Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karol. inst., 2003. / Härtill 6 uppsatser.

Thesis (MTech Biomedical Technology)) ---Cape Peninsula University of Technology, 2008 / Resistance to antibiotics has been acknowledged as a major global public health problem. The use of peptides to provide alternatives to combat multi drug resistant organisms is of current relevance to overcome antibiotic resistance. The high deversity of amphibian skin peptides render these animals a potential source for the discovery of novel drugs.

O presente estudo avaliou a ação in vitro de diferentes nanopartículas de prata (nanoAg) sintetizadas pelo Instituto de Pesquisas Tecnológicas (IPT) e Universidade Federal de São Carlos (IFSC) e controles de sulfadiazina de prata, nitrato de prata e nanoAg comercial Sigma, frente a bactérias e leveduras. Os objetivos do estudo foram avaliar a ação in vitro de NanoAg sintetizadas no Brasil frente a bactérias sensíveis aos antimicrobianos e multirresistentes (MR), incluindo Gram positivos e negativos, além de candidas isoladas de amostras clínicas. Definir as condições de síntese que resultem em nanoAg com melhor efeito antimicrobiano in vitro frente a isolados sensíveis e MR. Foram utilizadas diferentes metodologias tais como agar well diffusion, determinação de concentração inibitória mínima CIM, concentração bactericida mínima (CBM), curva do tempo de morte e inibição da formação de biofilme. Ao todo, foram avaliados 110 isolados, sendo 37 sensíveis aos antimicrobianos, 54 MR, e 19 candidas frente a 29 nanoAg com diferentes características de síntese. Os testes de difusão em meio sólido apresentaram heterogeneidade de resultados frente aos micro-organismos avaliados. Enquanto as informações de CIM50 e CIM90 evidenciaram não existir variações no efeito inibitório frente isolados sensíveis ou resistentes aos antimicrobianos. As curvas do tempo de morte ilustraram a dinâmica de inibição dos compostos de prata e a interferência do sangue nos testes in vitro. A partir dos testes com biofilme foi possível observar efeito inibitório e de descolamento de biofilme previamente formado. Os resultados permitiram concluir a maior eficácia para nanoAg com Citrato e Quitosana, seguido por nitrato de prata, sulfadiazina de prata e PVA. A NanoAg comercial (Sigma, 60 nm) apresentou resultados inferiores ao de nanoAg Citrato, nanoAg Quitosana e nitrato de prata. Estes resultados abrem caminho para novas análises de nanoAg sintetizadas no Brasil em busca de produtos com maior eficácia com ação contra bactérias MR e candidas / The present study evaluated the in vitro action of different silver nanoparticles (nanoAg) synthesized by \"Instituto de Pesquisas Tecnológicas\" (IPT) and \"Universidade Federal de São Carlos\" (IFSC) and silver sulfadiazine, silver nitrate and commercial nanoAg Sigma against bacteria and yeasts. The objectives of the study were to evaluate the in vitro action of NanoAg synthesized in Brazil against antimicrobial susceptible bacteria and multidrug-resistant (MDR), including Gram positive and negative, as well as some candida isolates from clinical source. Define the conditions that result in nanoAg synthesis with best in vitro antimicrobial effect against sensitive isolates and MDR. Different methodologies were used such as agar well diffusion, determination of minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (CBM), the time-kill curve and inhibition of biofilm formation. Altogether 110 isolates were evaluated, being 37 antimicrobial sensitive, 54 MDR, and 19 candidas, against 29 nanoAg with different synthesis. The solid medium diffusion tests showed heterogeneity of results against the evaluated microorganisms. While the information of MIC50 and MIC90 showed no changes in inhibitory effect against sensitive isolates or MDR. The time-kill curve illustrated the dynamics of inhibition of silver compounds and the interference of blood on the in vitro tests. From the tests with biofilm was possible to observe biofilm inhibitory effect and detachment of biofilm previously formed. The conclusion defined to greater effectiveness for nanoAg with Chitosan and Citrate, followed by silver nitrate, silver sulfadiazine and PVA. The commercial NanoAg (Sigma, 60 nm) presented lower performance than nanoAg citrate, nanoAg Chitosan and silver nitrate. These results open the way for new analyses of Brazil synthetized nanoAg with better efficiency against MDR bacterial and candida

INTRODUÇÃO: As infecções do trato urinário (ITU) feminino são muito prevalentes em mulheres. Em geral, elas dividem-se em cistites e pielonefrites de acordo com seu nível anatômico. Seu tratamento, apesar de simples, depende do conhecimento da flora bacteriana e do padrão de sensibilidade local, principalmente em tempos de aumento de resistência bacteriana. Este estudo avaliou e comparou a flora e o padrão de sensibilidade das bactérias causadoras de infecção não complicada do trato urinário feminino no período de 2007 a 2012. MÉTODOS: Analisamos retrospectivamente os resultados de 493 culturas de urina de pacientes com idade a partir de 14 anos e sintomas clínicos de cistite ou pielonefrite tratadas no Pronto-Socorro ou Ambulatório de Urologia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. As pacientes foram separadas em três grupos: 1- pacientes com cistite simples atendidas no Pronto-Socorro; 2- pacientes com cistite simples atendidas no Ambulatório; 3- pacientes com pielonefrite atendidas no Pronto-Socorro. As características demográficas como idade, presença de ITU de repetição, diabetes mellitus (DM) e outras comorbidades, e os resultados de flora bacteriana e padrão de sensibilidade foram analisados e comparados entre os grupos. RESULTADOS: A média de idade das pacientes nos três grupos foi 43,2, 55,0 e 36,0 anos, respectivamente. ITU de repetição esteve presente em 36,0%, 76,1% e 26,5% das pacientes dos grupos 1, 2 e 3, respectivamente, enquanto que 8,5%, 22,7% e 2,2% das pacientes nos grupos 1, 2 e 3, respectivamente, eram diabéticas. Escherichia coli (E. coli) foi a bactéria responsável por 75,1% das infecções no geral e 87,3% das pielonefrites. Staphylococcus saprophyticus foi o segundo agente etiológico mais frequente (6,7%), principalmente no grupo 1 (10,0%), enquanto que nas diabéticas, Enterococcus faecalis foi o segundo agente etiológico (15,6%). Ao avaliarmos todas as pacientes, o antibiograma demonstrou sensibilidade à amoxacilina/ácido clavulânico (AAC), ampicilina, ciprofloxacina, levofloxacina, nitrofurantoína, norfloxacina e sulfametoxazol/trimetoprima (SMT) de 85,8%, 46,5%, 82,0%, 83,3%, 88,3%, 83,3% e 65,7%, respectivamente. Nas pielonefrites, a sensibilidade geral à cefalotina, cefepime, ceftriaxone, ciprofloxacina e gentamicina foi de 67,0%, 95,5%, 94,3%, 81,8% e 98,0%, respectivamente. Ao analisarmos apenas as infecções por E. coli, os antibióticos orais com sensibilidade > 90% foram AAC (96,5%) e nitrofurantoína (98,8%). No geral, ao compararmos pacientes sem e com ITU de repetição, os antibióticos amicacina, gentamicina e nitrofurantoína foram os únicos que não apresentaram diminuição significativa de sensibilidade. Nas infecções de repetição por E. coli, os únicos antibióticos orais que mantiveram sensibilidade > 90% foram AAC e nitrofurantoína. Ao compararmos ITU por E. coli nas pacientes = 50 anos, os antimicrobianos orais que mantiveram sensibilidade > 90% em ambas faixas etárias foram AAC e nitrofurantoína. Nas pacientes diabéticas, houve diminuição estatística da sensibilidade ao ácido nalidíxico (80,5% x 61,5%), ciprofloxacina (84,8% x 65,1%), gentamicina (97,4% x 81,0%), levofloxacina (85,4% x 66,7%) e SMT (66,0% x 50%), respectivamente. As infecções por E. coli nas pacientes diabéticas também apresentaram diminuição estatística aos mesmos antibióticos; AAC e nitrofurantoína mantiveram sensibilidade > 95% nesta situação. Análise de regressão logística identificou aumento de chance de resistência ao ácido nalidíxico, ciprofloxacina e levofloxacina de 3,62, 4,72 e 5,27, respectivamente, quando há ITU de repetição, e à gentamicina de 5,38 quando há DM. CONCLUSÕES: Pielonefrites foram mais comuns em mulheres jovens em relação às cistites. E. coli foi o principal agente causador das infecções urinárias não complicadas, principalmente em pielonefrites. A nitrofurantoína manteve sensibilidade in vitro acima de 90% em diversas situações como no tratamento geral das cistites por E. coli, em casos de cistite de repetição, em mulheres > 50 anos e em diabéticas. AAC mostrou sensibilidade in vitro acima de 90% em algumas situações: ITU de repetição por E. coli, mulheres com idade >= 50 anos e diabéticas. A ceftriaxone apresentou sensibilidade in vitro suficiente para o tratamento empírico de pielonefrite. O histórico de infecção urinária de repetição aumentou a chance de resistência ao ácido nalidíxico, ciprofloxacina e levofloxacina e DM aumentou a chance de resistência à gentamicina. / INTRODUCTION: Uncomplicated urinary tract infections (UTIs) in women are common. Urinary tract infections are usually divided into cystitis or pyelonephritis, according to anatomical level. Although treatment of UTI is simple, it depends on knowledge of the local uropathogens and antimicrobial susceptibility patterns due to increasing antimicrobial resistance. This study analyzed the causative pathogens of UTIs in women and their susceptibility patterns between 2007 and 2012. METHODS: We conducted a retrospective analysis of 493 urine culture results of female patients aged 14 years and older with clinical diagnosis of cystitis or pyelonephritis who were treated at the urological emergency unit or urological outpatient clinic. Patients were divided into three groups: 1- simple cystitis attended to in the emergency unit; 2- simple cystitis attended to in the urological outpatient clinic; 3- pyelonephritis attended to in the emergency unit. Results of demographic data, such as age, history of recurrent UTI, diabetes mellitus (DM) and comorbidities, and those of the causative pathogens and their susceptibility patterns were analyzed and compared. RESULTS: The mean age for groups 1, 2 and 3 was 43.2, 55.0 and 36.0 years, respectively. Recurrent UTI was present in 36.0%, 76.1% and 26.5% of patients in groups 1, 2 and 3, respectively. DM was present in 8.5%, 22.7% and 2.2% of patients in group 1, 2 and 3, respectively. Escherichia coli (E. coli) was responsible for 75.1% of all UTIs and 87.3% of pyelonephritis. Staphylococcus saprophyticus was the second most common agent (6.7%), mainly in group 1 (10.0%), while Enterococcus faecalis was the second most common agent in diabetic patients (15.6%). General susceptibility rates to amoxicillin/clavulanate (A/C), ampicillin, ciprofloxacin, levofloxacin, nitrofurantoin, norfloxacin and sulfamethoxazole/trimethoprim (SMT) were 85.8%, 46.5%, 82.0%, 83.3%, 88.3%, 83.3% and 65.7%, respectively. For pyelonephritis, the general susceptibility rates to cephalothin, cefepime, ceftriaxone, ciprofloxacin and gentamicin were 67.0%, 95.5%, 94.3%, 81.8% and 98.0%, respectively. Analysis of the E.coli isolates showed that more than 90% of the strains were susceptible to A/C (96.5%) and nitrofurantoin (98.8%). There was a decrease in the susceptibility rates to all antimicrobials in patients with recurrent UTI, except for amikacin, gentamicin and nitrofurantoin. In cases of recurrent UTI by E. coli, susceptibility rates for oral nitrofurantoin and A/C were above 90%. In a comparison of patients below 50 years and those aged 50 and older diagnosed with E. coli UTI, only A/C and nitrofurantoin maintained susceptibility rates above 95% for all ages. Comparison between diabetic and non-diabetic patients showed a significant decrease in susceptibility rates for ciprofloxacin (84.8% x 65.1%), gentamicin (97.4% x 81.0%), levofloxacin (85.4% x 66.7%), nalidixic acid (80.5% x 61.5%) and SMT (66.0% x 50%), respectively. A similar susceptibility rate of E. coli was found in diabetic patients; however, A/C and nitrofurantoin maintained susceptibility rates above 95% in this situation. A multivariate analysis identified an increased odds of resistance to ciprofloxacin, levofloxacin and nalidixic acid (OR=4.72, 5.27 and 3.62, respectively) in the presence of recurrent UTI, while there was an increased probability for resistance to gentamicin (OR=5.38) in the presence of DM. CONCLUSIONS: Pyelonephritis was more common in young women than cystitis. E. coli was the main agent for uncomplicated UTI, particularly for pyelonephritis. Nitrofurantoin maintained in vitro susceptibility rates above 90% in many situations, such as E. coli infections, recurrent infections, women older than 50 years and diabetic patients. A/C maintained susceptibility rates above 90 % in some situations, such as recurring UTI caused by E. coli, women aged 50 years or older and diabetic patients. Ceftriaxone had a sufficient in vitro susceptibility profile to be indicated for empirical treatment of pyelonephritis. Recurrent UTI increased the odds of resistance to ciprofloxacin, levofloxacin and nalidixic acid, while DM increased the chance of resistance to gentamicin

Garcinia kola is one of the plants used in folklore remedies for the treatment of microbial infections. Bacterial resistance to commonly used antibiotics has necessitated the search for newer and alternative compounds for the treatment of drug resistant microbial infections. This study focuses on the bioactivity of G. kola seeds on Streptococcus pyogenes (ATCC 49399), Staphylococcus aureus (NCTC 6571), Plesiomonas Shigelloides (ATCC 51903) and Salmonella typhimurium (ATCC 13311), organisms which can cause illnesses from mild to severe with potentially fatal outcomes. The crude ethyl acetate, ethanol, methanol, acetone and aqueous extracts were screened by agar-well diffusion method and the activities of the extract were further determined by Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC) assays. The inhibition zones ranged from 0 - 24 mm, while MIC and MBC of the extract ranged between 0.04 - 1.25 mg/mL and 0.081 - 2.5 mg/mL respectively. Chloroform/ Ethyl Acetate/ Formic acid (CEF) solvent system separated more active compounds followed by Ethyl Acetate/ Methanol/ Water (EMW) and Benzene/ Ethanol/ Ammonium Hydroxide (BEA). The extracts were fractionated by Thin Layer Chromatography (TLC). Bioautography was used to assess the activity of the possible classes of compounds present in the more active extracts. Column chromatography was used to purify the active compounds from the mixture while Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) was used to identify the phyto components of the fractions. The MIC of the fractions ranged between 0.0006 - 2.5 mg/mL. CEF 3 (F3), CEF 11 (F11) and CEF 12 (F12) revealed the presence of high levels fatty acids Linoleic acid, 1, 2-Benzenedicarboxylic acid and 2, 3-Dihydro-3, 5-dihydroxy-6-methyl, respectively. The results obtained from this study justify the use of this plant in traditional medicine and provide leads which could be further exploited for the development of new and potent antimicrobials.

INTRODUÇÃO: Embora a lista dos microrganismos envolvidos em fungemias esteja em expansão, as espécies de Candida permanecem como os principais agentes etiológicos, causando morbidade e mortalidade significativas. A introdução de novos antifúngicos na prática clínica tem reforçado a necessidade de estudos que monitorem mudanças na epidemiologia e no perfil de sensibilidade de Candida spp. a nível local e global. OBJETIVO: Avaliar a prevalência e incidência de candidemia no HC-FMUSP durante o ano de 2006 e determinar o perfil de suscetibilidade das espécies isoladas. MÉTODOS: Foi realizado um estudo retrospectivo no qual os pacientes identificados foram caracterizados de acordo com variáveis clinicas disponíveis nos sistemas laboratoriais. A concentração inibitória mínima (MIC) foi determinada pelo método de microdiluição Sensititre YeastOne Ò, considerado como referência, além do Etest Ò. As seguintes drogas foram avaliadas: anfotericina B (AMB), caspofungina (CAS), fluconazol (FLU), itraconazol (ITR), voriconazol (VOR) e posaconazol (POS). O método de disco difusão (DD) também foi utilizado para FLU e VOR. Os resultados obtidos pelas três metodologias foram comparados entre si. RESULTADOS: A prevalência de Candida em hemocultura foi de 3,5%. Foram identificados 136 casos de candidemia e a incidência global foi de 1,87 casos/1.000 admissões hospitalares e 0,27 casos por 1.000 pacientes dia. A mediana de idade foi de 40 anos e 58,1% dos pacientes eram homens. Neoplasia foi a doença de base mais frequente. Na distribuição das espécies, C. albicans foi a espécie mais isolada (52,2%), seguida por C. parapsilosis (22,1%), C. tropicalis (14,8%) e C. glabrata (6,6%). O perfil de sensibilidade foi determinado em 100 cepas de Candida. Destas, 100% mostraram-se suscetíveis a AMB e CAS; 98 % ao VOR; 91%, ao FLU e 66% ao ITR. Para o POS, MIC90 foi de 0,25 µg/mL. O percentual de concordância essencial (CE) e concordância categórica (CC) entre o teste de referência e o Etest Ò foi > 93%, exceto para o itraconazol (CE 80%, CC 70%). O percentual de CC para o fluconazol e voriconazol pelo DD versus Sensititre Ò e Etest Ò foi, respectivamente: FLU 94%, 95% e VOR 96%, 98%. CONCLUSÃO: A prevalência a incidência de candidemia encontrada e a distribuição das espécies concordaram com outros dados nacionais. Observou-se uma boa atividade in vitro da maioria das drogas para Candida spp., exceto itraconazol. Houve uma boa concordância essencial entre os métodos utilizados, exceto também para itraconazol. As discordâncias de categoria observadas entre os métodos resultaram em erros menores na maior parte dos casos / INTRODUCTION: Although the spectrum of fungi causing bloodstream infections continues to expand, Candida species remain responsible for the majority of cases, causing significant morbidity and mortality. The introduction of new antifungal agents in the clinical practice has increased the need for new studies for monitoring changes in the epidemiology and susceptibility profiles of candidemia at a local and global level. PURPOSE: To determine the prevalence and incidence of candidemia, species distribution and antifungal susceptibility patterns at large Brazilian tertiary public hospital during 2006. METHODS: Data were collected retrospectively. Patients were evaluated for selected variables. The minimal inhibitory concentrations (MIC) were determined using Sensititre YeastOne Ò, considered the reference method, and Etest Ò. The following drugs were tested: amphotericin B (AMB); caspofungin (CAS); and posaconazole (POS),fluconazole (FLU) and voriconazole (VOR). The disk diffusion method was also employed for FLU and VOR. MIC results obtained by Etest Ò, Sensititre YeastOne Ò and disk diffusion were compared. RESULTS: The prevalence of Candida spp. from blood cultures was 3,5%. One hundred and thirty-six cases of candidemia were identified. The overall incidence of candidemia was 1,87 cases per 1.000 admissions and 0,27 cases per 1.000 patient-days. 58.1% patients were male and the median age was 40 years. Cancer was the most frequent underlying disease. C. albicans was the most commonly identified species (52,2%), followed by C. parapsilosis (22,1%), C. tropicalis (14,8%) and C. glabrata (6,6%). The susceptibility profile of 100 Candida spp. isolates was: 100% to AMB B and CAS; 98 % to voriconazole; 91% to fluconazole; and 66% itraconazole. For posaconazole MIC90 was 0,25 µg/mL. The percentage of essential agreement (EA) and categorical agreement (CA) between the reference and test methods was > 93%, except for itraconazole (EA 80%, CA 70%). The (CA) between Sensititre YeastOne Ò versus disk diffusion and Etest Ò versus disk diffusion were respectively: FLU (94%) (95%) and VOR (96%) (98%). Minor errors accounted for the majority of all categorical errors. CONCLUSION: The prevalence and incidence of candidemia found in this study were in agreement with previous national reports. There was a good in vitro activity for most drugs tested against Candida spp. except for itraconazole. A good EA was demonstrated between methods except again for itraconazole. Minor errors accounted for the majority of all categorical errors for between methods.

Introdução: Atualmente a incidência anual de pneumonia adquirida na comunidade nos países em desenvolvimento é de 150,7 milhões de casos entre crianças menores de 5 anos de idade , dos quais 11 a 20 milhões (7-13%) necessitam de internação hospitalar devido à gravidade. O tratamento geralmente é empírico mas o Streptococcus pneumoniae é o principal agente etiológico bacteriano.É necessário manter monitoramento dos sorotipos e padrão de resistência para melhor orientação terapêutica. Metodologia: Estudo de coorte retrospectivo com inclusão de 107 crianças com diagnóstico clínico e radiológico de pneumonia e com isolamento de Streptococcus pneumoniae em sangue e ou líquido pleural no período de janeiro de 2003 a outubro de 2008. Realizado determinação de concentração inibitória mínima (MIC) para penicilina e antibiograma para outros antimicrobianos. A sensibilidade para penicilina utilizada foi conforme Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI ) de 2008. Realizado sorotipagem de 96 cepas de pneumococos (89,7%) e analisados os dados da população em estudo e da evolução clínica. Resultados:Cerca de 47,5% das internações na enfermaria foram por pneumonia ou broncopneumonia e a média de positividade em cultura para pneumococo (sangue e ou líquido pleural) foi de 2,5%. Houve uma sazonalidade bem definida da pneumonia pneumocócica. Cerca de 70% ocorreram nos meses de junho a outubro. A mediana de idade foi de 23 meses (82,2%<5anos); predomínio do sexo masculino (58,9%);utilização de antibioticoterapia nos dois meses prévios à internação de 23,4%; freqüência em creche no menores de 2 anos de 36,4%; apenas um caso com vacinação heptavalente completa; doença associada em 44,9% sendo a mais freqüente a sibilância( 77,1%); tempo de febre e de sintomas respiratórios antes da admissão foi de 4 dias;necessidade de oxigenoterapia não invasiva em 70,1% com tempo médio de utilização de 4 dias;necessidade de ventilação mecânica em 19,6%, mediana do tempo de internação de 9 dias.Em 62% houve complicações sendo as mais freqüentes: empiema (53%) e efusão pleural não complicada (42%). As crianças com empiema tiveram mais pneumonia necrotizante, abscesso pulmonar, sepse, pneumotórax, necessidade de decorticação e ainda maior mortalidade (todas com p<0,05). As crianças com complicações tiveram mais dias de sintomas respiratórios antes da admissão (3x5dias), mais tempo de febre após o início de antibiótico (1x4,5dias), necessitaram de oxigenoterapia não invasiva(58,5x77,3%) e ventilação mecânica (7,3x27,3%) por tempo maior e permaneceram por mais tempo internados (5x12 dias). Das 107 cepas de pneumococo, 100 (93,5%) foram sensíveis à penicilina e 7 (6,5%) de sensibilidade intermediária. Todas as cepas testadas foram sensíveis para rifampicina e vancomicina e ainda mantiveram boa sensibilidade para clindamicina, cloranfenicol, ceftriaxone, eritromicina e levofloxacina. Cinco cepas foram multiresistentes. Notou-se que a média geométrica das concentrações inibitórias mínimas (GMC) para penicilina foram maiores nas crianças com complicações. Os sorotipos mais freqüentes foram: 14(36,5%), 1(16,7%) , 5(14,6%) e 6B(6,3%). O sorotipo 14 apresentou a maior GMC para penicilina e houve um aumento progressivo no decorrer dos anos de estudo. A cobertura dos sorotipos pela vacina heptavalente seria de 53,1% e esta cobertura menor se deve principalmente ao sorotipo 1 e 5, que corresponde a 31,3% dos casos. A cobertura dos sorotipos associados à resistência seria de 94,2%. A cobertura pela vacina 10-valente seria de 86,5% e com a 13-valente seria de 96,9%. Três casos que evoluíram para óbito (2,8%) tinha mediana de idade de 18 meses, todos do sexo masculino, todos com concentração inibitória mínima para penicilina menor ou igual 1g/mL, todos evoluíram com empiema e sepse. Dois foram do sorotipo 5 e um do sorotipo 14. Conclusões: Aproximadamente 2,5% das crianças internadas com diagnóstico de pneumonia foram diagnosticadas como pneumonia pneumocócica.Verificamos uma sazonalidade bem definida.Houve complicações em 62% dos casos. As mais freqüentes foram : empiema e a efusão pleural não complicada. Evidenciou-se uma GMC para penicilina maior nas crianças com complicações comparadas às crianças com ausência de complicações. Os sorotipos mais freqüentes foram 14,1 ,5 e 6B sendo que os sorotipos 1 e 5 totalizam 31,3%. A cobertura pela vacina heptavalente dos sorotipos isolados seria de 53,1%. A sensibilidade para penicilina dos pneumococos isolados de pneumonia foi de 93,5%. Assim, a opção terapêutica continua sendo a penicilina. / Introduction: Currently, the annual incidence of the acquired pneumonia in the developing country communities are around 150.7 million cases, among childrens under 5 years of age, and 11 to 20 million (7-13%) of those require hospitalization due to their gravity. In general, the treatments used to be empirical, however, it is important to be noted that Streptococcus pneumoniae is far the major bacterial etiologic agent. It is necessary to keep monitoring the serotypes and the pattern of resistance in order to improve the therapy guidance. Methodology: Retrospective cohort study with inclusion of the 107 childrens with clinical and radiological diagnosis of the pneumonia, and the isolation of Streptococcus pneumoniae in the blood and/or pleural fluid during the period of January 2003 to October 2008. It was performed determination of the minimum inhibitory concentration (MIC) related to the penicillin and other antibiotics. The sensitivity analysis to the penicillin was based on Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), 2008, recommendations. They were performed serotyping in 96 pneumococcal strains (89.7%) and they were analyzed datas referred to the considered population and their clinical course. Results: About 47.5% of admissions in the ward were caused by pneumonia or bronchopneumonia, and the average positive occurrences in the pneumococcal (blood and / or pleural) culture were 2.5%. It was noted a clear seasonality phenomena of the pneumococcal pneumonia. About 70% of the cases occurred during months of June to October. The median age was 23 months (82.2%<5 years); with predominance of males (58.9%); in the 23,4% of the cases the antibiotic therapy was used during two months prior to the admission; the daycare frequency of the childs less than 2 years were 36.4%; only one case with complete vaccination heptavalent; associated disease was detected in the 44.9% of the cases and the most frequent was wheezing (77.1%); time of fever and respiratory symptoms before admission were 4 days; the need for noninvasive oxygen therapy occurred in 70.1% being 4 days of the average time of the use; the need for mechanical ventilation occurred in 19.6%; the median period of stay were 9 days. In 62% of the cases there were the most frequent complications: empyema (53%) and non-complicated pleural effusion (42%). The childrens with empyema had more necrotizing pneumonia, lung abscess, sepsis, pneumothorax, need for decortication, and even higher mortality (all with p<0.05). The childrens with complications had more days of respiratory symptoms before admission (3x5days), more time of the fever after initiation with antibiotic (1x4, 5days), they need noninvasive oxygen therapy (58,5 x77, 3%) and mechanical ventilation (7 , 3x27, 3%) for more time and remained hospitalized during longer period(5x12 days). Among 107 pneumococcal strains, 100 (93.5%) were susceptible to penicillin and 7 (6.5%) presented intermediate sensitivity. All strains tested were sensitive to rifampicin and vancomycin, and they maintained good sensitivity to clindamycin, chloramphenicol, ceftriaxone, erythromycin and levofloxacin. Five strains were multi-resistant. It was noted that the geometric mean of minimum inhibitory concentrations (GMC) to penicillin were higher in children with complications. The most frequent serotypes were: 14 (36.5%), 1 (16.7%), 5 (14.6%) and 6B (6.3%). The serotype 14 presented the highest GMC for penicillin and it was verified a progressive increase during the years of the study. The coverage of serotypes by the heptavalent vaccine would be cover 53.1% and this less coverage is represented by serotype 1 and 5, which corresponds to 31.3% of the cases. The coverage of serotypes associated with resistance would be 94.2%. The coverage of the 10-valent vaccine would be 86.5% and for 13-valent would be 96.9%. Three cases that carried to died (2.8%) had median age of 18 months, all they male, all they with minimum inhibitory concentration for penicillin <= 1g/mL, all they progressed to empyema and sepsis. Two of them were serotype 5 and one of them was serotype 14. Conclusions: Approximately 2.5% of children were admitted with diagnosis of pneumonia were diagnosed as pneumococcal pneumonia. It was verified a clear seasonality phenomena. They were observed complications in 62% of the cases. The most frequent were: empyema and non-complicated pleural effusion cases. It was confirmed a higher GMC for penicillin in children with complications compared to the children without complications. The most frequent serotypes were 14, 1, 5 and 6B and the serotypes 1 and 5 accounted 31.3%. The coverage of heptavalent vaccine for the isolated serotypes would be 53.1%. The sensitivity to the penicillin of the isolated pneumococcal was 93.5%. Therefore, the therapy option remains being the penicillin.

Enterobactérias são importantes agentes de infecção podendo contaminar ambientes aquáticos poluídos por atividades antropogênicas, os quais podem ser importantes locais para a seleção e disseminação de bactérias resistentes aos antibacterianos (ATB) de uso na medicina humana e veterinária. O objetivo desse estudo foi monitorar a disseminação de enterobactérias resistentes aos ATB em ambientes aquáticos do estado de São Paulo. De 2009-2010, 135 enterobactérias resistentes à pelo menos um ATB, foram isoladas de rios, represas e estações de tratamento de esgoto. O fenótipo multirresistente (MR) foi predominante em 64% dos isolados, sendo que houve um predomino de E. coli (80%) e K. pneumoniae (48%). Oito porcento dos isolados apresentaram fenótipo ESBL (cefotaxima, CIM50 <font face=\"Symbol\">&#8805; 64 <font face=\"Symbol\">mg/ml) devido à presença de genes blaCTX-M-like, enquanto que a presença de genes qnr-like foi confirmada em 7% dos isolados resistentes à ciprofloxacina (CIM50 <font face=\"Symbol\">&#8805; 32<font face=\"Symbol\">mg/ml). A tipagem molecular revelou ausência de relação clonal entre os isolados de K. pneumoniae e E. coli. / Enterobacteria are important agents of infection may contaminate aquatic environments polluted by anthropogenic activities, which may be important sites for the selection and spread of bacteria resistant to antibiotics (ATB) for use in human and veterinary medicine. The aim of this study was to monitor the spread of enterobacteria resistant to ATB in aquatic environments of the state of Sao Paulo. From 2009-2010, 135 Enterobacteriaceae resistant to at least one ATB, were isolated from rivers, dams and sewage treatment plants. The phenotype resistant (MDR) was predominant in 64% of the isolates, and there was the predominance of E. coli (80%) and K pneumoniae (48%). Eight percent of the isolates showed ESBL phenotype (cefotaxime, MIC50 <font face=\"Symbol\">&#8805; 64 <font face=\"Symbol\">mg/ml) due to the presence of blaCTX-M-like, while the presence qnr-like gene was confirmed in 7% of isolates resistant to (ciprofloxacin MIC50 <font face=\"Symbol\">&#8805; 32<font face=\"Symbol\">mg/ml). Molecular typing revealed no clonal relationship among isolates of K. pneumoniae and E. coli.

Introdução: Atualmente a incidência anual de pneumonia adquirida na comunidade nos países em desenvolvimento é de 150,7 milhões de casos entre crianças menores de 5 anos de idade , dos quais 11 a 20 milhões (7-13%) necessitam de internação hospitalar devido à gravidade. O tratamento geralmente é empírico mas o Streptococcus pneumoniae é o principal agente etiológico bacteriano.É necessário manter monitoramento dos sorotipos e padrão de resistência para melhor orientação terapêutica. Metodologia: Estudo de coorte retrospectivo com inclusão de 107 crianças com diagnóstico clínico e radiológico de pneumonia e com isolamento de Streptococcus pneumoniae em sangue e ou líquido pleural no período de janeiro de 2003 a outubro de 2008. Realizado determinação de concentração inibitória mínima (MIC) para penicilina e antibiograma para outros antimicrobianos. A sensibilidade para penicilina utilizada foi conforme Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI ) de 2008. Realizado sorotipagem de 96 cepas de pneumococos (89,7%) e analisados os dados da população em estudo e da evolução clínica. Resultados:Cerca de 47,5% das internações na enfermaria foram por pneumonia ou broncopneumonia e a média de positividade em cultura para pneumococo (sangue e ou líquido pleural) foi de 2,5%. Houve uma sazonalidade bem definida da pneumonia pneumocócica. Cerca de 70% ocorreram nos meses de junho a outubro. A mediana de idade foi de 23 meses (82,2%<5anos); predomínio do sexo masculino (58,9%);utilização de antibioticoterapia nos dois meses prévios à internação de 23,4%; freqüência em creche no menores de 2 anos de 36,4%; apenas um caso com vacinação heptavalente completa; doença associada em 44,9% sendo a mais freqüente a sibilância( 77,1%); tempo de febre e de sintomas respiratórios antes da admissão foi de 4 dias;necessidade de oxigenoterapia não invasiva em 70,1% com tempo médio de utilização de 4 dias;necessidade de ventilação mecânica em 19,6%, mediana do tempo de internação de 9 dias.Em 62% houve complicações sendo as mais freqüentes: empiema (53%) e efusão pleural não complicada (42%). As crianças com empiema tiveram mais pneumonia necrotizante, abscesso pulmonar, sepse, pneumotórax, necessidade de decorticação e ainda maior mortalidade (todas com p<0,05). As crianças com complicações tiveram mais dias de sintomas respiratórios antes da admissão (3x5dias), mais tempo de febre após o início de antibiótico (1x4,5dias), necessitaram de oxigenoterapia não invasiva(58,5x77,3%) e ventilação mecânica (7,3x27,3%) por tempo maior e permaneceram por mais tempo internados (5x12 dias). Das 107 cepas de pneumococo, 100 (93,5%) foram sensíveis à penicilina e 7 (6,5%) de sensibilidade intermediária. Todas as cepas testadas foram sensíveis para rifampicina e vancomicina e ainda mantiveram boa sensibilidade para clindamicina, cloranfenicol, ceftriaxone, eritromicina e levofloxacina. Cinco cepas foram multiresistentes. Notou-se que a média geométrica das concentrações inibitórias mínimas (GMC) para penicilina foram maiores nas crianças com complicações. Os sorotipos mais freqüentes foram: 14(36,5%), 1(16,7%) , 5(14,6%) e 6B(6,3%). O sorotipo 14 apresentou a maior GMC para penicilina e houve um aumento progressivo no decorrer dos anos de estudo. A cobertura dos sorotipos pela vacina heptavalente seria de 53,1% e esta cobertura menor se deve principalmente ao sorotipo 1 e 5, que corresponde a 31,3% dos casos. A cobertura dos sorotipos associados à resistência seria de 94,2%. A cobertura pela vacina 10-valente seria de 86,5% e com a 13-valente seria de 96,9%. Três casos que evoluíram para óbito (2,8%) tinha mediana de idade de 18 meses, todos do sexo masculino, todos com concentração inibitória mínima para penicilina menor ou igual 1g/mL, todos evoluíram com empiema e sepse. Dois foram do sorotipo 5 e um do sorotipo 14. Conclusões: Aproximadamente 2,5% das crianças internadas com diagnóstico de pneumonia foram diagnosticadas como pneumonia pneumocócica.Verificamos uma sazonalidade bem definida.Houve complicações em 62% dos casos. As mais freqüentes foram : empiema e a efusão pleural não complicada. Evidenciou-se uma GMC para penicilina maior nas crianças com complicações comparadas às crianças com ausência de complicações. Os sorotipos mais freqüentes foram 14,1 ,5 e 6B sendo que os sorotipos 1 e 5 totalizam 31,3%. A cobertura pela vacina heptavalente dos sorotipos isolados seria de 53,1%. A sensibilidade para penicilina dos pneumococos isolados de pneumonia foi de 93,5%. Assim, a opção terapêutica continua sendo a penicilina. / Introduction: Currently, the annual incidence of the acquired pneumonia in the developing country communities are around 150.7 million cases, among childrens under 5 years of age, and 11 to 20 million (7-13%) of those require hospitalization due to their gravity. In general, the treatments used to be empirical, however, it is important to be noted that Streptococcus pneumoniae is far the major bacterial etiologic agent. It is necessary to keep monitoring the serotypes and the pattern of resistance in order to improve the therapy guidance. Methodology: Retrospective cohort study with inclusion of the 107 childrens with clinical and radiological diagnosis of the pneumonia, and the isolation of Streptococcus pneumoniae in the blood and/or pleural fluid during the period of January 2003 to October 2008. It was performed determination of the minimum inhibitory concentration (MIC) related to the penicillin and other antibiotics. The sensitivity analysis to the penicillin was based on Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), 2008, recommendations. They were performed serotyping in 96 pneumococcal strains (89.7%) and they were analyzed datas referred to the considered population and their clinical course. Results: About 47.5% of admissions in the ward were caused by pneumonia or bronchopneumonia, and the average positive occurrences in the pneumococcal (blood and / or pleural) culture were 2.5%. It was noted a clear seasonality phenomena of the pneumococcal pneumonia. About 70% of the cases occurred during months of June to October. The median age was 23 months (82.2%<5 years); with predominance of males (58.9%); in the 23,4% of the cases the antibiotic therapy was used during two months prior to the admission; the daycare frequency of the childs less than 2 years were 36.4%; only one case with complete vaccination heptavalent; associated disease was detected in the 44.9% of the cases and the most frequent was wheezing (77.1%); time of fever and respiratory symptoms before admission were 4 days; the need for noninvasive oxygen therapy occurred in 70.1% being 4 days of the average time of the use; the need for mechanical ventilation occurred in 19.6%; the median period of stay were 9 days. In 62% of the cases there were the most frequent complications: empyema (53%) and non-complicated pleural effusion (42%). The childrens with empyema had more necrotizing pneumonia, lung abscess, sepsis, pneumothorax, need for decortication, and even higher mortality (all with p<0.05). The childrens with complications had more days of respiratory symptoms before admission (3x5days), more time of the fever after initiation with antibiotic (1x4, 5days), they need noninvasive oxygen therapy (58,5 x77, 3%) and mechanical ventilation (7 , 3x27, 3%) for more time and remained hospitalized during longer period(5x12 days). Among 107 pneumococcal strains, 100 (93.5%) were susceptible to penicillin and 7 (6.5%) presented intermediate sensitivity. All strains tested were sensitive to rifampicin and vancomycin, and they maintained good sensitivity to clindamycin, chloramphenicol, ceftriaxone, erythromycin and levofloxacin. Five strains were multi-resistant. It was noted that the geometric mean of minimum inhibitory concentrations (GMC) to penicillin were higher in children with complications. The most frequent serotypes were: 14 (36.5%), 1 (16.7%), 5 (14.6%) and 6B (6.3%). The serotype 14 presented the highest GMC for penicillin and it was verified a progressive increase during the years of the study. The coverage of serotypes by the heptavalent vaccine would be cover 53.1% and this less coverage is represented by serotype 1 and 5, which corresponds to 31.3% of the cases. The coverage of serotypes associated with resistance would be 94.2%. The coverage of the 10-valent vaccine would be 86.5% and for 13-valent would be 96.9%. Three cases that carried to died (2.8%) had median age of 18 months, all they male, all they with minimum inhibitory concentration for penicillin <= 1g/mL, all they progressed to empyema and sepsis. Two of them were serotype 5 and one of them was serotype 14. Conclusions: Approximately 2.5% of children were admitted with diagnosis of pneumonia were diagnosed as pneumococcal pneumonia. It was verified a clear seasonality phenomena. They were observed complications in 62% of the cases. The most frequent were: empyema and non-complicated pleural effusion cases. It was confirmed a higher GMC for penicillin in children with complications compared to the children without complications. The most frequent serotypes were 14, 1, 5 and 6B and the serotypes 1 and 5 accounted 31.3%. The coverage of heptavalent vaccine for the isolated serotypes would be 53.1%. The sensitivity to the penicillin of the isolated pneumococcal was 93.5%. Therefore, the therapy option remains being the penicillin.

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-22 / Objetivos: I- Relatar a incidência de endoftalmite bacteriana e a frequência dos microorganismos identificados numa instituição brasileira. II- Avaliar a frequência de microorganismos isolados de pacientes com endoftalmite bacteriana e sua suscetibilidade antimicrobiana. III- Determinar a aplicabilidade da reação em cadeia de polimerase em tempo real (PCR em tempo real) no diagnóstico de endoftalmite bacteriana pós-operatória em casos diagnosticados clinicamente, e avaliar a presença de DNA bacteriano em amostras-controles. Métodos: I- Todos os casos com diagnóstico clínico de endoftalmite pós-operatória de 2002 a 2008 foram incluídos nesta análise retrospectiva. Foram avaliados: número de cirurgias de catarata, incidência de endoftalmite, positividade dos exames laboratoriais de bacterioscopia e cultura de aquoso e vítreo e os resultados dos antibiogramas. II- Foi feita análise retrospectiva de prontuários de pacientes com suspeita diagnóstica de endoftalmite bacteriana. As seguintes informações foram avaliadas: número de casos com diagnóstico clínico de endoftalmite e com cultura positiva, fatores predisponentes para a infecção, bacterioscopia e cultura (aquoso e/ou vítreo), caracterização microbiológica e sua frequência, bem como suscetibilidade antimicrobiana. III- Foram incluídas amostras de olhos de pacientes com diagnóstico clínico de endoftalmite, de provável origem infecciosa, após cirurgia de catarata, assim como amostras de vítreo e de aquoso de olhos sem infecção ou reação inflamatória para controle. Foi realizada PCR em tempo real universal e específica para Gram bem como foram determinados sensibilidade e limiar de ciclos (Ct) da reação. Também foram realizadas bacterioscopia e cultura para as amostras clínicas. Resultados: I- Setenta e três olhos de 73 pacientes (43 do sexo feminino e 30 do masculino) desenvolveram inflamação ocular de provável etiologia infecciosa após 24.590 cirurgias de catarata. A incidência reduziu-se de 0,49% em 2003 para 0,17% em 2006 e estabilizou-se nos anos subsequentes. Staphylococcus coagulase-negativa (SCoN) e Streptococcus viridans (56,5% e 15%, respectivamente) foram as bactérias mais comuns. Cultura e bacterioscopia foram negativas em 36,9%. SCoN apresentou taxas de sensibilidade de 80% à oxacilina, 90% às quinolonas de quarta geração e 100% à vancomicina. II- Cento e sete (46%) de 231 pacientes com endoftalmite bacteriana tiveram resultados positivos por bacterioscopia ou cultura. Desses, 97 (42%) pacientes tiveram positividade apenas na cultura. A maioria (62%) foi decorrente de procedimento cirúrgico (pós-operatório), 12% após trauma e 26% de fonte desconhecida. Foram isolados 100 micro-organismos (38 amostras de aquoso e 67 de vítreo) de 97 casos positivos na cultura. SCoN foram os mais frequentemente isolados (48%), seguidos por Streptococcus viridans (18%) e Staphylococcus aureus (13%). A suscetibilidade antimicrobiana para SCoN foi: vancomicina - 100%, cefalotina – 97,9%, cloranfenicol – 91,8%, amicacina – 91,6%, moxifloxacino – 89,5%, tobramicina – 85,4% gatifloxacino – 79,5%, gentamicina – 72,9%, ofloxacino – 70,8%, ciprofloxacino – 62,5%, oxacilina – 58,3%, ceftriaxona – 50% e penicilina – 33,3%. III- Onze pacientes com endoftalmite infecciosa (9 amostras de vítreo e 7 de aquoso) após cirurgia de catarata foram incluídos, assim como 12 amostras de vítreo e 50 de aquoso de olhos-controles. Foi possível identificar 80% e 70% dos pacientes com endoftalmite infecciosa por meio de bacterioscopia e cultura, respectivamente. PCR em tempo real foi positiva em 91% dos pacientes utilizando-se amostras de aquoso e/ou vítreo. Nenhum dos 12 vítreos-controles foi positivo por PCR em tempo real. Duas das amostras-controles de aquoso foram positivas. O ponto de corte do limiar de ciclos para PCR universal foi 36 (sensibilidade: 93,8%; especificidade: 100%) e 38 para PCR gram-específico (sensibilidade: 93,8%; especificidade: 100%). Micro-organismos gram-positivos predominaram e a acuidade visual variou de acordo com a bactéria causadora. Conclusões: I- A incidência de endoftalmite bacteriana, os micro-organismos isolados e a sensibilidade aos antibióticos estão em acordo com a literatura. Apesar do uso profilático de colírio antibiótico, casos de infecção foram identificados em bactérias sensíveis aos antibióticos usados topicamente. II- Bactérias gram-positivas foram as principais causas de endoftalmite infecciosa. SCoN foi o isolado mais comum e a suscetibilidade à oxacilina e às quinolonas de quarta geração foi menor do que relatado na literatura. III- PCR em tempo real é um método diagnóstico rápido e sensível nos casos de endoftalmite bacteriana. Sendo um método quantitativo, também pode servir para uma nova e distinta aplicação: diferenciação entre contaminação e infecção com base nos valores de limiar de ciclos. / Purpose: To report on the incidence, diagnostic technique, microbiological features of endophthalmitis at a university-setting in Brazil. Methods: All cases of presumed postoperative endophthalmitis from 2002 to 2008 at a teaching-hospital were included. Main data assessed were: number of cataract surgeries performed, incidence of endophthalmitis, microbiological outcome (aqueous and/or vitreous culture and Gram staining), and antimicrobial susceptibility testing of the positive cases. Results: Seventy-three eyes of 73 patients (43 females and 30 males) developed endophthalmitis after 24,590 cataract surgeries. The incidence decreased from 0.49% in 2003 to 0.17% in 2006 and stabilized afterwards. Coagulase negative Staphylococci (CoNS) and Streptococcus viridans (56.5% and 15%, respectively) were the most common bacterial isolates. Culture and Gram stain were negative in 36.9%. CoNS presented susceptibility rates of 80%-sensitivity to oxacillin, 90% to fourth-generation quinolones and 100% to vancomycin. Conclusions: The rate of endophthalmitis, diagnostic ability of conventional laboratory investigation, microbial isolates and antibiotic susceptibility are in accordance with other findings of the literature. Despite using prophylactic antibiotic drops, it was possible to identify organisms from infected cases that were susceptible to the antibiotics topically applied. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações