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Caracterização de um novo vírus de ssDNA infectando fruteiras de clima temperado, e aspectos da interação molecular begomovírus-hospedeiro / Characterization of a new ssDNA virus infecting temperate fruit trees, and molecular aspects of the begomovirus-host interactionBasso, Marcos Fernando 27 February 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-19T07:31:49Z
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Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Fruteiras de clima temperado são de grande importância econômica mundial e são suscetíveis a diversos patógenos transmissíveis por insetos ou nematoides. Seu caráter perene e a propagação vegetativa resultam no aparecimento de diversas doenças complexas, algumas das quais ainda etiologicamente desconhecidas. Em pomares e vinhedos brasileiros frequentemente são observados sintomas de possível origem viral, mas os agentes não foram identificados. Com o objetivo de prospectar agentes virais associados a estas culturas, 74 amostras de fruteiras foram coletadas em diferentes regiões produtoras e avaliadas por PCR e RCA. Um novo vírus altamente divergente, monossegmentado, com genoma de ssDNA circular de aproximadamente 3.400 nucleotídeos, apresentando características moleculares semelhantes às de vírus classificadas nas famílias Circo-, Nano- e Geminiviridae foi detectado em plantas de macieira, pereira e videira. A associação com os hospedeiros foi confirmada e sua infectividade comprovada por meio de inoculação com um clone correspondente ao genoma completo. A análise de sequências e suas características moleculares indicam que este novo vírus poderá pertencer a um novo gênero ou família viral. Os begomovírus (família Geminiviridae) são patógenos de grande importância econômica em diversas culturas, principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Eles regulam, direta ou indiretamente, diversos mecanismos de defesa do hospedeiro, a exemplo da via dos pequenos RNAs (smRNAs), de forma a facilitar a infecção viral. O segundo objetivo deste trabalho foi avaliar o perfil de smRNAs em plantas de Nicotiana benthamiana infectadas pelo begomovírus Tomato yellow spot virus (ToYSV). Utilizando sequenciamento de nova geração, bibliotecas de smRNAs de plantas de N. benthamiana, sadias e infectadas com o ToYSV, foram sequenciadas a fim de investigar sua complexidade e compreender os mecanismos regulatórios envolvidos na patogênese. Os resultados indicam que os begomovírus são alvo das vias de silenciamento de RNA (VSR) nas etapas iniciais da infecção e que suas proteínas supressoras de silenciamento atuam in trans para interferir com as VSRs. O sucesso da infecção viral e a indução de sintomas estariam assim, ao menos em parte, correlacionados com a regulação negativa das VSRs, com a mudança do perfil de smRNAs e com a regulação da expressão de diversos genes do hospedeiro que transcrevem mRNAs e miRNAs. A proteína de movimento (MP) dos begomovírus bissegmentados é responsável pelo movimento célula-a-célula, indução de sintomas e na determinação da gama de hospedeiros. O terceiro objetivo deste trabalho foi identificar proteínas de hospedeiros do ToYSV candidatas a interagirem com a MP. Complexos proteicos provenientes de plantas expressando constitutiva- ou transientemente NTAPi-MP foram purificados, seguido de identificação por espectrometria de massas. Entretanto, não foi possível encontrar proteínas que interagissem com MP do ToYSV. Ensaios de pull-down com a proteína MP fusionada a uma etiqueta de seis histidinas (6His-MP) identificaram 64 proteínas da planta candidatas a interagirem com a MP. Destas, 25 foram selecionadas para avaliação da interação pelo sistema duplo-híbrido em levedura, contudo, os resultados foram negativos para todas as 25 proteínas. / Temperate fruit trees are of great economical importance worldwide and are susceptible to several insect or nematode-transmitted pathogens. Their perennial nature and vegetative mode of propagation result in the appearance of several complex diseases, some of which are aetiologically undetermined. In Brazilian orchards and vineyards, virus-like symptoms are often observed, but the causal agents have not been identified. With the objective of prospecting viral agents associated with these plants, 74 fruit tree samples were collected at different regions and evaluated by PCR and RCA. A novel, highly divergent virus with a monopartite circular ssDNA genome of approximately 3400 nucleotides, with molecular characteristics similar to viruses in the Circo-, Nano- and Geminiviridae families was identified in apple, pear tree and grapevine plants. Its association with the hosts was confirmed and its infectivity was proven by inoculation with a full-length genomic clone. Sequence analysis and molecular characteristics indicate that this novel virus will be classified in a new viral genus or family. Begomoviruses (Geminiviridae family) cause diseases of major economic importance in many crops, especially in tropical and subtropical regions. They regulate, directly or indirectly, several host defense mechanisms such as small RNA (smRNA) pathways so as to facilitate viral infection. The second objective of this work was to evaluate the profile of smRNAs in Nicotiana benthamiana plants infected by the begomovirus Tomato yellow spot virus (ToYSV). Using Next Generation Sequencing approaches, we sequenced smRNA libraries from healthy or ToYSV-infected N. benthamiana plants to understand their complexity and to explore the regulatory mechanisms involved in pathogenesis. The results indicate that begomoviruses are targets of RNA silencing pathways (RSP) early in the infection and that their silencing suppressor proteins act in trans to interfere with RSP. The success of viral infection and the appearance of ToYSV-induced symptoms may be correlated, at least in part, with RSP downregulation, smRNA profile change and regulation of expression of several host genes (mRNA- and miRNA-transcribing). The movement protein (MP) of bipartite begomoviruses is responsible for cell-to-cell movement, symptom induction and determination of host range. The third objective of this work was to identify host proteins that interact with the ToYSV MP. Protein complexes were purified from plants expressing NTAPi-MP either constitutively or transiently, followed by mass spectrometry-based identification. However, no candidate host proteins were identified. Pull-down assays using the MP with a six histidine tag (6His-MP) identified 64 candidate proteins, 25 of which were selected for evaluation of the interaction using the yeast two- hybrid system. However, results were negative for all 25 proteins.
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Identificação de interações proteína-proteína do fator de transcrição GmbZIPE2 de soja (Glycine max) / Identification of protein-protein interaction of the transcription factor GmbZIPE2 of soybean (Glycine max)Fontes, Patrícia Pereira 22 July 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-19T17:40:54Z
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Previous issue date: 2016-07-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Em vias de defesa envolvidas na interação planta/patógeno e planta/ambiente, a modulação da transcrição é etapa fundamental na ativação de respostas intracelulares. Esses mecanismos são regulados principalmente pelos fatores de transcrição (FT), que entre os mais estudados em plantas estão a família basic leucine zipper motif (bZIP). Interações dos bZIP com outras proteínas modulam a atividade destes transfatores por diversos mecanismos, e essa modulação afeta vias de transdução de sinais nas plantas. O GmbZIPE2 (Glyma05g168100.1) de soja tem sua expressão alterada em resposta à infecção por patógenos e ao tratamento com fitormônios de defesa, sugerindo que esse transfator possa estar envolvido em vias de sinalização de interação planta-patógeno. O objetivo deste trabalho foi identificar interações proteicas do GmbZIPE2 utilizando o ensaio de duplo-híbrido de leveduras. Identificamos que a proteína GmbZIPE2 foi capaz de interagir com G. max uncharacterized LOC100786585 (RbcX), identificada no Phytozome como Chaperonin-like Rbcx Protein, que atua como chaperona no dobramento da Rubisco, e a proteína G. max uncharacterized LOC100777895, cuja função biológica descrita no Uniprot é relacionada à montagem do fotossistema II (PSII). Uma vez que interage com proteínas envolvidas com a fotossíntese e que podem atuar como moléculas sinalizadoras do estado fotossintético da célula, o GmbZIPE2 pode estar relacionado à transmissão de sinais do cloroplasto para o núcleo, atuando na via de sinalização retrógada. / In defence pathways triggered after the plant /pathogen interaction and upon environment stress, the transcriptional modulation is a critical step for the activation of intracellular responses. This modulation is mainly regulated by transcriptional factors (TF). The basic leucine zipper family (bZIP) is the most studied TF in plants. The interaction between bZIP and other proteins modulates the activity of these transcriptional factors by several mechanisms, and that modulation affects the signal transduction pathways. The GmbZIPE2 (Glyma05g168100.1) is responsive to pathogen infection and treatment with phytohormones related to defense, suggesting that GmbZIPE2 is part of pathogen response signaling pathways in soybean. The aim of this study was to identify protein that can interact with GmbZIPE2 using yeast two-hybrid. We found that the GmbZIPE2 was able to interact with G. max uncharacterized LOC100786585 (RbcX), identified in Phytozome as Chaperonin-like Rbcx Protein, that acts as chaperone in folding of Rubisco, and the G. protein max uncharacterized LOC100777895, that was described to the assembly of photosystem II (PSII). These interactions suggest that GmbZIPE2 can be related to signal transmission from chloroplast to the nucleus.
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Chapa : um agente de interface para ferramentas de bate-papo em ambientes de ensino a distancia da WebLachi, Ricardo Luís, 1977- 27 May 2003 (has links)
Orientador: Heloisa Vieira da Rocha / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-03T16:14:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2003 / Resumo: A educação à distância se caracteriza pelo não existência, parcial ou total, do elemento 'presencial' na relação de aprendizagem professor-aluno. Isto é, o professor e aluno encontram-se em localidades distintas (fora de uma sala de aula) e necessitam do uso de um canal de comunicação para mediar a interação. Nos últimos anos, a educação à distância, via ambientes que utilizam a Internet como meio de comunicação, tem aumentado significativamente. Esses ambientes caracterizam-se por disponibilizar inúmeras ferramentas que dão suporte ao processo de comunicação via rede (ferramentas de bate-papo, correio eletrônico, grupos de discussão). Na literatura existem inúmeros artigos que relatam o enorme volume de trabalho necessário por parte de um professor de um curso à distância para poder acompanhar adequadamente o desenvolvimento dos alunos. Com o intuito de auxiliar o professor nessa tarefa de acompanhar o desenvolvimento dos alunos de um curso à distância foi desenvolvido o agente de interface Chapa descrito em detalhes nesta dissertação. O foco do Chapa é ajudar na análise das contribuições dos participantes de uma sessão de bate-papo ocorrida no ambiente de Educação à Distância TelEduc. Nesse sentido, o Chapa é capaz de selecionar quais as mensagens mais interessantes a um determinado usuário permitindo a este analisar somente uma fração do número total de mensagens existentes em uma sessão. Essa seleção é feita com base em um dicionário de dados específico, que constrói para cada usuário, por meio das técnicas de aprendizagem inerentes ao conceito de agentes de interface. Neste trabalho, já são apresentados alguns testes preliminares feitos com o Chapa por um grupo de usuários. No entanto, mesmo tendo sido bastante positivos os resultados desses testes iniciais, ainda é necessária a realização de outros mais, em situações reais de um curso à distância, para se validar melhor o Chapa / Abstract: Distance education is characterized by the partial or total absence of the "presential" element in the teacher-student relationship, that is, teacher and student are far ftom each other and need to use a communication channel to media te the interaction. In the last few years, distance education based on environments that use Internet as a communication channel has grown larger and larger. These environments make available many tools that support communication through the Internet (for example: chat, e-mail, newsgroup). In the literature, many articles relate the large amount of work needed by the teacher of a distance course to accompany properly the development of the students. In order to help the teacher with the task of accompanying the development of the students in a distance course we developed the interface agent Chapa, described in details in this dissertation. Chapa's focus is on helping the analysis of participants' contributions to a chat session that took place in T elEduc, a supporting environment for distance education. In order to do that, it is capable of selecting which messages are more interesting to one user, allowing him to analyze only a ftaction of the total number of messages that exist in a session. lt is able to do this selection based on a specific data dictionary which is built for each user by means of learning techniques inherent to the technology of interface agents. In this work, some preliminary tests were done with Chapa. However, even though the results were very positives, it is still necessary to realize more tests in real world courses in order to better proofChapa's effectiveness / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação
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Abordagem dos elementos da experiência do usuário aplicada ao design de uma interface de webmail acessívelSOARES FILHO, Antônio Gerard Tenório 31 August 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-04-22T19:40:36Z
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Previous issue date: 2015-08-31 / CAPES / Esta pesquisa investiga a forma como pessoas cegas ou com baixa visão utilizam
serviços de e-mail, a partir de uma abordagem qualitativa associada ao Design de
Interação (DI), em busca de problemas. Ainda na perspectiva do DI, é elaborada
uma proposta de solução para um dos problemas encontrados. A concepção da
proposta utiliza-se de técnicas e recursos como, wireframes, documentos de
requisitos, fluxos navegacionais, diagramas e modelos conceituais para representar
as características do sistema. Por fim é desenvolvido um protótipo interativo,
baseado em HTML/CSS e JavaScript, para realização de testes com usuários e
implementação de melhorias, obtidas por meio do feedback e da análise do material
coletado. / This research investigates how visual impaired people use e-mail services, from a
qualitative approach associated to Interaction Design (ID), in the pursue of problems.
Proceeding with the DI perspective, it has been drafted a solution for one of the
problems encountered. The proposal was structured with techniques and resources
as wireframes, requirements documents, navigational flows, diagrams and
conceptual models to represent the characteristics of the system. Finally it was
developed a high-fidelity interactive prototype, based on HTML / CSS and JavaScript,
to conduct user testing and implementation of improvements obtained through the
feedback and analysis of the collected material.
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O homem satelite : estetica e mutações do corpo na sociedade tecnologicaCouto, Edvaldo Souza 24 July 2018 (has links)
Orientador: Vani Moreira Kenski / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação / Made available in DSpace on 2018-07-24T08:35:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1998 / Doutorado
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Escrever se aprende reescrevendo : um estudo da interação professor/aluno na revisão de textosGrillo, Sheila Vieira de Camargo 25 August 1995 (has links)
Orientador: Raquel Salek Fiad / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Estudos da Linguagem / Made available in DSpace on 2018-07-20T15:56:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1995 / Resumo: Esta pesquisa está embasada em uma teoria sócio-interacionista, segundo a qual o conhecimento é constituído na dinâmica das interações sociais. O objeto de estudo é a interação professor/ aluno em atividades de revisão ou reescrita de textos. Estas atividades são encaradas como constitutivas da modalidade escrita da linguagem. O foco de estudo é o modo como as orientações da professora/pesquisadora interferem na reescrita de textos de dez alunos de uma sétima série de um curso supletivo. A seleção dos alunos foi feita usando como critério o desempenho na escrita, ou seja, procurou-se escolher alunos em diferentes estágios de familiaridade com a escrita. A análise dos textos foi feita observando como os comentários escritos na primeira versão dos textos dos alunos interferiram nas alterações ocorridas na segunda versão. Verificou-se que o sucesso das atividades de reescrita dependeu tanto do tipo de orientação do professsor, quanto da habilidade do aluno em alterar seu texto. Orientações que explicitavam o problema e apresentavam possíveis soluções tiveram mais chance de serem respondidas adequadamente, do que aquelas que somente explicitavam o problema. Alunos com uma maior familiaridade com a escrita apresentaram mais fàcilidade para reescrever seus textos seguindo as instruções escritas do professor. Entretanto, fatores relativos à história pessoal dos alunos como o contato extra-escolar com a escrita, a ocupação profissional, a militância em movimentos políticos, e fatores relativos ao tipo de ensino como os textos utilizados na preparação para a produção e o tipo de texto proposto também interagiram no processo de reescrita, interferindo na interação professor/aluno / Abstract: This research is based on a socio-interactionist theory 01' language in which knowledge is constituted in the dynarnic 01' social interactions. The subject 01' study is the interaction between teacher and students in revising texts. The focus 01' study is the way the teacher/researcher's instructions interfere in the revision 01' the texts written by ten 7th grade adults. The choice 01' the students was made on the basis 01' writing development, that is, students in different stages 01' writing acquisition were chosen. The analysis was made by observIDg how writing instructions made by the teacher in the first version 01' the texts interfered in their rewriting. It was observed that success in rewriting depended both on the teacher's instructions and on the student's ability to rewrite bis texto The more explicit instructions were more adequately answered and students with higher proficiency in writing revised their texts easier according to the teacher's instructions. Nevertheless there are other factors that contributed to the revision proccess such as the degree 01' literacy at home, the profession, the participation in political activities as well as the kind 01' texts used at school for reading and writing. All these factors were present in the studentlteacher interactions / Mestrado / Mestre em Linguística
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Um estudo da confabulação no contexto neuropsicologico : o discurso a deriva ou as sem-razões do sentidoMorato, Edwiges Maria, 1961- 31 August 1995 (has links)
Orientadores: Maria Irma Hadler Coudry, Ingedore G. Villaça-Koch / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Estudos da Linguagem / Made available in DSpace on 2018-07-20T18:06:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1995 / Resumo: A confabulação, na pesquisa clínico-cognitiva, se presta a muitos e diferentes entendimentos. Aparece na literatura neuropsicológica, especialmente, como um item semiológico das síndromes amnésicas, demenciais e afásicas. Embora suas causas e
mecanismos cognitivos não estejam ainda devidamente elucidados, admite-se que esteja relacionada com as alterações de memória e de consciência. Ainda que a confabulação seja um fenômeno discursivo indiscutível, a linguagem ou o linguístico não surgem para o campo que tradicionalmente se tem dedicado a ela de maneira constitutiva ou, pelo menos, relevante. Dedicamo-nos, neste trabalho, a averiguar seus componentes linguísticos, pragmáticos e interativos, bem como a discutir os termos do meta-discurso clínico sobre a confabulação. O objetivo é tomar a (discussão sobre) confabulação como um expediente interessante para o estudo do quadro relacional entre linguagem e cognição. Levando em conta dados obtidos no contexto patológico, em especial, e também no contexto normal, e considerando as situações discursivas e as atividades enunciativas em meio às quais a confabulação ocorre, procuramos refutar, teórica e empiricamente, as propostas explicativas da abordagem clínica tradicional. Como o estudo da confabulação, para nós, diz respeito a diversos processos que estão em jogo na construção da significação, ele pode subsidiar as investigações que se
projetam nas áreas da Linguística que se interessam pela relação de reciprocidade entre linguagem e cognição. Ao contrário do que tem feito a abordagem (neuro)psicológica da confabulação, todo nosso empenho é mostrar que, em se tratando de processos cognitivos dito "superiores", como a memória ou o pensamento, a linguagem e o discursivo não podem ser alijados. Em se tratando de confabulação, de memória ou de produção de consciência, poderíamos afirmar, como o fez Foucault a respeito da relação do homem com as coisas do mundo: Aqui há linguagem / Abstract: The confabulation, in the clinical cognitive research, has many different interpretations. It appears in the neuropsychological literature as a semiological item of amnesia, dementia and aphasic syndromes. Althought its causes and cognitive
mechanisms have not been properly elucidated, it is accepted as related to memory and consciousness alterations. Althought the confabulation is unarguably a discoursive phenomenon, it has not been taken as an object of research by neuropsychology. Through this work, we aim to evaluate its linguistic, pragmatic and interactive components, as welI as discussing the metadiscourse terms about confabulation. The objective is to discuss confabulation considering this phenomenon as interesting to the study of the relation patterns between language and cognition. In view of the data obtained in the normal and pathological contexts and considering the discoursive situations and enunciative activities among which the confabulation occurs, we try to deny theoretically and empirically, the explicative proposals of the traditional clinical approach of confabulation, all our efforts are turned to demonstrate that, in the case of 'superior' cognitive processes, like memory and thinking, the language and the discoursive should not be Kept apart from the cognitive system configuration. About confabulation, we could state, like Foucault. Here, there is language / Doutorado / Doutor em Ciências
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Design de ambientes computacionais para modelagem em um contexto educacionalOliveira, Osvaldo Luiz de 14 September 1995 (has links)
Orientador: Maria Cecilia Calani Baranauskas / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-20T17:32:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1995 / Resumo: Software para modelagem tem sido tradicionalmente digirido a profissionais experientes... / Abstract: Modeling tools have been directed to expert users, with formal competence in mathematics... / Mestrado / Mestre em Ciência da Computação
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O papel dos estilos de ensino e de aprendizagem na interação professor/alunoHeinrich, Sylvia Helena 29 September 1993 (has links)
Orientador : Eunice Ribeiro Henriques / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Estudos da Linguagem / Made available in DSpace on 2018-07-18T13:36:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1993 / Resumo: O objetivo deste trabalho é verificar o papel dos estilos de ensino/aprendizagem na interação professor (nativo)/aluno (não-nativo)...Observação: O resumo, na integra, podera ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Not informed. / Mestrado / Mestre em Linguística Aplicada
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Identidade e interação na sala de aula : pre/conceito e auto/conceitoOliveira, Ivone Martins de 18 July 2018 (has links)
Orientador : Ana Luiza Bustamante Smolka / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação / Made available in DSpace on 2018-07-18T14:33:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1993 / Resumo: Este trabalho tem como preocupação central o estudo dos processos envolvidos na elaboração da identidade do aluno. Questionando-se a respeito da forma como esta elaboração tem sido abordada por teorias que trabalham com a noção de autoconceito, busca no referencial teórico e metodológico da Perspectiva Sócio-Histórica em Psicologia um caminho para proceder a esta investigação. Ao basear-se em tais princípios teóricos e metodológicos. Coloca em destaque o processo social e histórico de elaboração da identidade. Mediada/constituída pelo outro, mediada/constituída pela palavra. Detendo-se particularmente no modo como o aluno se vê e se avalia. Este estudo focaliza as enunciações de crianças com traços físicos de negritude - e discriminadas por outras crianças e as Enunciações dos colegas dirigidas a estas crianças em situações de interação na sala de aula. No jogo do entrecruzamento entre as diversas falas destacadas na sala e outras falas que dizem sobre o"negro"/"preto" e sobre a"auto desvalorização" da "pessoa" , encontram-se elementos para tecer o fio dos sentidos que atravessam as enunciações de algumas destas crianças com traços físicos de negritude, ao falarem sobre si mesmas. bem como para a explicitação de aspectos sociais e históricos envolvidos na elaboração da identidade do aluno / Mestrado / Psicologia Educacional / Mestre em Educação
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