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Uso de modelos de distribuição de abundância na análise da relação entre diversidade de aves e variáveis ambientais e antrópicas / Species abundance distribution models on analysis of relation between bird diversity and environmental and anthropic variables

Rodrigues, Rodolpho Credo 14 October 2011 (has links)
Modelos de distribuição de abundâncias relativas das espécies (DAE) representam um dos mais gerais padrões em ecologia de comunidades, denominado de curva côncava. Este padrão, mostra que independente do grupo taxonômico ou ambiente, as espécies comuns e mais abundantes são poucas e a maioria das espécies é rara. Estes modelos são úteispara descrever a diversidade em comunidades naturais por que mostram como o número de indivíduos é distribuído entre as espécies e portanto, representam o grau de dominância nas comunidades. Um dos principais objetivos da ecologia de comunidades é entender como fatores ambientais em escalas globais, regionais e locais podem determinar a riqueza e abundância de espécies dentro das comunidades. Apesar do conhecimento acerca destes padrões, a ocorrência de processos em escalas diferentes dificulta a escolha de um ou mais deles como determinantes da diversidade nas comunidades. Assim, nosso objetivo foi avaliar qual a importância relativa do aumento da produtividade, biogeografia, destruição e fragmentação de habitats sobre a determinação da diversidade em comunidades de aves de sub bosque. Para isto, nós utilizamos dados compilados de uma das maiores bases de dados sobre estudos deste grupo para a região sudeste do Brasil e selecionamos 104 localidades amostradas por meio do método de rede de neblina nesta região. Porém, devido às características ambientais e do esforço amostral realizado em cada local serem diferentes, as estimativas de diversidade realizadas a partir destes estudos poderiam ser afetadas, impossibilitando a comparação entre estas comunidades. Assim, no primeiro capítulo desta dissertação, nós avaliamos o efeito da variação do esforço amostral nas estimativas de diversidade realizadas por dois modelos de distribuição de abundância de espécies, o de série logarítmica e o lognormal. O primeiro possui um parâmetro denominado alfa e o segundo outro parâmetro chamado sigma, sendo que ambos medem a dominância em comunidades e são apontados como independentes do esforço amostral empregado. Através de simulações computacionais onde foram geradas comunidades fictícias e amostras destas comunidades, nós avaliamos a frequência de detecção do modelo correto e o viés da estimativa dos parâmetros destes modelos a partir de amostras com intensidades diferentes. Nós encontramos que o modelo de série logarítmica foi detectado com maior eficiência a partir de amostras com intensidades variáveis e que seu parâmetro sofreu menos viés em relação ao modelo lognormal e seu parâmetro. Assim, nós concluímos que o modelo de série logarítmica foi menos sensível à variação do esforço amostral que o lognormal e, portanto, mais útil para a comparação da diversidade entre comunidades. No capítulo seguinte, nós procedemos com a análise da relação dos fatores ambientais e antrópicos sobre a diversidade de aves. Nossas hipóteses foram que a produtividade poderia afetar positivamente a diversidade nas comunidades de aves de sub bosque, assim como o efeito histórico e biogeográfico poderia afetar diferentemente a diversidades em determinadas regiões. Porém, devido à perda e a fragmentação de habitats causada pelo homem sobre a paisagem, estes padrões poderiam ser afetados negativamente, o que poderia acontecer de forma semelhante ou diferente em localidades mais ou menos produtivas, ou situadas em diferentes regiões biogeográficas. Nossos resultados mostraram uma forte relação positiva da produtividade com a diversidade de aves mensurada pelo parâmetro alfa do modelo de série logarítmica, o que significa que a produtividade diminuiu a dominância nestas comunidades da forma esperada. Este efeito, quando adicionado ou interagindo com o efeito negativo das variáveis que mediam perda e fragmentação de habitats, foi considerado tão plausível quanto o efeito isolado da produtividade sobre a diversidade. Porém, a incerteza sobre a existência de efeitos fracos ou ausência de efeito da perda e fragmentação em conjunto com a produtividade nos levaram a concluir em favor de um efeito preponderante da produtividade sobre a diversidade de aves de sub bosque, ao menos na escala analisada em nosso estudo. O efeito biogeográfico, foi menos evidente que o efeito da produtividade, mesmo por que parte de seu efeito é causado pela produtividade. A partir destes resultados, nós concluímos que a influência da produtividade parece ser mais foi determinante sobre o grau de dominância nestas comunidades. Entretanto, o papel tanto da perda quanto da fragmentação de habitats em conjunto com a produtividade pode explicar de forma equivalente a variação da dominância nas comunidades avaliadas por nós, o que aponta para a importância de se considerar ambos fatores e escalas para explicar a diversidade de aves nesta região. / Species abundance distribution models represent one of the most general patterns in community ecology and is called as hollow or concave curve. This pattern shows that regardless of taxonomic group or enviroment, the most and common species are few and the most species are rare. These models are useful to describe the diversity in natural communities because they show how the number of individuals is distributed among species and thus, the degree of dominance in the communities. A major goal of community ecology is understand how environmental factors on global, regional and local scales determine the richness and abundance of species within communities. Despite the knowledge about these patterns, the occurrence of processes at different scales difficult the choice of one or more of them as determinants of diversity in communities. Thus, our objective was to evaluate the relative importance of productivity, biogeography, habitat destruction and fragmentation on the determination of diversity in understory bird communities. For this, we used data compiled from one of the largest databases of studies of this group for the southeast region of Brazil and selected 104 sites sampled by the method of mist nets in this region. However, due to habitat characteristics and sampling effort carried out at each site are different, the diversity estimates made from these studies could be affected, making it impossible to compare these communities. Thus, in the first chapter of this thesis, we evaluated the effect of varying sampling effort on diversity estimates made by two models of distribution of species abundance, the logseries and lognormal SAD models. The first has a parameter called alpha and the second sigma parameter, which both measure the dominance in communities and are appointed as independent of the sampling effort employed. Through computer simulations where they were generated fictitious communities and samples of these, we evaluated the frequency of detection of the correct model and the bias of the estimated parameters of these models from samples with different intensities. We find that the logseries model has been detected with greater efficiency from samples with varying intensities and its parameter has less bias toward the lognormal model and its parameter. Thus, we conclude that the logseries model was less sensitive to variation of sampling effort that the lognormal and therefore more useful to compare the diversity between communities. In the next chapter, we proceed with the analysis of the relationship between environmental and anthropogenic factors on the diversity of birds. Our hypotheses were that productivity could positively affect the diversity in understory bird communities, as well as the effect of biogeography could lead to different diversity in certain regions. However, due to habitat loss and fragmentation caused by humans on the landscape, these patterns could be affected negatively, which could happen in a way similar or different in more or less productive locations, or in sites at different biogeographical regions. Our results showed a strong positive relationship of productivity with the diversity of birds measured by the parameter alpha of the logseries model, which means that productivity decreased dominance in these communities. This effect, when added to or interacting with the negative effect of the variables that mediate loss and fragmentation of habitats, was considered as plausible as the isolated effect of productivity on diversity. However, uncertainty about the existence of weak effects or no effect of the loss and fragmentation together with productivity led us to conclude in favor of a predominant effect of productivity on understory birds diversity, at least on the scale considered in our study. The biogeographic effect was less evident that the effect of productivity, even for that part of its effect is caused by productivity. From these results, we conclude that the influence of productivity on the diversity of understory birds seems more preponderant to determine the degree of dominance in these communities. However, the role of both the loss and fragmentation of habitats together with productivity should be considered to explain the dominance variation in communities assessed by us, which points to the importance of considering both factors and scales to explain the diversity of birds in this region.
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Padrões da comunidade de trepadeiras e suas relações com a biomassa arbórea e a regeneração natural em uma Floresta Estacional Semidecidual em Piracicaba, SP: implicações no manejo de fragmentos florestais degradados / Climbing plants community patterns and its relations with tree biomass and natural regeneration in a Seasonal Semidecidual Forest: Implications for the management of degraded forest fragments

Mello, Felipe Nery Arantes 08 October 2015 (has links)
Devido ao histórico processo de exploração e conversão do uso do solo, as florestas tropicais hoje se encontram altamente fragmentadas e com os remanescentes de vegetação sobre constante pressão, como é possível observar para Florestas Estacionais Semideciduais do Estado de São Paulo. O aumento na frequência e intensidade de fatores de perturbação em pequenos fragmentos florestais pode ocasionar uma proliferação desequilibrada de plantas trepadeiras que acabam por contribuir com a degradação florestal iniciada pelas perturbações. Isto se reflete na crescente demanda por resolução de problemas ligados ao manejo de tais plantas em fragmentos florestais como forma de restauração florestal. Sendo assim o presente trabalho teve como objetivos caracterizar a comunidade de plantas trepadeiras em diferentes setores de conservação de um fragmento de Floresta Estacional Semidecidual degradado e avaliar os padrões de associação de variáveis como densidade, diâmetro e biomassa de trepadeiras com variáveis estruturais da flroesta como a regeneração natural e a biomassa arbórea da área total e estratos de conservação. As variáveis que mostraram associação em pelo menos algum estrato foram selecionados para compor modelos candidatos utilizando a densidade de regeneração natural como variável resposta, sendo feito uma seleção do melhor modelo através de Akaike Information Criterion (AIC). Utilizando os modelos selecionados como indicativos, foram traçados e discutidos possíveis estratégias de manejo. Foram amostradas 2323 plantas trepadeiras pertencentes a 62 espécies, 50 gêneros e 20 famílias botânicas. As espécies Mansoa difficilis, Lundia obliqua, Dicella bracteosa, Fridericia triplinervia, Serjania fuscifolia, Adenocalymma marginatum, Bignonia sciuripabula e Bignonia campanulata representaram 50% da abundância total de indivíduos. Os resultados mostraram que a área possui uma grande riqueza e diversidade de plantas trepadeiras, sendo registrada uma abundância heterogênea nos diferentes estratos de conservação, com espécies exclusivas para cada um deles. Algumas espécies como Bignonia campanulata apresentou alta densidade em estratos \"pouco degradados\", média em \"degradados\" e não foi encontrada em \"muito degradados\". Em geral as variáveis de plantas trepadeiras não mostraram tendências de associação com a regeneração natural e biomassa arbórea quando considerado a área total, porém algumas associações moderadas foram obtidas em diferentes estratos de conservação. O modelo selecionado para área total e para setores \"degradado\" e \"muito degradado\" mostrou um efeito negativo da densidade de plantas trepadeiras e positivo da biomassa arbórea sobre a regeneração natural, sendo que para o setor \"pouco degradado\" o melhor modelo não mostrava qualquer efeito de preditoras. Os resultados mostram que parâmetros como a densidade de plantas trepadeiras e a biomassa arbórea do fragmento florestal influênciam a regeneração natural, sendo taís características importantes de serem levadas em conta em atividades de manejo através do corte de trepadeiras, sendo sugerido controle da densidade destas plantas e manutenção e promoção da biomassa arbórea em fragmentos florestais degradados. / Due to the historical process of exploration and conversion of land use in tropical forest, nowadays these regions are highly fragmented and the remaining vegetation under constant pressure, what can be seen in the semideciduous seasonal forests of São Paulo, Brazil. The increase in the frequency and intensity of disturbance factors in small forest fragments can cause an unbalanced proliferation of climbing plants that end up contributing to forest degradation initiated by the disturbances. Demand for solving problems related to the management of these plants as a forest restoration tool has increasingly risen. Thus, the present study aimed to characterize the pattern of climbing plants community in different conservation areas of a small and degraded Seasonal Semidecidual forest fragment and evaluate the patterns of association within variables such as density, diameter and biomass with forest structural variables as the natural regeneration and the tree biomass of the total area and conservation sectors. The variables that were associated with at least some strata were selected to compose candidate models using natural regeneration density as the response variable, being made a selection of the best model using Akaike Information Criterion (AIC). Using the models selected as guides, were drawn and discussed possible management strategies. Were sampled 2323 individuals from climbing plants belonging to 62 species, 50 genera and 20 botanical families. The species difficilis Mansoa, oblique Lundia, bracteosa Dicella, triplinervia Fridericia, Serjania fuscifolia, Adenocalymma marginatum, Bignonia Bignonia campanulata sciuripabula and accounted for 50% of the total abundance of individuals. The results showed that the area has a wealth and diversity of climbing plants, and registered a motley abundance in different conservation sectors, with exclusive species for each of them. Some species as Bignonia campanulata showed high density in sectors \"little degraded,\" few individuals in \"degraded\" sectors and was not found in sectors \"highly degraded\". In general, the variables of climbing plants don\'t showed strong trends of association with natural regeneration and tree biomass when considering the total area, but some moderate associations were obtained in different conservation sectors. The model selected for total area and sectors \"degraded\" and \"highly degraded\" showed a negative effect by the climbing plants density and a positive effect by the tree biomass on natural regeneration. In the other hand the \"little degraded\" sector best model showed no effect of any precditive variable. By the results, the author suggests that the management focused on the control of density and maintenance and promotion of tree biomass would be more suitable in degraded forest fragments.
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Importância dos corredores ripários para a fauna - pequenos mamíferos em manchas de floresta, matriz do entorno e elementos lineares em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica / Importance of riparian corridors for the fauna: small mammals in forest patches, surrounding matrix and linear elements in an Atlantic forest fragmented landscape

Naxara, Laura Regina Capelari 20 October 2008 (has links)
Essa dissertação de mestrado objetivou avaliar a importância dos corredores ripários para a fauna em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica. Em quatro sistemas compostos por fragmento - corredor fragmento avaliamos tanto a assembléia de pequenos mamíferos (capitulo 2) como a qualidade do habitat através da estrutura da vegetação e da disponibilidade de recurso alimentar para a fauna (capitulo 3). No capitulo 2 comparamos a assembléia de pequenos mamíferos entre áreas abertas do entorno, corredores ripários, bordas e interiores de fragmentos. Verificou-se uma forte segregação na distribuição das espécies entre áreas abertas da matriz e os habitats florestados. Todas as espécies endêmicas só foram capturadas nos habitats florestais, enquanto que a matriz de áreas abertas abrigou uma assembléia de pequenos mamíferos composta exclusivamente por espécies não endêmicas ao bioma Mata Atlântica e apenas duas espécies não-endêmicas ocuparam todos os habitats. Observou-se ainda, que as flutuações temporais na abundância das espécies não diferiram entre habitats, ou seja, as diferenças que encontramos na distribuição das espécies não dependeram da sessão de captura. Além disso, a riqueza e abundância das espécies endêmicas foram maiores nos ambientes florestais em comparação a matriz aberta, enquanto que a abundância das espécies não-endêmicas foi maior na matriz comparada aos interiores de fragmentos. As duas espécies endêmicas mais abundantes na área de estudo ocorreram apenas nos habitats florestais, e a abundância das duas foi menor nas bordas do que nos interiores e, em um caso, também do que nos corredores. Por outro lado, a abundância de uma das três espécies não-endêmicas mais comuns foi maior nas bordas do que nos interiores. Assim concluímos os corredores ripários funcionam como elemento conector para a fauna endêmica de pequenos mamíferos da Mata Atlântica, amenizando os efeitos deletérios da fragmentação. No capitulo 3, ao avaliar a qualidade do habitat entre os corredores ripários, e bordas e interiores de fragmentos secundários, observamos que a oferta de recursos alimentares (artrópodes e frutos) para a fauna, assim como a estrutura da vegetação, em termos da estratificação da densidade da folhagem, não variou entre os diferentes tipos de habitat florestal. Nesse sentido, nossos resultados sugerem que, ao contrário do observado em florestas tropicais primárias, em florestas tropicais secundárias não há um efeito de borda claro sobre a qualidade do habitat em termos de estrutura da vegetação ou disponibilidade de alimento para a fauna nem mesmo em estruturas lineares como os corredores. Os resultados apresentados nos dois capítulos evidenciam a importância da manutenção dos corredores ripários para a conservação, em paisagens fragmentadas de Mata Atlântica, da fauna de um dos grupos mais diversificados de mamíferos. / This master thesis aimed to evaluate the importance of riparian corridors for the fauna in an Atlantic Forest fragmented landscape. In four systems composed by fragment corridor fragment, we evaluate both the small mammal assemblage (chapter 2) and the habitat quality measured through the vegetation structure and food resources availability for the fauna (chapter 3). In chapter 2 we compared small mammal assemblages among open areas of the surrounding matrix, riparian corridors, edges and interiors of forest fragments. We verified a strong segregation in species distribution between the open matrix and the forested habitats. Endemic species were captured only in forested habitats, while the open areas of the matrix harbored a small mammals assemblage composed exclusively by species non-endemic to the Atlantic Forest biome, and only two non-endemic species occupied all habitat types. We also observed that temporal fluctuations in species abundance did not differ among habitats, that is, observed differences in species distribution were not dependent on capture session. Moreover, richness and abundance of endemic species were higher in forested habitats than in the open areas of matrix, while the abundance of nonendemic species was higher in the matrix than in the interior of forest fragments. The two most abundant endemic species occurred only in forested habitats and their abundance was lower at edges compared to forest interiors and, for one of them, also compared to riparian corridors. On the other hand, the abundance of one of the three most common non-endemic species was higher at edges than in interiors. We conclude that riparian corridors function as a connector element for the endemic small mammals of the Atlantic Forest, minimizing the deleterious effects of habitat fragmentation. In chapter 3, through the evaluation of habitat quality in riparian corridors, edges and interiors of second-growth fragments, we observed that food resource availability (arthropods and fruits) for the fauna, as well as the vegetation structure, measured as foliage vertical stratification, did not differ among the three forested habitats. Thus, our results suggest that, contrary to the observed in primary tropical forests, there is no clear edge effects on vegetation structure or on food resources availability for the fauna in secondary forest fragments even in linear habitats such as corridors. The results reported in these two chapters highlight the importance of the maintenance of riparian corridors for the conservation, in fragmented landscapes of the Atlantic Forest, of one of the most diverse group of mammals.
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Pesquisa de Leishmania sp. em flebótomos e mamíferos silvestres de fragmentos florestais na região do Pontal do Paranapanema, SP / Survey of Leishmania sp in sandflies and mammals in forest fragments in the Pontal of Paranapanema region, SP

Nardi, Marcello Schiavo 05 August 2010 (has links)
As alterações ambientais antrópicas são os principais fatores de emergência ou reemergência de doenças infecciosas. A leishmaniose cutânea é uma doença que está relacionada, em caráter epidêmico, com episódios de desmatamento. No entanto, o caráter endêmico da doença ocorre quando o homem se encontra próximo de áreas florestais já colonizadas. O Pontal do Paranapanema é uma área onde ocorreu intenso desmatamento e a mata nativa remanescente está representada pelo Parque Estadual Morro do Diabo e alguns fragmentos florestais. Casos de leishmaniose cutânea em humanos são comuns na região, principalmente em áreas marginais de floresta. O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da fauna flebotomínica e de mamíferos silvestres potencialmente reservatórios no Parque Estadual Morro do Diabo e alguns fragmentos da região, buscando avaliar se o tamanho do fragmento tem influência na ocorrência das espécies e na freqüência de Leishmania sp, através da técnica da PCR. Foram capturadas 26 espécies de flebótomos e sete espécies de mamíferos silvestres. O gênero Brumptomyia foi predominante em quase todas as áreas florestais, com exceção da borda do Parque, que apresentou dominância de Nyssomyia neivai. Os resultados das análises da PCR demonstraram quatro espécies de mamíferos portadores de Leishmania sp, Akodon cursor, Dasyprocta azarae, Didelphis albiventris e Oligoryzomys sp. As amostras de pools de flebotomíneos apresentaram resultados negativos. Não foi observada diferença significativa na freqüência de mamíferos infectados em relação ao tamanho da área florestal. / Anthropogenic environmental changes are the main factors of emergence or reemergence of infectious diseases. Cutaneous leishmaniasis is a disease that is related, in an epidemic form, with episodes of deforestation. However, the endemicity of the disease occurs when the man is close to forest areas already colonized. The Pontal of Paranapanema is an area where massive deforestation has occurred and the remaining native forest is represented by the Morro do Diabo State Park and a few forest fragments. Cases of cutaneous leishmaniasis in humans are common in the region, especially in marginal areas of forest. The aim of this study was a survey of sand flies and mammals potentially reservoirs, in Morro do Diabo State Park and some fragments of the region, seeking to assess whether the fragment size has an influence on species occurrence and frequency of Leishmania, through the PCR technique. We captured 26 species of sandflies and seven species of wild mammals. The genus Brumptomyia was prevalent in almost all forest areas, except the edge of the park, which showed dominance of Nyssomyia neivai. The results of PCR analysis revealed four species of mammals suffering from Leishmania, Akodon cursor, Dasyprocta azarae, Didelphis albiventris and Oligoryzomys sp. Samples of sandfly pools tested negative. There was no significant difference in the frequency of infected mammals in relation to the size of the forest.
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Uso de habitat e padrão de atividade de médios e grandes mamíferos e nicho trófico de Lobo-Guará (Chrysocyon brachyurus), Onça-Parda (Puma concolor) e Jaguatirica (Leopardus pardalis) numa paisagem agroflorestal, no Est / Habitat use and activity patterns use of large and medium size mammals and niche overlap of Manned-wolf (Chrysocyon brachyurus), Mountain-lion (Puma concolor) and ocelot (Leopardus pardalis) in a agroforest landscape, in São Paulo State

Ciocheti, Giordano 17 April 2008 (has links)
O presente trabalho visou analisar padrões de atividade e uso de habitats por mamíferos de médio e grande porte, bem como dieta e sobreposição de nicho trófico de espécies de felinos e canídeos, numa região fragmentada do estado de São Paulo. Na paisagem estudada, existem duas unidades de conservação de proteção integral com vegetação de cerrado e floresta semidecídua, além de fragmentos de floresta nativa (semidecídua) em propriedades privadas. As hipóteses gerais do trabalho são: em ambientes mais impactados, i. as espécies de mamíferos de médio e grande porte tendem a generalizar seu comportamento de uso de habitat e padrão de atividade e ii. predadores de topo de cadeia alimentar aumentam a competição por recursos alimentares. Para explorá-las, foram estudados, por meio de armadilhas fotográficas e triagem de fezes, os seguintes aspectos: a) a freqüência do uso de diferentes habitats por mamíferos de médio e grande porte; b) o padrão de atividade de mamíferos de médio e grande porte; c) a dieta e a sobreposição de nicho de três carnívoros de topo de cadeia alimentar: lobo-guará (Chrysocyon brachyurus), onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis). As coletas foram distribuídas em sete fragmentos, onde existem fitofisionomias nativas - cerrado sensu stricto, cerradão e floresta semidecídua - e também reflorestamento com espécies de eucaliptos. Foram obtidas 165, fotografias, nas quais identificou-se 17 espécies. Foram coletadas e identificadas 233 amostras de fezes, sendo 93 de lobo-guará, 68 de onça-parda, 38 de jaguatirica, 30 de outros pequenos felinos e 4 de cachorro-do-mato. Os resultados mostraram que, de forma geral, os mamíferos de médio e grande porte utilizam a área como um todo; os mamíferos mais especialistas, como o tapiti (Sylvilagus brasiliensis), mantiveram sua preferência por um habitat específico. Testes de correlação de Spearman mostraram que algumas espécies mais suscetíveis a alterações antrópicas mostraram-se correlacionadas a áreas com maior tamanho e grau de conectividade. Em relação aos padrões de atividade, os dados indicam que as espécies estão generalizando o seu comportamento: espécies que tinham atividade em alguns períodos do dia estão permanecendo ativas também em outros períodos. Quanto à dieta, o lobo-guará foi a espécie que utilizou mais itens entre os carnívoros estudados, alimentando-se de aves, répteis, frutos, mamíferos de diversos portes e insetos. A onça-parda e a jaguatirica apresentaram uma dieta mais restrita, sendo que os mamíferos representaram 90% dos itens consumidos. Houve uma alta sobreposição de nicho trófico entre lobo-guará e jaguatirica, indicando competição entre essas espécies. Os resultados, obtidos tanto por meio de armadilhamento fotográfico como por análise da dieta, indicam que pode existir uma relação entre áreas com maior grau de conservação (áreas maiores, menos isoladas estruturalmente e imersas em matrizes mais permeáveis) e a freqüência de mamíferos, a sobreposição de nicho dos carnívoros de topo e a densidade de fezes encontradas / The following study analyzed activity patterns and habitat use of large and medium size mammals as well as diet and trophic niche overlapping of feline and canid species in a fragmented area of the State of São Paulo. The landscape studied contains two fully protected conservation units with cerrado and semi-deciduous vegetation and also remnants of native semi-deciduous forest located in private properties. The general hypothesis of this study are: in more impacted environments, i, large and medium size mammal species tend to generalize their behavior regarding habitat use and activity patterns and ii, top food chain predators increase the competition for resources. The following aspects were studied through photographic traps and fecal sorting: a) frequency of different habitat use by large and medium size mammals; b) activity pattern of large and medium size mammals; c) diet and niche overlapping of three top food chain carnivores: Chrysocyon brachyurus, Puma concolor and Leopardus pardalis. Samples were withdrawn from seven fragments of native phytophysiognomies - cerrado sensu stricto, cerradão and semideciduous forest - and from areas of eucalyptus plantations. One hundred and sixty five photographs were obtained, where 17 species were identified. Two hundred and thirty three samples of feces were collected and identified, of which 93 of Chrysocyon brachyurus, 68 of Puma concolor, 38 of Leopardus pardalis, 30 of other small felines and 4 of Cerdocyon thous. The results show that, generally, large and medium size mammals use the entire area. However, more specialist mammals, such as the Sylvilagus brasiliensis, kept their preference for a more specific habitat. Spearman correlation tests demonstrated that those species which are more susceptible to anthropic alterations were more correlated with areas containing a higher connectivity and bigger size. The data also indicated that species are generalizing their behavior regarding the activity patterns: species that were active in some periods of the day are now remaining active in other periods as well. Among the carnivore species studied, Chrysocyon brachyurus was the specie with the most diversified diet, feeding on birds, reptiles, fruits, insects and mammals. Puma concolor and Leopardus pardalis had more restricted diets, where 90% of the items ingested belonged to other mammals. The trophic niche of C. brachyurus and L. pardalis species were strongly overlapped, indicating competition between them. The results obtained through photographic traps and diet analysis indicate that there might be a relation between more conserved areas (less isolated larger areas immersed in more permeable matrixes) and the frequency of mammals, the overlapping niche of top food chain carnivores ad the density of feces found.
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Aspectos da fisiologia metabólica e do desempenho locomotor em anfíbios anuros: implicações da fragmentação ambiental / Aspects of metabolic physiology and locomotor performance in anuran amphibians: implications of habitat fragmentation

Otani, Lye 05 August 2011 (has links)
Diversos aspectos metabólicos e comportamentais possuem uma estreita relação com as condições do ambiente, havendo um compromisso entre as condições naturais e a dinâmica de modificações sobre os organismos. Devido ao grande índice de degradação ambiental proveniente da atividade humana nos últimos tempos, populações de anfíbios têm sido particularmente mais afetadas devido a sua alta sensibilidade a alterações ambientais. Em uma paisagem fragmentada, a manutenção de metapopulações viáveis é um importante fator a persistência das populações. Dentro deste contexto, este estudo propõe investigar as relações entre a fragmentação florestal e habilidade das algumas espécies de anuros para se deslocar entre os fragmentos, ou entre estes e corpos d\'água. Assim, realizamos comparações, fisiológicas e comportamentais intra e interespecífica de espécies de anuros residentes em paisagens contínuas e fragmentadas em duas localidades da Floresta Atlântica, com base em suas características morfológicas. De acordo com nossos resultados, as diferenças ambientais entre as paisagens estão relacionadas com as diferenças morfofisiológicas entre as espécies. / In the last few decades, human activity has changed environmental condition, resulting in amphibian populations decline all around the world. In this study we analyze the relationships between forest fragmentation and the ability of some frog species to move between forest fragments or between fragments and breeding sites. Our study focus relies on anuran locomotor performance and supporting physiology, and the relationship between these traits and resistance to forest fragmentation. We compare morphological, physiological and behavioral traits between populations of anurans species living in different landscapes (continuous or fragmented) of two sites in the Atlantic Forest. According to our data, differences in environmental conditions of landscape are related to morpho-physiological traits. This relationship, however, depends on the site of the Atlantic Forest and also varies between species.
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Narrativa Ativa: Retrotopia, fragmentação e a reintegração do futuro nas narrativas / Active Narrative: Retrotopia, fragmentation and the reintegration of the future in narratives

Almeida, Nara Luiza Costa de 29 October 2018 (has links)
O contexto de aceleração tecnológica, individuação e sobrecarga informacional gera uma fragmentação dos indivíduos e do coletivo, pressionando os fluxos da narrativa e da experiência em seus níveis ontológico, público, conceitual e metanarrativo. Esse contexto produz mais choques do que damos conta de significar, mais estímulos do que podemos processar sem elevar drástica e cronicamente nossos níveis de ansiedade: choque de futuro e ansiedade de informação, em uma corrida no gelo fino dos contextos líquido-modernos. Quando, olhando adiante, vemos avançar em nossa direção a difusa imagem da entropia informacional, dos choques contínuos e da impossibilidade da significação, voltamo-nos para o território da significação já produzida, a retrotopia. Nela, avançamos na neblina, com os olhos no passado, o novo território das expectativas frente a um futuro incognoscível. Este estudo exploratório relaciona o contexto descrito com os processos semióticos (para significação individual e coletiva) para que haja retomada nos fluxos narrativos em suas dimensões. Essa trajetória é a narrativa em ação pela reintegração social no futuro enquanto território de sentidos e expectativas compartilhadas. Por fim, avalia documentalmente a relação dos conceitos investigados no caso Facebook-Cambridge Analytica, para identificar dinâmicas dessas correlações na sociedade contemporânea. / The context of technological acceleration, individuation and informational overload generates a fragmentation of individuals and the collective, putting pressure on the flows of narrative and experience in their ontological, public, conceptual and metanarrative levels. This context produces more shocks than we have the ability to make meaningful, more stimulus than we can process without elevating dramatically and chronically our levels of anxiety: future shock and information anxiety, in a race above the thin ice of liquid-modern contexts. When, looking ahead, we see the diffuse image of informational entropy, continuous shocks, and the impossibility of signification, we turn towards the territory of signification already produced, retrotopia. In it, we advance in the mist, with our eyes on the past, which is now the new territory of expectations in the face of an unknowable future. This exploratory study relates the context described with the semiotic processes (for individual and collective signification) so that it can be resumed in the narrative flows in its dimensions. This trajectory is the narrative in action for social reintegration into the future as a territory of shared meanings and expectations. Finally, it evaluates documentarily the relationship of the concepts investigated in the Facebook-Cambridge Analytica case, to identify dynamics of these correlations in contemporary society.
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Estudo dos fatores envolvidos na fragmentação de DNA dos espermatozoides em ovinos / Study of factors involved in DNA fragmentation of spermatozoa in rams

Hamilton, Thais Rose dos Santos 17 December 2014 (has links)
A fragmentação do DNA espermático é uma das principais causas de infertilidade nos machos. Alterações na integridade do DNA podem ser decorrentes da ação de espécies reativas de oxigênio (EROS), de defeitos na protaminação e da apoptose. A sensibilidade do espermatozoide ovino frente as biotecnologias reprodutivas pode ser resultado de uma alta suscetibilidade a ação de EROS ou alterações na protaminação espermática desencadeadas por estresse oxidativo induzido por estresse térmico, tornando o espermatozoide mais suscetível a fragmentação de DNA. Com o objetivo de entender mais este processo, foi realizado um primeiro experimento para avaliar o status oxidativo, os atributos espermáticos e a expressão gênica de proteínas envolvidas nos processos de protaminação em diferentes níveis de suscetibilidade a peroxidação lipídica (baixo, médio, alto e altíssimo) em sêmen ovino. Foi observado um aumento da atividade enzimática da glutationa peroxidase e uma diminuição da atividade enzimática da glutationa redutase no plasma seminal no grupo com suscetibilidade a peroxidação lipídica alta e altíssima. Com relação a catalase, não foi verificado esse aumento, no entanto houve maior imunodetecção desta enzima. Em relação a condição espermática, observou-se um aumento na porcentagem de defeitos totais e lesões nas membranas acrossomal e plasmática, além de porcentagens menores de espermatozoides com baixo potencial de membrana mitocondrial no grupo com maior suscetibilidade a peroxidação lipídica. Este mesmo grupo também apresentou alta suscetibilidade ao dano da cromatina e aumento do número de cópias do gene da protamina 1 (PRM1) em espermatozoides. O segundo experimento avaliou os atributos de espermatozoides provenientes do ejaculado e do epidídimo frente ao estresse térmico induzido por insulação testicular (tratado), assim como as relações com o status antioxidante. Observou-se diminuição da motilidade, vigor, turbilhonamento e aumento na porcentagem de defeitos maiores e menores, e de lesões na membrana acrossomal e plasmática em espermatozoides ejaculados no grupo tratado. Essas diferenças não foram observadas em espermatozoides epididimais. Uma maior atividade enzimática da glutationa peroxidase e da glutationa redutase foi observada no plasma seminal do grupo tratado. Foi verificado uma diminuição de espermatozoides com alto potencial de membrana mitocondrial no grupo tratado, indicando que o metabolismo mitocondrial parece estar envolvido no quadro de estresse oxidativo. Um terceiro estudo foi conduzido para verificar o efeito do estresse térmico na integridade da cromatina espermática, na protaminação do DNA espermático e na ativação de vias apoptóticas em testículo ovino. Em espermatozoides provenientes do ejaculado, houve um aumento da porcentagem de células com suscetibilidade a fragmentação da cromatina no grupo tratado; não observado em espermatozoides epididimais. Uma alta porcentagem de espermatozoides com fragmentação de DNA grau III (ensaio COMETA) e aumento do número de cópias de mRNA da proteína de transição 1 (TNP1) em espermatozoides provenientes do ejaculado, foi observada no grupo tratado. Já em espermatozoides provenientes do epidídimo, a PRM1 apresentou maior expressão no 30ο dia do ciclo espermático comparado a 7ο dia, enquanto que a TNP1 comportou-se de maneira contrária. Em relação a ativação de vias apoptóticas em testículo ovino, a proteína anti-apoptótica Bax foi imuno-identificada em espermatócitos e a Blc-2 em espermátides, sem diferença entre os grupos. Em conclusão, a alta susceptibidade dos espermatozoides ovinos a peroxidação lipídica altera o status oxidativo ocasionando um quadro de estresse oxidativo, principal causador de dano a cromatina. Adicionalmente, o estresse oxidativo induzido por estresse térmico prejudica os atributos espermáticos e aumenta a suscetibilidade dos espermatozoides a fragmentação de DNA. / Sperm DNA fragmentation is referred as one of the main causes of male\'s infertility. Among the etiologies of abnormalities on DNA integrity the action of reactive oxygen species (ROS), protamination failures and apoptosis are considered the most important. The known sensitivity of ram´s sperm to reproductive biotechnologies could be a result of a higher susceptibility to the action of ROS or changes in sperm protamination triggered by oxidative stress induced by heat stress. This would increase the susceptibility of sperm DNA to fragmentation. Initially, the ram sperm quality, seminal protamine gene expression and oxidative status were evaluated in semen samples of different levels of susceptibility to lipid peroxidation (low, medium, high and very high). There was an increase on glutathione peroxidase and decreased glutathione reductase enzymes' activity in groups with high and very high susceptibility to lipid peroxidation. However, only catalase showed increased immunodetection. An increase on total defects and damaged acrosomal and plasmatic membranes were observed in the group showing the highest susceptibility to lipid peroxidation. Also, the percentage of sperm with low mitochondrial membrane potential, the percentage of sperm susceptible to chromatin damage and the number of copies of protamine 1 (PRM1) mRNA were increased in the group showing higher susceptibility to lipid peroxidation. The second study evaluated sperm\'s attributes from the epididymis and ejaculated sperm subjected to heat stress induced by testicular insulation (treated group), as well as correlations with the antioxidant status. We observed decrease on motility, vigor, and mass motility and increase on the percentages of sperm showing major and minor defects, and damaged plasma and acrosome membranes in the treated group. These differences were not observed in epididymal sperm. Increased enzymatic activities of glutathione peroxidase and glutathione reductase were observed in the treated group. Mitochondrial metabolism appeared to be involved in the oxidative homeostasis imbalance. This was effectively observed by a decrease on the percentage of sperm with high mitochondrial membrane potential in the treated group. A third study was conducted to determine the effect of heat stress induced by testicular insulation on the integrity of chromatin, protamination and apoptotic activation pathway in ram testis. An increase on the percentage of sperm with susceptibility to chromatin fragmentation in the treated group was observed. However, the previous findings were not observed in epididymal sperm. A higher percentage of sperm showing DNA fragmentation level III (Comet assay) and an increase on the number of copies of transition protein 1(TNP1) mRNA were observed in the treated group. In epididymal sperm, a higher expression of the PMR1 gene was observed on the 30th day of the espermatogenic cycle, while TNP1 behaved contrarily. In the testicular samples, the anti-apoptotic protein Bax was detected only in spermatocytes while Bcl-2 was observed singularly in spermatids, with no difference between groups. In conclusion, the disruption of oxidative homeostasis may be exacerbated by the higher susceptibility of ram\'s sperm to lipid peroxidation, which could be the main etiology of chromatin damage. In addition, oxidative stress induced by heat stress impairs sperm attributes and DNA integrity.
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Proteólise miofibrilar e maciez da carne de bovinos (Bos indicus) submetidos a diferentes técnicas pós-morte de resfriamento das carcaças / Myofibril fragmentation index and shear force of Bos indicus steers and heifers submitted to different hanging positions during chilling

Silva, Eliane Bonifácio 18 November 2005 (has links)
O objetivo deste trabalho foi avaliar a posição da suspensão de carcaças durante o período de resfriamento, no primeiro experimento lados alternados de dez animais Nelores machos castrados, foram suspensos pelo método tradicional (Tendão de Aquiles) ou dispostos horizontalmente em pallets, no segundo experimento lados alternados de 16 animais machos castrados e 16 fêmeas foram suspensos pelo método tradicional (Tendão de Aquiles) ou pelo músculo Carpo Radial. Amostras do músculo Longissimus dorsi na 12ª costela foram coletadas de todos os lados (42 lados esquerdos e 42 lados direitos) após o período de 24 horas de resfriamento, estas amostras foram embaladas a vácuo e maturadas por sete dias antes de serem congeladas e armazenadas até a realização das analises de força de cisalhamento, perdas de água por cocção e índice de fragmentação miofibrilar (MFI). Para a primeira experiência nenhuma diferença foi observada para espessura de gordura subcutânea, perdas de água por cocção, força de cisalhamento e MFI.Na segunda experiência não houve diferença para espessura de gordura entre os tratamentos, mas as fêmeas apresentavam maior espessura que os machos. Para perdas de água por cocção e força de cisalhamento não houve diferença, mas observando o MFI existe diferença entre os machos e fêmeas e também entre os métodos de pendura. A média de MFI para o tratamento de suspensão pelo Carpo Radial foi maior do que a suspensão pelo tendão de Aquiles. / The objective of this work was to evaluate the carcass hanging position during the chilling period in which 1st experiment: alternate sides of ten Nellore steers were hang either by the traditional way (Achilles tendon) or placed horizontally over pallets or 2nd experiment: alternate sides of 16 Nellore steers and 16 Nellore heifers were hang either by the Achilles tendon or by the Carpus radial muscle of the forequarter. Longissimus dorsi muscle samples at the 12th rib level were removed from all sides (42 left and 42 right sides) after a 24 hr chilling period, vacuum packaged and aged for 7 days before being frozen and kept for future analysis of shear force, cooking losses and Myofibril fragmentation index (MFI). For the first experiment no differences were observed for fat thickness, cooking losses, shear force and MFI. In the second experiment there was not differences for fat thickness between treatments but heifers showed a thicker fat layer than steers. For cooking losses and shear force there was not differences although for the MFI and hanging position between heifers and steers were observed. The MFI average of the treatment hang by the Carpus radial muscle were higher than the treatment hang by the Achilles tendon.
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Avaliação do efeito da fragmentação florestal na diversidade de carrapatos e patógenos transmitidos por carrapatos ma região do Pontal Paranapanema, SP / Evaluating the impact of forest fragmentation on prevalence and transmission of tick pathogens

Peterka, Cássio Roberto Leonel 12 December 2008 (has links)
Avaliou-se o impacto da fragmentação florestal na diversidade de carrapatos de vida-livre e a presença de patógenos nestes carrapatos em remanescentes florestais do Pontal do Paranapanema, estado de São Paulo, Brasil. Estes fragmentos florestais abrigam uma rica e importante biodiversidade, com espécies endêmicas e ameaçadas como o mico-leão-preto (Leontopithecus chrysopygus), a anta (Tapirus terrestris), a onça pintada (Panthera onca), o macuco (Tinamus solitarius) e várias outras espécies de aves, mamíferos, répteis, anfíbios e peixes. Aproximadamente 90% das espécies de carrapatos parasitam exclusivamente hospedeiros selvagens. O restante pode ter animais domésticos e humanos como hospedeiros. Embora a maioria das pesquisas tenha sido dirigida a espécies de importância econômica, os carrapatos que parasitam animais selvagens possuem relevante papel na manutenção dos níveis de patógenos em populações de vida livre. Algumas destas espécies, por exemplo, demonstraram que podem parasitar hospedeiros não selvagens e promover o surgimento de zoonoses. Em habitats fragmentados, a diversidade de espécies vertebradas é menor se comparado a habitats com pouca alteração antrópica. Portanto, a fragmentação do habitat diminui a diversidade de espécies de carrapatos também. Para estudar a relação entre a fragmentação florestal e a ecologia das populações de carrapatos foram coletados carrapatos em 8 fragmentos florestais pelo método de arrasto de flanela e inspeção visual da vegetação. Os índices de comparação utilizados foram de similaridade de Jaccard, de diversidade de Shannon e complexidade do fragmento florestal de Patton. Utilizou-se o modelo de regressão linear para compara os índices de Shannon e Patton. Um total de 2149 ninfas de Amblyomma spp foi coletado e foram identificadas as espécies de 629 carrapatos. As espécies coletadas foram Amblyomma cajennense (94,28%), A. coelebs (1,59%), A. naponense (2,86%), A. ovale (0,64%), A. nodosum (0,32%), A. brasiliense (0,16%) e Haemaphysalis juxtakochi (0,16%). Nenhum indivíduo testado foi positivo pelo teste da hemolinfa. Os resultados mostraram uma tendência de correlação entre a fragmentação floresta, e a diversidade de espécies de carrapatos. / This study evaluated the impact of forest fragmentation on diversity of freeliving ticks and prevalence of tick pathogens in remaining forest fragments in the Pontal do Paranapanema, São Paulo state, Brazil. These forest fragments shelter rich and important biodiversity, with endemic and threatened species such as the black lion tamarin (Leontopithecus chrysopygus), the tapir (Tapirus terrestris), jaguar (Panthera onca), the solitary tinamou (Tinamus solitarius) and various other species of birds, mammals, reptiles, amphibians and fish. Approximately 90% of tick species parasitize exclusively wild hosts. The remainder can also have domestic animals and humans as hosts. Although most research has been directed to species of economic importance, ticks that parasitize wild animals are also relevant due to their role in maintaining enzootic pathogen levels in wild populations. Some of these species, for example, have been shown to cross-over onto non-wild hosts and promote emergent zoonoses. In fragmented habitats, the diversity of vertebrate species is normally lower than comparable habitats with minimal anthropic alteration. Thus, habitat fragmentation decreases the diversity of tick species too. To study the relationship between forest fragmentation and population ecology of ticks, ticks were collected in 8 forest fragments using dragging and visual inspection of vegetation. The index used were Jaccard´s similarity, diversity f Shannon and Patton. The linear regression model was used to compare Shannon and Patton indexes. A total of 2149 nymphs of Amblyomma spp. And 629 identified ticks was collected. The species of ticks collected was Amblyomma cajennense (94,28%), A. coelebs (1,59%), A. naponense (2,86%), A. ovale (0,64%), A. nodosum (0,32%), A. brasiliense (0,16%) e Haemaphysalis juxtakochi (0,16%). All ticks were negative by hemolimph test. The results showed a tendency of correlation between forest fragmentation and diversity of tick species.

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