Made available in DSpace on 2014-12-17T15:14:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LucioMSA_DISSERT.pdf: 2352542 bytes, checksum: 3ddf1aee669aec19aca5499d42ccdccb (MD5) Previous issue date: 1999-12-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Usamos um c?digo num?rico euleriano de diferen?as finitas, chamado ZEUS 3D, para fazer simula??es envolvendo a colis?o entre duas nuvens moleculares magnetizadas, visando avaliar a taxa de forma??o estelar desencadeada pela colis?o e analisar como essa taxa varia, dependendo das orienta??es relativas entre os campos magn?ticos das nuvens antes do choque. O c?digo ZEUS 3D n?o ? um c?digo de f?cil tratamento. Tivemos de criar duas sub-rotinas, uma para estudar a colis?o nuvem-nuvem e outra para a sa?da dos dados. O ZEUS ? um c?digo baseado em m?dulos. Seu funcionamento hier?rquico ? explicado, assim como o funcionamento de nossas sub-rotinas. Estudamos a colis?o entre duas nuvens moleculares, empregando dois conjuntos diferentes de valores iniciais para densidade, temperatura e campo magn?tico das nuvens e do meio. Para cada conjunto desses valores, analisamos detalhadamente seis casos com diferentes dire??es e sentidos do campo magn?tico das nuvens em rela??o ? dire??o do seu movimento. A an?lise desses doze casos nos permitiu comprovar previs?es te?rico-anal?ticas propostas na literatura e nos possibilitou a obten??o de v?rios resultados originais. Trabalhos anteriores indicaram que, se os campos magn?ticos das nuvens antes da colis?o forem ortogonais ? dire??o do movimento, ocorre forte inibi??o da forma??o de estrelas durante um choque nuvem-nuvem, enquanto que esses campos magn?ticos forem paralelos ao movimento haver? indu??o da forma??o estelar. Nosso tratamento do problema comprovou numericamente essas previs?es, permitindo inclusive quantificar as relativas efici?ncias de forma??o estelar em cada caso. E mais: propusemos e analisamos um caso intermedi?rio, onde uma nuvem teria campo ortogonal ao movimento e a outra teria campo paralelo a este. Conclu?mos que neste caso ocorre forma??o estelar com uma taxa tamb?m intermedi?ria entre os dois extremos mencionados. Al?m disso, estudamos o caso onde os campos s?o ortogonais ? dire??o do movimento, mas, em vez de serem paralelos um ao outro, eles s?o antiparalelos, o que tampouco havia sido feito na literatura, e obtivemos a correspondente varia??o da taxa de forma??o de estrelas devido a essa altera??o de configura??o. Nosso estudo permite extrair das simula??es a taxa de forma??o estelar em cada caso, assim como a depend?ncia temporal dessa taxa conforme cada uma das colis?es estudadas evolui, o que fazemos em detalhe para um dos casos em particular. Os valores para a taxa de forma??o de estrelas que obtivemos est?o de acordo com aqueles esperados dos dados observacionais existentes at? o presente momento

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:14:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ManiloSM_DISSERT_1-50.pdf: 4744435 bytes, checksum: 63f2fe48dd9e2c3e0e16f7ec2bb17cdf (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Investigamos neste trabalho as propriedades da din?mica da magnetiza??o em amostras na forma de multicamadas de [Co40Fe40B20/M] ? 50 produzidas por magnetron sputtering, com 10 nm de espessura da camada amorfa de CoFeB e 2 nm de espessura para a camada M, onde M ? uma material met?lico n?o magn?tico, tais como, Ta, Ag e Cu. Atrav?s das medidas de difra??o de raio-X (caracteriza??o estrutural) e das medidas de magnetostric??o, obtidas atrav?s de um sistema cantilever , foi poss?vel explicar o comportamento da din?mica da magnetiza??o obtida pelas medidas do efeito Magnetoimped?ncia (MI) realizadas em um amplo intervalo de freq??ncia, 10 MHz at? 1800 MHz. Os resultados mostram a influ?ncia das diferen?as estruturais e do comportamento magnetostrictivo em fun??o dos diferentes materiais espa?adores no efeito MI. Com os dados obtidos na caracteriza??o magn?tica e com os modelos propostos por L. Spinu para o c?lculo do tensor susceptibilidade transversal e L. V. Panina para o c?lculo da MI de uma tri-camada foi poss?vel simular para uma faixa de freq??ncias o efeito MI nas amostras estudadas.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:14:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CalistroSCN.pdf: 698756 bytes, checksum: 2ee4fe2f9e66e82eba6613dc8d66afde (MD5) Previous issue date: 2006-07-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / In this work we obtain the cosmological solutions and investigate the thermodynamics of matter creation in two diferent contexts. In the first we propose a cosmological model with a time varying speed of light c. We consider two diferent time dependence of c for a at Friedmann-Robertson- Walker (FRW) universe. We write the energy conservation law arising from Einstein equations and study how particles are created as c decreases with cosmic epoch. The variation of c is coupled to a cosmological Λ term and both singular and non-singular solutions are possible. We calculate the "adiabatic" particle creation rate and the total number of particles as a function of time and find the constrains imposed by the second law of thermodynamics upon the models. In the second scenario, we study the nonlinearity of the electrodynamics as a source of matter creation in the cosmological models with at FRW geometry. We write the energy conservation law arising from Einstein field equations with cosmological term Λ, solve the field equations and study how particles are created as the magnetic field B changes with cosmic epoch. We obtain solutions for the adiabatic particle creation rate, the total number of particles and the scale factor as a function of time in three cases: Λ = 0, Λ = constant and Λ α H2 (cosmological term proportional to the Hubble parameter). In all cases, the second law of thermodynamics demands that the universe is not contracting (H ≥ 0). The first two solutions are non-singular and exhibit in ationary periods. The third case studied allows an always in ationary universe for a suficiently large cosmological term / Neste trabalho, n?s obtemos as solu??es cosmol?gicas e investigamos a termodin?mica da cria??o de mat?ria em dois contextos diferentes. No primeiro, n?s propomos um modelo cosmol?gico com a velocidade da luz c variando com o tempo. N?s consideramos duas depend?ncias temporais diferentes para c em um universo plano de Friedmann-Robertson-Walker (FRW). N?s escrevemos a lei da conserva??o da energia que surge das equa??es de Einstein e estudamos como as part?culas s?o criadas quando c decresce com o tempo c?smico. A varia??o de c ? acoplada a um termo cosmol?gico Λ e solu??es singulares e n?o-singulares s?o poss?veis. N?s calculamos a taxa de cria?o adiab?tica de part?culas e o n?mero total de partculas como fun??o do tempo e encontramos os v?nculos impostos pela segunda lei da termodin?mica sobre esses modelos. No segundo cen?rio, n?s estudamos a n?o-linearidade da eletrodin?mica como uma fonte de cria??o de mat?ria em modelos cosmol?gicos com geometria de FRW. N?s escrevemos a lei de conserva??o da energia obtida a partir das equa??es de Einstein com termo cosmol?gico A, resolvemos as equa??es de campo e estudamos como as part?culas s?o criadas quando o campo magn?tico B muda com a ?poca c?smica. N?s obtemos solu??es para a taxa de cria??o adiab?tica de part?culas, o n?mero total de part?culas e o fator de escala como uma fun??o do tempo em tr?s casos: Λ = 0, Λ = constante e Λ / H2 (termo cosmol?gico proporcional ao par?metro de Hubble). Em todos os casos, a segunda lei da termodin?mica imp?e que o universo n?o est? em contra??o (H ≥ 0). As primeiras duas solu??es s?o n?o-singulares e exibem per?odos in acion?rios. O terceiro caso permite universos sempre in acion?rios para um termo cosmol?gico suficientemente grande

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:32:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarianneVC_Dissert.pdf: 1419234 bytes, checksum: 19a586a86828d12941eac044033e933c (MD5) Previous issue date: 2010-02-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Introdu??o: A displasia epitelial oral (DEO) ? uma les?o potencialmente maligna, cujo diagn?stico e grada??o se baseia na histologia das altera??es arquiteturais e citol?gicas, preconizados pela OMS, que divide a les?o em leve, moderada e severa, o qual ? subjetivo. Maior concord?ncia ? observada no uso do sistema bin?rio (baixo/alto risco), o qual est? relacionado ao risco de transforma??o maligna. As galectinas constituem uma fam?lia de lectinas e est?o envolvidas na tumorig?nese, sendo a -1, -3 e -7 as mais investigadas, devido a express?o alterada em c?nceres orais. Materiais e m?todos: Foi analisada a express?o imuno-histoqu?mica dessas prote?nas em 50 esp?cimes de DEO (21 baixo/ 29 alto risco) e 5 de mucosa oral normal e relacionamos com a presen?a/aus?ncia de marca??o, padr?o de distribui??o, intensidade, localiza??o epitelial (estratifica??o) (1/3 inferior, m?dio e superior), e localiza??o celular (compartimento) (n?cleo, citoplasma e membrana) . Resultados: Dos 29 casos de alto e dos 21 de baixo risco, 21 (72,4%) e 12 (57,1%) foram positivos para a galectina -1, respectivamente. Dessa forma, de 50 casos, 33 foram positivos. O n?cleo e citoplasma foram positivos em 91,7% nas de baixo risco e em 90,5% nas de alto. Todos os casos de mucosa normal foram negativos. Com rela??o a galectina -3, dos 21 casos das DEOs de baixo risco, 12 (57,1%) apresentaram express?o e dos 29 casos das DEOs de alto risco, 15 (51,7%) foram positivos, havendo imunoexpress?o em um total de 27 casos. O padr?o difuso, assim como a fraca intensidade foram os mais freq?entes para os 2 graus. O n?cleo e o citoplasma foram a localiza??o mais comum tanto nas les?es de baixo (58,3%), quanto nas de alto risco (66,7%). Quatro casos de mucosa normal foram positivos, com marca??o membranar e intensidade fraca. Dos 21 casos das DEOs de baixo risco, 17 (81%) apresentaram express?o imuno-histoqu?mica para a galectina -7 e das 29 DEOs de alto risco, 27 (93,1%) foram positivos. Ent?o, a express?o imuno-histoqu?mica da galectina -7 foi observada em 44 casos, a maioria com intensidade de moderada a forte. O n?cleo e o citoplasma foram a localiza??o mais freq?ente, nas de baixo (70,6%) e alto risco (66,7%). Quatro esp?cimes de mucosa normal marcaram membrana em ter?o m?dio e superior, com intensidade moderada a forte. Conclus?es: Altera??es na express?o das galectinas -3 e -7 e principalmente da -1 sugerem seu envolvimento na fisiopatologia das displasias, participando do processo de transforma??o de fen?tipo normal para o displ?sico. / Introdu??o: A displasia epitelial oral (DEO) ? uma les?o potencialmente maligna, cujo diagn?stico e grada??o se baseia na histologia das altera??es arquiteturais e citol?gicas, preconizados pela OMS, que divide a les?o em leve, moderada e severa, o qual ? subjetivo. Maior concord?ncia ? observada no uso do sistema bin?rio (baixo/alto risco), o qual est? relacionado ao risco de transforma??o maligna. As galectinas constituem uma fam?lia de lectinas e est?o envolvidas na tumorig?nese, sendo a -1, -3 e -7 as mais investigadas, devido a express?o alterada em c?nceres orais. Materiais e m?todos: Foi analisada a express?o imuno-histoqu?mica dessas prote?nas em 50 esp?cimes de DEO (21 baixo/ 29 alto risco) e 5 de mucosa oral normal e relacionamos com a presen?a/aus?ncia de marca??o, padr?o de distribui??o, intensidade, localiza??o epitelial (estratifica??o) (1/3 inferior, m?dio e superior), e localiza??o celular (compartimento) (n?cleo, citoplasma e membrana) . Resultados: Dos 29 casos de alto e dos 21 de baixo risco, 21 (72,4%) e 12 (57,1%) foram positivos para a galectina -1, respectivamente. Dessa forma, de 50 casos, 33 foram positivos. O n?cleo e citoplasma foram positivos em 91,7% nas de baixo risco e em 90,5% nas de alto. Todos os casos de mucosa normal foram negativos. Com rela??o a galectina -3, dos 21 casos das DEOs de baixo risco, 12 (57,1%) apresentaram express?o e dos 29 casos das DEOs de alto risco, 15 (51,7%) foram positivos, havendo imunoexpress?o em um total de 27 casos. O padr?o difuso, assim como a fraca intensidade foram os mais freq?entes para os 2 graus. O n?cleo e o citoplasma foram a localiza??o mais comum tanto nas les?es de baixo (58,3%), quanto nas de alto risco (66,7%). Quatro casos de mucosa normal foram positivos, com marca??o membranar e intensidade fraca. Dos 21 casos das DEOs de baixo risco, 17 (81%) apresentaram express?o imuno-histoqu?mica para a galectina -7 e das 29 DEOs de alto risco, 27 (93,1%) foram positivos. Ent?o, a express?o imuno-histoqu?mica da galectina -7 foi observada em 44 casos, a maioria com intensidade de moderada a forte. O n?cleo e o citoplasma foram a localiza??o mais freq?ente, nas de baixo (70,6%) e alto risco (66,7%). Quatro esp?cimes de mucosa normal marcaram membrana em ter?o m?dio e superior, com intensidade moderada a forte. Conclus?es: Altera??es na express?o das galectinas -3 e -7 e principalmente da -1 sugerem seu envolvimento na fisiopatologia das displasias, participando do processo de transforma??o de fen?tipo normal para o displ?sico.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-02-15T11:56:11Z No. of bitstreams: 1 AnaBeatrizMedeirosLinsDeAlbuquerqueTavares_DISSERT.pdf: 11754321 bytes, checksum: 9e9a6f52cc32b8d2dcb05449e7c48e9b (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-02-16T15:39:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AnaBeatrizMedeirosLinsDeAlbuquerqueTavares_DISSERT.pdf: 11754321 bytes, checksum: 9e9a6f52cc32b8d2dcb05449e7c48e9b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-16T15:39:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaBeatrizMedeirosLinsDeAlbuquerqueTavares_DISSERT.pdf: 11754321 bytes, checksum: 9e9a6f52cc32b8d2dcb05449e7c48e9b (MD5) Previous issue date: 2017-12-08 / Quando ativado, o nosso sistema imunol?gico ? capaz de reconhecer e destruir c?lulas tumorais pela ativa??o dos chamados pontos de verifica??o imunol?gicos, essenciais para evitar eventos autoimunes, criando barreiras para a ativa??o de c?lulas T e rejei??o de tumores. Uma das principais vias de inibi??o ? feita pela prote?na PD-1, cuja ativa??o ? explorada por v?rios tipos de tumores cancer?genos, sendo considerado hoje em dia uma abordagem terap?utica nova e importante para o tratamento do c?ncer em geral incluindo o c?ncer de mama. V?rios anticorpos inibidores dos pontos de verifica??o imunol?gicos j? foram aprovados pela US-FDA (United States - Food and Drug Administration) para interromper a intera??o do receptor PD-1 com os seus ligantes PD-L1 e PDL2, atenuando os sinais inibit?rios e aumentando a resposta antitumoral.Entre eles, a droga pembrolizumab, um anticorpo inibidor do ponto de controle imune, est? sendo amplamente utilizada para bloquear eficientemente um mecanismo protetor do tumor, estimulando as c?lulas T para atacar e destruir as c?lulas cancer?genas. Dentro deste contexto, o objetivo deste trabalho ? descrever as energias de intera??o entre a prote?na PD-1, o receptor de morte celular programado, e seu inibidor, o f?rmaco pembrolizumab, usando m?todos de bioqu?mica qu?ntica, considerando-se a estrutura cristalina da prote?na PD-1 emcomplexo com seu inibidor. A energia de intera??o entre cada mol?cula de PD-1 e o f?rmaco foi calculada in silico atrav?s de abordagens qu?nticas, levando-se em conta res?duos de amino?cidos atrativos e repulsivos significativos. Foi observado poucas intera??es repulsivas, com forte predomin?ncia da contribui??o atrativa, apontando para uma forte inibi??o do receptor PD-1. Al?m disso, foram analisados v?rios aspectos bioqu?micos, especialmente ?queles relacionados aos pontos de verifica??o imune. Nossos resultados mostram que o m?todo computacional usado neste trabalho ? um primeiro passo, de baixo custo, para desvendar os res?duos de amino?cidos do f?rmaco que desempenham o papel mais importante na afinidade de liga??o do complexo pembrolizumab / PD-1. Al?m disso, pode ser considerado uma etapa qualitativa para que a imunoterapia se torne uma das ferramentas padr?o, levando ao desenvolvimento de novas e eficientes drogas farmac?uticas contra o c?ncer. / During immunosurveillance, the immune system is capable to recognize and destroy tumor cells by the activation of the so-called immunological checking points, essential to avoid autoimmune events, creating barriers to the T-cell activation and tumor rejection. One of the foremost inhibitory pathways is done by the PD-1 protein (Programmed cell death protein-1), which is activated by several types of cancerous tumors, and is now considered a new and important therapeutic approach for the treatment of cancer in general, including breast cancer. Several immune checkpoint inhibitor antibodies are already approved by the US-FDA (United States - Food and Drug Administration) to bind the protein PD-1, disrupting its interaction with the PD-L1 and PD-L2 ligands, thereby attenuating inhibitory signals and augmenting the host anti-tumor response. Among them, the drug pembrolizumab, an immune checkpoint inhibitor antibody, is being widely used to efficiently blocks a protective mechanism on cancer cells, triggering the T-cells to destroy them. The aim of this work is to describe the interaction energies between the protein PD-1 and its drug inhibitor pembrolizumab by using a quantum biochemistry calculation, taking advantage of the X-ray crystal structure of the protein PD-1 in complex with its inhibitor. The interaction energy between each PD-1 molecule and the drug was calculated in silico through quantum chemistry approaches considering any significant attractive and repulsive drug?s amino acid residues. Although it was observed few repulsive interactions, the attractive ones were predominant, pointing out to a strong inhibition of the programmed cell death receptor. Besides, several biochemical aspects were analyzed, especially those related to the immune checking points. Our results show that the computational method used in this work is a low cost efficient first step to unveil the drug?s amino-acids residues that play the most important role on the binding affinity of the pembrolizumab/PD-1 complex. Besides, it can be considered a great qualitative step for immunotherapy to become one of the standard tools leading to the development of new and effective cancer drugs.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-02-21T21:54:36Z No. of bitstreams: 1 GabrielleMacedoPereira_TESE.pdf: 7916343 bytes, checksum: 47f4f16d292c186e81c42187080b1343 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-02-23T21:04:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 GabrielleMacedoPereira_TESE.pdf: 7916343 bytes, checksum: 47f4f16d292c186e81c42187080b1343 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-23T21:04:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GabrielleMacedoPereira_TESE.pdf: 7916343 bytes, checksum: 47f4f16d292c186e81c42187080b1343 (MD5) Previous issue date: 2017-08-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / O bioma Caatinga ? exclusivamente brasileiro, marcado pelo clima semi?rido. Este bioma se destaca pelo alto ?ndice de endemismo e desconhecimento cient?fico ao seu respeito. Para sobreviver neste ambiente, as plantas desenvolveram mecanismos intr?nsecos de percep??o dos sinais ambientais externos e suas respectivas respostas metab?licas. Dentre as esp?cies de ocorr?ncia no bioma Caatinga, como fonte de alcaloides bioativos, destaca-se Erythroxylum pungens, que apresenta potencial pouco explorado. Assim, o objetivo deste trabalho ? investigar o proteoma total e o perfil metab?lico de E. pungens, aliado ? bioprospec??o de alcaloides trop?nicos com potencial citot?xico. Para isso, no cap?tulo 1 identificou-se, por espectrometria de massas, sete alcaloides trop?nicos conhecidos; 3-(2-metilbutiriloxi)tropan-6, 7-diol como tamb?m 3-(2-metilbutiriloxi)nortropan-6, 7-diol foram isolados e caracterizado por RMN 1D e 2D pela primeira vez. N,N-Dimetil-1-H-indol-3-etanamina foi isolado e caracterizado a partir de ra?zes de E. pungens. Al?m disso, verificou-se que alcaloides isolados de E. pungens, frente a cinco linhagens celulares, apontaram potencial seletivo de 3-(2-metilbutiriloxi)tropan-6, 7-diol contra c?lulas de tumorais de pr?stata. Para melhor conhecer a esp?cie e, com vistas na produ??o de alcaloides trop?nicos, trabalhou-se o proteoma e perfil alcalo?dico no cap?tulo 2. Dessa forma foi poss?vel identificar 1746 prote?nas nas folhas, 1779 no caule e 1026 na raiz de E. pungens. Atrav?s da recupera??o dos termos no Gene Ontology, observou-se os processos nos quais estas prote?nas est?o envolvidas, verificando o mesmo perfil de processos para os tr?s ?rg?os de E. pungens, com destaque para respostas a estresses bi?ticos, abi?ticos, qu?micos, al?m das respostas ao estresse oxidativo. Foram observados n?veis significativos de prote?nas envolvidas na fotoss?ntese das folhas de E. pungens, fotorrespira??o, al?m prote?nas relacionadas ?s respostas ao estresse: prote?nas da fam?lia 14-3-3, peroxidases, catalases, super?xido-dismutase e prote?nas de choque t?rmico, que tamb?m podem atuar no turnover prote?co. Ainda foram identificadas cinco prote?nas hom?logas a tropinona redutase na folha, e produ??o de alcaloide em todos os ?rg?os. No cap?tulo 3, por meio do experimento com esp?cimes de E. pungens submetidas a estresse h?drico por suspens?o de rega em casa de vegeta??o, notou-se que esta esp?cie investe no aumento de prote?nas relacionadas ?s respostas ao estresse h?drico, aumenta significativamente o teor de prolina livre no citosol. Ademais, mat?m a produ??o de alcaloides que parecem estar mais relacionado a fase de desenvolvimento da planta. Com isso, os resultados deste trabalho busca contribuir para a fitoqu?mica e fisiologia de E. pungens, assim como promove o uso racional da esp?cie, e consequentemente a conserva??o do bioma Caatinga. / Caatinga biome is exclusive brazilian, marked by semi-arid climate. This biome stands out for the high endemism index and scientific unfamiliarity.To survive in this environment with peculiar edaphoclimatic conditions, plants show evolution of intrinsic mechanisms of external environmental signals perception and their respectives metabolic responses. Among the occurrence genera in Caatinga biome, as bioactive alkaloids source, the Erythroxylum pungens species, which has unexplored potential, is outstanding. Thus, the objective of this work is to investigate total proteome and metabolic fingerprint of E. pungens, together with tropane alkaloids bioprospection with cytotoxic potential. For this, in chapter 1 it was possible to identify, by mass spectrometry, seven known tropane alkaloids; 3-(2-methylbutyryloxy)tropan-6, 7-diol as well as 3-(2-methylbutyryloxy)tropan-6, 7-diol were isolated and characterized by 1D and 2D NMR for the first time. N,N-Dimethyl-1-H-indol-3-ethanamine was isolated and characterized from roots of E. punctures. In addition, it was found that alkaloids isolated from E. pungens, against five cell lines, indicated selective potential of 3-(2-methylbutyryloxy)tropan-6, 7-diol against prostate tumor cells. In chapter 2, it was possible to identify 1746 proteins in the leaves, 1779 in the stem and 1026 in the root of E. pungens. Through the recovery of the GO terms, it was possible to evaluate processes in which these proteins are involved, verifying the same process profile for three organs of E. pungens, with emphasis on biotic, abiotic, chemical stress responses, as well as responses to oxidative stress. Were observed significant proteins levels involved in photosynthesis of E. pungens leaves, photorespiration, as well as many proteins related to stress responses: proteins from 14-3-3 family, peroxidases, catalases, superoxide dismutase and shock proteins, which can also act on protein turnover. Were still identificated five proteins homologous to tropinone reductase, and alkaloid production in all organs suggesting that even under chronic stress conditions, E. pungens maintains the production of these metabolites. In chapter 3, through specimens submission experiment of E. pungens to water stress by irrigation suspension in greenhouse, it was observed that this species invest in the increase of proteins related to the responses to water stress, it significantly increases free proline content in cytosol which functions as an important osmoprotector. Furthermore, maintains alkaloids production that appear to be more related to development stage of the plant than stress condition in which it is inserted. The results of this work seek to contribute to knowledge of E. pungens phytochemistry and physiology, as well as to promote the species and consequently conservation of Caatinga biome.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-02T23:09:14Z No. of bitstreams: 1 VivianeBritoNogueira_DISSERT.pdf: 3038632 bytes, checksum: 6b375d3a8d8d5af0979152bdca538728 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-13T18:02:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 VivianeBritoNogueira_DISSERT.pdf: 3038632 bytes, checksum: 6b375d3a8d8d5af0979152bdca538728 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-13T18:02:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VivianeBritoNogueira_DISSERT.pdf: 3038632 bytes, checksum: 6b375d3a8d8d5af0979152bdca538728 (MD5) Previous issue date: 2017-12-14 / O sagui comum (Callithrix jacchus), um pequeno primata de novo mundo, tem sido amplamente empregado como modelo biol?gico, n?o apenas para decifrar disfun??es em transtornos neuropsiqui?tricos como tamb?m para compreender circuitos neurais envolvidos no comportamento social humano. A este respeito, a disponibilidade de dados de express?o g?nica advindos de tecnologias nextgeneration sequencing (NGS) representam uma oportunidade para novos estudos aprofundados na gen?tica e na epigen?tica desta esp?cie. Uma das fronteiras na neuroci?ncia ? manusear esses dados em larga escala a fim de conectar vias moleculares ao comportamento do sistema nervoso. Para tornar esses dados mais acess?veis para a comunidade cient?fica sem forma??o em bioinform?tica, foi criado o CajaDB, um banco de dados que fornece uma interface web para dados de gen?mica, express?o g?nica e splicing alternativo, incluindo ferramentas para an?lises biol?gicas. Com os dados processados para esta plataforma foram realizadas duas an?lises distintas: (1) Express?o diferencial de genes nos hemisf?rios direito e esquerdo, uma vez que lateraliza??o ? um aspecto crucial do funcionamento da arquitetura cerebral para habilidades cognitivas, onde foram encontrados 49 genes diferencialmente expressos, sendo 24 para o hemisf?rio esquerdo e 25 para o hemisf?rio direito; (2) Express?o diferencial de genes entre machos e f?meas, com foco em c?rtex frontal e compara??o com dados equivalentes de humanos. Neste ?ltimo caso, foi verificado que genes com express?o enviesada para machos s?o conservados e enriquecidos para fun??es de manuten??o celular. J? genes com express?o enviesada para f?mea foram relacionados a fun??es de plasticidade neural, envolvidos com remodelamento dos circuitos sin?pticos, cascatas de estresse e comportamento visual. Com base em conhecimentos sobre dimorfismo comportamental entre sexos de saguis, ? sugerido que estas express?es diferenciais podem estar relacionadas a determinadas circuitarias neurais associadas ?s estrat?gias adaptativas de sobreviv?ncia e reprodu??o para cada sexo. Diante do exposto, espera-se que os dados dispon?veis no banco de dados associados ?s ferramentas biol?gicas dispon?veis facilitem a gera??o de hip?teses e a interpreta??o de resultados sobre o funcionamento cerebral nesta esp?cie que ? um modelo biol?gico largamente utilizado, abrindo perspectivas de investiga??o e desenvolvimento de novos tratamentos para doen?as neuropsiqui?tricas no futuro. CajaDB est? dispon?vel em cajadb.neuro.ufrn.br. / Common marmoset (Callithrix jacchus), a small New World monkey, has been widely used as a biological model not only to elucidate brain dysfunction in neuropsychiatric disorders, but also for deciphering neural circuits involved in human social behaviors. In this regard, the availability of gene expression data derived from next-generation sequencing (NGS) technologies represents an opportunity for deeper studies on the genetic and epigenetic architecture of this species. One of the frontiers in neuroscience field requires handling omics large-scale data sets for connecting molecular pathways to nervous system behavior. To make these omics datasets more accessible for the scientific community without a solid bioinformatics background, we have created CajaDB, a database that provides a friendly interface for genomic, expression and alternative splicing data, including tools for biological analyses. Using the processed data two analysis were conducted: (1) Differential expression between right and left hemispheres, once lateralization is a crucial aspect of the functional brain architecture for cognitive abilities. It was found 49 differentially expressed genes, where 24 genes had left hemisphere bias and 25 genes had right hemisphere bias. (2) Sex-biased gene expression with focus in frontal comparing to humans. It was found that genes whose expression is male biased are conserved between marmosets and humans and enriched with "housekeeping" functions. On the other hand, female-biased genes are more related to neural plasticity functions involved in remodeling of synaptic circuits, stress cascades and visual behavior. Based on knowledge of dimorphic social behavior of male and female common marmosets we discuss that these differences might be linked to neuronal circuitry underlying the expression of the adaptive strategies in each sex and related to survival and reproductive behavior traits. Hence, it is expected that data available in the webpage associated with available biological tools will facilitate generation of hypotheses and interpretation of results on brain functioning, facilitating improvements in neurological diseases treatment in the future. CajaDB is available at cajadb.neuro.ufrn.br.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-02T23:17:21Z No. of bitstreams: 1 NivaldoFreireDeAndradeNeto_DISSERT.pdf: 3043754 bytes, checksum: 81f701dde4d2487b0d56ee58677070b6 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-13T18:18:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 NivaldoFreireDeAndradeNeto_DISSERT.pdf: 3043754 bytes, checksum: 81f701dde4d2487b0d56ee58677070b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-13T18:18:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NivaldoFreireDeAndradeNeto_DISSERT.pdf: 3043754 bytes, checksum: 81f701dde4d2487b0d56ee58677070b6 (MD5) Previous issue date: 2017-06-16 / O crescimento das atividades industriais vem proporcionando um aumento na gera??o de efluentes, que fez com que ?rg?os governamentais relacionados ao meio ambiente propusessem a cria??o de marcos regulat?rios para limitar a gera??o de efluentes. Os efluentes gerados pelas ind?strias t?xteis s?o de dif?cil degrada??o por m?todos tradicionais de tratamento. Os processos oxidativos avan?ados (POAs) s?o uma alternativa eficiente para a degrada??o de poluentes org?nicos, como corantes (azul de metileno). Neste trabalho, part?culas de cloreto de prata (AgCl) impregnadas com ?xido de cobre (CuO) foram sintetizadas via m?todo sonoqu?mico. Foram preparadas composi??es molares de 1:1 e 2:1 de AgCl/CuO, respectivamente. Tais composi??es passaram por tr?s rotas de obten??o distintas. Para a caracteriza??o das part?culas, utilizou-se as t?cnicas de difra??o de raios-X (DRX), microscopia eletr?nica de varredura com emiss?o de campo (MEV-FEG), e espectroscopia UV-vis?vel (UV-vis). Para verificar a aplicabilidade do composto foram realizados nas amostras de AgCl/CuO testes fotocatal?ticos para degrada??o do corante azul de metileno e a atividade antimicrobiana frente ?s bact?rias Escherichia coli e Staphylococcus aureus. Os resultados da difra??o de raios-X confirmaram a forma??o de AgCl e CuO em todas as amostras, n?o havendo ind?cios de dopagem para nenhuma rota utilizada. Os resultados da atividade fotocatal?tica indicam que o aumento da propor??o molar de AgCl (1:1 para 2:1) acelera a degrada??o do azul de metileno em m?dia em 25%. / The growth of industrial activities has led to an increase in the generation of effluents, which led environmental agencies to propose the creation of regulatory frameworks to limit the generation of effluents. The effluents generated by the textile industries are difficult to be degraded by traditional methods of treatment. Advanced oxidative processes (POAs) are an efficient alternative for the degradation of organic pollutants such as dyes (methylene blue). In this work, silver chloride particles (AgCl) impregnated with copper oxide (CuO) were synthesized via method sonochemistry. AgCl/CuO 1:1 and 2:1 molar compositions, respectively, were prepared. Such compositions went through three distinct procurement routes. To characterize the particles, X-ray diffraction (XRD), scanning electron microscopy with field emission (SEM-FEG), and UV-visible (UV-vis) spectroscopy were performed. To verify the applicability of the compound were carried out in the samples of AgCl/CuO photocatalytic tests for degradation of the methylene blue dye and the antimicrobial activity against the bacteria Escherichia coli and Staphylococcus aureus. The results of X-ray diffraction confirmed the formation of AgCl and CuO in all samples, with no evidence of doping for any route used. The results of the photocatalytic activity indicate that increasing the molar ratio of AgCl (1:1 to 2:1) accelerates the degradation of methylene blue on average by 25%.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-13T12:38:22Z No. of bitstreams: 1 HugoLopesDeAraujo_DISSERT.pdf: 3125432 bytes, checksum: 6eb44e30d262c3ba524e8f8dade800da (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-19T15:06:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 HugoLopesDeAraujo_DISSERT.pdf: 3125432 bytes, checksum: 6eb44e30d262c3ba524e8f8dade800da (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T15:06:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 HugoLopesDeAraujo_DISSERT.pdf: 3125432 bytes, checksum: 6eb44e30d262c3ba524e8f8dade800da (MD5) Previous issue date: 2017-11-24 / Considerando-se o atual momento na gest?o p?blica brasileira, onde se prioriza os princ?pios da efici?ncia e a qualidade dos servi?os prestados, se faz preciso a constante melhoria dos procedimentos administrativos das institui??es em geral, em especial das institui??es p?blicas, criticadas pela sociedade. Os processos s?o a base do funcionamento das institui??es, fontes de cont?nuas melhorias neste trabalho. Este estudo tem como objetivo propor melhorias a partir do mapeamento de processos do curso de gradua??o em administra??o da Universidade Federal do Rio Grande do Norte - UFRN, contemplando a identifica??o, a descri??o e a elabora??o dos fluxos de atividades acad?micas. Nesse sentido, realizou-se uma an?lise na Coordena??o do curso de gradua??o em Administra??o baseada na t?cnica de pesquisa-a??o, com finalidade explorat?rio-descritiva. Adotou-se como estrat?gica metodol?gica a pesquisa documental; pesquisa bibliogr?fica; e estudo de caso. Utilizou-se a abordagem qualitativa, uma vez que n?o se pretendia chegar a dados estat?sticos, visando compreender os aspectos dos processos da Coordena??o e as informa??es que influenciam no desempenho desses. Ap?s a an?lise dos processos considerados foi realizada a elabora??o dos fluxos atrav?s da nota??o BPMN com o uso do software Bizagi Process Modeler ? BPM. Foram feitas propostas de melhorias para os processos, como torna-los eletr?nicos e eliminar fluxos burocr?ticos desnecess?rios, e para a realiza??o das atividades do setor, visando melhorar a efici?ncia e a qualidade dos servi?os. Melhorias estas aplic?veis a todas as coordena??es de cursos de gradua??o que utilizem o sistema SIGAA. Ademais, foi criada uma carta de servi?os, descrevendo e disponibilizando aos usu?rios, todos os servi?os desenvolvidos pelo setor. / Considering the current moment in Brazilian public management, where priority is given to the principles of efficiency and the quality of services provided, it is necessary to constantly improve the administrative procedures of institutions in general, especially public institutions, criticized by society. The processes are the basis of the functioning of the institutions, sources of continuous improvements in this work. This study aims to propose improvements from the mapping of processes of the undergraduate course in administration of the Federal University of Rio Grande do Norte - UFRN, contemplating the identification, description and elaboration of flows of academic activities. In this sense, an analysis was conducted in the Coordination of the undergraduate course in Administration based on the research-action technique, with an exploratory-descriptive purpose. Documentary research was adopted as a methodological strategy; bibliographic research; and case study. The qualitative approach was used, since it was not intended to reach statistical data, aiming to understand the aspects of the Coordination processes and the information that influence the performance of these. After the analysis of the processes considered, the elaboration of the flows through the BPMN notation using the Bizagi Process Modeler - BPM software was performed. Proposals were made to improve processes, such as making them electronic and eliminate unnecessary bureaucratic flows, and to carry out activities in the sector, in order to improve the efficiency and quality of services. These improvements apply to all coordinations of undergraduate courses that use the SIGAA system. In addition, a service letter was created, describing and making available to users, all the services developed by the sector.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-21T11:48:14Z No. of bitstreams: 1 JonathasDiegoLimaSantos_TESE.pdf: 8935214 bytes, checksum: 86433d89608ea11b99ac2a3911f14149 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-23T11:23:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JonathasDiegoLimaSantos_TESE.pdf: 8935214 bytes, checksum: 86433d89608ea11b99ac2a3911f14149 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-23T11:23:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JonathasDiegoLimaSantos_TESE.pdf: 8935214 bytes, checksum: 86433d89608ea11b99ac2a3911f14149 (MD5) Previous issue date: 2017-12-15 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Chromobcterium violaceum (C. violaceum) ? uma bact?ria Gram-negativa, encontrada em regi?es tropicais e subtropicais, considerada organismo modelo de vida livre. Alguns estudos prote?micos realizados com esta bact?ria demonstraram sua capacidade de adapta??o a desafios ambientais, como alta concentra??o de ferro e exposi??o ao estresse oxidativo. No entanto, nenhum estudo foi feito com esta esp?cie submetida ? microgravidade simulada (MGS), ou seja, em condi??es em que a gravidade ? artificialmente reduzida para menos de 1xg. Estudos MGS podem ser importantes para entender as modula??es em n?vel molecular sofridas pelos organismos vivos. Portanto, o objetivo deste estudo foi caracterizar a resposta de C. violaceum, como organismo modelo de vida livre, cultivado em MGS, usando t?cnicas de prote?mica para entender como a bact?ria responde a esse estresse. A MGS foi conseguida por meio da rota??o do vessel ao redor do eixo horizontal perpendicular ao vetor gravitacional nos sistemas de cultura de c?lulas rotativas - Rotating Cell Culture Systems ? (RCCS4). MGS foi conduzido a uma velocidade de 40 rpm por um per?odo de 12 horas para obter a curva de crescimento a cada 2 horas. Prote?nas totais foram extra?das de amostras de cultura de c?lulas bacteriana coletada ?s 5 e 12 horas, correspondendo as fases exponenciais inicial (MG5) e tardia (MG12), respectivamente, tendo a curva de crescimento como refer?ncia. Ap?s a tripsiniza??o, as amostras foram analisadas em espectr?metro de massas Q-TOF. Como resultado um total de 212 prote?nas durante ?s 5h de crescimento e 192 ?s 12h foram detectadas, das quais 144 delas foram comuns em ambos os per?odos. No proteoma de C. violaceum obitido em 5h de crescimento 195 prote?nas foram identificadas em gravidade normal (GN5) e 155 prote?nas foram identificadas em MG5, sendo 18 upreguladas, 19 downreguladas e 17 expressas somente na condi??o de MG5. No proteoma obtido em 12h de crescimento, 165 prote?nas foram identificadas em gravidade normal (GN12) e 173 em MG12, das quais, 17 foram upreguladas, 22 downreguladas e 28 expressas somente na condi??o de MG12 Al?m disso, foi poss?vel identificar 25 prote?nas com fun??o desconhecida em MG5 e MG12. Utilizando ferramentas computacionais foi poss?vel construir redes de intera??es prote?na-prote?na (PPI) e as sub-redes contendo grupo de prote?nas com fun??es correlacionadas, analisar vias metab?licas, processos biol?gicos, contexto gen?mico e busca por dom?nios conservados e sequ?ncias hom?logas de prote?nas com fun??o desconhecida. Como resultado, identificamos sub-redes relacionadas com a bioss?ntese de prote?nas, regula??o da transcri??o e tradu??o, resposta ao estresse e metabolismo energ?tico, conclu?mos que as respostas celulares associadas ? express?o diferencial induzida pela MGS levaram ? diminui??o do crescimento de C. violaceum, acompanhado pela regula??o negativa de prote?nas relacionadas com processos transcricionais, traducionais e libera??o de energia por vias aer?bicas e pela regula??o positiva de prote?nas envolvidas no estresse oxidativo, na via anaer?bica e na sobreviv?ncia celular. / Chromobcterium violaceum (C.violaceum) is a Gram-negative bacteria, which has been found at tropical and subtropical regions, considered a free living model organism. Some proteomic studies performed with this bacterium have demonstrated its ability to adapt to environmental challenges such as high iron concentration and oxidative stress exposure. However, no study was made with this specie submitted to simulated microgravity (SMG), that is, under conditions in which the gravity is artificially reduced to less than 1xg. MGS studies may be important in understanding the molecular-level modulations undergone by living organisms. Therefore, the aim of this study was to characterize the response of C. violaceum, as free-living model organism, cultured at MGS, using proteomics techniques in order to understand how this bacterium response to this stress. The SMG was achieved by rotating the vessel around the horizontal axis perpendicular to the gravitational vector in Rotating Cell Culture Systems (RCCS4). SMG was conducted at a speed of 40 rpm for a period of 12 hours to obtain the growth curve every 2 hours. Total protein extraction was made in two times: 5 and 12 hours, corresponding to early (MG5) and late (MG12) exponential phase, respectively, taking the growth curve as a reference. After trypsinization, samples were analyzed with Q-TOF mass spectrometer. As a result a total of 212 proteins during 5h of growth and 192 at 12h were detected, of which 144 of them were common in both periods. We detected 155 proteins during MG5, from which 18 proteins were upregulated, 19 down-regulated and 17 proteins were exclusive when compared to GN5. In the proteome obtained in 12h of growth, 165 proteins were identified in normal gravity (GN12) and 173 in MG12, of which, 17 were upregulated, 22 were downregulated and 28 expressed only in MG12 condition. In addition, it was possible to identify 25 proteins with unknown function in MG5 and MG12. Using computational tools it was possible to construct networks of protein-protein interactions (PPI) and sub-networks containing group of proteins with correlated functions, to analyze metabolic pathways, biological processes, genomic context and search for conserved domains and homologous sequences of proteins with unknown function . As a result, we identified sub-networks related to protein biosynthesis, transcription regulation and translation, stress response and energetic metabolism, we conclude that the cellular responses associated with differential expression induced by MGS led to a decrease in the growth of C. violaceum, accompanied by the negative regulation of proteins related to transcriptional, translational and energy release by aerobic pathways and by the positive regulation of proteins involved in oxidative stress, anaerobic pathway and cell survival.