Made available in DSpace on 2016-06-02T18:57:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4191.pdf: 677581 bytes, checksum: e7aef0443c9085d4d6c4b894377923d8 (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / The citrus industry faces serious problems represented by diseases that reduce the productivity and depreciate the fruits that give the appearance thereof. Among these diseases the citrus black spot caused by Guignardia citricarpa is one of the most important. As the predominant control of this disease is related to the chemical application, the financial costs, environmental and public health of these applications, as well as the increasing restrictions on the presence of residues in fresh fruits, and the possibility of emergence of resistant strains of pathogens to fungicides, it is necessary to study new control alternatives. Therefore, this work aimed to investigate the use of biocontrol agents, under field conditions, by applications of Bacillus subtilis, Trichoderma spp., uréia e combinação dos produtos comerciais Soil-Set® + Compostaid® on the citrus leaves that fallen to the ground, in order to reduce the production of ascospores directly and, indirectly, by acceleration of the decomposition of citrus leaves. The results of this work showed the viability of such applications as a help during the disease management to control of citrus black spot. / O setor citrícola enfrenta sérios problemas representados por doenças que, além de diminuírem a produtividade, depreciam os frutos pelo aspecto que conferem aos mesmos. Dentre tais doenças encontra-se a mancha preta dos citros, causada por Guignardia citricarpa. A medida predominante de controle desta doença corresponde às aplicações com produtos químicos. Considerando-se os custos financeiros, ambientais e de saúde pública destas aplicações, as crescentes restrições à presença de resíduos em frutas frescas e, a possibilidade de seleção de linhagens resistentes dos patógenos aos fungicidas, faz-se necessário o estudo de novas alternativas de controle. Portanto, este trabalho teve por objetivo estudar a utilização de diferentes agentes de biocontrole, sob condições de campo, através de aplicações de Bacillus subtilis, Trichoderma spp., uréia e combinação dos produtos comerciais Soil-Set® + Compostaid® sobre as folhas de citros caídas ao solo, visando reduzir a produção de ascósporos direta e, indiretamente, pela aceleração da decomposição das mesmas. Os resultados encontrados neste trabalho mostraram a viabilidade de tais aplicações, como medida auxiliar no manejo de controle da mancha preta dos citros

Made available in DSpace on 2016-06-02T18:57:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5948.pdf: 2099671 bytes, checksum: a2a82b16af89dab4eb5f364794eebc2f (MD5) Previous issue date: 2014-05-29 / Financiadora de Estudos e Projetos / The species of fungi belonging to the genus Trichoderma can be found in many environments, especially in the rhizosphere, as colonizers of roots and plant growth promoters, for their ability in facilitating the absorption of nutrients and protecting them against attack by pathogens. Thus, this study aimed to test isolates of Trichoderma spp. for application as growth promoting agents and inducers of resistance to Phytophthora nicotianae in citrus rootstocks. First, eighteen isolates of Trichoderma were tested in vitro for their ability in inhibiting mycelial growth of P. nicotianae, in terms of: production of volatiles or termostable antifungical substances and cell free compounds. The growth promotion test was done with three rootstocks: Sunki tangerine, Swingle citrumelo and Rangpur lime, whose height and number of leaves were measured at 30, 60, 90, 120, 150 and 180 days after treatment with the antagonistic; and in the end of the test, the measuring of dry weight for shoots and roots of plants was measured. The seeds of the rootstocks were treated with the Trichoderma spp isolates and, 180 days later, was tested their capacity of resistance induction through pathogen inoculation on stem, assessed by lesion length. The Phytophthora control assay was carried out by seeds microbiolization of tangerine Sunki and Rangpur lime. By the results, it was found that all Trichoderma spp. isolates provided more than 50% inhibition of the pathogen colony, however, no one produced volatile metabolites. Five isolates produced cell free metabolites and, only the ACB-38 produced termostable antifungal substances, capable of inhibiting the pathogen growth. Trichoderma spp. has the potential for rootstocks growth promoting and resistence inducing to P. nicotianae, but the responses vary according to the plant genotype and the type of isolate antagonist applied. Most isolates of Trichoderma spp. tested were able to control P. nicotianae in Sunki tangerine and Rangpur lime plants. / As espécies de fungos pertencentes ao gênero Trichoderma podem ser encontradas em muitos ambientes, principalmente na rizosfera, como colonizadores de raízes de plantas e promotores de crescimento das mesmas, por facilitarem a absorção de nutrientes, além de protegê-las contra o ataque de fitopatógenos. Sendo assim, esse trabalho teve por objetivo selecionar isolados de Trichoderma spp. com potencial de aplicação como agentes promotores de crescimento e indutores de resistência à Phytophthora nicotianae em porta-enxertos de citros. Primeiramente, avaliou-se in vitro a produção de metabólitos voláteis, termoestáveis e livres de células de dezoito isolados de Trichoderma spp., assim como, a atividade antagônica sobre o crescimento micelial do patógeno. Os testes in vivo compreenderam estudos de promoção de crescimento de três porta-enxertos: tangerina Sunki, citrumelo Swingle e limão Cravo, avaliando-se a altura e o número de folhas aos 30, 60, 90, 120, 150 e 180 dias após o tratamento com o antagônico e, a produção de massa seca da parte aérea e raiz das plantas. Microbiolizou-se as sementes dos porta-enxertos e testou-se a indução de resistência pela inoculação no caule, 180 dias após o tratamento, avaliada pelo comprimento de lesão. O teste de controle de Phytophthora foi realizado pela microbiolização de sementes de tangeriana Sunki e limão Cravo. Pelos resultados dos testes in vitro, verificouse que, todos os isolados de Trichoderma spp. proporcionaram mais de 50 % de inibição na colônia do fitopatógeno, porém, nenhum produziu metabólitos voláteis. Cinco isolados produziram metabólitos livres de células e, somente o ACB-38 produziu substâncias antifúngicas termoestáveis, com capacidade para inibir o desenvolvimento do patógeno. Trichoderma spp. têm potencial para promover crescimento de porta-enxertos cítricos, bem como induzir a resistência à P. nicotianae, porém, as respostas variam de acordo com o genótipo da planta e com o isolado do antagonista utilizado. A maioria dos isolados de Trichoderma spp. testada foi capaz de controlar P. nicotianae em plantas de tangerina Sunki e limão Cravo.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01 - capa_abstract.pdf: 107744 bytes, checksum: 0807d1ecfd23bdfe8fe2f85acc20e131 (MD5) Previous issue date: 2008-02-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Rice (Oryza sativa L.) is known to accumulate high amount of silicon (Si) on its tissues with helps to decrease the intensity of many economically important diseases. Among these diseases, brown spot, caused by the fungus Bipolaris oryzae, is the most devasting because negatively affects yield and grain quality. This study aimed to evaluate the importance of the active Si uptake in rice on the control of brown spot. Some components of host resistance as well as physiological and biochemical variables were evaluated on plants from cultivar Oochikara and its respective mutant lsi1 (low silicon 1; deficient in the active Si uptake). Plants were grown in hydroponic culture amended with 0 or 2 mmol Si L-1 and inoculated or not with B. oryzae. The components of host resistance evaluated were: incubation period (IP), relative infection efficiency (RIE), final disease severity (FDS), area under brown spot progress curve (AUBSPC), final lesion size (FLS), rate of lesion expansion (r) and area under lesion expansion progress curve (AULEPC). Si content in rice tissues was also determined. The physiological and biochemical variables studied were: concentration of malonic aldehyde (MA), electrolyte leackage (EL), concentration of total soluble phenolics (TSP) and derivatives of lignin-thioglicolic acid (DLTGA) as well as the activity of chitinases (CHI), peroxidases (POX) and poliphenoloxidases (POL). Si content on tissues of plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 supplied with this element increased, respectively, by 381 and 263%. Plants from cultivar Oochikara had 112% more Si than plants from mutant lsi1. The IP of brown spot on leaves of plants from cultivar Oochikara increased about 6 h in the presence of Si and the RIE, FS, AUBSPC, FLS, r and AULEPC were significantly reduced, respectively, in 65, 70, 75, 33, 36 and 35%. In the presence of Si, the IP increased 3 h on plants from mutant lsi1, but the RIE, FS, AUBSPC, FLS, r and AULEPC were only reduced, respectively, in 40, 46, 50, 12, 21 and 12%. The correlation between Si content on tissues and IP was significantly positive, but it was negatively correlated with RIE, FS, AUBSPC, FLS, r and AALEPC. Single degree of freedom contrasts were performed to verify if there was significative difference between plants from cultivar Oochika a and from mutant lsi1 supplied or not with Si. Plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 supplied with Si were significantly different from plants not supplied with this element for all components of resistance evaluated. This indicates that the availability of Si to plants was detrimental for increase their resistance to brown spot. Comparisons between plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 not supplied with Si showed that there was no difference for the components of resistance studied. However, the comparison between plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 supplied with Si indicated that there was difference for the components of resistance evaluated. This clearly indicates that a less Si content in tissues of plants from mutant lsi dramatically affected its basal resistance to brown spot. Biochemical and physiological changes associated with an increase in rice resistance, mainly for plants from cultivar Oochikara supplied with Si, to brown spot occurred through a less concentration of MA and EL besides an increase in the concentration of TSP and on the activity of CHI and POX. The lower concentration of MA and EL suggests, even though indirectly, a less cellular damage caused by the fungus during the infection course. The participation of POL in rice resistance to brown spot, regardless of the presence of Si, was not evident. The concentration of DLATG was higher on plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 not supplied with Si, probably due to the lower number of lesions formed on leaves of these plants. In general, plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 supplied with Si showed a high assimilation of CO2 upon inoculation with B. oryzae. Interestingly, the assimilation of CO2 from non-inoculated plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 supplied with Si was also great. The concentration of total chlorofil and carotenoids on non- inoculated plants from cultivar Oochikara and from mutant lsi1 was not affected by Si. However, when plants supplied with Si were inoculated, the concentration of total chlorofil and carotenoids was higher. Contrary to plants from cultivar Oochikara, Si had a less impact in affect some components of resistance and the physiological and biochemical variables on plants from the mutant lsi1. In conclusion, the results from this study underline the importance of the active Si uptake system in rice for an increased in resistance to brown spot as well as for a better physiological response of plants to this biotic type of stress. / Dentre as plantas até então estudadas, o arroz (Oryza sativa L.) é a com a maior capacidade de acumular silício (Si). Entre os benefícios atribuídos a esse elemento está o controle de doenças. Neste estudo, objetivou-se avaliar a importância da absorção ativa de Si pelas plantas de arroz no controle da mancha parda (Bipolaris oryzae). Para isso foram avaliados alguns componentes da resistência em plantas da cultivar Oochikara e no seu respectivo mutante lsi1 cultivadas em solução nutritiva contendo 0 ou 2 mmol Si L-1, bem como algumas variáveis bioquímicas e fisiológicas associadas com a resistência das plantas de arroz a Bipolaris oryzae. Os componentes de resistência avaliados foram: período de incubação (PI), eficiência relativa de infecção (ERI), severidade final (SF), área abaixo da curva de progresso da mancha parda (AACPMP), o comprimento final de lesão (CFL), taxa de expansão de lesão (r) e área abaixo de curva de progresso da expansão de lesão (AACPEL). As variáveis bioquímicas e fisiológicas estudadas foram: concentração de aldeído malônico (MDA), extravasamento de eletrólitos (EE), a atividade das quitinases (QUIs), peroxidases (POXs) e polifenoloxidases (PFOs), concentração de compostos fenólicos solúveis totais (CFST) e concentração de derivados lignina-ácido tioglicólico (DLATG). A concentração foliar de Si nas plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1, ambas supridas com o elemento, foi de até 381 e 263% maior, respectivamente, em relação à das plantas não supridas. Nas plantas supridas com Si, o acúmulo pela cultivar Oochikara foi 112% superior em relação ao mutante lsi1. Nas folhas das plantas da cultivar Oochikara, supridas com Si, o PI da mancha parda aumentou em seis horas. Nessas plantas, ERI, SF, AACPMP, CFL, r e AACPEL foram reduzidas, respectivamente, em 65, 70, 75, 33, 36 e 35% em relação às folhas das plantas não supridas com Si. Nas folhas das plantas do mutante lsi1, supridas com Si, o PI aumentou três horas, a ERI, SF, AACPMP, CFL, r e AACPEL foram reduzidas, respectivamente, em 40, 46, 50, 12, 21 e 12% em relação às folhas das plantas não supridas com Si. Correlação positiva e significativa foi obtida da concentração foliar de Si com o PI da mancha parda. Em contraste, observou-se correlação negativa e significativa entre a concentração foliar de Si com a ERI, SF, AACPMP, CFL, r e AACPEL. Análises de contrastes foram realizadas para verificar a existência de diferença entre plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1 supridas ou não com Si. Os resultados mostraram que plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1 supridas com Si foram diferentes das plantas não supridas com Si para os componentes de resistência. Isso indica que a presença de Si foi crucial para uma maior resistência das plantas de arroz a mancha parda. Na comparação entre plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1, ambos não supridos com Si, não ocorreu diferença significativa entre os componentes de resistência avaliados. Já entre plantas cultivar Oochikara e do mutante lsi1, ambos supridos Si, ocorreu diferença significativa, indicando que o menor acúmulo de Si pelo mutante lsi1 comprometeu a expressão da resistência de plantas de arroz a mancha parda. As alterações bioquímicas e fisiológicas relacionadas com a maior resistência das plantas de arroz, principalmente da cultivar Oochikara supridas com Si, foram uma proteção resultando em danos celulares, causados por B. oryzae, em menor extensão como indicado pela menor concentração de MDA e menor EE. Além de um aumento na produção de CFST e maior atividade das QUIs e POXs. Para a PFOs, não ficou evidente sua participação na defesa das plantas de arroz contra a mancha parda. A concentração de derivados da lignina-ácido tioglicólico foi superior nas plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1 não supridas com Si, provavelmente devido ao maior número de lesões observadas nas folhas dessas plantas. Plantas supridas com Si e inoculadas ou não com B. oryzae apresentaram maior assimilação de CO2. A concentração de clorofila total e carotenóides, em plantas da cultivar Oochikara e do mutante lsi1 não inoculadas, não foi afetada pela presença de Si. No entanto, quando as plantas foram inoculadas com B. oryzae, uma maior concentração de clorofila total e carotenóides foi detectada em folhas das plantas supridas com Si. No mutante lsi1, mesmo na presença de Si, a redução em alguns componentes de resistência associada com a potencialização de mecanismos de defesa foi menos evidente. Ao contrário, em plantas da cultivar Oochikara, alterações de natureza fisiológica e bioquímica culminaram em um aumento na resistência das plantas à mancha parda. Em conclusão, os resultados do presente estudo evidenciam a importância do sistema ativo de absorção do Si pelo arroz para garantir uma maior resistência à mancha parda.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 467886 bytes, checksum: 051d33e9fe8f41b61beb20c091a64c17 (MD5) Previous issue date: 2008-02-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objectives of this work were to study the resistance inheritance of the Híbrido Timor UFV 443-3 to Hemileia vastatrix and identify QTLs associated with resistance to coffee leaf rust. To study the inheritance we used a population of 246 individuals, produced from the controlled self-pollinated F1 H 511-1, 115 susceptible backcrossing (BCS) plants, and 87 resistant backcrossing (BCR) plants, originated from the crossing between F1 with Catuaí amarelo UFV 2148-57 and Híbrido de Timor UFV 443-3, respectively. These populations were inoculated with the race II, and a noncharacterized field isolate, designated pathotype 001, both from a single pustule-isolate of H. vastatrix. For both pathotypes, the Catuaí amarelo UFV 2148-57 was susceptible, while the Híbrido de Timor, the F1, and the BCR plants were resistant. The F2 plants inoculated with the race II showed two goodness of fit by the chi-square test, 15:1 (P=24.92%) and 61:3 (P=87.27%). The resistance inheritance was confirmed by the inoculation of BCs plants which segregated in a rate of 3:1 (P=17.83%), expected for the two genes, whereas the hypothesis of segregation 7:1, expected for three genes, was rejected. These results demonstrate that two independent dominant genes are responsible for the resistance of the Híbrido de Timor 443-3 to the race II of H. vastatrix. Similar results were observed with the pathotype 001 showing a segregation of 15:1 (P=92.13%) in the F2, and 3:1 (P=78.78%) in the BCs. These data indicate that two independent dominant genes, also, control the resistance of the Híbrido de Timor to this pathotype. To identify QTLs associated with the resistance of the Híbrido de Timor UFV 443-3 to coffee leaf rust we tested 286 molecular markers (282 SSR and 4 RAPD) in the parental genotypes. Those polymorphic markers (21 SSR and 4 RAPD) were used to screening the 246 F2 plants and to construct the linkage map. Among the 25 analyzed markers, two did not match to any of the six linkage groups formed by the 23 remaining markers, covering 277.90cM of the genome. Three QTLs were identified, QTLHv1, QTLHv2 and QTLHv3, that explain, 5.94%, 5.52% and 15.92% of the phenotypic variation respectively. The LOD score and the recombination frequency between the marker and respective QTLs were 3.69 and 14cM to the QTLHv1, 3.18 and 0.5cM to the QTLHv2, and 10.33 and 22cM to the QTLHv3. This is the first report of SSR markers in the identification of QTLs associated to the coffee tree resistance to H. vastatrix. These QTLs could be used in the assisted selection for introgression of genes for resistance from the Híbrido de Timor UFV 443-3 to coffee leaf rust into commercial genotypes. / Este trabalho teve como objetivos estudar a herança da resistência do Híbrido de Timor UFV 443-3 a Hemileia vastatrix e identificar QTLs associados à resistência à ferrugem do cafeeiro. Para o estudo da herança, foram utilizadas 246 plantas da população F2, originadas da autofecundação controlada do F1 H 511-1, 115 plantas do retrocruzamento suscetível (RCS) e 87 do retrocruzamento resistente (RCR), derivados de cruzamentos do F1 com o genótipo Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57) e o Híbrido de Timor UFV 443-3, respectivamente. Essas plantas foram inoculadas com a raça II de H. vastatrix e um isolado coletado de Coffea arabica Oeiras , de raça desconhecida, denominado patótipo 001, ambos isolados de lesões monopustulares. Para os dois patótipos, o Catuaí Amarelo UFV 2148-57 foi suscetível, enquanto que o Híbrido de Timor UFV 443-3, a F1 e as plantas do RCR foram resistentes. As plantas F2, quando inoculadas com a raça II, apresentaram duas segregações significativas pelo teste Qui-quadrado, 15:1 (P=24,92%) e 61:3 (P=87,27%). A herança da resistência foi confirmada pela inoculação das plantas do RCS que segregaram na proporção de 3:1 (P=17,83%), esperado para os dois genes, enquanto que a segregação 7:1, esperada para três genes, foi rejeitada. Estes dados sugerem que dois genes dominantes e independentes conferem a resistência desse Híbrido de Timor à raça II de H. vastatrix. Resultados semelhantes foram obtidos com o patótipo 001, onde foi observada segregação de 15:1 (P=92,13%) na F2 e de 3:1 (P=78,78%) no RCS, demonstrando, também, que dois genes dominantes e independentes controlam a resistência do Híbrido de Timor a esse outro patótipo. Para a identificação de QTLs associados à resistência do Híbrido de Timor UFV 443-3 a H. vastatrix, 286 marcadores moleculares (282 SSR e 4 RAPD) foram analisados nos parentais. Os marcadores polimórficos (21 SSR e 4 RAPD) foram utilizados para amplificar o DNA das 246 plantas F2 e construir o mapa genético. Dos 25 marcadores analisados, dois não se ligaram a nenhum dos seis grupos de ligação formados pelos 23 marcadores restantes, que cobriram 277,90 cM do genoma. Três QTLs foram identificados e designados como QTLHv1, QTLHv2 e QTLHv3, que explicaram, respectivamente, 5,94%, 5,52% e 15,92% da variação fenotípica. Os valores de LOD e distância entre as marcas e respectivos QTLs foram de 3,69 e 14 cM para o QTLHv1, 3,18 e 0,5 cM para o QTLHv2 e 10,33 e 22 cM para o QTLHv3. Este é o primeiro relato da utilização de marcadores SSR na identificação de QTLs associados à resistência do cafeeiro a H. vastatrix. Esses QTLs poderão ser utilizados na seleção assistida para a introgressão de genes de resistência do Híbrido de Timor UFV 443-3 à ferrugem nos genótipos comerciais.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 260879 bytes, checksum: fa09049ee9e837e88f50f741ad60afe5 (MD5) Previous issue date: 2009-10-15 / The root-knot nematodes cause great losses in vegetable crops, and they are economically important pathogens of tomato in the world. The use of synthetic nematicides is not desirable due to contamination of the environment. Because of this, alternative control methods have been evaluated for the control of nematodes, such as the use of organic materials with nematicidal effect. There are several sources of organic matters that have proven to have nematicidal effect; however some of them are not consistent in the control of nematodes, although they increase crop productivity. Little is known about the influence of doses of these materials in the control of nematodes. In this study we investigated the effect of agriculture compost; peat, coffee pulp, cow manure, a liquid biofertilizer and earthworm humus on Meloidogyne javanica in tomato in the summer; and coffee pulp, peat and liquid biofertilizer at the recommended dose and half dose in the winter. The organic materials, in general, increased the nematode infection except the coffee pulp, which reduced the gall index. The organic materials, in general, increased the productivity of tomato except the biofertilizer, the only organic matter that did not promote plant growth. In the fall-winter experiment, coffee pulp and peat reduced the number of galls and eggs. The egg reduction for coffee pulp and peat was about 86% and 37%, respectively, for the same dose used in the summer. The biofertilizer only presented control in full dose, and in a half dose, increased nematode infection as in the summer experiment. The peat reduced the nematode population in the full dose. However it was not statistically different of the control treatment in the half dose. The coffee pulp reduced statistically more in full dose than in half dose. / Os nematoides das galhas causam grandes perdas em olerícolas, sendo economicamente importantes patógenos de tomate em todo o mundo. O uso de nematicidas sintéticos não é desejável por contaminarem o meio ambiente. Devido a isso, métodos alternativos de controle vêm sendo estudados para o controle de fitonematoides, como o uso de materiais orgânicos com efeito nematicida. Diversas são as fontes de matéria orgânica que possuem efeito nematicida comprovado, no entanto algumas apresentam resultados controversos no controle do nematoide, apesar de serem inegáveis seus benefícios à produtividade das culturas. Pouco se conhece sobre a influência das dosagens desses materiais no controle de fitonematoides. Investigou-se nesse trabalho o efeito de composto agrícola, turfa, palha de café, esterco bovino, biofertilizante líquido e húmus de minhoca sobre Meloidogyne javanica em tomateiro, no verão; e palha de café, turfa e biofertilizante em dose completa e meia dose no inverno. No experimento de verão, os materiais orgânicos testados, em geral, aumentaram a infecção pelo nematoide, diferindo da testemunha estatisticamente pelo teste de Duncan (5%), exceto a palha de café, que reduziu o índice de galhas. O biofertilizante foi o único que não promoveu crescimento de planta na dose testada. No experimento de outonoinverno, a palha de café e a turfa reduziram o número de galhas e ovos por planta. A redução de ovos por planta com adição de palha de café e turfa foi de 86% e 37%, respectivamente, na mesma dose utilizada no verão. O biofertilizante reduziu a população de nematoides somente na dose completa,sendo que na meia dose aumentou a infecção do nematoide como no experimento do verão. A turfa apresentou reduções significativas na dose completa, mas não diferiu estatisticamente da testemunha na meia dose. A palha de café reduziu significativamente mais na dose completa do que na meia dose.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3609057 bytes, checksum: 2af9cc974a8ec672a5fb592087febb51 (MD5) Previous issue date: 2010-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The rhizome of ginger (Zingiber officinale R.) is one of the most important spices in the world due to its use as feedstock in the food industry, pharaceuticals and cosmetics. The brazilian export of ginger has increased in recent years despite the damage caused by decay of rhizomes. Still unknown are the main etiological agents associated with postharvest rot of ginger in Brasil, a prerequisite for the development of na integrated management program for diseases. This study aimed conduct a survey of fungi and bacteria associated with postharvest decay of ginger rhizomes. Rhizomes to rot symptoms were sampled in 2006 and 2009, in Santa Leopoldina, ES, and in Santa Maria de Jetiba, ES, in packing-house. Another sample was selected in 2008 in Santa Leopoldina, ES, in five farms during the harvest. The samples were sent to the UFV Department of Plant Pathology, for isolation, identification and pathogenicity tests of fungi and bacteria. In the packing-house, it was found the presence of Acremonium murorum, Acrostalagmus luteo-albus, Fusarium graminearum, Fusarium oxysporum, Lasiodiplodia theobromae and Sclerotium rolfsii, and all these were able to cause rot in the rhizomes. In the collection in the field, it was found the average incidence in ginger rhizomes 74 % of F. oxysporum, 31% of F. graminearum, 21% of Fusarium solani, 5% of Nigrospora oryzae, 6% of Fusarium semitectum and of Nigrospora sphaerica, 4% of Alternaria tenuissima, 3% of Penicillium commune, Verticillium sp. (1) and Verticillium sp. (2), 2% of A. luteo-albus, Aspergillus niger, Chaetomium sp. and Epicoccum sp., and 1%of Curvularia geniculata and Mucor hiemalis, for the five properties. Fungi collected in the field capable of causing decay in rhizomes were Acrostalagmus luteo-albus, Fusarium graminearum and Fusarium oxysporum. The occurrence of F. graminearum was considered of great importance because this species known to produce mycotoxins. In this sample, we identified bacteria that cause soft rot in 5% of the rhizomes of ginger, four isolates identified as Enterobacter cloacae subsp. cloacae and one isolate identified as Pseudomonas fluorescens. Enterobacter cloacae subsp. cloacae indicated a probable contamination of fecal origin. Join as the x first occurrence in the world of Fusarium graminearum and Pseudomonas fluorescens causing rot in ginger rhizomes, and the first occurrence in Brasil of Acremonium murorum, Acrostalagmus luteo-albus, Lasiodiplodia theobromae and Sclerotiumrolfsii causing rhizome rot ginger. / O rizoma de gengibre (Zingiber officinale R.) constitui uma das especiarias mais importantes do mundo devido ao uso como matéria-prima na indústria de alimentos, fármacos e cosméticos. A exportação do gengibre brasileiro tem aumentado nos últimos anos apesar dos danos decorrentes das podridões de rizomas. Ainda são desconhecidos os principais agentes etiológicos associados às podridões pós-colheita de gengibre no Brasil, requisito para o desenvolvimento de um programa de manejo integrado de doenças. O presente trabalho teve como objetivo realizar um levantamento de fungos e bactérias associados às podridões pós-colheita de rizomas de gengibre. Rizomas com sintomas de podridões foram amostrados em 2006 e 2009, em Santa Leopoldina, ES e em Santa Maria de Jetibá, ES, em packinghouse. Outra amostragem foi realizada em 2008, em Santa Leopoldina, ES, em cinco propriedades rurais, durante a colheita. As amostras foram encaminhadas ao departamento de Fitopatologia da UFV, para isolamento, identificação e testes de patogenicidade de fungos e bactérias. Em packing-house, constatou-se a presença de Acremonium murorum, Acrostalagmus luteo-albus, Fusarium graminearum, Fusarium oxysporum, Lasiodiplodia theobromae e Sclerotium rolfsii, e todos estes foram capazes de causar podridão em rizomas. Na coleta em campo, verificou-se a incidência média nos rizomas de gengibre de 74% de F. oxysporum, 31% de F. graminearum, 21% de Fusarium solani, 5% de Nigrospora oryzae, 6% de Fusarium semitectum e de Nigrospora sphaerica, 4% de Alternaria tenuissima, 3% de Penicillium commune, Verticillium sp. (1) e Verticillium sp. (2), 2% de A. luteoalbus, Aspergillus niger, Chaetomium sp. e Epicoccum sp., e 1% de Curvularia geniculata e Mucor hiemalis, para as cinco propriedades amostradas. Os fungos capazes de causar podridões em rizomas coletados em campo foram A. luteo-albus, F. graminearum e F. oxysporum. A ocorrência de F. graminearum foi considerada de grande importância, pois esta espécie é conhecidamente produtora de micotoxinas. Nesta amostragem, foram identificadas bactérias causadoras de podridão-mole em 5% dos rizomas de gengibre, 4 isolados identificados como viii Enterobacter cloacae subsp. cloacae e 1 isolado identificado como Pseudomonas fluorescens. Enterobacter cloacae subsp. cloacae indicou uma provável contaminação de origem fecal. Registra-se como a primeira ocorrência, no mundo, de Fusarium graminearum e de Pseudomonas fluorescens causando podridão em rizomas de gengibre, e a primeira ocorrência, no Brasil, de Acremonium murorum, Acrostalagmus luteo-albus, Lasiodiplodia theobromae e Sclerotium rolfsii causando podridão em rizomas de gengibre.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 396843 bytes, checksum: 9fd7aac5086c275bb20b53a394a45824 (MD5) Previous issue date: 2010-07-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Species of the complex Ceratocystis fimbriata sensu lato (sl) are important pathogens of a large number of woody plants and herbs, especially the cultivation of eucalyptus. The disease caused by C. fimbriata, called Ceratocystis wilt, is considered an emerging disease and difficult to control because it is a vascular pathogen with wide host range. The main way for disease control is done by planting resistant material, but the possible variability in the pathogen population may affect the selection of resistant genotypes. In this study, we evaluated the agressivity of isolates of C. fimbriata obtained from Eucalyptus spp. in Brazil. Ten isolates were inoculated in ten commercial clones of Eucalyptus spp. The experiment was conducted in a randomized design in factorial composed of two factors (clone X isolate) with four replications. At 60 days after inoculation, we evaluated the length of lesion in the wood in relation to height (% of diseased tissue). The isolates presented pathogenic variability, differing at various levels of aggressiveness. The ANG1 and PT15 isolates were less aggressive, causing infections in just one clone. The isolates RM35 and PT12 were the most aggressive, while the first was able to infect eight of the ten clones inoculated. The remaining isolates had intermediate values and aggression varied according to clone evaluated. Clones 386 and A06 were the most resistant, while 1172 and 1288 the most susceptible. These clones highly resistant and highly susceptible can be used as comparators in controlled experiments and field inoculation. The result of this work shows that there is variability in the population of C. fimbriata in Eucalyptus spp. and that the most aggressive isolates are recommended for artificial inoculations to select disease resistant genotypes. / Espécies do complexo Ceratocystis fimbriata sensu lato (s.l.) são importantes patógenos de um grande número de plantas arbóreas e herbáceas, com destaque para a cultura do eucalipto. A doença causada por C. fimbriata, denominada murcha-de-ceratocystis, é considerada emergente e de difícil controle por se tratar de um patógeno vascular e com ampla gama de hospedeiros. A principal forma de controle da doença é feita pelo plantio de material resistente, mas a possível variabilidade na população do patógeno pode comprometer a seleção de genótipos resistentes. Neste trabalho, avaliou-se a variabilidade patogênica de isolados de C. fimbriata obtidos de plantas de Eucalyptus spp. no Brasil. Foram inoculados dez isolados do fungo em dez clones comercias de Eucalyptus spp. O experimento foi realizado em delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial composto de dois fatores (clone X isolado), com quatro repetições. Aos 60 dias após a inoculação, avaliou-se o comprimento de lesão no lenho em relação a altura da planta (% de tecido doente). Os isolados apresentaram variabilidade patogênica, diferenciando em vários níveis de agressividade. Os isolados ANG1 e PT15 foram os menos agressivos, causando infecções em apenas um clone. Os isolados RM35 e PT12 foram os mais agressivos, sendo que o primeiro foi capaz de infectar oito dos dez clones inoculados. Os demais isolados tiveram valores intermediários e variaram a agressividade de acordo com o clone avaliado. Os clones 386 e A06 foram os mais resistentes, enquanto 1172 e 1288 os mais suscetíveis. Esses clones altamente resistentes e altamente suscetíveis podem ser utilizados como comparadores nos experimentos de inoculação controlada e no campo. O resultado do presente trabalho permite concluir que existe variabilidade patogênica na população de C. fimbriata de Eucalyptus spp. e que os isolados mais agressivos são recomendados para as inoculações artificiais visando a seleção de genótipos resistentes à doença.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1071091 bytes, checksum: e66eafe7f0d234fc9622a12ffaa47c2c (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In the past, there was no preoccupation in minimizing water consumption which was probably due the belief of its abundance and easy access. Nowadays, the interest in water conservation and reuse has increased especially in forest nurseries. However, before water is reused it must be treated in order to minimize the risk of spread inocula of pathogens and to reduce losses caused by diseases. In this study, water treatment processes of ultrafiltration and conventional physical-chemical treatment were evaluated regarding the eradication inocula of Ralstonia solanacearum, Xanthomonas axonopodis, Botrytis cinerea and Cylindrocladium candelabrum, the most common nursery pathogens in Brazil. The ultrafiltration eradicated over 99% inocula of R. solanacearum, X. axonopodis and B. cinerea and 100% of inoculum of C. candelabrum. The treated water was tested for irrigation and yielded no infected eucalyptus rootted cuttings. Sand filtration used in the physical-chemical treatment system allowed complete eradication of C. candelabrum inoculum, but complete inoculum eradication of the other pathogens was only achieved after chlorination of the filtered water with residual chlorine from 1.74 mg/L. No symptoms of phytotoxicity were found on Eucalyptus rooted cuttings irrigated with water containing residual chlorine at 1.74 mg/L. Both methods tested are practical, viable and safe to eradicate phytopathogens inoculum from irrigation water. / No passado, não havia conscientização em minimizar o consumo de água em virtude de sua abundância e facilidade de obtenção. Entretanto, atualmente tem aumentado o interesse pelo uso racional da água e sua reutilização, especialmente em viveiros florestais. Porém, antes de sua reutilização, a água tem que ser devidamente tratada visando à erradicação de inóculo fitopatogênico a fim de minimizar os riscos de dispersão de patógenos e mitigar as perdas causadas por doenças. No presente trabalho, avaliou-se a eficiência do tratamento da água por ultrafiltração e pelo método físicoquímico convencional visando à erradicação de inóculo de Ralstonia solanacearum, Xanthomonas axonopodis, Botrytis cinerea e Cylindrocladium candelabrum, principais patógenos, comumente encontrados em viveiros florestais. A ultrafiltração permitiu erradicar acima de 99% de inóculo de R. solanacearum, X. axonopodis e B. cinerea e 100% de C. candelabrum. A baixa quantidade de inóculo remanescente dos três primeiros patógenos não induziu doenças nas mudas inoculadas. A floculação e filtração rápida em filtro de areia empregadas no método físíco-químico permitiram erradicação completa de inóculo de C. candelabrum, mas para os demais patógenos obteve-se a erradicação total somente após cloração da água filtrada com cloro residual a partir de 1,74 mg/L. Mudas de três clones de eucalipto irrigadas por 45 dias com água contendo cloro residual a 1,74 mg/L não apresentaram sintomas de fitotoxicidade. Ambos os métodos testados são práticos, viáveis e principalmente seguros visando à eliminação de inóculo de fitopatógenos da água de irrigação.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1333692 bytes, checksum: 9bcd2dfa7f5cb679627a7e4240a82858 (MD5) Previous issue date: 2011-02-24 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / The coffee leaf rust caused by the biotrophic fungus Hemileia vastatrix, it is the most important fungal disease of coffee, causing productivity losses and its control increases the costs of coffee production. This study aimed to identify genes of H. vastatrix that encode secreted proteins that may function as effectors needed for the establishment of the biotrophic interaction and / or as triggers of resistance responses, by analyzing a database consisting of 9828 expressed sequence tags (ESTs) from an susceptible interaction. These ESTs were generated by sequencing the 5' end of cDNA clones from a library constructed from mRNA isolated from coffee leaves collected 12 days after inoculation with single pustule isolation HV-01. It was obtained 1004 contigs and 3301 singlets after clustering the sequences using the CAP3 program. From 890 unique transcripts that encode proteins without similarity to sequences of non-redundant database of GenBank / NCBI, which had no identity to sequences of Coffea spp., also deposited in this database, were identified 46 ORFs that encode peptides over 60 amino acids with positive prediction from five or more parameters of algorithms used to predict secretion signal sequences. We selected five genes which were amplified from the H. vastatrix genome, generating fragments equal or higher than those amplified from cDNAs. These genes, unique to H. vastatrix showed no identity with cDNA sequences derived from germination spores, demonstrating that their expression may occur within the infected tissue. The secretion of proteins encoded by four genes was demonstrated using the Yeast Secretion System. Functional studies should be conducted to confirm the effector activity of the genes characterized, as well as from other genes identified in this study, whose origin and secretion of fungal the predicted proteins in yeast has been demonstrated. / A ferrugem causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix é a doença mais importante do cafeeiro, pois atinge, com gravidade, grandes áreas de lavouras, onde causa prejuízos na produtividade e seu controle aumenta os custos de produção. O presente trabalho teve por objetivo identificar genes de H. vastatrix que codificam proteínas secretadas que possam funcionar como efetores necessários para o estabelecimento da interação biotrófica e, ou, como desencadeadores de respostas de resistência, por meio da análise de um banco constituídos por 9828 etiquetas de sequências expressas (ESTs) em uma interação suscetível. Essas ESTs foram geradas pelo sequenciamento da extremidade 5´de clones de cDNA de uma biblioteca construída a partir de mRNA isolado de folhas de cafeeiro coletadas 12 dias após a inoculação com o isolado monopustular HV-01. Foram obtidos 1004 contíguos e 3301 singletos após o alinhamento das sequências pelo programa CAP3. A partir de 890 transcritos únicos que codificam proteínas sem similaridade a sequências do banco não redundante do GenBank/NCBI e que não possuíam identidade a sequências de Coffea spp. também depositadas nesse banco de dados, foram obtidas 46 ORFs que codificam peptídeos com mais de 60 aminoácidos e predição positiva em cinco ou mais parâmetros do algoritmo de predição de sequências sinal de exportação SignalP. Foram selecionados cinco genes que tiveram a região da ORF amplificada do genoma de H. vastatrix, gerando fragmentos iguais ou maiores aos amplificados a partir do cDNA. Esses genes, exclusivos de H. vastatrix, não mostraram identidade com sequências únicas derivadas de esporos germinados desse patógeno, demonstrando que a sua expressão ocorre no interior do tecido infectado. A secreção das proteínas codificadas por quatro genes foi confirmada em levedura. Estudos funcionais deverão ser realizados para comprovar a atividade efetora dos genes caracterizados, assim como dos demais genes identificados nesse estudo, cuja origem fúngica e secreção das proteínas preditas em levedura seja demonstrada.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1345308 bytes, checksum: 4904086a1207f460b748a72cd12e433b (MD5) Previous issue date: 2010-08-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The leaf bligh and defoliation of teratosphaeria is one of the most important leaf diseases of Eucalyptus globulus. Due to the importance of this specie for production of pulp and paper and the recent report of the leaf disease in Brazil, this study was carried out aiming the identification of the pathogen in Santa Catarina and Rio Grande do Sul and to test the mycelial growth and sporulation of the fungus under different culture media. The following species were identified: Mycosphaerella scytalidii, M. lateralis, Teratosphaeria ohnowa, T. perpendicularis, T. pseudafricana, T. flexuosa and T. nubilosa. Based on ascospore germination patterns, more than one species of the fungus was found concurrently in a single lesion or in a single leaf. Slow growth and lack of sporulation of the fungus species are limiting factors for the production of inoculum to be used in inoculation under controlled conditions. Thus in the second phase of this study, we tested the mycelial growth and sporulation of the identified cultures in several culture media. Mycosphaerella scytaliddi, Teratosphaeria ohnowa and Teratosphaeria flexuosa presented a higher growth rate in coconut water-agar (CWA), malt extract-agar (MEA), potato- dextroseagar (PDA), mycophil-ágar (MA), and oatmeal-sacarose-agar (OSA); Teratosphaeria nubilosa presented higher growth rate in PDA, OSA, and MEA. No sporulation was obtained for all species tested. / A mancha foliar e desfolha de teratosphaeria é uma das doenças foliares mais severas de Eucalyptus globulus. Tendo em vista a importância dessa espécie para a produção de celulose e papel e a recente constatação da doença no Brasil, procurou-se no presente estudo identificar as espécies do patógeno associadas à doença em Santa Catarina e no Rio Grande do Sul e avaliar a influência de meios de cultura sobre o crescimento micelial e a esporulação das espécies identificadas. As seguintes espécies foram identificadas: Mycosphaerella scytalidii, M. lateralis, Teratosphaeria ohnowa, T. perpendicularis, T. pseudafricana, T. flexuosa e T. nubilosa. Baseado no padrão de germinação dos ascósporos encontraram-se mais de uma espécie do fungo em uma mesma lesão ou em uma mesma folha. Na segunda fase do estudo, avaliaram-se o crescimento micelial e a esporulação das culturas identificadas. Mycosphaerella scytalidii, T. ohnowa e T. flexuosa apresentaram maior área abaixo da curva de crescimento micelial nos meios água de cocoágar (ACA), extrato de malte-ágar (MEA), batata-dextrose-ágar (BDA), micophil-ágar (MIC) e aveia-sacarose-ágar (AVSA). Teratosphaeria nubilosa apresentou maior área abaixo da curva de crescimento micelial nos meios BDA, AVSA e MEA. Nenhum dos meios testados propiciou a esporulação das espécies testadas.