O mecanismo patogênico mais importante no IAM é a oclusão trombótica de uma artéria coronariária no local de ruptura de uma placa aterosclerótica. Recentemente, diversos estudos têm investigado a associação entre o IAM e fatores genéticos protrombóticos. O presentetrabalho é um estudo tipo caso-controle a fim de avaliar o efeito de diversos polimorfismos genéticos em um grupo de pacientes com IAM antes dos 60 anos de idade. Foram investigados 283 pacientes e 93 indivíduos controles, todos caucasóides e sem diferenças quanto à proporção sexual e idade média entre os grupos. / The most important mechanism of AMI is the thrombotic oclusion of coronary artery at the site of a ruptured atherosclerotic plaque. Recently, several studies have been investigated the association between the AMI risk and prothrombotic genetic factors. The present study is a case-control study to evaluate the effect of several genetic polymorphisms in a case group with AMI before the age of 60 years. 283 patients and 93 control subjects were investigated, all caucasian and without sex and age differences between groups.

A eficiência da técnica de cultura de anteras, em escala comercial, ainda pode ser considerada baixa quando medida em número de plantas duplo-haplóides férteis obtidas para cada antera estabelecida in vitro. Dessa forma, o presente trabalho é pioneiro no estudo detalhado da embriogênese in vitro do micrósporo e do grão de pólen de cevada (Hordeum vulgare L. ssp. vulgare). Com o objetivo de contribuir para o aperfeiçoamento da técnica de cultura de anteras foi analisada a embriogênese, com especial ênfase na etapa da indução, através de análises citológicas e histológicas de anteras cultivadas in vitro. Foram analisadas uma cultivar brasileira de cevada, em comparação com linhagens de duas outras cultivares brasileiras, que foram selecionadas, por seleção divergente para maior ou para menor resposta na indução da rota embriogênica e, respectivamente, para menor ou para maior capacidade de regenerar plântulas verdes. Somente foram estabelecidas em cultivo in vitro as anteras que apresentaram micrósporos e pólens jovens, das linhagens selecionadas da cultivar A-05 (S3A22 e S3A23), e da cultivar BR-2(S3B63 e, apenas na cultura de anteras, S3B61), bem como da cultivar MN-599 (nãoselecionada). Para as análises histológicas, foram fixadas, a cada dois dias, duas anteras, correspondentes a cada fileira da mesma espiga, após o início do cultivo in vitro. As anteras em cultivo e respectivas estruturas multicelulares foram fixadas em FAA 50%, desidratadas em série etílica e incluídas em hidroxietilmetacrilato. Os blocos de resina polimerizada foram secionados longitudinalmente com 3 mm de espessura. Para as análises citológicas foram fixadas, de cada espiga recém-coletada, três espiguetas sendo uma da base, outra do meio e outra do ápice. Após o pré-tratamento à baixa temperatura (5 °C), porém antes do cultivo in vitro, foram fixadas três anteras (amostras utilizadas como controles). A cada três dias, durante o cultivo, três anteras foram fixadas (até 18 dias). As anteras em cultivo e estruturas multicelulares foram fixadas em Farmer e FAA 50%, transferidas após 24 horas para etanol 70%. Na cultura in vitro das anteras houve diferenças entre uma das linhagens da cultivar A-05 em relação a cultivar MN- 599, na produção inicial de estruturas embriogênicas, diferença que desapareceu na produção total. Entretanto, houve diferenças na formação dos xiii embriões: a cv.MN-599 formou embriões bem diferenciados ao passo que a linhagem S3A22 produziu um número aparentemente menor, sendo que os embriões não eram bem diferenciados. A linhagem S3B63 não apresentou embriões até o final da análise histológica. Considerando que a amostra dessa linhagem, mantida em cultura, formou plantas verdes, pode-se propor que a formação de embriões deve ocorrer posteriormente ao desenvolvimento da cv.MN-599. Cabe destacar que houve diferenças significativas entre as cultivares A-05 e BR-2 quanto à regeneração de plântulas verdes. Esses resultados indicam ter havido maior eficiência da seleção em relação à etapa da regeneração. Com relação às categorias classificatórias dos micrósporos e grãos de pólen, constatou-se que desde o início da análise histológica (2o dia de cultivo in vitro) até o final (34o dia), foram observados micrósporos, o mesmo tendo sido observado na análise citológica. Os grãos de pólen multinucleados ocorreram praticamente em todo o período de cultivo in vitro, em ambas análises; não ocorrendo nos controles da citologia (antes do cultivo); os multinucleados foram observados a partir do 3o dia, enquanto que os multicelulares a partir do 4o dia de cultivo. As estruturas multicelulares foram observadas a partir do 8o dia. A quantidade e o tamanho das estruturas multicelulares foram variáveis ao longo da análise histológica, sendo que do 14o ao 20o dia foram encontradas as de maiores dimensões, resultantes da proliferação celular por mitoses sucessivas. A partir do 22o dia (cultivar MN- 599), a ocorrência de estruturas multicelulares no interior dos lóculos da antera diminuiu, predominando o processo de proliferação externo às anteras. Para as linhagens, a partir do 18o dia foram observadas estruturas multicelulares liberadas das anteras. A análise das estruturas multicelulares permitiu classificá-las em quatro categorias: 1. SFD: Sem forma definida; 2. MAC: meristema apical caulinar; 3. MAR: meristema apical radical embrionário adventício; e 4. Embriões. As estruturas amorfas apareceram em maior número, quando comparadas com as outras categorias. Em síntese: as linhagens selecionadas e a cultivar diferiram não apenas no tempo necessário para a formação dos embriões, mas também no desenvolvimento dos mesmos, que foi mais diferenciado na cultivar MN-599, porém sendo observados mais cedo na linhagem S3A22 e S3A23, do que na cultivar MN-599. / The efficiency of anther culture technique, on a commercial scale, can be considered low when the number of fertile double-haploid plants obtained from single anthers established in vitro is evaluated. The present work pioneers a detailed study of in vitro microspores and young pollen embryogenesis of barley (Hordeum vulgare L ssp. vugare). Aiming for the improvement of anther culture technique, cytological and histological analyses of barley in vitro embryogenesis were made, with special emphasis on the induction stage. A Brazilian cultivar of barley (MN-599) was compared with strains of two other cultivars, previously selected, for three generations, for divergent responses to the induction process of in vitro culture, as well as to green plant regeneration, i.e. better response to induction and worse to green plant regeneration (strains S3A22 and S3A23 selected from cultivar A-05) or worse response to induction and better to green plant regeneration (S3B63 and S3B61 – the last one only analyzed for anther culture; both obtained from cv. BR-2). Only anthers with microspores and young pollen grains were cultured in vitro. For the histological analyses, two anthers from each row of the same spike were fixed, every two days after the beginning of in vitro culture. Anthers and respective multicellular structures were fixed in 50% FAA, dehydrated in ethylic series and included in hydroxyethylmetacrylate. The blocks of polymerized resin were longitudinally cut into 3mm thick sections. For the cytological analyses, three spikelets were fixed, one from the base, other from the middle and another from the top of each just collected spike. After the low temperature (5 oC) pretreatment, but before in vitro culture, three anthers (from the opposite row of each spike) were fixed . These two samples were used as controls. Every three days after the beginning of in vitro culture, three anthers were fixed – until the 18th day. Anthers and multicellular structures from in vitro culture were fixed in Farmer or 50% FAA and transferred to 70% ethanol after 24 hours. Differences were observed between in vitro cultivated anthers of one strain of cv A-05 and cultivar MN-599, in their initial production of embryogenic structures, but the total, final production did not differ. But differences were observed between cultivar MN- 599 and strain S3A22 in embryo formation: cv. MN-599 produced well differentiated embryos, but embryos of strain S3A22, besides in smaller number, were less differentiated. No embryo was found in all histologically analyzed samples of strain S3B63. However, considering that another sample of this same strain also cultivated in vitro generated green plants, one can propose that embryos formation does occur but later than in cv. MN-599, after 34 days in culture. One should emphasize that significant differences were found between the cultivars A-05 and BR-2 as for green plant generation. These results indicate that selection was more efficient for the plant regeneration step than for the induction phase. As for the results of in vitro culture of microspores and pollen grains, it was observed that, from the first sample of histological analyses (2nd day of in vitro culture) until the last one (34th day in culture), microspores were always present; the same was observed for the cytological analyses. Multinucleated pollen grains were observed at almost all analyzed samples; but they did not occur in the two controls of cytological analyses – i.e. before in vitro culture. Multinucleated grains were observed, in culture, from the 3rd day on. Multicellular were present in vitro culture from the 4th day on. Multicellular structures were first observed at 8th day. Multicellular structures varied in number and size at different samples of histological analysis, reaching the largest size from the 14th to the 20th day, as a result of cell proliferation due to successive mitoses. From the 22nd day on, in cultivar MN-599, there was a decrease in number of multicellular structures inside the anther loculi, but an increase and predominance of proliferation outside the anthers. As for the strains, from the 18th day on, multicellular structures liberated from the anthers were observed. The analyses of multicellular structures allowed to classify them in four classes: 1. SFD = without a defined shape; 2. MAC = shoot apical meristem; 3. MAR = adventitious embryonary apical root meristem; and 4. Embryos. The largest class was that of amorphous structures, when compared with the remaining classes. Summarizing, it was shown that the selected strains and the non-selected cultivar differed, not only in time needed for embryos formation, but also in the degree of embryo differentiation; embryos of cultivar MN-599 were well-differentiated, what was not observed for strain S3A22 and S3A23; however these strains produced embryos earlier than the cultivar.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-08-16T20:24:05Z No. of bitstreams: 1 2016_ClêniadosSantosAzevedo.pdf: 3228575 bytes, checksum: 52c4b5bc7aca2ec9b7980c243056f4d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-09-05T22:01:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ClêniadosSantosAzevedo.pdf: 3228575 bytes, checksum: 52c4b5bc7aca2ec9b7980c243056f4d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-05T22:01:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ClêniadosSantosAzevedo.pdf: 3228575 bytes, checksum: 52c4b5bc7aca2ec9b7980c243056f4d3 (MD5) / Enzimas deubiquitinantes (DUBs) desempenham um papel importante na regulação da degradação de proteínas e de outros processos não-degradativos, por desconjugação de ubiquitina (Ub) de proteínas marcadas, como a modulação da resposta imune, a sinalização da quebra da dupla fita do DNA e endocitose. Explorar o papel de deubiquitinação em Leishmania infantum demonstra uma alternativa promissora para procurar novos alvos terapêuticos para a leishmaniose, já que a quimioterapia utilizada é onerosa, tóxica e tende a ser ineficiente. Este estudo teve como objetivo o estabelecimento de duas linhagem de L. infantum expressando uma cópia extra de otubaína (OtuLi), caracterização da atividade enzimática e funcional da OtuLi recombinante produzida em E. coli (rOtuLi). Com relação ao estabelecimento das linhagens, o gene otuli foi amplificado, clonado no vetor pLEXSY-hyg2 e linearizado. Os promastigotas de L. infantum foram transfectados com os cassetes e selecionados. A integração dos cassetes ao locus gênico da 18S rRNA foi confirmada por PCR e a expressão da OtuLi fusionada ao peptídeo FLAG ou a cauda de 6 histidinas foi verificada por western blot. A citolocalização da FLAG-OtuLi indica que a enzima encontra-se em pequenas vesículas no citoplasma da célula com fortes marcações perto da região do cinetoplasto, corroborando o resultado visto utilizando anticorpos específicos para a OtuLi. A OtuLi não co-localiza com a mitocôndria marcada por duas sondas diferentes e com o retículo endoplasmático imunomarcado pela Proteína Dissulfato Isomerase em promastigotas. A rOtuLi apresentou atividade em pH ácido com substrato de tetra-ubiquitina ligado pela lisina 48 e o perfil de inibição indica que os inibidores NEM e Ub-aldeído são capazes de inibi-la. Através de mutações sítio-dirigidas realizadas na OtuLi, foi observado que tanto os resíduos próximos ao sítio catalítico quanto aqueles envolvidos na interação com a ubiquitina ocasionaram mudanças estruturais, conforme dinâmica molecular, resultando na redução ou perda da atividade da enzima. A rOtuLi foi capaz de estimular a formação de corpúsculos lipídicos em macrófagos peritoniais e induzir a secreção de IL-6 e TNF-α, citocinas pró-inflamatórias. O estabelecimento das linhagens com a cópia extra de otuli representa o primeiro passo para futura identificação de proteínas capazes de interagir com a OtuLi e assim, elucidar seu mecanismo de ação no parasito. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Deubiquitylating enzymes (DUBs) play an important role in regulating protein degradation and other non-degradative processes, by deconjugation of ubiquitin (Ub) from marker proteins, such as immune response modulation, signalling of double strand breaks at DNA and endocytosis. Exploring the role of deubiquitination in Leishmania infantum demonstrates a promising alternative to search for new therapeutic targets for leishmaniasis, since its primary chemotherapy is expensive, toxic and tending to be inefficient. This study aimed to establish two L. infantum strains expressing an extra copy of otubain (OtuLi), characterization of enzymatic and functional activity of recombinant OtuLi (rOtuLi). Regarding the establishment of the strains, the otuli gene was amplified, cloned in pLEXSY-hyg2 and the vector was linearized. The promastigotes of L. infantum were transfected with the cassette and selected. The integration of the cassettes into the 18S rRNA gene locus was confirmed by PCR and the expression of OtuLi fused to the FLAG peptide or to a 6 histidine tail was accessed by western blot. The citolocalization of FLAG-OtuLi indicates that the enzyme is in small vesicles in the cytoplasm of the cell with strong markings near the kinetoplast region, confirming the results seen using antibodies specific for OtuLi. The OtuLi is not co-located with the mitochondria marked by two different probes and with the endoplasmic reticulum immunolabeled by protein disulfide-isomerase. The rOtuLi showed activity at acid pH with lysine 48-linked tetra-ubiquitin substrate and the inhibition profile indicates that NEM and Ub-aldehyde inhibitors are able to inhibit it. Through site-directed mutations in OtuLi, it was observed that the residues near the catalytic site or those involved in the interaction with the ubiquitin caused structural changes as shown by molecular dynamics, resulting in a reduction or loss of enzyme activity. The rOtuLi was able to stimulate the formation of lipid body in peritoneal macrophages and to induce the secretion of IL-6 and TNF-α, pro-inflammatory cytokines. The establishment of these strains with the extra copy of otuli is the first step for future identification of proteins that interact with OtuLi and thus elucidate its mechanism of action in the parasite.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2015. / Submitted by Guimaraes Jacqueline (jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-10-26T14:26:38Z No. of bitstreams: 1 2015_SamiraRezendeDuarte.pdf: 2853365 bytes, checksum: 624a3a17b57b69c9a57ef74a70d63ce2 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-12-17T15:55:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_SamiraRezendeDuarte.pdf: 2853365 bytes, checksum: 624a3a17b57b69c9a57ef74a70d63ce2 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-17T15:55:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_SamiraRezendeDuarte.pdf: 2853365 bytes, checksum: 624a3a17b57b69c9a57ef74a70d63ce2 (MD5) / A família Bucconidae (Aves: Galbuliformes) é exclusiva da região Neotropical, abriga 12 gêneros e 38 espécies, e ainda, 77 subespécies, sendo que três espécies encontram-se ameaçadas de extinção. Nesta família, se destaca o gênero Nystalus, com sete espécies: N. chacuru (Vieilot, 1816), N. maculatus (Gmelin, 1788), N. striolatus (Pelzeln, 1856), N. striatipectus (Silva, 2001), N. radiatus (Sclater, 1854), Nystalus obamai (Whitney et al., 2013) e N. torridus (Bond & Meyer de Schauensee, 1940). Apresentam uma ampla distribuição na América do Sul, com representantes nos principais biomas, como também na região andina. Portanto, os objetivos deste trabalho foram: validar a taxonomia atual das espécies do gênero Nystalus com base em sequências de DNA, assumindo o conceito filogenético de espécies; identificar o processo temporal de diversificação das espécies deste gênero, e elucidar os padrões filogeográficos de N. chacuru e N. maculatus, com intuito de entender como os eventos históricos podem ter contribuído para moldar a distribuição atual da variabilidade genética nestas duas espécies. Para isso, foi utilizado um fragmento de DNA mitocondrial do gene NADH desidrogenase subunidade 2 (ND2) e um segmento de DNA nuclear da região do íntron 5 do β-fibrinogênio (FIB5). As análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos de máxima verossimilhança (ML) e inferência bayesiana (IB). As análises populacionais para N. chacuru e N. maculatus foram realizadas por meio da construção de rede de haplótipos e análise de variância molecular (AMOVA). Os resultados obtidos evidenciaram incongruências entre os segmentos de DNA utilizados, além de incongruência entre o gene mitocondrial para os diferentes métodos filogenéticos empregados. No entanto, foi possível inferir que as espécies do gênero Nystalus apresentam duas linhagens principais: uma de ocorrência em áreas florestais e outra de ocorrência em áreas de vegetação aberta. Com exceção de N. obamai e N. striolatus, as demais espécies do gênero formaram linhagens monofiléticas para o gene ND2, porém estas linhagens não foram claramente identificadas com base no segmento nuclear. De acordo com a hipótese do relógio molecular, as espécies do gênero Nystalus se separaram dos outros gêneros da família Bucconidae provavelmente no Mioceno. N. striatipectus e N. maculatus se instalaram nas regiões do centro oeste do Brasil, e posteriormente foram sobrepostas com N. chacuru. Já N. torridus dispersou para o extremo leste do Brasil, enquanto N. striolatus/ N. obamai permaneceram próximos ao rio Madeira no Amazonas e N. radiatus se dispersou para o extremo oeste da América do Sul. Os resultados para análises populacionais das espécies de N. chacuru e N. maculatus indicam estruturação das populações, já que os valores de ɸST foram altos, também apresentaram uma diversidade haplotípica alta, como também uma alta variação. A rede de haplótipos não apresentou nenhum compartilhamento de haplótipos, corroborando com a taxonomia atual, visto que ocorre uma alta diferenciação genética. / The Bucconidae family (Aves: Galbuliformes) is exclusive to the Neotropics and has 12 genera and 38 species, and yet, 77 subspecies, with three species are endangered. In this family, we highlight the genus Nystalus, with seven species: N. chacuru (Vieilot, 1816), N. maculatus (Gmelin, 1788), N. striolatus (Pelzeln, 1856), N. striatipectus (Silva, 2001), N. radiatus (Sclater, 1854), Nystalus obamai (Whitney et al., 2013) e N. torridus (Bond & Meyer de Schauensee, 1940). They Show a wide distribution in South America, with representatives in major biomes, as well as in the Andean region. Therefore, the objectives of this study were to validate the current taxonomy of species of the genus Nystalus based on DNA sequences, assuming the phylogenetic species concept; identify the temporal process of diversification of species of this genus, and elucidate the phylogeographic patterns of N. chacuru and N. maculatus, aiming to understand how historical events may have contributed to shaping the present distribution of genetic variability in these two species. For this, was used a mitochondrial DNA fragment of NADH dehydrogenase subunit 2 gene (ND2) and nuclear DNA segment of intron region 5 of β-fibrinogen (FIB5). The phylogenetic analyzes were performed by methods of maximum likelihood (ML) and bayesian inference (IB). The time of divergence of the species was estimated from the molecular clock hypothesis and population analyzes were performed through the construction of haplotype network and analysis of molecular variance (AMOVA). The results showed inconsistencies between the DNA segments used in addition to the inconsistency between the mitochondrial genes for different phylogenetic methods. However, it was possible to infer that the species of the genus Nystalus have two main lines: one to occur in forests and other vegetation to occur in open areas. Except for N. obamai and N. striolatus, the other species of the genus formed monophyletic lineages for the ND2 gene, but these clades have not been clearly identified based on nuclear segment. According to the hypothesis of the molecular clock, the species of the genus Nystalus separated from other genus Bucconidae family probably in the Miocene. N. striatipectus and N. maculatus settled in the regions of west central Brazil, and were later superimposed with N. chacuru. N. torridus already scattered to the far east of Brazil, while N. striolatus / N. obamai little remained near the Madeira River in the Amazon and N. radiatus dispersed to the west tip of South America. The results population analysis N. chacuru and N. maculatus populations indicate structuring, since high ɸST values were also showed high haplotype diversity, as well as a high variance. The haplotype network did not show any haplotype sharing, supporting the current taxonomy, since a high genetic differentiation occurs.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2018. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-08-22T20:08:02Z No. of bitstreams: 1 2018_PauloRicardoMartinsLima.pdf: 3888297 bytes, checksum: bdc59844d4666790d43e7a11e56ba31a (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-08-27T22:22:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_PauloRicardoMartinsLima.pdf: 3888297 bytes, checksum: bdc59844d4666790d43e7a11e56ba31a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-27T22:22:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_PauloRicardoMartinsLima.pdf: 3888297 bytes, checksum: bdc59844d4666790d43e7a11e56ba31a (MD5) Previous issue date: 2018-08-22 / A importância do meio ambiente como um todo sempre será vital no setor agropecuário, pois o impacto dos mesmos podem levar não só a prejuízos pontuais dentro de uma propriedade, como também de forma mais ampla, gerando adversidades por toda uma cadeia produtiva, e quando não acompanhadas podem se tornar irreverssíveis. Sendo assim, este estudo foi desenvolvido afim de explorar e compreender a relação das variáveis climáticas, ambientais e socioeconômicas com a distribuição pelo território nacional de diversas raças zebuínas através da localização dos animais por município, investigando suas diferenças e semelhanças genéticas com possível interação ambiental, além da provável influência sobre os valores genéticos médios de animais da raça Nelore. As análises estatísticas incluíram análise de variância, regressão logística, análises discriminantes, canônicas e de clusters, para comparar e melhor compreender possíveis relações entre as variáveis estudadas. A maior concentração de animais zebuínos está na região Centro- Oeste do Brasil, seguido pelo Sudeste e Norte, onde Pará se destaca. Na região Sul houve uma menor frequência de raças zebuínas, devido tradicionalmente usarem raças europeias. Nos estados do Nordeste, a menor distribuição de zebuínos em comparação com outros locais é, provavelmente, devido ao seu clima extremo, altamente suscetível a longos períodos de altas temperaturas e ausência de precipitação, o que afeta diretamente o rebanho local. Quando analisado por tipo, as raças de carne mostraram-se distribuídas mais uniformemente pelo país. As diferentes aptidões de cada raça mostraram diferenças estatísticas quando comparadas as diferentes variáveis. Ao se analisar os valores genéticos especificamente da raça Nelore, pode-se verificar ampla distribuição pelo país dos melhores clusters de cada grupo de características, mostrando diferença estatística quando os grupos de valores genéticos foram analisados entre si, onde o melhor cluster de cada grupo também apresentava os maiores valores das outras características. Forte discriminação foi verificada para ambientes tendenciosos a exploração bovina de corte a pasto, com formatação climática desafiadora, por apresentarem altos índices. Os resultados obtidos poderão favorecer o melhor entendimento da real situação das raças zebuínas, pelos diferentes climas e ambientes brasileiros, corrigindo possíveis erros de programas de seleção genética, bem como manejos inadequados.analisado por tipo, as raças de carne mostraram-se distribuídas mais uniformemente pelo país. As diferentes aptidões de cada raça mostraram diferenças estatísticas quando comparadas as diferentes variáveis. Ao se analisar os valores genéticos especificamente da raça Nelore, pode-se verificar ampla distribuição pelo país dos melhores clusters de cada grupo de características, mostrando diferença estatística quando os grupos de valores genéticos foram analisados entre si, onde o melhor cluster de cada grupo também apresentava os maiores valores das outras características. Forte discriminação foi verificada para ambientes tendenciosos a exploração bovina de corte a pasto, com formatação climática desafiadora, por apresentarem altos índices. Os resultados obtidos poderão favorecer o melhor entendimento da real situação das raças zebuínas, pelos diferentes climas e ambientes brasileiros, corrigindo possíveis erros de programas de seleção genética, bem como manejos inadequados. / The importance of the environment as a whole will always be vital in the agricultural sector, since their impact can lead not only to punctual damage within a property, but also more broadly, generating adversities throughout an entire productive chain, and when unaccompanied may become irreversible. Thus, this study was developed in order to explore and understand the relationship of climatic, environmental and socioeconomic variables with the distribution of zebu breeds across the national territory through the location of the animals by municipality, as well as via sampling by individuals of microsatellite markers, investigating their genetic differences and similarities with possible environmental interaction, in addition to the probable influence on the average genetic values of Nelore animals. Statistical analyzes included analysis of variance, logistic regression, discriminant, canonical and clusters analyzes, to compare and better understand possible relationships between the studied variables. The highest concentration of zebu animals is in the Center-West region of Brazil, followed by the Southeast and North, where Pará stands out. In the southern region had a lower frequency of zebu breeds, traditionally using European breeds. In the Northeastern states, the lower distribution of zebu compared to other locations is probably due to its extreme climate, highly susceptible to long periods of high temperatures and absence of precipitation, which directly affects the local herd. When analyzed by type, the breeds of meat were distributed evenly throughout the country. The different abilities of each breed showed statistical differences when compared to the different variables. When analyzing the genetic values specifically of the Nelore breed, one can verify the country's distribution of the best clusters of each group of characteristics, showing statistical difference when the groups of genetic values were analyzed among themselves, where the best cluster of each group also presented the highest values of the other characteristics. Strong discrimination was observed for tendentious environments for beef cattle grazing, with challenging climatic formatting, due to the high indexes. The results obtained may favor a better understanding of the real situation of zebu breeds, by the different Brazilian climates and environments, correcting possible errors of genetic selection programs, as well as inadequate management.

Resumo: A Ordem Xenarthra é uma ordem de mamíferos placentários composta por três formas viventes: tamanduás, tatus e preguiças arborícolas. É originária da América Sul e tem como distribuição geográfica o centro sul da América do Norte até o extremo sul da América do Sul. A Ordem possui trinta espécies viventes divididas em quatro famílias: Dasypodidae formada pelos tatus, com vinte e uma espécies, Myrmecophagidae (tamanduás) com quatro espécies, Bradypodidae (preguiças de três dedos) com quatro espécies e Megalonychidae (preguiças de dois dedos) com duas espécies. As espécies Priodontes maximus (tatu-canastra), Tolypeutes tricinctus (tatu-bola da caatinga), Bradypus torquatus (preguiça de coleira) e Myrmecophaga tridactyla (tamanduá-bandeira) estão classificadas como vulneráveis pela IUCN (International Union of Conservation), sendo a preguiça de coleira e o tatubola da caatinga endêmicos do Brasil. A maioria dos xenartros possui uma constituição cariotípica que varia de 48 até 65 cromossomos, exceto a espécie Tolypeutes matacus com 2n=38 cromossomos. Das trinta espécies conhecidas atualmente, apenas dezenove tiveram seu cariótipo descrito ou relatado. Os xenartros apresentam uma ampla gama de eventos cromossômicos, como fusão / fissão entre as espécies do gênero Cabassous, Choloepus e Bradypus e na família Myrmecophagidae, eventos de rearranjos cromossômico no gênero Dasypus e a combinação de ambos no gênero Chaetophractus. A presente tese está dividida em quatro capítulos: 1 revisão bibliográfica sobre os dados cromossômicos na Ordem Xenarthra; 2 descrição do cariótipo da espécie Cabassous unicinctus; 3 descrição uma nova espécie do gênero Tamandua; 4 análise da evolução cromossômica da Ordem Xenarthra, utilizando abordagem filogenética. / Abstract: Not available. / Orientador: Wilham Jorge / Coorientador: Eduardo Bagagli / Doutor

Orientador: Raquel Mantuanelli Scarel Caminaga / Banca: Márcia Pinto Alves Mayer / Banca: Joni Augusto Cirelli / Resumo: A Doença Periodontal (DP) é uma doença infecciosa de caráter multifatorial causada por microrganismos periodontopatogênicos e influenciada por fatores como: suscetibilidade genética do hospedeiro, reação do sistema imune, hábito de fumar e doenças sistêmicas. Estudos recentes realizados por nosso grupo verificaram indivíduos com predisposição genética à periodontite crônica, mesmo após ajustes para idade, gênero, cor da pele e hábito de fumar. Tal predisposição genética foi determinada pela presença de um haplótipo formado por polimorfismos no gene IL8. O objetivo do presente estudo é comparar a microbiota subgengival de sítios afetados ou não pela DP, antes e após 45 dias do tratamento periodontal não-cirúrgico em indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à periodontite crônica. Dessa forma, será possível saber se, entre indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à DP, ocorrem diferenças qualitativa e/ou quantitativa de microrganismos periodontopatogênicos. Também se pretende avaliar se indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à DP respondem diferentemente ao tratamento periodontal não-cirúrgico, por meio da análise de parâmetros clínicos e microbiológicos. Foram selecionados 65 indivíduos divididos quanto à presença ou não do referido haplótipo ATC/TTC no gene IL8, de forma que os indivíduos "suscetíveis" e "não suscetíveis" à DP foram subdivididos quanto à presença ou ausência de periodontite crônica. Os pacientes selecionados foram submetidos a novo exame clínico periodontal e coleta de placa subgengival antes e 45 dias após tratamento periodontal. Três microrganismos periodontopatogênicos Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Periodontal disease (PD) is a multifactorial disease caused by periodontopathogenic microorganisms and influenced by factors such as genetic susceptibility, reaction of the immune system, smoking and the occurrence of systemic diseases. Recent studies carried out by this group have observed individuals with a genetic predisposition to periodontitis even after adjusting for covariates such as age, gender, skin color and smoking. Such genetic predisposition was determined by the haplotype presence formed by IL8 gene polymorphisms. The purpose of this study is to compare the subgingival microbiota of sites with and without PD, before and after 45 days of non-surgical periodontal treatment in individuals who are genetically susceptible and non susceptible to PD. In this way, it will be possible to know if there are qualitative/quantitative differences of periodontopathogenic microorganisms between individuals who are genetically susceptible and non susceptible to PD, and if between these groups, there is differential influence on non-surgical periodontal treatment on the clinical and microbiological parameters. Sixty-five individuals were selected and divided regarding the presence or not of that ATC/TTC haplotype in the IL8 gene. The "susceptible" and the "non susceptible" individuals were subdivided about the presence or absence of PD. In each group there are patients with and without periodontitis. The selected patients were submitted to a new periodontal exam and had their gingival fluid collected before and after 45 days of periodontal treatment. The periodontopathogenic microorganism Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, and Treponema denticola have been quantified by absolute quantification by the use of Real Time PCR (qPCR). The microbiological data... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga / Banca: Silvana Regina Perez Orrico / Banca: Andrea Marcia Marcaccini / Resumo: A Doença Periodontal (DP), desencadeada pela infecção de microrganismos periodontopatogênicos tem sua progressão e morbidade grandemente influenciada pela suscetibilidade genética do hospedeiro. Dentre as várias citocinas produzidas pelo periodonto inflamado está a Interleucina 4 (IL-4). Estudos recentes realizados por este grupo demonstraram que os polimorfismos -590(T/A), +33(T/G) e VNTR (Inserção/Deleção) no gene IL4, bem como haplótipos formados por eles, estavam associados à periodontite crônica, mesmo após ajustes para idade, gênero, cor da pele e hábito de fumar. O objetivo do presente estudo foi testar a hipótese de que há diferença nos índices clínicos periodontais e nos níveis de IL-4 no fluido sulcular gengival de pacientes suscetíveis e protegidos, e como segundo objetivo foi avaliar a resposta ao tratamento periodontal não-cirúrgico, em função da referida carga genética. Foram selecionados 62 pacientes que carregavam um haplótipo no gene IL4 que confere suscetibilidade genética à periodontite crônica ou que confere proteção contra o desenvolvimento desta, tendo sido subdivididos quanto à presença ou ausência da periodontite crônica. Cada paciente foi submetido a exame clínico periodontal e coleta de fluido sulcular (FS) antes 18 (baseline), 45 e 90 dias após finalizado o tratamento periodontal não-cirúrgico. A citocina IL-4 foi quantificada por meio de teste imunoenzimático (ELISA). Como resultado verificou-se que, comparando indivíduos geneticamente suscetíveis à DP com os geneticamente protegidos, no período baseline, houve diferença estatisticamente significante dos índices de placa visível, sangramento marginal e sangramento à sondagem considerando tais parâmetros clínicos de boca toda. Não houve diferença significante quanto à resposta... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Periodontal disease (PD) is an encompasses multifactorial disease. Genes belonging to the immune response have been investigated as a potential factor influencing the susceptibility to PD. Among the various cytokines produced by the inflamed periodontium is interleukin 4 (IL-4), which is a potent downregulator of macrophage function that inhibits the secretion of proinflammatory cytokines Previously, we identified a haplotype formed by - 590(T/A), +33(T/G) and VNTR (variable number of tandem repeats; I/D) polymorphisms in the IL4 gene that conferred susceptibility to or protection against PD. The aim of this study was to investigate whether subjects with genetic susceptibility [S] to PD compared to genetically protected [P] individuals would present both differences in the clinical parameters and levels of IL-4 in sulcular fluid, and if these were different 45 and 90 days after non-surgical periodontal treatment. Those patients were subdivided in: genetically susceptible without PD (healthy) (SH, n=16), genetically susceptible with PD (SPD, n=16), genetically protected without PD (PH, n=20), and genetically protected with PD (PPD, n=10). Periodontal clinical examination and collection of periodontal sulcular fluid were performed for each patient at baseline, 45 and 90 days after finishing the non-surgical periodontal treatment. The cytokine IL-4 was measured by the use of Enzyme Immunoassay (ELISA). The results 22 showed that comparing the genetically susceptible with the genetically protected individuals to PD, there were significant differences in clinical parameters: plaque index (p=0.013), bleeding index (p=0.005), bleeding on probing (p=0.015) at baseline. There were no significant differences in clinical parameters 45 and 90 days after completion of the periodontal treatment. The total amount and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-02Bitstream added on 2014-06-13T19:57:17Z : No. of bitstreams: 1 finoti_ls_me_arafo.pdf: 807524 bytes, checksum: 5006bb12d9dfd8b018947dc9bf5f9a44 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-10-27T11:27:32Z: finoti_ls_me_arafo.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-10-27T11:28:04Z : No. of bitstreams: 1 000699432_20161215.pdf: 108734 bytes, checksum: bb249231be9783ec2b2e8a69bab2d4d9 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-12-16T09:54:38Z: 000699432_20161215.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-12-16T09:55:19Z : No. of bitstreams: 1 000699432.pdf: 1829489 bytes, checksum: 1673fe1964d933a8139de0e818870022 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A Doença Periodontal (DP) é uma doença infecciosa de caráter multifatorial causada por microrganismos periodontopatogênicos e influenciada por fatores como: suscetibilidade genética do hospedeiro, reação do sistema imune, hábito de fumar e doenças sistêmicas. Estudos recentes realizados por nosso grupo verificaram indivíduos com predisposição genética à periodontite crônica, mesmo após ajustes para idade, gênero, cor da pele e hábito de fumar. Tal predisposição genética foi determinada pela presença de um haplótipo formado por polimorfismos no gene IL8. O objetivo do presente estudo é comparar a microbiota subgengival de sítios afetados ou não pela DP, antes e após 45 dias do tratamento periodontal não-cirúrgico em indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à periodontite crônica. Dessa forma, será possível saber se, entre indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à DP, ocorrem diferenças qualitativa e/ou quantitativa de microrganismos periodontopatogênicos. Também se pretende avaliar se indivíduos geneticamente suscetíveis e não suscetíveis à DP respondem diferentemente ao tratamento periodontal não-cirúrgico, por meio da análise de parâmetros clínicos e microbiológicos. Foram selecionados 65 indivíduos divididos quanto à presença ou não do referido haplótipo ATC/TTC no gene IL8, de forma que os indivíduos “suscetíveis” e “não suscetíveis” à DP foram subdivididos quanto à presença ou ausência de periodontite crônica. Os pacientes selecionados foram submetidos a novo exame clínico periodontal e coleta de placa subgengival antes e 45 dias após tratamento periodontal. Três microrganismos periodontopatogênicos Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia... / Periodontal disease (PD) is a multifactorial disease caused by periodontopathogenic microorganisms and influenced by factors such as genetic susceptibility, reaction of the immune system, smoking and the occurrence of systemic diseases. Recent studies carried out by this group have observed individuals with a genetic predisposition to periodontitis even after adjusting for covariates such as age, gender, skin color and smoking. Such genetic predisposition was determined by the haplotype presence formed by IL8 gene polymorphisms. The purpose of this study is to compare the subgingival microbiota of sites with and without PD, before and after 45 days of non-surgical periodontal treatment in individuals who are genetically susceptible and non susceptible to PD. In this way, it will be possible to know if there are qualitative/quantitative differences of periodontopathogenic microorganisms between individuals who are genetically susceptible and non susceptible to PD, and if between these groups, there is differential influence on non-surgical periodontal treatment on the clinical and microbiological parameters. Sixty-five individuals were selected and divided regarding the presence or not of that ATC/TTC haplotype in the IL8 gene. The susceptible and the non susceptible individuals were subdivided about the presence or absence of PD. In each group there are patients with and without periodontitis. The selected patients were submitted to a new periodontal exam and had their gingival fluid collected before and after 45 days of periodontal treatment. The periodontopathogenic microorganism Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, and Treponema denticola have been quantified by absolute quantification by the use of Real Time PCR (qPCR). The microbiological data... (Complete abstract click electronic access below)

Orientadora : Profª. Drª. Maria da Graça Bicalho / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 24/04/2009 / Inclui bibliografia / Desde a descoberta do sistema de histocompatibilidade a literatura específica tem relacionado genes envolvidos com a resposta imune, como os do sistema HLA para um melhor prognóstico do transplante. Contudo, outros genes não HLA podem estar também influenciando, como por exemplo, os genes codificantes de receptores semelhantes à Imunoglobulina das células Natural Killer (KIR). A descoberta que receptores semelhantes à Ig (KIR) das células NK interagem com epítopos geneticamente polimórficos em moléculas HLA classe I, e que o repertório próprio de receptores KIR é geneticamente variável, levou à investigação da relevância do sistema KIR para transplante de células progenitoras hematopoiéticas. A cura dos pacientes com leucemias e outras doenças malignas hematológicas após o Transplante de Medula Óssea (TMO) alogênico tem sido atribuída, em parte, à capacidade das células imunes do doador, presentes no enxerto, reconhecerem e eliminarem as células neoplásicas do paciente. A ação citotóxica das células NK é mediada por interações entre receptores de superfície celular e moléculas HLA de classe I específicas na superfície da célula alvo. A ausência de ligantes HLA I específicos na superfície da célula alvo para receptores KIR inibidores pode levar a aloreatividade das células NK do receptor contra células do aloenxerto (hipótese .missing-self.). Esta ausência do ligante específico é denominada em vários estudos como .Incompatibilidade KIR-Ligante.. No presente estudo foi analisada, através da técnica de tipagem PCR-SSOP, a presença/ausência de 16 genes KIR, os genótipos e haplótipos KIR de 39 famílias de pacientes com doenças hematopoiéticas e, uma comparação foi realizada com dados de uma amostra da população paranaense. Foi realizada também a tipagem do locos HLA-Cw, conhecido por ser um dos ligantes específicos de KIR, e, com base no genótipo KIR de potenciais doadores no núcleo familiar e genótipos HLA-Cw do paciente desenvolveu-se um modelo teórico com o grupo de 11 pacientes LMA para escolha de duplas doador/receptor baseando-se na incompatibilidade KIR-ligante. Neste estudo foi desenvolvido também um modelo de banco de dados que descreve as características gerais, como grupo racial, sexo, idade e doença de base. As freqüências da presença/ausência dos genes KIR foram semelhantes às freqüências observadas em populações européias, o que seria de se esperar considerando-se a predominância de Brancos euro-descendentes na região Sul do Brasil. Os genes de moldura KIR3DL3, KIR3DP1, KIR2DL4 e KIR3DL2 foram positivos em todas as amostras. A comparação do repertório KIR entre pacientes, irmandades e pais de pacientes com indivíduos controles normais pertencentes ao banco de dados do LIGH, revelou na amostra paciente que os genes inibidores KIR2DL2 (p=0,0005) e KIR2DL5 (p=0,0067), bem como os genes ativadores KIR2DS1 (p=0,0013), KIR2DS2 (p=0,0038), KIR2DS3 (p=0,0153) apresentaram diferenças significativas (p<0,05). No presente estudo, observamos uma maior freqüência de haplótipos A nos grupos analisados. Entre os 39 pacientes observamos 59% haplótipos A vs 41% haplótipos B; na irmandade 62% vs 38% e entre os pais, 57% vs 43% No que se refere à distribuição e comparações de genótipos entre pacientes e controles, observamos que os homozigotos AA (p=0,0463) e heterozigotos AB (p=0,0282) apresentaram diferenças significativas. Tais achados merecem ser interpretados com ampliação do tamanho amostral em novos estudos investigativos.