, plant growth, and crop practices. The objective of this study was to develop models for risk analysis based on decision trees in order to understand how cropping patterns determine the progress of the disease in Guatemala to identify and prioritize the important factors. For this work were used 1215 observations, obtained in 35 coffee plots from April 2013 to December 2014. The modeled variable was the leaf severity. Using the CHAID (Chi-Square Automatic Interaction Detection) algorithm were developed two decision trees. The first predicts leaf severity in plots where the producer does not follow the disease, while the second requires rust monitoring 28 days before the date of the severity risk analysis. In the trees, the main predictor was the fungicide spraying per year. The following predictor variables on the tree were related with the tissue availability for new infections, which also stimulates microenvironments with high relative humidity, warm temperatures, and foliar wetness prevalence. Only for non-monitoring tree was included the average rainfall, which suggests that climate relationship with the epidemic, is at microclimate level. The tree for plots with disease monitoring includes in all levels the 28 before severity and replaced management or climate variables getting similar predicted values. The accuracy of the tree for monitored plots was 65.85% with an estimated accuracy by cross validation of 73.34%, and for the monitored plots, the accuracy was 62.53% and 68.54%, respectively. Risk analysis models prove to be tools of support in making management decisions to implement the control of coffee rust and allow list in order of importance, management practices, and climatic factors that influence disease severity in different crop patterns. / A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berk & Br., é a principal doença do cafeeiro (Coffea arabica L.) na América Latina. O principal dano é desfolha e morte de ramos laterais, que provocam perdas prematuras de frutos. A Guatemala produz café em 270.000 hectares, sendo que cerca de 82% é cultivado com variedades suscetíveis às raças de ferrugem. A epidemia da ferrugem é um processo complexo baseado nas relações entre ambiente, crescimento da planta, e práticas de manejo. O objetivo deste estudo foi desenvolver modelos para análise de risco baseados em árvores de decisão, a fim de entender como os padrões de cultivo determinam o progresso da doença na Guatemala para identificae e priorizar os fatores importantes. Para este trabalho foram utilizadas 1215 observações, obtidas de 35 lavouras de abril de 2013 a dezembro de 2014. A variável modelada foi a severidade da folha. Utilizando o algoritmo CHAID (Chi-Quadrado Detecção Automatic Interaction), foram desenvolvidas duas árvores de decisão. A primeira árvore permite prever a severidade na folha nas parcelas em que o produtor não realiza acompanhamento da doença, enquanto a segunda requer o monitoramento da ferrugem 28 dias antes da data da análise de risco da severidade. Nas árvores, o principal preditor foi o número de aplicações de fungicida por ano. As seguintes variáveis preditoras na árvore foram relacionadas com disponibilidade de tecido para novas infecções, que podem favorecem a formação de microambientes com alta umidade relativa, temperaturas amenas e prevalência da molhadura folhar. Apenas para a árvore de não monitoramento foi incluída a variável da precipitação média, o que sugere que a relação do clima é em nível microclimático. A árvore com monitoramento inclui em todos os níveis a severidade aos 28 dias antes e substitui variáveis de manejo ou clima, estimando valores semelhantes. A acurácia da árvore para lavouras não monitoradas foi de 65,85% com uma estimativa de acurácia por validação cruzada de 73,34%. Na árvore para lavouras monitoradas a acurácia foi de 62,53% e 68,54%, respectivamente. Os modelos de análise de risco demonstram ser ferramentas de apoio na tomada de decisões de manejo para implementar o controle da ferrugem do cafeeiro e possibilitam listar, em ordem de importância, as práticas de manejo e fatores climáticos que influenciam na severidade da doença em diferentes padrões do cultivo.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-12-05T12:34:11Z No. of bitstreams: 1 Gisely Santana de França.pdf: 805870 bytes, checksum: df58123076789cb14b94920cb48377b4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-05T12:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gisely Santana de França.pdf: 805870 bytes, checksum: df58123076789cb14b94920cb48377b4 (MD5) Previous issue date: 2016-09-14 / The yam (Dioscorea cayennensis Lam.), Also called yam-the-coast or yams-the-coast belongs to Dioscoreaceae family. This culture is affected by various diseases, the green rot one of the most important, as it causes loss of biological deterioration of tubers during transport and storage. It is caused by the fungus Penicillium sclerotigenum. To control the disease is recommended chemical treatment with fungicides based on benomyl or thiabendazole. However, chemical control induces resistance, and contaminates the environment with the need for alternatives to control. Biological control becomes a promising alternative with considerable success in the control of diseases pre and post-harvest. Among the antagonists used in biological control are the yeast. Thus, the aim of this research was to select yeast isolates and evaluate these as the biocontrol mechanisms. Yeasts were obtained from fragments of leaves, tubers and healthy yam. The P. sclerotigenum isolates used in the pathogenicity and biocontrol tests were isolated from tubers with typical symptoms of the disease. The pathogenicity test was conducted with ten isolated, and the isolated PES 02, the most aggressive and selected for the biocontrol assay. In selecting yeast fifteen isolates were highlighted by reducing the average lesion diameter, being positive for killer toxin, producing volatile compounds and biofilm production. This result supported the biocontrol test, which stood out as the green yams rot biocontrol agents the yeast LEV 02 and LEV 09. These two yeasts were evaluated for resistance induction in tubers through the production of enzymes ascorbate peroxidase (APX ) and catalase (CAT). A variation in enzyme levels in the treated tubers with the pathogen and yeast was verified; when compared to the checks, the pathogen treated only with sterile distilled water. Yeasts have shown potential biocontrol, being a tool for biological control of P. Sclerotigenum in yam. / O inhame (Dioscorea cayennensis Lam.), também denominado de inhame-da-costa ou cará-da-costa pertence à família Dioscoreaceae. Esta cultura é acometida por várias doenças, sendo a podridão verde uma das mais importantes, pois ocasiona perdas por deterioração biológica das túberas durante o transporte e armazenamento. Tendo como agente etiológico Penicillium sclerotigenum. Para o controle da doença é recomendado o tratamento químico, com fungicidas à base de benomyl ou thiabendazol. No entanto, o controle químico induz resistência, e polui o meio ambiente, havendo a necessidade de alternativas para o controle. O controle biológico torna-se uma alternativa promissora com considerável sucesso no controle de doenças de pré e pós-colheita. Dentre os agentes antagonistas utilizados no controle biológico estão às leveduras. Sendo assim, o objetivo da pesquisa foi selecionar isolados de leveduras e avaliar quanto aos mecanismos de biocontrole. As leveduras foram obtidas, de fragmentos de folhas, e túberas sadias de inhame. Os isolados de P. sclerotigenum utilizados nos testes de patogenicidade e biocontrole foram isolados de túberas com sintomas típicos da doença. O teste de patogenicidade foi realizado com dez isolados, sendo o isolado PES- 02, o mais agressivo e selecionado para o teste de biocontrole. Na seleção de leveduras, quinze isolados se destacaram, reduzindo o diâmetro médio da lesão, sendo produtoras de toxina killer, compostos voláteis e produção de biofilme. Este resultado subsidiou o teste de biocontrole, no qual se destacaram as leveduras LEV 02 e LEV 09 como agentes de biocontrole da podridão verde do inhame. As duas leveduras foram avaliadas quanto à indução de resistência em túberas através da produção das enzimas ascorbato peroxidase e catalase. Foi verificada uma variação nos níveis de enzimas nas túberas tratadas com o patógeno e as leveduras; quando comparada com as testemunhas, tratadas apenas com o patógeno e água destilada esterilizada. As leveduras demonstraram potencial de biocontrole, sendo uma ferramenta para o controle biológico do P. sclerotigenum no inhame.