Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-25T22:10:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Jadson Diogo Pereira Bezerra.pdf: 2111258 bytes, checksum: a81c84d27b6814ba348cd55237e852ba (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-28T18:13:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Jadson Diogo Pereira Bezerra.pdf: 2111258 bytes, checksum: a81c84d27b6814ba348cd55237e852ba (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-28T18:13:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Jadson Diogo Pereira Bezerra.pdf: 2111258 bytes, checksum: a81c84d27b6814ba348cd55237e852ba (MD5) Previous issue date: 2016-12-27 / CAPES / CNPq / Fungos endofíticos vivem associados simbioticamente com plantas de diversos ecossistemas em todo o mundo e são relatados como protetores das plantas contra patógenos e estresses ambientais. No Brasil, o ecossistema Caatinga, representante do bioma floresta tropical seca, compreende uma das florestas mais diversas e de importância ambiental e econômica do país. Entretanto, só recentemente tem recebido a atenção dos pesquisadores para a sua preservação, estimativa da diversidade e benefícios econômico-sociais associados. O presente estudo teve com objetivo estudar a diversidade de fungos endofíticos associados a Pilosocereus gounellei subsp. gounellei, Melocactus zehntneri e Tacinga inamoena em áreas de Caatinga preservada e em áreas com agricultura familiar sustentável no estado de Pernambuco (Brasil). Para isso, foram coletados cladódios de representantes das três espécies de cactos, e após assepsia do material foram utilizados 1.620 fragmentos de tecido vegetal. Para identificação dos fungos endofíticos foi utilizada taxonomia polifásica (morfologia, técnicas moleculares, fisiologia, bioquímica e/ou análise proteômica). No total, 496 fragmentos vegetais foram colonizados (30 %) e 317 fungos endofíticos foram isolados. O cacto T. inamoena e a área da Caatinga com agricultura familiar apresentaram as maiores taxas de colonização (16,91 % e 66 %, respectivamente). Os fungos endofíticos foram identificados como pertencentes a 71 táxons, principalmente do filo Ascomycota (classes Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Saccharomycetes e Sordariomycetes), distribuídos em 49 gêneros. Houve diferenças significativas nas comunidades de fungos endofíticos entre os três cactos e entre as duas áreas estudadas. A composição da comunidade de fungos endofíticos diferiu entre os cactos e entre áreas de Caatinga. A maior riqueza de fungos endofíticos foi associdada com T. inamoena (24 táxons na Caatinga preservada e 27 táxons na Caatinga com agricultura familiar). A diversidade de fungos difere entre os cactos e as áreas de Caatinga estudadas, sendo M. zehntneri e a área de Caatinga preservada os que apresentaram a maior estimativa de diversidade. Não foram recuperados os dados estimados para as comunidades de fungos. Entretanto, a riqueza obtida se aproximou da esperada. Os gêneros Alternaria, Penicillium, Candida, Cladosporium, Phoma, Aureobasidium, Exophiala e Toxicocladosporium tiveram representantes mais frequentemente isolados, e Aspergillus lentulus, Chaetomium aureum, Penicillium simplicissimum, Purpureocillium lilacinum e Talaromyces aurantiacus foram espécies indicadoras para o cacto M. zehntneri. Toxicocladosporium foi um táxon indicador para o hospedeiro P. gounellei subsp. gounellei. Os endófitos Alternaria gossypina e Talaromyces aurantiacus foram espécies indicadoras de áreas de Caatinga com agricultura familiar. Alguns endófitos estão sendo descritos como novos táxons. Espécies de cactos da Caatinga possuem uma marcante “micodiversidade endofítica” e devem ser preservadas in situ e ex situ para contribuir com as estimativas da diversidade fúngica global. / Endophytic fungi lives symbiotically associated with plants in diverse ecosystems around the world, and they are reported as plant protectors against pathogens and environmental stresses. In Brazil, the Caatinga ecosystem, representative of the tropical dry forest biome, comprises one of the most diverse and important forests to environmental and economy. However, it recently received an attention of the researchers for its preservation, estimation of the diversity and associated socio-economic benefits. The present study aimed to study the diversity of endophytic fungi associated with the cacti Pilosocereus gounellei subsp. gounellei, Melocactus zehntneri and Tacinga inamoena in protected areas of the Caatinga and areas with sustainable family farming in the state of Pernambuco (Brazil). For this purpose, the three cacti species were collected, and after sterilization of the plant material we used 1,620 fragments of the plant tissue. For identification of the endophytic fungi was used polyphasic taxonomy (morphology, molecular techniques, physiology, biochemistry and/or proteomic analysis). In total, 496 tissue fragments were colonized (30%), and 317 endophytic fungi were isolated. The cactus T. inamoena and the Caatinga with family farming presented the highest rates of colonization (16.91% and 66%, respectively). The 317 endophytic fungi were identified as belonging to 71 taxa mainly of the Ascomycota (classes Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Saccharomycetes and Sordariomycetes), and they were distributed in 49 genera. There was a significant difference in the endophytic fungi community between the three cacti and the two studied Caatinga areas. The composition of the endophytic fungi community differed between cacti and Caatinga areas. The greatest richness of endophytic fungi was associated with T. inamoena (24 taxa in the protected Caatinga, and 27 taxa in the Caatinga with sustainable family farming). The diversity of fungi differs between cacti and Caatinga areas, with the cactus M. zehntneri and the protected Caatinga area presented a greater diversity estimate. The estimated data for fungal communities were not recovered. However, the obtained richness was close to the expected richness. The genera Alternaria, Penicillium, Candida, Cladosporium, Phoma, Aureobasidium, Exophiala and Toxicocladosporium had representatives more frequently isolated, and Aspergillus lentulus, Chaetomium aureum, Penicillium simplicissimum, Purpureocillium lilacinum and Talaromyces aurantiacus were indicators species for cactus M. zehntneri. Toxicoclipsporium was an indicator taxon for the host P. gounellei subsp. gounellei. The endophytes Alternaria gossypina and Talaromyces aurantiacus were indicators species to the Caatinga with family farming. Some endophytes are described as new taxa. Cacti species in the Caatinga forest have an important endophytic microdiversity, and they have to be protected in situ and ex situ to contribute to the estimates of the global fungal diversity.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-05T19:17:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Paula Danielle de Souza Vieira.pdf: 2293181 bytes, checksum: 9ee7785ee557c4161ebf9d86c1d29ed2 (MD5) / Rejected by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br), reason: Pedro, por favor, poderia trocar o arquivo pelo que está no banco? ObrigadA! on 2018-09-20T18:15:36Z (GMT) / Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-10-02T17:06:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Paula Danielle de Souza Vieira.pdf: 2132569 bytes, checksum: 6f27b5f6a08046d4a716c76a2f5be75a (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-10-02T18:21:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Paula Danielle de Souza Vieira.pdf: 2132569 bytes, checksum: 6f27b5f6a08046d4a716c76a2f5be75a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-02T18:21:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Paula Danielle de Souza Vieira.pdf: 2132569 bytes, checksum: 6f27b5f6a08046d4a716c76a2f5be75a (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / FACEPE / A bioprospecção de metabólitos secundários produzidos por fungos endofíticos constitui uma atividade promissora na pesquisa e detecção de novas espécies capazes de produzir compostos com atividades biológicas de interesse na área de saúde e na agronômica. O objetivo deste estudo foi isolar e determinar a frequência de colonização de fungos endofíticos associados a folhas, pecíolos, raízes e sementes da planta medicinal Plantago major, avaliar sua capacidade para produzir metabólitos secundários com ação antibacteriana e antifúngica frente a micro-organismos patogênicos, bem como analisar a eficiência da utilização de resíduos agroindustriais como meios de cultivo alternativos para endofíticos, visando à produção de esporos e de compostos bioativos. As espécies mais frequentemente isoladas foram Phoma eupyrena, Colletotrichum gloeosporioides, Fusarium oxysporium e Pestalotiopsis maculans. Os resultados obtidos apontam os fungos endofíticos associados a P. major como uma fonte promissora de metabólitos secundários bioativos, onde esses compostos podem ser obtidos a baixo custo por fermentação em resíduos agroindustriais de arroz e maracujá. / Bioprospecting of secondary metabolites produced by endophytes is a promising activity in research and detection of new species capable of producing compounds with biological activities of interest in the area of health and agronomy. The aim of this study was to isolate and determine the frequency of colonization of endophytic fungi associated with leaves, petioles, roots and seeds of medicinal plant Plantago major, assess its ability to produce secondary metabolites with antibacterial and antifungal against pathogenic to humans and plants share microrganisms, as well as analyze the efficiency of the use of agroindustrial wastes as alternative means of cultivation for endophytic, aimed at producing spores and bioactive compounds. The most frequently isolated species were Phoma eupyrena, Colletotrichum gloeosporioides, Fusarium oxysporium and Pestalotiopsis maculans. The results obtained indicate the endophytic fungi associated with P. Major as a promising source of bioactive secondary metabolites, where these compounds can be obtained at low cost by fermentation of agroindustrial waste rice and passion fruit.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-05-24T15:10:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Dra. Adamares Marques.pdf: 1946328 bytes, checksum: 7e1614903239ea531ddb8e4647317cfb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T15:10:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Dra. Adamares Marques.pdf: 1946328 bytes, checksum: 7e1614903239ea531ddb8e4647317cfb (MD5) Previous issue date: 2015-02-10 / CAPES / A quitosana é um polissacarídeo natural, de interesse biotecnológico, ocorrendo nas paredes celulares de fungos (zygomycetes), bem como pode ser obtido da quitina através da desacetilação, formando uma maior proporção de cadeia polimérica com unidades de β1,4-2-amino-2-desoxi-D-glicose, e um menor número, de unidades β1,4-2-acetamino-2-desoxi-D-glicose da quitina. Considerando as suas propriedades fisco-químicas e bibiocompatibilidade), a quitosana é um polímero de grande interesse biotecnlógico. Visando esse interesse estudos foram realizados para a produção e otimização da produção de biomassa e quitosana por Rhizopus arrhizus, através da utilização de resíduos agroindustriais, como substratos, aplicando planejamento fatorial de 2², tendo como variáveis independentes milhocina (água de maceração de milho) e glicerina, oriunda do processamento do biodiesel, e como variáveis respostas produção de biomassa e de quitosana por R. arrhizus. Foi preparado um pré-inóculo do fungo contendo 40 discos de 6mm de diâmetro em 50mL de YMB (Yeast Malte Broth) durante 24h em Erlenmeyers de 250mL, após esse pré-inóculo foram transferidos para frascos de Erlenmeyers de 250mL contendo 100mL do meio com resíduos agroindustriais, de acordo com planejamentos, incubados a 28° C, sob agitação orbital de 150 rpm, durante 72h. A biomassa foi obtida por centrifugação a 5.000 g, por 15 min, seguido de lavagens com água, e posterior inativação por autoclavagem a 121ºC. A eficiência da biomassa como sorbente foi avaliada no processo de descoloração do corante têxtil vermelho congo. Os resultados demonstraram uma produção otimizada da biomassa de 22,5g/L e uma habilidade de descoloração de 80,85% do corante sintético de vermelho congo. A quitosana obtida da biomassa foi caracterizada por Infravermelho por Transformada de Fourier (FTIR) e difração de raio X para determinar o índice de cristalinidade (IC). A quitosana isolada apresentou um rendimento de 44,46 mg/g de biomassa, Grau de Desacetilação (DD) de 74% e índice de cristalinidade 44%. Investigações foram realizadas com a quitosana caracterizada, avaliando a eficiência do polímero como antifúngico, na proteção de tomates (Solanum lycopersicum var. cerasiforme) pelo ataque do fitopatógeno Botrytis cinerea. Estudos das condições de cultivo do fitopatógeno B. cinerea através de microscopia de luz demonstraram que 70% apresentavam tubos germinativos com 16h de incubação. A quitosana microbiológica demonstrou um CMI (Concentração mínima inibitória) de 100μg/mL contra o fitopatógeno B. cinerea. O tratamento de tomates contra o B. cinerea com quitosana na concentração do CMI apresentou resultados satisfatórios até com 19 dias de inoculação, quando comparado aos controles. Os resultados promissores obtidos demonstraram o excelente potencial biotecnológico de R. arrhizus como sorbente na descoloração de efluente têxtil, na produção de quitosana, bem como na inibição do crescimento do fitopatógeno B. cinerea, causador da degradação de frutos e hortaliças, em especial, pós-colheita, demonstrando ser um importante bioproduto biotecnológico para aplicação pela agroindústria. / Chitosan is a natural polysaccharide of biotechnological interest occurring in the cell walls of fungi (Zygomycetes) and derived from chitin by deacetylation forming a higher proportion of polymer chain units β1,4-2-amino-2- deoxy-D-glucose, and a smaller number of units β1,4-2-acetamido-2-deoxy-D-glucose chitin. Due to structural versatility, chitosan is a polymer of great biotechnological interest, considering its solubility properties, viscosity. Lack of toxicity were performed with biocompatibility. Studies were done about Rhizopus arrhizus biomass and chitosan production and optimization, through the use of the agro-industrial wastes as substrates, applying 2² factorial design, having as independent variables corn steep liquor and glycerin derived from biodiesel process, and as a response variable biomass and chitosan by R. arrhizus. The fungus was grown in 250ml Erlenmeyer flasks containing 100ml of medium containing industrial residues, according to the planning, with the inoculum of 6 disks of 40 mm in diameter fungus grown on YMA (Yeast Malt Agar), incubated at 28°C under an orbital agitation of 150 rpm for 72 hours. The biomass was obtained by centrifugation at 5,000 g for 15 min, followed by washing with water and subsequent inactivation by autoclaving at 121°C. The efficiency of biomass as a sorbent was evaluated in the process of bleaching a textile dye congo red. The best results have demonstrated an optimized production of biomass 22,5g/l, a bleaching ability to 80.85% of the textile dye. Chitosan was obtained from biomass, characterized by Fourier transform infrared (FTIR) spectra and X-ray diffraction to determine the crystallinity index (CI). The isolated chitosan showed a yield of 44.46 mg/g biomass degree of deacetylation (DD) of 74% and 44% crystallinity index, confirming the amorphous nature of the polymer. Investigations were carried out with the chitosan characterized by evaluating the efficiency of the polymer as an antifungal in tomatoes protection (Solanum lycopersicum var. Cerasiforme) the attack of pathogen Botrytis cinerea. Cell viability study of pathogen B. cinerea by light microscopy showed that 70% had germinated tubes 16h of incubation. Microbiological chitosan showed an MIC of 100μg/ml against pathogen B. cinerea. The processing of tomatoes against B. cinerea with chitosan concentration in the MIC showed satisfactory results until 19 days after inoculation, when compared to controls. Promising results demonstrate the excellent biotechnological potential of R. arrhizus as an effluent sorbent from bleaching in the textile, in the production of chitosan, as well as in inhibiting the pathogen B. cinerea, causing degradation of fruits and vegetables, in particular postharvest, proved to be an important crop protection.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-13T17:40:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) merged (3).pdf: 2859898 bytes, checksum: 09007e1f478ead6b0273d0459b360222 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-13T17:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) merged (3).pdf: 2859898 bytes, checksum: 09007e1f478ead6b0273d0459b360222 (MD5) Previous issue date: 2015-02-11 / CAPES / A Organização Mundial da Saúde (OMS) estima que até 2030 sejam previstos 27 milhões de casos incidentes de câncer, 17 milhões de mortes por câncer e 75 milhões de pessoas vivas, anualmente, convivendo com esta doença. No Brasil, as estimativas para o ano de 2012, válidas também para o ano de 2013, apontam a ocorrência de aproximadamente 518.510 novos casos de câncer, reforçando a magnitude do problema do câncer no país. Apesar da inserção de novos fármacos na terapia contra o câncer, vários tumores sólidos ainda não dispõem de tratamento adequado. Assim, é necessária a busca de novas alternativas medicamentosas para melhorar a eficácia do tratamento de doenças neoplásicas avançadas. Uma das principais áreas estudadas atualmente no mundo é a pesquisa de novos medicamentos com propriedades antitumorais. Microorganismos endofíticos podem ser entendidos como aqueles que vivem no interior das plantas, habitando, suas partes aéreas, como folhas e caules sem causar aparentemente nenhum dano a seus hospedeiros e conseguem viver nos tecidos internos das plantas e dispõem de uma riqueza bioquímica ainda não muito bem explorada. Os metabólitos secundários são compostos de baixo peso molecular, produzidos por fungos endofíticos em resposta às condições ambientais. Esses compostos apresentam potencial aplicação como os antibióticos. O objetivo do presente estudo foi avaliar seis gêneros da micoteca/URM quanto à produção do taxol. Os gêneros foram cultivados em meio BD (Batata Dextrose) por 72 horas em temperatura ambiente seguida de filtração a vácuo para extração do DNA. As reações de PCR foram realizadas com iniciadores e condições específicas para a amplificação do gene ITS do rDNA. Os produtos do gene ITS rDNA amplificados foram purificados e sequenciados. Os dados obtidos pelo sequenciamento do gene ITS rDNA foram analisados e comparados, pelo programas BLAST. Após a confirmação foram realizadas fermentações, seguidas da extração do metabólito secundário com acetato de etila. Os extratos foram analisados em Cromatografia em Camada Delgada (CCD) que mostrou um resultado satisfatório quando correlacionada a técnica Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (HPLC). Dessa forma, se faz necessário uma continuidade desse estudo para otimização do processo de fermentação e extração do produto bioativo. / The World Health Organization estimates that by 2030 are provided 27 million incident cases of cancer, 17 million deaths from cancer and 75 million people alive each year living with this disease. In Brazil, the estimates for the year 2012, also valid for the year 2013 indicate the occurrence of approximately 518,510 new cases of cancer, reinforcing the magnitude of the cancer problem in the country. Despite the inclusion of new drugs in cancer therapy, several solid tumors still lack appropriate treatment. Thus, the search for new medicinal alternative is needed to improve the effectiveness of treatment of advanced malignancies. One of the main areas currently studied in the world is the search for new drugs with antitumor properties. Endophytic microorganisms can be understood as those who live within the plant, dwelling, its aerial parts such as leaves and stems without apparently causing any damage to their hosts and can live in the internal tissues of plants and have a biochemical wealth yet very well traveled. Secondary metabolites are low molecular weight compounds produced by endophytes in response to environmental conditions. These compounds have potential application as antibiotics. The aim of this study was to evaluate six genera of mycology collection / URM for the production of taxol. The genera were cultured in BD (Potato Dextrose) for 72 hours at room temperature followed by vacuum filtration for DNA extraction. PCR reactions were performed with specific primers and conditions for the gene amplification of the rDNA ITS. The STI gene amplified rDNA products were purified and sequenced. The data obtained by sequencing of the ITS rDNA were analyzed and compared by BLAST programs. After confirming fermentations were performed, followed by secondary metabolite extraction with ethyl acetate. The extracts were analyzed by Thin Layer Chromatography, which showed a satisfactory result when correlated Liquid Chromatography Technical High Efficiency. Thus, if a continuation of this study to optimize the process of fermentation and extraction of bioactive product is necessary.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-30T19:06:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação com ficha catalografica.pdf: 611268 bytes, checksum: 466d9eb0160de7fc999ad4eb1c2e4696 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-30T19:06:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação com ficha catalografica.pdf: 611268 bytes, checksum: 466d9eb0160de7fc999ad4eb1c2e4696 (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / CNPQ / O petróleo é o recurso energético mais utilizado na sociedade atual, porém seu uso ocasiona grandes riscos de impactos ambientais. Portanto, a aplicação de técnicas como a biorremediação, que utiliza o metabolismo dos microrganismos, para eliminação ou redução de poluentes é aplicada em acidentes com petróleo e seus derivados. O objetivo deste trabalho foi de avaliar a capacidade dos microrganismos em degradar petróleo e estabelecer as melhores condições para a biorremediação. Os microrganismos (18 bactérias e 14 fungos) utilizados pertencem as Coleções de Microrganismos da UFPE. Inicialmente foram selecionados 3 bactérias e 3 fungos com potencialidade para degradação do petróleo. Essas linhagens foram submetidas à aclimatação em concentrações crescentes do poluente. O consórcio foi definido através de delineamento experimental utilizando uma matriz de Plackett & Burman e o melhor consórcio foi submetido a um ensaio em reator. Dentre os fungos o Aspergillus oryzae apresentou a melhor taxa de degradação com 66,05% dos compostos alifáticos e a bactéria B15 apresentou percentual de 32,43%. O planejamento experimental mostrou o consórcio número 12 com degradação de 91,96% dos hidrocarbonetos alifáticos do petróleo. Em biorreator observa-se um perfil característico para um consórcio misto, com degradação dos hidrocarbonetos de 87,52%. Com base nos resultados, isoladamente o Aspergillus oryzae pode ser apontado como promissor na biorremediação e o consórcio selecionado também pode ser utilizado na degradação de hidrocarbonetos alifáticos de petróleo. / Oil is the most used energy resource in our society, but their use produces serious risks of environmental impacts. Therefore, the application of techniques such as bioremediation, which uses the metabolism of microorganisms for elimination or reduction of pollutants is applied in accidents petroderivados. The aim of this study was to evaluate the ability of microorganisms to degrade oil and establish the best conditions for bioremediation. The microorganisms (18 bacteria and 14 fungi) used belong Collections of Microorganisms, UFPE. Initially we selected three bacteria and three fungi with potential for oil degradation. These strains were subjected to acclimation at increasing concentrations of oil. The consortium was set by experimental design using a matrix of Plackett & Burman and best consortium submitted to a test reactor. Among the fungi Aspergillus oryzae showed the best degradation rate with 66.05% of aliphatic compounds and bacteria B15 presented a percentage of 32.43%. The planning consortium showed the number 12 with 91.96% of the degradation of aliphatic hydrocarbons from petroleum. In a bioreactor there is a characteristic profile for a mixed consortium, with degradation of the hydrocarbons of 87.52%. Based on results alone Aspergillus oryzae is reported as promising in bioremediation and the consortium can also be used in the degradation of aliphatic hydrocarbons from petroleum.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-07-19T17:59:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Helder Completo 2016 (2).pdf: 6015507 bytes, checksum: b7445aab5f66311e88c1785a5425bc2e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-19T17:59:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Helder Completo 2016 (2).pdf: 6015507 bytes, checksum: b7445aab5f66311e88c1785a5425bc2e (MD5) Previous issue date: 2013-07-05 / FACEPE / Numa ectomicorriza, a fase pré-simbiótica é um período crucial na determinação da compatibilidade entre o fungo e o seu hospedeiro vegetal para o sucesso e estabelecimento da simbiose. Embora a associação tenha sido amplamente documentada do ponto de vista funcional/ecológico, informações acerca dos genes/proteínas envolvidos no início da interação ainda são escassas. O gene PtSRP é sobrexpresso entre 6-12h do pré-contato entre Pisolithus tinctorius-Castanea sativa e estudos in silico demonstraram que sua proteína apresenta região inicial hidrofóbica transmembranar em alfa-hélice seguida de seis fitas-beta intercaladas por loops. Por essas características foi especulado que esse peptídeo (127 a.a e 13,969 kDa) poderia estar relacionado à sinalização/controle das fases iniciais de formação/desenvolvimento da simbiose. Este trabalho objetivou a clonagem da ORF, expressão e purificação da PtSRP e a produção de anticorpos policlonais anti-PtSRP para serem usados na imunolocalização da proteína em P. tinctorius. A ORF mais provável do PtSRP foi amplificada por PCR com o uso de iniciadores adicionados de sítios de restrição para EcoR1 e Xho1. Os fragmentos foram clonados em vetor comercial pJET1.2 e a ORF subclonada em vetor de expressão pET21D(+), previamente tratado com as respectivas enzimas. Essa nova construção do vetor foi utilizada para transformar bactérias de expressão BL-21 Star. A PtSRP foi então expressa em larga escala sob ação do indutor IPTG a 0,1 mM e purificada com e sem o uso de ureia. As proteínas purificadas foram utilizadas na produção de anticorpos anti-PtSRP, em coelhos Oryctolagus curiculus, imunizados com quatro pulsos de 150μg da PtSRP. Após a sangria total, o soro foi coletado, os anticorpos purificados e testados quanto à sensibilidade e especificidade no reconhecimento da PtSRP por western blot. A partir do microcultivo em lâmina de P. tinctorius, o micélio foi submetido aos testes de imunolocalização com uso de anticorpos primários conformacionais anti-PtSRP obtidos nos ensaios anteriores e os anticorpos secundários Alexa Fluor 488 nm Goat anti-rabbit IgG. Para o controle negativo o micélio foi incubado na ausência do anticorpo primário anti-PtRSP. Na imunofluorescência convencional, o micélio foi observado em microscópio Leica DMI 4000B/objetiva 63x e os campos analisados foram escolhidos de acordo com a dispersão/morfologia das hifas, sendo as imagens capturadas e digitalizadas pelo acoplamento de um computador à câmera digital do microscópio. Na microscopia confocal as imagens foram adquiridas com objetiva de 63x/laser 488nm/ óleo de imersão, sendo capturadas e digitalizadas através do acoplamento de computador à câmera digital do microscópio Leica TCS SP2. Os resultados de expressão em sistema procarioto demonstraram que o peptídeo possui massa de 16 kDa o que confirmou as análises de predição anteriores. Na microscopia de fluorescência convencional houve forte marcação da PtSRP ao longo de toda a hifa, especialmente na região correspondente à membrana. A microscopia confocal identificou a marcação da PtSRP principalmente na periferia da hifa, mais especificamente na região correspondente à parede celular/membrana, inclusive no grampo de conexão (estrutura típica dos Basidiomycota). Esses achados coincidem com propriedades de outras proteínas fúngicas envolvidas na formação e reconhecimento das ectomicorrizas (SRAPs e hidrofobinas) que têm localização membranar. Estudos adicionais como nocaute gênico ou utilização de RNAs de interferência serão fundamentais para melhor compreensão do papel fisiológico da PtSRP na simbiose ectomicorrízica. / In ectomycorrhiza, the pre-symbiotic period is crucial to determine the compatibility between the fungus and its host plant for the success and establishment of symbiosis. Although the association is widely documented, information about the genes/proteins involved in the early period interaction are still missing. The PtSRP gene is overexpressed 6-12h of pre-contact between Pisolithus tinctorius-Castanea sativa and in silico studies have shown that PtSRP protein present a initial region hydrophobic transmembrane in alpha-helix followed by a six-sheet interspersed by loops . For these characteristics it has been speculated that this peptide (127 aa and 13,969 kDa) could be related to signaling/control of the early stages of symbiosis development. This work aimed to clone the ORF, to express and purify the PtSRP as well the polyclonal anti-PtSRP production for use in P. tinctorius protein immunolocalization. The most PtSRP ORF was amplified by PCR using primers with restriction sites (Xho1 and EcoR1). The amplified fragments were cloned into pJET1.2 vector and the ORF was subcloned into pET21D (+)expression vector previously treated with these respective enzymes. This new vector was used to transform BL-21 Star bacterial expression. The PtSRP was then expressed in large scale under the action of inductor 0.1 mM IPTG and purified with and without the use of urea. The purified proteins were used to produce antibodies PtSRP, in Oryctolagus curiculus rabbits immunized with four pulses of 150μg PtSRP. After total bleeding, the serum was collected, and purified antibodies tested for their sensitivity and specificity in recognition of PtSRP by western blot. From the P. tinctorius microculture, the mycelium was submited to immunolocalization tests using primary conformational-antibodies anti- PtSRP obtained in previous trials and the secondary antibodies Alexa Fluor 488 nm goat anti-rabbit IgG. For the negative control the mycelium was incubated in the absence of primary anti-PtRSP. In conventional immunofluorescence, the mycelium was observed in a 4000B/objetiva 63x Leica DMI and the analyzed fields were chosen according to the morphology of hyphae, and the images were captured and digitized by coupling a computer to a microscope digital camera. In confocal microscopy images were acquired with the objective 63x/laser 488nm / immersion oil being captured and digitized by coupling a computer to a Leica TCS SP2 microscop digital camera. The results in the prokaryotic expression system showed that the peptide has a mass of 16 kDa which confirm earlier prediction analyzes. In conventional fluorescence microscopy there was a strong marking PtSRP throughout the hyphae, especially in the membrane region. Confocal microscopy identified marking PtSRP mainly in the periphery of hyphae, and more specifically the region corresponding to the cell wall / membrane, including the clamp connection (typical structure of Basidiomycota). These findings are consistent with properties of other fungal proteins involved in the formation and recognition of ectomycorrhizal (SRAPs and hydrophobins) that have membrane localization. Additional studies such as gene knockout or use of interfering RNAs are essential for better understanding of the physiological role of PtSRP in ectomycorrhizal symbiosis.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-07-20T18:06:04Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTACAO BIBLIOTECA FINAL.pdf: 1485629 bytes, checksum: 4489609a5b599943b9b028166a1ef41f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-20T18:06:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTACAO BIBLIOTECA FINAL.pdf: 1485629 bytes, checksum: 4489609a5b599943b9b028166a1ef41f (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / CAPES / A Caatinga destaca-se como o mais complexo bioma brasileiro, apresentando variada cobertura vegetal. Contudo, encontra-se sob intensa utilização humana, com menos de 2% de seu domínio em unidades de proteção integral, tornando-se de fundamental importância estudos sobre sua biodiversidade e qualidade biológica. A comunidade microbiana do solo está envolvida em vários processos fundamentais à manutenção dos ecossistemas terrestres, e parâmetros que avaliem sua atividade servem como indicadores de qualidade do solo e da dinâmica dos ecossistemas. Entre esses a diversidade e a, atividade enzimática microbianas apresentam alta sensibilidade. Parte da comunidade microbiana é composta por fungos micorrízicos arbusculares (FMA) que formam a mais ampla simbiose entre fungos e plantas, proporcionando inúmeras vantagens e sendo indispensáveis para as comunidades vegetais. Considerando a necessidade de estudos na Caatinga este trabalho teve como objetivos: determinar a diversidade/distribuição da comunidade de FMA e a atividade microbiana do solo em fitofisionomias do Parque Nacional do Catimbau - PE (PARNA Catimbau): caatinga Strictu senso, caatinga de areia, carrasco, afloramento rochoso, e duas caatingas antropizadas. Seis amostras de solo compostas (seis subamostras) foram coletadas em maio e setembro de 2012 e março de 2013, em cada área. Registraram-se 80 táxons de FMA, distribuídos em 16 gêneros, com predominância de Glomus e Acaulospora. A caatinga de areia apresentou a maior riqueza de espécies, densidade de glomerosporos e diversidade pelo índice de Margalef. Os valores do carbono da biomassa micobiana, respiração edáfica basal e quociente metabólico do solo não diferiram estatísticamente entre as áreas. A colonização micorrízica, atividade da β-glicosidadse e desidrogenase apresentaram maiores valores na area de carrasco, enquanto os maiores valores da atividade da fosfatase ácida e hidrólise do diacetato de fluresceína foram registrados na caatinga stricto sensu e no afloramento rochoso, respectivamente. As comunidades de FMA nas áreas naturais tendem a ser mais similares, difereindo das áreas que sofreram antropização, o que indica influência do uso da terra entre outros fatores, na ocorrência desses fungos, ocasionando mudanças na comunidade. Dados da atividade microbiana do solo corroboram os resultados na comunidade de FMA, demostrando que a área antropizada sofre alteração significativa na comunidade microbiana. / The Caatinga stands out as the most complex biome , with varied vegetation. However , is under intense human use, with less than 2% of its area in strictly protected areas, making it studies on biodiversity and biological quality extremely important. The soil microbial community is involved in several fundamental to the maintenance of terrestrial processe , and parameters to evaluate their activity serve as indicators of soil quality and ecosystem dynamics . Among these parameters and diversity , microbial enzyme activity exhibit high sensitivity. Part of the microbial community consists of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF ), that form the broadest symbiosis between fungi and plants provides many advantages and is essential for plant communities. Considering the need for studies on Caatinga this study aimed to: determine the diversity/distribution of AMF community and soil microbial activity in phytophysiognomies of the Catimbau National Park (PARNA Catimbau): caatinga Strictu senso, sandy caatinga, carrasco, rocky outcrop, anthropic caatinga I and II. Soil samples composed of six sub-samples were collected in May and September 2012 and March 2013, in each area , with six replicates (six subsamples). We recorded 80 taxa of AMF, distributed in 16 genera, with a predominance of Glomus and Acaulospora. The sandy caatinga had the highest species richness, density and diversity glomerospores by Margalef index. The values of the microbial biomass carbon, basal soil respiration and microbial metabolic quotient did not differ statistically between the areas. AMF colonization, activity and β - glicosidase dehydrogenase showed higher values in the area of carrasco, while higher values of acid phosphatase and hydrolysis of diacetate fluresceína activity were recorded in stricto sensu caatinga and rocky outcrop, respectively. AMF communities in natural areas tend to be more similar, diferring of the areas that suffered human disturbance, which indicates the influence of land use and other factors in these fungi occurrence, causing changes in the community. Data of soil microbial activity corroborate the results of the FMA community, demonstrating that the human altered impacted agricultural region undergoes significant change in the microbial community.

Submitted by Rafael Santana (rafael.silvasantana@ufpe.br) on 2018-01-31T19:35:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Aline Dantas de Oliveira.pdf: 7187935 bytes, checksum: 2f865a50020bf3264c45bd86c0acd251 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-31T19:35:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Aline Dantas de Oliveira.pdf: 7187935 bytes, checksum: 2f865a50020bf3264c45bd86c0acd251 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / CAPES / O Brasil é o maior consumidor de pesticidas. Cipermetrina é um pesticida no grupo dos piretróides, altamente tóxico (classe II). Metomil é um metilcarbamato, extremamente tóxico (classe I). Ambos são credenciados para uso em várias culturas e diversos resíduos de agrotóxicos têm sido encontrados nos alimentos, dos mais variados tipos, no Brasil. Isto levanta o problema que envolve o consumo desenfreado de pesticidas e seus efeitos sobre a microbiota humana. A colonização adequada da microbiota normal impede o adoecimento do organismo, por diversos mecanismos funcionais e de defesa que dependem da atuação de micro-organismos comensais. O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos isolados da Cipermetrina e Metomil sobre a microbiota humana. Os testes realizaram-se com bactérias e leveduras comensais, utilizando espécies comuns da microbiota humana (Escherichia coli, Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Candida albicans, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. guilliermond). Para os testes foram usados métodos de microtitulação em caldo Mueller-Hinton (para bactérias) e caldo Saboreaud (para leveduras), conforme norma técnica da ANVISA. Cipermetrina e Metomil provaram ser capazes de destruir esses micro-organismos. A ênfase é sobre cipermetrina, cujas concentrações bactericida (0,03 mg) e fungicida (0,03 mg) ficaram muito próximas à Ingestão Diária Aceitável (IDA) estabelecida pela ANVISA (0,05 mg/ kg peso). Portanto, os níveis de consumo de cipermetrina estabelecidos como ingestão segura podem gerar riscos para a saúde. Não se exclui o risco do Metomil que, com ação microbicida em concentrações maiores, é igualmente comprometedor, porque as doses bactericidas e fungicidas também se aproximaram de sua IDA. / Brazil is the largest consumer of pesticides. Cypermethrin is a pesticide in the highly toxic (Class II) pyro-trophic group. Methomyl is an extremely toxic methylcarbamate (class I). Both are accredited for use in several crops and various agrotoxic residues have been found in foods in Brazil. This raises the problem that involves the uncontrolled consumption of pesticides and their effects on a human microbiota. An adequate colonization of the normal microbiota prevents the organism from becoming diseased, through several functional and defense mechanisms that depend on the performance of commensal microorganisms. The objective of this study was to evaluate the isolated effects of Cypermethrin and Methomyl on a human microbiota. The tests were carried out with bacteria and commensal yeasts, using common species of the human microbiota (E. coli, Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Candida albicans, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. guilliermond). For the tests, microtiter methods were used in Mueller-Hinton broth (for bacteria) and Saboreaud broth (for yeasts), according to the ANVISA technical standard. Cypermethrin and Metomil proved to be capable of destroying these microorganisms. The emphasis is on cypermethrin, whose bactericidal (0.03 mg) and fungicidal (0.03 mg) were very present in the Acceptable Daily Intake (ADI) established by ANVISA (0.05 mg / kg bw). Therefore, the levels of cypermethrin consumption established as safe intake may lead to health risks. The risk of Metomil, which with the bactericidal and fungicidal doses also approached its ADI, is not excluded.

Submitted by Rafael Santana (rafael.silvasantana@ufpe.br) on 2018-02-05T17:59:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação Diogo final sem assinatura.pdf: 3458178 bytes, checksum: 097e5e8ee672b87fe24f8b7b5b2c8139 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-05T17:59:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação Diogo final sem assinatura.pdf: 3458178 bytes, checksum: 097e5e8ee672b87fe24f8b7b5b2c8139 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / CAPES / A ordem Mucoralesé composta por fungos frequentemente isolados de solos e excrementos de herbívoros.Esses micro-organismos desempenham um papel importante nos ecossistemas, realizando a ciclagem de nutrientes. Trabalhos realizados em regiões do semiárido do Brasil reportaram apenas 20 espécies de Mucorales, o que não reflete a rela riqueza desses fungos no bioma Caatinga. Dessa forma, esse trabalho teve como objetivos comparar ariqueza, diversidade, frequência e distribuição do grupo em solos de fitofisionomias naturais e antropizadas, e conhecer a riqueza e frequência deste grupo em excrementos de herbívoros no Parque Nacional do Catimbau, Buíque, Pernambuco, Brasil. Foram realizadas seis coletas de solo em três áreas naturais: carrasco, caatinga arenosa e vegetação de caatinga stricto sensue em uma subárea antropizada, e seis coletas de excrementos de bovinos, caprinos e ovinos na última área. Foram observados 13 táxons de Mucorales no solo e 11 no excremento, distribuídos entre os gêneros Absidia, Circinella, Cunninghamella, Gongronella, Lichtheimia, Mucor, Pilobolus, Rhizopuse Syncephalastrum. A riqueza e diversidade dos Mucorales do solo variaram entre as fitofisionomias, enquanto a riqueza não variou entre os excrementos. Syncephalastrumracemosum e Piloboluskleinii foram as espécies mais frequentes no solo e nos excrementos, respectivamente. O efeito antrópico na caatinga stricto sensu demonstra uma baixa riqueza e diversidade de Mucorales do solo. Seis espécies ocorreram pela primeira vez no bioma de Caatinga e uma nova espécie de Absidiaestá sendo descrita para ciência / The Mucorales order is composed of fungi commonly isolated from soil and dung of herbivorous. These microorganisms play an important role in ecosystems, performing nutrient cycling. Work in the semiarid regions of Brazil reported only 20 species of Mucorales, which does not reflect the real richness of these fungi in the Caatinga biome. Thus, this study aimed to compare the richness, diversity, frequency and distribution of the group in soils of natural and disturbed vegetation types and the richness and frequency excrement of herbivores in Catimbau National ParkBuíque - PE.Six samplings were performed at three natural areas: Carrasco, Caatingasandy and vegetation ofCaatingastrictosensuand an anthropic subarea, and six collections of dung of bovine, goats and sheep in the latter area.13 taxa of Mucorales in soil and 11 were observed in dung, distributed between genera: Absidia, Circinella, Cunninghamella, Gongronella, Lichtheimia, Mucor, Pilobolus, Rhizopus e Syncephalastrum.The richness and diversity of the Mucorales soil were distinct in the vegetation types, while richnesswas not different between the dungs. Syncephalastrumracemosumis more frequent in soil, while Piloboluskleiniiin dung. The anthropic effect on caatingastrictosensu demonstrates a low richness and diversity of soil Mucorales.Six species first occurred in the Caatinga biome and a new species of Absidiawas recorded for science.

Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-04-13T18:05:15Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Layla Carvalho Mahnke.pdf: 1183243 bytes, checksum: 43cec3c6cd1904bf476f6f95cfd6ff1f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-13T18:05:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Layla Carvalho Mahnke.pdf: 1183243 bytes, checksum: 43cec3c6cd1904bf476f6f95cfd6ff1f (MD5) Previous issue date: 2015-03-30 / CAPES / Queratinases (EC: 3.4.99) são amplamente utilizadas na indústria durante o processamento do couro, na produção de detergentes, assim como aplicadas na medicina e cosmética para remoção de calosidades. Elas são produzidas por diversos microrganismos, entre eles, o gênero Cunninghamellatem se mostrado promissor entre os fungos filamentosos. Desta forma, este trabalho teve como objetivo produzir, quantificar, caracterizar e purificar as queratinases obtidas pelos fungos Cunninghamella echinulata UCP 1299 e Cunninghamella phaeosphora UCP 1303 isolados do solo da Caatinga. Os microrganismos foram mantidos em meio sólido mineral específico contendo queratina extraída de penas de ave como única fonte de Carbono e Nitrogênio por 15 dias e usado posteriormente na fermentação submersa para a determinação quantitativa da produção enzimática. O cultivo foi realizado durante 15 dias, a 28°C em agitador orbital a 150 rpm. A cada três dias foram retiradas alíquotas para avaliar a concentração proteica, atividade queratinolítica e variação do pH durante a produção. Os isolados apresentaram uma elevada atividade específica de 84,1 U/mg para C. echinulata UCP 1299 no 9º dia de cultivo e de 96,2 U/mg para C. phaeosphoraUCP 1303 no 6º dia de cultivo, onde ambos extratos brutosforam utilizados para a caracterização parcial da enzima. As queratinases da C. echinulata UCP 1299e C. phaeosphora UCP 1303apresentaram valores com maior atividade no pH e temperatura de 8,0 e 28ºC – 45ºC; 9,0 e 35ºC – 55ºC, respectivamente. As queratinases, com massa molecular de aproximadamente 35 KDa foram purificadas por cromatografia de afinidade empregando partículas do compósito magnetita-queratina obtendo um fator de purificação de 37,4% e 44,1% para C. echinulata UCP 1299e C. phaeosphora UCP 1303 respectivamente. Deste modo, ambos os microrganismos podem ser utilizadospara produzir queratinase que pode ser purificada por afinidade utilizando a queratina magnetizada. / Keratinases (EC: 3.4.99) is widely used in the industry for leather processing, detergent production, so as applied in medicine and cosmetics for removing calluses. Various microorganisms, including the genus Cunninghamella, have shown to produce these enzymes. Thus, this study aimed to produce, quantify, characterize and purify keratinases obtained by fungi Cunninghamella echinulata UCP 1299 and Cunninghamella phaeosphora UCP 1303 isolated from soil of Caatinga (Pernambuco, Brazil). The microorganisms were maintain on solid medium, containing keratin bird feathers as the sole source of carbon and nitrogen, for 15 days and subsequently used in submerged fermentation for the enzyme production. Cultures it grown for 15 days at 28°C in an orbital shaker at 150 rpm. Every three days aliquots it collected to assess the protein concentration, keratinase activity and pH variation during production. The isolates showed a high specific activity of 84.1 U / mg for C. echinulata UCP in 1299 on the 9th day of cultivation and 96.2 U / mg for C. phaeosphora UCP 1303 on the 6th day of cultivation, where both crude extracts were used for partial characterization of the enzyme.Keratinases from C. echinulata UCP 1299and C. phaeosphora UCP 1303showed best activity in pH and temperature values of 8.0 and 28°C-45°C; 9.0 and 35°C-55°C, respectively. The keratinases, with a molecular mass of approximately 35 kDa were purify by affinity chromatography using particles of a composite magnetite-keratin obtaining a purification factor of 37.4% and 44.1% for C. echinulataUCP 1299 and C. phaeosphoraUCP 1303 respectively. Thus, both microorganisms can be used to produce keratinase can be affinity purified using magnetized keratin.