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Linfomas Double-Hit em casuística de Linfomas Não-Hodgkin B de alto grau: estudo clínico, morfológico, imunoistoquímico e citogenéticoOliveira, Cristiano Claudino [UNESP] 07 October 2015 (has links) (PDF)
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000855321.pdf: 1398004 bytes, checksum: 326dbbb4b555143ff52169d63ce0621f (MD5) / Introdução: Linfomas Double-Hit (LDH) são neoplasias de alto grau raras, caracterizadas pela translocação do gene MYC concomitante a translocação envolvendo os genes BCL2 e/ou BCL6, cujo diagnóstico depende da realização de exame citogenético, técnica de baixa disponibilidade e elevado custo. Diante disso, tem-se valorizado a identificação de fatores morfológicos e/ou imunofenotípicos que tenham associação com a detecção de tais translocações diagnósticas. Objetivos: Identificar pacientes portadores de LDH em casuística de linfomas Não-Hodgkin de alto grau e avaliar as associações entre os resultados citogenéticos imunoistoquímicos (IHQ) relativos aos marcadores MYC, BCL2 e BCL6. Material e Métodos: Procedeu-se revisão clínico-morfológica de 120 pacientes com diagnóstico de linfoma difuso de grandes células B (LDGCB) e linfoma de Burkitt (LB), com confecção de plataforma de tissue microarray (TMA) para realização IHQ (CD20, CD79a, PAX5, CD10, BCL6, BCL2, MUM1, TDT e c-MYC) e hibridação por fluorescência in situ (FISH) para detecção de translocações dos genes c-MYC, BCL6 e BCL2. Resultados: Detectaram-se três pacientes portadores de LDH: dois com translocações de MYC e BCL2 e um com translocações de MYC e BCL6, todos evoluindo para óbito em menos de seis meses. Entre 90 amostras com citogenética avaliável, houve associação entre IHQ e FISH para MYC (p=0,036) e BCL2 (p=0,001), com concordância regular indicada por valores de Kappa de 0,23 [0,0;0,49] e de 0,35 [0,13;0,56], respectivamente. No grupo de LDGCB (n=72), as translocações envolvendo individualmente os genes MYC, BCL6 e BCL2 representaram 4,1%, 12,5% e 15,2%, respectivamente, sendo a morfologia de céu estrelado fortemente associada à detecção de translocações do gene MYC (p=0,01). Conclusão: A detecção de apenas três pacientes portadores de LDH na casuística estudada, todos com evolução para óbito, corrobora... / Background: Double-Hit Lymphomas (DHL) are rare high-grade neoplasms characterized by the translocation of gene MYC to other translocations involving genes BCL2 and/or BCL6, whose diagnosis depends on the cytogenetic examination, a technique with low availability and high cost. Therefore, it has been valued the identification of morphologic and/or immunophenotypic factors that have association with the detection of those translocations. Objectives: To identify DHL patients in group of high grade non-Hodgkin lymphoma (NHL-B) and evaluate the associations between the cytogenetic and immunohistochemical (IHC) results for the MYC, BCL2 and BCL6 markers. Design: Clinical and morphological review of 120 patients diagnosed with diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and Burkitt lymphoma (BL) was proceeded, with production of a tissue microarray platform (TMA) to perform IHC (CD20, CD79a, PAX5, CD10, BCL6, BCL2, MUM1, TDT and c-MYC) and fluorescence in situ hybridization (FISH) for detection of c-MYC, BCL2 and BCL6 gene translocations. Results: Three patients with DHL were detected: two with translocations of MYC and BCL2 and one with translocations of MYC and BCL6, all leading to death in less than six months. Among 90 cytogenetically evaluable samples, associations were determined between IHC and FISH for MYC (p=0.036) and BCL2 (p=0.001), though with regular compliance testing, indicated by Kappa value of 0.23 [0.0;0.49] and 0.35 [0.13;0.56], respectively. In the DLBCL group (n=72), MYC, BCL6 and BCL2 translocations were present in 4.1%, 12.5% and 15.2%, respectively. Starry sky morphology was strongly associated with MYC positivity (p=0.01). Conclusion: The detection of only three DHL patients in this series, all evolving to death, confirms the rarity and aggressiveness of this neoplasm. The morphological pattern starry sky and the expression by IHC of MYC and BCL2 can represent possible selection factors for the ...
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Análise citogenética em espécies de Vespertilionidae dos gêneros Eptesicus, Histiotus, Lasiurus e Myotis (Chiroptera, Mammalia)Marchesin, Sandra Regina de Carvalho [UNESP] 26 June 2002 (has links) (PDF)
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marchesin_src_me_sjrp.pdf: 635247 bytes, checksum: b4432ae0de06265a064ac1eae2f6d35f (MD5) / Foram analisados citogenéticamente seis espécies de Vespertilionidae dos gêneros Myotis, Lasiurus, Histiotus e Eptesicus. As metáfases obtidas de culturas de fibroblastos foram analisadas em coloração convencional, Ag-NOR, bandamento C e G e hibridização in situ fluorescente com sonda de seqüências teloméricas (TTAGGG)n humana. As espécies Myotis nigricans, Myotis riparius (2n=44; NF=50), Eptesicus brasiliensis (2n=50; NF=48) e Histiotus velatus (2n=50; NF=48) foram as que apresentaram o maior número de cromossomos; Lasiurus ega (2n=28; NF=48) e Lasiurus cinereus (2n=28; NF=48) apresentaram o menor número de cromossomos, o que evidencia variabilidade cariotípica ao nível morfológico. A coloração Ag-NOR evidenciou variação no número de nucléolos interfásicos e nos cromossomos com RONs. Em M. nigricans e M. riparius as marcações nos cromossomos portadores de RONs variaram em distribuição, número e tamanho. Em M. nigricans o número de cromossomos marcados variou de 7 a 9 e em M. riparius de 6 a 10. Nas duas espécies, as RONs foram observadas nas extremidades dos braços curtos e longos de cromossomos acrocêntricos. A variação no número deve estar refletindo a ativação diferencial de RONs, o que resulta uma variação no número e no tamanho dos nucléolos. Em M. nigricans o número de nucléolos observados variou de 01 a 09 e em M. riparius de 01 a 10. Além da ativação diferencial, a fusão nucleolar resultante do movimento, crescimento e aproximação dos nucléolos podem ser responsáveis pela variação observada. Em L. cinereus e H. velatus as RONs foram coincidentes com as constrições secundárias dos pares heteromórficos 11 e 13 em L. cinereus, e 15 em H. velatus. O padrão de bandas G obtidos para as espécies M. nigricans e M. riparius evidenciou a ocorrência de homologias cromossômicas entre elas. / Six species of four vespertilionid genera (Myotis, Lasiurus, Histiotus and Eptesicus) were cytogenetically analyzed. The metaphases obtained from fibroblast cultures were analyzed in conventional staining, Ag-NOR, C and G banding and fluorescent in situ hybridization with probe of human telomeric sequence (TTAGGG)n. The species Myotis nigricans (2n=44, NF=48), Myotis riparius (2n=44; NF=50), Eptesicus brasiliensis (2n=50; NF=48) and Histiotus velatus (2n=50; NF=48) showed the highest number of chromosomes; Lasiurus ega (2n=28; NF=48) and Lasiurus cinereus (2n=28; NF=48) showed the lowest number, indicating karyotypic variability on the morphologic level. Ag-NOR staining evinced variation in the number of interphasic nucleoli and in chromosomes with NORs. In M. nigricans and M. riparius, the chromosomal Ag-stained regions varied in distribution, number and size. In M. nigricans, the number of marked chromosomes varied between 7 and 9, and in M. riparius, the number varied between 6 and 10. In both species, the NORs were observed on the extremities of the short and long arms of acrocentric chromosomes. The variation in number might be reflecting of NORs differential activation, resulting in variation in the number and size of nucleoli. In M. nigricans, the number of observed nucleoli has varied between 01 and 09, and in M. riparius, between 01 and 10. Besides differential activation, the nucleolar fusion resulting from the movement, growth and approximation of nucleoli might be responsible for the observed variation. In L. cinereus and H. velatus, the NORs were coincident with the secondary constrictions of heteromorphic pairs 11 and 13 in L. cinereus, and pair 15 in H. velatus. The pattern for G banding obtained for the species M. nigricans and M. riparius evinced the occurrence of chromosomal homologies between them.
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Estimativa da frequência da inversão SWBinv-1 entre pais de portadores ds síndrome de Williams-Beuren e pais de filhos normais do BrasilLoaiza Medina, Juan Diego [UNESP] 12 December 2014 (has links) (PDF)
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000827183.pdf: 711875 bytes, checksum: 144b7d1e43a7ce42d46cbed83d739a5d (MD5) / A síndrome de Williams-Beuren (SWB) é uma rara afecção genética, caracterizada por varias anormalidades físicas, incluindo dismorfismos faciais, anomalias cardiovasculares, deficiência intelectual e de crescimento, perfil cognitivo característico e ocasionalmente, hipercalcemia infantil transitória, com prevalência de 1/7500. A etiologia da SWB é uma deleção hemizigótica de genes contíguos na região cromossômica 7q11.23. Os tamanhos das deleções mais comum são de 1,5 e 1,8 Mb e abrangem 28 genes. O mecanismo de deleção esta diretamente ligado a regiões cromossômicas repetitivas, denominadas Low Copy Repeats (LCR). Estas regiões repetitivas estão distribuídas por todo genoma, constituindo cerca de 5% de seu total e são o substrato para as recombinações cromossômicas (crossing-over) durante o processo meiótico. Em algumas ocasiões o processo de recombinação pode ocorrer de maneira desigual entre homólogos não alélicos (nonallelic homologous recombination – NAHR), o que pode resultar na deleção, duplicação ou inversão de um gene ou mais genes. Inversões balanceadas podem acarretar em um polimorfismo hemizigótico, tendo sido verificado que a região critica para SWB esta invertida (SWBinv-1) com maior frequência entre genitores de indivíduos com SWB. Dados da literatura sugerem que indivíduos portadores da inversão SWBinv-1 tem uma probabilidade de 22-25% de terem um filho com SWB, comparado com a população geral (5,8%). Nós desenvolvi mos uma estratégia para triagem de possíveis portadores de SWBinv-1, dentre os genitores de indivíduos com SWB, para podermos verificar a frequência desta inversão tanto em pais de crianças com SWB como entre pais de crianças sem SWB no Brasil. Desta forma foram realizadas analises de núcleos interfásicos em esfregaço de sangue pela técnica de hibridação”in situ” por fluorescência (FISH) e comparamos com ... / The Williams-Beuren syndrome (WBS) is a rare genetic disorder characterized by various physical abnormalities, including facial dimorphisms, cardiovascular abnormalities, intellectual disability and growth characteristic cognitive profile and occasionally transient infantile hypercalcemia, with a prevalence of 1/7500 . The etiology of SWB is a hemizygous deletion of contiguous genes at chromosome region 7q11.23. The most common sizes of deletions are 1.5 and 1.8 Mb and encompass 28 genes. The mechanism of deletion is directly linked to repetitive chromosomal regions, called Low Copy Repeats (LCR). These repetitive regions are distributed throughout the genome, constituting about 5% of its total and are the substrate for chromosomal recombination (crossing-over) during the meiotic process. In some instances the process of recombination can occur unevenly among homologous non-allelic (homologous recombination nonallelic - NAHR), which can result in deletion, duplication or inversion of a gene or more genes. Balanced inversions can result in a hemizygous polymorphism has been found that the critical region for this inverted SWB (SWBinv-1) with greater frequency among parents of individuals with WBS. Published data suggest that individuals inversion SWBinv-1 has a 22-25% chance of having a child with SWB, compared with the general population (5.8%). We we developed a strategy for screening potential carriers SWBinv-1, among the parents of individuals with WBS, so we can check the frequency of this inversion in both parents of children with SWB as between parents of children without SWB in Brazil. Thus analyzes of interphase nuclei were performed on blood smear by technique hybridization in situ by fluorescence (FISH) analysis and compared to metaphase and interphase lymphocyte culture. Were part of the sample group and 38 couples in the control group 20 couples. Of the 38 couples in the sample group ...
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Monitoramento do perfil microbiológico de dentes com infecção endodôntica primária durante terapia com diferentes medicações intracanalFerreira, Nádia de Souza [UNESP] 27 June 2014 (has links) (PDF)
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000822376.pdf: 932644 bytes, checksum: 53b39dc2f6dd4c37657a8fa6333a660a (MD5) / Os objetivos deste estudo foram: 1. Correlacionar características clínicas e radiográficas com a microbiota presente no canal radicular de dentes com infecção primária; 2. Monitorar o perfil microbiológico após o preparo biomecânico e uso de diferentes medicações intracanal; 3) Verificar a susceptibilidade de complexos microbianos a diferentes medicações intracanal. Trinta dentes unirradiculares com necrose pulpar e lesão periapical visível radiograficamente foram submetidos ao tratamento endodôntico utilizando hipoclorito de sódio 2,5% como solução irrigadora e divididos em 3 grupos de acordo com a medicação intracanal utilizada: hidróxido de cálcio P.A. + solução salina fisiológica; hidróxido de cálcio P.A. + Zingiber officinale (extrato glicólico de gengibre); hidróxido de cálcio P.A. + gel de clorexidina 2%. Foram realizadas coletas do canal radicular com cones de papel absorvente após a abertura coronária, após a instrumentação e após 14 dias de ação da medicação intracanal. Para análise do conteúdo microbiológico dos canais radiculares, as amostras foram analisadas a partir de sondas de DNA pelo método de hibridização DNA-DNA checkerboard. Além disso, foi realizado teste de avaliação da atividade antimicrobiana do tratamento clínico por cultura microbiológica. Os resultados foram submetidos à análise estatística pelo teste de tendência linear, teste exato de Fisher, teste pareado de Wilcoxon e teste de Mann-Whitney, valor de p < 0,05. Houve associação entre dor à palpação e complexos roxo, verde e laranja. Fístula foi associada ao complexo vermelho. Maiores áreas de reabsorção foram associadas à presença de Capnocytophaga ochracea. Foi observada redução de bactérias após o tratamento endodôntico. Ao utilizar o método de hibridização DNA-DNA checkerboard, as bactérias mais prevalentes foram Strepctococcus anginosus.... / The objectives of this study was: 1. Correlate clinical and radiographic features and microbiota present in root canal of teeth with primary infection; 2 Monitoring the microbiological profile after biomechanical preparation and use of different intracanal medications; 3) Verify the microbial susceptibility of bacterial complexes of different intracanal medications. Thirty single-rooted teeth with pulp necrosis and periapical lesion are undergoing treatment using 2.5% sodium hypochlorite as irrigating solution and divided into 3 groups according to the intracanal medication used: calcium hydroxide + saline solution, calcium hydroxide + 20% ginger glycolic extract, calcium hydroxide + 2 % chlorhexidine gel. Samples of the root canal were taken with absorbent paper cones after the coronal opening, after instrumentation and 14 days after medication. For analysis of the microbial content of the root canal the samples were analyzed from DNA probes using the method of DNA-DNA hybridization checkerboard. In addition, tests of antimicrobial activity of clinical treatment were performed by microbiological culture. The results were statistically analyzed with linear trend test, Fisher’s exact test, Wilcoxon matched pairs test and Mann-Whitney post hoc Dunn test. For all performed tests, a P-value < 0.05 was set as statically significant. There was an association between pain on palpation and purple, green and orange complex. Sinus tract was associated with the red complex. Bone resorptions were associated with the presence of Capnocytophaga. ochracea. The reduction of bacteria was observed after endodontic treatment. By using the method of checkerboard DNA-DNA hybridization, the more prevalent bacteria were Strepctococcus anginosus, Veillonella parvula, Parvimonas micra, Enterococcus faecium and Capnocytophaga ochracia, both initially and after biomechanical preparation. All treatments reduced ....
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Características seminais e resfriamento de sêmen de tamanduá (Myrmecophaga tridactyla) de vida livre / Seminal characteristics and cooling semen of in situ anteaters (Myrmecophaga tridactyla)Luba, Camila do Nascimento [UNESP] 29 August 2014 (has links) (PDF)
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000831031.pdf: 2511455 bytes, checksum: 5ffd0294e34ec2c25575109974ce6b2c (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) é considerado vulnerável à extinção e dados científicos em relação à andrologia e características seminais são escassos. Colheu-se sêmen de oito animais com o intuito de estabeler parâmetros seminais de tamanduás-bandeira de vida livre no que se refere a volume, odor, coloração, motilidade, vigor, concentração e morfologia espermática, e investigar o tempo em que o sêmen mantém-se com motilidade e vigor sob refrigeração à 5ºC. A motilidade e vigor espermáticos foram avaliados de forma subjetiva por microscopia óptica convencional, e a análise morfológica dos espermatozoides foi realizada por microscopia de luz, microscopia de contraste e interferência diferencial e microscopia eletrônica de transmissão. O ejaculado foi caracterizado com duas frações distintas (fração esbranquiçada, leitosa e rica em células espermáticas, e fração gel, incolor e viscosa com ausência de espermatozoides) e volume médio 0,75 ml (±0,13). Os valores médios dos parâmetros (± erro padrão) encontrados nas amostras seminais à fresco foram motilidade 75% (±2,98), vigor 3,21(±0,29), concentração 108,5 x106/ml (±13,46), índice de integridade de membrana plasmática de 71% (±4,01), anormalidades espermáticas em coloração karras-modificado 35,5% (±3,38) e 48,37% (±6,83) em microscopia de contraste de interferência diferencial. Quando submetido a refrigeração o sêmen apresentou motilidade e vigor até no máximo 24 horas, com valores decrescentes em ambos os parâmetros com o decorrer do tempo / The giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) is considered vulnerable to extinction and scientific data regarding andrology and seminal characteristics are scarce. The semen were collected from eight animals with the intention of seminal parameters to establish anteaters free life as regards the volume, odor, color, motility, vigor, concentration and morphology, and to investigate the time the semen remains with motility and vigor under refrigeration at a temperature of 5 ° C. The sperm motility and vigor were subjectively assessed by light microscopy and morphological analysis of sperm were performed by conventional optical microscopy, differential interference contrast microscopy and transmission electron microscopy. The ejaculate was characterized with two distinct fractions (fraction whitish, milky and rich in sperm cells, and gel fraction colorless and viscous with absence of sperm) and average volume 0.75 ml (± 0.13). The mean values of the parameters (± standard error) found in the fresh semen samples motility were 75% (± 2.98), vigor 3.21 (± 0.29), concentration x106/ml 108.5 (± 13.46), index of plasma membrane integrity of 71% (± 4.01) and sperm abnormalities in karras-modified staining 35.5% (± 3.38) and 48.37% (± 6.83) in contrast microscopy differential interference. When subjected to cooled semen presented motility and vigor up to 24 hours, with decreasing values in both parameters over time
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Características seminais e resfriamento de sêmen de tamanduá (Myrmecophaga tridactyla) de vida livre /Luba, Camila do Nascimento. January 2014 (has links)
Orientador: João Carlos Pinheiro Ferreira / Banca: Fernanda da Cruz Landim Alvarenga / Banca: Marcelo Alcindo de Vaz Barros Gumarães / Resumo: O tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) é considerado vulnerável à extinção e dados científicos em relação à andrologia e características seminais são escassos. Colheu-se sêmen de oito animais com o intuito de estabeler parâmetros seminais de tamanduás-bandeira de vida livre no que se refere a volume, odor, coloração, motilidade, vigor, concentração e morfologia espermática, e investigar o tempo em que o sêmen mantém-se com motilidade e vigor sob refrigeração à 5ºC. A motilidade e vigor espermáticos foram avaliados de forma subjetiva por microscopia óptica convencional, e a análise morfológica dos espermatozoides foi realizada por microscopia de luz, microscopia de contraste e interferência diferencial e microscopia eletrônica de transmissão. O ejaculado foi caracterizado com duas frações distintas (fração esbranquiçada, leitosa e rica em células espermáticas, e fração gel, incolor e viscosa com ausência de espermatozoides) e volume médio 0,75 ml (±0,13). Os valores médios dos parâmetros (± erro padrão) encontrados nas amostras seminais à fresco foram motilidade 75% (±2,98), vigor 3,21(±0,29), concentração 108,5 x106/ml (±13,46), índice de integridade de membrana plasmática de 71% (±4,01), anormalidades espermáticas em coloração karras-modificado 35,5% (±3,38) e 48,37% (±6,83) em microscopia de contraste de interferência diferencial. Quando submetido a refrigeração o sêmen apresentou motilidade e vigor até no máximo 24 horas, com valores decrescentes em ambos os parâmetros com o decorrer do tempo / Abstract: The giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) is considered vulnerable to extinction and scientific data regarding andrology and seminal characteristics are scarce. The semen were collected from eight animals with the intention of seminal parameters to establish anteaters free life as regards the volume, odor, color, motility, vigor, concentration and morphology, and to investigate the time the semen remains with motility and vigor under refrigeration at a temperature of 5 ° C. The sperm motility and vigor were subjectively assessed by light microscopy and morphological analysis of sperm were performed by conventional optical microscopy, differential interference contrast microscopy and transmission electron microscopy. The ejaculate was characterized with two distinct fractions (fraction whitish, milky and rich in sperm cells, and gel fraction colorless and viscous with absence of sperm) and average volume 0.75 ml (± 0.13). The mean values of the parameters (± standard error) found in the fresh semen samples motility were 75% (± 2.98), vigor 3.21 (± 0.29), concentration x106/ml 108.5 (± 13.46), index of plasma membrane integrity of 71% (± 4.01) and sperm abnormalities in karras-modified staining 35.5% (± 3.38) and 48.37% (± 6.83) in contrast microscopy differential interference. When subjected to cooled semen presented motility and vigor up to 24 hours, with decreasing values in both parameters over time / Mestre
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Detecção do Paracoccidioides spp. em amostras ambientais e diferenciação do complexo P. brasiliensis da espécie P. lutzii por Nested PCR e hibridização in situ /Arantes, Thales Domingos. January 2015 (has links)
Orientador: Eduardo Bagagli / Coorientador: Raquel Cordeiro Theodoro / Banca: Patricia Albuquerque de Andrade Nicola / Banca: Adriana Pardini Vicentini / Banca: Silvio de Alencar Marques / Banca: Renata Castiglioni Pascon / Resumo: O solo é o provável habitat do fungo patogênico Paracoccidioides spp., devido à detecção molecular deste patógeno neste tipo de amostra, associada à frequente infecção de trabalhadores rurais e isolamento em animais silvestres (Dasypus novemcinctus e Cabassous centralis). O presente estudo visou detectar e diferenciar as espécies Paracoccidioides brasiliensis (complexo) e Paracoccidioides lutzii no ambiente, pelas técnicas de Nested PCR, FISH, respectivamente, em amostras ambientais aerossóis e solo de tocas de tatus provenientes de áreas endêmicas para a Paracoccidioidomicose nas regiões Sudeste, Centro-Oeste e Norte brasileiras. Além da detecção ambiental de Paracoccidioides sp. por métodos moleculares, foi estudada a ocorrência de tatus infectados com P. lutzii no centro-oeste brasileiro, região de maior prevalência desta espécie, onde nenhum animal havia sido avaliado até o presente momento. Obtivemos a detecção positiva para ambas as espécies de Paracoccidioides por ambas as técnicas de detecção (Nested PCR e hibridização in situ), além da diferenciação por ITS (Internal Transcribed Spacer) pudemos visualizar os espécimes fúngicos em algumas amostras aerossóis. Acreditamos que os dados refletem a real ocorrência dos fungos em seu nicho, no entanto, o isolamento animal em tatus demonstrou-se negativo para 7 animais avaliados no trabalho, o que pode indicar que a relação da espécie P. lutzii com os tatus pode não ser a mesma com os casos de tatus infectados com P. brasiliensis em outras regiões brasileiras / Abstract: Soil is probably the habitat of pathogenic fungi Paracoccidioides spp., due to the molecular detection of this pathogen in these samples, associated with the frequent of infection in rural workers and the isolation in wild animals (Dasypus novemcinctus and Cabassous centralis). This project aimed to detect and differentiate the species P. brasiliensis (complex) and P. lutzii in the environment, by the techniques of Nested PCR and FISH, respectively, in environmental aerosol samples and soil from armadillo's burrows, from endemic and non-endemic areas to Paracoccidioidomycosis in the Southeast, Midwest and North regions of Brazil. Besides the environmental detection of Paracoccidioides spp. by molecular methods, the occurrence of armadillos infected with P. lutzii the Brazilian center-west region with the highest prevalence of this kind, where no animals were evaluated at the present time will be studied. We achieved positive detection of both species of Paracoccidioides by both detection techniques (PCR and in situ hybridization), and further the differentiation by the ITS (Internal Transcribed Spacer) we could visualize fungal species in some aerosol samples also differentiating the two species. We believe of the data reflect the actual occurrence of fungi in their niche, however the animal isolation in armadillo's showed up negative for 7 animals evaluated at work, which indicated that the ratio of the species P. lutzii with armadillo may not be the same with cases of armadillo's infected with P. brasiliensis in other regions of Brazil / Doutor
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Detecção de gene TP53 e expressão das proteínas p53, Bcl-2 e p63 no tumor venéreo transmissível canino /Silva, Daniela Stochmann. January 2010 (has links)
Resumo: O tumor venéreo transmissível canino (TVTC) é uma neoplasia transmitida entre cães saudáveis pelo contato direto de pele e/ou mucosas lesionadas. Face aos escassos estudos relacionados aos eventos celulares envolvidos nas fases de crescimento do TVTC, o presente estudo teve por objetivo identificar a presença do gene TP53 e o RNAm referente a proteína codificada, além de detectar a expressão das proteínas p53, Bcl-2 e p63 em cortes histológicos de 13 amostras de TVTC. Com relação à evolução da neoplasia, 46% das amostras foram consideradas em fase de progressão e 54% no estágio de regressão. Foram utilizadas as técnicas de hibridização in situ (ISH) e RT-PCR in situ, que demonstrou a presença do DNA homólogo ao TP53 e seu respectivo RNAm em 92,30% das amostras. A expressão das proteínas p53, p63 e Bcl-2 foram detectadas em 50%, 70% e 100% das amostras, respectivamente. A p63 foi expressa de forma evidente nas amostras em regressão, porém a p53 e a Bcl-2 não apresentaram relação com o estágio evolutivo do tumor e provavelmente não podem ser analisados como fatores de prognóstico do TVTC. Observou-se, nesse estudo que, através das técnicas de ISH e RT-PCR in situ foi possível detectar o DNA do TP53 e seus transcritos, porém esse fato não significou a transcrição da p53, devido aos baixos níveis de expressão nas análises quantitativa e qualitativa nas amostras de TVTC / Abstract: The canine transmissible venereal tumor (CTVT) is transmitted by direct contact of skin or mucosal presenting lesions. In fact, few reports have been found describing the cellular immune response related to the evolution of the tumor. The objective of this study was to identify the TP53 gen and its transcription in CTVT in different stages of evolution, collected from dogs (N=13) examined at veterinary school, UNESP, Aracatuba, SP, Brasil. In addition, it was also evaluated the expression of p53, p63 and Bcl-2 in histological sections by the use of immunohistochemystry assay. The p53, p63 and Bcl-2 were evident in 50, 70 and 100% of analyzed samples. Regarding to tumor evolution, 6 out of 13 were considered in a progressive stage (46%), was list 7 out of 13 were classified in a regressive stage (54%). The use of in situ hybridization and reverse transcriptase polymerase chain reaction in situ (RT-PCR), revealed that TP53 was present in all samples and P63 was more expressed than p53. Take all results together, the real role of those marker are extremely important to understand the biological behavior and to improve therapeutic procedures for CTVT / Orientador: Maria Cecília Rui Luvizotto / Coorientador: Tereza Cristina Cardoso / Banca: Alexandre Lima de Andrade / Banca: Paula Rahal / Mestre
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Investigação da amplificação do EGFR em carcinoma de células escamosas de boca em pacientes jovens /Costa, Victor Bernardes Barroso. Unknown Date (has links)
Orientador: Estela Kaminagakura Tango / Banca: Ana Lia Anbinder / Banca: Silvana Pasetto / Resumo: O carcinoma de células escamosas (CEC) de boca é uma neoplasia incomum em pacientes jovens. Na literatura de língua inglesa não há relatos de estudos que investiguem a amplificação do EGFR e a expressão desta proteína neste grupo etário. O objetivo deste estudo foi investigar a amplificação do EGFR através da técnica de hibridização por fluorescência in situ (FISH) e correlacionar os resultados obtidos através da imunomarcação da proteína EGFR com a epidemiologia e com o prognóstico dos pacientes avaliados. Ao final dos testes de FISH e imunohistoquímicos, 21 amostras do grupo teste (pacientes ≤ 40 anos) e 39 amostras do grupo controle (pacientes ≥ 50 anos) foram consideradas adequadas para avaliação. As variáveis clínicas e anatomopatológicas foram comparadas pelos testes Qui-Quadrado ou exato de Fisher. A expressão do marcador EGFR e do método de FISH foi comparada entre os grupos por meio do teste não paramétrico de Mann-Whitney. As curvas de sobrevida foram calculadas utilizando o método de Kaplan-Meier e suas curvas foram comparadas através do teste de log-rank. Houve maior número de pacientes do sexo masculino, leucodermas, tabagistas e etilistas. A amplificação do EGFR foi maior no grupo teste (p = 0,018). A amplificação do EGFR associou-se estatisticamente com a variável estadiamento clínico avançado (p = 0,013), independente do grupo. A expressão da proteína EGFR correlacionou-se com tumores bem diferenciados (p = 0,011) e a presença de metástase (p = 0,035), independente da idade. A presença de amplificação foi mais frequente no grupo tese. Alguns casos de pacientes ≥40 anos de idade podem ser adequados ao emprego da terapia anti-EGFR, devido à amplificação do EGFR / Abstract: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is uncommon neoplasia in young patients. In the English literature, there are no reports of studies that investigate the amplification of EGFR and expression of this protein in this age group. The aim of this study was to investigate the amplification of EGFR by fluorescence in situ hybridization (FISH) and to correlate the results by immunostaining of EGFR protein with clinicopathological features and prognosis. After FISH and immunohistochemistry, 21 samples of the test group (≤ 40 years) and 39 samples of control group (≥ 50 years) were suitable for evaluating. Categorical variables were compared by the Pearson chi-square test or Fisher's exact test. Associations between protein levels and FISH results with clinicopathological characteristics of the patients were analyzed by Mann-Whitney U test. Survival rates were calculated using the Kaplan-Meier method and the curves were compared by the log-rank test. There was predominance for male patients, leucoderma, smoking and alcohol consumption. The EGFR amplification was higher in the test group (p = 0.018) and it was associated statistically with advanced clinical stage (p = 0.013), independent of the group. The expression of EGFR protein was correlated to well differentiated tumors (p = 0.011) and presence of metastasis (p = 0.035), regardless of age. Presence of EGFR amplification and/or expression. Some cases of patients ≥40 years old might be suitable for anti-EGFR therapy because of EGFR amplification / Mestre
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Monitoramento do perfil microbiológico de dentes com infecção endodôntica primária durante terapia com diferentes medicações intracanal /Ferreira, Nádia de Souza. January 2014 (has links)
Orientador: Marcia Carneiro Valera / Co-orientador: Frederico Canato Martinho / Banca: Cláudio Antônio Talge Carvalho / Banca: Ezilmara Leonor Rolim de Sousa / Banca: Caio Cezar Randi Ferraz / Banca: Ana Paula Martins Gomes / Resumo: Os objetivos deste estudo foram: 1. Correlacionar características clínicas e radiográficas com a microbiota presente no canal radicular de dentes com infecção primária; 2. Monitorar o perfil microbiológico após o preparo biomecânico e uso de diferentes medicações intracanal; 3) Verificar a susceptibilidade de complexos microbianos a diferentes medicações intracanal. Trinta dentes unirradiculares com necrose pulpar e lesão periapical visível radiograficamente foram submetidos ao tratamento endodôntico utilizando hipoclorito de sódio 2,5% como solução irrigadora e divididos em 3 grupos de acordo com a medicação intracanal utilizada: hidróxido de cálcio P.A. + solução salina fisiológica; hidróxido de cálcio P.A. + Zingiber officinale (extrato glicólico de gengibre); hidróxido de cálcio P.A. + gel de clorexidina 2%. Foram realizadas coletas do canal radicular com cones de papel absorvente após a abertura coronária, após a instrumentação e após 14 dias de ação da medicação intracanal. Para análise do conteúdo microbiológico dos canais radiculares, as amostras foram analisadas a partir de sondas de DNA pelo método de hibridização DNA-DNA checkerboard. Além disso, foi realizado teste de avaliação da atividade antimicrobiana do tratamento clínico por cultura microbiológica. Os resultados foram submetidos à análise estatística pelo teste de tendência linear, teste exato de Fisher, teste pareado de Wilcoxon e teste de Mann-Whitney, valor de p < 0,05. Houve associação entre dor à palpação e complexos roxo, verde e laranja. Fístula foi associada ao complexo vermelho. Maiores áreas de reabsorção foram associadas à presença de Capnocytophaga ochracea. Foi observada redução de bactérias após o tratamento endodôntico. Ao utilizar o método de hibridização DNA-DNA checkerboard, as bactérias mais prevalentes foram Strepctococcus anginosus.... / Abstract: The objectives of this study was: 1. Correlate clinical and radiographic features and microbiota present in root canal of teeth with primary infection; 2 Monitoring the microbiological profile after biomechanical preparation and use of different intracanal medications; 3) Verify the microbial susceptibility of bacterial complexes of different intracanal medications. Thirty single-rooted teeth with pulp necrosis and periapical lesion are undergoing treatment using 2.5% sodium hypochlorite as irrigating solution and divided into 3 groups according to the intracanal medication used: calcium hydroxide + saline solution, calcium hydroxide + 20% ginger glycolic extract, calcium hydroxide + 2 % chlorhexidine gel. Samples of the root canal were taken with absorbent paper cones after the coronal opening, after instrumentation and 14 days after medication. For analysis of the microbial content of the root canal the samples were analyzed from DNA probes using the method of DNA-DNA hybridization checkerboard. In addition, tests of antimicrobial activity of clinical treatment were performed by microbiological culture. The results were statistically analyzed with linear trend test, Fisher's exact test, Wilcoxon matched pairs test and Mann-Whitney post hoc Dunn test. For all performed tests, a P-value < 0.05 was set as statically significant. There was an association between pain on palpation and purple, green and orange complex. Sinus tract was associated with the red complex. Bone resorptions were associated with the presence of Capnocytophaga. ochracea. The reduction of bacteria was observed after endodontic treatment. By using the method of checkerboard DNA-DNA hybridization, the more prevalent bacteria were Strepctococcus anginosus, Veillonella parvula, Parvimonas micra, Enterococcus faecium and Capnocytophaga ochracia, both initially and after biomechanical preparation. All treatments reduced .... / Doutor
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