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Aspectos fisiológicos e produtivos de clones de cajueiro anão precoce cultivado sob dois regimes hídricos / Physiological aspects of productive and clones dwarf cashew tho grown under schemes

Nascimento, Antônio Henrique Cardoso do January 2010 (has links)
NASCIMENTO, Antônio Henrique Cardoso do. Aspectos fisiológicos e produtivos de clones de cajueiro anão precoce cultivado sob dois regimes hídricos. 2010. 97 f. Dissertação (Mestrado em engenharia agrícola)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2010. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-06-14T19:11:24Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_ahcnascimento.pdf: 2277808 bytes, checksum: 4d238c770562304bc9673bb5f3001bd9 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-06-14T22:49:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_ahcnascimento.pdf: 2277808 bytes, checksum: 4d238c770562304bc9673bb5f3001bd9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T22:49:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_ahcnascimento.pdf: 2277808 bytes, checksum: 4d238c770562304bc9673bb5f3001bd9 (MD5) Previous issue date: 2010 / This study aimed to evaluate the physiological and biochemical responses of the clones CCP 76 and BRS 189 of dwarf cashew (Anacardium occidentale L.) that were subjected to two water regimes: irrigated and rainfed conditions. The experiment was conducted in the Experimental Field Curu, Embrapa Tropical in Paraipaba - Ceará, from January to December 2009. Plants of the experiment were in full productive age (5 years). Monthly, we investigated the leaf water content, stomatal conductance to water vapor, transpiration rate, photosynthetic rate, foliar concentrations of inorganic ions and the concentrations of total soluble carbohydrates. In addition, we analyzed the nut productivity and postharvest quality of peduncle. In general, there were no significant differences between plants of the two water regimes for most variables, except foliar concentrations of some ions. This small change was probably due to excess precipitation occurred in the year of the study. Thus, under the conditions studied, the practice of irrigation did not influence the two clones of cashew evaluated. Regarding the two clones: BRS 189 and CCP 76, overall, no significant differences were found, except foliar concentrations of ions K and Ca in the clone CCP 76 when grown under rainfed conditions showed higher content these nutrients in the leaves during the months September to December and staining in the clone CCP 76 showed higher brightness and less red color than plants of the clone BRS 189. / O presente trabalho teve como objetivo avaliar as respostas fisiológicas e bioquímicas dos clones CCP 76 e BRS 189 de cajueiro anão precoce (Anacardium occidentale L.), submetidos a dois regimes hídricos: irrigado e sequeiro. O experimento foi conduzido no Campo Experimental do Curu, da Embrapa Agroindústria tropical, em Paraipaba - Ceará, de janeiro a dezembro de 2009. As plantas do experimento estavam em plena idade produtiva (5 anos). Mensalmente, foram investigados o teor de umidade foliar, a condutância estomática ao vapor d´água, a taxa transpiratória, a taxa fotossintética, os teores foliares de íons inorgânicos e os teores de carboidratos solúveis totais. Além disso, foram analisadas a produtividade das castanhas e a qualidade pós-colheita dos pedúnculos. Em geral, não foram encontradas diferenças significativas entre as plantas dos dois regimes hídricos para a maioria das variáveis, com exceção dos teores foliares de alguns íons. Essa pequena variação provavelmente se deveu ao excesso de precipitação ocorrida no ano do estudo. Dessa forma, nas condições estudadas, a prática da irrigação praticamente não influenciou os dois clones de cajueiro avaliados e em termos globais também não foram encontradas diferenças significativas entre os dois clones avaliados: BRS 189 e CCP 76, com exceção dos teores foliares dos íons K e Ca, em que o clone CCP 76, quando cultivado sob condições de sequeiro apresentou maiores teor desses nutrientes nas folhas durante os meses setembro à dezembro e para a coloração do pedúnculo, em que o clone CCP 76 apresentou maior luminosidade e coloração menos avermelhada do que as plantas do clone BRS 189.
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Qualidade da madeira, critérios de seleção e interação genótipos x ambientes de clones de Eucalyptus no Rio Grande do Sul / Wood quality, selection criteria and genotype by environment interaction of Eucalyptus clones in Rio Grande do Sul, Brazil

Nunes, Andrei Caíque Pires 28 July 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-12-02T09:20:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1577551 bytes, checksum: 961f648025b4056d30162a4ef5515c13 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-02T09:20:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1577551 bytes, checksum: 961f648025b4056d30162a4ef5515c13 (MD5) Previous issue date: 2015-07-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os ensaios foram conduzidos nas áreas da empresa CMPC Celulose Riograndense, em quatro diferentes ambientes. Em cada sítio, um experimento no delineamento de blocos ao acaso foi estabelecido, com parcela de arvore única e 30 repetições. Aos três anos de idade, foram mensurados o diâmetro a altura do peito (DAP), altura total das arvores (Ht) e a profundidade de penetração do Pilodyn (Db), para obtenção do volume (Vol) e estimação indireta da densidade básica da madeira, respectivamente. Para o estudo da interação G x A, dois índices de peso de madeira (DAPxDb e VolxDb) foram criados. Com os valores genotípicos de cada variável analisada, índices de pesos de madeira foram propostos utilizando-se como ponderadores as correlações genéticas entre as variáveis, acurácias de predição, herdabilidades, correlações parciais e os efeitos diretos da análise de trilha. O índice DAPxDb (hºg = 0,23) apresentou interação G x A significativa e, a partir da análise de interação dos ambientes par a par, duas “zonas de melhoramento” foram definidas para DAPxDb. Na análise de critérios de seleção, três índices foram os mais eficientes, em virtude de suas acurácias elevadas. O índice l2, baseado na correlação parcial do caráter objetivo peso de madeira e os caracteres auxiliares DAP e Db, l1 (conceito de blup multivariado) e o índice IVR DAPxDb baseado no conceito de variável relacional, com acurácias de 1,00, 0,97 e 0,96, respectivamente. Dessa forma, constatou-se que e possível efetuar a seleção multicaracterística para peso de madeira em Eucalyptus, com alta eficiência, sem a necessidade de estabelecer procedimentos complexos para modelos multivariados mistos. A medição precisa do DAP juntamente com a Db no índice DAPxDb foi fundamental na obtenção de apenas duas “zonas de melhoramento”. / The tests were conducted in the areas of CMPC Celulose Riograndense company in four different environments. At each site, an experiment in a randomized block design was established, with single-tree-plot and 30 repetitions. At three years old, the diameter at breast height (DBH), total height (Th) and the depth Pilodyn penetration were measured in each tree of the experiments, to obtain the volume (Vol) and the indirect estimation of the wood basic density (Bd), respectively. To study the G x E interaction, two wood weight index (DBHde and Voled) were created. With the genotypic values of each variable, wood weight indexes were proposed using as weights the genetic correlations between variables, heritability, prediction accuracies, partial correlations and the direct effects of path analysis. The DBHde index (hºg 0.23) showed significant G x E interaction and, from the interaction analysis of environments in pairs, two "improvement areas" have been set to DBHde. In the analysis of selection criteria, three indexes were the most effective, due to their high accuracies. The I2 index based on the partial correlation of the objective character wood weight and auxiliary characters DBH and Bd, the l1 index (concept of multivariate blup) and IVR DBHde index based on the concept of relational variable, with accuracies of 1.00, 0.97 and 0.96, respectively. Thus, it was found that it is possible to make the wood weight multi-trait selection in Eucalyptus, with high efficiency without the need for complex procedures of mixed multivariate models. The accurate measurement of the DBH with the Bd on the DHBde index was crucial to obtain only two improvement areas".
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Adaptabilidade e estabilidade de híbridos comerciais de milho pelos métodos de Eberhart & Russell, centróide, AMMI e Modelos Mistos / Adaptability and stability of commercial hybrids of maize by Eberhart & Russell (1966), centroid, AMMI and Mixed Models REM/BLUP Methods

Faria, Sirlene Viana de 22 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-17T16:13:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 426165 bytes, checksum: 7d59d46d1133624a1d6498fa61b0d90c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-17T16:13:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 426165 bytes, checksum: 7d59d46d1133624a1d6498fa61b0d90c (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos comerciais de milho, pelos métodos Eberhart & Russell (1966), centróide, AMMI e modelos mistos-REM/BLUP; e comparar os resultados obtidos por meio das quatro metodologias. Para tal, vinte e nove híbridos comerciais de milho foram avaliados para produtividade de grãos em cinco ambientes de Minas Gerais. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso com duas repetições. Cada parcela foi constituída de duas linhas de cinco metros de comprimento, espaçadas em 0,80 m. Houve diferença significativa (P<0,01) para os efeitos de híbridos, ambientes e interação híbridos x ambientes. A maioria dos híbridos avaliados apresentou ampla adaptabilidade e boa estabilidade. O híbrido 30A16PW comportou-se mais adequadamente em ambientes superiores e é indicado para agricultores que adotam elevados padrões tecnológicos de manejo. Entretanto, o híbrido CARGO é recomendado para regiões com o emprego de baixa tecnologia e insumos. As metodologias de Eberhart & Russell, centróide, AMMI e modelos mistos apresentaram resultados semelhantes na classificação e recomendação de híbridos com ampla adaptabilidade. Contudo, ocorreu divergência na indicação de híbridos com adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e desfavoráveis, o que justifica a utilização de mais de um método de avaliação para uma maior confiabilidade na recomendação de híbridos comerciais de milho. / The objective of this study was to evaluate the adaptability and stability of commercial maize hybrids by Eberhart & Russell (1966), centroid, AMMI and mixed models REM/BLUP methods; and compare the results obtained by the four methodologies. For such, twelve-nine commercial maize hybrids were evaluated for grain yield in five environments of Minas Gerais. We used the randomized complete block design with two replicates. Each plot consisted of two 5 m long rows spaced 0.8 m. There was significant difference (P<0.01) for the hybrids, environments and genotype-by- environment interactions. Most of hybrids showed good adaptability and stability. The 30A16PW hybrid behaved better in the superior environments and it is indicated for farmers who adopt the highest technological standards for crop management. However, CARGO hybrid is recommended for regions with the use of low agriculture input. The Eberhart & Russell, centroid, AMMI and mixed models methods, presented similar results in the classification and recommendation hybrid with wide adaptability. However, there was divergence in the statement of hybrids with specific adaptability to favorable and unfavorable environments, which justifies the use of more than one assessment method for reliability on the recommendation of commercial maize hybrids.
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Avaliação do crescimento e de mecanismos de tolerância à salinidade em plantas de sorgo forrageiro irrigados com águas salinas / Evaluation of the grown and mechanisms of tolerance to the salinity in plants of forrage sorghum (Sorghum bicolor (L) Moench), irrigated with saline waters.

Aquino, Alexandre José Silva de January 2005 (has links)
AQUINO, Alexandre José Silva de. Avaliação do crescimento e de mecanismos de tolerância à salinidade em plantas de sorgo forrageiro irrigados com águas salinas. 2005. 89 f. : Dissertação ( mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Curso de Mestrado em Agronomia, Fortaleza-CE, 2005. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-06-02T13:25:52Z No. of bitstreams: 1 2005_dis_ajsaquino.pdf: 426079 bytes, checksum: 0a30bd700ba37eab5d425f683fa5d132 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-06-02T13:26:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2005_dis_ajsaquino.pdf: 426079 bytes, checksum: 0a30bd700ba37eab5d425f683fa5d132 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-02T13:26:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2005_dis_ajsaquino.pdf: 426079 bytes, checksum: 0a30bd700ba37eab5d425f683fa5d132 (MD5) Previous issue date: 2005 / This work studied the tolerance of two genotypes of forrage sorghum (Sorghum bicolor (L) Moench), one salt sensitive (CSF 18) and another salt tolerant (CSF 20). Selected seeds were germinated in vases containing 12 Kg of sandy soil under greenhouse conditions. Ten days after seeding, plants were irrigated with different salt concentration water. For prepairing saline solutions, NaCl, CaCl2.2H2O e MgCl2.6H2O salts were used solved in destyled water, on proportion 7:2:1. the randomized completely design was used, and the treatments were outlined according to a 2 x 5 factorial arrangment, composed with two genotypes and five tratments of increasing salinity (0.5, 2.0 , 4.0, 6.0 e 8.0 dS.m-1), with five replicates. During vegetative growth measures of photosyntesis and gas exchanges were made. Fourty four days after germination, plants were harvested. The contents measured were morpholocial characteristics, shoot fresh and dry matter production (leaves, blades and colms) and water potential. Roots were colected with soil samples in three deaphts (10, 20 e 30 cm). Solute contents of shoot and soil samples were determinated. The genotype CSF 20 showed higher values of internode number, plant height and colm diameter. The reductions of growth were higher for CSF 18 genotype, when plants were exposed to the higher salt levels irrigation water. The relation of K+ in colms and leaves were lower in genotype CSF 20, sugesting that this genotype shows a higher capacity of distribution of K+ in leaves. The genotype CSF 20 showed higher accumulation of soluble carbohydrates in leaves. Results showed that CSf 18 genotype was most sensible to water salinity and CSF 20 was most tolerant to water salinity. / Neste trabalho foi avaliada tolerância de dois genótipos de sorgo forrageiro (Sorghum bicolor (L) Moench), considerados sensível (CSF 18) tolerante (CSF 20) ao estresse salino. Sementes selecionadas foram germinadas em vasos contendo 12 kg de solo arenoso em condições casa de vegetação. Dez dias após a semeadura as plantas passaram a ser irrigadas com água de diferentes concentrações de sais. Para o preparo das soluções salinas, foram utilizados os sais de NaCl, CaCl2.2H2O e MgCl2.6H2O dissolvidos em água destilada, na proporção de 7:2:1. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 5, composto por dois genótipos, cinco tratamentos em doses crescentes de água salina (0.5, 2.0 , 4.0, 6.0 e 8.0 dS.m-1) e cinco repetições. Durante a fase de crescimento vegetativo foram realizadas medições de fotossíntese e trocas gasosas nas plantas. A coleta das plantas teve início quarenta e quatro disa após o início dos tratamentos. Foram realizadas medições de características morfológicas, massas seca e fresca das partes aéreas das plantas (limbos, bainhas e colmos) e potencial hídrico. As raízes foram coletadas, juntamente com amostras de solo em três profundidades (0.10, 0.20 e 0.30 m). Foram determinados os teores de íons das partes aéreas e das amostras de solo. O genótipo CSF 20 apresentou maiores valores de número de entrenós, altura da planta, diâmetro do colmo. As reduções dos padrões de crescimento foram maiores para o genótipo CSF 18, quando as plantas foram expostas aos maiores níveis de salinidade da água de irrigação. A relação entre os teores de K+ nos colmos e nos limbos foliares foram bem menores no genótipo CSF 20, sugerindo que esse genótipo apresenta maior capacidade de distribuição de K+ para as folhas. Os maiores valores na relação Na+/K+ foram observados no genótipo CSF 18 em função de sua menor capacidade de acumular K+ nas folhas. O genótipo CSF 20 acumulou maior quantidade de carboidratos solúveis nas folhas. Os resultado mostraram que o genótipo CSF 18 mostrou-se sensível à salinidade, enquanto que o genótipo CSF 20 mostrou-se tolerante à salinidade.
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Tipos e graus de resistência de genótipos de soja a Spodoptera eridania (Cramer, 1782) (Lepidoptera: Noctuidae)

Souza, Bruno Henrique Sardinha de [UNESP] 28 July 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-28Bitstream added on 2014-06-13T19:32:18Z : No. of bitstreams: 1 souza_bhs_me_jabo.pdf: 587764 bytes, checksum: 1094a966b0fcff3c45f3bc97ca9434fd (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Esse trabalho teve por objetivo avaliar a não preferência para alimentação e parâmetros biológicos de Spodoptera eridania (Cramer, 1782) em genótipos de soja. Inicialmente, foram avaliados 23 genótipos, divididos em três experimentos com nove genótipos, mantendo-se o genótipo utilizado como padrão de resistência IAC 100 e o suscetível BR 16. A partir dos resultados obtidos, realizou-se um experimento com os 10 genótipos que mais se destacaram com características de resistência e suscetibilidade, quais sejam: IAC 100, PI 227682, PI 227687, DM 339, P 98Y51 RR, BRSGO 8360, IGRA RA 518 RR, IGRA RA 516 RR, IGRA RA 626 RR e BR 16. Foram realizados testes com e sem chance de escolha, onde no primeiro, discos foliares foram dispostos em placas de Petri e em seguida foi liberada uma lagarta de 3º instar por genótipo e no segundo, utilizou-se um disco de cada genótipo por placa onde foi liberada uma lagarta de 3º instar. A atratividade das lagartas foi avaliada a 1, 3, 5, 10, 15, 30, 60, 120, 360, 720 e 1080 minutos após sua liberação, além da área foliar consumida. No teste de biologia, lagartas recémeclodidas foram transferidas para placas de Petri, onde folhas de plantas dos genótipos de soja foram oferecidas durante todo o período larval. Foram avaliados o período e viabilidade de larva, período e viabilidade de pré-pupa, período e viabilidade de pupa, período e viabilidade total (eclosão da larva à emergência do adulto), peso de lagartas e pupas macho e fêmea, razão sexual e longevidade dos adultos. O genótipo IAC 100 foi o menos atrativo e consumido pelas lagartas, enquanto BRSGO 8360 e P 98Y51 RR foram os mais consumidos, em testes com e sem chance de escolha, respectivamente... / This work aimed to evaluate the no preference for feeding and biological parameters of Spodoptera eridania (Cramer, 1782) in soybean genotypes. Initially, 23 genotypes were evaluated and divided in three experiments with nine each, keeping the genotype used as pattern of resistance IAC 100 and the susceptible BR 16. From the results obtained, a final experiment was carried out with the 10 highlighted genotypes with characteristics of resistance and susceptibility, which were: IAC 100, PI 227682, PI 227687, DM 339, P 98Y51 RR, BRSGO 8360, IGRA RA 518 RR, IGRA RA 516 RR, IGRA RA 626 RR e BR 16. In all experiments, free choice and no choice tests were performed, where in the former leaf discs were placed in Petri dishes and then one third instar larvae per genotype was released, and in the latter we used one leaf disc of each genotype per plate where one third instar larvae was released. The attractiveness of the caterpillars was evaluated at 1, 3, 5, 10, 15, 30, 60, 120, 360, 720 and 1080 minutes after releasing them, as well as the leaf area consumed. In the biology test, recently hatched caterpillars were transferred to Petri dishes where leaves of the plants of the soybean genotypes were offered daily to the caterpillars “ad libitum” during the larval period. The following biological parameters were evaluated: larvae, pre-pupae, pupae and total (eclosion of the larva to the emergence of the adult) periods and viabilities, weight of larvae and male and female pupae, sexual ratio and longevity of adults. In free choice and no choice no preference for feeding tests, the genotype IAC 100 was less attractive and consumed by the caterpillars, while BRSGO 8360 and P 98Y51 RR were more consumed in free choice and no choice tests, respectively. The presence of negative stimulus, chemical and/or morphological... (Complete abstract click electronic access below)
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Patogenicidade de isolados de Sclerotinia sclerotiorum sobre germoplasma de soja / Analysis of populations of Sclerotinia sclerotiorum pathogenic on soybean germplasm

Guerra, Renato Carnellosso 30 June 2017 (has links)
The White mold or Sclerotinia stem rot, caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum, has become a serious problem in soybean production areas. The objectives of this work were to evaluate whether in different agricultural regions of Brazil, the fungus S.sclerotiorum, has a behavioral similarity at the level of symptoms on certain soybean genotypes, to evaluate which genotypes can be used for each region and which materials can be used for plant breeding. The experiment was conducted at the University of Santa Maria, in a growth chamber with controlled temperature and humidity, between November 2016 and February 2017, with three isolated of S.sclerotiorum, collected in the cities of Itaara and Passo Fundo in Rio Grande do sul and Jataí in Goias, in the season of 2015/2016, on a total number of 56 soybean genotypes. The inoculation of the isolates was performed by the straw test method when the plants were in the growth stages V3/V4. For all genotypes, it was evaluated average lesion size, in centimeters, five days after inoculation. Each treatment was consisted of seven replications, each replication being one plant. Analyzes resulted in the formation of four symptom levels, being susceptible, intermediate, moderately resistant and resistant. Analyzes demonstraded that for the three isolates, different resistant reaction levels were obtained for the tested genotypes. It was verified that the isolate of Passo Fundo - RS, showed resistant pattern the genotype CD 2655 and as susceptible patterns, five genotypes. For the reaction to the Itaara - RS isolate, there were no resistant reactions and nine genotypes were susceptible. For the isolate from Jatai - GO, six genotypes were resistant and one susceptible, NS4823. The use of the UPGMA grouping method, created for each isolate, showed no correlation emphasizing that the isolates have genetic diversity. / O mofo branco ou podridão branca da haste, causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, tem se tornado um problema grave nas áreas de produção de soja. Os objetivos deste trabalho foram avaliar se em diferentes regiões agrícolas do Brasil, o fungo presente S. sclerotiorum, tem similaridade de comportamento ao nível de sintomas sobre determinados genótipos de soja, avaliar quais genótipos podem ser usados para cada região, bem como quais materiais podem ser utilizados pelo melhoramento genético. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, em câmara de crescimento com temperatura e umidade do ar controladas, entre os meses de novembro de 2016 a fevereiro de 2017, com um número de 3 isolados de S. sclerotiorum, coletados nas cidades de Itaara e Passo Fundo no Rio Grande do Sul e Jataí em Goiás, na safra agrícola 2015/2016, sobre um número total de 56 genótipos de soja. A inoculação dos isolados foi realizada pelo método straw test quando as plantas estavam em estádio fenológico de V3/V4. Avaliou-se o tamanho médio da lesão, em centímetros, cinco dias após a inoculação, para todos os genótipos. Cada tratamento foi constituído de sete repetições, sendo cada repetição uma planta. As análises resultaram na formação de quatro níveis de sintomas, sendo suscetível, intermediário, moderadamente resistente e resistente. As análises demonstraram que para os 3 isolados se obteve níveis de reação a resistência distintos para os genótipos testados. Foi verificado que o isolado de Passo Fundo – RS apresentou como padrão resistência o genótipo CD 2655 e como padrões suscetíveis 5 genótipos. Para a reação ao isolado Itaara - RS não houve reações de resistência e 9 genótipos foram suscetíveis. Para o isolado de Jataí - GO 6 genótipos foram resistentes e um suscetível, NS4823. A utilização do método de agrupamento UPGMA criado para cada isolado mostrou-se não possuir correlações, ressaltando de que os isolados têm diversidade genética.
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Modelo oculto de Markov para imputação de genótipos de marcadores moleculares: Uma aplicação no mapeamento de QTL utilizando a abordagem bayesiana / Hidden Markov model for imputation of genotypes of molecular markers: An application in QTL mapping using Bayesian approach

Elias Silva de Medeiros 28 August 2014 (has links)
Muitas são as características quantitativas que são, significativamente, influenciadas por fatores genéticos, em geral, existem vários genes que colaboram para a variação de uma ou mais características quantitativas. As informações ausentes a respeito dos genótipos nos marcadores moleculares é um problema comum em estudo de mapeamento genético e, por conseguinte, no mapeamento dos locus que controlam estas características fenotípicas (QTL). Os dados que não foram observados ocorrem, principalmente, devido a erros de genotipagem e de marcadores não informativos. Para solucionar este problema foi utilizado o método do modelo oculto de Markov para inferir estes dados. Os métodos de acurácias evidenciaram o sucesso da aplicação desta técnica de imputa- ção. Uma vez imputado, na inferência bayesiana estes dados não serão mais tratados como uma variável aleatória resultando assim, numa redução no espaço paramétrico do modelo. Outra grande dificuldade no mapeamento de QTL se deve ao fato de que não se conhece ao certo a quantidade destes que influenciam uma dada característica, fazendo com que surjam diversos problemas, um deles é a dimensão do espaço paramétrico e, consequentemente, a obtenção da amostra a posteriori. Assim, com o objetivo de contornar este problema foi proposta a utilização do método Monte Carlo via cadeia de Markov com Saltos Reversíveis, uma vez que este permite flutuar, entre cada iteração, modelos com diferentes quantidades de parâmetros. A utilização da abordagem bayesiana permitiu detectar cinco QTL para a característica estudada. Todas as análises foram implementadas no programa estatístico R. / There are many quantitative characteristics which are significantly influenced by genetic factors, in general, there are several genes that contribute to the variation of one or more quantitative trait. The missing information about the genotypes in molecular markers is a common problem in studying genetic mapping and therefore the mapping of loci that control these phenotypic traits (QTL). The data were not observed occur mainly due to errors in genotyping and uninformative markers. To solve this problem the method of occult Markov model to infer this information was used. Techniques accuracies demonstrated the successful application of this technique of imputation. Once allocated, in the Bayesian inference this data will no longer be treated as a random variable thus resulting in a reduction in the parameter space of the model. Another great difficulty in mapping QTL is due to the fact that no one knows exactly the amount of these which influence a given characteristic, so that several problems arise, one of them is dimension of the parameter space and, consequently, obtaining the sample a posterior. Thus, in order to solve this problem using the method via Monte Carlo Markov chain Reversible Jump was proposed, since this allows fluctuate between each iteration, models with different numbers of parameters. The use of the Bayesian approach allowed five QTL detected for the studied trait. All analyzes were implemented in the statistical software R.
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Caracterização morfológica de cercospora e eficiência da toxina cercosporina na seleção de genótipos de pimenteiras ornamentais / Characterization cercospora morphological and toxin efficiency in genotypes cercosporin selection chili ornamental

Santos, Aline da Silva 29 May 2015 (has links)
Submitted by Katiane Souza (katyane.souza@gmail.com) on 2016-06-05T14:30:20Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2173132 bytes, checksum: 26847d26f9234311c1ecbcd39be1a04e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-05T14:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2173132 bytes, checksum: 26847d26f9234311c1ecbcd39be1a04e (MD5) Previous issue date: 2015-05-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Cercospora leaf spot is an serious fungal disease of plants of the genus Capscum, it is caused by fungi of genus Cercospora, which produce a toxin, the cercosporin, that has a red coloration which is very toxic to the plant tissues. Therefore, this work purpose was realize a characterization of this disease in ornamental chili plants, as well as, try the efficiency of cercosporin toxin in the genotype of chili ornamental plants. Therefore, it has proceeded an organs collet of infected organs by ornamental chili plants grown in a greenhouse, located in the Science Center Agrarian of Federal University of Paraíba – UFPB/CCA, Campus II, Areia – PB. The samples were taken to the Biotechnology Laboratory of UFPB/CCA for a morphological characterization of the fungus. The disease characterization was did observing plants with symptoms of the disease. To test the efficiency of the cercosporin, it was realized an induction of the production of cercosporin in fungi colonies grown in different in various culture media having as the base coconut milk (LCO), coconut water (ACO), V8 juice (A- V8), leaf extract of pepper (A – P), and water agar (A-A). After that, the toxin was identified throw de change of coloration to green of the fungal solution in contact with the alkaline way, KOH 5N. After this moment of identification, it was realized a quantification and an extraction of cercosporin with the aid of extractor solution Tris-HCl that has pH 6,8. The toxin quantification was made using the Bradford method, proceeding its inoculation in leaves of seven genotypes of chili plants using the concentration that best expressed the symptoms. When the results was analyzed, it has observed that fungous structure was the same kind of the description of the cercospora capsici fungi, which is the responsible for the Cercospora leaf spot has said the Koch postulate. Direct isolation method has given the possibility the achievement of fungus in all plants parts, and, the indirect method have given possibility it with the branches. The water agar base way has promote a bigger mycelial growth, and the leaf extract base way improve a bigger colony proportion. The ACO way has promote the toxin expansion in all Petri dish and has have a bigger quantity of cercosporin for mycelial disc. All the way, except the A-A, has induced a cercosporin produce. The coconut milk base way and the leaf extract with and without gelling present the biggest cercosporina production. The isolated grown in the A-A way has produced quantities of cercosporin equal the isolated grown in the LCO and P-A ways with gelling. The toxin concentrations 40% and 50% showed better the cercosporin symptoms. The UFPB 131, UFPB 132, and UFPB 358 has showed tolerance to the cercosporin toxin. / A cercosporiose é uma grave doença fúngica de plantas do gênero Capsicum, causada por fungos do gênero Cercospora, que se caracterizam por produzir uma toxina, a cercosporina, de coloração vermelha de alta toxidez aos tecidos vegetais. Com isso, o objetivo do trabalho foi realizar a caracterização da doença em plantas de pimenteiras ornamentais, bem como, testar a eficiência da toxina cercosporina na seleção de genótipos de pimenteiras ornamentais. Para isso, procedeu-se a coleta de órgãos infectados de plantas de pimenteiras ornamentais cultivadas em casa de vegetação, no Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal da Paraíba - UFPB/CCA, Campus II, Areia – PB. As amostras foram encaminhadas para o Laboratório de Biotecnologia da UFPB/CCA, para a caracterização morfológica do fungo. A caracterização da doença foi realizada observando plantas com sintomas da doença. Para testar a eficiência da cercosporina, realizou-se a indução da produção de cercosporina em colônias fúngicas cultivadas em diferentes meios de cultura à base de leite de coco (LCO), água de coco (ACO), suco V8 (A-V8), extrato de folhas de pimenteiras (A-P) e água-ágar (A-A). Em seguida, identificou-se a toxina através da mudança de coloração para verde da solução fúngica em contato com o meio alcalino KOH 5N. Após a identificação foi realizada a quantificação e a extração da cercosporina, com auxilio da solução extratora Tris-HCl com pH 6,8. A quantificação da toxina foi feita pelo método de Bradford, procedendo a sua inoculação em folhas de sete genótipos de pimenteiras utilizando a concentração que melhor expressou os sintomas. Analisando os dados, observou-se que estruturas fúngicas presentes em lesões de pimenteiras foram semelhantes às descritas para o fungo Cercospora capsici, e confirmando como causador de cercosporiose pelo postulado de Koch. O método de isolamento direto possibilitou a obtenção do fungo em todas as partes vegetais e o método indireto utilizando os ramos. O meio à base de ágar-água promoveu o maior crescimento micelial e o meio à base de extrato de folhas de pimenteira o maior tamanho da colônia. O meio ACO promoveu a expansão da toxina em toda a placa de Petri e obteve a maior quantidade de cercosporina por disco micelial. Todos os meios, com exceção do meio A-A, induziram a produção de cercosporina. Os meios à base de leite de coco e extrato de folha de pimenteira com e sem geleificante apresentaram as maiores produções de toxina. Os isolados cultivados no meio A-A produziram quantidades de cercosporina iguais aos dos isolados cultivados nos meios LCO e P-A com geleificantes. As concentrações da toxina 40 e 50% foram as que melhor expressaram os sintomas de cercosporiose. Os genótipos UFPB 131, UFPB 132 e UFPB 358 apresentaram tolerância à toxina cercosporina.
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Preparados homeopáticos no manejo fitossanitário e rendimento de germoplasma da batata cultivada no sistema orgânico / Homeopathic prepared in management plant health and potato germplasm yield cultivated in organic system

Busnello, Fábio José 07 August 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-06T17:42:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV15DA026.pdf: 3639882 bytes, checksum: 1206d344d1bc8cd0853a09b84490eff6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-07 / In potato crops the presence of insects and diseases requires the use of phytosanitary products of synthetic origin, which increases both the economic costs and the social. In this context the search for not waste control measures and regional germplasm are promising alternatives to potato crops. This work was carried out to evaluate the effect of homeopathic preparations and local germplasm in the potato crop protection as well as on the production and storage of tubers. Under organic farming system. They were conducted over two crop cycles, two different field experiments. One to evaluate the effect of homeopathic preparations and one for evaluating the performance of germplasm potatoes. Both experiments were conducted in two different locations in Lages and Quilombo, SC. during 2012/13 and 2003/14 seasons. To test the effect of homeopathic preparations used were three commercial varieties of potato (BRS-Ana, BRS-Eliza and Cota) who underwent five treatments: 1) Silicea 12 CH; 2) 60 CH Silicea; 3) Hypericum 12 CH; 4) Hypericum 60 CH; 5) control without application. The application in a double-blind system starting at twenty days after planting, completed in full bloom, totaling eight applications. It was found in these experiments that the BRS-Ana variety has the potential production under organic production system, the product Silicea 12CH and 60CH Hypericum is promising to control disease in potatoes. The local resistance of potato genotypes to diseases and insects. The results in different environments and evaluation dates, show significant differences between genotypes / varieties, for different insect pests evaluated. The results for insect pests and fresh weight loss show significant differences between genotypes and varieties for different environments / Nos cultivos de batata a presença de insetos e doenças requer o emprego de produtos fitossanitário de origem sintética, o que eleva tanto os custos econômicos como os sociais. Neste contexto a busca por medidas de controle não residuais e por germoplasma regional são alternativas promissoras para os cultivos de batata. Este trabalho foi conduzido com o objetivo de avaliar o efeito de preparados homeopáticos e de germoplasma local na proteção de plantas de batatas, bem como sobre a produção e conservação de tubérculos. Sob o sistema de cultivo orgânico. Foram conduzidos, durante dois ciclos de cultivo, dois diferentes experimentos de campo. Um para avaliar o efeito de preparados homeopático e outro para avaliar o desempenho de germoplasma de batatas. Ambos os experimentos foram conduzidos em dois diferentes locais, no município de Lages e Quilombo, SC. durante as safras 2012/13 e 2003/14. Para testar o efeito de preparados homeopáticos foram utilizadas três variedades comerciais de batata (BRS-Ana, BRS-Eliza e Cota) que foram submetidas a cinco tratamentos: 1) Silicea 12 CH; 2) Silicea 60 CH; 3) Hypericum 12 CH; 4) Hypericum 60 CH; 5) testemunha sem aplicação. A aplicação seguindo sistema duplo-cego, iniciando aos vinte dias após o plantio, finalizadas na plena floração, totalizando oito aplicações. Verificou-se nestes experimentos que A variedade BRS-Ana apresentou potencial produtivo sob sistema orgânico de produção, o preparado Silicea 12CH e Hypericum 60CH é promissor para manejo fitossanitário da batateira. A resistência de genótipos locais de batata a doenças e a insetos. Os resultados em diferentes ambientes e datas de avaliação, revelam diferenças significativas entre genótipos/variedades, para os diferentes insetos-pragas avaliados. Os resultados para insetos-pragas e perda de massa fresca evidenciam diferenças significativas entre os genótipos e variedades para os diferentes ambientes
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Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de linhagens de mamona (ricinus communis L.) avaliadas em duas épocas de semeadura

Jesus, Cleusa Rosana de [UNESP] 28 November 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-11-28Bitstream added on 2014-06-13T20:00:34Z : No. of bitstreams: 1 jesus_cr_dr_botfca.pdf: 1287343 bytes, checksum: 957f120eef7cc5f846e8cad6a566175e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Realizou-se o presente trabalho, com o objetivo de avaliar a produtividade média de grãos (kg.ha-1) de linhagens de mamona (Ricinus communis L.) e estimar os parâmetros para a adaptabilidade e estabilidade fenotípicas. As avaliações da época 1 foram realizadas entre novembro de 2006 à junho de 2007 e na época 2, de março à agosto de 2005 nos municípios de Araçatuba, Botucatu, Ilha Solteira, Penápolis e São Manuel – SP, sob delineamento de blocos ao acaso com três repetições e parcela útil de 10 m2. Foram realizadas análises de variância individuais para cada local, conjunta dos cinco locais para cada época e, posteriormente as médias foram comparadas pelo teste de Scott e Knott (1974) a 5% de probabilidade. Observou-se significância para a característica avaliada em todas as análises e, devido à interação significativa entre épocas, locais e linhagens foram realizadas análises de adaptabilidade e estabilidade fenotípicas considerando-se como ambiente as épocas de semeaduras segundo metodologia proposta por Finlay e Wilkinson (1963). Na época 1 com relação à produtividade destacaram-se as linhagens 1, 6, 8, 15, 16 e 18. Quanto aos parâmetros para a adaptabilidade e estabilidade fenotípicas as linhagens 3, 13 e 18 apresentaram adaptabilidade geral e estabilidade média. Na época 2, com relação aos mesmos parâmetros, as linhagens 1, 2, 4, 7, 10, 11, 12, 14, 15, 16, e 19 apresentaram maiores produtividades, predominância de adaptabilidade específica à ambientes favoráveis e estabilidade baixa. Para as duas épocas de semeaduras as linhagens 1, 6, 8, 15 e 16 apresentaram-se como superiores em produtividade. / This work was carried out to evaluate average grains yield (kg ha-1) of castor bean (Ricinus communis L.) lines and to estimate the parameters for fenotypical adaptability and stability. The evaluations for period 1 were conducted between November, 2006 to June, 2007, and period 2, consisted of March to August, 2005 in Araçatuba, Botucatu, Ilha Solteira, São Manuel and Penápolis, Municipals Districts, in São Paulo State, by using randomized complete blocks scheme with three replicates and useful plots of 10 m2. Individual variance analysis for each site were calculated as well as joint variance analysis involving the five locations for each period and subsequently averages were compared by Scott and Knott test (1974) to 5% of probability. Significance was observed for the characteristic evaluated in all analysis and due to the significant interaction between periods, locations and lines, data were studied with analysis of fenotypical adaptability and stability considering the environment as the sowing crop periods according to the methodology proposed by Finlay and Wilkinson (1963). For period 1, in relation to grains yield, lines 1, 6, 8, 15, 16, 18 were outstanding. For adaptability and stability fenotypical parameters, lines 3, 13 and 18 showed general adaptability and medium stability. In period 2, compared with the same parameters, lines 1, 2, - 3 - 4, 7, 10, 11, 12, 14, 15, 16, and 19 presented higher grains yield, predominance of specific adaptability to favorable environments and inferior stability. For the two sowing crop periods, lines 1, 6, 8, 15 and 16 were superior in grains yield.

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