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Mapeamento de QTLs e eQTLs associados à reação a “Candidatus Liberibacter asiaticus” em Poncirus trifoliata, Citrus sunki e híbridos / Mapping of QTLs and eQTLs associated with reaction the "Candidatus Liberibacter asiaticus" in Poncirus trifoliate, Citrus sunki and hybrids

Soratto, Tatiany Aparecida Teixeira 01 September 2017 (has links)
Submitted by Tatiany Aparecida Teixeira Soratto (tatiany_soratto@hotmail.com) on 2017-10-31T12:37:37Z No. of bitstreams: 2 DISSERTACAO_Tatiany_final.pdf: 3171924 bytes, checksum: 81e554e8e0137d88785acf8a80455d32 (MD5) Encaminhamento do orientador.pdf: 236358 bytes, checksum: 344f7f279720c6058970c50ae22f4a46 (MD5) / Approved for entry into archive by Alini Demarchi (alini@cca.ufscar.br) on 2017-11-30T14:04:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DISSERTACAO_Tatiany_final.pdf: 3171924 bytes, checksum: 81e554e8e0137d88785acf8a80455d32 (MD5) Encaminhamento do orientador.pdf: 236358 bytes, checksum: 344f7f279720c6058970c50ae22f4a46 (MD5) / Approved for entry into archive by Alini Demarchi (ri.bar@ufscar.br) on 2018-01-15T17:25:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DISSERTACAO_Tatiany_final.pdf: 3171924 bytes, checksum: 81e554e8e0137d88785acf8a80455d32 (MD5) Encaminhamento do orientador.pdf: 236358 bytes, checksum: 344f7f279720c6058970c50ae22f4a46 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-01T13:19:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTACAO_Tatiany_final.pdf: 3171924 bytes, checksum: 81e554e8e0137d88785acf8a80455d32 (MD5) Encaminhamento do orientador.pdf: 236358 bytes, checksum: 344f7f279720c6058970c50ae22f4a46 (MD5) Previous issue date: 2017-09-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The Centro APTA Citros Sylvio Moreira/IAC has been conducting an extensive breeding program of citrus via directed crosses. In a previous study with Citrushuanglongbing pathosystem (HLB) held in our group, using a population obtained by hybridization between Citrus sunki and Poncirus trifoliata, differences were found in the multiplication of the bacterium Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), the causal agent of HLB, in the parents and in the progeny. It was observed that the rate of infection and bacterial concentration was higher in C. sunki than in P. trifoliata. Thus, it is important to deepen the studies with this genus and hybrids to increase knowledge of which mechanisms could be involved in the tolerance to HLB, considered the most important disease of citrus currently. In this sense, the objective of this study was to establish sinteny between the linkage groups of the C. sunki and P. trifoliata maps with the genome of Citrus sinensis and to map genomic regions associated to tolerance CLas bacterium through phenotypic analysis (QTLs) and gene expression (eQTLs). With the comparative analysis between maps and genome, it was observed that all the linkage groups showed synteny with reference genome chromosomes used, with the exception of the linkage group 10 of the C. sunki map. For the phenotypic data, a population of 79 F1 hybrids between C. sunki and P. trifoliata was used. The quantification of the bacterium and accumulation of starch in the leaves were evaluated after two years of inoculation with the pathogen. Through the statistical analysis of the mixed model it was possible to group the hybrids into resistant, tolerant and susceptible, being important the validation of these data in the field. The expression of 14 candidate genes related to HLB was performed in 72 hybrids of the population and used as expression data for the mapping of eQTLs. It was possible to locate nine QTLs and 52 eQTLs on the C. sunki genitor map and 17 QTLs and 40 eQTLs were found on the P. trifoliata genitor map. The overlapping eQTLs of the majority genes of QTL (phenotypic data) indicates that the genes are related to the phenotype and are probably responsive to the pathogen infection. / O Centro APTA Citros Sylvio Moreira/IAC vem realizando um amplo programa de melhoramento genético de citros via cruzamentos dirigidos. Em um estudo prévio com o patossistema Citros-huanglongbing (HLB) realizado pelo nosso grupo, utilizando uma população obtida por hibridação controlada entre Citrus sunki e Poncirus trifoliata, foram verificadas diferenças na multiplicação da bactéria Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), agente causal do HLB, tanto nos genitores quanto na progênie. A taxa de infecção e a concentração de bactéria foi maior em Citrus sunki em relação ao P. trifoliata. Assim, é importante aprofundar os estudos com esses gêneros e seus híbridos para ampliar o conhecimento de quais mecanismos poderiam estar envolvidos na tolerância ao HLB, considerada a mais importante doença dos citros atualmente. O objetivo do trabalho foi estabelecer sintenia entre os grupos de ligação dos mapas de C. sunki e P. trifoliata com o genoma de Citrus sinensis e mapear regiões genômicas associadas à tolerância a CLas por meio de análise fenotípica (QTLs) e de expressão gênica (eQTLs). Com a análise comparativa entre mapas e genoma, foi observado que todos os grupos de ligação apresentaram sintenia com pseudocromossomos do genoma de referência utilizado, com exceção do grupo de ligação 10 do mapa da C. sunki. Para os dados fenotípicos foi utilizada uma população de 79 híbridos F1 entre C. sunki e P. trifoliata, sendo avaliada a quantificação da bactéria e acúmulo de amido nas folhas após dois anos da inoculação com o patógeno. Com a análise estatística utilizando modelo misto foi possível agrupar os híbridos em resistentes, tolerantes e suscetíveis, sendo importante a validação desses dados em campo. A análise de expressão de 14 genes candidatos relacionados ao HLB foi realizada em 72 híbridos da população e utilizados como dados de expressão para o mapeamento de eQTLs. Foram encontrados nove QTLs e 52 eQTLs no mapa do genitor C. sunki enquanto no mapa do genitor P. trifoliata foram encontrados 17 QTLs e 40 eQTLs. A sobreposição de eQTLs da grande maioria dos genes com QTLs dos dados fenotípicos, indicam que os genes têm relação com o fenótipo e que provavelmente são responsivos à infecção do patógeno.
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Dispositivo de ajuda perceptiva na atividade de inspeção visual para detecção de plantas cítricas com Huanglongbing (HLB, Greening) / Perceptual assistant device for visual inspection activity of citrus Huanglongbing (HLB) Greening

Arantes, Luiz Otávio dos Santos 30 July 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:52:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5497.pdf: 10407694 bytes, checksum: db6127b4369c7514344d60d66a7e3612 (MD5) Previous issue date: 2013-07-30 / Universidade Federal de Minas Gerais / This research aimed to develop a perceptual assistant device for citrus Huanglongbing (HLB) Greening´s scouts, which are workers responsible for symptomatic diseased plants identification by visual inspections on field. The methodology used has as starting point the Ergonomics Work Analysis (EWA) of HLB´s scouts, proceeded by Gonçalves (2011). The inspection´ EWA is articulated with Engineering Project methods for device development from the Activity standpoint. From EWA problem structuring, the device concept was defined as a lens which provides perceptual aid to HLB scouts by color contrast enhancement of mottling leaves, facilitating yellow bunch identification during visual inspection, but without any restriction to additional symptoms identification. Based on efficiency and productivity perspective, confronted against health and wellbeing perspective, it was used a method of data acquisition for quantitative analysis by statistical analysis of variance, related to inspection activity efficiency, and qualitative analysis, by semi-structured interviews related to user perception about wearing the perceptual assistant device. Results show that, in one hand, wearing the device helps to relief some cognitive constraints related to inspection activity, such as lightness, sun light reflection, shadows over the leaves, sun light direction variation, and also enhances symptomatic mottled leaves visualization. On the other hand, related to inspection efficiency, wearing the device does not resulted in higher or lower HLB identification on field. Therefore, the perceptual assistant device utilization for health improvement in the workplace and how is done mobilization and coordination between different social actors around the device development and evaluation, stays in this research as a reference about a way to create innovation. / Esta pesquisa teve como objetivo desenvolver um dispositivo de ajuda perceptiva para os inspetores de Huanglongbing (HLB) Greening da citricultura, trabalhadores cuja função é detectar plantas doentes em campo por meio de inspeções visuais. A metodologia utilizada tem como ponto de partida a Análise Ergonômica do Trabalho (AET) dos inspetores de HLB realizada por Gonçalves (2011). A AET do trabalho de inspeção é articulada com o Projeto de Engenharia para o desenvolvimento do dispositivo sob o ponto de vista da atividade. A partir da estruturação do problema pela AET, definiu-se o conceito do dispositivo como uma lente que proporciona ajuda perceptiva aos inspetores pela intensificação do contraste entre as cores do mosqueado das folhas, facilitando a detecção do ramo amarelo durante as inspeções, sem restringir a identificação dos demais sintomas. Balizado na confrontação entre a perspectiva de eficiência e produtividade com a perspectiva de bem-estar e saúde, a análise dos dados coletados foi direcionada de forma quantitativa por análise estatística de variância, relaciona a eficiência da atividade de inspeção, e qualitativa, por entrevistas semi-estruturadas relacionadas à percepção dos usuários quanto à utilização do dispositivo de ajuda perceptiva. Os resultados demonstram, por um lado, que a utilização do dispositivo ajuda a minimizar alguns constrangimentos cognitivos relacionados à atividade de inspeção quanto à claridade, reflexo dos raios solares, sombra sobre as folhas, variação de direção dos raios solares e também melhora a visualização dos sintomas de mosqueamento das folhas. Por outro lado, quanto à eficiência de inspeção, a utilização do dispositivo não acarretou em maior ou menor identificação de HLB em campo. Portanto, a utilização do dispositivo de ajuda perceptiva para melhoria da saúde no trabalho e o modo de mobilização e coordenação entre os diferentes atores sociais em torno do desenvolvimento e avaliação do dispositivo, ficam nesta pesquisa como referência de uma forma de criar inovação.
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Relações tritróficas: Variedades de Citros x Diaphorina citri Kuwayama, 1908 (Hemiptera: Psyllidae) x Tamarixia radiata (Waterson, 1922) (Hymenoptera: Eulophidae) / Tritrophic Relationships: Citrus varieties x Diaphorina citri Kuwayama, 1908 (Hemiptera: Psyllidae) x Tamarixia radiata (Waterson, 1922) (Hymenoptera: Eulophidae)

Gustavo Rodrigues Alves 22 January 2013 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi avaliar a influência de variedades comerciais de citros e de murta no desenvolvimento de Diaphorina citri Kuwayama, 1908 e a preferência do parasitoide Tamarixia radiata (Waterson, 1922) sobre o referido psilídeo, criado em diferentes variedades cítricas e na murta, por meio de estudos biológicos e comportamentais, para definir estratégias de controle da praga em programas de MIP em citros. Foram realizados testes de livre escolha e confinamento (sem chance de escolha) para avaliar o efeito de variedades de citros sobre a alimentação e fertilidade de D. citri, bem como a biologia da referida espécie de psilídeo em diferentes hospedeiros. Avaliou-se ainda o efeito da variedade de citros sobre o parasitismo de T. radiata, bem como sua biologia em D. citri criado em diferentes hospedeiros. Pode-se concluir que: D. citri preferiu ovipositar e se alimentar, em teste de livre escolha, em \'Natal\', sendo que no teste de confinamento (sem chance de escolha) a oviposição foi semelhante em \'Natal\', \'Valência\' e \'Pêra\'. Em ambos os tipos de teste, \'Hamlin\' foi a menos adequada para D. citri. Com base nos demais parâmetros biológicos avaliados, a análise de agrupamento separou os hospedeiros em três grupos distintos, sendo \'Valência\' e murta os hospedeiros mais adequados ao desenvolvimento de D. citri. No segundo grupo (\'Natal\', \'Pêra\' e \'Ponkan\') concentraram-se as variedades que proporcionaram um desenvolvimento intermediário ao psilídeo, sendo \'Hamlin\' a menos adequada ao desenvolvimento do inseto. Com base na tabela de vida de fertilidade, a taxa líquida de reprodução (Ro) de D. citri foi 2,5 vezes maior quando criado em \'Valência\' em relação a \'Hamlin\'. Os demais parâmetros (T, λ e rm) também favoreceram o inseto quando criado em \'Valência\'. Os hospedeiros estudados não afetaram o parasitismo e desenvolvimento de T. radiata sobre D. citri. Os resultados obtidos poderão fornecer subsídios ao planejamento do plantio de variedades de citros em pomares novos com vistas à incidência e manejo do HLB. / This research\'s aim was to evaluate the influence of commercial citrus varieties and orange jessamine on the development of Diaphorina citri Kuwayama, 1908 and the parasitoid Tamarixia radiata (Waterson, 1922) preference on the Asian Citrus Psyllid (ACP), reared on different citrus varieties and on orange jessamine, by the means of biological and behavioral studies, in order to establish strategies of pest control in Integrated Pest Management (IPM) citrus programs. Free-choice and nochoice tests were carried out to evaluate the citrus varieties effects on the feeding and fertility of D. citri, as well as the biology of this psyllid species on different hosts. It was evaluated the citrus variety effect on the T. radiata parasitization, as well as its biology with D. citri reared on different hosts. It can be concluded that: D. citri preferred laying eggs and feeding, in free-choice tests, on \'Natal\', while in the nochoice test, the laying-eggs behavior was the same on \'Natal\', \'Valência\' and \'Pêra\'. In the both tests, \'Hamlin\' was the least suitable for D. citri. According to the other biological characteristics evaluated, the grouping analysis identified 3 different groups, being \'Valência\' and orange jessamine the best hosts for D. citri development. In the second group (\'Natal\', \'Pêra\' e \'Ponkan\') are the varieties that provided a reasonable development to the psyllid, being \'Hamlin\' the least suitable for the insect development. According to the fertility life table, the reproduction net rate (Ro) of D. citri was 2,5 times bigger if reared on \'Valência\' compared to \'Hamlin\'. The other life table parameters (T, λ e rm) also supported the results when it was reared on \'Valência\'. The studied hosts did not affect the parasitization and the development of T. radiata on D. citri. The results obtained will provide information for planting planning of citrus varieties in new groves considering the HLB incidence and management.
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Extratos vegetais amazônicos no processo têxtil: caracterização físico-química e aplicações / Amazonian plant extracts on textile process : physicochemical characterization and application

Bárbara Leonardi 15 February 2016 (has links)
Os extratos vegetais amazônicos para uso em beneficiamento têxtil podem ser uma alternativa sustentável e ecológica em relação às atuais matérias-primas utilizadas pelo mercado. Este estudo teve como objetivo efetuar a caracterização físicoquímica de extratos vegetais amazônicos (óleo-resina de copaíba, óleo de castanha do Brasil, óleo de buriti, manteiga de cacau, manteiga de tucumã e manteiga de cupuaçu), preparar emulsões e realizar aplicações preliminares destas em têxteis. A caracterização físico-química foi realizada através das técnicas instrumentais analíticas de espectroscopia de infravermelho por transformada de Fourrier (FTIR) e cromatografia a gás com detecção por ionização de chama (CG-FID). Além disso, foi realizada a determinação do Equilíbrio Hidrófilo-Lipófilo (EHL) das emulsões preparadas a partir dos extratos estudados; seleção da emulsão mais estável por extrato para aplicação por foulardagem; avaliação da oxidação das emulsões aplicadas sobre o material têxtil em diferentes temperaturas (120 a 200ºC); e avaliação sensorial de toque proporcionado pelas emulsões em comparação a um amaciante de uso industrial. Os principais resultados foram que o óleo de castanha do Brasil e as manteigas de cacau, tucumã e cupuaçu apresentaram resultados próximos nas análises por FTIR; a distribuição graxa por cromatografia a gás mostrou-se útil para a caracterização destes extratos vegetais; os valores de referência de EHL para os extratos analisados foram de 7,51 a 10,72 e estão de acordo com a literatura científica (de 6 a 12); os extratos estudados emulsionados nas condições do estudo não possuem tendência à oxidação por temperatura; as médias globais das análises sensoriais de toque indicam um resultado inferior ao padrão comercial, porém, as manteigas de cacau, cupuaçu e o óleo de castanha do Brasil apresentaram os melhores resultados, com notas entre 2,8 e 2,9 (numa escala de 1 a 5). Assim, nota-se que, os resultados obtidos podem ser utilizados como base para pesquisas futuras no sentido de melhorar as formulações das emulsões para a produção de amaciantes ou outros produtos / The Amazonian plant extracts for use in textile processing can be a sustainable and environmentally friendly alternative to the current raw materials used by the market. This study aimed to make the physicochemical characterization of Amazonian plant extracts (copaiba oleoresin, Brazil nut oil, buriti oil, cocoa butter, tucumã butter and cupuaçu butter), prepare emulsions and perform preliminary applications in textile. The physicochemical characterization was performed by analytical instrumental techniques, such as FTIR spectroscopy and gas chromatography with FID detection (GC-FID). Furthermore, the determination of the Hydrophile-Lipophile Balance (HLB) was performed of the emulsions prepared from the extracts studied; the emulsion more stable for selection extract for application by padding; evaluation of the oxidation of emulsions applied to the textile material at different temperatures (120 to 200C); and sensory evaluation provided by the touch emulsions compared to a industrial softener. The main results were that the Brazil nut oil and cocoa, tucumã and cupuaçu butters showed similar results in the analysis by FTIR; grease distribution by gas chromatography proved to be useful for the characterization of plant extracts; the HLB values for the reference analyzed the extracts were 7.51 to 10.72 are consistent with the literature (6 to 12); the extracts studied emulsified in the study conditions have no tendency to oxidation temperature; the global average of sensory analysis touch indicate somewhat lower than the commercial standard, however, cocoa and cupuaçu butter and Brazil nut oil showed the best results, with grades between 2.8 and 2.9 (on a scale of 1 to 5). Thus, it is noted that the results obtained can be used as the basis for further research in order to improve the formulations of emulsions for the production of fabric softeners or other products
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Desenvolvimento de emuls?es contendo ?leos vegetais para uso cosm?tico

Farias, Iury Einstein Gomes de 28 September 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:16:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 IuryEGF_DISSERT_partes_autorizadas.pdf: 116631 bytes, checksum: 3dcaa9a01c6b9b2ba123ac09b7c86c26 (MD5) Previous issue date: 2009-09-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / The fat acid esters and tocopherolic derivatives are of great economic interest in many industries. The sunflower oil, which had its rich constitution in these composites, is a very interesting raw material source for the job in some sectors as bio-carburants, bio-lubrificants, bio-surfactants, dispersing agents, food industries, medicines and cosmetics. A system emulsified steady from this oil can wide be used in the therapeutical one, therefore it is of easy acceptance for the patient, for being pharmaceutical forms that allow a better medicine administration. The chemical composition characteristics, rich in unsaturad fat acid and tocopherolic derivatives, the sunflower oil, make of the emulsified systems contend this oil a proposal promising for formularizations of pharmaceutical and cosmetic use with antirust and photoprotection. The general objective of this work was to apply the HLB beddings to determine the sunflower oil critical HLB and, from this, to be able to evaluate the ideal mixture of the constituent of this system through the study of the ternary diagrams for the determination of the ratio of constituent that will generate the emulsion most steady / Os ?steres de ?cidos graxos e os derivados tocofer?licos s?o de grande interesse econ?mico em muitas ind?strias. O ?leo do girassol, devido a sua constitui??o rica nesses compostos ? uma fonte muito interessante de mat?ria-prima para o emprego em v?rios setores como biocombust?veis, lubrificantes, biosurfactantes, dispersantes, ind?strias de alimentos, medicamentos e cosm?ticos. Um sistema emulsionado est?vel a partir deste ?leo pode ser largamente empregado na terap?utica, pois ? de f?cil aceita??o pelo paciente, por serem formas farmac?uticas que permitem melhor administra??o de um medicamento. As caracter?sticas da composi??o qu?mica, rica em ?cidos graxos insaturados e derivados tocofer?licos, do ?leo de girassol, fazem dos sistemas emulsionados contendo este ?leo uma proposta promissora para formula??es de uso farmac?utico e cosm?tico com a??es antioxidante e fotoprotetora. O objetivo geral deste trabalho foi aplicar os fundamentos de HLB para determinar o HLB cr?tico do ?leo de girassol e, a partir disso, poder avaliar a mistura ideal dos constituintes desse sistema atrav?s do estudo dos diagramas tern?rios para a determina??o da propor??o de constituintes que gerar? a emuls?o mais est?vel

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