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Integrating the archaea, bacteria and fungi of the gut microbiome with human diet / Integrando arqueas, bactérias e fungos do microbioma intestinal humano com a dieta

Hoffmann, Christian 15 August 2013 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-24T20:12:44Z No. of bitstreams: 2 hoffmann_doctoralThesis_2013_final.v4_forPrint.pdf: 2888260 bytes, checksum: 4331871b2fa71a10777e85a507ba14c8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-09-24T21:00:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 hoffmann_doctoralThesis_2013_final.v4_forPrint.pdf: 2888260 bytes, checksum: 4331871b2fa71a10777e85a507ba14c8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-24T21:00:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 hoffmann_doctoralThesis_2013_final.v4_forPrint.pdf: 2888260 bytes, checksum: 4331871b2fa71a10777e85a507ba14c8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-08-15 / A dieta influencia a saúde sendo uma fonte de nutrientes e toxinas, e por moldar a composição de populações microbianas residentes no corpo humano. Estudos prévios começaram a mapear as associações entre a dieta e bactérias e vírus do microbioma intestinal humano. Este trabalho investiga as associações entre a dieta e populações arqueanas e fúngicas, tomando vantagem de amostras oriundas de 98 indivíduos bem caracterizados, e integra esses dados novos com o conhecimento corrente relacionado a bactérias e o microbioma intestinal humano. A dieta foi quantificada utilizando questionários que acessam a dieta usual e recente, e arquêas e fungos foram caracterizados usando genes marcadores obtidos de amostras fecais através e sequenciamento de DNA em larga escala de última geração. Foram encontrados 66 gêneros de fungos, geralmente com uma presença mutuamente exclusiva dos filos Ascomycota e Basidiomycota. Quanto as arquêas, Methanobrevibacter foi o gênero mais prevalente, presente em 30% das amostras. Diversas outras arquêas foram detectadas com abundancia e frequência mais baixa. Uma miríade de associações foi observada entre fungos e arquêas e a dieta, entre fungos e arquêas, e entre estes e linhagens bacterianas. Metanobrevibacter e Candida foram positivamente associados com uma dieta rica em carboidratos, e negativamente com dietas ricas em amino acidos, proteínas e ácidos graxos. Dados publicados previamente enfatizam que a estrutura das populações bacterianas no intestino são primariamente com hábitos alimentares de longo prazo, porém, uma abundancia alta de Candida foi fortemente associada com a ingestao recente de carboidratos. A abundância de Methanobrevibacter foi associada tanto com a ingestão usual ou recente de carboidratos. Estes resultados confirmam estudos direcionados anteriores e provém varias novas associações a serem consideradas quando modelando os efeitos da dieta no microbioma intestinal e a na saúde humana. / Diet influences health as a source of nutrients and toxins, and by shaping the composition of resident microbial populations. Previous studies have begun to map out associations between diet and the bacteria and viruses of the human gut microbiome. This work investigates associations of diet with fungal and archaeal populations, taking advantage of samples from 98 well-characterized individuals, and integrates this novel data with the current knowledge regarding the bacteria of the human gut microbiome. Diet was quantified using inventories scoring both long-term and recent diet, and archaea and fungi were characterized by deep sequencing of marker genes in DNA purified from stool. For fungi, we found 66 genera, with generally mutually exclusive presence of either the phyla Ascomycota or Basiodiomycota. For archaea, Methanobrevibacterwas the most prevalent genus, present in 30% of samples. Several other archaeal genera were detected in lower abundance and frequency. Myriad associations were detected for fungi and archaea with diet, with each other, and with bacterial lineages. Methanobrevibacter andCandida were positively associated with diets high in carbohydrates, but negatively with diets high in amino acids, protein, and fatty acids. Previously published data emphasized that bacterial population structure was associated primarily with long-term diet, but high Candida abundance was most strongly associated with the recent consumption of carbohydrates. Methobrevibacter abundance was associated with both long term and recent consumption of carbohydrates. These results confirm earlier targeted studies and provide a host of new associations to consider in modeling the effects of diet on the gut microbiome and human health.
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InduÃÃo, isolamento e caracterizaÃÃo de linhagens de calos de feijÃo-de-corda (Vigna unguiculata) / Induction, isolation and caracterization of cowpea(Vigna unguiculata) callus lines.

Emmanuel de Sousa Jereissati 23 April 2008 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / EmbriogÃnese SomÃtica à o processo pelo qual, tecidos somÃticos vegetais dÃo origem a embriÃes de plantas sob condiÃÃes indutivas. A embriogÃnese somÃtica à atualmente a ferramenta mais empregada para a propagaÃÃo de plantas em escala comercial. Recentemente foram identificados alguns genes envolvidos no processo. Alguns desses genes estÃo envolvidos com a manutenÃÃo do meristema, outros estÃo envolvidos com a formaÃÃo de padrÃo. Existem genes que quando expressos ectopicamente podem induzir a formaÃÃo de embriÃes somÃticos. Existem poucos trabalhos na literatura sobre a embriogÃnese somÃtica em feijÃo-de-corda. AlÃm disso, esses trabalhos apresentam uma freqÃÃncia de regeneraÃÃo pequena e um complicado sistema de regeneraÃÃo que envolve muitas etapas. O objetivo deste trabalho foi isolar linhagens de calos embriogÃnicos de feijÃo-de-corda e estabelecer as condiÃÃes de cultivo ideais para estes calos. AnÃlises histolÃgicas foram utilizadas para a caracterizaÃÃo anatÃmica das linhagens de calos isolados. Das 4 linhagens de calos isolados trÃs apresentam cÃlulas com caracterÃsticas de cÃlulas embriogÃnicas, sendo que apenas a linhagem 2 deu origem a estruturas embriogÃnicas em suspensÃo celular. Essas linhagens de calos foram subcultivadas por mais de um ano sem perder as suas caracterÃsticas. Os experimentos de crescimento das suspensÃes celulares mostraram que as suspensÃes devem ser subcultivados em perÃodos de 5 dias. Os prÃximos trabalhos que envolvam a regeneraÃÃo em feijÃo-de-corda devem trabalhar com essa linhagem de calo facilmente isolÃvel e altamente estÃvel em cultura. / Somatic embryogenesis is the process by which somatic plant tissues gives rise to plant embryos under inductors conditions. Somatic embryogenesis represents the most commonly employed tool in commercial propagation of plants. In recent times, genes involved in the process have been identified, partucularly those involved in the maintenance of meristems and pattern formation. There are genes which, when ectopically expressed, can induce the formation of somatic embryos. In cowpea, there are few reports on somatic embryogenesis. In addition, the reports on the process recorded a very low frequency and a complicated system of regeneration involving several steps. This work attempted to isolate callus lines of cowpea and establish an ideal culture condition necessary for their maintenance. Histological analysis was conducted to characterize the isolated lines of callus anatomically. From the four lines obtained, 3 presented cells exhibiting the charactersitc embryogenic potential and of this, Line 2 actually gave rise to embryogenic structures when cultured in liquid media. The lines of callus were maintained in cultured condition for over a year without loss of their characteristics. Experiments that monitored the growth of cell suspension from the callus revealed that five days is the best period for subculture of the cells. Regeneration experiments in cowpea will find the different callus lines isolated in this work useful in the attempt to optimize the different strategies of regeneration of the crop in vitro.
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Influência do equilíbrio redox na resistência a fibrose pulmonar induzida por bleomicina em camundongos / Influence of redox balance on the resistance bliomycin-induced pulmonary fibrosis in mouse

Marco Aurélio dos Santos Silva 14 July 2011 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O desenvolvimento de fibrose pulmonar (FP) induzida por bleomicina tem sido associado com as características genéticas e estresse oxidativo. Nosso objetivo foi investigar a influência do equilíbrio redox sobre a resistência a fibrose pulmonar induzida por bleomicina em diferentes linhagens de camundongos. Uma única dose de bleomicina (0,1 U/camundongo) ou salina (50 mL) foi administrada por via intratraqueal (i.t.) em camundongos C57BL/6, DBA/2 e camundongos BALB/c. Vinte e um dias após a administração de bleomicina, a taxa de mortalidade foi acima de 50% em camundongos C57BL/6 e 20% em DBA/2, enquanto não foi observada em BALB/c. Houve um aumento na elastância (p<0.001), &#916;P2 (p<0.05), &#916;Ptot (p<0.01) e DE,l (p<0.05) em camundongos C57BL/6. O volume dos septos aumentaram em camundongos C57BL/6 (p<0.05) e DBA/2 (p<0.001). Os níveis de INF-&#947; foram reduzidas em camundongos C57BL/6 (p<0.01). Níveis OH-prolina foram aumentados em camundongos C57BL/6 e DBA/2 (p<0.05). Atividade e expressão de SOD foram reduzidas em camundongos C57BL/6 e DBA/2 (p<0.001 e p<0.001, respectivamente), enquanto que a atividade de CAT reduziu em todas as linhagens (C57BL/6: p<0.05; DBA/2: p<0.01, BALB/c: p<0.01). A atividade da GPx e expressão GPx 1/2 diminuiram em camundongos C57BL/6 (p<0.001). Nós concluímos que a resistência da FP pode também estar relacionada com a atividade e expressão de SOD em camundongos BALB/c / The development of bleomycin-induced pulmonary fibrosis (PF) has been associated with differences in genetic background and oxidative stress status. Our aim was to investigate the cross-talk between the redox profile, lung architecture and function in PF in different mouse strains. A single dose of either bleomycin (0.1 U/mouse) or saline (50 &#956;L) was by intratracheal (i.t.) administration in C57BL/6, DBA/2 and BALB/c mice. Twenty-one days after bleomycin, the mortality rate was over 50% in C57BL/6 and 20% in DBA/2 mice and PF was not observed in BALB/c. There was an increase in Est (p<0.001), &#916;P2 (p<0.05), &#916;Ptot (p<0.01) and &#916;E (p<0.05) in C57BL/6 mice. Septa volume increase in C57BL/6 (p<0.05) and DBA/2 (p<0.001). The levels of INF-&#947; were reduced by in C57BL/6 mice (p <0.01). OH-proline levels were increased in C57BL/6 and DBA/2 mice (p<0.05). SOD activity and expression was reduced in C57BL/6 and DBA/2 mice (p<0.001 and p<0.001 respectively), whereas CAT was reduced in all strains 21 days following bleomycin when compared to saline groups (C57BL/6: p<0.05; DBA/2: p<0.01, BALB/c: p<0.01). GPx activity and GPx1/2 expression decreased in C57BL/6 (p<0.001). We conclude that the PF resistance may also be related to the activity and expression of SOD in BALB/c
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Efeitos citotóxicos do teniposide, um derivado semi-sintético das epipodofilotoxinas, sobre linhagens celulares de carcinoma renal humano

Faria, Denise Heidrich January 2000 (has links)
O câncer renal corresponde a aproximadamente 3% dos tumores malignos do adulto, sendo a terceira malignidade urológica mais comum. Os tratamentos sistêmicos disponíveis para pacientes portadores de carcinoma renal avançado são, via de regra, pouco eficazes e sem um impacto definido na sobrevida. Portanto, torna-se imperioso que novos agentes e/ou estratégias terapêuticas para esta enfermidade sejam desenvolvidas. O derivado das epipodolofilotoxinas, etoposide, tem sido utilizado com sucesso no tratamento de vários tipos de tumores sólidos e hematológicos. Este agente exerce a sua ação antitumoral através da inibição da enzima nuclear topoisomerase II. Estudos recentes demonstraram que o efeito citotóxico in vitro deste agente é bem mais pronunciado quando as linhagens tumorais são expostas à droga por um tempo mais prolongado. Isto vem sendo confirmado em estudos clínicos, nos quais foi documentado um aumento significativo no percentual de respostas tumorais objetivas em pacientes com câncer avançado tratados com etoposide em doses repetidas diárias de forma continuada, comparativamente a pacientes que receberam pulsos de doses altas da droga a intervalos mais longos. Infelizmente, estudos iniciais com etoposide não revelaram uma atividade antitumoral significativa em pacientes com câncer renal avançado. Por esta razão, os estudos preliminares explorando o potencial terapêutico de seu análogo teniposide nesta doença também não receberam a devida atenção na literatura. Entretanto, este análogo possui potenciais vantagens terapêuticas em relação ao etoposide, uma vez que apresenta um tempo de retenção intracelular mais prolongado em linhagens de tumores sólidos in vitro. Estas observações nos estimularam a reconsiderar o estudo do potencial citotóxico do teniposide em modelos experimentais de câncer renal avançado. Nesta dissertação, foram estudados vários protocolos de administração de teniposide em linhagens de câncer renal humano, uma vez que esta neoplasia carece de drogas ativas disponíveis no armamentário terapêutico. Foram utilizadas as linhagens celulares RXF-393, A-498 e TK-10, as quais foram incubadas com teniposide em concentrações pré-determinadas e tempos de incubação variáveis. Além disto, foram feitos experimentos em que protocolos de administração de teniposide como agente único foram comparados a protocolos em que o mesmo foi combinado com agentes que bloqueiam a ação da glicoproteína P, responsável pelo efluxo ativo da droga do interior da célula tumoral. Além disso, foram também estudados protocolos incluindo a associação de teniposide com agentes que interferem com a síntese do DNA. Para os estudos de avaliação de citotoxicidade dos agentes quimioterápicos, os mesmos foram pré-incubados por 24 h na ausência ou presença do inibidor da DNA polimerase α afidicolina glicinada (0,2 µM) ou do inibidor da ribonucleotídeo redutase hidroxiuréia (200 µM) e após incubados por diferentes tempos de exposição com diluições seriadas de teniposide. Os efeitos citotóxicos foram avaliados através do método colorimétrico com sulforodamina B (SRB). Os protocolos de exposição prolongada das células ao teniposide mostraram um aumento significativo na sua citotoxicidade nas linhagens RXF-393, A-498 e TK-10, sugerindo que a citotoxicidade do teniposide é dependente de tempo de administração. Neste sentido, uma maior taxa de dano no DNA foi observada nas células expostas ao teniposide por tempos de administração mais prolongados. Curiosamente, os diferentes tempos de exposição ao teniposide não influenciaram de forma clara na formação de complexos DNA-topoisomerase II, nem nas medidas da atividade desta enzima. O uso concomitante de agentes moduladores da glicoproteína P como o verapamil, a ciclosporina A e o tamoxifeno não produziu potencialização do efeito antiproliferativo do teniposide. Por sua vez, os tratamentos com agentes que interferem na síntese de DNA, como a afidicolina glicinada ou a hidroxiuréia, potencializaram a citotoxicidade do teniposide em todas as linhagens estudadas, seguindo as características intrínsecas de cada linhagem. Em conclusão, os resultados apresentados nesta dissertação sugerem que o teniposide apresenta um maior efeito citotóxico em protocolos de administração prolongada em combinação com agentes inibidores da síntese de DNA. Frente a estes resultados iniciais, o teniposide será testado nos protocolos de administração acima mencionados em um painel contendo um maior número de linhagens tumorais in vitro. Uma vez confirmadas as observações acima descritas, serão iniciados estudos em modelos tumorais in vivo. Estes estudos servirão de base nas decisões quanto à reavaliação clínica do teniposide em ensaios de fase I em pacientes com neoplasias avançadas refratárias.
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Ganhos genéticos devido à seleção entre e dentro de famílias S 4 de milho-pipoca, em programa de produção de linhagens / Within S 4 families selection in a popcorn (Zea mays L.) inbred lines development program

Arnhold, Emmanuel 13 February 2004 (has links)
Submitted by Cleber Casali (clebercasali@ufv.br) on 2017-06-01T19:30:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 360661 bytes, checksum: 4cff8e80de48264f8058313b2ce3aa43 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T19:30:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 360661 bytes, checksum: 4cff8e80de48264f8058313b2ce3aa43 (MD5) Previous issue date: 2004-02-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste trabalho foram investigar a eficiência da seleção dentro, promover melhoramento intrapopulacional, com seleção de 35 famílias S 4 , em capacidade de expansão (CE) e produção, e obter 70 famílias S 5 superiores, com seleção dentro de 70 e 35 famílias S 4 , selecionadas para as mesmas características, sendo que a seleção em CE foi priorizada. Neste trabalho foram avaliadas 106 famílias S 4 da população Beija-Flor, em experimento sem repetição, com duas testemunhas intercaladas a cada dez famílias. Assumindo delineamento inteiramente casualizado, fez-se o ajuste de modelo de regressão múltipla, para correção dos efeitos ambientais. Como a determinação do modelo completo foi, em geral baixa, optou-se por utilizar os dados sem correção. Assumiu-se, também, delineamento em blocos incompletos, que considera controle local. Encontrou-se variabilidade genética entre as famílias para produção e CE, quando assumido delineamento inteiramente casualizado e delineamento em blocos incompletos. As correlações genotípicas entre produção e CE, em ambos os casos, foram satisfatórias, 0,36 e 0,42, respectivamente. As herdabilidades entre famílias foram mais elevadas que dentro das famílias, para produção e CE. Os valores podem ser considerados médios para produção e altos para CE. A correlação genotípica encontrada dentro das famílias para CE e produção foi de 0,33. A variância genotípica entre famílias foi inferior à encontrada dentro de famílias . Para o cálculo dos ganhos entre, utilizou-se ás médias e parâmetros genéticos obtidos quando assumido delineamento em blocos incompletos. Foram utilizadas três estratégias de seleção: seleção direta em CE, seleção direta em produção e uso do índice de Mulamba e Mock, com peso 3 para CE e 1 para produção. A estratégia que proporcionou maiores ganhos preditos foi seleção direta em CE, de 35 famílias, com seleção de 70 plantas dentro destas com uso do índice. Obteve-se com esta estratégia ganhos preditos totais de 271,2 kg/ha para produção e 7,2 mL/g para CE. Com estes ganhos, espera-se uma elevação de 2474,4 para 2745,6 kg/ha e de 28,6 para 35,8 mL/g, ou seja, qualidade de milho-pipoca muito superior à das testemunhas, que são híbridos comerciais. Quando avaliada a eficiência da seleção dentro, verificou-se que, para a melhor estratégia em promover os ganhos desejáveis, a contribuição do ganho dentro foi de 39,1% para produção e 33,3% para CE, demonstrando a importância da seleção dentro. Quando analisadas as demais estratégias de seleção, também se verificou uma elevada importância dos ganhos dentro. No caso de seleção de 70 famílias, os ganhos dentro foram responsáveis por mais de 50% dos ganhos totais para CE e produção. A elevada importância dos ganhos dentro pode ser atribuída à elevada variação genotípica dentro, que pode ter sido superestimada devido a desvios ambientais e/ou devido a população estar sobre seleção. Analisando os ganhos realizados, observou-se ganhos em produtividade e qualidade. Para CE os ganhos foram inferiores aos preditos. Os critérios que proporcionaram maiores ganhos realizados em CE foram seleção de 70 famílias S 4 com base em CE e seleção de 70 plantas dentro destas, também com base em CE, com ganho realizado de 1,34 mL/g. A seleção dentro, neste caso, foi responsável por 89,5% do ganho total obtido com seleção entre e dentro. Portanto, para uma maior eficiência seletiva com famílias S 4 , deve-se praticar seleção dentro, sendo que a importância desta é maior quando se diminui a intensidade de seleção entre. / In this work 106 S 4 families from the Beija-Flor population were evaluated in experiment without replication, with two intercalated controls, at each ten families. The objectives were to investigate the efficiency of the within selection; to accomplish intrapopulacional breeding, with selection of 35 S 4 families, looking forward to expansion capacity (CE) and yield; and to obtain 70 superior S 5 families, with selection inside 70 and 35 S 4 families, which were selected for the same characteristics, being prioritized the selection for CE. Assuming completely randomized design, models were determined by multiple regression, for correction of the environmental effects. However, the determination of the models was in general low, therefore it was used the data without correction. It was also assumed, incomplete blocks design, which considers local control. Genetic variability was found among the families for production and CE, when either completely randomized design or incomplete blocks design was assumed. xiiiThe correlations between yield and CE, in both cases, were also satisfactory (0.36) and (0.42) respectively. The heritabilities among families were higher than inside them, for yield and for CE. The values can be considered medium for yield and high for CE. The correlation, for CE and yield, inside the families was 0.33. The genetic variance among families was of lower magnitude than inside them. To calculate the gains among families, it was used averages and genetic parameters obtained when assumed the incomplete blocks design, because this design considers local control and, therefore, it is more reliable. Three strategies were used, direct selection in CE, direct selection in yield, and index of Mulamba and Mock, with weights 3 for CE and 1 for yield. The strategy that provided larger predicted gains was direct selection on CE, of 35 families, with selection of 70 plants inside of them, using the index. It was obtained, with this strategy, total predicted gains of 271.2 kg/ha for yield and 7.2 mL/g for CE. With these gains, an elevation from 2474.4 to 2745.6 kg/ha is expected for yield and from 28.6 to 35.8 mL/g for CE, in other words, popcorn quality very superior to that found in the control hybrids, that are commercial hybrids. When evaluated the efficiency of the inside selection, it is verified that, for the best strategy in promoting the desirable gains, mentioned previously, the contribution of the inside gains was of 39.1% for yield and of 33.3% for CE, demonstrating the importance of the inside selection. When the other selection strategies were analyzed, a high importance of the inside gains was also verified. In the case of selection of 70 families, the inside gains were responsible for more than 50% of the total gains for CE and yield. The high importance of the inside gains may be due to the high inside genetic variation. Analyzing the accomplished gains for CE, gains was observed, however inferior to the predicted ones. The strategy that provided larger accomplished gains in CE was selection of 70 S 4 families in CE and selection of 70 plants in CE inside of these, with accomplished gains of 1.34 mL/g. The inside selection, in this case, was responsible for 89.5% of the gains. Though, for larger selection efficiency in S 4 families, inside selection should be practiced and, the importance of these is enhanced when the among selection intensity is diminished.
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Avaliação de testadores e seleção de linhagens de milho / Evaluating the testers and selecting the maize lines

Guimarães, Lauro José Moreira 17 August 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T13:28:19Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 423809 bytes, checksum: 0c6d5bf12dfd59568787b46b403db59a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:28:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 423809 bytes, checksum: 0c6d5bf12dfd59568787b46b403db59a (MD5) Previous issue date: 2004-08-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste trabalho foram avaliar cultivares como testadores e selecionar linhagens geneticamente superiores do Programa Milho ® (Programa de melhoramento de milho da Universidade Federal de Viçosa). Foram avaliados híbridos top-crosses, sintetizados a partir do cruzamento de quatro testadores com um conjunto de 162 linhagens . Foram conduzidos nove ensaios em látice 7 x 7, num total de 441 tratamentos, em Coimbra – MG, no ano agrícola de 2002/03. As características avaliadas foram: produtividade de grãos, florescimento masculino e feminino, altura de plantas, estande final e prolificidade. Foram feitas análises dos experimentos individuais e agrupadas, em delineamento com fatores hierárquicos , em que os efeitos de tratamentos foram decompostos em efeitos de híbridos top-crosses , testadores, linhagens dentro de testadores, testemunhas, bem como o contraste híbridos top-crosses vs testemunhas e análises dialélicas parciais , para verificação da existência de diferenças genéticas entre os grupos de genótipos e o tipo de ação gênica predominante. Foram estimados os efeitos de capacidade geral de combinação para as linhagens, em cada experimento, com informação de um único testador e no conjunto de linhagens que participaram em cruzamentos com os quatro testadores. Os testadores mais adequados para seleção de linhagens-elite do Programa Milho ® foram o SynD, que é um cultivar sintético de polinização aberta com grãos dentados e o HS1 que é um híbrido simples de grãos duros . A população de híbridos top-crosses apresentou média de produtividade de grãos de 9.524 kg.ha -1 e foi verificada variabilidade genética para todas as características . Os efeitos genéticos aditivos, para a produtividade de grãos, foram importantes em todas as análises dialélicas, bem como os efeitos genéticos não aditivos, que refletem o potencial heterótico na produtividade de híbridos deste grupo de linhagens . Portanto, é possível a síntese de híbridos de alto potencial produtivo com a seleção e recombinação das melhores linhagens . Para a seleção de linhagens -elite, quanto maior o número de cruzamentos com testadores, em top-crosses , mais precisas serão as estimativas de capacidades de combinação e as estimativas do potencial produtivo de híbridos não sintetizados. Estimativas discrepantes de capacidade geral de combinação, para os testadores , permitem a discriminação de grupos de linhagens com grupos gênicos diferenciados e a utilização de informações sobre a divergência genética entre as linhagens-elite possibilitam a escolha de cruzamentos mais promissores. / The objectives of this study were to evaluate four cultivars of maize as testers and to select the genetically superior lines of the Programa Milho ® (UFV maize improvement program). Some top-cross hybrids synthesized from the crossing of four testers with a group of 162 lines were evaluated. Nine assays on a lattice design 7 x 7, as so totaling 441 treatments, were carried out in the agricultural year 2002/03, in Coimbra county-MG. The following traits were evaluated: kernel productivity, masculine and feminine flowerings, plant heights, final stand, and prolificacy. The individual, grouped and on a hierarchical factor design analyses of the experiments were performed, where the effects of the treatments were decomposed into effects from the top-cross hybrids, testers, lines within testers, controls, the top-cross hybrids vs control contrast, and partial diallelic analyses in order to verify the existence of genetic differences between the genotype groups and the kind of predominant gene action. In each experiment, the effects of the general combination ability were estimated for the lines, with a single tester's information and in the line groups participating into crossings with those four testers. The most appropriate testers for selection of the elite lines from the Programa Milho ® were SynD, that is a synthetic open- pollinated cultivar with dent kernels, and HS1 that is a simple flint kernel hybrid. The top-cross hybrid population showed an average kernel productivity of 9,524 kg.ha -1 , and genetic variability was found for all the characteristics under study. The addictive genetic effects for the productivity of kernels were important in all diallelic analyses, as well as the non-addictive genetic effects reflecting the heterotic potential into the productivity of hybrids of this line group. Therefore, the synthesis of hybrids provided with high productive potential is possible by the selection and recombination of the best lines. For selection of the elite lines, as higher is the number of crossings with testers in top-cross , as more accurate will be the estimates of the combination abilities, and the estimates of the productive potential of no-synthesized hybrids as well. The discrepant estimates of the general combination ability for the testers allow for discrimination of the line groups with differentiated gene groups, whereas the use of information on the genetic divergence among the elite lines make possible the choice for more promising crossings.
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Avaliação da digestibilidade e da qualidade protéica de linhagens de soja com ausência do inibidor de tripsina Kunitz e das isoenzimas lipoxigenases / Digestilility and protein quality evaluation from soy strains in absence of Kunitz trypsin and isoenzymes lipoxygenases

Monteiro, Márcia Regina Pereira 04 October 2000 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-21T13:46:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 505600 bytes, checksum: 8e43949bb2f44571cb70f82baf79f8f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T13:46:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 505600 bytes, checksum: 8e43949bb2f44571cb70f82baf79f8f0 (MD5) Previous issue date: 2000-10-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As farinhas de soja integrais utilizadas neste trabalho foram obtidas, a partir de grupos de sementes (bulks) derivadas de linhagens que diferem entre si com relação à presença de lipoxigenases (LOX) e/ou inibidor de tripsina Kunitz (KTI). Para essa seleção e confirmação dos genótipos realizaram-se análises de lipoxigenases, de inibidores de tripsina e de quimotripsina. Realizou-se ainda, análise da composição química centesimal para caracterização das farinhas e atividade hemaglutinante nas sementes e nas farinhas de soja derivadas. Constatou-se , através da atividade hemaglutinante, que o tratamento térmico (89oC por 5 minutos) aplicado no processamento das farinhas foi suficiente para inativar as lectinas presentes na soja. Com o objetivo de avaliar a qualidade protéica e digestibilidade in vivo das farinhas de soja, procedeu-se aos ensaios biológicos com ratos, em que foram avaliados o PER (Relação da Eficiência Protéica), NPR (Razão Protéica Líquida), NPU (Utilização Protéica Líquida) e a digestibilidade. Os valores de PER, NPR, NPU para as variedades de soja foram inferiores aos valores obtidos para caseína, possivelmente em virtude da deficiência da proteína de soja em algum tipo de aminoácido essencial. Para as farinhas sem KTI foram obtidos valores de digestibilidade maiores que para as farinhas com KTI, e esses foram bem próximos aos da caseína. Isto comprova que a eliminação genética do KTI melhora consideravelmente a digestibilidade da proteína de soja. No entanto, essa diferença não refletiu em melhor qualidade protéica dessa variedade, visto que não houve diferença nos valores de PER, NPR e NPU entre as variedades estudadas. Procedeu-se a determinação da composição aminoacídica das farinhas e cálculo do PDCAAS (Escore Químico Corrigido pela Digestibilidade) , constatando-se que o aminoácido limitante dessa soja é lisina e não metionina, ao contrário do que aponta a literatura, possivelmente em decorrência do melhoramento genético que levou a essa alteração. Os resultados do PDCAAS não indicaram diferença entre as farinhas sem KTI das farinhas derivadas de linhagens com KTI, como foi observado pelos resultados da digestibilidade in vivo. Conclui-se que a retirada genética do inibidor de tripsina Kunitz melhora significativamente a digestibilidade da proteína de soja, eliminando a necessidade de se empregar altas temperaturas nos produtos de soja visando inativação desse inibidor e, conseqüentemente, evitando o superaquecimento com insolubilização de proteínas, perdas de características funcionais e destruição de alguns aminoácidos. / The whole soy flours used in this work were obtained from seed bulks derived from strains differing in relation to presence of lipoxygenases (LOX) and/or Kunitz trypsin (KTI). Analyses for lipoxygenase and trypsin and chemotrypsin inhibition were performed in order to select and confirm the genotypes. Chemical content analysis was also performed so as to characterize the flours and the hemaglutinating activity in the seeds and the derived soy flour. It was observed from that activity that the thermal treatment (89 o C for 5 min) on the flour processing was enough to inactivate the lectins present in the soy. In order to evaluate the in vivo digestibility and protein quality for the soy flours, biological tests with rats were performed and from these tests, PER, NPR, NPU and digestibility were evaluated. PER (Protein Efficiency Ratio), NPR (Net Protein Ratio) and NPU (Net Protein Utilization) values were obtained below the values for casein. This result may be due to the deficiency of sulfured amino acids in soy protein. Flours without KTI showed higher values for digestibility than flours with KTI. These values were quite close to the ones for casein. This indicates that the KTI genetic elimination in soy improves the digestibility for the soy protein a lot. However, this difference did not reflect in better protein quality of this soy strain, since there was no differences in the values of PER, NPR and NPU between the strains. Amino-acidic content for the flours and PDCAAS (Protein Digestibility Corrected Amino Acid Score) values were determined showing that lysine rather than methionine is the limiting amino acid for this soy, different of that pointed by literature, possibly because the genetic enhancements. PDCAAS showed no difference between flours without KTI and the flours derived from KTI strains as it was observed from the in vivo digestibility results. It follows that the genetic withdrawal of Kunitz trypsin inhibitor significantly improves digestibility of soy protein, eliminating the need to deploy high temperatures in soy products to inactivate this inhibitor and, consequently, avoiding overheating with protein insolubilization, characteristics and loss of some aminoacids. loss of functional / Tese importada do Alexandria
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Efeitos citotóxicos do teniposide, um derivado semi-sintético das epipodofilotoxinas, sobre linhagens celulares de carcinoma renal humano

Faria, Denise Heidrich January 2000 (has links)
O câncer renal corresponde a aproximadamente 3% dos tumores malignos do adulto, sendo a terceira malignidade urológica mais comum. Os tratamentos sistêmicos disponíveis para pacientes portadores de carcinoma renal avançado são, via de regra, pouco eficazes e sem um impacto definido na sobrevida. Portanto, torna-se imperioso que novos agentes e/ou estratégias terapêuticas para esta enfermidade sejam desenvolvidas. O derivado das epipodolofilotoxinas, etoposide, tem sido utilizado com sucesso no tratamento de vários tipos de tumores sólidos e hematológicos. Este agente exerce a sua ação antitumoral através da inibição da enzima nuclear topoisomerase II. Estudos recentes demonstraram que o efeito citotóxico in vitro deste agente é bem mais pronunciado quando as linhagens tumorais são expostas à droga por um tempo mais prolongado. Isto vem sendo confirmado em estudos clínicos, nos quais foi documentado um aumento significativo no percentual de respostas tumorais objetivas em pacientes com câncer avançado tratados com etoposide em doses repetidas diárias de forma continuada, comparativamente a pacientes que receberam pulsos de doses altas da droga a intervalos mais longos. Infelizmente, estudos iniciais com etoposide não revelaram uma atividade antitumoral significativa em pacientes com câncer renal avançado. Por esta razão, os estudos preliminares explorando o potencial terapêutico de seu análogo teniposide nesta doença também não receberam a devida atenção na literatura. Entretanto, este análogo possui potenciais vantagens terapêuticas em relação ao etoposide, uma vez que apresenta um tempo de retenção intracelular mais prolongado em linhagens de tumores sólidos in vitro. Estas observações nos estimularam a reconsiderar o estudo do potencial citotóxico do teniposide em modelos experimentais de câncer renal avançado. Nesta dissertação, foram estudados vários protocolos de administração de teniposide em linhagens de câncer renal humano, uma vez que esta neoplasia carece de drogas ativas disponíveis no armamentário terapêutico. Foram utilizadas as linhagens celulares RXF-393, A-498 e TK-10, as quais foram incubadas com teniposide em concentrações pré-determinadas e tempos de incubação variáveis. Além disto, foram feitos experimentos em que protocolos de administração de teniposide como agente único foram comparados a protocolos em que o mesmo foi combinado com agentes que bloqueiam a ação da glicoproteína P, responsável pelo efluxo ativo da droga do interior da célula tumoral. Além disso, foram também estudados protocolos incluindo a associação de teniposide com agentes que interferem com a síntese do DNA. Para os estudos de avaliação de citotoxicidade dos agentes quimioterápicos, os mesmos foram pré-incubados por 24 h na ausência ou presença do inibidor da DNA polimerase α afidicolina glicinada (0,2 µM) ou do inibidor da ribonucleotídeo redutase hidroxiuréia (200 µM) e após incubados por diferentes tempos de exposição com diluições seriadas de teniposide. Os efeitos citotóxicos foram avaliados através do método colorimétrico com sulforodamina B (SRB). Os protocolos de exposição prolongada das células ao teniposide mostraram um aumento significativo na sua citotoxicidade nas linhagens RXF-393, A-498 e TK-10, sugerindo que a citotoxicidade do teniposide é dependente de tempo de administração. Neste sentido, uma maior taxa de dano no DNA foi observada nas células expostas ao teniposide por tempos de administração mais prolongados. Curiosamente, os diferentes tempos de exposição ao teniposide não influenciaram de forma clara na formação de complexos DNA-topoisomerase II, nem nas medidas da atividade desta enzima. O uso concomitante de agentes moduladores da glicoproteína P como o verapamil, a ciclosporina A e o tamoxifeno não produziu potencialização do efeito antiproliferativo do teniposide. Por sua vez, os tratamentos com agentes que interferem na síntese de DNA, como a afidicolina glicinada ou a hidroxiuréia, potencializaram a citotoxicidade do teniposide em todas as linhagens estudadas, seguindo as características intrínsecas de cada linhagem. Em conclusão, os resultados apresentados nesta dissertação sugerem que o teniposide apresenta um maior efeito citotóxico em protocolos de administração prolongada em combinação com agentes inibidores da síntese de DNA. Frente a estes resultados iniciais, o teniposide será testado nos protocolos de administração acima mencionados em um painel contendo um maior número de linhagens tumorais in vitro. Uma vez confirmadas as observações acima descritas, serão iniciados estudos em modelos tumorais in vivo. Estes estudos servirão de base nas decisões quanto à reavaliação clínica do teniposide em ensaios de fase I em pacientes com neoplasias avançadas refratárias.
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Influência do equilíbrio redox na resistência a fibrose pulmonar induzida por bleomicina em camundongos / Influence of redox balance on the resistance bliomycin-induced pulmonary fibrosis in mouse

Marco Aurélio dos Santos Silva 14 July 2011 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O desenvolvimento de fibrose pulmonar (FP) induzida por bleomicina tem sido associado com as características genéticas e estresse oxidativo. Nosso objetivo foi investigar a influência do equilíbrio redox sobre a resistência a fibrose pulmonar induzida por bleomicina em diferentes linhagens de camundongos. Uma única dose de bleomicina (0,1 U/camundongo) ou salina (50 mL) foi administrada por via intratraqueal (i.t.) em camundongos C57BL/6, DBA/2 e camundongos BALB/c. Vinte e um dias após a administração de bleomicina, a taxa de mortalidade foi acima de 50% em camundongos C57BL/6 e 20% em DBA/2, enquanto não foi observada em BALB/c. Houve um aumento na elastância (p<0.001), &#916;P2 (p<0.05), &#916;Ptot (p<0.01) e DE,l (p<0.05) em camundongos C57BL/6. O volume dos septos aumentaram em camundongos C57BL/6 (p<0.05) e DBA/2 (p<0.001). Os níveis de INF-&#947; foram reduzidas em camundongos C57BL/6 (p<0.01). Níveis OH-prolina foram aumentados em camundongos C57BL/6 e DBA/2 (p<0.05). Atividade e expressão de SOD foram reduzidas em camundongos C57BL/6 e DBA/2 (p<0.001 e p<0.001, respectivamente), enquanto que a atividade de CAT reduziu em todas as linhagens (C57BL/6: p<0.05; DBA/2: p<0.01, BALB/c: p<0.01). A atividade da GPx e expressão GPx 1/2 diminuiram em camundongos C57BL/6 (p<0.001). Nós concluímos que a resistência da FP pode também estar relacionada com a atividade e expressão de SOD em camundongos BALB/c / The development of bleomycin-induced pulmonary fibrosis (PF) has been associated with differences in genetic background and oxidative stress status. Our aim was to investigate the cross-talk between the redox profile, lung architecture and function in PF in different mouse strains. A single dose of either bleomycin (0.1 U/mouse) or saline (50 &#956;L) was by intratracheal (i.t.) administration in C57BL/6, DBA/2 and BALB/c mice. Twenty-one days after bleomycin, the mortality rate was over 50% in C57BL/6 and 20% in DBA/2 mice and PF was not observed in BALB/c. There was an increase in Est (p<0.001), &#916;P2 (p<0.05), &#916;Ptot (p<0.01) and &#916;E (p<0.05) in C57BL/6 mice. Septa volume increase in C57BL/6 (p<0.05) and DBA/2 (p<0.001). The levels of INF-&#947; were reduced by in C57BL/6 mice (p <0.01). OH-proline levels were increased in C57BL/6 and DBA/2 mice (p<0.05). SOD activity and expression was reduced in C57BL/6 and DBA/2 mice (p<0.001 and p<0.001 respectively), whereas CAT was reduced in all strains 21 days following bleomycin when compared to saline groups (C57BL/6: p<0.05; DBA/2: p<0.01, BALB/c: p<0.01). GPx activity and GPx1/2 expression decreased in C57BL/6 (p<0.001). We conclude that the PF resistance may also be related to the activity and expression of SOD in BALB/c
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Desempenho de genótipos de alface-crespa em diferentes ambientes de cultivo, no município de Igarapava - SP / Performance of crispy loose-leaf lettuce genotypes under different growth environments at Igarapava - SP

Silveira, Fabio Colli Garcia [UNESP] 26 February 2016 (has links)
Submitted by FABIO COLLI GARCIA DA SILVEIRA null (solocerto@bol.com.br) on 2016-04-19T08:22:12Z No. of bitstreams: 1 dissertação_Fabio_Colli_Garcia_Silveira.pdf: 758527 bytes, checksum: 599eacdb42f8604d8f19d25b810d20a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-25T19:11:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silveira_fcg_me_jabo.pdf: 758527 bytes, checksum: 599eacdb42f8604d8f19d25b810d20a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-25T19:11:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silveira_fcg_me_jabo.pdf: 758527 bytes, checksum: 599eacdb42f8604d8f19d25b810d20a4 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / A alface (Lactuca sativa L.) vem sendo cultivada por longos períodos desde a antiguidade. É considerada a mais importante hortaliça folhosa. É consumida na dieta brasileira, principalmente na forma de saladas cruas, devido a suas boas propriedades organolépticas. O presente trabalho objetivou avaliar o desempenho agronômico de oito linhagens e duas cultivares comerciais do Programa de Melhoramento Genético de Alface da UNESP – FCAV. As linhagens Jab 1, Jab 2, Jab 3, Jab 4, Jab 5, Jab 6, Jab 7 e Jab 8, e as cultivares de alfacecrespa Vanda e Vera foram avaliadas no município de Igarapava-SP, no período outono-inverno, em três sistemas de cultivo: Campo aberto, casa de vegetação tipo guarda-chuva e sombreado. Foram instalados três experimentos (ambientes de cultivo), em delineamento de blocos casualizados, com dez tratamentos (linhagens e cultivares) e quatro repetições. Foram avaliadas as características: diâmetro do caule, comprimento do caule, massa fresca total, número de folhas comerciais, massa das folhas comerciais e volume. Os resultados foram submetidos à análise conjunta, e as médias, comparadas pelo teste de Scott e Knott, ao nível de 5% de probabilidade. Não foram detectadas interações significativas para todas as características avaliadas. Os genótipos Jab 5 e Jab 6 destacaram-se por apresentarem os maiores volumes de planta, sendo superiores às demais linhagens e às cultivares comerciais Vera e Vanda. Os ambientes campo aberto e casa de vegetação tipo guarda-chuva foram mais adequados para todas as características avaliadas, exceto para o diâmetro do caule, que não apresentou diferença significativa entre os ambientes. / Lettuce (Lactuca sativa L.) has been cultivated for long a long time, since the antiquity. It’s considered the most important leafy vegetable. It’s consumed on Brazilian diet, mainly in fresh salads, due its good organoleptic properties. This work aimed to evaluate the agronomic behavior of eight lettuce strains and two commercial cultivars Breeding Program at UNESP – FCAV. The genotypes Jab 1, Jab 2, Jab 3, Jab 4, Jab 5, Jab 6, Jab 7, and Jab 8 and the crispy loose-leaf cultivars Vanda and Vera were assessed at Igarapava County, SP, during the fall-winter period in three cropping systems: Field, “Umbrella” greenhouse and shaded greenhouse. It was carried out three experiments (cropping systems) in randomized blocks design, with ten treatments (genotypes and cultivars) with four replications. The results were submitted to joint analysis and means compared by test of ScottKnott, at level of 5% of probability. It was assessed the following characteristics: stem diameter, stem length, total fresh mass, number of commercial leaves, commercial leaf mass, and volume. There were not significant interactions to all evaluated traits. The genotypes Jab 5 and Jab 6 highlighted from the others, even than the cultivars Vera and Vanda, due to the higher volume. The environments field and “umbrella” greenhouse were the most suitable for all characters, except to stem diameter, which did not present significant difference to all the evaluated environments.

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