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Estudios funcionales y estructurales de la triptofanil tRNA sintetasa de Acidithiobacillus ferrooxidansZúñiga Olate, Roberto Aquiles January 2002 (has links)
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Caracterización probiótica de una cepa nativa de Enterococcus faecium QPa.1 Aislada de queso de elaboración artesanalCruz Pio, Liz Erika January 2011 (has links)
En el presente trabajo se evaluó parcialmente las propiedades probióticas de Enterococcus faecium QPa.1, aislada por primera vez de quesos de elaboración artesanal. Para este propósito se realizaron varias pruebas, y se pudo comprobar una gran sensibilidad a la mayoria de los antibióticos ensayados, ausencia de actividad hemolítica, actividad antimicrobiana específica frente a Listeria monocytogenes, tolerancia a diferentes concentraciones de sales biliares (0,3 a 2% de bilis de buey) y resistencia a pH 2 y 3. Asimismo reveló una buena actividad proteolítica y propiedades de adherencia.
Enterococcus faecium QPa.1 presenta características propias de un probiótico y tiene una buena actividad inhibitoria solo contra Listeria monocytogenes, bacteria de alto riesgo patológico para la salud humana. Por lo tanto, esta cepa seleccionada puede ser útil como probiótico o como cultivo adjunto y/o bioprotector para la elaboración de quesos regionales, preservando su valor, calidad nutritiva y seguridad sanitaria.
Palabras claves: Enterococcus faecium QPa.1, probióticos, quesos / --- The present work evaluated partially probiotic properties of Enterococcus faecium QPa.1, to first time was isolated traditional cheeses. For this purpose several tests were performed, it was found very sensitivity to most antibiotics tested, no haemolytic activity, specific antimicrobial activity against Listeria monocytogenes, tolerance to different concentrations of bile salts (0,3 - 2 % oxgall) and resistance to pH 2 and 3. Also demonstrated good proteolytic activity and adherence properties.
Enterococcus faecium QPa.1 presents probiotic characteristics and has a good inhibitory activity only against Listeria monocytogenes, bacteria of pathological risk to human health. Therefore, the selected strain may be useful as a probiotic culture or as adjunct and/or bioprotective cultures in cheeses traditional making, to preserving value, nutritional quality and health safety.
Key words: Enterococcus faecium QPa.1, probiotics, chesses.
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Estudio comparativo del recuento e identificación de Streptococcus mutans, Lactobacillus app y Candida app en niños con Síndrome de Down y niños sin Síndrome de DownPacheco Barrios, María Graciela January 2014 (has links)
Trabajo de Investigación Requisito para optar al Título de Cirujano Dentista / Introducción: El Síndrome de Down (SD) es una anomalía genética que afecta a
2.47 por cada mil nacidos vivos en Chile, se manifiesta con retraso mental además
de diversas alteraciones físicas y fisiológicas. Individuos portadores de esta
anomalía presentan también inmunodeficiencia que los hace más susceptibles a
diversas infecciones a nivel general, incluyendo patologías infecciosas en la
cavidad oral.
Objetivo: Comparar los recuentos de especies de Streptococcus mutans,
Lactobacillus spp. y levaduras del género Candida aislados desde muestras de
saliva de niños con SD y un grupo control sin el síndrome.
Materiales y métodos: 25 sujetos con Síndrome de Down y 25 controles entre 2 y
17 años fueron evaluados clínicamente para determinar el índice de Higiene Oral
Simplificado, índices ceod y COPD para historia de caries. Además se
recolectaron muestras de saliva no estimulada para cultivo microbiológico, a partir
de los cuales se realizó el aislamiento, identificación y recuento de Streptococcus
mutans, Lactobacillus spp. y levaduras del género Candida.
Resultados: El grupo de niños con Síndrome de Down y grupo control no
presentaron diferencias significativas respecto al Índice de Higiene Oral
Simplificado y los índices ceod/COPD. Los hallazgos microbiológicos no arrojaron
diferencias significativas en relación al recuento de Streptococcus mutans, pero se
encontraron altos niveles de Lactobacillus spp. en el grupo control y altos niveles
levaduras del género Candida en los niños con SD, existiendo diferencias
estadísticamente significativas entre ambos grupos
Conclusiones: Los altos recuentos de levaduras del género Candida en niños con
Síndrome de Down podrían ser un factor de riesgo para el desarrollo de patologías
fúngicas orales y sistémicas asociadas a estos microorganismos.
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Diseño y desarrollo de un prototipo preparador de siete muestras biológicas basado en la tinción de Ziehl-Neelsen para baciloscopíaAvila De La Cruz, Ricardo Felipe Franco, Ramírez Suárez, Luis Augusto 06 May 2017 (has links)
La técnica fundamental en toda investigación bacteriológica de tuberculosis es la
baciloscopía, debido a que permite identificar entre el 70% y 80% de casos
pulmonares positivos de forma rápida [11]. Esta técnica no invasiva consiste en la
visualización en microscopio de una muestra de expectoración previamente teñida a
fin de mejorar el contraste de bacilos en el medio [12]. Dicho análisis es brindado de
forma gratuita por el estado peruano a través del Ministerio de Salud en diversos
hospitales del Perú donde se aplica el método de tinción de Ziehl-Neelsen por su
demostrada confiabilidad y menor precio de insumos comparado con otras técnicas.
Actualmente se cuenta con un dispositivo Preparador Automático de Muestras de
Esputo (PAME) desarrollado en la PUCP cuyo diseño promete lograr la
estandarización de la tinción de muestras [19] y realiza el procedimiento tradicional de
tinción mencionado para una sola muestra, dificultando su uso en un ambiente de alta
demanda de trabajo.
En el presente documento se enfatiza el diseño y desarrollo de un prototipo
automático que permita emular el procedimiento en simultáneo para varias muestras
como lo descrito según el manual de baciloscopía del Ministerio de Salud (MINSA).
Este estudio es realizado en 4 capítulos. En el primero, se brinda un estudio acerca de
la enfermedad, así como también una compilación en cifras basada en su
proliferación, tanto a nivel mundial como nacional. Se hace énfasis en el diagnóstico y
las técnicas de análisis para luego presentar equipos tecnológicos cuya principal
función es la de cubrir parcial o totalmente el procedimiento hasta llegar a describir el
dispositivo PAME.
En el segundo capítulo se describe el modo de operación del PAME, sus problemas,
causas y características. Además, se procede a establecer el objetivo principal de
procesar siete muestras en simultáneo y los objetivos específicos que aborden la
problemática encontrada, tomando como base el procedimiento realizado en el
laboratorio de microbiología del Hospital Dos de Mayo.
El tercer capítulo aborda el diseño y desarrollo de las plantas mecánica y electrónica
del equipo, se detallan los requerimientos, los alcances, las alternativas de solución,
los criterios de selección, el hardware y el software de cada una de las partes que lo
conforman.
Por último, el cuarto capítulo muestra los resultados obtenidos de las pruebas
independientes y en conjunto del prototipo desarrollado.
Finalmente, se presentan las conclusiones del trabajo realizado y las
recomendaciones en cuanto a las mejoras que se puedan realizar. / Tesis
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Exopolisacáridos de Haloferax MediterraneiAnton, Josefa 16 October 1989 (has links)
Comisión Asesora de Investigación Científica y Técnica del Ministerio de Educación y Ciencia, proyectos PR84/1099 y BT86/0011
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Lactobacilos productores de bacteriocinas aislados de quesos artesanales provenientes de Lima y provinciasCristóbal Delgado, Ruth Liliana January 2008 (has links)
Con la finalidad de obtener bacterias ácido lácticas productoras de bacteriocinas se recolectaron 33 muestras de quesos artesanales provenientes de Lima y provincias y se aislaron 341 cepas de lactobacilos según los procedimientos establecidos por el Manual de Bergey. Las especies de lactobacilos aisladas con mayor frecuencia fueron Lactobacillus casei 56 % (191) y Lactobacillus plantarum 35.8 % (122). Sólo el 16.42 % (56/341) de los aislados presentaron actividad bacteriocinogénica frente a Lactobacillus acidophilus ATCC 4356. Los sobrenadantes de los cultivos bacteriocinogénicos se ajustaron el pH a 6.5 para descartar la acción de ácidos orgánicos, además se determinó el péroxido de hidrógeno por acción de la catalasa. La constitución bioquímica de las bacteriocinas presentes en los sobrenadantes fue determinada enzimáticamente utilizando pronasa E, a -amilasa y lipasa. El 53 % (30) de las bacteriocinas fueron de naturaleza lipoproteica, 25 % (14) glicolipoproteica, 13 % (7) glicoproteica y 9 % (5) solamente proteica. Por otro lado, los sobrenadantes fueron sometidos a tratamientos térmicos de 60, 80 y 100 °C, a pH 4, 7 y 9, y a temperaturas de conservación de 4, 15 y 32 °C y se encontró que la termoestabilidad fue de 60 a 80 °C, el pH óptimo de 4 a 7 y la temperatura óptima de conservación de 4 a 32 °C. Las bacteriocinas presentes en los sobrenadantes de los diferentes aislados inhibieron el crecimiento de cepas de Bacillus cereus UA05, Staphylococcus aureus ATCC 25923, Escherichia coli ATCC 10536, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Salmonella choleraesuis ATCC 10708, Shigella sonnei ATCC 9290 y Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. Sin embargo, Listeria innocua UP01 fue resistente. El aislado identificado como Lactobacillus plantarum LM1 produjo la bacteriocina con los mejores parámetros fisicoquímicos experimentados y además presentó un amplio espectro de inhibición contra los microorganismos indicadores evaluados. Palabras Clave: bacterias ácido lácticas, bacteriocinas, lactobacilos, Lactobacillus plantarum, quesos artesanales / The aim of this study was to get bacteriocin – producing lactic acid bacteria. For the purpose of this study, thirty three samples of artisanal cheeses from Lima and provinieses were collected, and three hundred and forty one strains of lactobacilli were isolated according to the procedures established by Bergey’s Manual. The most frequently isolated species were Lactobacillus casei 56% (191) and Lactobacillus plantarum 35.8% (122). Only 16.42% (56/341) of the isolates showed bacteriocinogenic activity against Lactobacillus acidophilus ATCC 4356. The supernatants of bacteriocinogenic cultures were adjusted to pH 6.5 to rule out the action of organic acids, and it was determined the presence of hydrogen peroxide by the assay with catalase. The biochemical constitution of the bacteriocins present in the supernatants was determined using enzymatically pronase E, a - amylase and lipase. The 53% (30) of bacteriocins was of lipoproteinaceous nature, 25% (14) of glycolipoproteinaceous nature, 13% (7) of glycoproteinaceous nature, and 9% (5) only of proteinaceous nature. On the other hand, the supernatants were exposed to various heat treatments at 60, 80, and 100°C, to pH variation at 4, 7, and 9, and to storage temperatures at 4, 15 and 32°C, and it was found that the thermostability of bacteriocins was found from 60 to 80°C, the optimum pH was from 4 to 7, and the optimum storage temperature was from 4 to 32°C. The bacteriocins present in the supernatants of the different isolates inhibited the growth of Bacillus cereus UA05, Staphylococcus aureus ATCC 25923, Escherichia coli ATCC 10536, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Salmonella choleraesuis ATCC 10708, Shigella sonnei ATCC 9290 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. However, Listeria innocua UP01was resistant. The isolate identified as Lactobacillus plantarum LM1 produced the bacteriocin with the best physicochemical parameters, and showed a broad spectrum of inhibition against the indicator microorganisms. Key words: Lactic acid bacteria, bacteriocins, lactobacilli, Lactobacillus plantarum, artisanal cheeses.
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Frecuencia de enterobacterias en verduras frescas de consumo crudo expendidas en cuatro mercados de Lima MetropolitanaMuñoz Javier, Silvia Melina January 2005 (has links)
El presente estudio tuvo como objetivo evaluar el grado de contaminación fecal en 3 de las verduras de mayor consumo crudo expendidas en cuatro importantes mercados mayoristas de Lima Metropolitana. Se recolectaron en total 180 muestras, 15 de lechuga (Lactuca sativa), 15 de col (Brassica oleracea) y 15 de espinaca (Spinacea oleracea) en La Parada, Ramón Castilla, Ceres y Caquetá. Las muestras fueron procesadas según el método del Número más Probable para detección y recuento de coliformes fecales y E. coli Tipo I (Típico), así como por la prueba de Ausencia/Presencia para Salmonella. El estudio demuestra que el 18.9% y 56.7% del total de verduras, y el 22.2% y 64.4% de verduras provenientes de los mercados 1 y 3, presentaron niveles de colifecales superiores a lo establecido por la ICMSF (100) y el MINSA (10), respectivamente. Además, el 2.2% de verduras del mercado 4 presentó niveles de E. coli Tipo I (Típico) superiores a lo establecido por la ICMSF y el MINSA (10). En ambos casos, la espinaca tuvo la mayor contaminación. Respecto a Salmonella spp., el 10% de las verduras presentó contaminación, resaltando la col y fue el mercado 2 el que presentó el mayor porcentaje (20%). Los mercados 3 y 4 presentaron las verduras con el mayor porcentaje de aceptabilidad total y el mercado 2 aquellas con el mayor porcentaje de rechazo. / The purpose of this study was to evaluate the degree of faecal contamination in three vegetables of major raw consumption that are selled in four importants wholesale markets in Lima city. A total of 180 samples, 15 lettuce (Lactuca sativa) samples, 15 cabbage (Brassica oleracea) samples and 15 spinach (Spinacea oleracea) samples from La Parada, Ramón Castilla, Ceres and Caquetá were collected. Samples were processed using the Most Probable Number method for faecal coliform and E. coli Type I (Typical) detection and count, plus Absence/Presence test for Salmonella. In this study 18.9% and 56.7% from all vegetables, and 22.2% and 64.4% of vegetables from markets 1 and 3 displayed faecal coliforms levels higher than those were established by ICMSF (100) and MINSA (10), respectively. In addition, 2.2% vegetables from the market 4 displayed E. coli Type I (Typical) levels higher than that was established by ICMSF and MINSA (10). In both cases, spinach had the higher contamination. About Salmonella spp., 10% all vegetables were contaminated, standing out the cabbage and the market 2 displayed the higher percentage (20%). Markets 3 and 4 displayed vegetables with higher percents of total acceptance, and the market 2 those with higher percents of reject.
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Estudio de la lisina-épsilon-oxidasa LodA sintetizada por Marinomas mediterranea : papel de la flavoproteína LodB en la generación del cofactor quinónico de LodA mediante modificación post-traduccionalChacón Verdú, María Dolores 03 July 2015 (has links)
Las L-aminoácido oxidasas (LAOs) son enzimas que oxidan aminoácidos generando el cetoácido correspondiente, amonio y peróxido de hidrógeno. Generalmente, estas enzimas tienen una flavina como cofactor. En la bacteria marina Marinomonas mediterranea se han descrito las dos primeras LAOs que poseen un cofactor quinónico. Este tipo de cofactores se generan mediante modificación post-traduccional de aminoácidos. La primera LAO descrita en M. mediterranea, LodA, es una novedosa L-lisina-épsilon-oxidasa (EC 1.4.3.20). De forma paralela a la realización de este trabajo, se ha descrito GoxA, una glicina oxidasa con características distintas a las glicinas oxidasas descritas previamente en otros organismos. Ambas proteínas son codificadas en operones. En el caso del operón lod, inmediatamente después al gen lodA, se encuentra el gen lodB que codifica la flavoproteína LodB. Datos previos indicaban que en M. mediterranea ambas proteínas son necesarias para obtener LodA activa. El objetivo de este trabajo ha sido estudiar el papel de LodB en la generación del cofactor quinónico de LodA. Así mismo, se han abordado por primera vez estudios de relación estructura/función de LodA para determinar residuos implicados en el proceso de generación del cofactor quinónico y en la actividad enzimática. El estudio presentado en esta memoria se ha llevado a cabo principalmente mediante expresión recombinante, solas o en combinación, en Escherichia coli de las distintas proteínas de los operones que codifican las LAOs. Las proteínas recombinantes se analizaron mediante espectrometría de masas para detectar la masa molecular de la proteína completa y de los péptidos generados por digestión enzimática, con el fin de identificar los residuos que son modificados post-traduccionalmente durante la generación del cofactor quinónico. Adicionalmente, el papel de los residuos seleccionados por estar conservados en LodA y proteínas similares o por su localización estructural, se ha estudiado mediante mediante mutagénesis dirigida. Finalmente, se ha realizado un análisis comparativo de las proteínas del operón lod y gox. Se ha determinado que LodA recombinante posee como cofactor cisteína triptofilquinona (CTQ) generado por modificación de los residuos Cys516 y Trp581. La expresión de LodA en ausencia de LodB, genera una forma precursora de LodA, a la que se ha denominado PreLodA, que no muestra actividad enzimática y está monohidroxilada en Trp581. Este resultado indica que la síntesis de la proteína activa requiere la flavoproteína LodB que actuaría sobre PreLodA. Por su parte, los experimentos de mutagénesis han permitido determinar que el residuo conservado Asp512 es esencial en la generación de PreLodA. Otros residuos analizados importantes para la actividad están localizados en la entrada del canal del centro activo de LodA o en la proximidad del cofactor. Las deleciones realizadas en el extremo C-terminal sugieren que esa zona podría participar en la generación de la forma activa de LodA. Mediante análisis bioinformático se ha detectado en genomas microbianos que los operones que codifican proteínas similares a LodA generalmente contienen, además del gen similar a lodA, un segundo gen que codifica una hipotética flavoproteína similar a LodB. El estudio del operón gox ha revelado que, al igual que ocurre con LodA, cuando se expresa GoxA en ausencia de GoxB, se detecta una forma intermedia monohidroxilada sin actividad enzimática que se ha denominado PreGoxA, por su similitud con PreLodA. Por último, se ha demostrado que las flavoproteínas que acompañan a LodA y GoxA no son intercambiables, indicando una alta especificidad de la quinooxidasa que modifica. Este trabajo supone un avance en el estudio de la nueva familia de LAOs con cofactor quinónico. En concreto, se ha puesto de manifiesto un mecanismo novedoso de modificación post-traduccional de proteínas, ya que con anterioridad no se había descrito la participación de flavoproteínas en este tipo de procesos. / L-amino acid oxidases (LAOs) oxidize amino acids releasing ammonium, hydrogen peroxide and the corresponding alpha keto acid. The marine bacterium Marinomonas mediterranea synthesizes two novel LAOs which contain a quinone cofactor, in contrast to other LAOs that contain a flavin cofactor. Quinone cofactors are generated by post-translational modification of amino acid residues. The first LAO described in M. mediterranea, LodA, is a novel L-lysine-epsilon-oxidase (EC 1.4.3.20). During the realization of this work, it has been described GoxA, a glycine oxidase which is different from the glycine oxidases previously described in other organisms. Both proteins are encoded in operons containing two genes. The operon lod contains immediately downstream to the gene coding for LodA, a second gene coding for the flavoprotein LodB. Previous data have demonstrated that both proteins are required for the generation of the active form of LodA in M. mediterranea. The aim of this work has been to study the role of LodB in the generation of the quinone cofactor of LodA. In addition, studies about structure/function relationship of LodA has been carried out for the first time with the aim of determining the residues involved in the biogenesis of the quinone cofactor and the enzymatic activity of LodA. This work has been carried out by heterologous expression in Escherichia coli of the different genes coding for either LodA or GoxA, alone or in combination with the genes encoding LodB or GoxB. In order to identify which residues are post-translationally modified, the recombinant proteins were analyzed by mass spectrometry to determine the molecular mass of the complete protein and that of the peptides generated by enzymatic digestion. In addition, the role of residues conserved in LodA and LodA-like proteins has been studied by site directed mutagenesis. Finally, a comparative analysis of protein encoded by lod and gox operons has been also performed. It has been determined that recombinant LodA contains a cysteine tryptophyl quinone cofactor (CTQ) which is generated by post-translational modification of residues Cys516 and Trp581. When LodA is expressed in absence of LodB, an inactive monohydroxylated intermediate of LodA, named PreLodA is generated. It is. This result indicates that LodB is required to obtain active LodA and that PreLodA would be its substrate. A critical role in the generation of this precursor of a conserved Asp residue has been revealed by site directed mutagenesis. Other important residues to obtain enzymatic activity are located at the entrance of the active site of LodA or in close vicinity to the quinone cofactor. Moreover, deletions in C-terminal region of LodA suggest a role of that region in the generation of the active form of LodA. Using bioinformatic analysis it has detected that operons encoding LodA-like proteins in microbial genomes usually contain a second gene encoding a hypothetical LodB-like flavoprotein. The analysis of the recombinant synthesis of GoxA in absence of GoxB has revealed, similarly to LodA, a soluble inactive precursor with partial post-translational modifications. This precursor has been named PreGoxA because of its similarity to PreLodA. Finally, it has been demonstrated that the roles of LodB and GoxB are not interchangeable and each flavoprotein acts specifically on its partner protein. This study gets insights in a novel family of LAOs with quinone cofactors. The data presented in this work have revealed a new mechanism of post-translational modification of proteins involving a flavoprotein.
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Regulación de las respuestas a la luz en el hongo mucor circinelloides.Silva Franco, Fátima 27 September 2013 (has links)
Introducción La luz regula gran cantidad de procesos fisiológicos y del desarrollo en muchos organismos. La mayoría de respuestas a la luz caracterizadas en hongos dependen de fotorreceptores de luz azul similares a la proteína Wc-1 de Neurospora crassa. La respuesta a la luz mejor conocida en el hongo Mucor circinelloides es la síntesis de β-caroteno. En este organismo, CrgA, una proteína que muestra características de ligasas de ubiquitina, reprime la carotenogénesis en la oscuridad, afectando también a otros procesos celulares como la esporulación y el crecimiento vegetativo. Objetivos El objetivo principal de la tesis era investigar las vías de transducción de la señal luminosa en hongos, concretamente en las respuestas fototrópica y fotocarotenogénica, utilizando M. circinelloides como modelo. Este objetivo general se estructuró en los siguientes objetivos específicos: 1. Identificación y aislamiento de los genes wc-1 de M. circinelloides. 2. Caracterización de las respuestas fototrópica y fotocarotenogénica. 3. Generación de mutantes nulos para cada gen wc-1 de M. circinelloides y análisis de sus fenotipos. 4. Generación de mutantes dobles para el gen crgA y cada uno de los genes wc-1 y análisis de sus fenotipos. Metodología M. circinelloides presenta el mayor repertorio de herramientas moleculares dentro de los cigomicetos y una respuesta fotocarotenogénica medianamente caracterizada, con mutantes disponibles en genes estructurales y reguladores de la síntesis de carotenos. Los genes mcwc-1 se identificaron y clonaron utilizando una genoteca de M. circinelloides en el fago λ y mediante hibridaciones tipo Southern. Para la caracterización de los genes mcwc-1a, mcwc-1b y mcwc-1c y el estudio de su relación con el gen crgA se generaron mutantes simples y dobles (crgAΔ) nulos para cada uno de los genes mcwc-1. Se analizó el contenido en β-caroteno de sus micelios y el fototropismo de los esporangióforos. También se estudiaron los cambios en los niveles de mRNAs en respuesta a la luz de los genes carotenogénicos y de los genes mcwc-1 utilizando hibridaciones tipo Northern. Además, en el caso de la proteína Mcwc-1b, se analizó su abundancia, sus modificaciones post-traduccionales y su posible interacción con CrgA por medio de hibridaciones tipo Western y co-inmunoprecipitación. Resultados y Conclusiones En primer lugar, utilizando diferentes longitudes de onda del espectro visible, se demostró que los esporangióforos de M. circinelloides poseen fototropismo positivo inducido por luz azul y verde, mientras que la carotenogénesis se induce sólo por luz azul. Además, se identificaron tres genes white-collar-1 en M. circinelloides (mcwc-1a, mcwc-1b y mcwc-1c) que codifican proteínas similares a Wc-1 de Neurospora crassa. Las tres contienen un dominio LOV (luz, oxígeno y voltaje) parecido al presente en receptores de luz azul de plantas y hongos. Los resultados obtenidos en el análisis de los mutantes simples mcwc-1Δ implicaron al gen mcwc-1a en el control del fototropismo y al gen mcwc-1c en la fotocarotenogénesis. Los resultados indican que mcwc-1a y mcwc-1c controlan diferentes rutas de transducción de la luz, aunque es posible que existan interacciones entre ambas rutas, ya que mcwc-1a está implicado en el regulación por luz de la expresión de mcwc-1c. Análisis de los dobles mutantes crgAΔ mcwc-1Δ demostraron que el efecto de crgA en la carotenogénesis depende de mcwc-1b, que actúa como un activador de la carotenogénesis. Por último, se demostró que CrgA está implicado en la mono- y diubiquitilación no degradativa de Mcwc-1b, resultando en su inactivación. La existencia de tres genes mcwc-1 y los fenotipos observados de sus mutantes apoyan la sucesiva duplicación de los genes tipo wc-1 postulada en cigomicetos, seguida de una especialización de sus funciones permitida por la aparición de las nuevas copias. / Introduction Light regulates many developmental and physiological processes in a large number of organisms. Most light responses studied in fungi require blue-light photoreceptors similar to Wc-1 of Neurospora crassa. The best-known light response in the fungus Mucor circinelloides is the biosynthesis of β-carotene. In this organism, CrgA, a protein that shows characteristics of ubiquitin ligases, represses carotenogenesis in the dark and affects also other cellular processes, like sporulation or vegetative growth. Objectives The main goal of this thesis was to study light transduction pathways in fungi, specifically photocarotenogenesis and phototropism responses, using M. circinelloides as a model. The main objective was divided in the following specific objectives: 1. Identification and isolation of wc-1 genes in M. circinelloides. 2. Characterization of photocarotenogenesis and phototropic responses. 3. Generation of knockout mutants of each wc-1 gene in M. circinelloides and analysis of their phenotypes. 4. Generation of double knockout mutants of crgA and each wc-1 gene and analysis of their phenotypes. Methods The most complete molecular toolset in zygomycetes is available in M. circinelloides. The photocarotenogenesis response has been studied in this organism and there are several mutants available in structural and regulatory genes of the biosynthesis of carotenes. A bacteriophage λ genomic library of M. circinelloides and Southern blots were used to identify and clone the three wc-1 genes of M. circinelloides (mcwc-1). To characterize mcwc-1a, mcwc-1b and mcwc-1c and to study their relationships with crgA, simple and double (crgAΔ) knockout mutants for each mcwc-1 gene were generated. Phototropism of sporangiophores and β-carotene content in the mycelium were analysed. Changes in the level of mRNAs in response to light of carotenogenic genes and of mcwc-1 genes were also studied by Northern blots. In addition, the expression levels of Mcwc-1b, its post-translational modifications and it possible interaction with CrgA were analysed using Western blots and co-immunoprecipitation. Conclusions Here, we show that M. circinelloides sporangiophores exhibit a positive phototropism. Analysis of light responses to different light wavelengths within the visible spectrum demonstrated that phototropism is induced by green and blue light, whereas carotenogenesis is only induced by blue light. Three white-collar-1 genes (mcwc-1a, mcwc-1b and mcwc-1c), coding for proteins showing similarity with the Wc-1, were identified in this thesis. All three contain a LOV (light, oxygen or voltage) domain, similar to the one present in fungal and plant blue-light receptors. The study of the knockout mutants for each mcwc-1 gene, showed that mcwc-1c is involved in the light transduction pathway that controls carotenogenesis and that positive phototropism is controlled by mcwc-1a gene. It seems therefore that mcwc-1a and mcwc-1c genes control different light transduction pathways, although cross-talk between both pathways probably exists, because mcwc-1a is involved in the light regulation of mcwc-1c expression. Analysis of double knockout mutants crgAΔ mcwc-1Δ showed that the effect of crgA on carotenogenesis is mediated by mcwc-1b, which acts as a carotenogenesis activator. Finally, it was demonstrated that CrgA is involved in the proteolysis-independent mono- and di-ubiquitylation of Mcwc-1b, which results in its inactivation. The existence and characteristics of the three mcwc-1 genes and the phenotypes of their knockout mutants support the successive duplication of the wc-1 like genes hypothesized in zygomycetes, followed by the functional specialization allowed by the presence of several copies.
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Lactobacilos productores de bacteriocinas aislados de quesos artesanales provenientes de Lima y provinciasCristóbal Delgado, Ruth Liliana, Cristóbal Delgado, Ruth Liliana January 2008 (has links)
Con la finalidad de obtener bacterias ácido lácticas productoras de bacteriocinas se recolectaron 33 muestras de quesos artesanales provenientes de Lima y provincias y se aislaron 341 cepas de lactobacilos según los procedimientos establecidos por el Manual de Bergey. Las especies de lactobacilos aisladas con mayor frecuencia fueron Lactobacillus casei 56 % (191) y Lactobacillus plantarum 35.8 % (122). Sólo el 16.42 % (56/341) de los aislados presentaron actividad bacteriocinogénica frente a Lactobacillus acidophilus ATCC 4356. Los sobrenadantes de los cultivos bacteriocinogénicos se ajustaron el pH a 6.5 para descartar la acción de ácidos orgánicos, además se determinó el péroxido de hidrógeno por acción de la catalasa. La constitución bioquímica de las bacteriocinas presentes en los sobrenadantes fue determinada enzimáticamente utilizando pronasa E, a -amilasa y lipasa. El 53 % (30) de las bacteriocinas fueron de naturaleza lipoproteica, 25 % (14) glicolipoproteica, 13 % (7) glicoproteica y 9 % (5) solamente proteica. Por otro lado, los sobrenadantes fueron sometidos a tratamientos térmicos de 60, 80 y 100 °C, a pH 4, 7 y 9, y a temperaturas de conservación de 4, 15 y 32 °C y se encontró que la termoestabilidad fue de 60 a 80 °C, el pH óptimo de 4 a 7 y la temperatura óptima de conservación de 4 a 32 °C. Las bacteriocinas presentes en los sobrenadantes de los diferentes aislados inhibieron el crecimiento de cepas de Bacillus cereus UA05, Staphylococcus aureus ATCC 25923, Escherichia coli ATCC 10536, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Salmonella choleraesuis ATCC 10708, Shigella sonnei ATCC 9290 y Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. Sin embargo, Listeria innocua UP01 fue resistente. El aislado identificado como Lactobacillus plantarum LM1 produjo la bacteriocina con los mejores parámetros fisicoquímicos experimentados y además presentó un amplio espectro de inhibición contra los microorganismos indicadores evaluados.
Palabras Clave: bacterias ácido lácticas, bacteriocinas, lactobacilos, Lactobacillus plantarum, quesos artesanales / The aim of this study was to get bacteriocin – producing lactic acid bacteria. For the purpose of this study, thirty three samples of artisanal cheeses from Lima and provinieses were collected, and three hundred and forty one strains of lactobacilli were isolated according to the procedures established by Bergey’s Manual. The most frequently isolated species were Lactobacillus casei 56% (191) and Lactobacillus plantarum 35.8% (122).
Only 16.42% (56/341) of the isolates showed bacteriocinogenic activity against Lactobacillus acidophilus ATCC 4356. The supernatants of bacteriocinogenic cultures were adjusted to pH 6.5 to rule out the action of organic acids, and it was determined the presence of hydrogen peroxide by the assay with catalase. The biochemical constitution of the bacteriocins present in the supernatants was determined using enzymatically pronase E, a - amylase and lipase. The 53% (30) of bacteriocins was of lipoproteinaceous nature, 25% (14) of glycolipoproteinaceous nature, 13% (7) of glycoproteinaceous nature, and 9% (5) only of proteinaceous nature. On the other hand, the supernatants were exposed to various heat treatments at 60, 80, and 100°C, to pH variation at 4, 7, and 9, and to storage temperatures at 4, 15 and 32°C, and it was found that the thermostability of bacteriocins was found from 60 to 80°C, the optimum pH was from 4 to 7, and the optimum storage temperature was from 4 to 32°C. The bacteriocins present in the supernatants of the different isolates inhibited the growth of Bacillus cereus UA05, Staphylococcus aureus ATCC 25923, Escherichia coli ATCC 10536, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Salmonella choleraesuis ATCC 10708, Shigella sonnei ATCC 9290 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. However, Listeria innocua UP01was resistant. The isolate identified as Lactobacillus plantarum LM1 produced the bacteriocin with the best physicochemical parameters, and showed a broad spectrum of inhibition against the indicator microorganisms.
Key words: Lactic acid bacteria, bacteriocins, lactobacilli, Lactobacillus plantarum, artisanal cheeses. / Tesis
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