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Estudo da influência de polimorfismos em il33 e il1rl1 na asmaQueiroz, Gerson de almeida January 2016 (has links)
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Dissertação Gerson 2016.pdf: 3140570 bytes, checksum: f563f94e781752cf57592ebd916b6bc8 (MD5) / CAPES / Asma e atopia são condições determinadas por fatores ambientais e genéticos Vários estudos de associação do genoma têm sido realizados para tentar entender os componentes genéticos de tais condições. Os genes IL33 e IL1RL1 são os mais replicados em estudos do tipo GWAS em todo o mundo. A citocina IL-33 e o seu receptor ligado à membrana (ST2L) ou sua forma solúvel (sST2), em conjunto são potentes moduladores de inflamação do tipo Th2. Quando ligada ao ST2L, IL-33 produzida por múltiplas células da resposta inata e adaptativa, induz citocinas pró-inflamatórias, tais como IL-4, IL-5 e IL-13, aumentando a resposta e inflamação Th2, principal característica da asma e alergias. Por outro lado, quando a IL-33 se liga ao sST2, neutraliza o seu efeito, impedindo sua ligação ao ST2L. Vários polimorfismos nestes genes têm sido associados com a asma e atopia. Assim, os fatores genéticos que afetam IL33 e IL1RL1 podem influenciar a susceptibilidade para asma e atopia. Neste contexto, este estudo teve como objetivo avaliar a influência de polimorfismos em IL33 e IL1RL1 na asma e atopia em uma população Latina. Estratégias diferentes foram usadas para, um estudo de coorte de asma leve e um estudo caso-controle de asma grave. O alelo A para rs1041973 em IL1RL1 na coorte SCAALA foi positivamente associado com IL-5 produção (OR 1,36, IC 95% 1,09-1,84, P=0,044) IgE específica (OR 1,40, IC 95% 1,07-1,84, P=0,013) e SPT (OR 1,48, IC 95% 1,08-2,03, P=0,014), ambos contra o ácaro B. tropicalis. Além disso, indivíduos atópicos com o genótipo AA de rs1041973 mostraram uma diminuição da produção de sST2 comparado com indivíduos com os genótipos AC e CC (P <0,05). O alelo G do SNP IL33 rs12551256 foi negativamente associado com asma (OR 0,71, IC 95% 0,53-0,94, P=0,017). Em relação ao estudo caso controle do ProAR, o alelo A do rs1420101 em IL1RL1, foi positivamente associado com asma atópica (OR 1,29, IC 95% 1,05-1,66, P=0,046) e negativamente com FEV1 (BETA -2,37, IC 95% -4,67; -0,07, P=0,043). Além disso, este mesmo alelo mostrou uma diferença estatisticamente significate com uma menor produção de sST2 plasmático em indivíduos controle (P <0,001). O alelo C do rs2381416 foi positivamente associado com SPT para A. flavus. (OR 7,2, IC 95% 1,05-3,37, P=0,033), epitélio de cão (OR 1,52, IC 95% 1,19-3,47, P=0,009) e gato (OR 1,52, IC 95% 1,04-2,63, P=0,048). Estes dados sugerem que os SNPs nos genes IL33 e IL1RL1 podem ter um impacto sobre o desenvolvimento de asma e alergia na população brasileira. No entanto, mais estudos devem ser realizados para elucidar o impacto funcional de tais polimorfismos aqui descritos no desenvolvimento de asma e atopia. / QUEIROZ, Gerson de Almeida. STUDY OF INFLUENCE OF IL33 AND IL1RL1 POLYMORPHISMS IN SEVERE ASTHMA. 93f. 2016. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências da Saúde, Universidade Federal da Bahia.
Asthma and atopy are conditions determined by environmental and genetic factors. Several genome-wide association studies have been conducted to try to understand the genetic components of such conditions. The IL33 and IL1RL1 are the most replicated genes in GWAS studies worldwide. The cytokine IL-33 and its receptor, membrane bound (ST2L) or its soluble form (sST2) together are potent Th2-type inflammation modulators. When bound to ST2L, IL-33 produced by multiple cells of the innate and adaptive response, induce proinflammatory cytokines such as IL-4, IL-5 and IL-13, increasing the response and Th2 inflammation main feature of asthma and allergies. On the other hand, when IL-33 binds to sST2, neutralizes their effect by preventing its binding to ST2L. Several polymorphisms in these genes have been associated with asthma and atopy. Thus, genetic factors that affect IL33 and IL1RL1 may influence susceptibility to asthma and atopy. In this context, this study aimed to evaluate the influence of polymorphisms in IL33 and IL1RL1 in asthma and atopy in a Latino population. To verify that he have used to different strategies, a cohort study for mild asthma and a case-control study for severe asthma. The A allele for rs1041973 in IL1RL1 in SCAALA cohort was positively associated with IL-5 production (1.36 OR, 95% CI 1.09-1.84, p=0.044) specific IgE (OR 1.40, 95% CI 1.07-1.84, p=0.013) and SPT (OR 1.48, 1.08-2.03 95% CI, p=0.014), both against B. tropicalis mite. Furthermore, atopic individuals with the AA genotype of rs1041973 showed a decreased production of sST2 as compared to individuals with the AC and CC genotypes (P<0.05). The G allele of IL33 SNP was negatively associated with asthma (OR 0.71, 95% CI 0.53-0.94, p=0.017). Regarding the ProAR case control study the A allele of rs1420101 in IL1RL1 was positively associated with atopic asthma (OR 1.29, 95% CI 1.05-1.66, P=0.046) and negatively associated with FEV1 (BETA -2.37, 95% CI -4.67 ; -0.07, P=0.043). In addition, this same allele showed a statistically significant difference with a lower production of plasma sST2 in control subjects (P<0.001). The C allele of rs2381416 was positively associated with SPT to A. flavus. (OR 7.2, 95% CI 1.05 to 3.37, P = 0.033), dog (OR 1:52, 1:19 to 3:47 95%, P = 0.009) and cat epithelium (OR 1:52, 95% CI 1.04-2.63, P = 0.048). These data suggest that SNPs in IL33 and IL1RL1 genes may have an impact on the development of asthma and allergy in Brazilian population. However, further studies should be conducted to further elucidate the functional impact of such polymorphisms described herein in the development of asthma and atopy.
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Caracterização de polimorfismos em genes associados à imunopatogênese da infecção pelo Mycobacterium tuberculosisLeandro, Ana Cristina Camara Santiago January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2014-05-07 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / A tuberculose (TB) é a principal causa de morbi-mortalidade por doença infecciosa no mundo. A cada ano ocorrem cerca de 9 milhões de novos casos com aproximadamente 2 milhões de mortes, sendo que, somente 1 em cada 10 indivíduos desenvolvem a doença. Fatores genéticos do hospedeiro podem influenciar no controle da susceptibilidade à doença. Desta forma, este trabalho teve como objetivo a caracterização de polimorfismos genéticos associados à imunopatogênese da TB. Para tanto, foram incluídos 172 pacientes com TB pulmonar ativa e 173 indivíduos controle sadios. Foi realizada a extração de DNA em todos os participantes deste estudo e os polimorfismos foram caracterizados para: NOS2A (-954G\2192C), IFNG (+874T\2192A), receptor de vitamina D (VDR) (TaqI, FokI, BsmI e ApaI) e proteína transportadora da vitamina D (DBP) (HaeIII e StyI). Não foi possível determinar nenhuma associação com o desenvolvimento da TB em relação aos polimortismos genéticos descritos neste estudo
No entanto, quando ajustamos a casuística em relação ao sexo e raça podemos verificar que o polimorfismo no gene VDR determinado pela enzima de restrição TaqI foi associado com o desenvolvimento da TB em nossa população. Apesar de não observarmos significância estatística em relação aos outros polimorfismos deste gene VDR (FokI, BsmI e ApaI), foi possível obervar que cinco das dezesseis possíveis combinações genéticas foram consideradas raras, sendo seis delas encontrados em cerca de 74,8%, tanto nos pacientes com TB quanto nos indivíduos controle. Apesar de não terem sido observadas diferenças estatísticas nos polimorfismos dos genes avaliados neste estudo, estes devem ser considerados de extrema importância na compreensão da ação do sistema imune bem como a expressão de seus produtos no desenvolvimento da TB, em células infectadas ou não pelo Mtb. Desta forma, análises funcionais em relação a estes genes e seus produtos estão em andamento para tentarmos esclarecer esta associação e possivelmente assegurar seu papel no desenvolvimento da tuberculose em nossa população / Tuberculosis (TB) is the main cause of morbid-mortality by an infection
disease worldwide. Each year 9 million new cases occur with approximately 2 million
deaths, and among them, only 1 in each 10 persons will develop the disease. Host
genetic factors can influence the control of the disease susceptibility, thus, the
objective of this study was to characterize the genetic polymorphisms associated
with the immunopathogenesis of TB. We included 172 active TB patients and 173
health control individuals. The DNA extraction was carried out in all the participants
of this study and the polymorphisms were characterized for: NOS2 (-954G→C),
IFNG (+874T→A), vitamin D receptor (VDR) (TaqI, FokI, BsmI e ApaI) and vitamin D
binding protein (DBP) (HaeIII and StyI). It was not possible to demonstrate any
association with the development of the TB regarding the genetic polymorphisms
described in this study. However, when we adjusted the cases and healthy controls
by matching sex and race we could verify statistical significance in the TaqI
restriction site in the VDR gene, meaning that this restriction site may be associated
with TB susceptibility in our population. Besides the lack of association among the
other polymorphisms sites in theVDR gene (FokI, BsmI e ApaI), we could observe
that five of sixteen genotype combinations were rare, although, six of them were
found in aproximatelly 74,8% of TB cases and control individuals. Regardless of
statistical differences among the evaluated polymorphisms in this study not being
observed, those genes must be considered of extreme importance to understand the
immune system actions as well as its product expression on TB development, in
cells infected or not by Mtb. Thereby, studies in our population are in progress to try
to identify the functional role of IFNG, NOS2A, VDR e DBP SNPs since their
secreted products are relevant to the innate and adaptive immune response against
Mycobacterium tuberculosis.
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Imunização genética contra infecção experimental por Leishmania (Viannia) braziliensis / Genetic immunization against experimental infection by Leishmania (Viannia) braziliensisSalay, Gerson [UNIFESP] January 2006 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2006 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A Leishmania (Viannia) braziliensis é o agente etiológico de mais de 90% dos
casos de leishmanioses cutânea e mucocutânea no Brasil. Apesar da alta freqüência no
Brasil, poucos estudos de vacinação estão descritos utilizando esta espécie de
Leishmania. Com intuito de iniciar os estudos de vacinação experimental contra as
leishmanioses cutânea e mucocutânea causada por L. (V.) braziliensis, isolamos os
genes que codificam os antígenos LACK, TSA, LeIF e LbSTI1 desta espécie. Os
genes foram caracterizados segundo sua seqüência de DNA e transcrição de mRNA
nas diferentes formas do parasita. Observamos alta conservação na seqüência predita
de aminoácidos quando comparamos as espécies L. (V.) braziliensis e L. (L.) major
com identidades de 83% a 96%. Observamos também a presença de mRNA tanto nas
formas promastigotas como amastigotas de L. (V.) braziliensis. Em seguida, inserimos
estes genes em vetores para expressão em células eucarióticas e procarióticas. As
proteínas recombinantes bacterianas foram inicialmente utilizadas para imunização de
camundongos. Os anticorpos específicos foram utilizados para confirmar a expressão
destes antígenos nas formas promastigotas e amastigotas de L. (V.) braziliensis.
Posteriormente, observamos que a imunização de camundongos com plasmídios e
proteínas recombinantes dos respectivos antígenos, induziu a produção de anticorpos
específicos, com diferenças na magnitude e tipos de subclasse de anticorpo, assim
como linfócitos produtores de IFN-γ. Por fim, analisamos a imunidade protetora após
o desafio com formas promastigotas de L. (V.) braziliensis. Observamos que a resposta
imune desencadeada pela imunização não foi suficiente para reduzir a lesão primária
da infecção experimental.
Desta parte de nossos estudos concluímos que: i) os quatro antígenos por nós
clonados de L. (V.) braziliensis possuem potencial para utilização em estratégias de
imunização contra infecção experimental por parasitas do gênero Leishmania; ii) as
diferentes estratégias de imunização utilizadas não foram capazes de induzir
significativa imunidade contra a infecção experimental com L. (V.) braziliensis.
Em paralelo, estudamos o papel da molécula “glucocorticoid-induced tumor
necrosis factor family-related receptor” (GITR) durante a infecção experimental com
L. (L.) major. Inicialmente, observamos que camundongos geneticamente deficientes
que não expressam a molécula GITR foram mais resistentes à infecção, quando
comparados ao grupo de animais selvagens. Este aumento na resistência correlacionou
com o aumento no número de células T CD4+
produtoras de IFN-γ presente no sítio de
infecção. Complementamos estes experimentos, estudando o efeito do tratamento com
anticorpos anti-GITR nesta infecção. Observamos que o tratamento com este anticorpo
levou a diminuição do número de parasitas no sítio da lesão quando comparado ao
grupo controle de animais. Este fenômeno foi correlacionado com a quantidade de
IFN-γ produzida por células do linfonodo de drenagem. Destes experimentos pudemos
concluir que a molécula GITR tem um papel crítico durante a leishmaniose cutânea
causada por L. (L.) major, e que anticorpos anti-GITR tem um potencial para serem
utilizados em estratégias de vacinação contra a leishmaniose cutânea potencializando a
resposta imune específica. / Leishmania (Viannia) braziliensis is responsible for more than 90% of the cases
of cutaneous and mucocutaneous leishmaniasis in Brazil. In spite of the high
frequency of this parasite in Brazil, few studies of vaccination using this species of
Leishmania are described. Aiming at initiating these studies of experimental
vaccination against cutaneous and mucocutaneous leishmaniasis caused by L. (V.)
braziliensis, we isolated the genes encoding the antigens LACK, TSA, LeIF e LbSTI1.
The genes were characterized according to their DNA sequence and mRNA
transcription in the different forms of the parasite. We observed a high conservation in
the predicted amino acid sequences when we compared the species L. (V.) braziliensis
and L. (L.) major. The identities varied from 83% to 96%. We also observed the
presence of mRNA in both forms of L. (V.) braziliensis (promastigotes and
amastigotes). Subsequently, we cloned these genes into vectors which allowed their
expression into eukaryotic or prokaryotic cells. The bacterial recombinant proteins
were initially used to immunize mice. Specific antibodies were used to confirm the
expression of these antigens in promastigotes and amastigotes of L. (V.) braziliensis.
Subsequently, we observed that the immunization of mice with recombinant plasmids
and recombinant proteins representing the distinct antigens induced specific antibodies
and IFN-γ producing T cells. Finally, we evaluated the degree of protective immunity
after a challenge with promastigotes forms of L. (V.) braziliensis. We observed that the
immune response induced by immunization was not sufficient to reduce the primary
lesion caused by infection.
From these results we concluded that: i) all four antigens isolated from L. (V.)
braziliensis have the potential to be used for immunization against experimental
infection by different species of Leishmania; ii) the different strategies of
immunization used were not capable of inducing significant immunity to experimental
infection with L. (V.) braziliensis.
In parallel, we studied the role of the glucocorticoid-induced tumor necrosis
factor receptor family-related protein (GITR) during infection with L. (L.) major.
Initially, we observed that genetically deficient mice which do not express GITR were
more resistant to infection when compared to wild type animals. The resistance
correlated with the increased number of IFN-γ producing CD4+
T cells in the infection
site. We complemented these experiments, studying the effect of the treatment with
antibodies to GITR during infection. We observed that treatment with these antibodies
led to reduction in the number of parasites in the lesion site when compared to control
animals. The reduction was correlated with the amount of IFN-γ produced by lymph
node cells. From these experiments we concluded that GITR has a critical role during
cutaneous leishmaniasis caused by L. (L.) major and that antibodies to GITR may have
a potential to be used for vaccination against cutaneous leishmaniasis improving the
specific immune response. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Associação de polimorfismos no gene IFIh1 com a diabetes tipo 1 e outras doenças autoimunesMOURA, Ronald Rodrigues de 31 January 2014 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T15:20:48Z
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Previous issue date: 2014 / CAPES; CNPq; FACEPE / Diabetes mellitus tipo 1 (DM1) é uma doença autoimune multifatorial
caracterizada por danos e destruição de células-beta, nas Ilhotas de Langerhans no
pâncreas, reduzindo ou inviabilizando a produção de insulina. Estudos apontam que
infecções virais, principalmente enterovírus, têm sido consideradas um dos principais
fatores ambientais associados com a DM1. A proteína codificada pelo gene Helicase
C induzida por interferon tipo 1 (IFIH1) participa do reconhecimento de vírus de
dsRNA e no desenvolvimento da DM1, o que sugere uma possível etiologia viral da
DM1 e outras desordens autoimunes como a doença autoimune da tireóide (DAIT) e
doença celíaca (DC). Este estudo teve como objetivo avaliar a associação entre os
polimorfismos de base única (SNP) não-sinônimos do IFIH1 rs3747517, rs1990760 e
rs10930046, além do tag-SNP rs6432714, com a DM1 e a insurgência de DC e DAIT
nesses pacientes. Não foi observada associação desses SNPs com o
desenvolvimento da DM1, nem com a insurgência de DC ou DAIT. Entretanto, o tag-
SNP rs6432714 indicou uma tendência de associação apenas com o
desenvolvimento da DM1 (P=0,0365). A Análise in silico do domínio helicase indicou
um aumento na estabilidade da proteína, quando ocorre a mutação H460R,
entretanto essa variação estrutural observada não parece ser suficiente para causar
uma deficiência na detecção do dsRNA viral. Apesar da evidência de nãoassociação
do rs1990760 na população estudada, uma meta-analise realizada
confirma a associação dessa variante com a DM1.
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Defeitos genético-moleculares e aspectos clínicos de pacientes com síndrome de hiper IgM autossômica. / Molecular-genetic defects and clinical spectrum of autosomal hyper IgM syndrome in Brazilian patients.Klaver, Stefanie Gomes 09 September 2011 (has links)
A síndrome de HIGM é uma imunodeficiência, caracterizada por níveis séricos normais ou elevados de IgM associados com baixos níveis de IgG, IgA e IgE. Neste estudo investigamos pacientes com HIGM autossômico recessivo. Selecionamos 15 pacientes com diagnóstico clínico sugestivo de AR-HIGM, 10 do sexo feminino, 05 do sexo masculino, onde onze são brasileiros, um é francês e três são turcos, com idades que variam de 2 a 40 anos. Todos os pacientes apresentam infecções recorrentes: 100% pneumonias, 80% otites médias agudas, 53% sinusites, 46% amigdalites, 40% diarréias 26% infecções urinárias, uma apresentou micobacteriose cutânea. Encontramos as seguintes mutações no gene AICDA: Pacientes EJ e GF, mutação missense na base 260 do cDNA (c.260G>C; p. Cys87Ser). Pacientes DA e RC apresentam defeito de splice, acarretando na deleção total do exon 4 do gene AICDA. Os pacientes estrangeiros foram previamente estudados para os genes AICDA, UNG e CD40, e nenhuma alteração foi encontrada. Neste caso, estudamos o gene INO80, e encontramos nos exons 04 (g.24012 G>A) e 26 (g.99976 G>T) do gene INO80, duas mutações missense em heterozigose no DNAg do paciente OD. O estudo molecular e genético é importante para a realização do diagnóstico diferencial, estratégia terapêutica e prognóstico dos casos. / HIGM syndrome is a rare immunodeficiency characterized by high or normal levels of serum IgM associated with low levels of IgG, IgA and IgE. We selected 15 patients with clinical diagnosis suggestive of AR-HIGM, 10 females, 05 males, where 11 are Brazilian, one is French and three are Turkish, with ages ranging from 2 to 40 years. All patients had recurrent infections: 100% pneumonia, 80% acute otitis media, 53% sinusitis, 46% tonsillitis, 40% recurrent diarrhea, 26% urinary tract infections, 20% stomatitis, and one patient presented a cutaneous mycobacteriosis. 20% of the patients had opportunistic infections: Mycobacterium marinum, Toxoplasma gondii, varicella-zoster virus, Pseudomonas aeruginosa, fungus, and Mycobacterium tuberculosis. As a result, we found two types of mutations in 4 diferent patients with no consanguinity. We found in AICDA gene the following mutations: Patients EJ and GF missense mutation in base 260 in cDNA, which results in a change of aminoacid (c.260G> C; Cys87Ser p.). Patients DA and RC showed a splice defect, resulting in a complete deletion of exon 4 in AICDA gene. All other patients were sequenced for AICDA, UNG and CD40 genes, and no changes were found. In this case, we studied the INO80 gene, and we found in exons 04 (g.24012 G> A) and 26 (g.99976 G> T) INO80 gene, two heterozygous missense mutations in DNAg of patient OD. Since these molecular genetic defects result in similar clinical features, molecular and genetic studies are important for the differential diagnosis, therapeutic strategy and prognosis of the cases.
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Papel da Arg127 na conformação estrutural e secreção de Fator H, importante proteína reguladora da via alternativa do sistema complemento / Role of Arg127 for complement regulatory Factor H structural conformation and secretion.Albuquerque, José Antonio Tavares de 13 September 2011 (has links)
A Via Alternativa é a principal via de ativação do sistema complemento (SC), sendo o Fator H (FH) um de seus principais reguladores. No presente estudo, nós investigamos os mecanismos moleculares pelo qual o paciente com a mutação Arg127His no FH possui deficiência do SC. Para isto, utilizamos fibroblastos de paciente e individuo normal estimulados com IFN-<font face=\"Symbol\">g e verificamos que as células do paciente eram capazes de produzir FH, contudo a maior parte das proteínas estava retida no retículo endoplasmático (RE). Em paralelo, transfectamos células Cos-7 com plasmídeos contendo a mutação CG453T<font face=\"Symbol\">® CA453T e observamos que a mutação foi responsável pelo retardo na secreção de FH. Apesar da mutação reduzir a secreção de FH, observamos que a capacidade de FH atuar como co-factor não foi afetada. Assim, avaliamos se o uso de chaperonas químicas poderia induzir a secreção da proteína e observamos que houve aumento na secreção de FH nos fibroblastos. Desta forma, propomos o uso desses fármacos como alternativa de tratamento para melhorar a sobrevida do paciente. / Factor H (FH) is one of the most important regulatory proteins of the alternative pathway of the complement system (CS). In this study, we investigated the consequences of FH Arg127His mutation to the secretion ratio of this protein by skin fibroblasts in vitro. We stimulated the FH synthesis from patient and normal control with IFN<font face=\"Symbol\">g when we observed that the patient cells were able to synthetize FH, however this mutant protein was mainly retained at the endoplasmic reticulum. In parallel, we transfected Cos-7 cells with plasmids containing CG453T<font face=\"Symbol\">® CA453T mutation and observed that the mutation was responsible for the delay in the FH secretion. Although the mutation reduced the FH secretion, we observed that the FH function was not affected. Thus, we evaluated whether the treatment with chemical chaperones could release FH to the culture supernant. We observed that patients fibroblasts treated increased the secretion of FH. In conclusion, we suggest the use of these chemical chaperones as a potential alternative therapeutic to improve the patients survival.
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Polimorfismo do HLA-G em pacientes com doenças inflamatórias intestinaisSchneider, Nutianne C. January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / Rational: The inflammatory bowel disease (IBD) represented by ulcerative retocolitis and Crohn’s disease is characterized for being an immunological systemic illness that presents the main clinical manifestations in gastrointestinal tract. This multifatorial disease is influenced by genetic factors that may predispose the development of the different symptoms of IBD. Some genes related to immune system already had been indicated as potentials in the development of the IBD. The HLA-G molecule is the of them. Although to present specific tecidual distribution and limited polymorphism compared with classic molecules of HLA, it’s expression can distinguishing in the chronic inflammatory processes, come to favor to the Th2 type Objective: To analyze the polymorphism insertion/deletion of 14 bp in éxon 8 of the region 3' UTR of the gene of the HLA-G with the purpose to verify if exists association between the IBD variants. Material and methods: 96 carrying patients of the IBD clinic in HSL-PUCRS had been evaluated. DNA genomic of these individuals was extracted, analyzing itself it region 3' referring UTR to the polymorphism insertion/deletion of 14pb in éxon 8 of the HLA-G.Delineation: Transversal. Results: The 96 patients with IBD had been subdivided in two groups, those with DC (n= 56) and those with RCU (n=40). It was become fullfilled analysis of the genotypic frequency in three groups: the homozygous for deletion (- 14bp/- 14bp) called Hd, the homozygous for insertion (+ 14bp/+ 14bp) called Hi and the heterozygous (- 14bp/+ 14bp) called Ht. The standard distribution of the genotype of the three sub-groups (Hd, Ht, Hi) when compared between the patients with DC, with RCU and controls was different (p = 0,013). The frequency of Hi genotype, was significantly lesser in the patients with DC (1. 8%) when compared with the group of patients with RCU (20. 0%) and to the group it has controlled (15. 2%) (p = 0,014). In the isolated comparison of the groups for situation DC vs RCU, OR = 13,8 (IC95%: 1,6 the 306,6; P < 0,01) and in situation DC vs Control OR = 9,87 (IC95%: 1,44 the 195,11; P < 0,01). The Hd frequency, was bigger in the patients with DC (50. 0%) when compared with the group of patients with RCU (30. 0%) and to the group it has controlled (36. 0%) (p = 0,08). Conclusion: We can suggest that the occurrence of the genotype of the insertion (+14bp) of the HLA-G that directs the standard of immune response for a Th2 type is lesser in the patients with DC, that present a standard of immune response Th1 type. Therefore, the genotype +14pb/+14pb of HLA-G seems to be contributing in the process of inflammation IBD. However the increase of the patients number for confirmation of this finding is essential. / Justificativa: A doença inflamatória intestinal (DII) representada pela retocolite ulcerativa (RCU) e pela Doença de Crohn (DC) caracteriza-se por ser uma doença imunológica sistêmica que apresenta as principais manifestações ao nível do trato gastrointestinal. É uma doença multifatorial onde fatores genéticos interferem na predisposição ao desenvolvimento dos diferentes sintomas presentes nessas patologias. Alguns genes relacionados ao sistema imune já foram indicados como alvos potenciais no desenvolvimento da DII. A molécula de HLA-G é uma delas. Apesar de apresentar distribuição tecido específica e polimorfismo limitado comparado às moléculas de HLA clássicas, pode ser expressa diferencialmente nos processos inflamatórios crônicos, vindo a favorecer respostas do tipo Th2. Objetivo: Analisar o polimorfismo inserção/deleção de 14 bp no éxon 8 da região 3’UTR do gene do HLA-G com a finalidade de verificar se existe associação entre as variantes com a DII. Material e métodos: Foram avaliados 96 pacientes portadores de DII pertencentes ao ambulatório de DII do HSL-PUCRS. Foi extraído DNA genômico desses indivíduos, analisando-se a região 3’ UTR referente ao polimorfismo inserção/deleção de 14pb no éxon 8 do HLA-G.Delineamento: Estudo transversal. Resultados: Os 96 pacientes com DII foram subdivididos em dois grupos, aqueles com DC (n = 56) e aqueles com RCU (n = 40). Realizou-se a análise da freqüência genotípica em três grupos: os homozigotos para deleção (- 14bp/- 14bp) chamados Hd, os homozigotos para inserção (+ 14bp/+ 14bp) denominados Hi e os heterozigotos (- 14bp/+ 14bp) chamados Ht. O padrão de distribuição do genótipo dos três subgrupos (Hd, Ht, Hi) quando comparado entre os grupos de pacientes com DC, grupo de pacientes com RCU e grupo controle foi diferente (p = 0,013). A freqüência de Hi foi significativamente menor nos pacientes com DC (1,8%) quando comparado ao grupo de pacientes com RCU (20,0%) e ao grupo controle (15,2%) (p = 0,014). Na comparação isolada dos grupos para a situação DC vs RCU observou-se um OR = 13,8 (IC95%: 1,6 a 306,6; P < 0,01) e na situação DC vs Controle um OR = 9,87 (IC95%: 1,44 a 195,11; P< 0,01). Já a freqüência Hd, foi maior nos pacientes com DC (50,0%) quando comparado ao grupo de pacientes com RCU (30,0%) e ao grupo controle (36,0%) (p = 0,08). Conclusão: Podemos sugerir que a ocorrência do genótipo da inserção (+14bp) do HLA-G que direciona o padrão de resposta imune para um padrão do tipo Th2 é menor nos pacientes com DC, que apresentam um padrão de resposta imune do tipo Th1. Portanto, O genótipo +14pb/+14pb de HLA-G parece estar contribuindo no processo de inflamação DII. No entanto é essencial o aumento do número amostral para confirmação deste achado.
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Avaliação da associação de polimorfismos presentes no cromossomo X com asma e atopiaMarques, Cintia Rodrigues 03 1900 (has links)
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TESE_CINTIA MARQUES.pdf: 774112 bytes, checksum: 4eb77463eb7b53260c945d76b45ec8f9 (MD5) / CAPES / Asma e atopia são condições determinadas por fatores genéticos e ambientais,
que podem atuar tanto independentemente quanto em interação. Diversos
estudos de associação ampla do genoma têm sido desenvolvidos para tentar
compreender quais componentes genéticos influenciam na asma. No entanto,
genes localizados no cromossomo X são frequentemente pouco representados.
Um dos genes localizados nesse cromossomo, o FOXP3, codifica uma fator de
transcrição que está diretamente relacionado à ativação e diferenciação de
células T regulatórias. Tais células constituem um importante mecanismo
relacionado ao controle de doenças alérgicas. Diversos polimorfismos já foram
descritos nas regiões codificante e regulatória do FOXP3, o que sugere que os
mesmos possam ter um impacto funcional sobre a proteína correspondente.
Desta forma, fatores genéticos que afetam o gene FOXP3 podem determinar
diferenças na susceptibilidade a doenças alérgicas, tais como a asma. Neste
contexto, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o impacto de
polimorfismos em genes localizados no cromossomo X, a exemplo FOXP3, no
desenvolvimento da asma e atopia. Para analisar a associação de
polimorfismos presentes no cromossomo X e asma, foi realizado um X-WAS
(Estudo da Associação Ampla do Cromossomo X). Já para verificar a
associação de polimorfismos no gene FOXP3 com asma e atopia foi realizado
um estudo de gene-candidato. Como resultados mais importantes destaca-se a
associação do polimorfismo rs12007907 no gene IL1RAPL com sintomas de
asma (P = 3.33x10-6; OR=0.49, 95% IC= 0.37 - 0.67) e níveis de produção de
IL-13 (p = 0.045) no X-WAS; a associação dos polimorfismos no gene FOXP3
rs2232368 (OR = 1,95; 95% IC= 1.04 – 3,66) com sintomas de asma,
rs2232368 (OR = 2,31; 95% IC= 1,16 – 4,59), rs3761549 (OR = 1,44; 95% IC=
1,028 – 2,018) e rs2280883 (OR = 0,836; 95% IC= 0,704 – 0,992) com atopia,
além da interação entre o rs2280883 no FOXP3 e infecção com EBV no
desenvolvimento de atopia definida por SPT (OR = 0,64; 95% IC: 0,47 – 0,87) e
IgE específico para aeroalérgenos (OR = 0,62; 95% IC: 0,46 – 0,83). Estes
achados sugerem que polimorfismos em genes do cromossomo X, dentre eles
FOXP3 e IL1RAPL, possuem impacto no desenvolvimento de asma e alergia
em nossa população. No entanto, novos estudos devem ser conduzidos na
tentativa de elucidar melhor o impacto funcional destes polimorfismos aqui
descritos no desenvolvimento de asma e alergia, além da replicação em outras
populações. / Asthma and atopy are conditions determined by genetic and environmental
factors, which can act independently and in interaction. Several Genome Wide
Association Studies has been conducted to try to understand which genetic
components influence asthma. However, genes located on the X chromosome
are often underrepresented. One of the genes located in this chromosome, the
FOXP3, encodes a transcription factor that is directly related to the activation
and differentiation of regulatory T cells. Such cells are an important mechanism
related to the control of allergic diseases. Several polymorphisms have been
described in coding and regulatory regions of the FOXP3, which suggests that
they may have a functional impact on the corresponding protein. Thus, genetic
factors affecting the FOXP3 gene can determine differences in susceptibility to
allergic diseases such as asthma. In this context, this study aimed to assess the
impact of polymorphisms in genes located on the X chromosome, such the
FOXP3, in the asthma and atopy risk. To analyze the association between
polymorphisms on chromosome X and asthma, it was carried out an X-WAS
(Study of Wide Association of Chromosome X). To verify the association of
polymorphisms in the FOXP3 gene with asthma and atopy, a gene-candidate
study was conducted. The meaningful results were the association of
rs12007907 polymorphism in IL1RAPL gene with asthma symptoms (p =
3.33x10-6; OR = 0.49, 95% CI = 0.37 - 0.67) and IL-13 production levels (p =
0.045) in X-WAS; furthermore we observed association of rs2232368 in the
FOXP3 gene with asthma symptoms (OR = 1.95; 95% CI = 4.1 - 3.66) and a
association with atopy for the rs2232368 (OR = 2.313; 95% CI = 1.16 to 4.59),
the rs3761549 (OR = 1.44; 95% CI = 1.03 to 2.02) and rs2280883 (OR = 0.836,
95% CI = 0.70 to 0.99). In addition, we reported an interaction between the
rs2280883 located on FOXP3 and infection with EBV in the atopy development
defined by SPT (OR = 0.64; 95% CI: 0.47 - 0.87) and specifc IgE to allergens
(OR = 0.62; 95% CI: 0.46 - 0.83). These findings suggest that polymorphisms in
genes of the X chromosome, including FOXP3 and IL1RAPL, have potential
impact on the development of asthma and allergy in our population. However,
further studies should be conducted to elucidate the functional impact of these
polymorphisms described in this study in the asthma and atopy, as well as
replication in other populations.
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Expressão heteróloga de proteínas do vírus da Hepatite A e avaliação da imunogenicidadeSilva Junior, Haroldo Cid da January 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O vírus da Hepatite A (HAV) é o principal agente etiológico das hepatites virais agudas e estima-se que ocasione 1,5 milhão de novas infecções no mundo anualmente. Apesar da eficácia apresentada pelas vacinas comerciais, a replicação do HAV em cultura de células é lenta e apresenta baixo rendimento, o que torna a sua produção difícil e dispendiosa. Nesse contexto, o uso de proteínas recombinantes do HAV pode representar uma alternativa ao modelo de vacina existente. O presente trabalho teve como objetivo expressar e avaliar a imunogenicidade das partículas virais destituídas de ácido nucleico (VLPs) e da proteína VP1 do HAV. As VLPs foram geradas a partir do sistema baculovírus/células de inseto através da infecção de células de inseto com baculovírus recombinantes contendo as regiões P1-2A e P3 do genoma do HAV. A poliproteína P1-2A foi expressa, clivada e se organizou em estruturas que continham epitopos conformacionais de neutralização. Partículas com características similares ao HAV foram identificadas por microscopia eletrônica, sugerindo que as proteínas expressas se montaram em VLPs. Em paralelo, a VP1 foi expressa nos sistemas baculovírus/células de inseto e Escherichia coli
Níveis mais elevados de expressão foram obtidos em E. coli, o que consequentemente aumentou a taxa de recuperação da proteína purificada. A VP1 derivada de E. coli foi utilizada nos ensaios de antigenicidade e mostrou reatividade frente aos soros de pacientes infectados pelo HAV, o que demonstra seu potencial como um marcador para diagnóstico. Para os estudos de imunogenicidade, a VP1 derivada de E. coli foi combinada a dois adjuvantes, o hidróxido de alumínio (A1(OH)3) e o adjuvante a base de saponina. A formulação VP1+A1(OH)3 induziu polarização da resposta Th2, enquanto que a formulação VP1r+saponina gerou um balanço maior entre as respostas Th1 e Th2. O adjuvante saponina permitiu a administração de uma dose menor da VP1 sem afetar a intensidade da resposta. Resultados preliminares sugerem que os anticorpos anti-VP1 induzidos pela formulação com saponina apresentaram reatividade cruzada com o HAV. Além disso, testes iniciais indicam que os camundongos imunizados com a VP1 em associação com ambos os adjuvantes apresentaram resposta anamnéstica contra o HAV. Os resultados aqui apresentados sugerem que a VP1 e as VLPs podem ser úteis para o desenvolvimento de uma nova vacina contra a Hepatite A / The hepatitis A virus (HAV) is the primary etiological agent of acute viral hepatitis and it is
estimated to cause 1.5 million of new infections each year worldwide. Despite the
effectiveness of commercial vaccines, the replication of HAV in cell culture is slow and has
low yield, which makes it difficult and expensive to manufacture. In this context, the use of
recombinant HAV proteins could represent an alternative model to the existing vaccines. This
study aimed to express and evaluate the immunogenicity of virus-like-particles (VLPs) and
VP1 protein of HAV. The VLPs were generated using the baculovirus/insect cell expression
system by the infection of insect cells with recombinant baculovirus containing HAV P1-2A
and P3 regions. The P1-2A polyprotein was successfully expressed, cleaved and organized
into structures that contained neutralizing conformational epitopes. HAV-like particles were
identified by electron microscopy, suggesting that the expressed proteins were assembled into
VLPs. In parallel, VP1 was expressed in both baculovirus/insect cell and Escherichia coli
expression systems. Higher protein levels were obtained in E. coli, which consequently
increased the recovery rate after protein purification. The E. coli-derived VP1 was then used
in antigenicity assays and showed reactivity against sera from patients infected with HAV,
demonstrating its potential as a diagnostic marker. For immunogenicity studies, the E. coliderived
VP1 was combined with two adjuvants, aluminum hydroxide (Al(OH)3) and the
saponin-based adjuvant. The VP1+Al(OH)3 induced Th2 polarization, while VP1+saponin
generated a Th1 and Th2 balanced immune response. Saponin-based adjuvant formulations
allowed the administration of lower dose of VP1 without affecting the intensity of the
response. Preliminary results suggest that the anti-VP1 antibodies induced by saponin-based
adjuvant showed cross-reactivity with HAV. Furthermore, initial tests indicate that
immunization of mice with VP1 in association with both adjuvants generated anamnestic
response against HAV. The results presented here suggest that VP1 and VLPs might be useful
to develop a new vaccine against hepatitis A. / 2016-07-10
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Defeitos genético-moleculares e aspectos clínicos de pacientes com síndrome de hiper IgM autossômica. / Molecular-genetic defects and clinical spectrum of autosomal hyper IgM syndrome in Brazilian patients.Stefanie Gomes Klaver 09 September 2011 (has links)
A síndrome de HIGM é uma imunodeficiência, caracterizada por níveis séricos normais ou elevados de IgM associados com baixos níveis de IgG, IgA e IgE. Neste estudo investigamos pacientes com HIGM autossômico recessivo. Selecionamos 15 pacientes com diagnóstico clínico sugestivo de AR-HIGM, 10 do sexo feminino, 05 do sexo masculino, onde onze são brasileiros, um é francês e três são turcos, com idades que variam de 2 a 40 anos. Todos os pacientes apresentam infecções recorrentes: 100% pneumonias, 80% otites médias agudas, 53% sinusites, 46% amigdalites, 40% diarréias 26% infecções urinárias, uma apresentou micobacteriose cutânea. Encontramos as seguintes mutações no gene AICDA: Pacientes EJ e GF, mutação missense na base 260 do cDNA (c.260G>C; p. Cys87Ser). Pacientes DA e RC apresentam defeito de splice, acarretando na deleção total do exon 4 do gene AICDA. Os pacientes estrangeiros foram previamente estudados para os genes AICDA, UNG e CD40, e nenhuma alteração foi encontrada. Neste caso, estudamos o gene INO80, e encontramos nos exons 04 (g.24012 G>A) e 26 (g.99976 G>T) do gene INO80, duas mutações missense em heterozigose no DNAg do paciente OD. O estudo molecular e genético é importante para a realização do diagnóstico diferencial, estratégia terapêutica e prognóstico dos casos. / HIGM syndrome is a rare immunodeficiency characterized by high or normal levels of serum IgM associated with low levels of IgG, IgA and IgE. We selected 15 patients with clinical diagnosis suggestive of AR-HIGM, 10 females, 05 males, where 11 are Brazilian, one is French and three are Turkish, with ages ranging from 2 to 40 years. All patients had recurrent infections: 100% pneumonia, 80% acute otitis media, 53% sinusitis, 46% tonsillitis, 40% recurrent diarrhea, 26% urinary tract infections, 20% stomatitis, and one patient presented a cutaneous mycobacteriosis. 20% of the patients had opportunistic infections: Mycobacterium marinum, Toxoplasma gondii, varicella-zoster virus, Pseudomonas aeruginosa, fungus, and Mycobacterium tuberculosis. As a result, we found two types of mutations in 4 diferent patients with no consanguinity. We found in AICDA gene the following mutations: Patients EJ and GF missense mutation in base 260 in cDNA, which results in a change of aminoacid (c.260G> C; Cys87Ser p.). Patients DA and RC showed a splice defect, resulting in a complete deletion of exon 4 in AICDA gene. All other patients were sequenced for AICDA, UNG and CD40 genes, and no changes were found. In this case, we studied the INO80 gene, and we found in exons 04 (g.24012 G> A) and 26 (g.99976 G> T) INO80 gene, two heterozygous missense mutations in DNAg of patient OD. Since these molecular genetic defects result in similar clinical features, molecular and genetic studies are important for the differential diagnosis, therapeutic strategy and prognosis of the cases.
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