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Association between parental history of Helicobacter pylori treatment failure and treatment failure in the offspring / 親のクラリスロマイシン3剤併用療法の不成功と子のクラリスロマイシン3剤併用療法の不成功との関連

Deguchi, Hisato 23 March 2020 (has links)
京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(社会健康医学) / 甲第22384号 / 社医博第106号 / 新制||社||医11(附属図書館) / 京都大学大学院医学研究科社会健康医学系専攻 / (主査)教授 妹尾 浩, 教授 古川 壽亮, 教授 中川 一路 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Public Health / Kyoto University / DFAM
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Avaliação da associação entre índice de massa corporal e polimorfismos que codificam metaloproteinases da matriz, com cronologia de erupção dentária, em crianças manauaras / Evaluation of the association between body mass index and polymorphisms in genes that codify matrix metalloproteinases with tooth eruption chronology in children from Manaus

Evangelista, Silvane e Silva 24 August 2018 (has links)
Diversos mecanismos estão envolvidos no processo de erupção dentária. O objetivo deste estudo foi avaliar se o sobrepeso/obesidade e os polimorfismos genéticos nos genes que codificam as metaloproteinases da matriz (MMPs) - 8 e -13 estão associados com a cronologia de erupção dos dentes permanentes, em crianças de Manaus - AM. Um total de 216 crianças de escolas públicas foram incluídas, com idade variando entre 9 e 12 anos. Inicialmente foi aplicado um questionário, contendo dados anamnésicos relevantes para a pesquisa. Em seguida, o índice de massa corporal escore-z foi calculado, e as crianças foram divididas em 2 grupos: crianças com peso normal e crianças com sobrepeso/obesidade (n=65). A seguir, foi efetuado o exame clínico, onde foram avaliados os dentes presentes na cavidade bucal e comparação com uma tabela de cronologia de erupção de dentes permanentes, sendo as crianças classificadas em 2 grupos: com atraso na cronologia de erupção e sem atraso na cronologia de erupção. Amostras de saliva de todos os participantes foram coletadas e utilizadas como fonte de DNA genômico. A genotipagem dos polimorfismos rs17099443 e rs3765620 em MMP8 e dos polimorfismos rs478927 e rs2252070 em MMP13 foi realizada pela análise do produto final de PCR, tecnologia Taqman. Os testes do qui-quadrado e/ou exato de Fisher foram utilizados para comparar crianças com e sem atraso de erupção. O grupo \"sobrepeso / obeso\" foi comparado com o grupo \"peso normal\" e comparado na proporção de 1:2. O teste de Shapiro-Wilk foi utilizado para verificar a normalidade dos dados. O teste t baseado na idade foi utilizado para comparação das médias entre os grupos. Uma análise de regressão linear usando idade e sexo como covariantes foi utilizada. O teste Anova com pós-teste de Tukey foi utilizado para comparar o número de dentes com atraso de erupção de acordo com o genótipo. O nível de significância adotado foi de 5%. Cento e vinte e sete crianças foram classificadas com peso normal e 65 foram classificadas com sobrepeso/obesidade (49 com sobrepeso e 16 com obesidade). A condição de sobrepeso/obesidade associouse ao sexo, no qual os meninos tiveram maior chance de apresentar condições de maior peso (OR = 1,84; IC 95% 1,06-3,37; p = 0,04). O número médio de dentes permanentes irrompidos foi maior no grupo sobrepeso/obesidade (p <0,001). A análise de regressão linear demonstrou que o estado nutricional, sexo e idade estavam fortemente associados ao número de dentes permanentes irrompidos (p<0,05). Concluiu-se que crianças manauaras com sobrepeso/obesidade apresentam aceleração da cronologia de erupção dentária, quando comparadas com crianças com peso normal. Não houve associação do gene MMP13 com atraso na cronologia de erupção e verificou-se que o polimorfismo rs17099443 em MMP8 está associado com atraso de erupção dentária, onde o genótipo GG e o alelo G foram encontrados mais frequentemente nas crianças com atraso da cronologia de erupção. Crianças com o genótipo GG nesse polimorfismo apresentavam um maior número de dentes permanentes com atraso na cronologia de erupção do que as crianças com os genótipos CC e CG / Many mechanisms are involved in the in the tooth eruption process. The aim of this study was to evaluate if overweight/obesity and genetic polymorphisms in genes that codify the matrix metalloproteinases (MMPs) - 8 and - 13 are associated with permanent tooth eruption chronology, in children from Manaus-AM. A total of 216 children from public were included, with the age ranging from 9 to 12 years old. Initially, a questionnaire was used containing anamnesic data relevant to the research. Body mass index z-score was calculated and the children were separated in two groups: normal weight children (n=127) and overweight/obesity children (n=65). The clinical examination was performed, the number of permanent teeth erupted in the oral cavity were evaluated and compared with a table of permanent tooth eruption chronology, in which the children were classified in two groups: with (n=126) and without delayed tooth eruption (n=90). Saliva samples were collected from all samples as a genomic DNA source. The genotyping of the polymorphisms rs17099443 and rs3765620 in MMP8, and of the polymorphisms rs478927 and rs2252070 in MMP13 were performed in the end-point analysis of the real time PCR, Taqman technology. Chi-square and/or Fisher exact tests were used to compare children with and without delayed tooth eruption. The &quot;overweight/obesity&quot; group was compared with &quot;normal weight&quot; group in the ratio 1:2. The Shapiro-Wilk test was used to verify the normality of the data. The t test was used based on the age was used to compare the means between groups. A linear regression analysis using age and gender and gender as co-variants was performed. Anova with Tukey posttest was used to compare the number of delayed tooth eruption according to the genotype. The significance level adopted was 5%. One hundred twenty-seven children were classified as normal weight and 65 as overweight/obesity (49 with overweight and 16 with obesity) Overweight/obesity condition was associated with gender, in which boys had a higher chance to present the condition (OR = 1.84; IC 95% 1.06-3.37; p = 0.04). The mean number of erupted permanent teeth was higher in the group overweight/obesity (p <0.001). The linear regression analysis demonstrated that the nutritional status, sex and age were associated with the number of erupted permanent teeth (p<0.05). In conclusion, children from Manaus with overweight/obesity presented an acceleration in the chronology of tooth eruption process in comparison with the normal weight children. The polymorphism rs17099443 in MMP8 is associated with delayed tooth eruption, and the genotype GG and the G allele were more frequent in the children with delayed on the chronology of tooth eruption. Children with GG genotype presented a higher number of permanent teeth with delayed on the chronology of tooth eruption than children with the genotypes CC and CG.
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Vliv polymorfismu kandidátního lokusu na technologické vlastnosti mléka

VAŇKOVÁ, Adéla January 2019 (has links)
The aim of this diploma thesis was to investigate the influence of milk betacasein locus (CSN2) polymorfic variants on production characteristics and milk technological qualities in Czech Simmental cattle and Holstein cattle. DNA extracted from milk of 702 cows was genotyped using PCR and RFLP methods. The genotypes A1A1, A1A2, and A2A2 had the following distribution within the population studied: A1A1 in 11,40 %, A1A2 in 8,46 %, and A2A2 in 50,14 % cows. The studied milk parameters were the milk yield (kg), protein and fat percentage and protein and fat yield (kg). The statistical evaluation was made STATISTICA 12 program. We found no statisticaly significant influence of CSN2 genotype on the selected milk yields. The results might be biased by the relatively low amount of individuals studied. Research will continue within the QJ1510339 and GAJU028/2019/ Z grant.
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Associação entre o polimorfismo genético das metaloproteinases da matriz 1 e 3 e a rotura completa do manguito rotador / Association between genetic polymorphism of matrix metalloproteinases 1 and 3 and the full-thickness rotator cuff tear

Assunção, Jorge Henrique 02 April 2019 (has links)
INTRODUÇÃO: Na patogênese da rotura do manguito rotador, diminuição da síntese e aumento da degradação das fibras colágenas são encontradas, associadas ao aumento da atividade das metaloproteinases da matriz 1 e 3 (MMP-1 e MMP-3). Há evidências que fatores genéticos estão envolvidos na produção das metaloproteinases e na etiologia da rotura do manguito rotador. O objetivo deste estudo foi avaliar a associação entre o polimorfismo genético das MMP-1 e MMP-3 com a rotura de espessura completa do manguito rotador. Como objetivos secundários, tivemos avaliar a correlação dos haplótipos da MMP-1 e MMP-3 com a rotura de espessura completa do manguito rotador e comparar se indíviduos com rotura transfixante do manguito rotador têm maior proporção de familiares com a mesma doença, em relação aos indíviduos controles. MÉTODOS: Avaliamos 64 pacientes com rotura transfixante do manguito rotador e 64 controles assintomáticos. Foram incluídos apenas pacientes com idade inferior a 65 anos e rotura de espessura completa não traumática. A rotura ou integridade do manguito rotador foi avaliada por ressonância magnética ou ultrassonografia em todos indivíduos. Os pacientes e os controles foram pareados por idade. O ácido desoxirribonucleico (DNA) dos voluntários foi obtido a partir de células epiteliais da mucosa bucal. Os genótipos das MMP-1 e MMP-3 foram determinados utilizando as técnicas de Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) e Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos de Restrição (RFLP). RESULTADOS: Observamos uma presença de 77% do alelo 1G e 64% do genótipo 1G/1G no grupo controle. Os pacientes com rotura transfixante do manguito rotador apresentaram uma taxa de 48% do alelo 2G e 73% de genótipos 1G/2G ou 2G/2G (p < 0,001). Indivíduos com genótipo 1G/2G e 2G/2G tiveram maior chance de ter uma rotura do manguito rotador: razão de chances (RC) igual a 4,8 (Intervalo de confiança de 95% [IC 95%] 2,1 a 11,0) e 5,2 (IC 95% 1,8 a 14,9), respectivamente. Também observamos uma distribuição significativamente diferente nos alelos e genótipos da MMP-3 (p = 0,045, p = 0,021, respectivamente) entre os casos e controles. Indivíduos com genótipo 5A/5A tiveram maior chance de apresentarem uma rotura do manguito rotador (RC 5,5; IC 95% 1,4 a 20,9). Indíviduos com haplótipo 2G/5A tiveram maior possibilidade de ter uma rotura do manguito rotador, este haplótipo foi encontrado em 42 de 64 pacientes (66%) e em 17 de 64 controles (27%), com razão de chances de 5,3 (IC 95% 2,5 a 11,3). Pacientes com rotura do manguito rotador relataram, em maior número (19 de 64 pacientes, 30%), a existência de familiares que realizaram tratamento para rotura do manguito rotador em relação aos pacientes controles (quatro de 64 pacientes, 6%; p = 0,001). CONCLUSÃO: O polimorfismo genético das MMP-1 e MMP-3 foi associado à rotura do manguito rotador / INTRODUCTION: In the pathogenesis of rotator cuff tear, decreased synthesis and increased degradation of collagen fibers are found, associated with an increase in activity of matrix metalloproteinases 1 and 3 (MMP-1 and MMP-3). There is evidence that genetic factors may be involved in metalloproteinase production and the etiology of rotator cuff tear. The aim of this study was to evaluate the association between the genetic polymorphism of MMP-1 and MMP-3 and full-thickness rotator cuff tear. As secondary aims, we measured the correlation of MMP-1 and MMP-3 haplotypes with full-thickness rotator cuff tears and compared if individuals with full-thickness rotator cuff tears have a higher proportion of relatives with the same disease than the control subjects. METHODS: We evaluated 64 patients with full-thickness rotator cuff tear and 64 asymptomatic controls. Patients aged below 65 years, with non-traumatic full thickness tears, were included. The rotator cuff tear or integrity was evaluated by magnetic resonance or ultrasound in all individuals. The patients and controls were paired by age. The deoxyribonucleic acid (DNA) of the volunteers was obtained from oral mucosa epithelial cells. MMP-1 and MMP-3 genotypes were determined using the Polimerase Chain Reaction (PCR) and Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) assays. RESULTS: We observed a 77% presence of allele 1G and 64% of genotypes 1G/1G in the control group. The patients with full-thickness rotator cuff tear presented 48% of allele 2G and 73% of genotypes 1G/2G or 2G/2G (p < 0.001). Individuals with genotypes 1G/2G and 2G/2G were more likely to have a rotator cuff tear: odds ratio equal to 4.8 (95% confidence interval [95% CI] 2.1 to 11.0) and 5.2 (95% CI 1.8 to 14.9), respectively. We also observed a significantly different distribution in the alleles and genotypes of MMP-3 (p = 0.045, p = 0.021, respectively) among the cases and controls. Individuals with the 5A/5A genotype were more likely to have a rotator cuff tear (OR 5.5; 95% CI 1.4 to 20.9). Individuals with the haplotype 2G/5A were more likely to have rotator cuff tears develop, this haplotype was found in 42 of 64 patients (66%) and in 17 of 64 controls (27%) with odds ratio 5.3 (95% CI 2.5 to 11.3). Patients with rotator cuff tears reported, in higher number (19 of 64 patients, 30%), the existence of relatives who previously had treatment for rotator cuff tears compared to control patients (four of 64 patients, 6%; p = 0,001). CONCLUSION: The genetic polymorphism of MMP-1 and MMP-3 was associated with rotator cuff tear
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Análise dos polimorfismos C677T e A1298C do gene MTHFR e a correlação dos micronutrientes em mães de indivíduos com fissura de lábio/palato / Analysis of the C677T and A1298C MTHFR gene polymorphisms and correlation of micronutrients in mothers of individuals with cleft lip/palate

Viana, Camila Saramelo 30 August 2013 (has links)
As fissuras de lábio e/ou palato (FL/P) estão entre as malformações mais comuns na espécie humana. São também consideradas um grande problema de saúde pública devido à necessidade de suporte médico, fonaudiológico, nutricional e odontológico por um período prolongado. A etiologia da FL/P é muito complexa envolvendo vários genes, mutações cromossômicas, interações poligênicas, fatores ambientais e interação gene-ambiente. Os polimorfismos C677T e A1298C no gene MTHFR (metilenotetrahidrofolato redutase) estão associados à interação gene-ambiente. Esse gene está envolvido na metabolização do folato, a enzima produzida cataliza a conversão 5,10-metilenotetrahidrofolato para 5-metiltetrahidrofolato. Um leve aumento do nível de homocisteína tem sido associado com aumento no risco das fissuras orais não sindrômicas e outras malformações ao nascimento. A redução do consumo de folato pela mãe durante o período periconcepcional associado ao polimorfismo C677T do gene MTHFR resulta em hiperhomocisteinemia aumentando o risco para fissuras orais, o polimorfismo A1298C resulta em uma diminuição da atividade MTHFR. O objetivo desse estudo foi avaliar o perfil nutricional, a dosagem dos micronutrientes que participam da via do folato e os polimorfismos do gene MTHFR, das mulheres que possuem filhos com FL/P atendidos no Hospital de Reabilitação de Anomalias Craniofaciais, Universidade de São Paulo (HRAC/USP) -Bauru. Para a realização deste estudo foi aplicado um questionário de frequência alimentar, dosagem dos micronutrientes vitaminas B12, ácido fólico e análise dos polimorfismos C677T nos grupos pesquisa (n=50) e controle (n=50) e o polimorfismo A1298C nos grupos pesquisa (n=27) e controle (n=22). As análises dos questionários de frequência alimentar (QFAs) revelaram que a suplementação de ácido fólico foi maior pelas mães do grupo pesquisa sendo, estatisticamente significativo (p=0,02) quando comparado com o grupo controle. A frequência alimentar dos outros micronutrientes mostrou não haver diferenças em ambos os grupos estudados, porém, quando comparamos com as recomendações das Dietary reference intakes (DRIs) observamos um baixo consumo de vitamina A e ácido fólico em ambos os grupos. Observou-se que não houve diferença significativa entre os polimorfismos 677CT/TT e 1298AC e a média dos níveis plasmáticos de vitamina B12 e ácido fólico nos grupos estudados, assim como na comparação entre esses polimorfismos e a média da ingestão dos micronutrientes em ambos os grupos. Conclui-se com este trabalho que os polimorfismos C677T e A1298C e a associação da baixa ingestão dos micronutrientes estudados pode não estar relacionado com um risco aumentado para fissuras orais nessa população. / Cleft lip and/or palate (CL/P) are among the most common birth defects in humans. They are also considered a major public health problem due to the need for medical support, speech pathology, nutritional and dental care for an extended period. The etiology of CL/P is very complex involving multiple genes, chromosomal mutations, polygenic interactions, environmental factors and gene-environment interaction. The C677T and A1298C in the MTHFR gene (methylenetetrahydrofolate reductase) are associated with gene-environment interaction. This gene is involved in the folate metabolism, the enzyme catalyzes the conversion produced 5,10-methylenetetrahydrofolate to 5-methyltetrahydrofolate. A slight increase in the level of homocysteine has been associated with increased risk of non-syndromic oral clefts and other birth defects. The reduction of folate intake by the mother during the periconceptional period associated with the C677T polymorphism of the MTHFR gene results in hyperhomocysteinemia increases the risk of oral clefts, the A1298C polymorphism results in decreased MTHFR activity. The aim of this study was to evaluate the nutritional profile, dosing of micronutrients that participate in the pathway of folate and MTHFR gene polymorphisms in women who have children with CL/P treated at Hospital de Reabilitação de Anomalias Craniofaciais, Universidade de São Paulo (HRAC/USP), Bauru. For this study a food frequency questionnaire was administered, dosing of vitamins B12 and folate micronutrients, and analysis of the polymorphisms C677T in the research (n=50) and control (n=50) groups and the A1298C in the research (n=27) and control (n=22) groups. Analyses of food frequency questionnaire (QFAs) revealed that supplementation of folic acid was higher by mothers in the study group being statistically significant (p=0.02) when compared with the control group. The food frequency of other micronutrients showed no differences in both groups, however, when compared with the recommendations of the Dietary Reference Intakes (DRIs) we observed a low intake of vitamin A and folic acid in both groups. It was observed that there was no significant difference between the 677CT/TT and 1298AC polymorphisms and mean plasma levels of vitamin B12 and folic acid in the groups studied, as well as the comparison between these polymorphisms and the average intake of micronutrients in both groups. We conclude that the C677T and A1298C polymorphisms and association of low intake of micronutrients may not be related to an increased risk for oral clefts in this population.
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Caracterização da produção científica sobre polimorfismos genéticos em catarata.

Cazorla, Fausto da Paz 10 August 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fausto da Paz Cazorla.pdf: 6710348 bytes, checksum: 606153332dc72a80b78d3048a1ddb0b6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / Cataracts are the leading cause of reversible blindness worldwide. It is estimated that currently about 20 million people are blind due to cataract, and this number is expected to grow with increasing life expectancy of the world population. Any opacity in the crystalline lens that causes light scattering and damage to vision is considered cataract. In this paper we conducted a survey and characterization of scientific literature on genetic polymorphisms in the various types of cataracts. The "Scopus" platform was used for the survey of articles and reviews. The analyzed data showed a growing number of publications on the subject in recent years; there is a large concentration of papers among the countries that publish on polymorphisms in cataracts, as well as the authors and institutions. One single journal (Molecular Vision) accounted for almost 35% of publications on the subject, and also an article stood out for the high impact factor of the journal in which it was published. We conclude that there is a growing interest about genetic polymorphisms of cataract, with a significant increase in research and publications, envisioning a future control of expression of these genes, in order to control the aging of the lens and dominate the emergence of cataract in individuals. / ! A catarata é a principal causa de cegueira reversível em todo o mundo. Estima-se que atualmente cerca de 20 milhões de pessoas estão cegas devido à catarata, e este número tende a crescer com o aumento da expectativa de vida da população mundial. Qualquer opacidade no cristalino que provoque dispersão da luz e prejuízo para a visão é considerada catarata. Neste trabalho foi feito um levantamento e caracterização da produção científica sobre os polimorfismos genéticos nos diversos tipos de catarata. Foi utilizada a plataforma Scopus para o levantamento dos artigos e revisões. Os dados analisados mostraram um número crescente de publicações sobre o assunto nos últimos anos; existe uma grande concentração de trabalhos entre os países que mais publicam sobre polimorfismos em catarata, assim como os autores e instituições. Uma única revista (Molecular Vision) foi responsável por quase 35% das publicações sobre o assunto, e também um artigo se destacou pelo alto fator de impacto do periódico no qual foi publicado. Concluímos que há um crescente interesse pelo domínio do conhecimento dos polimorfismos genéticos da catarata, com aumento expressivo das pesquisas e publicações, vislumbrando um futuro controle da expressão destes genes, com o intuito de controlar o envelhecimento do cristalino e dominar o surgimento da catarata nos indivíduos.
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Impacto de marcadores genéticos no fenótipo de rigidez arterial em uma população geral / Impact of genetic markers on arterial stiffness phenotype in a general population

Alvim, Rafael de Oliveira 07 August 2012 (has links)
Introdução: A rigidez arterial é um fenômeno complexo caracterizado pela diminuição da complacência vascular frente aos estímulos fisiológicos e patológicos. Semelhantemente a outros fenótipos cardiovasculares, a etiologia da rigidez arterial é modulada por fatores ambientais e genéticos. Levando em consideração a moderada herdabilidade e a característica poligênica do presente fenótipo, torna-se interessante a investigação de marcadores genéticos referentes aos diferentes sistemas envolvidos no remodelamento vascular. Objetivo: Avaliar o impacto dos polimorfismos C242T da subunidade p22phox da NADPH oxidase, G1036C da TXNIP, C609T/T471C da APOE, G1355A da elastina, I/D da ECA e A855G da MMP-9 no fenótipo de rigidez arterial em uma população geral. Métodos: Participaram do estudo 1.663 indivíduos da população geral da cidade de Vitória-ES. O DNA foi extraído a partir de uma amostra de sangue venoso. Posteriormente foram realizadas as genotipagens para as variantes genéticas supracitadas. A rigidez arterial foi avaliada por meio do método da velocidade de onda de pulso (VOP). Resultados: Em relação à VOP, os polimorfismos C242T da subunidade p22phox da NADPH oxidase e G1036C da TXNIP foram signifcativamente associados. Os indivíduos portadores do genótipo TT do polimorfismo C242T da subunidade p22phox (CC+TC=9,8 m/s versus TT=10,1 m/s, p=0,02) e do alelo G do polimorfismo G1036C da TXNIP (CC=9,8 m/s versus CG+GG=10,0 m/s, p=0,03) apresentaram maiores valores da VOP. Entretanto os polimorfismos C609T/T471C da APOE (2=10,0 m/s, 3=9,8 m/s, 4=9,8 m/s, p=0,60), G1355A da elastina (AA=9,8 m/s, GA=9,9 m/s, GG=9,8 m/s, p=0,92), I/D da ECA (DD=9,8 m/s, DI=9,8 m/s, II=9,9 m/s, p=0,53) e A855G da MMP-9 (AA=9,8 m/s, GA=9,8 m/s, GG= 9,8 m/s, p=0,60) não demonstraram tal associação. Somente o genótipo TT do polimorfismo C242T da subunidade p22phox (OR=1,93, p=0,002) apresentou um risco significativamente aumentado para o fenótipo de rigidez arterial. Já os polimorfismos G1036C da TXNIP (OR=1,19, p=0,19), C609T/T471C da APOE (OR=1,14, p=0,33), G1355A da elastina (OR=0,81, p=0,28), I/D da ECA (OR=0,91, p=0,48) e A855G da MMP-9 (OR=1,01, p=0,95) não apresentaram risco. Conclusão: Os polimorfismos C242T da subunidade p22phox da NADPH oxidase e G1036C da TXNIP podem contribuir como moduladores genéticos no enrijecimento vascular / Introduction: Arterial stiffness is a complex phenomenon characterized by decreased vascular compliance during physiological and pathological stimuli. Similar to other cardiovascular phenotypes, arterial stiffness etiology is modulated by environmental and genetic factors. Considering the moderate heritability and its polygenic phenotype, genetic markers investigations related to different systems involved in vascular remodeling are interesting. Objectives: To assess the impact of the p22phox C242T, TXNIP G1036C, APOE C609T/T471C, elastin G1355A, ACE I/D and MMP-9 A855G polymorphisms on arterial stiffness phenotype in a general population. Methods: This study included 1,663 individuals of the general population from Vitória-ES. DNA was extracted from a venous blood sample and genotyping assays were performed for the genetic variants described above. Arterial stiffness was evaluated by pulse wave velocity (PWV). Results: Regarding PWV, p22phox C242T and TXNIP G1036C polymorphisms were significantly associated. Individuals carrying TT genotype of the p22phox C242T (CC + CT vs TT = 9.8 m/s = 10.1 m/s, p = 0.02) and individuals carrying G allele of the TXNIP G1036C polymorphisms (CG + CC = 9.8 m/s vs GG = 10.0 m/s, p = 0.03) had higher PWV values. However, APOE C609T/T471C (2=10.0 m/s, 3=9.8 m/s, 4=9.8 m/s, p=0.60), elastin G1355A (AA=9.8 m/s, GA=9.9 m/s, GG=9.8 m/s, p=0.92), ACE I/D (DD=9.8 m/s, DI=9.8 m/s, II=9.9 m/s, p=0.53) and MMP-9 A855G (AA=9.8 m/s, GA=9.8 m/s, GG= 9.8 m/s, p=0.60) polymorphisms did not present association. Only the TT genotype of the p22phox C242T polymorphism (OR = 1.93, p = 0.002) presented an increased risk for the arterial stiffness phenotype. Already TXNIP G1036C (OR=1.19, p=0.19), APOE C609T/T471C (OR=1.14, p=0.33), elastin G1355A (OR=0.81, p=0.28), ACE I/D (OR=0.91, p=0.48) and MMP-9 A855G (OR=1.01, p=0.95) polymorphisms did not present risk. Conclusion: The p22phox C242T and the TXNIP G1036C polymorphisms may contribute to genetic modulators in vascular stiffening
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Diversidade, relações filogenéticas e taxonomia de Phytomonas spp. / Diversity, phylogenetic relationships and taxonomy of Phytomonas spp.

Zanetti, Andernice dos Santos 03 July 2015 (has links)
O gênero Phytomonas compreende parasitas cosmopolitas de plantas transmitidos por hemípteros. Não há estudos recentes sobre a taxonomia de Phytomonas e apenas duas espécies foram filogeneticamente validadas: P. serpens e P. françai. Até o momento 6 - 11 grupos (A-K) constituem esse gênero, dependendo do marcador molecular. O principal objetivo deste estudo foi caracterizar uma grande amostragem de isolados de Phytomonas de plantas e hemípteros com inferências filogenéticas de sequências de SSUrDNA, gGAPDH e ITSrDNA. Foi confirmado a subdivisão em 7 clados: Grupo A - 59 isolados de látex e insetos (Coreidae) de diferentes países. Grupo B - 7 isolados de látex e insetos (Scutelleridae e Pentatomidae) do Brasil e Suriname. Grupo C - 4 isolados de látex da Espanha. Grupo D - 11 isolados de Euphorbiaceae e Coreidae de diferentes países. Grupo E - 16 isolados de Solanaceae e Pentatomidae do Brasil. Grupo F - restrito a P. françai do Brasil. Grupo H - isolados de floema da América do Sul. Os resultados permitiram identificar candidatos a novas espécies de Phytomonas. / The Phytomonas genus is comprised by cosmopolitan plant´s parasites and is transmitted by Hemiptera. There are no recent studies based on the taxonomy of Phytomonas and only two species were phylogenetically validated: P. serpens and P. françai. To date this genus is constitute by 6 - 11 groups (A-K), depending on the molecular marker. The aim of this study was to characterize large samples of Phytomonas isolated from plants and Hemiptera throught phylogenetic inferences sequences SSUrDNA, gGAPDH and ITSrDNA. 7 Subclades was confirmed: Group A - 59 isolates of latex and insects (Coreidae) from different countries. Group B - 7 isolates of latex and insects (Scutelleridae and Pentatomidae) from Brazil and Suriname. Group C - 4 isolates of Spain latex. Group D - 11 isolates of Euphorbiaceae and Coreidae from different countries. Group E - 16 isolates of Solanaceae and Pentatomidae from Brazil. Group F - restricted to Brazilian P. françai isolates. Group H - Isolates of phloem from South America. Our results shown possible candidates for new species of Phytomonas.
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Estudo de alterações moleculares no gene da Glucoquinase (GCK) associado ao diagnóstico de diabetes do adulto de início no jovem (Maturity Onset Diabetes of the Young - MODY) em gestantes e neonatos / Study of molecular changes in the Glucokinase gene (GCK) associate with the diagnosis of Maturity Onset Diabetes of the Young ( MODY) in pregnant women and newborns

Lépore, Carolina Serri 16 September 2016 (has links)
Introdução: Diabetes Mellitus é a alteração metabólica mais comum na gestação, com prevalência variável de acordo com a população e métodos diagnósticos. Diabetes monogenética ou Diabetes do adulto de início no jovem (Maturity-Onset Diabetes of the Young - MODY) consiste em um subtipo ocasionado por defeito primário na secreção de insulina determinado por herança autossômica dominante, sendo responsável por aproximadamente 1 a 2% dos casos. O diagnóstico genético de gestantes e neonatos acometidos pode propiciar manejo específico, possibilitando melhor prognóstico evolutivo da doença em curto e longo prazo. Objetivos: Analisar alterações moleculares do gene GCK em gestantes com diagnóstico de Diabetes Mellitus e seus neonatos. Metodologia: Estudo transversal, com amostragem consecutiva, sendo incluídas gestantes diabéticas em seguimento no Ambulatório de Endocrinopatias em Obstetrícia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, no período de agosto de 2013 a dezembro de 2015. Amostras sanguíneas maternas e de cordão umbilical foram colhidas no momento do parto e enviadas para extração de DNA e reação em cadeia de polimerase (PCR) para identificação de alterações moleculares no gene GCK. Resultados: Foram encontrados duas mutações que geraram dois polimorfismos no gene da glucoquinase, respectivamente em 13 e em sete pacientes; e uma mutação deletéria que cursou com diagnóstico de MODY GCK em dois pacientes (uma amostra materna e uma de neonato), totalizando alterações em 10,6% dos pacientes. Este diagnóstico permitirá intervenções profiláticas e terapêuticas, interferindo beneficamente na evolução natural da doença. / ntroduction: Diabetes mellitus is the most common metabolic disorder in pregnancy, with prevalence varying according to the population and diagnostic methods. Monogenetic diabetes or Maturity - Onset Diabetes of the Young (MODY) consists of a subtype caused by primary defect in insulin secretion, which is determined by autosomal dominant inheritance and it is responsible for approximately 1-2 % of cases. Genetic diagnosis of affected pregnant women and newborns can provide specific management enabling better evolutionary prognosis of the disease in short and long term. Objectives: To analyze the molecular changes in the GCK gene in pregnant women diagnosed with Diabetes Mellitus and their neonates. Methods: Cross-sectional study with consecutive sampling, that included diabetic pregnant women in follow-up at the Clinical Hospital of the Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, from August 2014 to December 2015. Maternal and umbilical cord blood samples was collected at time of delivery and sent for DNA extraction and polymerase chain reaction (PCR) to identify molecular changes in the GCK gene. Results: We found mutations that generated two different polymorphisms in the glucokinase gene, one in 13 patients, and the other in seven patients; and a deleterious mutation that was diagnosed with MODY GCK in two patients (a maternal sample and in a neonate), resulting in change in 10,6% of the patients. This diagnosis will determine prophylactic and therapeutic interventions interfering beneficially in the natural evolution of the disease.
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Marcadores moleculares GST e CYP relacionados com fatores clínicos em câncer de mama

Santos, Stéphanie Piacenti dos 08 November 2016 (has links)
Submitted by Suzana Dias (suzana.dias@famerp.br) on 2018-10-19T18:22:34Z No. of bitstreams: 1 StephaniePiacentidosSantos_dissert.pdf: 499357 bytes, checksum: e7f6872448bfb8c9bb786b4bd30f9c94 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-19T18:22:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 StephaniePiacentidosSantos_dissert.pdf: 499357 bytes, checksum: e7f6872448bfb8c9bb786b4bd30f9c94 (MD5) Previous issue date: 2016-11-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Breast cancer is a leading cause of death in women worldwide. The etiology of this disease is multifactorial, including factors such as habits and lifestyle, hormonal, environmental and genetic. The xenobiotic metabolism contribute to the development of breast carcinoma and polymorphisms in genes encoding enzymes in this pathway, such as GST (GSTM1 and GSTT1) and CYPs (CYP1A1*2A and CYP1A1*2C) have been associated to breast cancer. Objectives: To investigate the influence of the GSTM1, GSTT1, CYP1A1*2A and CYP1A1*2C polymorphisms at the risk for developing breast cancer; to evaluate the association of polymorphisms and risk factors (age, smoking, alcohol, clinical features), tumor clinical and histopathologic features in breast cancer. Methods: This case-control study included 752 women, 219 patients and 533 controls. Molecular analysis were performed by PCR-multiplex (GSTM1 null and GSTT1 null), PCR-RFLP (CYP1A1*2A) and real-time PCR (CYP1A1*2C). For the statistical analysis, the MINITAB 16.0 (Multiple Logistic Regression Test), SNPstats (Inheritance Model tests) and BioEstat 5.0 (Hardy-Weinberg test) tests were used. Results: Women with old age and the alcohol consumption had increased risk for developing breast cancer. Women with breast cancer had slightly higher frequency (51%) of the GSTM1 null genotype than women without cancer (49%), however this difference was not significant statistically. GSTT1 null genotype was also not associated with breast cancer. CYP1A1*2A polymorphism was associated with the risk for breast cancer and CYP1A1*2C polymorphism was more frequent in tumors with no distant metastases. Conclusions: Women with age advanced and who drink alcohol present increased risk for developing breast cancer. CYP1A1*2A polymorphism is associated with breast cancer and CYP1A1*2C polymorphism is related to women with no distant metastases. The polymorphisms of the GSTM1 and GSTT1 genes are not associated with the development of breast cancer. / O câncer de mama é uma das principais causas de morte em mulheres no mundo. A etiologia desta doença é multifatorial e inclui fatores como hábitos, estilo de vida, hormonais, ambientais e genéticos. O metabolismo de xenobióticos contribui para o desenvolvimento do carcinoma mamário, e polimorfismos nos genes que codificam enzimas desta via, tais como GSTs (GSTM1 e GSTT1) e CYPs (CYP1A1*2A e CYP1A1*2C) têm sido associados ao câncer de mama. Objetivos: Investigar a influência dos polimorfismos GSTM1, GSTT1, CYP1A1*2A e CYP1A1*2C no risco de desenvolvimento de câncer de mama; avaliar a associação dos polimorfismos e fatores de risco (idade, fumo, álcool, características clínicas) no câncer de mama, assim como características clínicas e histopatológicas do tumor. Casuística e Métodos: O presente estudo caso-controle incluiu 752 mulheres, 219 pacientes e 533 controles. Para análise molecular foram realizadas as técnicas de PCR-Multiplex (GSTM1 e GSTT1), PCR-RFLP (CYP1A1*2A) e PCR em tempo real (CYP1A1*2C). Para a análise estatística foram utilizados os programas MINITAB 16.0 (teste de Regressão Logística Múltipla), SNPstats (testes de Modelos de Herança) e BioEstat 5.0 (teste de Equílibrio de Hardy-Weinberg). Resultados: Mulheres com idade avançada e com o hábito etilista apresentaram risco aumentado para o desenvolvimento de câncer de mama. Mulheres com carcinoma mamário apresentaram frequência discretamente maior (51%) do genótipo nulo GSTM1 em relação a mulheres sem câncer (49%), no entanto essa diferença não foi estatisticamente significante. O genótipo nulo de GSTT1 também não foi associado ao câncer de mama. O polimorfismo CYP1A1*2A foi associado ao risco para câncer de mama e o polimorfismo CYP1A1*2C foi mais frequente em tumores com ausência de metástase à distância. Conclusões: Mulheres com idade avançada e que ingerem bebida alcoólica apresentam risco aumentado para desenvolver câncer de mama. O polimorfismo CYP1A1*2A está associado ao câncer de mama e o polimorfismo CYP1A1*2C está relacionado às mulheres com ausência de metástase à distância. Os polimorfismos dos genes GSTM1 e GSTT1 não apresentam associação com o desenvolvimento do câncer de mama.

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