Introdução: A nefrite lúpica (NL) é o maior preditor de morbidade e mortalidade em pacientes portadores de lupus eritematoso sistêmico. Recentes estudos mostram que a proteína quimiotática de monócitos (MCP-1) está implicada na ativação de células inflamatórias, afetando a progressão e a severidade da NL, e que a excreção urinária do MCP-1 (uMCP-1) está aumentada em pacientes com NL em atividade. Na literatura os dados sobre o polimorfismo do gene MCP-1 A(-2518)G e do seu receptor CCR2 V(-64)I sobre a susceptibilidade para nefrite lúpica ainda estão em discussão. Objetivos: Avaliar a associação entre o polimorfismo do gene MCP-1 e do seu receptor CCR2 em pacientes com NL e indivíduos saudáveis, além da associação de ambos os polimorfismos com parâmetros clínicos e histológicos nos pacientes portadores de NL. Além disso, avaliar a associação entre a excreção urinária do MCP-1 em pacientes portadores de nefrite lúpica em atividade com parâmetros clínicos e histológicos. Pacientes e Métodos: As genotipagens do MCP-1 e do CCR2 foram realizadas em 197 pacientes com nefrite lúpica através da extração do DNA genômico, seguido da técnica de reação em cadeia da polimerase, utilizando-se primers específicos. A dosagem urinária do MCP-1 foi realizada em 34 pacientes com nefrite lúpica em atividade através da técnica de ELISA. Resultados: Foram estudados 197 pacientes portadores de nefrite lúpica, do sexo feminino, com idade média de 28±9,8 anos, sendo 65,5% de etnia branca e 34,5% não-branca, acompanhados em nosso ambulatório durante o período de 69±37,1 meses. Como grupo controle, utilizou-se um grupo de 220 indivíduos saudáveis do sexo feminino, pareados de acordo com idade e etnia. Quanto à distribuição do genótipo do MCP-1, evidenciou-se que a freqüência do genótipo GG foi significativamente maior nos pacientes portadores de nefrite lúpica quando comparado ao grupo controle (12,7%x5,0%) (p=0,019), enquanto que o genótipo AA apresentou maior freqüência no grupo controle, porém sem significância estatística (48,7%x56,8%). Com relação aos alelos, a freqüência do alelo A foi significativamente maior no grupo controle (75,9%x68%) (p=0,007) quando comparada aos pacientes com NL. Já em relação ao polimorfismo do CCR2, não foi observada nenhuma diferença na freqüência do genótipo entre os dois grupos, porém foi observada maior freqüência do alelo V no grupo controle (89,8%x86,3%) (p=0,046). Não houve associação entre o genótipo e alelos do MCP-1 e do CCR2 com a função renal no início e no final do estudo, marcadores imunológicos, manifestações clínicas (SLEDAI) e a classe histológica. Porém, observou-se um predomínio significante dos flares moderado e grave nos pacientes portadores dos genótipos AA e AG (p< 0,05) em relação ao genótipo GG, enquanto que, em relação à distribuição alélica do MCP-1 e ao CCR2, não se notou diferença estatística. Não se evidenciou diferença estatística entre as curvas de sobrevida renal funcional dos pacientes portadores de nefrite lúpica e os genótipos do MCP-1 e CCR2 e seus respectivos alelos. Notou-se diferença estatística na variação da creatinina sérica ao longo do seguimento (p<0,001). Foram também estudados 34 pacientes portadores de nefrite lúpica em atividade, do sexo feminino, com idade média de 28,4 ± 9,9 anos, sendo 26,5% pacientes de etnia branca e 73,5% de etnia não-branca. A dosagem do MCP-1 urinário foi realizada no início do quadro e após 3 e 6 meses de seguimento. Em relação ao uMCP-1, houve um aumento significante do mesmo no início do quadro renal quando comparado com 3 e 6 meses de tratamento (p<0,05). Evidenciou-se um aumento do uMCP-1 nos pacientes que apresentavam creatinina plasmática inicial > 1,2mg/dl (p<0,05), porém não houve associação entre uMCP-1 e a creatinina após 6 meses de tratamento. Não se observou associação entre os níveis de uMCP-1 com as manifestações clínicas (SLEDAI), classe histológica e marcadores imunológicos, exceto quanto ao anticorpo antifosfolípide, pois houve excreção aumentada do uMCP-1 em pacientes com anticorpo antifosfolípide positivo no início do quadro (p<0,05). Notou-se valores elevados do uMCP-1 nos pacientes que apresentaram flares grave e moderado em relação ao flare leve (p<0,05). Quanto à distribuição genotípica do MCP-1 em relação ao uMCP-1, foi observado uma associação do uMCP-1 em pacientes portadores dos genótipos AG e AA quando comparados ao genótipo GG (p<0,05). Já em relação à distribuição genotípica e alélica do CCR2, não se notou nenhuma diferença na freqüência dos mesmos e a dosagem de uMCP-1. Conclusões: Houve uma significante associação do genótipo GG do polimorfismo do MCP-1 em pacientes portadoras de NL na população estudada, além de uma associação entre os níveis do uMCP-1 com a severidade do flare renal e a função renal nas pacientes portadoras de NL. / Introduction: Lupus Nephritis (LN) contributes substantially to morbidity and mortality in patients with systemic lupus erythematosus. Literature data show monocyte chemoattractant protein (MCP-1) is implicated in the activation of inflamatory cells and has been suggested to affect the progression and severity of lupus nephritis and urinary MCP-1 levels (uMCP-1) are increased in LN patients during active renal disease. Literature data about genotype polymorphism of MCP-1 A(-2518)G and of its receptor CCR2 V(-64)I and susceptibility to LN is still open to discussion. Objectives: The aim of our protocol was to study association of the genotype polymorphism of MCP-1 and CCR2 with LN compared to a healthy matched population and study association these polymorphisms with clinical and histological parameters in LN patients. Moreover, investigate the relationship of uMCP-1 on the onset, severity and resolution of LN flare. Patients and Methods: Genomic DNA was extracted from peripheral leukocytes from 197 LN patients and MCP-1 and CCR2 genomic variants were detected by polymerase chain reaction followed by restriction enzyme-fragment analysis. uMCP-1 levels were mesured by enzyme-linked immunosorbent assay from 34 LN flare patients. Results: One hundred and ninety seven (197) female patients with histological diagnosis de LN undergoing follow up in our institution and 220 ethnically matched healthy controls were enrolled in this study. Epidemiological characteristics of the LN group were: age 28±9.8 years, race 65.5% of caucasians and 34.5% of Brazilian afro-south-latins. Baseline values were collected at the onset of LN and final values in their last follow up (69±37.1 months). There was a significant association of the GG genotype polymorphism of MCP-1 with LN patients compared to controls (12.7%x5.0%) (p=0.019), while the allele A distribuition was associated with healthy controls (75.9%x68%) (p=0.007). Considering CCR2 -64 V/I polymorphism genotype there was a association of the allele V with the control group compared to LN (89.8%x86.3%) (p=0.046). Analyzing genotype polymorphism of MCP-1 and CCR2 there werent correlation with renal function, immunological markers, clinical manifestations (SLEDAI) or histological classes of LN. There was a significant association of the AA and AG genotypes polymorphism of MCP-1 with moderate and severe renal flares compared to GG genotype polymorphism of MCP-1 (p< 0.05). Kaplan-Meier analysis of the renal survival curves with respect to the studied genotypes did not show any influence in the progression of renal disease. There was a significant association of the creatinine onset and on follow up (p<0.001). Thrity four (34) female patients with criteria for active LN and histological diagnosis were enrolled and treated for six months. Each patient was evaluated once a month and uMCP-1 bimonthly. Epidemiological characteristics of the group showed: age 28.4±9.9 years and race 26.5% caucasians and 73.5% Brazilian afro-south-latins. uMCP-1 excretion at onset (T0) of LN was significantly increased when compared to uMCP-1 measured on the third (T3) and sixth months (T6) (p<0.05). Analyzing uMCP-1 values on T0 there was a correlation with creatinine (p<0,05), but not with, clinical manifestations histological classes of LN or immunological markers, except in patients with positive antiphospholipid autoantibodies demonstrated increased of uMCP-1 (p<0.05). Otherwise, uMCP-1 levels were associated with seriousness of nephritis flares, severe and moderate over mild (p<0.05). Considering MCP-1 polymorphism genotype there was association of the AA and AG genotypes with increased uMCP-1 in patients with active renal disease (p<0.05). Conclusions: There is a significant association of the GG genotype of MCP-1 -2518 A/G polymorphism with LN in our population. uMCP-1 levels in LN is associated with flare seriousness and renal function.

O cancro bacteriano, causado por Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), é uma das doenças mais importantes da cultura do tomate (Lycopersicon esculentum Mill.), especialmente para tomateiros estaqueados. O controle está fundamentado na adoção de um conjunto de medidas preventivas, pois poucas são as informações sobre materiais resistentes à doença e não existe um produto químico que a controle eficientemente. Os objetivos desta tese foram determinar um método de inoculação adequado à seleção de genótipos de tomateiro resistentes ao cancro bacteriano; avaliar a reação de genótipos de tomateiro à inoculação com Cmm; e avaliar o efeito de acibenzolar-S-metil e outros produtos fitossanitários no controle da doença. Para o ensaio de metodologia, foram avaliados quatro métodos de inoculação (aspersão de suspensão bacteriana na face inferior das folhas; aspersão, sob pressão, de suspensão bacteriana na face inferior das folhas; corte do sistema radicular, com tesoura, seguido de imersão na suspensão bacteriana; e ferimento na haste com alfinete entomológico transpassando uma gota de suspensão de inóculo depositada na axila foliar) e três concentrações de inóculo (108 ufc/mL, 107 ufc/mL e 106 ufc/mL). Posteriormente, foi avaliado o efeito da inoculação em plantas com diferentes idades, aos 7, 14, 21 e 28 dias após a emergência. Foram utilizados os genótipos Kadá e Rotam-4 e um isolado bacteriano proveniente de Bragança Paulista, SP. A avaliação foi realizada através de uma escala descritiva, atribuindo-se notas que foram convertidas em índice de murcha bacteriana. A inoculação de Cmm, quatorze dias após a emergência das plantas, através da aspersão de suspensão bacteriana (108 ufc/mL) na face inferior das folhas, com avaliação aos 30 dias após inoculação, foi a metodologia mais apropriada para a avaliar a reação de genótipos de tomateiro. Estabelecida a metodologia, foram avaliados dez genótipos comerciais de tomateiro (Carmen, Débora max, IPA-6, Santa Clara, Alambra, Júpiter, Olimpo, Fanny, Jumbo e Densus) para identificação de materiais resistentes ao cancro bacteriano, tendo-se Kadá e Rotam-4 como controles suscetível e resistente, respectivamente. Alambra e Jumbo apresentaram comportamento semelhante a Rotam-4, sendo materiais promissores para o plantio em áreas com histórico de ocorrência da doença. Para a avaliação de controle do cancro bacteriano foram testados os seguintes produtos: acibenzolar-S-metil (ASM), ASM + mancozeb, ASM + oxicloreto de cobre, mancozeb + oxicloreto de cobre, e oxitetraciclina. Três esquemas de aplicação dos produtos foram adotados: (E1) 4 aplicações (a primeira e a segunda realizadas seis e três dias antes da inoculação; a terceira e a quarta, aos três e seis dias após a inoculação); (E2) apenas as duas aplicações préinoculação; (E3) apenas as duas aplicações pós-inoculação. Esses produtos foram incorporados a meio de cultura para avaliação in vitro de seus efeitos sobre Cmm. Independente da forma de aplicação, o ASM, isolado ou em mistura com fungicidas, proporcionou reduções significativas na severidade da doença e não inibiu o desenvolvimento da bactéria in vitro. / Bacterial canker, caused by Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), is one of the most important diseases of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.). Its control is based on a set of preventive measures, once there is a few information about resistant materials and the chemical control is not efficient. The objectives of this thesis were to determine a suitable inoculation methodology to bacterial canker resistance studies; to evaluate the reaction of commercial tomato genotypes to the inoculation with Cmm; and to evaluate the acibenzolar-S-methyl and other phytossanitary products effects on the control of that disease. To methodology trial, four inoculation methods were evaluated, including foliar pulverization with bacterial suspension; foliar pulverization under pressure with bacterial suspension; cutting of roots with scissor, followed by their immersion in bacterial suspension; and stem wounding with a pin passing over a drop of inoculum suspension deposited on the insertion point of leaf. Besides the inoculation methods, three inoculum concentrations were investigated: 108 cfu/mL; 107 cfu/mL and 106 cfu/mL. Later, it was evaluated the effect of inoculation on plants with different ages: 7, 14, 21 and 28 days after emergency. To those trials, genotypes Kadá and Rotam-4, and a bacterial isolate from Bragança Paulista, SP, were employed. The evaluation was accomplished through a descriptive scale, being attributed notes that were turned into bacterial wilt index. Inoculation of Cmm, fourteen days after emergency of plants, through aspersion with bacterial suspension (108 cfu/mL) over the inferior face of leaves, and evaluation 30 days after inoculation, was the most appropriated methodology to evaluate resistance to bacterial canker in tomato genotypes. After the establishment of the inoculation methodology, ten commercial tomato genotypes (Carmen, Débora max, IPA-6, Santa Clara, Alambra, Jupiter, Olimpo, Fanny, Jumbo and Densus) were investigated to identify resistant materials to the bacterial canker. Kadá and Rotam-4 were employed as susceptible and resistant controls, respectively. Alambra and Jumbo had a similar behavior to Rotam-4, being the most promising materials for the planting in areas with report of occurrence of bacterial canker. To evaluate the bacterial canker control following products were tested: acibenzolar-S-methyl (ASM), ASM + mancozeb, ASM + copper oxicloride, mancozeb + copper oxicloride, and oxytetracycline. Three schemes of application of the products were adopted: (E1) 4 applications (first and second ones were accomplished six and three days before inoculation; third and fourth ones, three and six days after inoculation); (E2) two applications before inoculation only; (E3) two applications after inoculation only. The effect in vitro of these products on Cmm was also evaluated. ASM, isolated or in mixture with fungicides, provided significant reductions in the disease severity independent of the scheme of application and had no effect on bacterial development in vitro.

O emprego de reguladores vegetais como maturadores da cana-de-açúcar tem sido uma prática bem utilizada, em virtude da necessidade de antecipação da colheita e da otimização do planejamento agrícola. Contudo, com a freqüente disponibilidade de genótipos de cana-de-açúcar pelos programas de melhoramento, pouca informação se tem das interações entre novos genótipos e produtos sobre a qualidade tecnológica. Este estudo objetivou determinar a resposta de sete genótipos de cana-de-açúcar à aplicação de dois reguladores vegetais quanto à influência na qualidade da matéria prima. O ensaio foi instalado em março de 2004 e conduzido na APTA Regional Centro-Oeste, Jaú (SP). O delineamento experimental foi o de blocos casualizados, em parcelas sub-divididas, com quatro repetições, constituído pela combinação dos genótipos IAC87-3396, IAC87-3410, IAC89-3124, IAC91-2195, IAC91-5155, PO88-62 e SP80-1842, e de três manejos de condução da maturação sulfometuron metil, 20 g p. c. ha-1; etefon, 2,0 l p. c. ha-1 e testemunha. A qualidade tecnológica foi determinada através dos atributos Brix no caldo, pol no caldo, pureza do caldo, fibra da cana, pol na cana, açúcares redutores no caldo, açúcares redutores na cana e açúcar total recuperável (ATR) aos 0, 21, 42, 63, 84, 105 e 126 dias após a aplicação (DAA), além dos atributos florescimento, “isoporização”, produtividade de colmos e de açúcar aos 126 DAA. Observou-se que, para a maioria dos genótipos, o emprego dos maturadores antecipou a colheita em 21 dias em relação à testemunha, sendo o etefon indicado para colheita entre 42 e 84 DAA, e o sulfometuron metil para o período entre 105 e 126 DAA. O IAC91-5155 não respondeu aos maturadores, o PO88-62 apresentou melhor resposta ao sulfometuron metil, e os demais genótipos ao uso de etefon, quanto à qualidade tecnológica. Os dois produtos, etefon e sulfometuron metil, controlaram o florescimento. Os genótipos IAC91-5155 e PO88-62, apesar de não florescidos, apresentaram “isoporização”. Para a maioria dos genótipos a aplicação dos maturadores não afetou a produtividade de colmos, exceto para o sulfometuron metil que reduziu a do genótipo SP80-1842, e para etefon que aumentou a do IAC91-2195. O sulfometuron metil e o etefon aumentaram a produtividade de açúcar do genótipo IAC89- 3124. O IAC91-2195 apresentou produtividade de açúcar maior com a aplicação de etefon. A produtividade de açúcar foi menor no SP80-1842 com o emprego de sulfometuron metil. / Use of plant growth regulators as sugarcane ripeners has been a practice well used, because of the need of early harvest and the agricultural planning optimization of the crop. However, with the frequent release of genotypes by breeding programs, little information is available about of the interactions among new genotypes and products over the technological quality. This study aimed to determine the response of seven sugarcane genotypes to the application of two ripeners in the raw material quality. The experiment was installed in march 2004 and carried out in the APTA Regional Center West, Jaú (SP). The experimental design was the randomized complete blocks, in split-plot, with four repetitions, constituted by the genotypes IAC87-3396, IAC87-3410, IAC89-3124, IAC91- 2195, IAC91-5155, PO88-62 and SP80-1842, and by three ripening manegement sulfometuron methyl, 20 g p. c. ha-1; ethephon, 2,0 l p.c. ha-1 and control. The technological attributes evaluated were Brix in the juice, pol in the juice, purity of the juice, fiber of the cane, juice reducing sugars, stalks reducing sugars and recoverable total sugars (ATR) to 0, 21, 42, 63, 84, 105 and 126 days after the application (DAA) besides flowering, pith, productivity of stalks and sugar attributes to 126 DAA. It was observed that for the most of the genotypes the use of ripeners antecipated the harvest in 21 days in relation to control, being ethephon recomendable for harvest between 42 and 84 DAA, and sulfometuron methyl for the period between 105 and 126 DAA. The genotype IAC91-5155 didn't answer to the ripeners, PO88-62 presented better answer to sulfometuron methyl and the others genotypes to ethephon to technological quality. Both products, ethephon and sulfomethuron methyl, controlled the flowering. The genotypes IAC91-5155 and PO88-62, in spite of no flowering, presented pith. For most of the genotypes the application of the ripeners didn't affect the productivity of stalks, except to sulfomethuron methyl that reduced it in SP80- 1842, and to ethephon that increased it in IAC91-2195. Sulfomethuron methyl and ethephon increased the productivity of sugar of the genotype IAC89-3124. IAC91-2195 presented bigger sugar productivity with ethephon application. The productivity of sugar was smaller in SP80-1842 with sulfomethuron methyl use.

O milho de segunda safra, também conhecido como milho safrinha, é definido como aquele semeado entre os meses de janeiro e março. Esta modalidade de cultivo atingiu no ano agrícola de 2013/2014 uma área plantada de 9,18 milhões de hectares, superior a área cultivada com milho primeira safra, que no mesmo período foi de 6,61 milhões de hectares. Na segunda safra, há alto risco de instabilidades climáticas, principalmente em decorrência de baixas temperaturas, geadas, má distribuição de chuvas e redução do fotoperíodo. Todos estes fatores prejudicam a atividade fotossintética do milho, reduzindo sua produtividade. No entanto, dada a importância deste cultivo, empresas públicas, privadas e universidades vêm buscando incrementar a produtividade e a estabilidade. Para isso, alguns caracteres são especialmente preconizados. Devido ao alto risco de perda por adversidades ambientais, muitos produtores investem pouco em adubação, principalmente adubação nitrogenada. Neste contexto, o desenvolvimento de plantas mais eficientes no uso e, ou, tolerantes ao estresse por nitrogênio, resultaria em maior segurança para o produtor. Não obstante, a precocidade tem elevada importância, já que materiais precoces reduzem o risco de perdas neste período. No entanto, a mesma deve estar sempre associada a alta produtividade. Assim, para a seleção simultânea destes caracteres, pode-se lançar mão de índices per se de resposta das plantas ao estresse, análises gráficas e, ou, índices de seleção simultânea. Adicionalmente, os valores genotípicos das linhagens para essas características, além de serem preditos via REML/BLUP single-trait (análise univariada), também podem ser preditos via REML/BLUP multi-trait (análise multivariada). Dessa forma, os valores genotípicos são corrigidos pela covariância existente entre os caracteres. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a possibilidade de seleção simultânea para eficiência no uso e tolerância ao estresse por nitrogênio, além de plantas precoces e produtivas. Para isto, linhagens de milho tropical foram cultivadas e avaliadas para estes caracteres. Foram então simulados diversos cenários de seleção simultânea. A partir destes resultados, observou-se que o índice per se de resposta das plantas ao estresse Média Harmônica da Performance Relativa (MHPR) foi o mais eficiente na seleção de plantas eficientes no uso e tolerantes ao estresse por nitrogênio. Isto ocorreu devido a forte correlação desfavorável entre os índices que estimam a eficiência e a tolerância, além da superioridade e em acurácia, herdabilidade e ganhos com a seleção deste índice per se. Já para a seleção simultânea da produtividade e precocidade, o índice Aditivo de seleção simultânea, utilizando os valores genotípicos preditos via REML/BLUP single-trait se mostrou o mais eficiente, já que obteve ganhos satisfatórios em todos os caracteres e há a possibilidade de modular, de forma mais satisfatória, os ganhos em cada caractere. Conclui-se que a seleção simultânea tanto para eficiência no uso e tolerância ao estresse por nitrogênio, quanto para produtividade e precocidade são possíveis. Além disso, a escolha do melhor método de seleção simultânea depende da magnitude e do sentido da correlação entre os caracteres. / Second growing season maize, also known as winter maize, is the maize sowed in Brazil between January and March. This growing modality reached 9.18 million hectares in 2013/2014, higher than the area cultivated in first growing season that was 6.61 million hectares in the same period. In the second season, there is a high risk of climate instabilities, mainly due to low temperatures, frost, poor rainfall distribution and reduction of photoperiod. All these factors harm photosynthetic activity, reducing the maize yield. However, because of the recent plant area increasing, public, private companies and universities have sought increased yield and stability of the second growing season maize. For this, some traits are mainly in the selection process. With the high risk of yield loses due to environmental adversities, many farmers have done little investment in fertilizers, especially nitrogen fertilization. In this context, the development of plants that are nitrogen use efficient and nitrogen stress tolerant could result in a safer activity for the farmers. In addition, the earliness is highly important, since early materials reduce the risk of losses during this period. However, the earliness must always be associated with a high yield. This way, simultaneous selection of these traits can be made by per se responses indexes of stressed plants, graphical analysis and simultaneous selection indexes. Additionally, the genotypic values of the genotypes for the traits can be predicted not only by REML/BLUP single-trait (univariate analysis), but also by REML/BLUP multi-trait (multivariate analysis). In the second, the genotypic values are adjusted considering the covariance between the traits. This way, the objective of this study was to investigate the possibility of simultaneous selection for nitrogen use efficiency and nitrogen stress tolerance, as well as early and high yielding plants. For this, tropical maize lines were grown and evaluate. By these data, it was simulated several simultaneous selection sets. It was observed that Harmonic Mean of the Relative Performance (HMRP) is the most efficient in the selection for nitrogen use efficient and nitrogen stress tolerance. This probably occurs due to the strong unfavorable correlation between the indexes that estimate the efficiency and the tolerance, as well as the superiority in accuracy, heritability and selections gains of HMRP. In case of simultaneous selection for yield and earliness, the additive simultaneous selection index using the genotypic values predicted by REML/BLUP single-trait proved the most efficient selection, because it got satisfactory gains in all the traits and, this index allows the possibility to modulate the gains in each trait. It was concluded that the simultaneous selection for nitrogen use efficiency and nitrogen stress tolerance, as well as for yield and earliness are possible. Furthermore, the choice of the best simultaneous selection method depends on the magnitude and direction of the correlation between the traits.

In plant breeding, genomic prediction (GP) may be an efficient tool to increase the accuracy of selecting genotypes, mainly, under multi-environments trials. This approach has the advantage to increase genetic gains of complex traits and reduce costs. However, strategies are needed to increase the accuracy and reduce the bias of genomic estimated breeding values. In this context, the objectives were: i) to compare two strategies to obtain markers subsets based on marker effect regarding their impact on the prediction accuracy of genome selection; and, ii) to compare the accuracy of four GP methods including genotype × environment interaction and two kernels (GBLUP and Gaussian). We used a rice diversity panel (RICE) and two maize datasets (HEL and USP). These were evaluated for grain yield and plant height. Overall, the prediction accuracy and relative efficiency of genomic selection were increased using markers subsets, which has the potential for build fixed arrays and reduce costs with genotyping. Furthermore, using Gaussian kernel and the including G×E effect, there is an increase in the accuracy of the genomic prediction models. / No melhoramento de plantas, a predição genômica (PG) é uma eficiente ferramenta para aumentar a eficiência seletiva de genótipos, principalmente, considerando múltiplos ambientes. Esta técnica tem como vantagem incrementar o ganho genético para características complexas e reduzir os custos. Entretanto, ainda são necessárias estratégias que aumentem a acurácia e reduzam o viés dos valores genéticos genotípicos. Nesse contexto, os objetivos foram: i) comparar duas estratégias para obtenção de subconjuntos de marcadores baseado em seus efeitos em relação ao seu impacto na acurácia da seleção genômica; ii) comparar a acurácia seletiva de quatro modelos de PG incluindo o efeito de interação genótipo × ambiente (G×A) e dois kernels (GBLUP e Gaussiano). Para isso, foram usados dados de um painel de diversidade de arroz (RICE) e dois conjuntos de dados de milho (HEL e USP). Estes foram avaliados para produtividade de grãos e altura de plantas. Em geral, houve incremento da acurácia de predição e na eficiência da seleção genômica usando subconjuntos de marcadores. Estes poderiam ser utilizados para construção de arrays e, consequentemente, reduzir os custos com genotipagem. Além disso, utilizando o kernel Gaussiano e incluindo o efeito de interação G×A há aumento na acurácia dos modelos de predição genômica.

Orientador: Carmen Sílvia Bertuzzo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-18T19:02:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bonadia_LucianaCardoso_D.pdf: 3915251 bytes, checksum: 0ec73a6295f4f385eff99d2de851f6c8 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A Fibrose Cística (FC) é uma doença autossômica recessiva letal com alta incidência na região sudeste brasileira. É causada por mutações no gene CFTR que codifica uma proteína que se localiza na membrana apical das células epiteliais das vias aeríferas, pâncreas, glândulas salivares e sudoríparas, intestino e aparelho reprodutor, constituindo um canal de cloro. O aumento da viscosidade do muco extracelular é responsável pela maioria das complicações clínicas relacionadas à FC, sendo o acometimento respiratório a principal causa de morbidade e mortalidade. Mais de 1500 mutações foram associadas à FC, divididas em seis classes de acordo com o efeito que causam na produção e atividade da proteína CFTR, sendo a F508del a mais frequente delas. Com o aumento do diagnóstico precoce e melhora da abordagem terapêutica, cada vez mais pacientes chegam à idade adulta. A atenção ao paciente deve acompanhar a mudança demográfica tendo em vista as necessidades específicas da idade sejam clínicas, psicológicas ou sociais. O objetivo desse projeto foi caracterizar uma amostra de pacientes adultos com hipótese diagnóstica de FC e correlacionar os aspectos clínicos, moleculares e fisiológicos. A caracterização clínica foi realizada por pesquisa de dados clínicos no arquivo médico dos pacientes; a molecular foi realizada por métodos de genotipagem como DHPLC, sequenciamento do DNA e MLPA e a fisiológica foi realizada por medidas de corrente intestinal por micro-câmara de Ussing. Foi observado que pacientes sem atividade da CFTR tendem a ser diagnosticados mais cedo. Houve associação entre as classes de mutação de CFTR e a atividade do canal e uma relação entre a gravidade da mutação/inatividade de CFTR e a idade ao diagnóstico, função pulmonar e gravidade avaliada por Escore de Shwachman. Houve associação entre a colonização crônica por Pseudomonas aeruginosa e a obstrução pulmonar avaliada por dados de espirometria. As principais contribuições desse estudo foram: implementação de um método pioneiro no Brasil que além de servir como ferramenta diagnóstica tem sido muito utilizado na pesquisa de novos fármacos para tratamento mutação-dirigidos; caracterização clínica, molecular e fisiológica dos adultos com hipótese diagnóstica de fibrose cística, um grupo de pacientes cada vez mais frequente no atendimento médico dessa doença / Abstract: Cystic Fibrosis (CF) is a lethal autosomal recessive disease with high incidence in Southeast Brazil. It is caused by mutations in the CFTR gene, which encodes a protein that is located in the apical membrane of epithelial cells of airway tract, pancreas, salivary and sweat glands, intestine and reproductive system, forming a chloride channel. The increasing of the viscosity of extracellular mucus is responsible for most clinical complications related to CF, with pulmonary impairment as a major cause of morbidity and mortality. More than 1500 mutations have been associated with CF, divided in six different classes according to the effect on CFTR protein production and activity, F508del being the most common type. With the increase of early diagnosis and improved therapeutic approach, more and more patients reach adulthood. The patient care should follow the demographic shift regarding the specific needs of the age are clinical, psychological or social. The aim of this study was to characterize a sample of adult CF patients with diagnosis of CF and to correlate the clinical, molecular and physiological features. Clinical characterization was obtained from archived medical records. Molecular characterization was performed by genotyping methods such as DHPLC, MLPA and sequencing and physiological characterization was performed by intestinal current measurements by micro-Ussing chamber. It was observed that patients in whom the CFTR channel does not show any residual activity tend to be diagnosed earlier. There was an association between the classes of CFTR mutation and the activity of the channel and a relationship of mutation severity/inactivity of CFTR with the age at diagnosis, lung function and severity score assessed by Shwachman-Kulczycki. There was an association between chronic colonization by Pseudomonas aeruginosa and pulmonary obstruction. The main contributions of this study were: implementation of a method pioneered in Brazil that serves as a diagnostic tool and has been used in researching new drugs for treatment of specifics mutation and clinical, physiological and molecular characterization of adults with cystic fibrosis, a growing group in medical care / Doutorado / Ciencias Biomedicas / Doutor em Ciências Médicas

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2016-08-03T13:55:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_pablo_cadore.pdf: 5773635 bytes, checksum: 63fadc0a8749af862e0e0b7a9b075c0c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T13:55:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) tese_pablo_cadore.pdf: 5773635 bytes, checksum: 63fadc0a8749af862e0e0b7a9b075c0c (MD5) Previous issue date: 2015-09-28 / Sem bolsa / O arroz é uma cultura de origem tropical amplamente cultivada em uma diversidade de áreas, atualmente é o segundo cereal mais produzido no mundo. A ocorrência de baixas temperaturas é um estresse comum na cultura do arroz em regiões temperadas, portanto a tolerância a baixas temperaturas é uma característica desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do país, onde as temperaturas baixas prejudicam a germinação, o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. Portanto, este trabalho tem como objetivo estudar o comportamento de cruzamentos de arroz tolerantes e sensíveis para o caráter de tolerância ao frio no estádio de germinação e identificar genes diferencialmente expressos através do transcriptoma. Foram realizados cruzamentos controlados com 5 genitores contrastantes. Os genitores e as populações segregantes em F3 e F4 foram submetidos a tratamentos com diferentes temperaturas (13C e 25C) e comparados quanto ao seu desempenho relativo, medido pela germinação, índice de velocidade de germinação em laboratório e em campo, comprimento do coleóptilo e comprimento da raiz. A análise do transcriptoma foi realizada através do RNAseq de dois genótipos BRS SCS Tio Taka e Oro, submetidos a tratamentos com diferentes temperaturas (13C e 25C). Os resultados indicam que o índice de velocidade de germinação obtido em laboratório, apresenta maior eficiência em identificar genótipos e populações comparado com a avaliação em campo. O comprimento do coleóptilo e o índice de velocidade de germinação são as metodologias mais adequadas pela elevada associação com a germinação em baixas temperaturas. Os resultados das correlações na geração F3 diferem dos resultados apresentados na geração F4, devido a segregação das populações. Na cultivar tolerante Oro, poucos genes tiveram expressão gênica aumentada significativamente. Uma lista de 55 genes com diferença na expressão comuns as duas cultivares e uma lista com 17 genes com diferença na expressão únicos para a cultivar tolerante Oro, foram selecionados devido a respostas desses genes à tolerância ao frio na germinação de arroz. / Rice is a tropical crop widely grown in a variety of areas, is currently the second most-produced cereal in the world. The presence of low temperatures is a common stress in rice crops in temperate regions, so the tolerance to low temperatures is a desirable characteristic in Brazilian rice genotypes cultivated in the south, where low temperatures damage germination, establishment of the crop and decrease grain yield. Therefore, this paper aims to study the behavior of rice crossings tolerant and sensitive to cold tolerance at the germination stage and identify differentially expressed genes through the transcriptome. Controlled crosses with 5 contrasting genotypes were performed. The parents and segregating populations in F3 and F4 were subjected to treatments with different temperatures (13C e 25C) and compared for their relative performance, as measured by germination, germination speed index in the laboratory and in the field, length coleoptile length and root. The transcriptome analysis was performed through the RNAseq two genotypes BRS SCS Tio Taka and Oro, submitted to treatment with different temperatures (13C e 25C). The results show that the germination speed index obtained in the laboratory, has higher efficiency and populations to identify genotypes compared with the field evaluation. The length of the coleoptile and the germination speed index are the most appropriate methodologies due the high association with germination at low temperatures. The results of the correlations in the generation F3 differed from the results shown in the F4 generation due to segregation populations. In tolerant cultivar Oro, few genes have increased gene expression significantly. A list of 55 genes with common expression difference in the two cultivars and a list of 17 genes with only difference in the expression for the tolerant cultivar Oro, were selected due to responses of these genes to cold tolerance in rice germination.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T17:47:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 277590 bytes, checksum: 771d4c385412e18fcc7725b22b7aff0f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T17:47:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 277590 bytes, checksum: 771d4c385412e18fcc7725b22b7aff0f (MD5) Previous issue date: 2003-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com o intuito de avaliar o efeito da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de animais da raça Pardo-Suíça no Brasil, foram utilizados registros de produção de leite e gordura do leite, para estimação de componentes de variâncias, e valores genéticos dos reprodutores, por meio do programa MTDFREML. Para tanto, foram utilizados três modelos, sem e com interação reprodutor x rebanho ou reprodutor x rebanho-ano, que consideravam como efeitos fixos, grupo genético, estação de parto e classe de rebanho-ano, e como aleatórios, os efeitos de animal, de ambiente permanente, de interação, quando considerada no modelo, e do erro, em análises de características únicas e múltiplas. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para verificar a efetividade da inclusão dos efeitos de interação nos modelos. No estudo do efeito da interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano sobre a avaliação genética de reprodutores, modelos de características múltiplas, para produção de leite e gordura, foram utilizados. Os componentes de variâncias praticamente não alteraram e os coeficientes de herdabilidades foram próximos entre si. A estimativa de herdabilidade foi de 0,40 para ambas características e, a correlação genética entre as características de 0,94, exceto quando o modelo considerou o efeito da interação reprodutor x rebanho, onde para produção de gordura, a herdabilidade foi de 0,39, e a correlação genética entre as características de 0,95. O logaritmo natural da função de verossimilhança aumentou (P< 0,01) quando se incluiu os efeitos de interação nos modelos. As correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos obtidos pelos diferentes modelos foram superiores a 0,99, para produção de leite e gordura, e acima de 0,90, entre as características avaliadas. Deste modo, as interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano não causaram mudanças na classificação dos reprodutores, não havendo necessidade de considerá-las nos modelos de avaliação genética. A fim de analisar a importância da heterogeneidade de variâncias entre rebanhos e a efetividade da inclusão da interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano como fator de ajustamento para a mesma, os dados foram estratificados em duas classes com base no desvio-padrão fenotípico dos rebanhos, para produção de leite, ajustada a duas ordenhas diárias, a 305 dias de lactação e a idade adulta da vaca. Os componentes de variâncias, para produção de leite e gordura, foram obtidos em análises de característica única geral, em análises de característica única, em cada classe de desvio-padrão e em análises de características múltiplas, em que a característica em cada classe de desvio-padrão fenotípico foi considerada como característica diferente. Os componentes de variâncias genética aditiva e residual foram maiores na classe de alto desvio-padrão fenotípico, e reduziram ou praticamente não variaram, com a inclusão dos efeitos de interação no modelo. Nas análises de características múltiplas, em geral, os componentes de variâncias genéticas foram maiores que os obtidos em análises de características únicas, resultando em estimativas de herdabilidades maiores (0,34 a 0,39). Correlações genéticas entre as duas classes de desvio-padrão foram iguais a 1,0, em todas as análises. Quando os efeitos de interação foram considerados nas análises, as correlações entre os valores genéticos praticamente não alteraram. O logaritmo natural da função de verossimilhança aumentou (P<0,01), para produção de gordura, em análises de características múltiplas, quando se incluiu o efeito da interação no modelo. Assim, verifica-se que as interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano não foram eficientes para corrigir a heterogeneidade de variância, e apesar de serem observadas variâncias heterogêneas, estas poderiam ser desconsideradas nas avaliações genéticas, sem afetar a acurácia dos valores genéticos dos animais. / Aiming to evaluate the effect from the variance heterogeneity in the genetic evaluation of the Brown Swiss animals in Brazil, the registers of the milk and milk fat production were used to determine either the variance components and the sire’s genetic values, by using through the MTDFREML program. So, three models were used, without and with interaction of either sire x herd or sire x herd-year, where the genetic group, season of calving, and herd -year class were considered as fixed effects, whereas the effects from the animals, permanent environment, the interaction when considered in the model, and the error were considered as random ones, in the univariate and multitrait analyses. The likelihood ratio test was applied to verify the effectiveness in including the interaction effects into the models. When studying the effects from the interaction of sire x herd and the sire x herd-year upon the genetic evaluation of sires, multitrait models for milk and fat production were used. The variance components practically did not alter and the heritability coefficients were close to each other. The heritability estimate went of 0,40 to both characteristics, and the genetic correlation among the characteristics of 0,94, except when the model considered the effect of the xiiinteraction sire x herd, where for fat production, the heritability went of 0,39, and the genetic correlation among the characteristics of 0,95. The natural logarithm of the likelihood function increased (P<0,01), when the interaction effects were included into models. Pearson and Spearman correlations among the genetic values obtained by these different models were superior to 0.99, for milk and fat production, and above 0.90 between the appraised characteristics. Therefore, the interactions of sire x herd and the sire x herd- year caused no changes in the classification of the sires, and there was no need for considering them into the genetic evaluation models. In order to analyze the importance of the variance heterogeneity between herds and the effectiveness in including the interaction of sire x herd and sire x herd-year as an adjust factor for this heterogeneity, the data were stratified into two classes, based on the phenotypic standard deviation of the herds, for milk production, adjusted to two daily milkings, to a lactation period of 305 days, and the cow’s adult age. The components of variance for milk and fat production were obtained in general univariate analyses, in univariate analyses, in each class of standard deviation and in multitrait analyses, in that the characteristic in each class of the phenotypic standard deviation was considered to be a different characteristic. The components of the genetic addictive and residual variances were higher in the class of high phenotypic standard deviation, and they reduced or practically did not vary with the inclusion of the interaction effects into the model. In the multitrait analyses, the components of the genetic variance were generally higher than those obtained in the univariate analyses, so resulting into higher heritability estimates (0,34 a 0,39). The genetic correlations between both standard deviation classes were equal to 1.0 in all analyses. When considering the interaction effects in the analyses, the correlations among the genetic values practically did not change. When including the effect into the model, the natural logarithm of the likelihood function increased (P<0,01) for fat production in the multitrait analyses. Therefore, it was found that the interactions of sire x herd and sire x herd-year were not efficient to correct the variance heterogeneity, and although the xiiiheterogeneous variances was observed, these might be disregarded in the genetic evaluations without affecting the accuracy of the animals’ genetic values.

Orientador: Louis Bernard Klaczko / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T03:22:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_FelipeBastos_D.pdf: 4246569 bytes, checksum: 8297db94661890abb9ddc71ef0280318 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Apesar de descrever a dinâmica populacional da variação genética, a teoria da genética de populações não descreve como a interação entre genótipos e os ambientes onde estes se desenvolvem gera distribuições fenotípicas. As normas de reação representam uma possível estratégia para tal descrição; elas representam a resposta fenotípica de cada genótipo para uma variável ambiental e, com isso, expõem a variação causada pela plasticidade fenotípica e capturam o fenômeno da interação genótipo-ambiente. Neste trabalho, Drosophila mediopunctata foi utilizada como organismo modelo. Ela é uma espécie do grupo tripunctata, do gênero Drosophila, polimórfica para inversões do segundo cromossomo e para um padrão de pigmentação conspícuo nos tergitos abdominais, formado por fenótipos que podem apresentar de zero a três pintas escuras. Na primeira parte deste trabalho, é apresentado um teste da independência genética entre a plasticidade fenotípica e o valor médio do polimorfismo de pigmentação. Foram utilizadas oito estirpes homocariotípicas para inversões do cromossomo II com diferentes valores fenotípicos médios para analisar a variação de normas de reação do número de pintas à temperatura. As normas de reação desse caráter foram parábolas cujas curvaturas estão correlacionadas ao valor médio, indicando que a variação dessas duas características pode ser determinada por pleiotropia. O mesmo padrão foi observado em heterozigotos resultantes de cruzamentos entre estirpes com normas de reação de curvaturas diferentes, evidenciando que a variação das normas de reação do número de pintas de D. mediopunctata é previsível por uma regra simples de associação entre forma (curvatura) e valor médio. Na segunda parte deste trabalho é apresentada uma análise de 40 normas de reação de cinco caracteres diferentes na qual se buscou estabelecer um padrão geral de forma das normas de reação e verificar as consequências desse padrão para estudos que investigam a variação da plasticidade fenotípica com modelos e métodos baseados na linearidade. Os resultados apresentados mostram que a forma típica das normas de reação é não-linear. Quando analisadas com um desenho experimental apropriado apenas para curvas lineares, i.e. com somente três ambientes, tais curvas apresentam um padrão imprevisível de variação, fundamentando um conceito de interação genótipo-ambiente associado à imprevisibilidade. Além disso, o uso de um modelo linear para descrever a variação da plasticidade fenotípica em normas de reação não lineares leva à perda de informação e, em alguns casos, a artefatos que embasam conclusões falsas. Considerando os resultados e conclusões obtidos, é proposta uma nova visão sobre normas de reação e plasticidade fenotípica, baseada no uso de um modelo parabólico e em desenhos experimentais mais abrangentes e detalhados, que permitiriam descrever a forma e variação das normas de reação sem perder fenômenos e padrões importantes / Abstract: Despite describing the population dynamics of genetic variation, the theory of population genetics lacks a description of how genotype and developmental environment interact to generate a phenotypic distribution. Such a description could be achieved through reaction norms, which give the phenotypic response of individual genotypes to a given environmental variation and describe the variation due to phenotypic plasticity and genotype-environment interaction. Here, we used Drosophila mediopunctata as a model organism. This species belongs to the tripunctata group of the genus Drosophila, and is polymorphic for second chromosome inversions. D. mediopunctata specimens display a conspicuous pigmentation polymorphism in the abdomen, with phenotypes ranging from zero to three dark spots in the last three tergites. In the first part of this study, we describe a test of the genetic independency between phenotypic plasticity and mean phenotypic value for the pigmentation polymorphism of D. mediopunctata. We analyzed the reaction norms of the number of abdominal spots in response to temperature of eight strains homozygous for second chromosome inversions and with different mean phenotypic values. The reaction norms were parabolic, and their curvature was correlated with the mean phenotypic value, suggesting that the variation of these two traits may be determined by pleiotropy. The same pattern was observed in heterozygous genotypes resulting from crosses between strains with different reaction norm curvatures. These results show that the variation of reaction norms of the number of dark abdominal spots of D. mediopunctata is predictable by a simple association rule between shape (curvature) and mean value. In the second part of this study we show the results from the analysis of 40 reaction norms of five different traits, which had two aims: establishing a general pattern of reaction norms shape; and verifying the impact of this pattern for studies that investigate the variation of phenotypic plasticity using models and methods based on a linearity assumption. The results show that the typical reaction norm shape is nonlinear. A pattern of unpredictable variation emerges when these curves are analyzed with only three environments, suggesting that the association of genotype-environment interaction with unpredictability may be due to the use of an experimental design only suitable for linear curves. Furthermore, the use of a linear model to describe the variation of nonlinear reaction norms leads to loss of information and, in some cases, artifacts which support false conclusions. Considering these results, we propose a new vision of reaction norms and phenotypic plasticity which is based on the use of a parabolic model and on more comprehensive and detailed experimental designs which would describe the shape and variation of reaction norms without losing important patterns and phenomena / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Orientador: Carmen Sílvia Bertuzzo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-27T12:57:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Goncalves_ClaudiaEstela_D.pdf: 2258187 bytes, checksum: 7cac2852cc031e31eba1a31c62d9dda2 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A Anemia de Fanconi (AF) é uma alteração genética caracterizada por múltiplas anomalias congênitas, anormalidades hematológicas e predisposição a uma variedade de tumores. A incidência mundial da AF em todo o mundo é de aproximadamente três por milhão e a frequência de heterozigotos é estimada em um para 300 na Europa e Estados Unidos. É uma doença causada por mutações em genes relacionados ao sistema de reparo. Até o momento foram descritos 16 genes que podem estar multados. São eles: FANCA, FANCB, FANCC, FNCD1, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCJ, FANCL, FANCM, FANCN, FANCO, FANCP E PANCQ. Os grupos mais frequentes são o FANCA e FANCC. De qualquer modo devido a essa heterogeneidade gênica, o diagnóstico molecular dessa alteração é complexo. Com o intuito de testar uma estratégia diagnóstica, o presente trabalho se propôs a identificar as mutações mais frequentes no gene FANC por PCR e digestão enzimática e investigar mutações no gene FANCA, por meio da Reação em Cadeia da Polimerase seguida de digestão enzimática da mutação Brasileira e posterior sequenciamento dos 43 éxons em 60 pacientes portadores de Anemia de Fanconi DEB positivos. Foram detectados 19 pacientes (27,94%), como sendo do grupo C e 16 pacientes como grupo A (23,53%). A mutação ?3788-3790 do gene FANCA teve uma frequência alélica de 15,4%. Foram encontradas 3 mutações intrônicas, 1 mutação sinônima e 1 mutação de sentido trocado no gene FANCA. Não foram encontradas correlações com as manifestações hematológicas, renais, baixo peso, malformações congênitas de membros, machas e pigmentação de pele, sexo e idade / Abstract: The Fanconi Anemia (FA) is a genetic disorder characterized by multiple congenital and hematological abnormalities and predisposition to a variety of tumors. The worldwide incidence of AF is approximately three per million and the frequency of heterozygotes is estimated at one in 300 in Europe and the United States. It is a disease caused by mutations in genes involved in the repair system. So far have been described 16 genes that may be mutated. They are: FANCA , FANCB , FANCC , FNCD1 , FANCD2 , FANCE , FANCF , FANCG , FANCI , FANCJ , FANCL , FANCM , FANCN , FANCO , FANCP And PANCQ . The most common groups are the FANCA and FANCC. However due to this genetic heterogeneity, molecular diagnosis of this change is complex. In order to test a diagnostic strategy, the present study aimed to identify the most frequent mutations in the FANC gene by PCR and restriction enzyme digestion and investigate mutations in the FANCA gene, using the polymerase chain reaction followed by enzymatic digestion of the mutation Brazilian and subsequent sequencing of the 43 exons in 60 patients with Fanconi Anemia positive DEB. 19 patients (27.94%) were detected as group C and 16 patients as group A (23.53%). The ?3788 - 3790 mutation in the FANCA gene had an allelic frequency of 15.4%. Three intronic mutations, one synonymous mutation and one mutation changed direction in FANCA gene were found. No correlation with hematologic, renal, low weight manifestations of congenital malformations members, butches and skin pigmentation, age and sex were found / Doutorado / Clinica Medica / Doutora em Clínica Médica