Made available in DSpace on 2016-06-02T19:26:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LAGANARO_Natasha_2013.pdf: 2207723 bytes, checksum: bd1833cc54fbd66fa459a656658c85e9 (MD5) Previous issue date: 2013-04-05 / Financiadora de Estudos e Projetos / Nos últimos tempos, muitas espécies entraram na lista de ameaça, tendo seu tamanho populacional reduzido ao ponto de se considerar que a melhor estratégia para sua conservação é a ex situ. A família Cracidae (Aves, Galliformes) é composta por 50 espécies, das quais 24 encontram-se em algum grau de ameaça. As populações trazidas para o cativeiro, no entanto, são compostas por um número pequeno de fundadores, estando sujeitas a endocruzamentos, deriva genética e efeitos fundadores. Assim, um dos grandes desafios para a reprodução é se amenizar essa perda, a longo prazo, da diversidade alélica e heterozigose. O manejo genético pode auxiliar propondo melhores acasalamentos, de maneira a maximizar os valores de heterozigose e preservar a riqueza alélica. No entanto, ao se propor essas análises os resultados não podem ser comparados, na maioria dos casos, com o cenário natural, simplesmente por não se haverem amostras dessas populações. Para o mutum-de-penacho há uma população originária da região da Usina Hidroelétrica de Porto Primavera que foi resgatada e trazida para o cativeiro da CESP Paraibuna. O objetivo desse trabalho foi analisar sua variabilidade genética e comparar com uma população já existente em cativeiro da mesma espécies e com dados da literatura para demais cracídeos ameaçados. Foram genotipados e analisados 64 C. fasciolata, sendo 50 da CESP e 14 do CCC Poços de Caldas, por meio de 10 loci de microssatélites. Os resultados demonstraram que não há diferença significativa entre a riqueza alélica e a heterozigose esperada da população natural com a mantida em cativeiro e com duas outras espécies de cracídeos ameaçados, bem como com demais espécies ameaçadas, sugerindo uma variação genética abaixo do desejável para se alcançar os objetivos proposto pela estratégia de conservação ex situ. Tabelas comparativas com valores de heterozigose e riqueza alélica para as matrizes de Porto Primavera e sua prole nascida em cativeiro demostraram que não houve perda de alelos nas gerações, indicando ausência de endocruzamento e deriva. Tabelas de pareamento e rankings indicam as relações de parentesco e níveis de variabilidade genética para cada indivíduos analisado, apontando melhores pareamentos dentro de criatórios e indivíduos aptos para reintrodução. / Nos últimos tempos, muitas espécies entraram na lista de ameaça, tendo seu tamanho populacional reduzido ao ponto de se considerar que a melhor estratégia para sua conservação é a ex situ. A família Cracidae (Aves, Galliformes) é composta por 50 espécies, das quais 24 encontram-se em algum grau de ameaça. As populações trazidas para o cativeiro, no entanto, são compostas por um número pequeno de fundadores, estando sujeitas a endocruzamentos, deriva genética e efeitos fundadores. Assim, um dos grandes desafios para a reprodução é se amenizar essa perda, a longo prazo, da diversidade alélica e heterozigose. O manejo genético pode auxiliar propondo melhores acasalamentos, de maneira a maximizar os valores de heterozigose e preservar a riqueza alélica. No entanto, ao se propor essas análises os resultados não podem ser comparados, na maioria dos casos, com o cenário natural, simplesmente por não se haverem amostras dessas populações. Para o mutum-de-penacho há uma população originária da região da Usina Hidroelétrica de Porto Primavera que foi resgatada e trazida para o cativeiro da CESP Paraibuna. O objetivo desse trabalho foi analisar sua variabilidade genética e comparar com uma população já existente em cativeiro da mesma espécies e com dados da literatura para demais cracídeos ameaçados. Foram genotipados e analisados 64 C. fasciolata, sendo 50 da CESP e 14 do CCC Poços de Caldas, por meio de 10 loci de microssatélites. Os resultados demonstraram que não há diferença significativa entre a riqueza alélica e a heterozigose esperada da população natural com a mantida em cativeiro e com duas outras espécies de cracídeos ameaçados, bem como com demais espécies ameaçadas, sugerindo uma variação genética abaixo do desejável para se alcançar os objetivos proposto pela estratégia de conservação ex situ. Tabelas comparativas com valores de heterozigose e riqueza alélica para as matrizes de Porto Primavera e sua prole nascida em cativeiro demostraram que não houve perda de alelos nas gerações, indicando ausência de endocruzamento e deriva. Tabelas de pareamento e rankings indicam as relações de parentesco e níveis de variabilidade genética para cada indivíduos analisado, apontando melhores pareamentos dentro de criatórios e indivíduos aptos para reintrodução.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 970.pdf: 592712 bytes, checksum: e6f35685131e115d74ca1fd6ef27e678 (MD5) Previous issue date: 2006-02-22 / Universidade Federal de Minas Gerais / "Curimbatá-pióa ", Prochilodus costatus (Valenciennes, 1850), is an endemic species from São Francisco river basin, with migratory habits, with important ecological role and of fishing importance. The present study aimed to assess the genetic variation in Prochilodus costatus in order to verify the occurrence of population genetic structure and to produce knowledge that contributes to the conservation of the species. Genetic variation was studied at three sites downstream of the Três Marias dam (MG) through six specific microsatellites loci, isolated and characterized in this study. The loci were amplified through PCR (polymerase chain reaction) and the individuals were genotyped in an automated sequencer. The statistical analyses were accomplished through the softwares GENEPOP 3.3 and FSTAT 2.9.3.2. Fish from the three sites had quite similar genetic diversity levels and they did not show genetic differentiation to each other, suggesting that P. costatus might represent a single reproductive unit in the high-middle São Francisco River. These findings are comparable to those previously obtained in the sister-species P. argenteus and should be important for futures management plans that seek the conservation of this species. / O curimbatá-pióa , Prochilodus costatus (Valenciennes, 1850), é uma espécie endêmica da bacia do Rio São Francisco, de hábitos migratórios, de importante função ecológica e importância pesqueira. O presente estudo propôs-se a estudar a variação genética em Prochilodus costatus para verificar a ocorrência de estruturação genética populacional e produzir conhecimentos que contribuam para a conservação da espécie. A variação genética foi estudada em três localidades à jusante da barragem de Três Marias (MG), utilizando-se seis loci de microssatélites específicos, isolados e caracterizados neste trabalho. Os loci foram amplificados via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) e os indivíduos genotipados em seqüenciador automático. As análises estatísticas foram realizadas através dos programas computacionais GENEPOP 3.3 e FSTAT 2.9.3.2. Os peixes das três localidades apresentaram níveis de diversidade genética bastante similares, e não apresentaram diferenciação genética entre si, sugerindo que P. costatus possa representar uma simples unidade reprodutiva na região do alto-médio Rio São Francisco. Esses achados são comparáveis ao observado em estudos prévios na espécie-irmã P. argenteus e devem ser importantes para futuros planos de manejo que visem à conservação dessa espécie.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-02-21T12:40:45Z No. of bitstreams: 1 PGPV15MA182.pdf: 576083 bytes, checksum: 30203f1600225b3bef1ac5a58e2caece (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-21T12:40:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV15MA182.pdf: 576083 bytes, checksum: 30203f1600225b3bef1ac5a58e2caece (MD5) Previous issue date: 2015-09-30 / Embrapa / To continue moving forward in terms of getting new wheat cultivars, more productive and more stable, it is necessary to increase the genetic variability made available to the breeder and increase the frequency of favorable alleles in new cultivars. As a contribution to these goals it studied the selection of parents possessing combining ability and superior genetic potential. In this sense the work was divided into two chapters. The first objective was to evaluate the performance of the parent wheat using multivariate techniques in order to obtain genotypes that approximate a ideotype. 16 genotypes were sown. Four commercial cultivars (BRS 331, CD 124, BRS Parrudo and Marfim). Six F1 hybrids obtained by artificial crosses between cultivars, forming a complete diallel without reciprocals. Six progenies of these crossings in the F2 generation. The treatments were arranged in a randomized complete block design with three replications. Were measured in all plants of the plots, five phenotypic variables: days from emergence to heading, plant height, peduncle length, number of ears per plant and grain yield per plant. Through multivariate contrasts, there were comparisons of interest which were significant. Standardized canonical coefficients were used to determine the importance of each variable on the significance of employed to Mahalanobis distance as dissimilarity measure contrasts. Among the evaluated intersections BRS 331 x CD 124 and BRS Parrudo x Marfim show the greatest genetic variability and Marfim x CD 124 does not have genetic dissimilarity to the set of characters studied. Cross only elite genotypes is not recommended for the provision of genetic variability. In the second chapter the objectives of this study were: i) estimate general and specific combining abilities through diallel analysis in order to identify crossings most likely to generate segregating populations with superior performance; ii) verify the existence of reciprocal effect on the evaluated hibrids. Were evaluated four varieties, Marfim, BRS Parrudo, BRS 331 and CD 124, using the the method 1 (p2 all combinations with reciprocal) of Griffing (1956). Five phenotypic variables were observed. Days from emergence to heading (DEE). Plant height (EST), measured in centimeters from the ground to the top of the ear, without considering the awn. Peduncle length (PED), measured in centimeters, distance from the last internode to the base of the main stem spike. Number of ears per plant (NEP), counting the spikes that formed grains. Grain yield per plant (MGP), measured in grams. They were estimated the general combining ability (GCA), specific combining ability (SCA) and the reciprocol effects (REC) of the traits of interest. The following conclusions were obtained: a) the assessed parents are contrasting and there is genetic variability for the studied characters; b) is greater the importance of the GCC and additive effects in the genetic control of observed variables, c) the effect of CGC's parent Marfim is increased NEP and MGP, the BRS Parrudo is to increase DEE, CD 124 is to decrease DEE, the BRS 331 is to reduce all traits; e) the CD 124 x BRS 331 crossing has reciprocal effect increasing DEE when CD 124 is used as a female / Para continuar avançando em termos de obtenção de novos cultivares de trigo, mais produtivos e mais estáveis, torna-se necessário aumentar a variabilidade genética posta à disposição do melhorista e aumentar a frequência de alelos favoráveis nas novas cultivares. Como forma de contribuir para estes objetivos foi estudada a seleção de genitores que possuam capacidade combinatória e potencial genético superior. Nesse sentido o trabalho foi dividido em dois capítulos. No primeiro o objetivo foi avaliar o desempenho de genitores em trigo através de técnicas multivariadas com o intuito de obter genótipos que se aproximem de um ideotipo. Foram semeados 16 genótipos. Quatro cultivares comerciais (BRS 331, CD 124, BRS Parrudo e Marfim). Seis híbridos F1 obtidos por cruzamentos artificiais entre os cultivares, formando um dialelo completo, sem os recíprocos. Seis progênies destes cruzamentos na geração F2. Os tratamentos foram dispostos em blocos completos casualizados, com três repetições. Foram mensuradas, em todas as plantas das parcelas, cinco variáveis fenotípicas: dias da emergência ao espigamento, estatura da planta, comprimento do pedúnculo, número de espigas por planta e massa de grãos por planta. Através de contrastes multivariados, verificaram-se quais comparações de interesse foram significativas. Foram utilizados coeficientes canônicos padronizados para determinar a importância de cada variável na significância dos contrastes Empregou-se a distância generalizada de mahalanobis como medida de dissimilaridade. Entre os cruzamentos avaliados BRS 331 x CD 124 e BRS Parrudo x Marfim apresentam a maior variabilidade genética e Marfim x CD 124 não apresentam dissimilaridade genética para o conjunto de caracteres estudados. O cruzamento apenas de genótipos elite não é recomendado para a disponibilização de variabilidade genética. No segundo capítulo os objetivos deste trabalho foram: i) estimar capacidades gerais e específicas de combinação através de análise dialélica com o intuito de identificar cruzamentos com maior possibilidade de gerar populações segregantes com desempenho superior; ii) verificar a existência de efeito recíproco nos cruzamentos avaliados. Foram avaliados quatro cultivares, Marfim, BRS Parrudo, BRS 331 e CD 124, utilizando-se o o método 1 (todas as p2 combinações com os recíprocos) de Griffing (1956). Foram observadas cinco variáveis fenotípicas. Dias da emergência ao espigamento (DEE). Estatura da planta (EST), medida em centímetros, do solo até o topo da espiga, sem considerar as aristas. Comprimento do pedúnculo (PED), medido em centímetros, distância do último entrenó até a base da espiga do colmo principal. Número de espigas por planta (NEP), contagem das espigas que formaram grãos. Massa de grãos por planta (MGP), medido em gramas. Foram estimadas a capacidade geral de combinação (CGC), a capacidade específica de combinação (CEC) e o efeito recíproco (REC) dos caracteres de interesse. Foram obtidas as seguintes conclusões: a) os genitores avaliados são contrastantes e existe variabilidade genética para os caracteres estudados; b) é maior a importância da CGC e dos efeitos aditivos no controle genético das variáveis observadas, c) o efeito da CGC do genitor Marfim é de aumento do NEP e MGP, do BRS Parrudo é de aumentar DEE, do CD 124 é de diminuir DEE, do BRS 331 é de diminuir todos os caracteres avaliados; d) o cruzamento CD 124 x BRS 331 apresenta efeito recíproco diminuindo DEE quando CD 124 é utilizado como fêmea

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 641792 bytes, checksum: 5b73a305694f3136938c6879fccae0e8 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste estudo foram (i) identificar linhagens de milho-pipoca eficientes no uso de nitrogênio; (ii) avaliar a diversidade genética entre linhagens de milhopipoca em alto e baixo N; (iii) investigar os efeitos causais de vários caracteres sobre a eficiência no uso de nitrogênio (NUE) e (iv) identificar marcadores SSR associados com caracteres relacionados à NUE. Foram avaliadas 25 linhagens-elite de milhopipoca pertencentes às populações 'Viçosa' e 'Beija-Flor', em alto e baixo N. Foram mensurados os seguintes caracteres: crescimento diário (DG, cm), massa de parte aérea (SDW, mg), de raiz (RDW, mg), e da planta total seca (TDW, mg), razão parte aérea:raiz seca (RSR), eficiência no uso (NUE, mg mg-¹), na absorção (NUpE, mg mg-¹) e na utilização (NUtE, mg mg-¹) de nitrogênio, diâmetro médio (RAD, mm), comprimento total (TRL, cm), área superficial (RSA, cm²) e volume (RV, cm³) de raízes. Foram identificadas linhagens eficientes em cada nível de N. A avaliação da diversidade genética pelo método de agrupamento UPGMA baseado no quadrado da Distância Euclidiana Média resultou em quatro grupos de linhagens para cada nível de N e a análise de componentes principais mostrou que as linhagens poderiam ser agrupadas predominantemente pelos seus caracteres de parte aérea. A eficiência na absorção de N (NUpE) foi a característica mais importante para a NUE em estádios precoces de desenvolvimento da planta em ambos os níveis de N, por apresentar alta correlação e alto efeito direto sobre a variável principal (NUE) na análise de trilha. Em baixo N, a eficiência na utilização de N (NUtE) também apresentou alta correlação e alto efeito direto sobre a variável NUE, mostrando ser uma característica importante para esta condição nesses estádios. Contudo, a seleção direta ainda parece ser o melhor método para aumentar a eficiência de seleção para NUE em estádios precoces. Três marcadores SSR foram validados como associados com os caracteres relacionados à NUE pela análise de mapeamento associativo baseada em ANOVA. / The objectives of this study were to (i) identify efficient inbred lines in nitrogen use; (ii) assess the genetic diversity among popcorn inbred lines under high and low N; (iii) investigate the causal effects of several traits in nitrogen use efficiency (NUE) and (iv) identify SSR markers associated with the traits related to NUE. Twenty-five elite popcorn inbred lines belonging to the 'Viçosa' and 'Beija-Flor' populations were evaluated under high and low N. The following traits were assessed: daily growth (DG, cm), shoot dry weight (SDW, mg), root dry weight (RDW, mg), total plant dry weight (TDW, mg), root:shoot ratio (RSR), nitrogen use efficiency (NUE, mg mg-¹), nitrogen uptake efficiency (NUpE, mg mg-¹), nitrogen utilization efficiency (NUtE, mg mg-¹), root average diameter (RAD, mm), total root length (TRL, cm), root surface area (RSA, cm²) and root volume (RV, cm³). Efficient inbred lines were identified under each N level. The genetic diversity assessment using the UPGMA method based on the squared Mean Euclidean distance grouped the inbred lines into four clusters for each N level and the principal component analysis revealed that the inbred lines could be categorized predominantly by their shoot traits. Nitrogen uptake efficiency (NUpE) was the most important trait for NUE in the early stages of plant development under both N levels, due its high correlation with and high direct effect on NUE obtained in the path analysis. Under low N, nitrogen utilization efficiency (NUtE) also showed high correlation with and direct effect on NUE, demonstrating its importance in this N level in these early stages. Notwithstanding, the direct selection still seems to be the best method to increase the selection efficiency for NUE in these early stages. Furthermore, three SSR markers were identified as true associations with the traits related to NUE, through the association mapping analysis based on ANOVA.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA11MA074.pdf: 600385 bytes, checksum: a494ebf1016e78409c7b3c6a97f69783 (MD5) Previous issue date: 2011-08-12 / The Brazilian caipira chickens egg blue are the result of random mating between different chicken breeds found in Brazil with chickens Araucania, giving rise to Brazilian caipira chicken with characteristic blue eggs. It stands out for its hardiness, disease resistance. And d adverse weather conditions and diet. The disease resistance is related to genetic variability of immune system genes. The immune response of chickens to pathogens is triggered from the presentation of antigens of the effect or cells of the immune system. This action is made by antigen-present cells (B cells, macrophages and a small percentage of T cells) animals that have surface molecules (glycoprotein) in wich these antigens are complexes. These glycoproteins presenting antigens, molecules called Major Histocompatibility Comples (MHC or B complex) can be class I or II. The class II, which present exogenous antigens, are composed of two polypeptide chains, an α chain and a ß chain. The chain is monomorphic α chain and ß is very polymorphic and is considered responsible for encoding different MHC class II molecules inn chickens. This study aimed to investigate the genetic variability of two gene loci of the MHC class II, B-LßI and B-LßII in caipiras chickens Brazilian blue eggs by obtaining sequences of these two genes and thus detect B-Lß existing alleles for these genes in these birds. This work was initially developed with DNA samples from 100 caipiras chickens blue eggs that were amplified from the region of interest and analyzed. From this analysis, the animals were grouped according to the sequence of exon2. Then, 16 animals were (with at least one representative from each group) for the reaction of DNA amplification, cloning and sequencing. The sample were submitted to the initiators of the genes B-LßII. Of these 16 birds were obtained 15 different sequences that were aligned to the standard sequence the B-LB12major (AJ248676) for BLßII and B-LB12c (AJ248578) to B-LßI, being eleven sequences B-LßII and B-LßI four sequences. Of these eleven sequences of the gene B-LßII seven were already described in the literature and four sequences of the gene B-LßII seven were already described in the literature and four sequences are new is not described, the other four sequences of the gene B-LßI three had already been described in the literature and a new . The 15 nucleotide sequences were transformed into sequences of amino acids. In the amino acid sequences of the gene was observed that B-LßI remains much more conserved than gene B-LßII. Thus this paper presents the genetic variability at both the DNA and polypeptide chain, genes B-LßII caipira chickens in Brazil s blue eggs / As galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis são o resultado de cruzamentos aleatórios entre diversas raças de galinhas encontradas no Brasil com galinhas Araucanas, dando origem a uma galinha caipira brasileira com característica de ovos azuis. Destaca-se pela sua rusticidade, resistência a doenças e as condições adversas de clima e alimentação. A resistência a doenças esta relacionada à variabilidade genética dos genes do sistema imune. A resposta imune das galinhas a patógenos é desencadeada a partir da apresentação de antígenos as células efetoras do sistema imune. Esta ação é feita pelas células apresentadoras de antígenos (células B, macrófagos e uma pequena porcentagem de células T) dos animais que possuem moléculas de superfície (glicoproteínas) na qual são complexados estes antígenos. Estas glicoproteínas apresentadoras de antígenos, chamadas de moléculas do Complexo Maior de Histocompatibilidade (MHC ou Complexo B), podem ser de classe I ou de classe II. As de classe II, que apresentam antígenos exógenos, são formadas por duas cadeias polipeptídicas, uma cadeia α e uma cadeia β. A cadeia α é monomorfica e a cadeia β é bem polimórfica, e é considerada a responsável por codificar diferentes moléculas MHC classe II em galinhas. Este estudo teve como objetivo investigar a variabilidade genética em dois loci gênicos do MHC de classe II, B-LI e B-LII, em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis através da obtenção das sequências destes dois genes B-L e assim detectar os alelos existentes para estes genes nestas aves. Este trabalho foi desenvolvido inicialmente com amostras de DNA de 100 galinhas caipiras de ovos azuis que foram amplificadas para a região de interesse e analisadas. A partir desta análise, os animais foram agrupados de acordo com a sequência do exon 2. Depois, 16 animais foram selecionados (com pelo menos um representante de cada grupo) para a reação de amplificação do DNA, clonagem e sequenciamento. As amostras foram submetidas aos iniciadores dos genes B-LβI e B-LβII. Destas 16 aves obteve-se 15 diferentes sequências que foram alinhadas a sequência padrão B-LB12major (AJ248576) para o B-LβII e B-LB12c (AJ248578) para o B-LβI, sendo onze sequências B-LβII e quatro sequências B-LβI. Destas onze sequências do gene B-LβII sete já estavam descritas na literatura e quatro são sequências novas ainda não descritas, das outras quatro sequências do gene B-LβI três já haviam sido descritas na literatura e uma nova . As 15 sequências nucleotídicas encontradas foram deduzidas em sequências de aminoácidos. Nas sequências de aminoácidos foi observado que o gene B-LβI se mantém bem mais conservado do que o gene B-LβII. Assim, este trabalho apresenta a variabilidade genética dos genes B-LβI e BLβII tanto em nível de DNA quanto de cadeia polipeptídica, em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA11MA083.pdf: 3400558 bytes, checksum: fedbf896e2daef8109b07884eb122a44 (MD5) Previous issue date: 2011-03-03 / Brazilian Caipira chicken are hardy birds that, it is believed, show high genetic diversity. However, there is almost no scientific studies that prove the alleged high genetic variability of the Caipira chicken. Studies that investigate this issue are very important, because the scientific evidence of this polymorphism makes the maintenance and conservation of these animals essential. The gene polymorphism is fundamental to the perpetuation of the species, besides being a source of alleles for genetic improvement programs for livestock. The commercial birds, for example, have lost much of their genetic variability because they have been through strict selection processes. Even though these animals are highly productive, some features related to production still deserve the attention of breeders, such as disease resistance. Some brazilian (blue-egg Caipira) chicken. This coloration of the egg shell is characteristic of a South American breed of chickens that participated in the formation of the native caipira chicken. This study used fifteen microsatellite loci to assess the genetic variability of brazilian (blue egg caipira) chicken. The animals were from the city of Two Lajeados - RS. By PCR, the amplicons obtained using a primer labeled with fluorophores were genotyped in an automatic sequencer and the results analyzed using the statistical program ARLEQUIN. It was detected a total of 168 alleles with an average of 11.2 alleles per locus, 288 genotypes, HE = 0.76 and HO = 0.49. These results confirmed the suspicion of high genetic variability in brazilian (blue egg Caipira) chicken / Galinhas caipiras brasileiras são aves rústicas, que, acredita-se, apresentam elevada diversidade genética. Entretanto, quase não há trabalhos científicos que comprovem a suposta alta variabilidade genética das aves caipiras. Trabalhos que investiguem esta questão são muito importantes, pois a comprovação científica deste polimorfismo transforma a manutenção e conservação destes animais imprescindível. O polimorfismo gênico é fundamental para a perpetuação da espécie, além de ser fonte de alelos para programas de melhoramento genético de animais de produção. As aves comerciais, por exemplo, perderam muito de sua variabilidade gênica por terem passado por rigorosos processos de seleção. Mesmo que estes animais sejam altamente produtivos, algumas características relacionadas à produção ainda merecem atenção dos melhoristas, como é o caso da resistência a doenças. Algumas galinhas caipiras brasileiras colocam ovos azuis. Esta coloração da casca do ovo é característica de uma raça sul-americana de galinhas que participou da formação das aves caipiras nacionais. Este trabalho utilizou quinze loci de microssatélites para avaliar a variabilidade genética de galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis. Os animais foram provenientes do município de Dois Lajeados RS. Através da técnica da PCR, os amplicons obtidos com a utilização de iniciadores marcados com fluoróforos foram genotipados em seqüenciador automático e os resultados obtidos analisados através do programa estatístico ARLEQUIN. Foi detectado um total de 168 alelos, com média de 11,2 alelos por locus, 288 genótipos, HE=0,76 e HO=0,49. Estes resultados comprovaram a suspeita de alta variabilidade genética presente em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis

Estudar a diversidade genética, a adaptabilidade e estabilidade de genótipos de soja é de extrema importância para os programas de melhoramento genético, visto que a identificação de parentais é prejudicada pela estreita base genética da soja brasileira, além disso, a recomendação de cultivares para as diversas regiões brasileiras constituise em um dos principais desafios do melhoramento. Esta dissertação está subdividida em três capítulos, sendo que no primeiro realizou-se o referencial teórico da soja, importância econômica, melhoramento genético e ferrugem asiática. O segundo capítulo foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a divergência genética de genótipos de soja sob infecção natural por ferrugem. O experimento foi realizado na Fazenda Capim Branco da UFU, na safra 2016/17. Utilizaram-se 14 genótipos, sendo 10 linhagens desenvolvidas pelo Programa de Melhoramento Genético de Soja da UFU e 4 cultivares (UFUS 7415, UFUS Riqueza, TMG 801 e BRSGO 7560), em delineamento de blocos casualizados com três repetições. Concluiu-se que existe variabilidade genética para todos os caracteres agronômicos avaliados, com exceção de altura de inserção da primeira vagem e altura de planta na floração. As linhagens UFUS 1117-01, UFUS 1117-07, UFUS 1117-08, UFUS 1117-09, UFUS 1117-10 apresentaram resistência a Phakopsora pachyrhizi e foi identificado que os caracteres de altura de planta na maturidade, número de vagens chochas, número de dias para a maturidade e área abaixo da curva de progresso da doença foram os que mais contribuíram para a divergência genética. Algumas hibridações foram sugeridas objetivando a resistência à ferrugem asiática, em todos os cruzamentos a linhagem UFUS 1117-06 esteve presente. O terceiro capítulo refere-se ao estudo da adaptabilidade e estabilidade produtiva dos 14 genótipos de soja cultivados nas safras 2013/14, 2014/15, 2015/16, 2016/17. Foi possível concluir que a interação genótipos por ambientes é do tipo complexa para a produtividade de grãos. A linhagem UFUS 1117-01 foi identificada como sendo de alta estabilidade produtiva pelos métodos de Eberhart e Russel (1966), Wricke (1965), Additive Main Effects and Multiplicative Interaction (AMMI 1 e AMMI 2), e Centroide. O genótipo UFUS 1117-07 apresentou alta estabilidade pelos métodos Eberhart e Russel (1966), Wricke (1965), Lin e Binns 1988 modificado por Carneiro 1999 e ampla adaptabilidade por Eberhart e Russel e Centroide, já UFUS 1117-09 foi identificado como sendo adaptável a ambientes desfavoráveis por Lin e Binns modificado por Carneiro, AMMI1 e Centroide, enquanto que UFUS 1117-10 apresentou adaptabilidade a ambientes favoráveis pelos métodos AMMI1 e Centroide e alta estabilidade por Eberhart e Russel. / Studying a genetic diversity, adaptability and stability of soybean genotypes are of extreme importance for breeding programs, since the identification of parents is impaired by the narrow genetic base of Brazilian soybean, and a recommendation of cultivars for the different regions is one of the main challenges for improvement. This dissertation is subdivided into three chapters, the first is the theoretical reference of soy, economic importance, genetic breeding and Asian rust. The second chapter was developed with the objective of evaluating the genetic divergence of soybean genotypes under natural rust infection. The experiment was carried out at Fazenda Capim Branco, UFU, in the 2016/17 harvest. A total of 14 genotypes were used, including 10 lines developed by the UFU Soybean Breeding Program and four cultivars (UFUS 7415, UFUS Riqueza, TMG 801 and BRSGO 7560) in a randomized complete block design with three replicates. It was concluded that there is genetic variability for all agronomic traits, except for the height of the first pod and plant height at flowering. The lineages UFUS 1117-01, UFUS 1117-07, UFUS 1117-08, UFUS 1117-09, UFUS 1117-10 presented resistance to Phakopsora pachyrhizi and were identified in components of plant height at maturity, number of pods, number of days to maturity and area under disease progress curve they were the ones that contributed most to a genetic divergence. Hybridizations were suggested aiming the resistance to Asian rust, the strain UFUS 1117-06 was present in all crosses. The third chapter refers to the study of the adaptability and productive stability of the 14 soybean genotypes grown in the 2013/14, 2014/15, 2015/16, 2016/17 seasons. It was possible to conclude that the genotypesenvironments interaction is of a complex type for grain yield. UFUS 1117-01 lineage was identified as being of high stability produced by the methods of Eberhart and Russel (1966), Wricke (1965), Principal additive effects and multiplicative interaction (AMMI 1 and AMMI 2), and Centroid. UFUS 1117-07 genotype showed high stability by the methods Eberhart and Russel (1966), Wricke (1965), Lin and Binns 1988 modified by Carneiro 1999 and wide adaptability by Eberhart and Russel and Centroid. UFUS 1117-09 was identified as being adaptive to unfavorable environments by Lin and Binns modified by Carneiro, AMMI1 and Centroid, while UFUS 1117-10 presented adaptability to environments favorable to AMMI1 and Centroid and high stability by Eberhart and Russel. / Dissertação (Mestrado)

Orientador: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Janete Apparecida Desiderio Sena / Banca: Gislayne Fernandes Lemes Trindade Vilas-Bôas / Banca: Sérgio Antonio de Bortoli / Banca: Fernando Hercos Valicente / Resumo: O trabalho foi desenvolvido no Laboratório de Genética de Bactérias e Biotecnologia Aplicada (LGBBA) da FCAV-UNESP. Foram caracterizados geneticamente, por PCR, isolados de Bacillus thuringiensis, provenientes de três coleções brasileiras, quanto aos tipos de genes cry1, avaliando-se o efeito dos mesmos sobre uma população de Plutella xylostella caracterizando-se também os isolados de B. thuringiensis quanto à presença de enterotoxinas HBL, NHE e o regulador pleitrópico PLC, por verificação biomolecular, avaliando a variabilidade, bem como a estruturação genética de populações de B. thuringiensis, por PCR-RFLP. Verificou-se que existe uma distribuição homogênea das subclasses cry1 dentro do banco de isolados de B. thuringiensis, com maior porcentagem de isolados portadores dos genes cry1Ab (42,12%) e com menor porcentagem de representantes da subclasse cry1Db (0,6%). Nos bioensaios observou-se 100% de mortalidade para lagartas de P. xylostella com os isolados utilizados, indicando que combinações de tipos diferentes de genes cry1 apresentam ação tóxica para larvas de P. xylostella. Analisando a estrutura populacional de B. thuringiensis foram obtidos 78 haplótipos, definidos para as populações das diferentes coleções, e 76 haplótipos, definidos para as populações de diferentes regiões brasileiras, retratando a variabilidade genética para os loci hblA, plcR, nheBC e cry1 analisados. Segundo valores FSTs, de comparação duas a duas, diferenças significativas entre coleções e populações de B. thuringiensis provenientes das regiões brasileiras foram verificadas. Mesmo assim, alguns grupos formados são constituídos por uma população clonal de isolados da bactéria. / Abstract: The work was developed in the Laboratory of Bacterias' Genetics and Applied Biotechnology (LGBBA) at UNESP/ Jaboticabal Campus. There were genetically characterized, by PCR, isolates of B. thuringiensis, belonging to three Brazilian collections basead on cry1 gene content, evaluating their effects on Plutella xylostella. They were also characterized concerning their enterotoxins production such as HBL, NHE and the PLC virulence factor, using molecular techniques, so as to evaluate their gene diversities, as well as their population genetic, using the PCR-RFLP approach. It was observed a homogeneous distribution of the cry1 subclasses within B. thuringiensis strain collections studied, with bigger percentage of isolates showing the cry1Ab genes (42.12%) and with lower percentage of isolates for subclass cry1Db (0.6%). The bioassays have revealed 100% mortality to P. xylostella larvae meaning that the effectiveness of B. thuringiensis as a biological control agent does not depend at the cry genes content. When the B. thuringiensis population structure was considered, 78 haplotypes were defined for the strains contents of different collections and 76 haplotypes were defined for strains of different Brazilian regions, exhibiting the great genetic variability for hblA, plcR, nheBC and cry1 loci. According to the FSTs values for establish pair comparisons, significant differences among the B. thuringiensis collections and populations, were observed. Nevertheless some of the formed groups were considered as bacterial clonal population. / Doutor

Resumo: A construção da Usina Hidrelétrica Engenheiro Sergio Motta, na região do Pontal do Paranapanema, promoveu severos impactos aos ambientes naturais, especialmente sobre as comunidades florestais remanescentes. Com a finalidade de compensar a perda das espécies florestais na área de inundação do reservatório, desenvolveu-se por meio do convênio CESP - ESALQ/USP-IPEF, o Projeto Banco Ativo de Germoplasma (BAG), implantando-se em forma de teste de progênies, delineamento de blocos ao acaso, constituído por três repetições, contendo parcelas lineares de oito plantas de trinta progênies de cada uma das espécies eleitas para conservação. O presente estudo objetivou verificar o comportamento, variação genética e propor estratégia adequada de seleção para caracteres silviculturais de 32 espécies do Banco Ativo de Germoplasma de espécies de Floresta Estacional Semidecidual (BAG - SP), implantado em Rosana - SP e de 31 espécies conservadas no Banco Ativo de Germoplasma de espécies do Cerrado (BAG - MS), implantado em Anaurilândia - MS. Foram avaliados os caracteres DAP (diâmetro a altura do peito), altura e sobrevivência. Os resultados, obtidos por meio do programa estatístico SELEGEN-REML/BLUP, possibilitaram observar que o sistema de plantio adotado na implantação do Banco Ativo de Germoplasma da Floresta Estacional Semidecidual (BAG - SP) e do Banco Ativo de Germoplasma do Cerrado (BAG - MS), mostra-se promissor para as espécies que se encontram conservadas nestes. Aos 9,3 anos após o início da implantação o BAG - SP apresenta, em média, 67,5% de sobrevivência, DAP de 5,42 cm e 5,73 m de altura. Aos 8,3 anos após o início da implantação o BAG - MS apresenta, em média, 65% de sobrevivência, DAP de 7,51 cm e 5,79 m de altura. A variação genética presente nas populações que compõe o... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The construction of the Hydroeletric Power Plant Engenheiro Sergio Motta; in the region of Pontal do Paranapanema, caused severe impacts to natural environments, especially on the remaining forest communities. To compensate the loss of forest species in the floodplain of the reservoir, was developed, through the partnership CESP - ESALQ/ USP-IPEF, the Project Active Germplasm Bank (AGB), implemented in the form of a progeny test, designed random blocks, consisting of three replicates, containing linear parcels of eight plants from thirty progenies of each one of the elected species for conservation. This work aimed to study the genectic variation for the silvicultural characters of 32 species from the Active Germplasm Bank of species of Semideciduous Seasonal Forest (AGB - SP), implemented in Rosana - SP and 31 species conserved in the Active Germplasm Bank of Cerrado species (AGB-MS), implemented in Anaurilândia - MS. Were evaluated the DBH (diameter at breast height), height and survival. The results obtained through the statistical program SELEGEN-REML/BLUP, allowed to observe that the plantation system adopted in the implementation of the Active Germplasm Bank of the Semideciduous Seasonal Forest (AGB-SP) and the Active Germplasm Bank of Cerrado (AGB-MS) shows promise for the species that are conserved in these. At 9.3 years after the beginning of the implementation, the AGB - SP showed 67.5% of survival, DBH of 5.42 cm and 5.73 m of height and the AGB-MS, at 8.3 years after the beginning of the implementation showed 65% of survival, DBH of 7.51cm and 5.79 m of height. The genetic variation present in populations that make up the AGBSP and AGB-MS validates the ex situ conservation program that was proposed and enables the development of an improving program for these species, in order to produce improved seeds. The strategy... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Marcos Deon Vilela de Resende / Banca: Marco Eustaquio de Sa / Banca: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Flávio Bertin Gandara / Banca: Reginaldo Brito da Costa / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-08-31Bitstream added on 2014-06-13T18:39:35Z : No. of bitstreams: 1 souza_cs_me_ilha.pdf: 372222 bytes, checksum: a23d8dffc9394536874e4aba2dd0153a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O Eucalyptus urophylla destaca-se pelo potencial de utilização de sua madeira, pela sua plasticidade de adaptação a diferentes condições ambientais brasileiras e por ser tolerante ao cancro do eucalipto (Cryphonectria cubensis). A utilização de sementes melhoradas se faz necessária, considerando o iminente déficit florestal que começou no Brasil, a partir de 2004, em função da demanda por madeira ser maior que a sua oferta. Entretanto, o melhoramento dessa espécie, no Brasil, depende da existência de variabilidade genética das populações introduzidas, a qual evita a ocorrência de depressão endogâmica. O presente trabalho visa o estudo genético de uma população base de E. urophylla, originária de Flores e Timor, e instalada em Selvíria-MS. Estudou - se a variabilidade genética dessa população através de análises quantitativas. Dessa forma, os objetivos específicos do estudo foram: a) estimar a variabilidade genética para os principais caracteres silviculturais; b) estimar possíveis ganhos na seleção, utilizando-se da seleção entre e dentro de progênies e do Índice Multi-efeitos, analisando o efeito do desbaste em uma população base de E. urophylla. O experimento foi instalado em 17 de março de 1992, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia, Campus de Ilha Solteira (FE/UNESP), localizada no município de Selvíria – MS. O teste de progênies foi instalado obedecendo a um delineamento experimental em Látice 8x8, quíntuplo, parcialmente balanceado, com 64 progênies provenientes da Estação Experimental do Instituto de Pesquisas e Estudos Florestais (IPEF/ESALQ/USP), localizada no município de Anhembi – S.P. As parcelas contêm oito árvores, no espaçamento de 3,0 x 3,0 metros. Os caracteres quantitativos avaliados e analisados foram: 1- diâmetro à altura do peito (DAP); 2- altura total da planta (H); 3- tipo de... / The Eucalyptus urophylla is detached for its wood potential of utilization for its plasticity of plasticity of adaptation in different Brazilian’s environmental conditions and for being tolerant towards the eucalyptus canker (Cryphonectria cubensis). The utilization of improved seeds is needed, considering the imminent woodland’s deficit that started in Brazil, in 2004, since the heavy Wood demand was higher than it offers. However the improvements of this specie in Brazil, depends on the existence of genetic variability of the installed populations, which avoids the occurrence of endogamous depression. The present report aims at the genetic study of a base population of E. urophylla, originated from Flores e Timor, and installed in Selvíria-MS. Its genetic variability was studied through quantitative analysis. This way, the specific objectives of this report was: a) Guess the genetic variability for the main silvicultural characters; b) Guess possible earnings in the selection, utilizing this selection among and inside the progenies and inside the progenies and the index of multi-effects, analyzing the skive effect in a base population of E. urophylla. The experiment was installed on March 17th of 1992, on the engineering university’s farm of teaching, researches, and extension, campus in Ilha Solteira (FE/UNESP), located in Selvíria - MS. The progenies test was installed obeying an experimental delineation in lattice of 8x8, quintuplet, partially balanced with 64 progenies which came from the experimental station in the woodland’s institute of researches and studies, (IPEF/ESALQ/USP), located in of Anhembi - SP. The parcels have 8 trees, in a space of 3,0 x 3,0 meters. The evaluated and analyzed quantitative characters was: 1-Diameter at chest’s height (DAP); 2-Total plant’s height (H); 3-Kind of bark (CAS); 4- Shape of the shank (FOR); 5- Bifurcation; 6- Survival (SOBR) ... (Complete abstract click electronic access below)