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Anatomia da madeira em Sapotaceae / Wood anatomy of the SapotaceaeMelfi, Adriana Donizetti Carvalho Costa 02 March 2007 (has links)
Este trabalho apresenta o levantamento anatômico da madeira de 107 espécies distribuídas em 11 gêneros pertencentes à família Sapotaceae (ordem Ericales), do continente americano, dentre os quais Manilkara Adanson, Sideroxylon Linnaeus, Micropholis (Grisebach) Pierre, Chromolucuma Ducke, Sarcaulus Radkolfer, Elaeoluma Baillon, Pouteria Aublet, Chrysophyllum Linnaeus, Ecclinusa Martius, Pradosia Liais e Diploon Cronquist. Na mais recente tentativa de classificação, Pennington (1990, 1991) reconheceu cinco tribos com base, principalmente, em características da flor e da semente. De acordo com o próprio pesquisador, quatro das tribos representariam grupos naturais, provavelmente monofiléticos. Entretanto Swenson & Anderberg (2005), utilizando a análise molecular combinada com características morfológicas, concluíram que os dois maiores gêneros da família, Chrysophyllum e Pouteria são polifiléticos. Desse modo, a família Sapotaceae necessita de uma revisão e inúmeros autores (Record, 1939; Kukachka, 1978a) mencionaram a necessidade de mais informações anatômicas do xilema para complementar e ampliar os estudos taxonômicos e filogenéticos. Portanto, este trabalho tem como objetivo verificar se a anatomia da madeira corrobora a classificação proposta por Pennington em 1990 e a obtenção de informações que possibilitem indicar características anatômicas de valor diagnóstico e estatístico, buscando contribuir com estudos futuros no agrupamento das espécies brasileiras associadas com as africanas e asiáticas da família. A descrição da anatomia da madeira segue a terminologia adotada pelo comitê da Associação Internacional dos Anatomistas de Madeira (IAWA Committee 1989). O resultado obtido pela estatística indica a formação de oito grupos que apresentam similaridades quanto ao tipo de parênquima axial, diâmetro dos vasos, diâmetro das pontoações intervasculares, tipo e localização das pontoações raio-vasculares e das inclusões minerais como, cristais prismáticos, estiloidais e areniformes, assim como dos corpos silicosos. Tais características agrupam gêneros e espécies afins com significância estatística. Conclui-se que a anatomia da madeira apresenta valor de diagnose para os diferentes gêneros, e que, em muitos casos, não corrobora a classificação proposta por Pennington (1990, 1991) na última revisão taxonomica da família. / This work presents the anatomical hoist of the wood of 107 species distributed in 11 belonging kinds to the family Sapotaceae (order Ericales), of the American continent, among the which Manilkara Adanson, Sideroxylon Linnaeus, Micropholis (Grisebach) Pierre, Chromolucuma Ducke, Sarcaulus Radkolfer, Elaeoluma Baillon, Pouteria Aublet, Chrysophyllum Linnaeus, Ecclinusa Martius, Pradosia Liais and Diploon Cronquist. In the most recent attempt of classification, Pennington (1990, 1991) recognized five tribes with base, mainly, in characteristics of the flower and of the seed. According to the own researcher, four of the tribes would represent natural groups, probably monofiléticos. However Swenson & Anderberg (2005), utilizing the molecular analysis combined with characteristics morfológicas, concluded that the two biggest kinds of the family, Chrysophyllum and Pouteria are polifiléticos. Of that way, the family Sapotaceae needs a revision and endless number authors (Record, 1939; Kukachka, 1978a) mentioned the need of more anatomical information of the xilema for complementary and extend the studies taxonômicos and filogenéticos. Therefore, this work has like objective verify itself the anatomy of the wood corroborates the classification proposal by Pennington in 1990 and the obtaining of information that are going to indicate worthy anatomical characteristics diagnosis and statistical, seeking contribute with future studies in the group of the Brazilian species associated with the Africans and Asians of the family. The description of the anatomy of the wood follows the terminology adopted by the committee of the International Association of the Anatomists of Madeira (IAWA Committee 1989). The result obtained by the statistical one indicates the formation of eight groups that present similarities as regards the kind of parênquima axial, diameter of the glasses, diameter of the pontoações intervasculares, kind and location of the pontoações ray-vascular and of the mineral enclosures as, crystals prismáticos, estiloidais and areniformes, as well as of the bodies silicosos. Such characteristics group kinds and related species with significância statistical. I concluded that the anatomy of the wood presents value of diagnose for the different kinds, and that, in many cases, does not corroborate the classification proposal by Pennington (1990, 1991) in the last revision taxonomica of the family.
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Pesquisa de Leishmania spp. e Plasmodium spp. em primatas neotropicais provenientes de regiões de Mata Atlântica e Amazônia impactadas por ações antrópicas: investigação in situ e ex situ / Survey of Leishmania spp. and Plasmodium spp. in neotropical primates form Atlantic Forest and Amazon Regions impacted by humans activities: in situ and ex situ studyMarina Galvão Bueno 22 March 2012 (has links)
Este trabalho investigou a ocorrência de infecções causadas por Plasmodium spp. e Leishmania spp. em primatas neotropicais mantidos em cativeiro e de vida livre, oriundos de regiões impactadas pelo homem nos biomas Mata Atlântica e Amazônia. Os agentes parasitários investigados são responsáveis por processos zoonóticos que acometem humanos, animais domésticos e selvagens, com significativas perdas ambientais e econômicas. Amostras biológicas foram colhidas e submetidas para análise parasitária por testes sorológicos e moleculares. Com relação aos plasmódios, os resultados alcançados sugerem a transmissão de Plasmodium spp. entre os primatas de cativeiro e de vida livre. No estado de São Paulo, nossos dados apontam para a circulação de P. malariae e P. simium, sendo este último encontrado em Callicebus nigrifrons. Na Amazônia, nossos dados indicam a circulação de P. brasilianum. Com relação às leishmanias, demonstramos que circula entre os primatas de cativeiro do estado de São Paulo a L. (L.) chagasi, as L. (L.) amazonenses e as leishmanias do complexo Viannia. Na região amazônica, 5,2% (1/19) foram positivos no PCR de sangue para L. (L.) chagasi. Os resultados deste trabalho podem subsidiar abordagens sanitárias públicas e veterinárias com relação aos primatas neotropicais existentes no estado de São Paulo e nas regiões Amazônicas. / This study investigated the occurrence of infections caused by Plasmodium spp. and Leishmania spp. in neotropical primates. Specimens were obtained both in captivity and in the wild in regions impacted by human activities in the Atlantic Forest and Amazon, Brazil. The pathogens investigated are responsible for significant zoonotic processes that affect humans, domestic and wild animals, with significant economic and environmental losses. The samples were collected and submitted for analysis by serological and molecular tests. The results suggest the transmission of Plasmodium spp. in primates from captive to those in the wild. In São Paulo state our data point for the presence of P. malariae and P. simium, this latter being found in Callicebus nigrifrons. In the Amazon, our data indicate the presence of P. brasilianum. Leishmania (L.) chagasi, L. (L.) amazonensis and the Leishmania Viannia complex circulates among the captive primates in São Paulo state. In the Amazon, 5.2% (1/19) of the primates sampled were detected by PCR as positive for L. (L.) chagasi. The results of this work may improve animal and public health approaches in relation to the neotropical primates in the regions studied.
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O período juvenil em macacos-prego (Sapajus sp.): ontogenia das relações sociais e do forrageamento / The juvenile period in tufted capuchin monkeys (Sapajus sp.): ontogeny of social relationships and foraging behaviorMariana Mascarenhas Winandy 08 May 2012 (has links)
Primatas apresentam maturação tardia em relação a outros mamíferos, com infância e, particularmente, juventude prolongadas. Duas hipóteses para explicar esta característica da ordem são a hipótese da necessidade de aprendizagem, que aponta a necessidade de aquisição de habilidades sociais ou de forrageamento como fator-chave, e a hipótese de aversão a riscos, segundo a qual primatas apresentam crescimento lento de modo a reduzir suas taxas metabólicas, uma vez que sofrem com a competição por alimento com indivíduos adultos devido à baixa posição hierárquica ou a uma menor eficiência no forrageamento. O presente trabalho analisou o desenvolvimento comportamental de jovens macacos-prego (Sapajus sp.) de um grupo que vive em semi-liberdade no Parque Ecológico do Tietê, São Paulo, de outubro de 2007 a maio de 2010. Os dados foram obtidos com os métodos Focal de Varredura e Todas as Ocorrências. Os resultados mostram uma hierarquia de dominância, de modo geral, herdada da mãe entre as fêmeas e dependente de idade entre os machos. O grande número de indivíduos com pouca participação em interações agonísticas e de díades sem relações de dominância e o baixo número de coalizões, que envolveram principalmente indivíduos dominantes, sugerem um mecanismo de evitação de conflitos por parte dos subordinados. Ao longo do desenvolvimento, houve uma redução na agressão sofrida pelos jovens, sugerindo que esse mecanismo de evitação é aprendido ao longo do desenvolvimento. As relações afiliativas de proximidade e catação dependeram fortemente do parentesco entre os indivíduos e de sua posição hierárquica, sendo que nas relações de proximidade houve também efeito da idade, com jovens mantendo-se próximos entre si. Jovens fêmeas investiram mais na construção e manutenção de redes afiliativas, por meio da catação, do que os jovens machos, e foram mais toleradas. O orçamento de atividades e o comportamento alimentar diferiram entre as categorias etárias, porém houve pouca influência do sexo. Houve evidências de sincronia de atividades entre os jovens e seus vizinhos mais próximos, porém as diferenças na dieta entre jovens e adultos sugerem que a aprendizagem social não foi o principal fator influenciando o comportamento alimentar dos jovens. Sua maior dedicação a recursos de fácil obtenção (frutos) do que a recursos mais difíceis de obter (invertebrados) indica menor eficiência no forrageamento. A menor dedicação a alimentos aprovisionados, por sua vez, sugere desvantagem na competição intra-grupo. O comportamento dos jovens no grupo estudado dá suporte ao modelo de aversão a riscos, embora haja evidências de que a aquisição de habilidades sociais e de forrageamento seja um fator importante no seu desenvolvimento / Primates exhibit delayed maturation in comparison to other mammals, with a long juvenile period. Two attempts to explain this characteristic are the needing to learn hypothesis, which points towards the need to acquire social or foraging skills as important challenges for juveniles, and the juvenile risk aversion hypothesis, according to which primates have slow growth rates in order to reduce metabolic rates, because they have a disadvantage in the competition for resources against adults, due to lower hierarchical position or to less foraging efficiency. The present work analyses the behavioral development of juvenile capuchin monkeys (Sapajus sp) from a semi-freeranging group at Parque Ecológico do Tietê (PET), São Paulo, Brazil, from October 2007 to May 2010. Data was obtained using scan sampling and all occurrences methods. Results show that the dominance hierarchy was mostly inherited from the mother, for juvenile females, and age-related, for males. The large number of individuals with little or no participation in agonistic interactions and of 0x0 ties, and the low number of coalitions, which involved mostly dominant individuals, suggest that a conflict-avoidance mechanism is being used by subordinates. There was a reduction in the aggression suffered by juveniles through time, suggesting that this mechanism is learned throughout the development. Affiliative relationships were highly dependent on kinship and hierarchical position, and in proximity there was also an effect of age, with juveniles close to one another. Juvenile females invested more in building and maintaining social networks, through grooming, than male juveniles, and were more tolerated in proximity. The activity budget and feeding behavior differed among age categories, but there was little influence of sex. There was evidence of synchrony of activities between juveniles and individuals in proximity, but differences in diet between juveniles and adults suggest that social learning was not the main influence on juveniles\' foraging behavior. They allocated more foraging time to resources easy to obtain (fruits) than to more difficult to obtain resources (invertebrates), which indicates they are less efficient in foraging. They also dedicated less time to provisioned food, suggesting a disadvantage in intra-group competition. The behavior of the juveniles observed in this study supports the risk aversion model, although there are evidences that the acquisition of social and foraging skills also plays an important role on their development
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Detecção de micoplasmas, bartonelas e vírus da leucemia felina em pequenos felídeos neotropicais mantidos em cativeiro no Refúgio Bela Vista, Foz do Iguaçu / Detection of mycoplasmas, bartonellas and feline leukemia vírus in small neotropical felids maintained in captivity at Refúgio Bela Vista, Foz do IguaçuGuimarães, Ana Marcia de Sá 24 June 2008 (has links)
Amostras de sangue total e suabes de orofaringe e conjuntiva foram coletadas de 57 felídeos Neotropicais (1 Leopardus geoffroyi, 17 L. wiedii, 22 L. tigrinus, 14 L. pardalis e 3 Puma yagouaroundi) mantidos em cativeiro no Refúgio Bela Vista, Foz do Iguaçu. Dados clínicos, hemograma e histórico dos animais foram disponibilizados. Materiais clínicos obtidos a partir dos suabes de orofaringe e conjuntiva foram submetidos ao cultivo para Mycoplasma spp em meio específico. DNA do sangue e suabes foram extraídos por meio de um kit comercial e pelo método de fervura, respectivamente. DNA extraído de amostras de sangue foram submetidos à PCR para detecção de Mycoplasma haemofelis (Mhf), Candidatus M. haemominutum (CMhm), DNA proviral do vírus da leucemia felina (FeLV) e Bartonella spp. DNA extraído dos suabes foram submetidos à PCR para detecção de Mollicutes e M. felis. Foi realizada uma análise de associação entre alterações clínicas e a infecção por Bartonella spp e um estudo de fator de risco da infecção por esse microrganismo. Apenas 1 (1,75%) animal foi positivo a reação para Mhf e nenhum foi positivo a reação para CMhm. Dois (3,5%) animais foram positivos a reação para FeLV e 6 (10,52%) foram positivos para Bartonella spp. Não houve co-infecção entre os agentes pesquisados nas amostras de sangue. Foram obtidos 5 (8,77%) isolados de Mycoplasma spp da orofaringe e nenhum de conjuntiva. DNA de Mollicutes foi detectado em 53 (93%) e 27 (47,36%) amostras de orofaringe e conjuntiva, respectivamente. Nenhuma amostra apresentou resultado positivo na detecção de DNA alvo de M. felis. Não houve associação entre as alterações hematológicas (anemia, desidratação, leucocitose, leucopenia, histórico de anemia) e a infecção por Bartonella spp. Machos apresentam maior risco de adquirir bartonelose do que fêmeas. Este é o primeiro relato da presença de DNA proviral de FeLV em L. tigrinus e L. pardalis no sul do aís, de DNA de B. henselae em L. tigrinus, L. pardalis, L. geoffroyii e P. yagouaroundi, e de um estudo de fator de risco associado a infecção por Bartonella spp em felídeos neotropicais. / Total blood samples and oropharinx and conjunctival swabs were collected from 57 neotropical felids (1 Leopardus geoffroyi, 17 L. wiedii, 22 L. tigrinus, 14 L. pardalis and 3 Puma yagouaroundi) maintained in captivity at Refúgio Bela Vista, Foz do Iguaçu. Clinical data, hemogram and clinical history of these animals were available. Clinical materials obtained from oropharinx and conjunctiva were cultured in specific media for Mycoplasma spp isolation. DNA of blood and swabs were extracted using a commercially available kit and a boiling method, respectively. DNA samples from swabs were submitted to a PCR for the detection of Mollicutes and M. felis. DNA samples from blood were submitted to a PCR for detection of Mycoplasma haemofelis (Mhf), Candidatus M. haemominutum (CMhm), feline leukemia virus (FeLV) proviral DNA , and Bartonella spp. The association between hematological alterations and bartonella infection was evaluated and a risk factor analysis was performed. Only 1 (1.75%) animal was positive for Mhf reaction, whereas all animals were negative for CMhm detection. Two (3.5%) animals were positives for FeLV and 6 (10.52%) animals were positive for Bartonella spp, by PCR. Co-infections among these agents were not observed. Five (8.77%) mycoplasma isolates were obtained from oropharinx samples and none was obtained from conjunctival samples. Mollicutes DNA was detected in 53 (93%) and 27 (47.36%) samples from oropharinx and conjunctiva, respectively. All samples were negative for M. felis detection. Hematological alterations (anemia, dehydration, leukocytosis, leucopenia, history of anemia) were not associated to Bartonella spp infection. Males are more likely to be infected than females. This is the first report of FeLV proviral DNA in L. tigrinus and L. pardalis in Southern Brazil, of B. henselae DNA in L. trigrinus, L. pardalis, L. geoffroyi and P. yagouaroundi, and the first study of risk factors for Bartonella spp infection in neotropical felids.
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Estudo sobre a ictiofauna do Rio Cabeça, um tributário do Rio Corumbataí com nascentes nas cuestas basalticas do estado de São PauloCardoso, Rodrigo Torres 08 March 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-03-08 / Financiadora de Estudos e Projetos / This study investigates the composition and distribution of fish species from Rio Cabeça, a tributary of Rio Corumbataí basin. Fish samples and physical data were monthly collected at four regular sampling sites and during 12 months, thorough the channel of Rio Cabeça and on five additional collection sites. From the physical data, width, depth and water velocity (in m/s) of the river were obtained. The fish collections were made with help of: gill net, trawl net, other hand net and sieve. Species richness and abundance were designed thorough the constancy of occurrence of the species; the Jaccard similarity analysis of rarefaction; the species accumulation curve and a descriptive analysis of the collecting sites. The sampling sites showed physical characteristics as: Site 1, narrow but deep and with rapid waters. Site 2, wider and shallower and with more water spread. Site 3, mostly broad and deeper. Site 4, also broad and shallow, but containing rapids and fast waters. The samples include 4.532 fish specimens belonging to six orders, 17 families and 65 species. Site 4, showed the best richness and abundance, and the other three sites revealed to be more or less similar. In terms of constancy the site 4 had the highest percentage of occasional species, while the other three sites had the highest percentage of regular species. The analysis of rarefaction had shown a greater richness of species at site 4 and lower species richness at remaining sites. The species accumulation curve shown that a considerable proportion of fish species is present in this river as represented in this study. The Jaccard similarity analysis shown significant differences in the species composition through the four collecting sites. The results and the discussion suggest that the basaltic Corumbataí mountain formation may interfere with the distribution, composition and richness of the ichthyofauna. On the other hand, the Rio Cabeça with 65 fish species is an important tributary of the Rio Corumbataí. Finnaly this study outcome the necessity of more attention to ichthyofauna conservation at waterfall environments, where the specimens are exposed to illegal fisheries. / Este trabalho objetivou estudar a composição e a distribuição das espécies de peixes do Rio Cabeça, um tributário do Rio Corumbataí entre os municípios de Rio Claro e Ipeuna. As coletas de peixes e de dados físicos do ambiente foram realizadas periodicamente durante um ano, em 4 pontos regulares de amostragem na calha do Rio Cabeça, e mais cinco pontos complementares tiveram sua ictiofauna amostrada. Nas coletas de dados físicos dos pontos de coleta foram obtidas: a largura, a profundidade e a velocidade da água do rio em m/s. Nas coletas de peixes foram utilizados: rede de emalhar, rede de arrasto, tarrafa e peneira. Na análise dos dados referentes às espécies foram calculadas: a constância de ocorrência das espécies, os índices de similaridade de Jaccard, a análise de rarefação, a curva de acúmulo de espécies e uma análise estatística descritiva da riqueza. A caracterização física dos locais de coleta é a seguinte: o Ponto 1 é estreito porém profundo e de águas volumosas e rápidas, o Ponto 2 é largo e mais raso, possuindo águas mais abertas, o Ponto 3 é o mais largo e profundo, e o Ponto 4 também é largo porém contendo corredeiras e em fundo raso e de águas mais rápidas. Durante as coletas foram capturados 4.532 indivíduos de peixes pertencentes a seis ordens, 17 famílias e 65 espécies. O Ponto 4 apresentou maior riqueza e abundância, e os outros três pontos apresentaram dados similares quanto a estes itens pesquisados. Quanto à constância de espécies da ictiofauna, o Ponto 4 teve maior porcentagem de espécies ocasionais, e os outros três pontos tiveram maior porcentagem de espécies constantes. Na analise de rarefação pode-se observar maior riqueza de espécies no ponto 4, e menor nos outros três pontos. A curva de acumulo de espécies mostrou parte considerável das espécies de peixes presentes neste rio está representada neste estudo. A análise de similaridade de Jaccard mostrou que os pontos apresentam diferenças significativas em sua composição de espécies. Através da análise e discussão dos resultados constatou-se que o relevo interfere na distribuição, composição e riqueza das espécies de peixes. Também chegou-se a conclusão que o Rio Cabeça, é importante para o censo da ictiofauna de tributários do Rio Corumbataí por que apresenta 65 espécies de peixes. Este trabalho é finalizado concluindo que é necessário maior atenção para a conservação da ictiofauna nos ambientes de cachoeiras, onde fica muito vulnerável a pesca predatória.
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Ictiofauna de lagoas marginais sazonalmente isoladas, rio Turvo, bacia do rio Grande, Alto Paraná, SPAraujo, Renato Braz de [UNESP] 19 December 2008 (has links) (PDF)
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araujo_rb_dr_jabo.pdf: 1067716 bytes, checksum: 706c3ec31777349a033e768e87ccffee (MD5) / Na planície de inundação do alto rio Paraná, lagoas marginais são viveiros naturais de espécies comercialmente importantes e habitat preferencial de peixes sedentários e de pequeno porte. No presente estudo, foram investigadas a composição e a abundância de comunidades de peixes em lagoas marginais (temporárias e permanentes) sazonalmente isoladas do rio Turvo, incluindo alterações qualitativas e quantitativas nas estações seca e chuvosa e sua relação com fatores ambientais. O material foi coletado em ambas as estações em seis lagoas marginais. As comunidades de peixes foram analisadas por meio de riqueza de espécies, diversidade e equitabilidade, similaridade qualitativa e quantitativa, e associações ecológicas entre amostras, espécies e variáveis ambientais. Foi registrado um total de 7.456 exemplares, distribuídos em 52 espécies, 40 gêneros, 19 famílias, e cinco ordens. As espécies mais abundantes foram Astyanax altiparanae, Serrapinnus heterodon, Liposarcus anisitsi, Hyphessobrycon eques, and Moenkahausia intermedia. A análise de agrupamento mostrou baixa similaridade entre as lagoas, sugerindo heterogeneidade desses ambientes. A composição e abundância das comunidades de peixes nas lagoas estudadas mostraram acentuada sazonalidade, sendo maiores os valores de riqueza e abundância obtidos na estação chuvosa. A análise de correspondência canônica revelou que temperatura da água, alcalinidade e abundância de anfíbios foram significativamente associadas à estrutura da ictiofauna. / In the Upper Paraná River floodplain, marginal lagoons are natural nurseries of commercially important fish species and preferential habitat of sedentary and small-sized fish species. The composition and abundance of fish communities in seasonally isolated lagoons (temporary and permanent) of the rio Turvo, qualitative and quantitative changes in the dry and rainy seasons, as well as relationship with environmental factors, were investigated. The material was sampled in both seasons in six marginal lagoons. The ichthyofauna was studied through species richness, diversity, evenness, qualitative and quantitative similarities, and ecological associations between the samples and species along an environmental gradient. A total of 7,457 specimens, distributed among 52 species, 40 genera, 19 families, and five orders, were recorded. The most abundant species were Astyanax altiparanae, Serrapinnus heterodon, Liposarcus anisitsi, Hyphessobrycon eques, and Moenkahausia intermedia. Cluster analysis showed a low similarity among lagoons suggesting heterogeneity of these environments. The composition and abundance of fish communities in the studied marginal lagoons showed a remarkable seasonality, with highest values of species richness and abundance obtained in the rainy season. Canonical correspondence analysis revealed that the water temperature, alkalinity, and amphibian abundance were significantly associated with the ichthyofauna structure.
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Evolução e diversidade de retrovírus endógenos em felídeos neotropicaisMata, Helena January 2012 (has links)
Retrovírus endógenos (ERVs) são vírus altamente difundidos no genoma de vertebrados. ERVs surgem quando retrovírus exógenos infectam células germinativas e se disseminam no genoma de seus hospedeiros, transmitindo seu material genético através das gerações por meio de herança mendeliana. ERVs são fundamentais na evolução dos genomas, sendo eles responsáveis por uma parte da diversidade genética de seus hospedeiros. O conhecimento sobre ERVs na família Felidae (Mammalia, Carnivora) estava praticamente restrito ao gato doméstico, e não se conhecia diversidade e padrões de evolução desses retroelementos em outras espécies. Este estudo teve como objetivo investigar diversidade, distribuição e padrões evolutivos de ERVs em espécies de gatos silvestres. Utilizando ferramentas de biologia molecular e bioinformática, foram identificadas e caracterizadas 85 sequências similares a retrovírus endógenos nos representantes das oito espécies brasileiras: Leopardus pardalis, L. wiedii, L. colocolo, L. geoffroyi, L. tigrinus, Puma concolor, P. yagouaroundi e Panthera onca. Encontrou-se uma predominância de ERVs similares a Gammaretrovirus, um padrão característico em muitas espécies de mamíferos. As análises filogenéticas evidenciaram três grupos principais de Gammaretrovirus, cada um evoluindo de maneira peculiar. Em uma visão geral, os ERVs provenientes de diferentes hospedeiros apresentaram-se distribuídos de forma heterogênea nas filogenias, dificultando a constatação de um padrão coevolutivo. No entanto, análises mais detalhadas de algumas sequências demonstraram peculiaridades, como no caso de um grupo de sequências similares a de um ERV oriundo do morcego Myotis lucifugus. Através de análises filogenéticas em comparação com dados obtidos na literatura, sugere-se que a infecção desse retrovírus ocorreu em uma espécie ancestral de felídeo, na segunda metade do Mioceno. Os resultados obtidos permitiram demonstrar que os felídeos neotropicais apresentam ERVs que seguem padrões semelhantes aos descritos a respeito de outros mamíferos, sugerindo também alguns casos de infecções de retrovírus muito similares entre diferentes ordens de mamíferos. / Endogenous retroviruses (ERVs) are widespread viruses in vertebrate genome. ERVs arise when exogenous retrovirus infects germinal cells and spread in the genome of their hosts, transmitting its genetic material throughout the generations by means of Mendelian inheritance. ERVs are fundamental for the evolution of genomes, being responsible for some part of the genetic diversity of their hosts. The knowledge on ERVs in felids (Mammalia, Carnivora, Felidae) was basically restricted to domestic cats, and the diversity and patterns of evolution of these retroviral elements in other species were not known. This study aimed to investigate diversity, distribution and evolutionary patterns of ERVs in wildcat species. Hence, by utilizing molecular biology and bioinformatics tools, 85 endogenous retrovirus-like sequences were identified and characterized in eight representative Brazilian species: Leopardus pardalis, L. wiedii, L. colocolo, L. geoffroyi, L. tigrinus, Puma concolor, P. yagouaroundi and Panthera onca. The analyses of these novel felid ERVs showed the predominance of Gammaretroviruslike sequences, which is a characteristic pattern present in many mammal species. Phylogenetic analyses have evidenced three major groups of Gammaretrovirus, each one evolving in a peculiar manner. ERVs from different hosts were distributed in a mixed way in the phylogenies, differently of a coevolutionary pattern. However, more detailed analyses of some sequences demonstrated peculiarities, as in the case of a group of sequences similar to an ERV from the bat Myotis lucifugus. Notably, through phylogenetic analyses, and in comparison to data obtained in the literature, it may be suggested that some infection by a retrovirus occurred in a felid ancestral species in the second half of the Miocene. Therefore, the results obtained demonstrate that ERVs from Neotropical felids follow patterns which are very similar to the ones described for other mammals, also suggesting some cases of similar retrovirus lineage infecting different mammal orders.
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Análise citogenética em algumas espécies de peixes em uma região de divisor de águas entre riachos de bacias hidrográficas distintasFerreira Neto, Maressa 25 August 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-08-25 / Universidade Federal de Sao Carlos / Cytogenetics studies in headwaters fishes have contributed significantly to the citotaxonomy and cytossistematic of these organisms. However, little is known about this diversity in the vast majority of river basins, especially among populations of adjacent basin headwaters, as it occurs in the Corumbataí area of environmental protection (Área de Proteção Ambiental APA Corumbataí), São Carlos city, São Paulo state. This way, an attempt was made to perform a comparative karyotypic analysis among the populations of many fishes of the Feijão upstream, tributary of Jacaré-Guaçu river, Tietê basin, and the Pântano upstream, tributary of Mogi-Guaçu basin, associating the cytogenetic data with the evolutionary aspects and the dispersal of the species in the region. Were studied species belongs of five Pisces families: Characidae (Astyanax altiparanae, Astyanax fasciatus, Moenkhausia sanctafilomenae); Curimatidae (Cyphocharax modestus); Prochilodontidae (Prochilodus lineatus); Cichlidae (Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum); and, Gymnotidae (Gymnotus carapo, Eigenmannia sp.). The Geophagus brasiliensis, Gymnotus carapo and, Astyanax altiparanae species were characterized using basic and molecular cytogenetics tools aiming to verify the similarities and/or the chromosomal changes occurred between allopatric species, while in the others were observed inherent specific problems only in one population. A great similarity of the karyotypic macrostructure was observed between G. brasiliensis and Gymnotus carapo populations in both regions studied. However, in A. altiparanae specie differences were detected in the karyotypic formulae and in the number of 18S ribosomal sites. So, the data obtained to G. brasiliensis and G. carapo indicate that despite they are separated by waters divisors, occurred the maintenance of a very similar karyotypic macrostructure, possibly reflecting a karyotypic stability of this specie. However, in A. altiparanae specie we can observe a certain degree of evolutionary divergence between the analyzed populations, resulted of a flow gene restriction. / Estudos citogenéticos em peixes de rios de cabeceiras têm ontribuído significativamente com a citotaxonomia e citossistemática. Entretanto, pouco se conhece sobre essa diversidade na grande maioria das bacias hidrográficas, principalmente entre populações de cabeceiras de bacias adjacentes, proximamente situadas, como ocorre na área de proteção ambiental (APA) de Corumbataí, São Carlos - SP. Dessa forma, procurou-se realizar uma análise cariotípica comparativa entre populações de diversas espécies de peixes do ribeirão do Feijão, afluente do rio Jacaré-Guaçu, bacia do Médio Tietê, e do ribeirão do Pântano, bacia do rio Mogi-Guaçu, associando os dados citogenéticos com aspectos evolutivos e dispersão de espécies na região. Foram estudadas espécies pertencentes a 5 famílias: Characidae (Astyanax altiparanae, Astyanax fasciatus, Moenkhausia sanctafilomenae); Curimatidae (Cyphocharax modestus); Prochilodontidae (Prochilodus lineatus); Cichlidae (Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum); e Gymnotidae (Gymnotus carapo, Eigenmannia sp.). As espécies Geophagus brasiliensis, Gymnotus carapo e Astyanax altiparanae foram caracterizadas através de técnicas citogenéticas básicas e moleculares com o objetivo de verificar as semelhanças e/ou possíveis alterações cromossômicas ocorridas entre as espécies que se encontram em alopatria, enquanto em todas as outras foram abordados problemas específicos inerentes a apenas uma população. Foi constatada uma grande similaridade para a macroestrutura cariotípica entre as populações de G. brasiliensis e Gymnotus carapo nas duas regiões estudadas. No entanto, na espécie A. altiparanae diferenças puderam ser detectadas na fórmula cariotípica e no número dos sítios ribossomais 18S encontrados. Dessa forma, os dados obtidos para G. brasiliensis e G. carapo indicam que, apesar destas populações estarem separadas por um divisor de águas, ocorre uma manutenção da macroestrutura cariotípica, possivelmente sendo reflexo da estabilidade cariotípica desta espécie. Já em A. altiparanae pode ser observado um certo grau de divergência evolutiva entre as populações analisadas, resultado da restrição ao fluxo gênico.
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Variação espacial e temporal na estrutura do habitat e prefência de microhabitat por pequenos mamíferos na Mata Atlântica / Spatial and Temporal Variation in habitat structure and small mammals' microhabitat choice at Atlantic ForestFreitas , Simone Rodrigues de 20 October 1998 (has links)
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Previous issue date: 1998-10-20 / FAPERJ / FUJB / CAPES / Atualmente os estudos de preferência de habitat vem se preocupando com o problema
da escala, tanto espacial quanto temporal. Este trabalho foi desenvolvido em
Guapimirim (22°29'S e 43°00'W), Estado do Rio de Janeiro de Fevereiro de 1997 a
Fevereiro de 1998. A área de estudo situa-se nos arredores do Parque Nacional de Serra
dos Órgãos na Mata Atlântica e é ocupada por casas de veraneio que podem influenciar
de alguma forma as comunidades animal e vegetal. Este trabalho se divide em quatro
abordagens principais: definição de conceitos, descrição de um novo método, o efeito
das escalas espacial e temporal sobre a estrutura do habitat, e a preferência de
microhabitat por pequenos mamíferos. Primeiramente, os diferentes usos do conceito de
habitat foram discutidos através de um breve histórico, e então uma nova definição
deste conceito distingüindo-o dos de nicho e biótopo foi apresentada. Em seguida, o uso
de um novo método para medir a estrutura de microhabitat foi proposto... / Nowadays studies on habitat choice have been worried with scale problems, as spatial
as temporal scale. This work was carried out in Guapimirim (22°29'S e 43°00'W), Rio
de Janeiro State from February'97 to February'98. The study area is a vicinity of Serra
dos Órgãos National Park at Atlantic Forest and is occupied by several houses that can
influence somehow animal and plant communities. This work is divided in four main
topics: concepts definition, new method description, effects of spatial and temporal
scales on habitat structure, and microhabitat choice by small mammals. First different
concepts of habitat used were discussed through a brief historie, then a new definition of
habitat distinguishing it from niche and biotipe concepts is presented. Therefore a new
method to measure microhabitat structure was proposed...
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Diversidade de morcegos (Chiroptera; Mammalia) em três áreas do noroeste paulista, com ênfase nas relações tróficas em PhyllostomidaeBreviglieri, Crasso Paulo Bosco [UNESP] 17 March 2008 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2008-03-17Bitstream added on 2014-06-13T20:10:11Z : No. of bitstreams: 1
breviglieri_cpb_me_sjrp.pdf: 448706 bytes, checksum: cc4e437e1c6fba71a0e0e2b6d1d3c65e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os morcegos constituem um grupo de mamíferos extremamente importantes do ponto de vista ecológico e de saúde pública, sendo importantes dispersores de sementes e pólen nos trópicos. Com a expansão dos agronegócios cada vez mais intensa no noroeste do estado de São Paulo, mais rara fica a presença de fragmentos de mata nativa que sejam substanciais a ponto de manter uma grande variedade de espécies. O próprio desconhecimento da diversidade de espécies para a maioria dos táxons constitui empecilho para a tomada de medidas de cunho conservacionista na região. Nesse contexto, os objetivos deste estudo foram, 1) realizar um levantamento da diversidade de espécies de morcegos - com ênfase nas suas relações tróficas em Phyllostomidae - encontrada em três áreas na região noroeste do Estado de São Paulo: (i) Mata Ciliar junto ao córrego Talhadinho, (ii) Mata Ciliar Córrego dos Tenentes e (iii) Fazenda Experimental (Pólo Regional de Desenvolvimento Tecnológico dos Agronegócios do Centro Norte) e testar o efeito da localização da área sobre a riqueza e abundância das espécies; e 2) Verificar interações entre guildas de morcegos e seus recursos alimentares. Para isso, foram realizadas duas coletas mensais em cada área durante o período de junho de 2005 a maio de 2006, utilizando oito redes tipo mist-net montadas ao anoitecer e retiradas após as 0300 h. Após a captura, os morcegos foram identificados em campo, e o antebraço medido com paquímetro. A massa corporal foi registrada com uma balança de campo. Após estes procedimentos o animal foi marcado com uma anilha metálica numerada, com o auxílio de um aplicador, e solto. As relações tróficas foram comparadas utilizando o índices de similaridade de Bray-Curtis, índice de Levins,... / The bats constitute a group of extremely important mammals of the ecological viewpoint and of public health, being important dispersores of seeds and pollen in the tropics. With the expansion of the agribusinesses more and more intense in the northwest of the state of São Paulo, more rare stayed the native forest fragments presence that be substantial to the point of maintain a big range of species. The own unfamiliarity of the diversity of species for the majority of the táxons was constituted impediment for the conservation stamp measures taking in the region. In that context, the objectives of this study were, 10 1) carry out a hoist of the bats species diversity - with emphasis in his trophic relations in Phyllostomidae - found in three areas in the northwest region of the State of São Paulo: (I) Ciliary Forest next to the Talhadinho brook, (ii) Ciliary Forest of the Tenentes brook and (iii) Experimental Farm (Pólo Regional de Desenvolvimento Tecnológico dos Agronegócios do Centro Norte) and quiz the effect of the location of the area about the wealth and abundance of the species; and 2) Verify interactions between guilds of bats and his resources you will feed. For that, were carried out two monthly collections in each area during the period of June of 2005 to May of 2006, utilizing eight amounted to mist-net kind nets the nightfall and retreats after the 0300 h. After capture, the bats were identified in field, and the forearm measured with pachymeter. The corporal batter was recorded with a scale of field. After these procedures the animal was marked with a anilha metallic numbered ring, with the aid of an aplicador, and free. The trophic relations were compared utilizing the indices of similarity of Bray-Enjoy, index of Levins, superimposition of niche and analyses of complex nets. They were recorded twenty-four ...(Complete abstract click electronic access below)
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