Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T13:17:49Z No. of bitstreams: 1 Josiene Silva Veloso.pdf: 976122 bytes, checksum: 7669da38d458979fe12860f67c3c1a9c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T13:17:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Josiene Silva Veloso.pdf: 976122 bytes, checksum: 7669da38d458979fe12860f67c3c1a9c (MD5) Previous issue date: 2013-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The cowpea (Vigna unguiculata) is grown predominantly in the North and Northeast of brazil, with low yields due to a variety of factors, including the fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum. The present study aimed to characterize isolates of F. oxysporum associated with wilt in cowpea through observations of morphological characters, pathogenicity test and analysis of sequences of the translation elongation factor 1-α (tef1) gene. The colony color of the isolates varied from white to violet with dense aerial mycelium. The microconidia were oval to ellipsoid, slightly curved and unicelular, arranged in false heads formed on short monophyalides. The macroconidiaformed on sporodochia were falcate, slightly curved with three to five septa. Of the 27 isolates of F. oxysporum analyzed 20 were pathogenic to cowpea, causing disease with severity ranging from 1 to 99%. The neighbor-joining analysis based on tef1 grouped the isolates into six haplotypes that were not correlated with pathogenicity.. It is suggested from the results of the present study that f. sp. tracheiphilum represents at least three phylogenetic lineages behaving as polyphyletic and paraphyletic, indicating they have independent evolutionary origins. / O Feijão-caupi é uma leguminosa cultivada predominantemente nas regiões Norte e Nordeste do brazil , apresentando baixo rendimento devido a uma diversidade de fatores, dentre eles a murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum. O presente estudo teve como objetivo caracterizar isolados de F. oxysporum associados à murcha em feijão-caupi por meio de observações de caracteres morfológicos, teste de patogenicidade e análise de sequencias do gene fator de elongação 1-α (tef1). Os isolados apresentaram coloração variando do branco ao violeta com micélio aéreo bastante denso. Os microconídios apresentaram formato oval a elipsóide, ligeiramente curvado e sem septo, dispostos em falsas cabeças produzidos em monofiálides curtas. Os macroconídios formados em esporodóquios apresentaram formato falcado, ligeiramente curvado com três a cinco septos. Dos 27 isolados de F. oxysporum analisados 20 se mostraram patogênicos ao feijão-caupi, causando doença com severidade variando de 1 a 99%. A análise de neighbor-joining baseada na região tef1 agrupou os isolados em seis haplótipos independentemente de serem ou não patogênicos. Pode-se sugerir a partir dos resultados obtidos no presente estudo que a f. sp. tracheiphilum representa pelo menos três linhagens filogenéticas comportando-se como polifilética e parafilética, indicando assim terem origens evolucionárias independentes.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:00:03Z No. of bitstreams: 1 Kesia Ferreira Alves.pdf: 466143 bytes, checksum: 66630edcc98b43dfb320ee8189581aa0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:00:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kesia Ferreira Alves.pdf: 466143 bytes, checksum: 66630edcc98b43dfb320ee8189581aa0 (MD5) Previous issue date: 2008-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose is considered an important disease of bell pepper (Capsicum annuum L.) in the state of Pernambuco and in various parts of the world, causing significant losses for fruit commercialization. Actions directed to preventive measures such as alternative control, are of great importance through the exploration of secondary compounds present in medicinal plants with antimicrobial activity. This study aimed to, assess the efficiency of crude extracts in the control of anthracnose in bell pepper, and analyze the control stability of promising treatments in relation to different extract, inoculum, temperature and pathogen isolates concentrations. In preliminary selection, 16 plant species were used in order to obtain aqueous and hidroalcoólico extracts. The aqueous extracts of garlic (Allium sativum L.), Mallow (Malva sp.), and ginger (Zingiber officinale Roscoe.) showed greater than 97% reductions in disease severity levels. The greatest value of CL75 was found for the garlic extract (3.5%), while the lowest value of CL75 was verified with the application of the ginger extract (2.1%). The lowest rate of efficiency reduction of the anthracnose control (TRE) with the pathogen inoculum increase occurred with garlic extract. With regard to different C. gloeosporioides isolates, significant interaction was found between the different extracts and isolates of the pathogen. The plant extracts were effective in controlling the disease in temperatures of 20, 25 and 30 ° C, while temperatures in the 10, 15and 35 ° C there was no disease. There were no differences in the efficiencies of garlic and ginger extracts, while the extract of hollyhock had the lower efficiency at 20 ° C, differing from the other temperatures, and other extracts at this temperature. The results obtained in this study indicate the great potential for use of the garlic extract (6%) in anthracnose control of bell pepper, considering its stability in different situations. / A antracnose é considerada uma importante doença do pimentão (Capsicum annuum L.) no Estado de Pernambuco e em várias partes do mundo, causando perdas significativas à produção de frutos para comercialização. Ações voltadas para medidas preventivas como o controle alternativo, são de grande relevância por meio da exploração de compostos secundários presentes em plantas medicinais com atividade antimicrobiana. O presente trabalho teve por objetivo, avaliar a eficiência de extratos vegetais brutos no controle da antracnose em pimentão, bem como analisar a estabilidade do controle dos tratamentos promissores em relação a.diferentes concentrações dos extratos, concentrações do inoculo e isolados do patógeno e, temperaturas. Na seleção preliminar foram utilizadas 16 espécies vegetais para obtenção de extratos aquosos e etanólicos. Os extratos aquosos de alho (Allium sativum L.), malva (Malva sp.) e gengibre (Zingiber officinale Roscoe.) propiciaram reduções superiores a 97% nos níveis de severidade. O maior valor de CL75 foi constatado para o extrato de alho (3,5%), enquanto o menor valor de CL75 foi verificado com a aplicação de extrato de gengibre (2,1%). A menor taxa de redução da eficiência do controle (TRE) da antracnose com o incremento do inóculo do patógeno ocorreu no extrato de alho. Com relação a diferentes isolados de C. gloeosporioides, foi constatada interação significativa entre os tipos de extratos e os isolados do patógeno. Os extratos vegetais foram eficientes no controle da doença nas temperaturas de 20, 25 e 30 oC, enquanto nas temperaturas 10, 15 e 35 °C não houve doença. Não houve diferenças nas eficiências dos extratos de alho e gengibre, enquanto o extrato de malva apresentou a menor eficiência a 20 oC, diferindo das outras temperaturas, bem como dos demais extratos nessa temperatura. Os resultados obtidos nesse estudo indicam o grande potencial de utilização do extrato de alho a 6% no controle da antracnose em pimentão, considerando sua estabilidade em diferentes situações.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:11:22Z No. of bitstreams: 1 Larissa de Brito Caixeta.pdf: 1251344 bytes, checksum: f836a0d0c30f9c764b4a7d186a485112 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:11:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Larissa de Brito Caixeta.pdf: 1251344 bytes, checksum: f836a0d0c30f9c764b4a7d186a485112 (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / The application of organic matter has been recognized as an efficient strategy for plant parasite nematode control, contributing for reduction of chemical products and their environmental impacts. In this context, the vinasse presents a high potential for use in alternative management of these important parasites due to the high volume of organic matter. The objectives of the present study were to evaluate nematode communities in soil and roots, correlating changes in physical and chemical soil attributes and nematode communities in function of irrigation with vinasse; evaluate the fertirrigation effect in vertical distribution of nematode communities in soil and in the spatial variability of the plant parasitic nematodes. Evaluations based on physical (soil humidity, density, porosity, granulometry, penetration resistance (MPa) and particle density) and chemical (pH, H, Al, P, Ca, Mg, Na, K and C-CO2 evolution) soil attributes and nematode community in soil and roots, carried out 30 days before and 30 and 90 days after sugarcane cut and vinasse application. There was reduction in total amount of nematode after vinasse irrigation. Soil density and Ca++ level correlated positively with the total amount of nematode and, in particular, the plant parasitic nematodes. Inversely, the organic matter correlated negatively with the free-living nematodes, plant parasitic nematodes and consequently the total amount of nematodes in soil, but presented positive correlation with endoparasites in roots. Changes in time on C-CO2 evolution were not significant neither the correlation with the taxa or trophic groups. The vertical irrigation effect on soil was signalized on Pratylenchus and Dorilamidae distribution and soil density. The higher changes in nematode densities in soil were attributed to depth, being layers of 10 and 20 cm the most crowded. According to semivariograms, endoparasite distribution fitted to spherical before and 30 days after and before vinasse application. However, ectoparasite distribution, fitted to spherical model before irrigation, shifted to exponential 30 days before vinasse application. Spatial dependence of ectoparasites was moderate after and before irrigation. Endoparasites presented moderate dependence before and weak after irrigation. At 90 days after irrigation, endo and ectoparasites did not present correlation among points sampled showing pure nugget effect. / O emprego de matéria orgânica tem sido preconizado com destacada eficiência para controle de fitonematóides, contribuindo para a redução do uso de produtos químicos e os conseqüentes impactos ao meio ambiente. Nesse contexto, a vinhaça apresenta grande potencial no manejo alternativo destes fitopatógenos, devido ao grande aporte de matéria orgânica em sua composição. Os objetivos do presente estudo foram avaliar as comunidades de nematóides no solo e raízes, correlacionando variações nos atributos físicos e químicos do solo e nas comunidades de nematóides em função da fertirrigação com vinhaça; avaliar o efeito da fertirrigação na distribuição vertical da nematofauna do solo e na variabilidade espacial dos fitonematóides. As avaliações fundamentaram-se em atributos físicos (umidade, densidade, porosidade, granulometria, resistência do solo a penetração e densidade de partícula) e químicos (pH, H, Al, P, Ca, Mg, Na, K e evolução C-CO2) do solo e caracterização da nematofauna, efetuadas 30 dias antes e 30 e 90 dias após o corte da cana e aplicação de vinhaça. Houve redução no número total de nematóides após a fertirrigação com vinhaça. A densidade do solo e o nível de Ca++ correlacionaram-se significativamente com o total de nematóides e, em particular, com os fitoparasitos. A matéria orgânica correlacionou-se negativamente com nematóides de vida livre, fitoparasitos e nematóides totais do solo, mas apresentou correlação positiva com os endoparasitos encontrados nas raízes. A evolução de C-CO2 não variou significativamente entre os períodos nem apresentou correlações com os taxa ou grupos tróficos. O efeito vertical da fertirrigação no solo foi constatado apenas nas distribuições de Pratylenchus e Dorylaimidae e na densidade do solo. As maiores variações nas densidades populacionais de nematóides no solo ocorreram nas camadas de 10 e 20 cm. A distribuição dos endoparasitos ajustou-se ao modelo esférico 30 dias antes e após a aplicação de vinhaça. Já os ectoparasitos, ajustado ao modelo esférico antes da fertirrigação, mudou para exponencial 30 dias após a aplicação de vinhaça. Os ectoparasitos apresentaram dependência espacial moderada antes e após a irrigação com vinhaça e, os endoparasitos, moderada antes e fraca 30 dias após a irrigação. Aos 90 dias após a irrigação, os endoparasitos e ectoparasitos não apresentaram correlações entre os pontos amostrados, revelando efeito pepita puro.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:25:14Z No. of bitstreams: 1 Leilson Lopes Santos Silva.pdf: 648009 bytes, checksum: 3453befdc26841cf0fe7cf84e0463cf2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:25:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leilson Lopes Santos Silva.pdf: 648009 bytes, checksum: 3453befdc26841cf0fe7cf84e0463cf2 (MD5) Previous issue date: 2011-02-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The grape variety of Italy is the main table grapes exported by Brazil mainly in the region of the São Francisco, but has major problems that arise after the harvest, among them is the rot. Among several agents of rot in grapes is of alternaria rot caused by Alternaria alternata which has caused great losses to producers and consumers. Objective was to verify the influence of different concentrations of inoculum (103, 104, 105,106 e 107 conídios/mL), wet period (0, 12, 24, 36 e 48 h) and temperature (10, 15, 20, 25, 30 e 35ºC) on the development of two isolates of A. alternata grape var. Italy, in addition to possible physical-chemical changes (pH, TSS, TA and ascorbic acid) in grape. Bunches of grape apparently free of disease in commercial maturation stage were inoculated by two most aggressive isolates were selected for the test of aggression, with 10μL of suspensão A. alternata, and concentration of 106 conidia/mL showed the greatest lesion size, no significant difference between different periods of wetness and temperature of 25°C favored the development of rot and temperature 10°C is recommended for storage for seven days without affecting the physical-chemical and providing the decrease in disease severity. / A variedade de uva Itália é a principal uva fina de mesa exportada pelo Brasil principalmente na Região do Vale do São Francisco, mas possui grandes problemas que se apresentam após a colheita, entre eles se encontra as podridões. Entre vários agentes de podridões em uva se encontra a podridão de alternaria causada por Alternaria alternata que tem provocado grandes perdas aos produtores e consumidores. O objetivo do trabalho foi de verificar a influência de diferentes concentrações de inóculo (103, 104, 105, 106 e 107 conídios/mL), do período de molhamento (0, 12, 24, 36 e 48 h) e da temperatura (10, 15, 20, 25, 30 e 35ºC) sobre o desenvolvimento de dois isolados de A. alternata em uva var. Itália, além das possíveis alterações físico-químicas (pH, SST, AT e ácido ascórbico) nos cachos. Os cachos de uva aparentemente livre de doenças em estádio de maturação comercial foram inoculados por dois isolados mais agressivos, selecionados pelo teste de agressividade, com 10μL da suspensão de A. alternata, sendo que a concentração de 106 conídios/mL foi a que apresentou maior tamanho de lesão, não houve diferença significativa (ao nível de 5%) entre os diferentes períodos de molhamento e a temperatura em torno 25ºC favoreceu ao desenvolvimento da podridão e a temperatura ao redor 10ºC é recomendada para armazenamento durante sete dias sem afetar as características físico-químicas e proporcionando a diminuição da severidade da doença

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T11:54:48Z No. of bitstreams: 1 Douglas Barbosa Castro.pdf: 3531587 bytes, checksum: 22215940a25ea18b769935787dced147 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T11:54:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Douglas Barbosa Castro.pdf: 3531587 bytes, checksum: 22215940a25ea18b769935787dced147 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Guava (Psidium guajava L.) farming has a great economic and social importance, especially for the Brazilian semiarid region. Severe damage caused by nematodes parasitism, particularly Meloidogyne enterolobii is reported in orchards across the country, with heavy losses. Neem-based products (Azadirachta indica) have emerged as a sustainable management alternative of these pathogens. The objectives of this study were: (a) evaluate the effects of the neem cake in nematode communities, in the soil microbial activity, soil and plant properties; (b) describe the structure and the composition of nematode communities in guava orchard area recently implemented; (c) to assess variations in the spatial and temporal distributions of plant nematodes and chemical properties of the soil by incorporating the neem cake. The study was conducted in a guava orchard located in a rural settlement in Pernambuco State, Brazil, which was divided into two areas, one of which was applied neem cake treatment. The evaluations were done before treatment, 90 and 180 days after initiation of treatment. Descriptive statistics, covariance and geostatistics was proceeded for nematological data, soil properties and plants nutrition. The results indicated that the neem cake improves soil quality, increasing of organic carbon content, microbial activity and microfauna abundance. Neem cake was effective to control plant parasitic nematode Pratylenchus, however it was not effective against M. enterolobii. The geostatistical analysis revealed that the spherical model fitted for the most of variables studied. Most nematodes not present spatial dependence, featuring pure nugget effect. The contour maps showed that neem cake incorporation increased the variability of soil chemical properties; spatial distribution of essential nutrients for root growth influenced the distribution of plant parasitic nematodes; and the introduction of M. enterolobii in the study area was through infected seedlings. / A cultura da goiabeira (Psidium guajava) é de grande importância econômica e social, especialmente para o semiárido do nordeste brasileiro. Danos severos causados pelo parasitismo por nematoides, principalmente os da espécie Meloidogyne enterolobii, são reportados em pomares de todo país, com elevados prejuízos. Os produtos à base de nim (Azadirachta indica) têm se mostrado uma alternativa para um manejo mais sustentável desses patógenos. Os objetivos do presente estudo foram: (a) avaliar os efeitos da incorporação da torta de nim nas comunidades de nematoides, na atividade microbiana do solo e nos atributos do solo e das plantas; (b) descrever a estrutura e a composição das comunidades de nematoides em área de pomar de goiabeiras recém-implantado; (c) avaliar variações nas distribuições espaço-temporal dos fitonematoides e atributos químicos do solo após a incorporação da torta de nim. O estudo foi conduzido em um pomar de goiabeiras localizado em um assentamento rural no agreste Pernambucano, o qual foi dividido em duas áreas; em uma delas foi aplicado o tratamento com a torta de nim. As avaliações foram feitas antes do tratamento, 90 e 180 dias após o início do tratamento. Procedeu-se com análises de estatística descritiva, covariância e geoestatística para os dados nematológicos, atributos do solo e nutricional de plantas. Os resultados obtidos indicaram que a torta de nim melhora a qualidade do solo, elevando os níveis de carbono orgânico, atividade microbiana e da microfauna. O tratamento foi eficaz em controlar os nematoides do gênero Pratylenchus presentes no solo, no entanto não foi eficaz contra M. enterolobii. A análise geoestatística revelou que o modelo esférico foi o que mais se ajustou às variáveis estudadas e que a maior parte das variáveis nematológicas não apresentou dependência espacial, caracterizando efeito pepita puro. Os mapas de isolinhas mostraram que a incorporação da torta de nim aumentou a variabilidade dos atributos químicos do solo; que a distribuição espacial de nutrientes importantes para o desenvolvimento radicular das plantas influenciou na distribuição de fitonematoides e permitiu concluir que a introdução de M. enterolobii na área se deu por meio de mudas infectadas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T13:11:21Z No. of bitstreams: 1 Indira del Carmen Molo Alvarado.pdf: 1069235 bytes, checksum: 54d92e63acb53f101863e46dc0721313 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T13:11:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Indira del Carmen Molo Alvarado.pdf: 1069235 bytes, checksum: 54d92e63acb53f101863e46dc0721313 (MD5) Previous issue date: 2006-07-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Yield of Chinese cabbage (Brassica pekinnensis) may be limited by the occurrence of soft rot caused by pectinolytic bacteria. In this study 39 isolates of bacteria causing soft rot in Chinese cabbage obtained from planting areas of Camocim de São Félix, in Pernambuco State, were identified and characterized as Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc) based upon biochemical tests confirmed by PCR. The variability of these isolates was evaluated through disease epidemiological components, sensitivity to antibiotics and molecular markers. The isolates were distributed in similarity groups considering 50% of the total linkage distance by the UPGMA method. Based on epidemiological components incubation period (PI), initial severity (SEVI), final severity (SEVF) and area under the disease curve progress the 39 isolates were distributed in six similarity groups. Among the epidemiological components significant Piersoncorrelation (P≤0.05) was only found for PI and SEVI (r = -0.57). Based on sensitivity to 12 antibiotics, the Pcc were distributed in 14 groups. There were significant correlations between sensitivity to gentamicin and PI (r = -0.41), as well as between sensitivity to clindamicin and SEVF (r = -0.45). The molecular markers REP, ERIC and BOX used in Rep-PCR revealed high genetic variability among the 39 isolates since 32 similarity groups were formed. No significant correlations were found among the linkage distances registered by molecular markers and the disease epidemiological components. In a second study it was evaluated soil influence on Pcc rifampicin resistant mutant (Pcc127Rif). The extinction rate of population was calculated (TEP) and ranged from 0.0547 to 0.6327 log (CFU)/d. Six soils showed suppressiveness to Pcc127Rif while five presented conducivity. The soil groupsbased on the TEP of Pcc127Rif did not correlate with municipalities, types of vegetation cover at the sampling time or soil textural classes. Considering all soils there were no significant correlations (P≤0,05) among TEP of Pcc127Rif and chemical, physical and microbiological characteristics of soils. Considering the six more suppressive soils the TEP of Pcc127Rif significantly correlated with soil apparent density (r = 0.76), total bacterium population (r = 0.82) and Bacillus spp. (r = 0.80). The Bacillus spp. population correlated with apparent density, but not with total bacterium population. Considering the five more conducive soils there was correlation between TEP of Pcc127Rif and Bacillus spp. population (r = -0.86). The high variability among Pcc isolates points out to the necessity of great attention in studies covering identification, detection, epidemiology and control of soft rot in Pernambuco. The elevated correlation between suppressiveness of some soils to P. carotovorum subsp. carotovorum and total bacteria and Bacillus spp. populations is relevant to effective implementation of soft rot management strategies / A produção de couve-chinesa (Brassica pekinensis) pode ser limitada pela ocorrência da podridão-mole causada por bactérias pectinolíticas. No presente estudo, 39 isolados de bactérias causadoras de podridão-mole em couve-chinesa, oriundos de áreas de plantio de Camocim de São Félix, em Pernambuco, foram identificados e caracterizados como Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc) por testes bioquímicos confirmados por PCR. A variabilidade desses isolados foi avaliada com base em componentes epidemiológicos da doença, sensibilidade a antibióticos e marcadores moleculares. Os isolados foram distribuídos em grupos de similaridade, considerando-se 50% da distância total de ligação pelo método UPGMA. Com base nos componentes epidemiológicos período de incubação (PI), severidade inicial (SEVI), severidade final (SEVF) eárea abaixo da curva de progresso da doença, os 39 isolados foram distribuídos em seis grupos de similaridade. Entre os componentes epidemiológicos, foi constatada correlação significativa (P≤0,05) somente de PI com SEVI (r = -0,57). Baseado na sensibilidade aos 12 antibióticos, os isolados de Pcc foram distribuídos em 14 grupos. Foram constatadas correlações significativas entre sensibilidade a gentamicina e PI (r = -0,41), bem como entre sensibilidade a clindamicina e SEVF (r = -0,45). A utilização dos marcadores moleculares REP, ERIC e BOX no Rep-PCR revelou grande variabilidade genética entre os 39 isolados, pois foram formados 32 grupos de similaridade. Não foram constatadas correlações significativas entre as distâncias de ligação registradas pelos marcadoresmoleculares e os componentes epidemiológicos da doença. Em outro estudo foi avaliada a influência dos solos na população de Pcc, utilizando-se mutanteresistente a rifampicina (Pcc127Rif). A taxa de extinção relativa da população (TEP) variou de 0,0547 a 0,6327 log (UFC)/dia. Seis solos mostraram-se supressivos a Pcc127Rif enquanto cinco evidenciaram conducividade. Os grupos de solos baseados na TEP de Pcc127Rif não apresentaram relação com os municípios de coleta, tipos de coberturas do solo na época da coleta ou classes texturais dos solos. Considerando-se todos os solos, não foram constatadas correlações significativas (P≤0,05) entre a TEP de Pcc127Rif e as características químicas, físicas e microbiológicas dos solos. Nos seis solos mais supressivos, a TEP de Pcc127Rif se correlacionou significativamente com a densidade aparente do solo (r = 0,76), populações de bactérias totais (r = 0,82) e Bacillus spp. (r = 0,80). A população de Bacillus spp. se correlacionou com a densidade aparente, mas não com a população de bactérias totais. Nos cinco solos mais conducivos houve correlação entre a TEP de Pcc127Rif e a população de Bacillus spp. (r = -0,86). A elevada variabilidadeverificada entre os isolados de Pcc aponta para a necessidade de maior atenção em estudos de identificação, detecção, epidemiologia e controle da podridão-mole em Pernambuco. A alta correlação observada entre a supressividade de alguns solos a Pcc e as populações de bactérias totais e Bacillus spp. é relevante para implementação efetiva de estratégias de manejo da doença.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T14:31:46Z No. of bitstreams: 1 Luis Gustavo Chaves da Silva.pdf: 1253285 bytes, checksum: 0a1b6f21c6f4abf5783394812a777ab7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T14:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luis Gustavo Chaves da Silva.pdf: 1253285 bytes, checksum: 0a1b6f21c6f4abf5783394812a777ab7 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The anthracnose, fungal disease caused by Colletotrichum gloeosporioides, stands out as an important disease of cashew (Anacardium occidentale), which may lead to losses of over 40% in production. The cashew nut is the most important agricultural product of the state of Ceará, about 350 thousand hectares, generating more than 100 thousand direct/indirect jobs and exports over 150 million dollars in almonds. It is also important for the states of Piauí and Rio Grande do Norte. There are few and outdated research about disease and the needs basic information for programs improvement and integrated management of diseases. By presenting large morphological and genetic variability, it is difficult to generalize basic aspects of the species. The aim of this study was to characterize populations of C. gloeosporioides occurring on cashew trees in various regions of Brazil. Used 220 isolates obtained from cashew leaves, from 22 different areas of the states: Amazonas, Ceará, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do North and São Paulo. Proceeded with pathogenic tests and molecular markers species-specific to all isolates. Then a representative from each collection area was selected to perform the other ratings, which are: morphological, molecular, epidemiological and physiological. The species-specific markers β-tubulin and ITS, noted the existence of only one group of 10 isolates of the same area, not being confirmed for C. gloeosporioides or C. acutatum, but morphological characteristics of C. gloeosporioides. Using seven primers ISSR markers and 100 representatives in 22 areas, it was possible identify the formation of four distinct genetic groups of C. gloeosporioides, where the unmarked isolated by ITS or β-Tubulin, not was contained in one or in groups. With the pathogenic test using 5 clones, it was possible to distinguish three groups and another 3 isolates distinct from other. Conclude that the species C. gloeosporioides is prevalent in cashew plantations in the areas studied. / A Antracnose, doença fúngica ocasionada por Colletotrichum gloeosporioides, destaca-se como doença importante do cajueiro (Anacardium occidentale), podendo levar a perdas de mais 40% na produção. A castanha de caju é o produto agrícola mais importante do estado do Ceará, com cerca de 350 mil hectares plantados, geração de mais de 100 mil empregos diretos e indiretos e exportações acima de 150 milhões de dólares em amêndoas. Também é importante para os estados do Piauí e Rio Grande do Norte. Há poucas e desatualizadas pesquisas sobre a doença, havendo a necessidade de informações básicas para os programas de melhoramento e manejo integrado da fitomoléstia. Por apresentar grande variabilidade morfológica e genética, torna-se difícil a generalização de aspectos básicos da espécie. O objetivo deste trabalho foi caracterizar populações de C. gloeosporioides que ocorrem em cajueiros de diversas regiões do Brasil. Foram usados 220 isolados, obtidos de lesões de folhas de cajueiro, provenientes de plantios de 22 áreas distintas dos estados do Amazonas, Ceará, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do Norte e São Paulo. Procedeu-se com testes de patogenicidade e marcadores moleculares espécie específicos para todos isolados. Em seguida, um representante de cada área de coleta foi selecionado para realização das demais avaliações, sendo elas: morfológicas, moleculares, epidemiológicas e fisiológicas. Os marcadores espécie específicos ITS e β-Tubulina, constataram a existência de apenas um grupo de 10 isolados de uma mesma área, não sendo confirmados para C. gloeosporioides ou C. acutatum, porém com características morfológicas de C. gloeosporioides. Usando 7 primers ISSR e 100 marcadores nos representantes das 22 áreas, foi possível identificar a formação de 4 grupos genéticos distintos de C. gloeosporioides, onde o isolado não marcado por ITS ou β-Tubulina, não ficou contido em nem um dos grupos. Com o teste de patogenicidade utilizando 5 clones, foi possível diferenciar 3 grupos e mais outros 3 isolados distintos dos demais. Conclui-se que a espécie C. gloeosporioides é prevalente em plantios de cajueiro nas áreas estudas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-22T14:15:27Z No. of bitstreams: 1 Michelle Jardelina de Oliveira.pdf: 626765 bytes, checksum: 09ece639b4aa984e06e818a82994095a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T14:15:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Michelle Jardelina de Oliveira.pdf: 626765 bytes, checksum: 09ece639b4aa984e06e818a82994095a (MD5) Previous issue date: 2007-03-14 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Fusarium rot, caused by the fungus Fusarium pallidoroseum, is an important postharvest disease of melon (Cucumis melo) fruits in the Brazil. This work aimed to analyze the influence of the inoculation method (pulverization, drop deposition, pulverization with wound, drop deposition with wound, and sub-epidermal injection), wound age (0, 12 and 24 hours), humidity (with and without moist chamber), temperature (10, 15, 20, 25, 30 e 35°C) and inoculum concentration (101, 102, 103, 104, 105, 106 conidia/mL-1) of three F. pallidoroseum isolates (CF-589, CF-685 and CF-687) on the severity of the Fusarium rot in melon fruits type Cantaloupe (cv. Torreon) and Honeydew (cv. Orange Flesh). The three F. pallidoroseum isolates had provoked symptoms of Fusarium rot in the evaluated situations, but they had not differed significantly (P=0,05) between itself how much to the severity levels of disease, as well as had not been evidenced significant interactions with melon’s cultivars. On the other hand, in all the experiments had been evidenced significant differences in the disease levels between two melon’s cultivar, with cv. Torreon presenting levels of disease’s severity significantly higher to the evidenced on Orange Flesh cultivar. It did not haveseverity significantly higher to the evidenced on Orange Flesh cultivar. It did not have development of injuries in the fruits when the inoculations had been carried without wound. The inoculation for atomization of the conidia’s suspension propitiated the biggest injuries in the submitted fruits at wounds. The inoculation for sub-epidermal injection caused lesser injuries than methods of atomization or drop with wound. It had the reduction of the severity of the disease in the fruits with the increase of the age of the wound. The injuries had been significantly lesser in the wounded fruits 24 hours before the inoculation than in those wounded fruits with 12 hours before or immediately before the inoculation. The free water presence in the surface of the fruits was unnecessary for the beginning of the infection’s process for F. pallidoroseum isolates, even so the injuries has been bigger in the fruits submitted to the humid chamber. The temperature significantly influenced the severity of the Fusarium rot, being that the optimum temperatures estimated for the disease’s development were 23,9 °C e 23,0 °C, respectively for Orange Flesh e Torreon cultivar. The severity of the disease increased with the increment in the inoculum concentration of F. pallidoroseum. The biggest injuries had been observed in the concentration of 1x106 conidia/mL-1 in the twocultivars, but same in lesser inoculum concentration (1x101 conídios/mL-1), they registered considerable levels of disease. The inoculum concentration necessary to generate 50% of the maximum size of the injury Orange Flesh cultivar was four times higher than that demanded for Torreon cultivar. / A podridão-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium pallidoroseum, é uma importante doença em pós-colheita de frutos de meloeiro (Cucumis melo) no Brasil. Este trabalho teve como objetivos avaliar a influência dos métodos de inoculação (atomização, gota, atomização com ferimento, gota com ferimento e injeção subepidérmica), da idade do ferimento (0, 12 e 24 h), da umidade (sem e com câmara úmida), da temperatura (10, 15, 20, 25, 30 e 35 °C) e da concentração de inóculo (1x101, 1x102, 1x103, 1x104, 1x105 e 1x106 conídios.mL-1) de três isolados de F. pallidoroseum (CF-589, CF-685 e CF-687) na severidade da podridão-de-fusário em frutos de meloeiro dos tipos cantaloupe (cv. Torreon) e honeydew (cv. Orange Flesh). Os três isolados de F. pallidoroseum provocaram sintomas da podridão-de-fusário nas situações avaliadas, mas não diferiram significativamente (P=0,05) entre si quanto aos níveis de severidade da doença, bem como não foram constatadas interações significativas com as cultivares de meloeiro. Por outro lado, em todos os experimentos foram constatadas diferenças significativas nos níveis de doença entre as duas cultivares de meloeiro, com a cultivar Torreon apresentando níveis de severidade da doença significativamente superiores aos constatados na cultivar Orange Flesh. Não houvedesenvolvimento de lesões nos frutos quando as inoculações foram realizadas sem ferimento. A inoculação por atomização da suspensão de conídios propiciou as maiores lesões nos frutos submetidos a ferimentos. A inoculação por injeção subepidérmica ocasionou lesões menores que os métodos de atomização ou gota com ferimento. Houve a redução da severidade da doença nos frutos com o aumento da idade do ferimento. As lesões foram significativamente menores nos frutos feridos 24 horas antes da inoculação do que naqueles feridos com 12 horas antes ou imediatamente antes da inoculação. A presença de água livre na superfície dos frutos foi desnecessária para o início do processo de infecção pelos isolados de F. pallidoroseum, embora as lesões tenham sido maiores nos frutos submetidos à câmara úmida. A temperatura influenciou significativamente a severidade da podridão-de-fusário, sendo que as temperaturas ótimas estimadas para o desenvolvimento da doença foram 23,9 °C e 23,0 °C para Orange Flesh e Torreon, respectivamente. A severidade da doença aumentou com o incremento na concentração de inóculo de F. pallidoroseum. As maiores lesões foramobservadas na concentração de 1x106 conídios.mL-1 nas duas cultivares, mas mesmo na menor concentração de inóculo (1x101 conídios.mL-1) foram registrados consideráveis níveis de doença. A concentração de inóculo necessária para gerar 50% do tamanho máximo da lesão na cultivar Orange Flesh foi mais de quatro vezes superior à exigida pela cultivar Torreon

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 369654 bytes, checksum: 05b409e311785546899f27d4c2b5add3 (MD5) Previous issue date: 2008-05-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The aim of this study was to evaluate the removal of mancozeb (Mn), mancozeb NT (NT), and copper hydroxide (Hc) residues from potato and tomato leaflets by rain and/or irrigation. Under controlled conditions different intensities of simulated rain (0, 30, 40, 60, and 97 mm / h), duration (5, 10, 20, and 40 min) and time of drying of the sprayed fungicide suspension (1, 2, 4, 6, and 24 h) were assessed. Greenhouse- grown plants were sprayed with Mn and NT at a rate of 2.4 kg of a.i. / ha and 1.0 kg of Hc a.i. / ha; and let to dry before being taken to the rain simulator. Increasing intensities of simulated rain caused exponential drop of Mn and NT; the same trend was observed for removal of Hc. In both hosts, there was a reduction of residues of all fungicides by increasing the rain duration. No significant difference between the removal of NT and Mn in both potato and tomato leaflets was observed. Increasing dryness time reduced the removal of fungicides residue. After fungicide application, 30 mm / h of rainfall can remove residue from the leaf surface. The deposited fungicide suspension must dry for at least 6h on the leaf surface to avoid the complete removal of fungicide residues by rain or irrigation. Under field conditions, removal of fungicide residues from potato foliage by irrigation and rain was assessed in two trials. The difference between the trials was the amount of water applied in the trial 2: 65mm higher than in the trial 1. The same fungicides and dosages used under controlled conditions were used in the field trials. Two samples were taken at weeks 1 and 2. The linear model described all fungicides removal. In both weeks of the first trial, the removal rate of Mn was higher than that of NT. The late blight severity was low, but in trial 1 all fungicide treatments resulted in less amount of disease than the control when considering the area under the disease progress curve (AUDPC) and maximum severity (P = 0.0001). There was no difference among treatments regarding disease severity in the middle of the epidemics duration (Y50). In the second trial, there was no difference between treatments when comparisons were made in the middle of epidemics, or based in the maximum severity. However, based on the AUDPC, treatments differ from control. / Estudaram-se os resíduos de mancozeb (Mn), mancozeb NT (NT) e hidróxido de cobre (Hc) em batateira e tomateiro em condições controladas, para analisar a influência de diferentes intensidades (0, 30, 40, 60 e 97 mm/h), duração de chuva simulada (5, 10, 20 e 40 min) e tempo de secagem da calda fungicida (1, 2, 4, 6 e 24 h). Em condições de campo, avaliou-se a remoção de resíduos da folhagem de batateira pela irrigação e chuva em dois ensaios. Sob condições controladas, pulverizaram-se plantas com 45 a 60 dias após o plantio com Mn e NT, ambos a 2,4 kg de i.a./ha, e Hc a 1,0 kg de i.a./ha; a seguir, elas foram submetidas aos tratamentos em simulador de chuvas. Com o aumento da intensidade de chuva simulada, houve queda exponencial de Mn e NT; a mesma tendência foi observada para a remoção de resíduos de Hc. Em ambas as hospedeiras, houve redução de resíduos com o aumento do tempo de duração de chuva, inclusive Hc em tomateiro. Não houve diferença significativa entre as perdas de Mn e NT tanto da superfície foliar de batata quanto de tomate. Quanto maior o tempo de secagem, menor a remoção de resíduos de todos os fungicidas. Os ensaios foram realizados em lavoura de batata e com os mesmos fungicidas. No segundo ensaio, a lâmina de água aplicada foi 65 mm maior que no primeiro. Duas amostragens foram realizadas (semanas 1 e 2). O modelo linear descreveu a remoção de todos os fungicidas. Nas semanas 1 e 2 do primeiro ensaio, a taxa de remoção de Mn foi maior que a de NT. A intensidade de requeima foi baixa, porém a testemunha no E1 diferiu dos tratamentos em relação à área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) e severidade máxima (P= 0,0001). Não houve diferença entre os tratamentos quanto à severidade na metade da epidemia (Y50). No segundo ensaio, não houve diferença entre os tratamentos quanto à severidade máxima, tampouco na metade da epidemia, diferindo apenas quanto à AACPD entre a testemunha e os demais tratamentos. Após a aplicação dos fungicidas, chuvas a partir de 30 mm/h podem remover resíduos de fungicidas da superfície foliar. É necessário tempo de secagem mínimo de 6h para assegurar menor remoção desses resíduos da superfície foliar.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2474594 bytes, checksum: 6cdab11f886d77e7d0c8a3d024dde318 (MD5) Previous issue date: 2008-07-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The genus Begomovirus (family Geminiviridae) includes viruses with a genome comprised of one or two molecules of circular, single-stranded DNA, transmitted to dicot species by the whitefly Bemisia tabaci. In Brazil, after the introduction of the B biotype of B. tabaci in the early 1990s, the incidence of begomoviruses in tomato has become frequent, with several reports of new viral species. Some of these species have become prevalent under field conditions, including Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). The purpose of this study was to characterize two isolates of these species through the cloning of their whole genomes followed by molecular analysis, and the production of infectious clones for determination of their host ranges. Total DNA extracts of infected plants were used for whole genome amplification using the phi29 phage DNA polymerase. The amplification products were cloned into plasmids and completely sequenced. Sequence analysis indicated that the DNA-A and DNA-B of ToSRV-[BR:Pir1:05] and ToYVSV- [BR:Pda30:05] isolates had greater than 90% identities with other isolates of ToSRV and ToYVSV, respectively. The molecular analysis indicated that the DNA-A of the BR:Pir1:05 isolate may be the result of a recombination event, in which the virus acquired the rep ORF of Tomato rugose mosaic virus (ToRMV) and the cp ORF of an unidentified virus. Analysis of the DNA-B of the same isolate indicated the existence of a relationship with viruses that infect weed/wild hosts in Brazil, corroborating the hypothesis that viruses present in wild hosts led to the virus currently found in tomatoes. Additionally, because of the high identity observed between the DNA-B of ToSRV-[BR:Pir1:05] and ToRMV, it is possible that this genomic component is shared by the two viruses. In host range assays, plants showing latent infections were observed for both isolates. Such plants can act as natural reservoirs and serve as a primary source of inoculum for host plants of economic importance such as the tomato. The infectious clones of ToYVSV- [BR:Pda30:05] had low infectivity in the host range assays. It is possible that the inoculation method was not effective in the transmission of this isolate, or one or both clones could contain mutations that reduce the efficiency of their replication. / O gênero Begomovirus (família Geminiviridae) inclui vírus com genoma composto por uma ou duas moléculas de DNA fita simples, transmitidos a espécies de plantas dicotiledôneas pela mosca-branca Bemisia tabaci. No Brasil, após a introdução do biótipo B de B. tabaci no início da década de 1990, a incidência de begomovírus em tomateiro tornou-se freqüente, com vários relatos de novas espécies virais. Algumas dessas espécies tornaram-se prevalentes em condições de campo no Brasil, incluindo o Tomato severe rugose virus (ToSRV) e o Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). O objetivo deste trabalho foi caracterizar dois isolados dessas espécies, por meio da clonagem de seus genomas completos seguida de análise molecular, e da obtenção de clones infecciosos para determinação de suas gamas de hospedeiros. Extratos de DNA total de plantas infectadas foram utilizados para a amplificação do genoma viral completo utilizando-se a DNA polimerase do fago φ29. Os produtos da amplificação foram clonados em plasmídeos e completamente seqüenciados. A análise das seqüências do DNA-A e DNA-B dos isolados ToSRV- [BR:Pir1:05] e ToYVSV- [BR:Pda30:05] indicou valores de identidade acima de 90% com outros isolados de ToSRV e ToYVSV, respectivamente. A análise molecular indica que o DNA-A do isolado BR:Pir1:05 pode ser resultado de um evento de recombinação, no qual o vírus adquiriu a ORF rep do Tomato rugose mosaic virus (ToRMV) e a ORF cp de um vírus não identificado. A análise do DNA-B do mesmo isolado indica a existência de relacionamento com vírus que infectam plantas daninhas/silvestres no Brasil, reforçando a hipótese de que vírus presentes em hospedeiros silvestres deram origem aos vírus atualmente encontrados em tomateiro. Adicionalmente, devido à alta identidade observada entre os DNAs-B dos isolados BR:Pir1:05 e do ToRMV, é possível que este componente genômico seja compartilhado pelos dois vírus. Nos testes de gama de hospedeiros, plantas apresentando infecções latentes foram observadas para os dois isolados. Tais plantas podem atuar como reservatórios naturais e servir de fonte de inóculo primário para plantas hospedeiras de importância econômica, como o tomateiro. Os clones infecciosos do isolado BR:Pda30:05 apresentaram baixa infectividade nos testes de gama de hospedeiros. É possível que o método de inoculação não tenha sido eficiente na transmissão deste isolado, ou que os clones apresentem mutações que reduzam a eficiência de sua replicação.