Orientador: Jose Antonio Scaramucci / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-04T02:55:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cunha_MarceloPereirada_M.pdf: 671663 bytes, checksum: 87af7e834b9701c03bd716e529e67ed9 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O objetivo deste estudo é quantificar alguns impactos sobre a economia brasileira decorrentes de uma maior participação do setor sucroalcooleiro na matriz energética, especificamente o aumento da produção de eletricidade a partir da queima do bagaço de cana-de-açúcar (processo de co-geração) e maior oferta de álcool como combustível para a frota leve de veículos. São analisados os impactos sobre a estrutura da economia, emprego, nível de produção e PIB. Para tal, aplicamos o modelo de insumo-produto, utilizando-se uma base de dados estimada referente a 1999, que foi obtida com a desagregação de alguns setores produtivos, como geração de eletricidade, transmissão e distribuição de eletricidade, produção de álcool, produção de gasoálcool e gás natural. Os dados usados foram obtidos das contas nacionais fornecidas pelo IBGE, do Balanço Energético Nacional divulgado pelo Ministério de Minas e Energia e outras fontes diversas. A metodologia empregada parte da descrição tecnológica (bottom-up) dos setores produtores de eletricidade ¿ termoelétricas a gás natural, co-geração a partir da biomassa de cana-de-açúcar e hidroeletricidade. Esses novos setores são inseridos na economia brasileira, em determinadas condições de operação, resultando em mudanças econômicas que são então quantificadas / Abstract: This work aims at investigating the impacts on the Brazilian economy of a greater contribution to the energy matrix of the sugarcane agro-industry, more specifically, of an increase on the production of electricity from bagasse (combined heat and power process) and fuel ethanol as well. The effects on the economy structure, employment, production level and GDP are analyzed. An input-output (I-O) model based on an estimated database for 1999 is used for that. I-O tables were obtained by disaggregating some economic sectors ¿ such as electricity generation, transmission and distribution (treated separately), ethanol, gasoline, and natural gas ¿ from the national accounts provided by IBGE, using energy data from MME and other sources of information. The analysis starts from a bottom-up technological description of the sectors producing electricity from natural gas, sugarcane bagasse and hydro energy. These sectors are inserted in the Brazilian economy, under certain operation conditions, resulting in economic changes that are then quantified. / Mestrado / Matematica Aplicada / Mestre em Matemática Aplicada

Orientador: Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-04T03:26:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kiihl_SamaraFlamini_M.pdf: 1063133 bytes, checksum: 4c4cce349b3bd30501a820e973a44fb2 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Variacao genetica no nivel de nucleotideo e uma fonte poderosa de informacao para o estudo da evolucao de uma populacao. Importantes aspectos da evolucao de populacoes naturais tem sido investigados utilizando sequencias de nucleotideos. A quantidade ? = 4N?, em que N e o tamanho efetivo da populacao e ? e a taxa de mutacao por sequencia (gene, locus) por geracao, e um parametro essencial porque determina o grau de polimorfismo em um locus. O sucesso da inferencia sobre a evolucao de uma populacao e medido pela acuracia da estimacao deste parametro. Esta dissertacao de mestrado apresenta diversos metodos de estimacao do parametro ?, bem como uma comparacao entre eles atraves de simulacoes e aplicacoes a dados reais. Utilizando informacoes filogeneticas de amostras de sequencias de DNA, constr'oi-se um modelo linear onde o coeficiente da variavel independente e a estimativa do parametro ?. Verificou-se que utilizando informacoes filogeneticas dos dados obtem-se estimadores bem mais eficientes / Abstract: Genetic variation at the nucleotide level is a powerful source of information for studying the evolution of a population. Important aspects of the evolution of a population have been investigated by using nucleotide sequences. The quantity ? = 4N?, where N is the effective size of the population and ? is the mutation rate per sequence (gene, locus) per generation, is an essential parameter because it determines the degree of polymorphism at the locus. The degree of success in our inference about the evolution of a population is measured to some extent by the accuracy of estimation of this essential parameter. This work presents some methods of estimation of this parameter, comparisons between the different methods through computational simulations and applications to real data. The evolution of a species can be seen through a phylogenetic tree and a linear model can be constructed by using the phylogenetic information to estimate ?. It has been verified that the use of such information leads us to more accurate estimators of ? / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-08Bitstream added on 2014-06-13T19:02:44Z : No. of bitstreams: 1 borba_lhf_dr_jabo.pdf: 857431 bytes, checksum: 9fca82a12c53154ccccaf9966a463570 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Características reprodutivas são importantes na produção de bovinos de corte, entretanto são pouco utilizadas em programas de melhoramento genético, pois são fortemente influenciadas por fatores ambientais. Neste estudo procurou-se verificar as relações existentes entre características de crescimento, de conformação e de reprodução como proposta para definição de critério de seleção para fertilidade na raça Canchim. As características analisadas foram: idade ao primeiro parto (IPP), idade ao primeiro parto penalizada (IPPPEN), idade ao segundo parto (ISP), idade ao segundo parto penalizada (ISPPEN), ocorrência de parição até os 38 meses de idade (PP38), e circunferência escrotal (CE420), peso (PE420) e escore de conformação frigorífica (CF420) aos 420 dias de idade. As médias (± DP) das estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,02 ± 0,01(IPP); 0,03 ± 0,01 (IPPPEN); 0,05 ± 0,04 (ISP); 0,05 ± 0,02 (ISPPEN); 0,06 ± 0,03 (PP38); 0,25 ± 0,04 (CE420), 0,30 ± 0,02 (PE420) e 0,17 ± 0,05 (CF420). As médias (± DP) das estimativas de correlação genética com PE420 foram -0,09 ± 0,20 (IPP); 0,05 ± 0,21 (IPPPEN); 0,10 ± 0,18 (ISP); 0,13 ± 0,16 (ISPPEN); -0,09 ± 0,17 (PP38), com CE420 foram -0,67 ± 0,23 (IPP); -0,50 ± 0,25 (IPPPEN); -0,33 ± 0,18 (ISP); -0,31 ± 0,25 (ISPPEN) e 0,37 ± 0,25 (PP38), e com CF420 foram -0,16 ± 0,34 (IPP), -0,33 ± 0,36 (IPPPEN), 0,16 ± 0,36 (ISP), 0,35 ± 0,35 (ISPPEN) e 0,42 ± 0,28 (PP38). Estes resultados sugerem que as características reprodutivas das fêmeas (CR) não deverão apresentar boas respostas à seleção, que a seleção para PE420 não deverá provocar mudanças nas CR, que a seleção para maior CE420 deverá melhorar as CR e que a seleção para maior CF420 deve resultar em maior PP38 / Reproductive traits are important to beef cattle production systems, however their use in animal breeding programs is still small, because they are strongly influenced by environmental factors. Genetic parameters of reproduction, growth and conformation traits were estimated in a Canchim population to evaluate their potential to be included as selection criteria in a breeding program. The traits studied were age at first calving (IPP), age at first calving penalized (IPPPEN), age at second calving (ISP), age at second calving penalized (ISPPEN), occurrence of calving until 38 months of age (PP38), scrotal circumference (CE420), body weight (PE420) and carcass conformation score (CF420) at 420 days of age. The mean (± SD) of the heritability estimates were 0.02 ± 0.01 (IPP); 0.03 ± 0.01 (IPPPEN); 0.05 ± 0.04 (ISP); 0.05 ± 0.02 (ISPPEN); 0.06 ± 0.03 (PP38); 0.25 ± 0.04 (CE420); 0.30 ± 0.02 (PE420) and 0,17 ± 0,05 (CF420). The mean (± SD) of the genetic correlation estimates with PE420 were -0.09 ± 0.20 (IPP); 0.05 ± 0.21 (IPPPEN); 0.10 ± 0.18 (ISP); 0.13 ± 0.16 (ISPPEN) and -0.09 ± 0.17 (PP38), with CE420 were -0.67 ± 0.23 (IPP); -0.50 ± 0.25 (IPPPEN); -0.33 ± 0.18 (ISP); -0.31 ± 0.25 (ISPPEN) and 0.37 ± 0.25 (PP38), and with CF420 were -0.16 ± 0,34 (IPP), -0.33 ± 0,36 (IPPPEN), 0.16 ± 0,36 (ISP), 0.35 ± 0,35 (ISPPEN) and 0.42 ± 0,28 (PP38). These results suggest that the female reproductive traits (RT) will not show good genetic progress through selection, that selection for PE420 should not change RT, that selection to increase CE420 should change female reproductive traits favorably, and that selection to increase CF420 should increase PP38

Resumo: Características reprodutivas são importantes na produção de bovinos de corte, entretanto são pouco utilizadas em programas de melhoramento genético, pois são fortemente influenciadas por fatores ambientais. Neste estudo procurou-se verificar as relações existentes entre características de crescimento, de conformação e de reprodução como proposta para definição de critério de seleção para fertilidade na raça Canchim. As características analisadas foram: idade ao primeiro parto (IPP), idade ao primeiro parto penalizada (IPPPEN), idade ao segundo parto (ISP), idade ao segundo parto penalizada (ISPPEN), ocorrência de parição até os 38 meses de idade (PP38), e circunferência escrotal (CE420), peso (PE420) e escore de conformação frigorífica (CF420) aos 420 dias de idade. As médias (± DP) das estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,02 ± 0,01(IPP); 0,03 ± 0,01 (IPPPEN); 0,05 ± 0,04 (ISP); 0,05 ± 0,02 (ISPPEN); 0,06 ± 0,03 (PP38); 0,25 ± 0,04 (CE420), 0,30 ± 0,02 (PE420) e 0,17 ± 0,05 (CF420). As médias (± DP) das estimativas de correlação genética com PE420 foram -0,09 ± 0,20 (IPP); 0,05 ± 0,21 (IPPPEN); 0,10 ± 0,18 (ISP); 0,13 ± 0,16 (ISPPEN); -0,09 ± 0,17 (PP38), com CE420 foram -0,67 ± 0,23 (IPP); -0,50 ± 0,25 (IPPPEN); -0,33 ± 0,18 (ISP); -0,31 ± 0,25 (ISPPEN) e 0,37 ± 0,25 (PP38), e com CF420 foram -0,16 ± 0,34 (IPP), -0,33 ± 0,36 (IPPPEN), 0,16 ± 0,36 (ISP), 0,35 ± 0,35 (ISPPEN) e 0,42 ± 0,28 (PP38). Estes resultados sugerem que as características reprodutivas das fêmeas (CR) não deverão apresentar boas respostas à seleção, que a seleção para PE420 não deverá provocar mudanças nas CR, que a seleção para maior CE420 deverá melhorar as CR e que a seleção para maior CF420 deve resultar em maior PP38 / Abstract: Reproductive traits are important to beef cattle production systems, however their use in animal breeding programs is still small, because they are strongly influenced by environmental factors. Genetic parameters of reproduction, growth and conformation traits were estimated in a Canchim population to evaluate their potential to be included as selection criteria in a breeding program. The traits studied were age at first calving (IPP), age at first calving penalized (IPPPEN), age at second calving (ISP), age at second calving penalized (ISPPEN), occurrence of calving until 38 months of age (PP38), scrotal circumference (CE420), body weight (PE420) and carcass conformation score (CF420) at 420 days of age. The mean (± SD) of the heritability estimates were 0.02 ± 0.01 (IPP); 0.03 ± 0.01 (IPPPEN); 0.05 ± 0.04 (ISP); 0.05 ± 0.02 (ISPPEN); 0.06 ± 0.03 (PP38); 0.25 ± 0.04 (CE420); 0.30 ± 0.02 (PE420) and 0,17 ± 0,05 (CF420). The mean (± SD) of the genetic correlation estimates with PE420 were -0.09 ± 0.20 (IPP); 0.05 ± 0.21 (IPPPEN); 0.10 ± 0.18 (ISP); 0.13 ± 0.16 (ISPPEN) and -0.09 ± 0.17 (PP38), with CE420 were -0.67 ± 0.23 (IPP); -0.50 ± 0.25 (IPPPEN); -0.33 ± 0.18 (ISP); -0.31 ± 0.25 (ISPPEN) and 0.37 ± 0.25 (PP38), and with CF420 were -0.16 ± 0,34 (IPP), -0.33 ± 0,36 (IPPPEN), 0.16 ± 0,36 (ISP), 0.35 ± 0,35 (ISPPEN) and 0.42 ± 0,28 (PP38). These results suggest that the female reproductive traits (RT) will not show good genetic progress through selection, that selection for PE420 should not change RT, that selection to increase CE420 should change female reproductive traits favorably, and that selection to increase CF420 should increase PP38 / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Coorientador: Luiz Otávio Campos da Silva / Banca: Arthur dos Santos Mascioli / Banca: João Cláudio do Carmo Panetto / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Pedro Franklin Barbosa / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-01-30Bitstream added on 2014-06-13T19:35:45Z : No. of bitstreams: 1 haddad_sr_me_botfmvz.pdf: 305893 bytes, checksum: 02ff7e2de8b8a9ad8c10e7f22f207754 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho objetivou comparar, utilizando dados de um experimento de Microarray com um delineamento simples, os resultados de diferentes testes estatísticos a fim de verificar suas características na detecção de diferenças no nível de expressão dos genes. Os dados foram provenientes da South Dakota State University-EUA, do Department of Biology and Microbiology, Department of Animal Science, onde toda a parte experimental foi realizada. O material biológico envolveu quatro aves infectadas e quatro não infectadas com o vírus de bronquite infecciosa (IBV). O RNA utilizado foi extraído da camada epitelial da traquéia de animais controle e infectados com o vírus da IBV e, após a transcrição reversa foi marcado com os corantes fluorescentes (Cy3 e Cy5) e hibridizados com o microarray 13k cDNA de aves (FHCRC, Seattle, WA). A análise de dados dos resultados do experimento de microarray englobou dois estágios, sendo o primeiro denominado de Normalização, em que os dados foram pré-processados utilizando o procedimento Loess. A seguir foram realizadas as análises estatísticas propriamente ditas com testes de significância. Utilizou-se um modelo simples de ANOVA e aplicaram-se diferentes metodologias de análise. A análise das imagens revelou que dos 16192 spots em cada slide, apenas 10.926 puderam ser lidos sem defeitos no primeiro slide, 11.633 no segundo slide, 12577 no terceiro e 13.154 no quarto slide. A grande maioria dos spots em branco e controles negativos apresentou defeitos que determinaram sua eliminação. Um total de 13.597 spots foi lido no conjunto dos quatro slides, mas apenas 9.853 spots estavam representados em todos os slides. Concluiu-se que os experimentos de microarray, por tratarem de um conjunto muito grande de observações a serem analisados requerem análises estatísticas específicas. O método de Cui et al. (2005) reduziu... / The aim of this research was to compare, using real data of an experiment of Microarray with a simple design, the results of different statistical tests in order to verify their characteristics in the detection of differences in the level of expression of the genes. The data were coming of South Dakota State University-EUA, of the Department of Biology and Microbiology, Department Animal of Science, where the whole experimental part was accomplished. The biological material involved four infected animals and four no infected with the virus of infectious bronchitis (IBV). Used RNA was extracted of the layer epitelial of the windpipe of animals control and infected with the virus of IBV and, after the reverse transcription it was marked with the fluorescent colors (Cy3 and Cy5) and hybridization with the microarray 13k cDNA of birds (FHCRC, Seattle, WA). The analysis of data of the results of the microarray experiment included two apprenticeships, being the first denominated of Normalization, in that the data were pre-processed using the procedure Loess. To follow the statistical analyses they were accomplished properly said through real data with significant tests. A simple model of ANOVA was used and different analysis methodologies were applied. The analysis of the images revealed that of the 16192 spots in each slide, only 10.926 could be read without defects in the first slide, 11.633 in the second slide, 12577 in the third slide and 13.154 in the fourth slide. The great majority of the spots in white and negative controls presented defects that determined it elimination. A total of 13.597 spots was read in the group of the four slides, but only 9.853 spots were represented in all of the slides. It was ended that the microarray experiments, for they treat of a very big group of observations to be analyzed request specific statistical analyses. The method of Cui et al. (2005) it reduced... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: João Francisco Escobedo / Banca: João Carlos Cury Saad / Banca: Flávio Ferrari Aragon / Banca: Amauri Pereira de Oliveira / Banca: Emerson Galvani / Resumo: A radiação solar direta na incidência é uma fração da radiação solar global e possui aplicações na agronomia, biologia e na engenharia térmica. No trabalho, são descritas a evolução diurna das médias horárias e a evolução anual das médias mensais da radiação direta na incidência, no período de 1996 a 2003, em Botucatu/SP/Brasil. É apresentada ainda a proposta e a validação dos modelos estatísticos de estimativa de Liu & Jordan e Angström, e do modelo de estimativa paramétrico de Linke. A evolução diurna das médias horárias anuais gerou uma equação temporal, com elevado coeficiente de determinação (R2= 0,99867), que permite estimar a radiação direta horária anual, com precisão e exatidão (MBE=1,0%, RMSE=3,7% e d=0,9980). Em função da dependência sazonal, foi proposta a equação de estimativa diurna da média horária mensal com elevados coeficientes de determinação. A evolução anual da média mensal horária gerou uma equação temporal com coeficiente de determinação R2 =0,75, e a validação mostrou bom desempenho nos indicativos estatísticos, superestimando a medida em menos de 1%, causando espalhamento de 6,72% e índice de ajustamento de d=0,9232. Os resultados para o modelo Liu & Jordan mostram que: a equação de estimativa horária, polinomial de 2 quarta ordem, com R2= 0,99815, pode estimar ) ( h b K em função de h T K com MBE =- 4,25%, RMSE = 27,60%, e o índice de ajustamento d= 0,972; a equação de estimativa diária, polinomial de quarta ordem, com R2= 0,9060, pode estimar ) ( d b K em função de d T K com: MBE = - 3,42%, RMSE = 18,21%, e d= 0,97; a equação de estimativa mensal é linear, com elevado coeficiente de determinação R2=0,9660, e mostra que m b K pode ser estimada com MBE= 3,21%; RMSE=14,8% e d=0,9149. O modelo de Angström diário mostra que, a correlação d b K x N n / não é linear... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: The direct solar radiation is a fraction of the global solar radiation and it has applications in the agronomy, biology and in the thermal engineering. This work describes the diurnal evolution of the hourly-averaged and the annual evolution of the monthly-averaged of the direct radiation in the incidence carried out from 1996 to 2003, in Botucatu/SP/Brazil. It's presented the proposal and the validation of the statistical model of Liu & Jordan and Angström, and of the parametric model of Linke. The diurnal evolution of the hourly values of the direct radiation provided a temporary equation, with high coefficient of determination R2 = 0.99867, which allows to esteem with accuracy (MBE=1.0%, RMSE=3.7% and d=0.9980). Because of the seasonal dependence, equations to estimate diurnal evolution of the hourly monthly average values of the direct radiation were proposed, with high determination coefficients. The annual evolution of the daily monthly average values provided a temporal equation with R2=0.75, and the validation showed good agreement in the statistical indicators, overestimating the measure in less than 1%, scattering in 6.72% with index of agreement of d=0.9232. The Liu & Jordan's model to estimate the hourly values of the direct radiation is a polynomial equation of fourth order, with the following statistical results: R2 = 0.99815, MBE = -4.25%, RMSE = 27.60%, and d = 0.972; The Liu & Jordan's model to estimate the daily values is a polynomial equation of fourth order too, with the following statistical results: MBE = - 3.42%, RMSE = 18.21%, and d = 0.97; The Liu & Jordan's model to estimate the monthly values is the first order (R2=0.9660), with the following statistical results: MBE=3.21%; RMSE=14.8% and d=0.9149. The Angström's model to estimate daily values showed that the dependence is not linear between b K and N n /... (Complete abstract, click electronic address below). / Doutor

Orientador: Víctor Hugo Lachos Dávila / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-20T06:44:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matos_LarissaAvila_M.pdf: 2008810 bytes, checksum: 0aee0c4f4bbf58ba67490d26cdd300ba (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Modelos mistos são geralmente usados para representar dados longitudinais ou de medidas repetidas. Uma complicação adicional surge quando a resposta é censurada, por exemplo, devido aos limites de quantificação do ensaio utilizado. Distribuições normais para os efeitos aleatórios e os erros residuais são geralmente assumidas, mas tais pressupostos fazem as inferências vulneráveis, 'a presença de outliers. Motivados por uma preocupação da sensibilidade para potenciais outliers ou dados com caudas mais pesadas do que a normal, pretendemos desenvolver nessa dissertação, inferência para modelos lineares e não lineares de efeito misto censurados (NLMEC / LMEC) com base na distribui ção t- Student multivariada, sendo uma alternativa flexível ao uso da distribuição normal correspondente. Propomos um algoritmo ECM para computar as estimativas de máxima verossimilhança para os NLMEC / LMEC. Este algoritmo utiliza expressões fechadas no passo-E, que se baseia em fórmulas para a média e a variância de uma distribui ção t-multivariada truncada. O algoritmo proposto é implementado, pacote tlmec do R. Também propomos aqui um algoritmo ECM exato para os modelos lineares e não lineares de efeito misto censurados, com base na distribuição normal multivariada, que nos permite desenvolver análise de influência local para modelos de efeito misto com base na esperança condicional da função log-verossilhança dos dados completos. Os procedimentos desenvolvidos são ilustrados com a análise longitudinal da carga viral do HIV, apresentada em dois estudos recentes sobre a AIDS / Abstract: Mixed models are commonly used to represent longitudinal or repeated measures data. An additional complication arises when the response is censored, for example, due to limits of quantification of the assay used. Normal distributions for random effects and residual errors are usually assumed, but such assumptions make inferences vulnerable to the presence of outliers. Motivated by a concern of sensitivity to potential outliers or data with tails longer-than-normal, we aim to develop in this dissertation inference for linear and nonlinear mixed effects models with censored response (NLMEC/LMEC) based on the multivariate Student-t distribution, being a flexible alternative to the use of the corresponding normal distribution. We propose an ECM algorithm for computing the maximum likelihood estimates for NLMEC/LMEC. This algorithm uses closed-form expressions at the E-step, which relies on formulas for the mean and variance of a truncated multivariate-t distribution. The proposed algorithm is implemented in the R package tlmec. We also propose here an exact ECM algorithm for linear and nonlinear mixed effects models with censored response based on the multivariate normal distribution, which enable us to developed local influence analysis for mixed effects models on the basis of the conditional expectation of the complete-data log-likelihood function. The developed procedures are illustrated with two case studies, involving the analysis of longitudinal HIV viral load in two recent AIDS studies / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Raysildo Barbosa Lobo / Banca: Danísio Prado Munari / Resumo: O presente trabalho objetivou comparar, utilizando dados de um experimento de Microarray com um delineamento simples, os resultados de diferentes testes estatísticos a fim de verificar suas características na detecção de diferenças no nível de expressão dos genes. Os dados foram provenientes da South Dakota State University-EUA, do Department of Biology and Microbiology, Department of Animal Science, onde toda a parte experimental foi realizada. O material biológico envolveu quatro aves infectadas e quatro não infectadas com o vírus de bronquite infecciosa (IBV). O RNA utilizado foi extraído da camada epitelial da traquéia de animais controle e infectados com o vírus da IBV e, após a transcrição reversa foi marcado com os corantes fluorescentes (Cy3 e Cy5) e hibridizados com o microarray 13k cDNA de aves (FHCRC, Seattle, WA). A análise de dados dos resultados do experimento de microarray englobou dois estágios, sendo o primeiro denominado de Normalização, em que os dados foram pré-processados utilizando o procedimento Loess. A seguir foram realizadas as análises estatísticas propriamente ditas com testes de significância. Utilizou-se um modelo simples de ANOVA e aplicaram-se diferentes metodologias de análise. A análise das imagens revelou que dos 16192 spots em cada slide, apenas 10.926 puderam ser lidos sem defeitos no primeiro slide, 11.633 no segundo slide, 12577 no terceiro e 13.154 no quarto slide. A grande maioria dos spots em branco e controles negativos apresentou defeitos que determinaram sua eliminação. Um total de 13.597 spots foi lido no conjunto dos quatro slides, mas apenas 9.853 spots estavam representados em todos os slides. Concluiu-se que os experimentos de microarray, por tratarem de um conjunto muito grande de observações a serem analisados requerem análises estatísticas específicas. O método de Cui et al. (2005) reduziu... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this research was to compare, using real data of an experiment of Microarray with a simple design, the results of different statistical tests in order to verify their characteristics in the detection of differences in the level of expression of the genes. The data were coming of South Dakota State University-EUA, of the Department of Biology and Microbiology, Department Animal of Science, where the whole experimental part was accomplished. The biological material involved four infected animals and four no infected with the virus of infectious bronchitis (IBV). Used RNA was extracted of the layer epitelial of the windpipe of animals control and infected with the virus of IBV and, after the reverse transcription it was marked with the fluorescent colors (Cy3 and Cy5) and hybridization with the microarray 13k cDNA of birds (FHCRC, Seattle, WA). The analysis of data of the results of the microarray experiment included two apprenticeships, being the first denominated of Normalization, in that the data were pre-processed using the procedure Loess. To follow the statistical analyses they were accomplished properly said through real data with significant tests. A simple model of ANOVA was used and different analysis methodologies were applied. The analysis of the images revealed that of the 16192 spots in each slide, only 10.926 could be read without defects in the first slide, 11.633 in the second slide, 12577 in the third slide and 13.154 in the fourth slide. The great majority of the spots in white and negative controls presented defects that determined it elimination. A total of 13.597 spots was read in the group of the four slides, but only 9.853 spots were represented in all of the slides. It was ended that the microarray experiments, for they treat of a very big group of observations to be analyzed request specific statistical analyses. The method of Cui et al. (2005) it reduced... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Mauricio Enrique Zevallos Herencia / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-24T02:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Reis_SandraSantosdos_M.pdf: 1897835 bytes, checksum: 24e50267c694dbcb380ddcfc9d7bdace (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Neste trabalho discutimos a detecção de observações influentes em modelos simétricos lineares e não lineares. Em primeiro lugar é realizado um estudo de simulação para avaliar o desempenho de três métodos de estimação em dados gerados por quatro situações: sem observações influentes, com outliers na variável resposta, com observações influentes de média alavancagem e com observações influentes de alta alavancagem. São analisados dois métodos de máxima verossimilhança e um método robusto. Foram considerados modelos de regressão linear e não linear com erros logísticos tipo II e t-Student. Em segundo lugar é discutida detecção de observações influentes mediante a distância de Cook generalizada, a estatística de Peña e a estatística de Andrews-Pregibon. Em particular é discutida a conveniência de utilizar a metodologia de limiares para caracterizar uma observação como influente ou não influente, assim como o efeito da estimação de parâmetros na construção de limiares. Estas medidas foram aplicadas a conjuntos de dados reais e simulados considerando o ajuste de alguns modelos simétricos com uma adaptação no método de estimação scoring de Fisher / Abstract: We discuss the detection of influential observations in symmetrical linear and nonlinear regression models. First a simulation study is conducted to evaluate the performance of three estimation methods on data generated by four situations: without influential observations with outliers in the response variable, with influential observations average leverage and influential observations with high leverage. Two methods of maximum likelihood and robust method are analyzed. We considered linear and nonlinear regression models with logistic-II and Student-t errors. Secondly detection of influential observations by generalized Cook's distance, the statistic PeÃ?a and Andrews - Pregibon statistic is discussed. In particular the convenience of using the methodology to characterize a threshold observation as influential or not influential, as well as the effect of parameter estimation in the construction of thresholds is discussed. These measures were applied to sets of real and simulated data considering the fit of some symmetrical regression models with an adaptation estimation method of Fisher scoring / Mestrado / Estatistica / Mestra em Estatística

Orientador: Víctor Hugo Lachos Dávila / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-26T19:55:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Massuia_MoniqueBettio_M.pdf: 2926597 bytes, checksum: 2a1154c0a61b13f369e8390159fc4c3e (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Este trabalho tem como objetivo principal apresentar os modelos de regressão lineares com respostas censuradas sob a classe de distribuições de mistura de escala skew-normal (SMSN), visando generalizar o clássico modelo Tobit ao oferecer alternativas mais robustas à distribuição Normal. Um estudo de inferência clássico é desenvolvido para os modelos em questão sob dois casos especiais desta família de distribuições, a Normal e a t de Student, utilizando o algoritmo EM para obter as estimativas de máxima verossimilhança dos parâmetros dos modelos e desenvolvendo métodos de diagnóstico de influência global e local com base na metodologia proposta por Cook (1986) e Poom & Poon (1999). Sob o enfoque Bayesiano, o modelo de regressão para respostas censuradas é estudado sob alguns casos especiais da classe SMSN, como a Normal, a t de Student, a skew-Normal, a skew-t e a skew-Slash. Neste caso, o amostrador de Gibbs é a principal ferramenta utilizada para a inferência sobre os parâmetros do modelo. Apresentamos também alguns estudos de simulação para avaliar a metodologia desenvolvida que, por fim, é aplicada em dois conjuntos de dados reais. Os pacotes SMNCensReg, CensRegMod e BayesCR para o software R dão suporte computacional aos desenvolvimentos deste trabalho / Abstract: This work aims to present the linear regression model with censored response variable under the class of scale mixture of skew-normal distributions (SMSN), generalizing the well known Tobit model as providing a more robust alternative to the normal distribution. A study based on classic inference is developed to investigate these censored models under two special cases of this family of distributions, Normal and t-Student, using the EM algorithm for obtaining maximum likelihood estimates and developing methods of diagnostic based on global and local influence as suggested by Cook (1986) and Poom & Poon (1999). Under a Bayesian approach, the censored regression model was studied under some special cases of SMSN class, such as Normal, t-Student, skew-Normal, skew-t and skew-Slash. In these cases, the Gibbs sampler was the main tool used to make inference about the model parameters. We also present some simulation studies for evaluating the developed methodologies that, finally, are applied on two real data sets. The packages SMNCensReg, CensRegMod and BayesCR implemented for the software R give computational support to this work / Mestrado / Estatistica / Mestra em Estatística