Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-09-16T19:54:22Z No. of bitstreams: 1 2015_CristianaMouraAndrade.pdf: 1562427 bytes, checksum: c6b3855c58847246d1e9597518b95126 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-09-30T22:02:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_CristianaMouraAndrade.pdf: 1562427 bytes, checksum: c6b3855c58847246d1e9597518b95126 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-30T22:02:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_CristianaMouraAndrade.pdf: 1562427 bytes, checksum: c6b3855c58847246d1e9597518b95126 (MD5) / Sclerotinia sclerotiorum é um fungo necrotrófico, que causa uma doença devastadora denominada mofo branco, responsável por infectar mais de 450 espécies de plantas por todo o mundo. Sendo muito difícil seu controle por fungicidas. Desta forma, o uso de plantas hospedeiras com níveis adequados de resistência é a melhor alternativa para o manejo da doença. Entretanto, devido à natureza da doença, programas de melhoramento tem tido sucesso limitado. Uma alternativa para o desenvolvimento de resistência a um fungo necrotrófico é o uso da estratégia de HIGS (Silenciamento Gênico Induzido pelo Hospedeiro), que envolve a expressão de construções no hospedeiro, gerando dsRNA dirigidos para silenciar genes do patógeno. O alvo escolhido foi o gene que codifica para quitina sintase (chs), que determina a síntese de quitina, um polissacarídeo que é componente estrutural crucial na parede celular de diversos fungos. Plantas de fumo foram transformadas com uma construção do tipo intron-hairpin para silenciamento do gene chs do fungo. Cinco linhagens de plantas transformadas demonstraram uma redução na severidade da doença 72 horas após a inoculação, variando de 55,5% a 86,7% quando comparadas a linhagens não transgênicas. A área da lesão não mostrou extensivo progresso com o passar do tempo (até 120h) em linhagens transgênicas. Resistência à doença e silenciamento do gene chs do fungo teve uma correlação positiva com a presença de siRNAs detectáveis em linhagens transgênicas. Demonstrou-se que genes endógenos do fungo necrotrófico muito agressivo, S. sclerotiorum pode ser silenciado induzido pelo hospedeiro. HIGS do gene da síntese de quitina de fungo pode gerar plantas tolerantes à mofo branco. Do ponto de vista biotecnológico, nossos resultados abrem novas perspectivas para o desenvolvimento de plantas transgênicas resistentes a fungos necrotróficos patogênicos. / Sclerotinia sclerotiorum is a necrotrophic fungus, which causes a devastating disease called white mold, infecting more than 450 plant species worldwide. Its control with fungicides is difficult. Thus, the use of adequate levels of host-plant resistance is the best alternative for disease management. However, due to the nature of the disease, breeding programs have had limited success. A potential alternative to developing necrotrophic fungal resistance is the use of the host-induced gene silencing (HIGS) methods, which involves host expression of dsRNAgenerating constructs directed against genes in the pathogen. We chose as a target the gene coding for chitin synthase (chs) that is involved in the synthesis of chitin, the polysaccharide that is a crucial structural component of the cell walls of many fungi. Tobacco plants were transformed with an interfering intron-hairpin construct for silencing the chs fungal gene. Five transgenic lines showed a reduction in disease severity 72 h after inoculation ranging from 55.5% to 86.7% compared with the non-transgenic lines. The lesion area did not show extensive progress over this time (up to 120h). Disease resistance and silencing of the chs fungal gene was positively correlated with the presence of detectable siRNA in the transgenic lines. It was demonstrated that endogenous genes from the very aggressive necrotrophic fungus S. sclerotiorum can be silenced induced by the host. HIGS of the fungal chitin synthase gene can generate white mold-tolerant plants. From a biotechnological perspective, our results open new prospects for the development of transgenic plants resistant to necrotrophic fungal pathogens.

O tabaco (Nicotiana tabacum L.), originário dos Andes, pertence à família das Solanaceas e é cultivado em diversos países. A produção de tabaco contribui com a economia de 150 países e gera uma receita de mais de U$ 2 bilhões de dólares anuais. Porém, alguns fatores podem restringir os ganhos de produtividade. Dentre eles, as doenças se destacam como um dos fatores mais importantes e o mofo branco, causado por Sclerotinia sclerotiorum, atinge, principalmente, as lavouras localizadas na região litorânea de Santa Catariana, local que favorece o desenvolvimento do fungo devido às características climáticas. A partir dessa problemática este estudo buscou avaliar a agressividade de isolados de S. sclerotiorum frente a cultivares comerciais de tabaco, bem como e também conhecer o perfil genético dos isolados. Foram utilizadas cinco diferentes cultivares de tabaco e 33 isolados de S. sclerotiorum de diferentes municípios dos estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina, Paraná e São Paulo. Para o teste de agressividade, em casa de vegetação, somente dez isolados do fungo foram inoculados em hastes de plantas de tabaco mediante perfuração com palito de dente estéril Para avaliação do perfil genético utilizou-se a técnica de microssatélites com 33 isolados do fungo. Os resultados mostraram que os isolados apresentaram diferentes perfis de agressividade e diferentes taxas de mortalidade. Os níveis de agressividade observados neste estudo comprovaram que a suscetibilidade da cultivar foi dependente do isolado. Foram detectados 114 alelos com média de 11 alelos por Locus. Alguns marcadores apresentaram alelo nulo em alguns genótipos, em especial o marcador 99, o qual foi nulo em 14 isolados. A maioria dos isolados (61%) apresentaram alelos exclusivos e clones não foram observados. A análise da informação do conteúdo de polimorfismo (PIC) foi altamente informativa (PIC > 0.50) para todos os marcadores. / Tobacco (Nicotina tabacum L.), which is originated from South America, belongs to the Solanaceae family and it is grown in many countries. Tobacco production contributes to the economy of 150 countries, being responsible for U$ 2 bilions dollar of revenue. However, there are many factors affecting the productivity, for example, diseases. White mold, caused by Sclerotinia sclerotiorum, primarily affects crops located in the coastal region of the Santa Catarina state, where mold development is favored by the weather conditions. Because of that, this research aimed to evaluate the S. sclerotiorum aggressiveness in commercial tobacco cultivars and assess the genetic diversity of isolates. Five different tobacco cultivars and 33 S. sclerotiorum isolates were used. These isolates were collected in different areas of Rio Grande do Sul, Santa Catarina, Paraná and São Paulo states. For the aggressively tests in green house, ten isolates were inoculated in tobacco stem plants by the sterile toothpick perforation technique. For the genetic diversity assessment, 33 mold isolates were evaluate by the microsatellite technique. As a result, the tested isolates showed different aggressiveness profiles and mortality rates. The cultivar susceptibility was dependent on isolates. One hundred and fourteen alleles were detected, 11 alleles average per Locus. Some markers showed null alleles in some genotypes. Fourteen isolates did not amplify the marker 99. Most of isolates (61%) showed unique alleles, without clone presences. The analysis of polymorphism information content (PIC) was highly informative (PIC> 0:50) for all markers.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-08-26T17:47:11Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) FRANCIMARSILVA.pdf: 843897 bytes, checksum: e547985b0559e2b0f30785d8bad76231 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-26T17:47:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) FRANCIMARSILVA.pdf: 843897 bytes, checksum: e547985b0559e2b0f30785d8bad76231 (MD5) Previous issue date: 2007-05-05 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / We studied the effect of ethanol extracts and vegetable waste in carpogenic germination Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) De Bary. The extracts studied were obtained from Cerrado trees, and residues of crops (corn, beans, oats, millet, wheat and vetch). From these residues were obtained ethanol extracts of which were later submitted to the partition with different solvents and evaluated the effect of the obtained phases. Regarding the effects of the extracts of the trees, there was suppressive effect on carpogenic germination of ethanol extracts of Terminalia periderm fagifolia of seed Magonia pubecens. ethanol extracts of periderm of Tabebuia heptaplylla and hexane phases and CH3CN / CHCl3 obtained the partition of the ethanol extract of the core of Terminalia fagifolia had inhibitory effect on germination carpogenic. Oatmeal waste, beans, vetch and millet spread on sclerotia germination carpogenic suppressed. The ethanol extracts of oats and vetch suppressed carpogenic germination, while wheat, beans, corn and millet only delayed the carpogenic germination. The phases obtained from the partition of the ethanol extracts from crop residues, regardless of the solvent used in the partition, and cultural residue which was extracted, reduced carpogenic germination. The pH of oat extracts, vetch and millet had no influence on the suppressive effect of carpogenic germination. pH levels lower than 5.0 miceliogênica stimulated germination. / Estudou-se o efeito de extratos etanólicos de e resíduos de vegetais na germinação carpogênica de Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary. Os extratos estudados foram obtidos de árvores do cerrado, e de resíduos de plantas cultivadas (milho, feijão, aveia, milheto, trigo e ervilhaca). A partir destes resíduos foram obtidos extratos etanólicos os quais foram posteriormente submetidos à partição com diferentes solventes e avaliado o efeito das fases obtidas. Em relação aos efeitos dos extratos das árvores, houve efeito supressor na germinação carpogênica dos extratos etanólicos da periderme de Terminalia fagifolia das sementes de Magonia pubecens. Extratos etanólicos da periderme de Tabebuia heptaplylla e das fases hexânica e CH3CN/CHCl3 obtidas da partição do extrato etanólico do cerne de Terminalia fagifolia tiveram efeito inibidor na germinação carpogênica. Os resíduos de aveia, feijão, ervilhaca e milheto distribuídos sobre os escleródios suprimiram a germinação carpogênica. Os extratos etanólicos de aveia e ervilhaca suprimiram a germinação carpogênica, enquanto de trigo, feijão milho e milheto apenas retardaram a germinação carpogênica. As fases obtidas da partição dos extratos etanólicos de resíduos de culturas, independente do solvente utilizado na partição, e do resíduo cultural do qual foi extraído, reduziram a germinação carpogênica. O pH dos extratos de aveia, ervilhaca e milheto não tiveram influência no efeito supressor da germinação carpogênica. Níveis de pH inferiores a 5,0 estimularam germinação miceliogênica.

Introdução - Alguns tipos de fungos, como o mofo, são de fundamental importância médica, principalmente por produzirem toxinas nocivas à saúde dos humanos. São frequentemente encontrados no interior dos domicílios quando há condição favorável, como umidade e temperatura adequada. Vários estudos relataram associação entre mofo e doenças alérgicas ou respiratórias em crianças. Objetivos - Descrever as características dos domicílios dos recém-nascidos incluídos em um estudo de coorte na cidade de São Paulo e identificar as possíveis associações com o desenvolvimento de mofo visível nas superfícies (paredes, piso e teto). Métodos - Este trabalho faz parte de uma coorte de recém-nascidos com início em 2003 e término em 2007, denominada PROJETO CHIADO. Participaram do estudo 378 domicílios. Entrevistadores fizeram visitas nestas residências para coletar dados referentes às características dos domicílios (tipo de cobertura, tipo de forro, idade da construção) e condições intra-domiciliares (ventilação, aglomeração, incidência solar, temperatura, presença de umidade, presença de mofo). Foram realizadas análises descritivas e análises bivariável e multivariável (regressão logística) para identificar possíveis associações entre as características dos domicílios e a presença de mofo. Resultados Foi encontrado mofo visível na maioria dos domicílios visitados (66 por cento), sendo 28 por cento no quarto da criança e 38 por cento em outros cômodos. Foi relatada umidade em aproximadamente metade dos domicílios (47 por cento) e ventilação regular, ruim ou péssima em 42 por cento. Foram identificadas associações positivas entre a presença de mofo no quarto da criança e ventilação ruim ou péssima (OR=2,14; IC95 por cento:1,05-4,38), falta de incidência solar no verão (OR=3,84; IC95 por cento:1,59-9,28) e aglomeração de quatro ou mais pessoas no quarto da criança (OR=2,09; IC95 por cento:1,24-3,50). Por outro lado, os tipos construtivos apresentaram associação inversa com o mofo (OR=0,41; IC95 por cento: 0,17-1,01) para cobertura com telha de cerâmica e forro de madeira ou cobertura com fibrocimento e forro de concreto e OR=0,40; IC95 por cento: 0,18-0,90 para cobertura com telha de cerâmica e forro de concreto. Conclusão Ventilação precária, falta de incidência solar no domicílio durante o verão e aglomeração de pessoas no domicílio propiciam o desenvolvimento de mofo enquanto que os tipos construtivos com coberturas feitas com materiais de maior densidade protegem os domicílios contra o desenvolvimento de mofo. A partir do conhecimento das características dos domicílios, é possível realizar intervenções para evitar o crescimento do mofo / Introduction Some kind of fungi, such as mold, has fundamental medical importance, especially by producing toxins harmful to human health. They are often found inside the homes when there are favorable conditions, such as appropriated humidity and temperature. Several studies have reported associations between mold and respiratory and allergic diseases in children. Objectives To describe the household characteristics of the newborns included in a cohort study in the city of São Paulo and to identify possible associations with the visible mold development on the surfaces (walls, floors and ceiling). Methods This study is part of a newborns cohort study that started in 2003 and finished in 2007, called WHEEZING PROJECT. 378 households participated in the study. Interviewers visited the homes to collect data from households characteristics (type of roof, type of ceiling, building age) and indoor conditions (ventilation, crowding, solar incidence, temperature, presence of moisture, presence of mold). Descriptive analyses and bivariate and multivariate analyses (logistic regression) were performed to identify associations between households characteristics and the presence of mold. Results Visible mold was found in most households visited (66 per cent), 28 per cent in the child´s room and 38 per cent in the other rooms. Moisture was reported in 47 per cent of the houses, and regular, bad or very bad ventilation in 42 per cent. Positive associations were found between the presence of mold in the homes and bad or very bad ventilation (OR=2,14; 95 per centCI: 1,05-4,38), no solar incidence in the summer (OR=3,84; 95 per centCI: 1,59-9,28) and crowding of at least four people in the child´s room (OR=2,09, 95 per centCI: 1,24-3,50). On the other hand, the type of construction showed inverse association with the mold (OR=0,41; 95 per centCI: 0,17-1,01) to ceramic tile roof and wood ceiling or cement-fibre roof and concrete ceiling and OR=0,40; CI IC95 per cent: 0,18-0,90 to ceramic tile and concrete ceiling. Conclusion Poor ventilation, no solar incidence in the home during the summer and crowding in the child´s room facilitate the development of mold, while the type of construction with high density materials protects the homes against the mold development. From the knowledge of the households characteristics, it is possible to perform interventions to prevent mold growth

Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-06-02T12:47:54Z No. of bitstreams: 1 MarianaRochaMaximianoDissertacaoParcial2015.pdf: 459398 bytes, checksum: b2185a3a3375dbb7ac1ed82fc658146b (MD5) / Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-06-02T12:48:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MarianaRochaMaximianoDissertacaoParcial2015.pdf: 459398 bytes, checksum: b2185a3a3375dbb7ac1ed82fc658146b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T12:48:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarianaRochaMaximianoDissertacaoParcial2015.pdf: 459398 bytes, checksum: b2185a3a3375dbb7ac1ed82fc658146b (MD5) Previous issue date: 2015-06-18 / Sclerotinia sclerotiorum, the causal agent of white mold, is a plant pathogenic fungus that has a characteristic feature, production of sclerotia, resistance structures that can be viable for up to 10 years in the soil, with ability to initiate a new cycle of infection under favorable conditions. The disease control methods are based on integrated management practices, including biological and chemical control. The proteomic study of this interaction may be a strategy for studying this pathosystem, however, the small amount of mycelium produced during the infectious process in vivo greatly limits the study of this pathosystem using this strategy. The main goals of this work were the development and validation of a culture medium that would partially mimic the host and allow the production of large amounts of micelium for in vitro studies of this pathosystem. For this purpose, a protocol was established for the production of culture media prepared with leaf extract of the hosts. These media were inoculated with sclerotia of the monosporic isolate SS 200 of S. sclerotiorum and the differential expression of effectors and candidate effectors of virulence of the fungus was evaluated by qPCR. The results showed that a large amount of micelia grew in the media and effector genes and candidate effector genes were induced in these media. These results indicate that the proposed culture media can be used to study the in vitro interaction between S. sclerotiorum and several plant hosts and that they can be useful especially in proteomic studies. / Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco, ?? um fungo fitopatog??nico que possui uma caracter??stica marcante, a produ????o de escler??dios, estruturas de resist??ncia que podem ser vi??veis por at?? 10 anos no solo, com capacidade de iniciar um novo ciclo de infec????o em condi????es favor??veis. Os m??todos de controle da doen??a baseiam-se em pr??ticas de manejo integrado, incluindo controle biol??gico e qu??mico. O estudo prote??mico desta intera????o pode ser uma estrat??gia para o estudo deste patossistema, entretanto, a pequena quantidade de mic??lio produzido pelo pat??geno durante o processo infeccioso in vivo limita bastante o estudo deste patossistema utilizando esta estrat??gia. Os objetivos deste trabalho foram o desenvolvimento e valida????o de um meio de cultura que mimetizasse parcialmente o hospedeiro e permitisse a produ????o de grande quantidade de massa micelial para estudos in vitro desse patossistema. Para tal, foi estabelecido um protocolo para a produ????o de meios de cultura, preparados a partir de extratos foliares dos hospedeiros. Estes meios foram inoculados com escler??dios do isolado monosp??rico de S. sclerotiorum SS 200 e a express??o diferencial de genes efetores e candidatos a efetores de virul??ncia do fungo foi avaliada por qPCR. Os resultados mostraram que em todos os meios testados houve crescimento de grande quantidade de massa micelial e que os meios foram capazes de induzir a express??o de genes efetores e candidatos a efetores. Portanto, os resultados indicam que os meios propostos podem ser usados no estudo da intera????o in vitro de S. sclerotiorum com v??rios hospedeiros, especialmente em estudos prote??micos.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:37:25Z : No. of bitstreams: 1 forner_c_me_botfca.pdf: 342661 bytes, checksum: b86ed8f1c4237edcdaae7ee7fe632688 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O bolor verde, causado por Penicillium digitatum, é a principal doença em pós-colheita dos citros, responsável por grandes perdas no transporte, armazenamento e comercialização. Devido às exigências do mercado consumidor por alimentos sem a presença de resíduos de agrotóxicos, há necessidade de desenvolver tecnologias para atender a essa demanda. Assim, o trabalho teve como objetivo avaliar o controle do bolor verde, em laranjas Pêra, com agentes de biocontrole (Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis e Sporidiobolus pararoseus), associados ou não ao tratamento térmico. Os frutos submetidos a esses tratamentos foram armazenados, por 28 dias, em temperatura de 10 ºC e UR 90%±5 ou por oito dias a 20 ºC e UR 90%±5. As avaliações foram iniciadas quatro dias após a inoculação do patógeno, pela medição do diâmetro das lesões nos pontos de inoculação do patógeno. As medições foram realizadas diariamente, por sete dias, quando os frutos foram armazenados a 10 ºC, ou por cinco dias quando armazenados a 20 ºC. Após a avaliação foi calculada a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) e com esses dados realizadas as análises estatísticas para comparação de médias. As análises de qualidade dos frutos (acidez titulável, sólidos solúveis, ratio, rendimento de suco, firmeza da polpa, coloração da casca e perda de peso), além da incidência natural de doenças em pós-colheita dos frutos armazenados a 10º C, foram avaliadas após 14 e 28 dias. De um modo geral, o tratamento térmico reduziu a AACPD nos frutos. Por outro lado, os agentes de biocontrole não controlaram a doença, mostrando... / The green mold, caused by Penicillium digitatum, is the main disease in postharvest of citrus, responsible for major losses during transportation, storage and marketing. Due to the demands of the consumer market for food without the presence of pesticide residues, there is A need to develop technologies to meet this demand. Thus, the study focused on evaluating the control of green mold in Pêra oranges with biocontrol agents (Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis and Sporidiobolus pararoseus), associated or not with heat treatment. Fruits submitted to these treatments were stored for twenty eight days at temperature of 10 ºC and RH 90%±5 or for eight day at 20 ºC and 90%±5. Assessments were initiated four days after pathogen inoculation, by measuring the diameter of the lesions in sections of pathogen inoculation. Measurements were performed daily, for seven days, when fruits were stored at 10 ºC, or five days when stored at 20 ºC. After the assessment, the area under the disease progress curve (AUDPC) was calculated and, with these data, statistical analyzes to means comparison were performed. The analysis of fruit quality (acidity, soluble solids, ratio, juice, pulp firmness, peel color and weight loss), besides the natural incidence of disease in postharvest fruit stored at 10 ºC, were assessed after fourteen and twenty eight days. In general, the heat treatment reduced the AUDPC in the fruit. In general, biocontrol agents did not control the disease, showing that the organisms tested did not present curative activity against the green mold. The heat treatment also reduced the incidence of natural... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Maurício Dutra Zanotto / Coorientador: Dartanhã José Soares / Banca: Marcelo de Almeida Silva / Banca: Sérgio Gonçalves Dutra / Resumo: A mamoneira (Ricinus communis L.) é uma oleaginosa da família das Euforbiáceas que disseminou-se por varias regiões do mundo devido a sua fácil propagação e adaptação. O principal produto negociado no mercado internacional é o óleo de rícino e o Brasil é o segundo maior fornecedor desse produto. O melhoramento vegetal visando à obtenção de novas cultivares e híbridos de mamoneira é primordial para o sucesso econômico da cultura, pois, o plantio de materiais mais produtivos, resistentes à doenças e que permitem o uso de mecanização traz maior retorno econômico para os produtores. O objetivo do presente estudo foi realizar a caracterização agromorfológica, avaliar a divergência genética e a reação ao mofo cinzento de 58 acessos de mamoneira coletados em diferentes regiões do Brasil. Realizou-se a criação de um banco de sementes de mamoneiras selvagens através de coletas em diversas regiões do Estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e na capital do Rio Grande do Norte. As sementes foram levadas para o Departamento de Produtividade e Melhoramento Vegetal da Faculdade de Ciências Agronômicas (FCA) em Botucatu - SP para beneficiamento e realização de testes preliminares (vigor, germinação e teor de óleo). Os acessos pré-selecionados foram semeados e caracterizados através de 31 descritores morfológicos. Foram coletados racemos desses materiais para testar a reação e a resistência ao mofo cinzento da mamoneira no Laboratório de Entomologia e Fitopatologia da Embrapa Meio Ambiente ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Castor bean (Ricinus communis L.) is an an Euphorbiaceae family oilseed that has spread to various regions of the world due to its easy propagation and adaptation. Brazil is the second largest castor oil supplier, the main product traded in the international market. Plant breeding to generate cultivars and hybrids more productive, resistant to diseases, allowing the use of mechanization of castor bean can drive this crop for the economic success, generating producer's profit. Our aim was to perform the agro-morphological characterization, evaluate genetic divergence and gray mold reaction of 58 accessions of castor bean collected in different regions of Brazil. A wild castor bean seed bank was created through collections in several São Paulo State regions, South of Minas Gerais and in the capital of Rio Grande do Norte. Processing and preliminary tests (vigor, germination and oil content) were performed at the Department of Productivity and Plant Breeding from Faculty of Agronomic Sciences (FCA) in Botucatu, SP, Brazil. Preselected accessions were sown and characterized by 31 morphological descriptors. Castor bean racemes were tested to gray mold reaction and resistance in the Laboratory of Entomology and Phytopathology, Embrapa Meio Ambiente in Jaguariúna-SP, Brazil. Variance analysis, similarity by the nearest neighbor hierarchical method and principal components analysis was performed on all data obtained. BTC5, SAP1 and SBS2 showed the highest germination percentage (98.67%). SM2, SAP4, SM1, SBS2, SJC2, BOIT1, CBJ1, BOF2, BTC5 and CJ4 were selected as the resistance source of the castor bean gray mold while BOC1 was the most divergent. SM2, SM1, SBS2, CJ4, BJC4, CJ3, CJ1, CBJ1, CJ6, SAP2, SAP1 and SAP4 have agro-morphological characteristics of commercial interest and they are promising to constitute a germplasm collection in castor bean breeding programs. / Mestre

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2015. / Submitted by Patrícia Nunes da Silva (patricia@bce.unb.br) on 2016-02-05T13:05:53Z No. of bitstreams: 1 2015_AlaersonMaiaGeraldine_Parcial.pdf: 11895274 bytes, checksum: 0a59c54f104d2e95f8af0824dd15d853 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2016-02-05T13:52:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_AlaersonMaiaGeraldine_Parcial.pdf: 11895274 bytes, checksum: 0a59c54f104d2e95f8af0824dd15d853 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-05T13:52:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_AlaersonMaiaGeraldine_Parcial.pdf: 11895274 bytes, checksum: 0a59c54f104d2e95f8af0824dd15d853 (MD5) / Apesar do grande número de estudos sobre doenças causadas por Sclerotiniasclerotiorum, os processos componentes do ciclo das doenças nos diferentes hospedeiros são quase sempre estudados independentemente. O ciclo das doenças causadas por Sclerotiniaé bastante complexo, e pode ser dividido em quatro fases, correspondendo a estruturas típicas do ciclo de vida do patógeno. Essas fases correspondem à formação e função biológica de quatro tipos de propágulos: (1) escleródios, (2) apotécios e ascósporos, (3) pétalas infectadas, e (4) hifas infecciosas. Um etográfico serve para sintetizar o conhecimento relevante sobre a epidemiologia de uma doença. No primeiro capítulo, versões sucessivas de um etográfico são usadas para discutir a fenomenologia do mofo-branco do feijoeiro, enfatizando as relações entre propágulos de S. sclerotiorum, os sucessivos estágios da doença e os estágios de desenvolvimento do hospedeiro. O etográfico descreve a fenomenologia do mofo-branco do feijoeiro através do exame dos vários estágios do ciclo da doença em maior detalhamento do que geralmente é apresentado, e leva em consideração a concatenação de eventos pertinente ao ciclo. O método é útil em identificar os estágios-chave do ciclo e em explicitar as relações entre os estágios da doença, os quatro tipos de propágulos e os fatores que afetam seus respectivos processos de infecção. A abordagem também é útil como primeiro passo para modelagem quantitativa do mofo-branco do feijoeiro. No capítulo 2, foram analisados os estágios sucessivos (fases das epidemias), bem como seus processos de regulação e fatores envolvidos. Foram estudadas epidemias em lavouras de feijão, em condições ambientais naturais prevalecentes no período de inverno no Brasil Central. Os conjuntos de epidemias experimentais objetivaram promover uma série de epidemias de mofo branco. Cinquenta e sete epidemias, representando uma grande variação em níveis de severidade e formas de progresso da doença foram monitorados com atenção específica para os quatro tipos de propágulos considerados. As epidemias foram analisadas por diferentes técnicas estatísticas e três grupos (A, B e C) de epidemias foram identificados. O Grupo A inclui epidemias de lento estabelecimento, desenvolvidas em uma baixa taxa de infecção e levaram a incidências e severidades finais muito baixas. As epidemias no Grupo C tiveram um início precoce, progrediram muito rapidamente com uma taxa de infecção inicialmente elevada, seguida de estabilização. As epidemias no Grupo B apresentaram um comportamento intermediário, inicialmente com baixa taxa de progresso da doença, seguido por um forte aumento da taxa de infecção da folhagem em fases posteriores. Supõe-se que a infeção planta-a-planta (infecção secundária) ocorre raramente em epidemias do grupo A devido menor frequência de contatos efetivos, resultando em um pequeno número de lesões na folhagem e baixa incidência de plantas doentes (média de 12% de incidência). Por outro lado, presume-se que, em epidemias do Grupo C, infecções planta-a-planta ocorrem com frequência, devido maior frequência de contatos efetivos, que conduz a um número muito maior de lesões e maior incidência de plantas doentes (média de 81% de plantas doentes). Portanto, mesmo considerando a relevância do inóculo primário na forma de escleródios e a subsequente formação de apotécios, o papel das infecções subsequentes por outros propágulos em epidemias de mofo-branco deve ser levado em conta. No capítulo 3 é descrita a estrutura de um modelo de epidemias de mofo-branco em feijão que enfatiza os sucessivos tipos de propágulos do patógeno e sua interação com plantas hospedeiras. Um etográfico descrevendo o ciclo de infecção em feijão mofo-branco foi desenvolvido utilizando símbolos e conceitos desenvolvidos para análise de sistemas. Em seguida um modelo simplificado foi construído utilizando o programa STELLA® 10,6 (Isee system, EUA). Em seguida, oito parâmetros do modelo foram ajustados para variar em quatro níveis. Análises de sensibilidade e métodos estatísticos foram então conduzidos a fim de identificar lacunas, quais parâmetros mais contribuem para variabilidade dos resultados e quais parâmetros são altamente correlacionados com as saídas do modelo. A análise de sensibilidade do sub-modelo de germinação de escleródios mostrou que mudanças na taxa relativa de escleródios germinados (RRGSC) causou variação na área abaixo da curva de progresso da doença (AUDPC), que foram menores do que os causados pela variação no número de inicial de escleródios (SC). A análise de sensibilidade do sub-modelo de infecção de flor mostrou que alterações nos valores da taxa relativa de senescência floral (RRFS) causou menor variação na AUDPC do que mudanças na taxa relativa de infecção floral (RRFI). No terceiro sub-modelo de simulação de infecção da folhagem de feijão, a taxa relativa de infecção primária na folhagem (RRP) teve o mais forte efeito sobre os valores AUDPC. Diferentes análises (análise de variância e análise de componentes principais) indicam que SC, RRGS, RRFI, RRP e RRS foram os parâmetros mais importantes do modelo de simulação de epidemias de mofo-branco. Três grupos de epidemias foram estabelecidas utilizando os resultados do modelo (valores de AUDPC) como um critério para a formação de grupos. Como resultados, os três grupos de epidemias foram confirmados pela análise de discriminante envolvendo uma combinação de parâmetros do modelo de simulação mofo branco. Claramente, o patossistemaPhaseolusvulgaris - Sclerotiniasclerotiorum é muito mais complexo do que o modelo teórico geral para doenças "de juros simples", mesmo que a quantidade de inóculo inicial (na forma de propágulo 1, escleródios) permaneça como um dos mais importantes parâmetros, como mostrado por análise de sensibilidade. / Despite the large number of studies on Sclerotiniadiseases on several hosts, the processes composing disease cycles are almost always studied separately.The cycle of Sclerotiniadiseases is complex, and can be divided in four broad phases, corresponding to typical structures of the pathogen life cycle. These phases correspond to the formation and the biological functions of four different types of propagules: (1) sclerotia, (2) apothecia and ascospores, (3) infected petals, and (4) infectious hyphae. An ethograph graphically synthesizes knowledge relevant to epidemiology of a disease. In the first chapter, successive versions of an ethograph are used to discuss the phenomenology of the bean white mould cycle and to highlight relationships among S. sclerotiorum propagules, successive stages of the disease and bean developmental stages. The ethograph describe the phenomenology of bean white mould through the examination of the several stages of the disease cycle in more detail than it is usually attempted and taking into account the concatenation of events. The method is useful to identify key stages and to explicit the relationships among disease stages of the disease cycle, the four types of propagules, and the factors that affect their respective processes of infection. It constitutes an initial step to for the development of a quantitative, simulation model. In Chapter 2 we analysed these successive stage (phases), as well as their regulating processes and factors. Sets of experimental epidemics were created in bean fields under natural environmental conditions prevailing in the winter season in Central Brazil. The sets of experimental epidemics aimed to promote a range of white mould epidemics. Fifty-seven epidemics, representing a wide variation in severity levels and in disease progress shapes, were monitored, with specific attention paid to the four considered propagule types. Epidemics were analysed by different statistical techniques and three groups (A, B, or C) of epidemics were distinguished. Group A includes epidemics which were slow to establish, developed at a low rate, and led to very low terminal incidence and severity. Epidemics in Group C had an earlier onset, progressed very rapidly with an initially high rate of increase, followed by stabilization. Epidemics in Group B displayed an intermediate behaviour, with an initially low rate of disease increase, followed by a strong increase of the rate of foliage infection at later stages. It is assumed that plant-to-plant spread (secondary infection) occurs rarely in Group A epidemics because of the lower frequency of effective contacts, resulting into a small number of lesions on the foliage and low incidence of diseased plants (average 0.12% of incidence). By contrast, it is assumed that, in epidemics of Group C, plant-to-plant spread occurs frequently, because of the higher frequency of effective contacts, leading to a much higher number of lesions and higher incidence of diseased plants (average 0.81% of incidence). Therefore, even if the primary inoculum in the form of sclerotia and the subsequent formation of apothecia are, in part, relevant, the role of subsequent infections by other propagules on white mould epidemics must be taken into account. In chapter 3 we described the structure of a model for bean white mould epidemics that emphasizes on the successive types of pathogen propagules and their interaction with host plants. An ethograph describing the infection cycle in bean white mould was developed using symbols and concepts developed for system analysis and a simplified model was built using the STELLA® 10.6 programme (Isee systems, USA). Next, eight model parameters were set to vary in four levels for model evaluation. Sensitivity analyses and statistical methods were then conducted in order to identify gaps, which inputs contribute most to output variability and which parameters are most highly correlated with the outputs. Sensitivity analysis of the sclerotia germination sub-model showed that changes in the relative rate of germinated sclerotia (RRGSC) caused variation in the area under disease progress curve (AUDPC) that were smaller than those caused by variation in the parameter initial number of sclerotia (SC). Sensitivity analysis of the flower infection sub-model showed that changes in values of the relative rate of flower senescence (RRFS) caused narrower AUDPC variation than changes in the relative rate of flower infection, RRFI. In the third sub-model simulating infection of bean foliage, the relative rate of primary infection on foliage, RRP, had the strongest effect on AUDPC values. Different analyses (analyses of variance and principal component analysis) indicate that SC, RRGS, RRFI, RRP and RRS were the most important parameters of the white mould epidemic simulation model. Three epidemics groups were established using the outputs of the model (AUDPC values) as a criterion for group formation. As a result three epidemic groups were defined by discriminant analysis involving a combination of parameters of the white mould simulation model. Clearly, the bean (Phaseolus vulgaris) - Sclerotiniasclerotiorumpathosystem is much more complex than the theoretical general “simple interest” diseases model, even if the amount of initial inoculum (in the form of propagule 1, sclerotia) remains as one of the most important parameters, as shown by sensitivity analysis.

O cultivo de mudas de fúcsia (Fuchsia speciosa) pode sofrer perdas por Mofo Cinzento (MC), causado por Botrytis cinerea. Relatos indicam que Clonostachys rosea é um fungo eficaz no controle do MC em diferentes hospedeiros. Esta pesquisa objetivou definir a eficácia do congelamento como método alternativo ao meio de cultivo com paraquat para a detecção de infecções latentes de B. cinerea em tecidos de fúcsia; comparar a eficacia de três estirpes de C. rosea no controle do MC em cultivo experimental de fúcsia; comparar o desempenho de C. rosea aos fungicidas na incidência/severidade do MC, na fotossíntese e na produção de mudas no cultivo comercial. Nos resultados verificou-se que o tratamento de folhas destacadas com temperatura -20 °C por 15 e 20 min mostrou efeito semelhante à incubação em meio ágarparaquat na detecção de B. cinerea. No experimento conduzido em 2004 e 2005 em estufa em Porto Alegre, RS, a eficiência das estirpes GFO4, G8 e GSAL de C. rosea no controle do MC foi comparada avaliando-se folhas de fúcsia destacadas. As três estirpes do antagonista não diferiram na redução da incidência do MC. No experimento conduzido nestes dois anos, em estufa com cultivo comercial de mudas em Vacaria, RS, as plantas foram aspergidas: (1) semanalmente com água + espalhante adesivo (0,01%); (2) aplicação seqüencial de fungicidas (clorotalonil, folpet, oxicloreto de cobre, mancozeb, iprodione e thiram); (3) suspensão de conídios da estirpe GFO4, 39 vezes a partir dos 26 dias do transplantio; e (4) suspensão de GFO4, 29 vezes a partir dos 61 dias do transplantio. C. rosea reduziu a incidência/severidade do MC a níveis similares das plantas tratadas com fungicida nos dois anos, sem afetar a fotossíntese ou o número de mudas. As aplicações com C. rosea podem ser iniciadas no segundo mês pós o transplantio. / Gray Mold (GM), caused by Botrytis cinerea, may induce heavy losses to the production of fuchsia cuttings. The effectiveness of Clonostachys rosea in the control of GM on several plants is well-known. This research aimed to define the efficiency of leaf freezing for the detection of latent infections of B. cinerea; to compare three strains of C. rosea in the control of GM on fuchsia experimental growth; to compare C. rosea to usually applied fungicides on a commercial growth on the incidence and severity of GM, the photosynthesis and the production of cuttings. In a preliminary study, the method of detecting B. cinerea by submitting detached leaves to -20 °C for 15 and 20 min showed similar results to the incubation on agar-paraquat medium, and was adopted to evaluate the amount of GM. In a greenhouse experiment in 2004 and 2005, Porto Alegre, RS, the efficiency of three strains of C. rosea was compared using detached leaves of fuchsia. The GFO4, G8 and GSAL strains showed the same performance in preventing and reducing the incidence of GM. In another experiment conducted in these two years in a commercial greenhouse, Vacaria, RS, plants of fuchsia var. 022, from cuttings, were sprayed with: (1) water + wetting agent, 0.01% (control); (2) fungicides (chlorotalonil, folpet, copper, mancozeb, iprodione or thiram), applied weekly, alternating the active ingredients; (3) 39 applications 26 days after transplanting, conidial suspension of strain GFO4 of C. rosea, and (4) 29 application after 61 days of the transplanting. Conidial suspension of GFO4 of C. rosea reduced the incidence and severity of GM to similar levels of the fungicide-treated plants in both years, without diference in the photosynthesis and numbers of cuttings. The disease amount did not change when the treatment with C. rosea started two months after transplanting.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-02T18:54:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 429906 bytes, checksum: 0b67805b081bf9b6884b7dce27e092c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-02T18:54:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 429906 bytes, checksum: 0b67805b081bf9b6884b7dce27e092c3 (MD5) Previous issue date: 2005-05-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O mofo-branco, causado por Sclerotinia sclerotiorum, é uma das doenças mais destrutivas do feijoeiro em Minas Gerais, especialmente nos plantios irrigados do outono-inverno. O controle da doença é mais eficiente com a adoção de medidas integradas, visando, principalmente, à redução do inóculo do patógeno no solo. O objetivo deste trabalho foi estudar a associação de estratégias de controle do mofo-branco do feijoeiro em área irrigada, incluindo o controle biológico, a redução da freqüência de irrigação e da densidade de plantio e a aplicação de fungicida. Foram realizados dois experimentos em um campo experimental da Universidade Federal de Viçosa infestado de escleródios de S. sclerotiorum, entre os meses de maio e agosto de 2004. Em cada experimento, foi montado um fatorial 2 x 2 x 3 x 4, com dois regimes de irrigação (semanal e quinzenal), duas densidades de plantio (6 e 12 sementes/m), três estratégias de aplicação de produtos/agentes de controle biológico (aplicação do fungicida fluazinam, aplicação de Trichoderma spp. e testemunha sem aplicação) e quatro repetições. Não foi observado efeito significativo dos diferentes regimes de irrigação sobre o desenvolvimento do mofo-branco e sobre a produtividade do feijoeiro, em decorrência do regime de chuvas atípico ocorrido durante a execução do experimento. Maior severidade da doença foi observada no tratamento com densidade de plantio de 12 plantas/m, em comparação com a densidade de 6 plantas/m. Alguns componentes da produtividade foram maiores no tratamento com densidade de 6 plantas/m, comparado com 12 plantas/m. Esses resultados confirmam a viabilidade da redução da densidade de plantas em áreas infestadas por escleródios de S. sclerotiorum no controle do mofo-branco. O fungicida fluazinam destacou-se no controle da doença e ao proporcionar ganhos de produtividade, em comparação com a aplicação de Trichoderma spp. e com o tratamento sem a aplicação do fungicida e dos antagonistas. / Common beans are staple food in Brazil. Bean diseases caused by soilborne pathogens, like white mold by Sclerotinia sclerotiorum, have increased in the last years, especially during the “winter season”, in the irrigated areas, because the growers do not properly manage the irrigation, leading to high relative humidity and soil moisture conditions. No single treatment provides a satisfactory disease management, but some practices used simultaneously may be effective to control white mold. The objective of this work was to study the association of control strategies of bean white mold in an irrigated area, including biological control, plant density adjustments, water management and fungicide application. Two field experiments were carried out on May-August 2004 in an experimental field of the Federal University of Viçosa, MG, Brazil. This field is naturally infested with sclerotia of S. sclerotiorum. The trials were conducted as a 2 x 2 x 3 x 4 factorial in the randomized complete-block design: two irrigation frequencies (seven und 14 days), two plant densities (rows spaced 0.5 m apart with 6 or 12 plants/m), three disease control treatments (no control, application of fluazinam, application of Trichoderma spp.) and four replications. No significantly effect of the irrigation frequencies was observed either on the disease development or on the bean yield, probably due the untypical rain occurred during the experiments. Higher disease severity was observed in the plant density 12 plants/m, compared with 6 plants/m. Some yield components were higher in the plant density 6 plants/m, compared with 12 plants/m. These results confirm the viability of using lower plant density in sclerotia infested fields to control bean white mold. The fungicide fluazinam was efficient to control the disease and to improve the bean yield, compared to the treatments with no application of fungicide and application of Trichoderma spp. / Dissertação importada do Alexandria